单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Single-nucleus RNA and ATAC sequencing reveals the impact of chromatin accessibility on gene expression in Arabidopsis roots at the single-cell level
2021-03-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2021.01.001
PMID:33422696
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研究论文 | 本文利用单核RNA测序（sNucRNA-seq）和单核转座酶可及染色质测序（sNucATAC-seq）技术，研究了拟南芥根部细胞在单细胞水平上染色质可及性对基因表达的影响。 | 首次在拟南芥根部应用单核RNA和ATAC测序技术，揭示了细胞类型特异性标记基因的染色质可及性模式，并验证了使用细胞核作为生物实体建立植物细胞类型特异性转录组的方法。 | NA | 深入理解控制植物基因表达的调控机制 | 拟南芥根部细胞的染色质可及性和基因表达 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（sNucRNA-seq），单核转座酶可及染色质测序（sNucATAC-seq） | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | NA |
| 162 | 2024-08-09 |
Differential Network Analysis Reveals Regulatory Patterns in Neural Stem Cell Fate Decision
2021-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-020-00415-2
PMID:33439459
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研究论文 | 本研究提出了一种新方法，整合先验信息构建基因调控网络，并应用于分析四个不同单细胞转录组数据集中的五条神经干细胞分化路径 | 本研究首次系统性地整合多个时间阶段的神经干细胞分化数据，通过构建基因调控网络揭示了共同的和特定的调控机制 | NA | 解析神经干细胞分化过程中的调控模式 | 神经干细胞的分化机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组 | 基因调控网络 | 转录组数据 | 四个不同的单细胞转录组数据集 |
| 163 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing to Disentangle the Blood System
2021-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314654
PMID:33441024
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简要综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨血液系统的复杂性，揭示了细胞类型中间体的丰富性和确保分化细胞平衡补充的分子机制 | 利用单细胞RNA测序技术提供了对血液细胞分化的新见解，并强调了推动单细胞分辨率下理解造血作用的技术创新 | NA | 探索血液系统的复杂性及其分子机制 | 血液系统的细胞类型和分子机制 | 单细胞技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 164 | 2024-08-09 |
Circadian clock genes promote glioma progression by affecting tumour immune infiltration and tumour cell proliferation
2021-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12988
PMID:33442944
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研究论文 | 研究昼夜节律基因失调与胶质瘤进展之间的关系 | 首次探讨了昼夜节律基因失调如何通过影响肿瘤免疫浸润和细胞周期促进胶质瘤进展 | NA | 探索昼夜节律基因失调与胶质瘤进展之间的关系 | 昼夜节律基因在胶质瘤中的作用 | NA | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序分析, ssGSEA, CIBERSORT算法, CCK8检测, 集落形成检测, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 训练数据集672个样本, 验证数据集1570个样本 |
| 165 | 2024-08-09 |
Novel application of single-cell next-generation sequencing for determination of intratumoral heterogeneity of canine osteosarcoma cell lines
2021-Mar, Journal of veterinary diagnostic investigation : official publication of the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians, Inc
IF:1.2Q3
DOI:10.1177/1040638720985242
PMID:33446089
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研究论文 | 本文应用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）分析了4种犬骨肉瘤细胞系的肿瘤内异质性 | 首次在犬类物种中使用scRNA-seq技术，并将CanFam3.1参考基因组上传到10X Genomics Cell Ranger分析管道 | NA | 深入了解骨肉瘤的异质性和基因混乱的本质 | 犬骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 4种犬骨肉瘤细胞系（COS31, DOUG, POS, HMPOS） |
| 166 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis revealed the heterogeneity and microenvironment of gastrointestinal stromal tumors
2021-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14795
PMID:33393143
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃肠道间质瘤（GIST）的细胞异质性和微环境 | 揭示了GIST中肿瘤细胞的异质性及其与其他细胞的相互作用，为GIST的研究和治疗提供了新的理论基础 | NA | 旨在发现GIST中肿瘤细胞的异质性及其与其他细胞的相互作用 | GIST患者的肿瘤内和肿瘤周围组织 | 数字病理学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 65个GIST样本 |
| 167 | 2024-08-09 |
Decoding Human Megakaryocyte Development
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.006
PMID:33340451
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞发育过程 | 首次详细描述了早期巨核细胞的转录组、细胞异质性和发育轨迹，并发现了一种具有免疫反应相关基因高表达的CD42bCD14巨核细胞亚群 | NA | 揭示早期人类巨核细胞发育的分子和细胞机制 | 人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胚胎卵黄囊和胎肝的巨核细胞样本 |
| 168 | 2024-08-09 |
Single-cell profiles of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells after IFN-γ and TNF-α licensing
2021-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.145347
PMID:33333228
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研究论文 | 研究分析了IFN-γ和TNF-α预处理后的人骨髓来源间充质干细胞的单细胞表达谱 | 首次在单细胞分辨率下展示了未经和经过IFN-γ和TNF-α预处理的间充质干细胞在细胞周期、干性、分化潜能和免疫调节能力方面的表达谱 | 细胞异质性限制了对炎症预处理效应的全面理解 | 探讨IFN-γ和TNF-α预处理对间充质干细胞免疫命运和免疫调节能力的影响 | 人骨髓来源的间充质干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的Gene Expression Omnibus数据库中的单细胞RNA测序数据 |
| 169 | 2024-08-09 |
Novel biomarkers of intervertebral disc cells and evidence of stem cells in the intervertebral disc
2021-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2020.12.005
PMID:33338640
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研究论文 | 本研究使用10X Genomics技术分析了野生型大鼠椎间盘的单细胞转录组，识别了新的椎间盘细胞基因标记，并提供了椎间盘细胞的单细胞基因表达图谱 | 本研究首次在单细胞水平上提供了椎间盘细胞的表型和标记基因，并提出了新的标记基因，包括多能干细胞（MSC）标记基因 | NA | 旨在深入了解健康成熟椎间盘细胞的标记基因和细胞表型 | 大鼠椎间盘细胞及其异质性细胞群 | 数字病理学 | NA | 10X Genomics技术 | NA | 单细胞转录组 | 13,578个单细胞转录本 |
| 170 | 2024-08-09 |
Mesenchymal Niches for Digestive Organ Development, Homeostasis, and Disease
2021-03, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.11.010
PMID:33349527
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研究论文 | 本文探讨了间质细胞在消化器官发育、稳态及疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学和多组学分析，揭示了间质细胞的异质性及其在器官发育和疾病中的调控机制 | NA | 研究间质细胞在消化器官发育和疾病中的作用及其调控机制 | 消化器官的间质细胞及其在器官发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA |
| 171 | 2024-08-09 |
Melatonin improves the effect of cryopreservation on human oocytes by suppressing oxidative stress and maintaining the permeability of the oolemma
2021-Mar, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12707
PMID:33274466
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research paper | 本研究探讨了褪黑素（MLT）通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来改善人类卵子冷冻保存效果的作用 | 首次报道了褪黑素在人类卵子冷冻保存中的应用，通过抑制氧化应激和维持卵母细胞膜通透性来提高卵子的发育能力 | 研究仅限于体外成熟的卵子，未涉及体内环境的影响 | 研究褪黑素对人类卵子冷冻保存效果的影响 | 体外成熟的卵子 | NA | NA | 荧光染色、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 卵子 | 随机分为新鲜组、MLT处理冷冻保存组（MC组）和无MLT处理冷冻保存组（NC组），每组包含10 μM、100 μM、1 mM和10 mM的MLT处理子组 |
| 172 | 2024-08-09 |
Similarities between bovine and human germline development revealed by single-cell RNA sequencing
2021-03, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0313
PMID:33275120
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、定量实时PCR和免疫荧光分析，研究了牛和人类原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 | 揭示了牛和人类原始生殖细胞在基因表达和分化模式上的相似性 | NA | 评估牛原始生殖细胞在生殖腺发育初期的分子特征 | 牛和人类的原始生殖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 40至90天胎龄的牛胎儿生殖腺 |
| 173 | 2024-08-09 |
Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2
2021-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0739-1
PMID:33288904
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研究论文 | 本文介绍了Slide-seqV2技术，该技术通过改进文库生成、珠子合成和阵列索引，实现了接近单细胞分辨率的高灵敏度空间转录组学分析 | Slide-seqV2的RNA捕获效率提高了约50%，接近基于液滴的单细胞RNA-seq技术的检测效率 | NA | 旨在提高空间转录组学技术的灵敏度和分辨率，以更好地理解组织形成和功能 | 研究对象包括小鼠海马体中的神经元和新生小鼠大脑皮层的时空发育 | 空间转录组学 | NA | Slide-seqV2 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠海马体和新生小鼠大脑皮层的样本 |
| 174 | 2024-08-09 |
Schistosoma mansoni venom allergen-like protein 6 (SmVAL6) maintains tegumental barrier function
2021-03, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2020.09.004
PMID:33253697
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研究论文 | 本文研究了曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6（SmVAL6）在维持体表屏障功能中的作用 | 首次提供了Group 2 SmVAL在血吸虫生物学中具有基本功能的证据 | 目前缺乏对Group 2 SmVAL其他功能的研究支持 | 探讨SmVAL6在血吸虫生物学中的功能 | 曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6（SmVAL6）及其在血吸虫体表屏障功能中的作用 | NA | NA | 原位杂交（WISH）、小干扰RNA（siRNA）、酵母双杂交筛选、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、计算机模拟 | NA | RNA | 涉及成年血吸虫的细胞和组织 |
| 175 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus and In Situ RNA-Sequencing Reveal Cell Topographies in the Human Pancreas
2021-03, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.11.010
PMID:33212097
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序和原位RNA测序技术，揭示了人类胰腺中的细胞拓扑结构。 | 创新性地开发了单核RNA测序协议，并首次创建了全面的人类胰腺细胞图谱。 | NA | 旨在更好地理解健康和疾病状态下新生儿和成人胰腺的异质性和细胞组成。 | 人类胰腺细胞的异质性和组成。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 细胞 | 超过120,000个细胞来自成人和新生儿的胰腺捐赠者。 |
| 176 | 2024-08-09 |
Targeting fibroblast growth factor 23-responsive pathways uncovers controlling genes in kidney mineral metabolism
2021-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.10.024
PMID:33159963
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研究论文 | 本研究通过基因阵列和单细胞RNA测序技术，探索了FGF23响应途径中的调控基因，特别是在肾脏矿物质代谢中的作用 | 发现HBEGF作为FGF23下游调控基因的新角色，并通过靶向共同信号途径发挥作用 | NA | 识别可作为控制FGF23介导的矿物质代谢目标的新基因 | FGF23响应途径中的调控基因及肾脏矿物质代谢 | NA | NA | 基因阵列，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 野生型小鼠肾脏样本 |
| 177 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process
2021-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-020-00640-8
PMID:33116295
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研究论文 | 本研究利用大规模单细胞RNA测序技术，分析了成年蝾螈肢体再生过程中的细胞分类，揭示了与再生相关的线粒体相关肌肉骨骼细胞群。 | 发现了支持再生过程的线粒体相关集群和通过细胞间相互作用信号促进再生的COL2+集群，以及支持肌肉骨骼系统再生的COL2-线粒体子集群。 | NA | 探索蝾螈肢体再生过程中的关键驱动因素，为人类肢体再生提供新见解。 | 成年蝾螈肢体再生过程中的细胞亚群和细胞外基质。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞样本 |
| 178 | 2024-08-09 |
Single-cell patterning and axis characterization in the murine and human definitive endoderm
2021-03, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-00426-0
PMID:33106598
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠和人类早期体节形成阶段的内胚层细胞，定义了四个主要内胚层区域及其发育路径。 | 本研究首次详细描述了人类内胚层前体的区域化模式，并揭示了背侧和腹侧胰腺前体从中间肠群落起源并沿不同路径发育为相同细胞类型的过程。 | NA | 理解呼吸和消化器官生成和再生的机制 | 小鼠和人类早期体节形成阶段的内胚层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 179 | 2024-08-09 |
Cell populations in neonatal rat peripheral nerves identified by single-cell transcriptomics
2021-03, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23928
PMID:33079428
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研究论文 | 通过单细胞转录组学技术，研究了新生大鼠外周神经中的细胞群体多样性，特别是施万细胞的异质性 | 首次通过高覆盖率的单细胞测序技术，对新生大鼠的外周神经和背根神经节中的细胞群体进行了分类，并揭示了施万细胞的亚型及其基因特征和功能富集 | NA | 探究新生大鼠外周神经中细胞群体的多样性和复杂性 | 新生大鼠的坐骨神经和背根神经节中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自新生（1天龄）大鼠的坐骨神经和背根神经节样本 |
| 180 | 2024-08-09 |
STARCH: copy number and clone inference from spatial transcriptomics data
2021-03-09, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/abbe99
PMID:33022659
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARCH的新方法，用于从空间转录组数据中推断拷贝数变异和克隆信息 | STARCH方法利用肿瘤中相邻细胞可能共享相似拷贝数变异的观察结果，克服了从RNA测序数据中推断拷贝数变异的挑战 | NA | 开发一种新的方法来从空间转录组数据中推断肿瘤细胞的拷贝数变异 | 肿瘤细胞的拷贝数变异和克隆信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 每个点包含少量细胞的网格 |