单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-09 |
A new graph-based clustering method with application to single-cell RNA-seq data from human pancreatic islets
2021-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa087
PMID:33575647
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研究论文 | 本文提出了一种基于图模型的新的聚类框架，用于处理单细胞RNA测序数据中的异质性，并应用于人类胰岛细胞的分析 | 引入了基于图模型的聚类方法，并考虑了单细胞RNA测序数据组成的特性，采用对数比变换 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型检测问题 | 人类胰岛细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类胰岛细胞 |
| 142 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of early-relapse hepatocellular carcinoma
2021-Mar, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-021-00428-2
PMID:33594272
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-09 |
Tumor Functional Heterogeneity Unraveled by scRNA-seq Technologies: (Trends in Cancer 6, 13-19, 2020)
2021-Mar, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2021.02.001
PMID:33596415
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-09 |
Cell-specific network analysis of human folliculogenesis reveals network rewiring in antral stage oocytes
2021-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16315
PMID:33599396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了人类卵泡发育过程中卵母细胞和颗粒细胞的动态调控网络，揭示了卵泡腔阶段卵母细胞的基因网络结构及其重构过程 | 首次在单细胞网络层面探索卵泡发育过程中的基因功能，发现了两个潜在的基因子网络，这些子网络可能在卵母细胞功能中起重要作用 | NA | 探索卵泡发育过程中单细胞分辨率的动态调控网络 | 人类卵母细胞和颗粒细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | WGCNA, MCODE | 基因表达数据 | NA |
| 145 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional analysis reveals developmental stage-dependent changes in retinal progenitors in the murine early optic vesicle
2021-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.01.043
PMID:33548738
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠早期视泡中视网膜前体细胞在不同发育阶段转录组的变化 | 首次报道了在单细胞分辨率下，视网膜初始分化阶段依赖性的转录组特征，并揭示了小鼠视泡结构在发育过程中的意外异质性 | NA | 研究早期视泡中细胞类型的多样性及其在视杯区域化之前的转录组变化 | 小鼠早期视泡中的视网膜前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7989个细胞 |
| 146 | 2024-08-09 |
Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in trophectoderm by analysis of single-cell RNA-seq data of human blastocyst
2021-Mar, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-021-00770-3
PMID:33543402
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研究论文 | 本研究通过重新分析来自两个独立组的植入后胚胎的单细胞RNA测序数据，鉴定了不同类型的滋养层细胞及其标记物，并关注了滋养层特异性转录因子在不同模型中的基因表达模式。 | 本研究利用单细胞测序技术，首次在人类胚胎植入后阶段对滋养层细胞的转录调控机制进行了深入分析。 | 研究主要依赖于体外培养的滋养层细胞模型，可能与体内实际情况存在差异。 | 揭示人类妊娠早期滋养层细胞分化的转录调控机制。 | 人类植入后胚胎的滋养层细胞及其特异性转录因子。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自两个独立组的植入后胚胎样本 |
| 147 | 2024-08-09 |
Exploring the secrets of brain transcriptional regulation: developing methodologies, recent significant findings, and perspectives
2021-Mar, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-021-02230-x
PMID:33547496
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综述 | 本文综述了大脑转录调控的分子多样性，并讨论了非编码DNA/RNA在转录/后转录水平的分子机制，以及时空和单细胞转录组学在脑发育和疾病进展中的应用 | 利用最新的技术进步，深入探讨了大脑中复杂的转录网络，并尝试通过时空和单细胞转录组学获得对脑发育和疾病进展的新见解 | 尽管取得了显著进展，但该领域仍面临许多挑战需要解决 | 探索和揭示人类大脑功能的秘密，特别是大脑转录调控的分子机制 | 大脑的转录调控机制，包括基因表达的空间和时间变化与大脑结构和功能的关系 | NA | NA | 时空和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及啮齿动物、非人类灵长类和人类的大脑 |
| 148 | 2024-08-09 |
A novel CD4+ CTL subtype characterized by chemotaxis and inflammation is involved in the pathogenesis of Graves' orbitopathy
2021-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00615-2
PMID:33514849
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、免疫荧光和混合淋巴细胞反应等方法，鉴定出一种新的CD4+细胞毒性T淋巴细胞亚型，该亚型具有趋化性和炎症特征，并参与了Graves眼病的病理过程 | 发现了一种新的Graves眼病特异性的CD4+细胞毒性T淋巴细胞亚型，该亚型具有趋化性和炎症特征，并通过克隆扩增和强细胞毒性反应证实其在疾病中的致病作用 | NA | 探索驱动Graves眼病进展的致病性CD4+ T细胞类型 | Graves眼病和Graves甲状腺功能亢进症患者的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、T细胞受体测序（TCR-Seq）、流式细胞术、免疫荧光和混合淋巴细胞反应（MLR） | NA | 细胞 | Graves眼病和Graves甲状腺功能亢进症患者的CD4+ T细胞 |
| 149 | 2024-08-09 |
Study Offers Insights into Gastric Cancer
2021-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-NB2021-0305
PMID:33526445
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了转移到腹膜腔的胃癌异质性，并识别出两种与患者生存差异相关的细胞类型 | 首次通过单细胞测序技术详细描述了胃癌转移至腹膜腔的细胞异质性，并开发了新的预后基因表达特征 | NA | 探索胃癌转移至腹膜腔的细胞异质性及其对患者生存的影响 | 胃癌转移至腹膜腔的细胞类型及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 150 | 2024-08-09 |
The Roles of T cells in Bladder Pathologies
2021-03, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2021.01.003
PMID:33536141
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研究论文 | 本文探讨了T淋巴细胞在膀胱疾病中的作用，包括细菌感染、膀胱癌和慢性炎症 | 利用单细胞RNA测序和报告小鼠等新技术，揭示了T细胞在膀胱免疫中的新角色 | NA | 研究T细胞在膀胱疾病中的作用及其潜在的免疫治疗价值 | T细胞在膀胱疾病中的作用 | 免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-09 |
Dysregulation of the NRG1/ERBB pathway causes a developmental disorder with gastrointestinal dysmotility in humans
2021-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI145837
PMID:33497358
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研究论文 | 本文通过三重外显子测序和分子生物学分析，揭示了ERBB3和ERBB2基因的双等位变异在导致包括胃肠动力障碍在内的发育障碍中的作用 | 首次详细描述了ERBB3和ERBB2基因变异在人类发育障碍中的作用，并揭示了这些变异在肠道神经系统和肌肉异常中的具体机制 | 研究主要基于病例系列和实验室模型，需要进一步的临床验证和更广泛的样本量来确认结果的普遍性 | 探讨ERBB3和ERBB2基因变异在人类发育障碍中的分子基础及其对胃肠道动力的影响 | 患有胃肠动力障碍及相关发育障碍的患者 | 遗传学 | 发育障碍 | 外显子测序，单细胞RNA测序，定量实时PCR，免疫印迹 | NA | 基因数据，细胞数据 | 8名患者 |
| 152 | 2024-08-09 |
Oncolytic virotherapy-mediated anti-tumor response: a single-cell perspective
2021-03-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.12.022
PMID:33482123
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研究论文 | 研究了Talimogene laherparepvec（T-VEC）这种经过基因改造的单纯疱疹病毒1型（HSV-1）在皮肤原发性B细胞淋巴瘤（pCBCL）中的抗肿瘤效应，通过单细胞转录组学和免疫组库分析其临床和组织学效应。 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了T-VEC治疗后肿瘤细胞和非肿瘤细胞的转录组变化，并识别了三种pCBCL亚型。 | 研究仅限于皮肤原发性B细胞淋巴瘤，且样本量相对较小。 | 探讨T-VEC在皮肤原发性B细胞淋巴瘤中的抗肿瘤效应及其分子机制。 | 皮肤原发性B细胞淋巴瘤患者及其肿瘤组织。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 13名患者，其中11名显示出注射部位肿瘤反应。 |
| 153 | 2024-08-09 |
Roles of TGF-β Superfamily Proteins in Extravillous Trophoblast Invasion
2021-03, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2020.12.005
PMID:33478870
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综述 | 本文综述了TGF-β超家族蛋白在调控人类早期妊娠中滋养外胚层细胞（EVT）侵袭过程中的作用及其机制 | 介绍了3D培养滋养层类器官、单细胞测序和微流控技术在EVT侵袭研究中的应用 | NA | 探讨TGF-β超家族成员及其受体、信号通路和下游分子靶点在调控EVT侵袭中的功能，并总结这些发现对不良妊娠结局的相关性 | TGF-β超家族蛋白及其在EVT侵袭中的作用 | NA | 妊娠相关疾病 | 3D培养、单细胞测序、微流控技术 | NA | 细胞 | NA |
| 154 | 2024-08-09 |
A hitchhiker's guide to single-cell transcriptomics and data analysis pipelines
2021-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.01.007
PMID:33485955
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学（SCT）技术及其数据分析流程 | SCT技术提供了前所未有的单细胞分辨率，揭示了细胞异质性和罕见细胞群 | SCT数据高度复杂，需要先进的统计和计算方法进行分析 | 探讨SCT技术的最新趋势、挑战、数据分析的机器学习方法及未来展望 | 单细胞转录组数据及其在细胞生物学和疾病研究中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学（SCT） | NA | 转录组数据 | NA |
| 155 | 2024-08-09 |
Derivation of snake venom gland organoids for in vitro venom production
2021-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00463-4
PMID:33504990
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研究论文 | 本文描述了如何生成、维护和应用蛇毒腺器官，以实现体外蛇毒生产 | 首次提出使用蛇毒腺器官作为体外生产蛇毒的安全替代方法 | NA | 开发一种安全的方法来生产蛇毒，以促进抗蛇毒和新型治疗药物的开发 | 蛇毒腺器官的生成、维护及其在蛇毒生产中的应用 | NA | NA | 组织培养技术 | 3D 培养模型 | 细胞 | 从胚胎晚期和最近死亡的成年蛇的毒腺组织中提取 |
| 156 | 2024-08-09 |
Corrigendum to: Inferring microenvironmental regulation of gene expression from single-cell RNA sequencing data using scMLnet with an application to COVID-19
2021-03-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab015
PMID:33448287
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Vascular Cells in Early Stage Murine Abdominal Aortic Aneurysm-Brief Report
2021-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315607
PMID:33472403
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了小鼠腹主动脉瘤早期血管细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了小鼠腹主动脉瘤中不同细胞类型的转录组特征 | NA | 阐明腹主动脉瘤中细胞和分子层面的异质性 | 小鼠腹主动脉瘤组织中的血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉瘤组织 |
| 158 | 2024-08-09 |
SUSCC: Secondary Construction of Feature Space based on UMAP for Rapid and Accurate Clustering Large-scale Single Cell RNA-seq Data
2021-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-020-00411-6
PMID:33475958
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研究论文 | 本文提出了一种基于UMAP的特征空间二次构建方法，用于快速准确地对大规模单细胞RNA测序数据进行聚类 | 采用UMAP进行特征空间的二次构建，提高了聚类速度和准确性 | NA | 设计一种更快速和更准确的聚类方法，以应对大规模单细胞RNA测序数据的挑战 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | UMAP | k-means算法, k-nearest neighbor算法 | 基因表达矩阵 | 大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 159 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics uncovers phenotypic alterations in the monocytes in a Chinese population with chronic cadmium exposure
2021-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2020.111881
PMID:33444878
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了中国慢性镉暴露人群中单核细胞表型的改变 | 这是首次对人类循环免疫系统对血浆镉水平的响应进行单细胞转录组学分析 | NA | 研究慢性镉暴露如何影响循环免疫细胞的表型和分子水平 | 中国湖南省镉污染地区的人群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共分析了3283名个体，其中30名个体用于单细胞RNA测序和流式细胞术分析 |
| 160 | 2024-08-09 |
Establishment of intestinal organoid cultures modeling injury-associated epithelial regeneration
2021-03, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-00453-x
PMID:33420425
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研究论文 | 本文建立了一种新型肠道类器官培养系统，模拟肠道上皮损伤后的再生过程 | 首次建立了包含多种成分的肠道类器官培养系统，能够模拟肠道上皮损伤后的再生过程 | NA | 研究肠道上皮损伤后的再生过程 | 肠道类器官 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 类器官 | NA |