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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Dynamic blood single-cell immune responses in patients with COVID-19
2021-03-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00526-2
PMID:33677468
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研究论文 | 研究通过单细胞分辨率下的5'基因表达、T细胞受体（TCR）和B细胞受体（BCR）V(D)J转录组分析，探讨了COVID-19患者在不同阶段血液免疫反应的动态变化。 | 本研究首次详细描述了COVID-19患者血液中免疫细胞的动态变化，并揭示了特定免疫反应对SARS-CoV-2抗原的作用。 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证这些发现。 | 揭示SARS-CoV-2感染后人体血液免疫反应的动态变化，为治疗COVID-19提供潜在的治疗线索。 | COVID-19患者的血液免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 341,420个外周血单个核细胞（PBMCs），185,430个克隆型T细胞和28,802个克隆型B细胞，来自16名COVID-19患者的25个样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-09 |
Single cell eQTL analysis identifies cell type-specific genetic control of gene expression in fibroblasts and reprogrammed induced pluripotent stem cells
2021-03-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02293-3
PMID:33673841
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和群体遗传学，研究了遗传变异对不同细胞亚型基因表达的影响 | 首次在单细胞水平上评估了遗传变异对重编程细胞系基因表达的影响，并揭示了细胞类型特异性的表达数量性状位点（eQTLs） | NA | 研究遗传变异如何影响不同细胞亚型的基因表达 | 纤维母细胞和重编程诱导的多能干细胞 | 群体遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 64,018个纤维母细胞来自79个供体，19,967个重编程诱导的多能干细胞来自31个重编程供体线 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
Deciphering the state of immune silence in fatal COVID-19 patients
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21702-6
PMID:33674591
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序分析血液样本和支气管肺泡灌洗液与临床、免疫学和体外功能数据，揭示了与COVID-19严重程度相关的免疫特征 | 首次揭示了COVID-19患者中由髓系细胞驱动的免疫抑制现象，并强调了单核细胞中精氨酸酶-1表达的免疫调节特征 | NA | 解析致命性COVID-19患者中的免疫沉默状态 | COVID-19患者的免疫特征和临床结果 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 血液样本和支气管肺泡灌洗液 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-09 |
Identifying transposable element expression dynamics and heterogeneity during development at the single-cell level with a processing pipeline scTE
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21808-x
PMID:33674594
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research paper | 本文开发了一种名为scTE的单细胞转座子处理流程，用于研究不同生物背景下单细胞中转座子的表达情况 | 首次开发了针对单细胞转座子表达分析的scTE处理流程，并展示了其在多种生物过程中的应用 | NA | 研究转座子在单细胞水平上的表达动态及其对细胞异质性的贡献 | 转座子在单细胞中的表达及其在细胞异质性和生物过程中的作用 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell ATAC-seq data | 涉及多种生物背景下的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-09 |
An Outline of the Outset of Thrombopoiesis in Human Embryos At Last
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.007
PMID:33667354
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人卵黄囊和胎肝，追踪了巨核细胞分化的两条替代途径 | 揭示了巨核细胞具有止血和造血干细胞支持功能，并发现人胚胎干细胞衍生的血小板反应蛋白1阳性内皮细胞能在体外产生巨核细胞 | NA | 探究人类胚胎中血栓形成过程的起点 | 人卵黄囊和胎肝中的巨核细胞分化 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: one step closer to the clinic
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01276-y
PMID:33664491
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-09 |
A multiscale model via single-cell transcriptomics reveals robust patterning mechanisms during early mammalian embryo development
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008571
PMID:33684098
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研究论文 | 本文构建了一个多尺度的三维模型，用于重现从受精卵到晚期囊胚的哺乳动物胚胎发育过程，并探讨了形成Epi/PE层的两个关键过程 | 本文通过整合多个单细胞转录组数据集的时空信息，提出了一种选择性的细胞间粘附机制和细胞信号的时间衰减机制 | NA | 研究早期哺乳动物胚胎发育中形成Epi/PE层的稳健模式机制 | 哺乳动物胚胎的早期发育过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-09 |
Spatial profiling technologies and applications for brain cancers
2021-Mar, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2021.1900735
PMID:33685321
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在脑癌研究中的应用 | 介绍了下一代成像和多组学技术如何为精细表征脑肿瘤组织生物学提供工具 | NA | 旨在提高对脑肿瘤微环境细胞组成的理解，并探索有效的治疗策略 | 脑癌及其微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学 | NA | 蛋白质/mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
Transcriptional bursts explain autosomal random monoallelic expression and affect allelic imbalance
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008772
PMID:33690599
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研究论文 | 本文研究了转录爆发如何解释单细胞RNA测序数据中观察到的等位基因表达模式，包括常染色体单等位基因表达的频繁现象 | 本文首次通过转录爆发模型解释了单细胞中等位基因表达的模式，并揭示了爆发频率对单等位基因表达比例的影响 | 文章未提及具体的局限性 | 探究转录爆发对单细胞中等位基因表达模式的影响 | 单细胞RNA测序数据中的等位基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 转录爆发模型 | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-09 |
Progenitor cell diversity in the developing mouse neocortex
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2018866118
PMID:33649223
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了发育中的小鼠新皮质中的神经前体细胞，揭示了神经前体细胞的多样性及其与神经元类型指定相关的基因表达模式。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了神经前体细胞在不同发育阶段的基因表达动态变化，以及这些变化与神经元身份基因表达的关系。 | NA | 确定神经前体细胞中的时间基因表达是否与神经元类型指定相关。 | 发育中的小鼠新皮质中的神经前体细胞。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 多个神经前体细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals that targeting HSP90 suppresses PDAC progression by restraining mitochondrial bioenergetics
2021-Mar-03, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-021-00311-4
PMID:33658487
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了通过靶向HSP90抑制胰腺导管腺癌（PDAC）进展的机制 | 首次揭示了HSP90抑制通过破坏HSP90与OPA1的相互作用，减少线粒体嵴数量和能量产生，从而抑制PDAC进展 | NA | 开发针对胰腺导管腺癌的新治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | KPC小鼠的PDAC肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-09 |
Proteogenomics of glioblastoma associates molecular patterns with survival
2021-03-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108787
PMID:33657365
|
研究论文 | 本文通过整合高分辨率质谱蛋白质组学和RNA测序数据，分析了87名胶质母细胞瘤患者的蛋白质表达、RNA表达及临床信息，以探索与生存相关的分子模式。 | 研究揭示了蛋白质组特征与生存之间的更强关联，并发现了与已建立的基于RNA的分类不同的独特蛋白质分类。 | NA | 旨在通过蛋白质组学分析，揭示胶质母细胞瘤的分子模式与患者生存之间的关系。 | 胶质母细胞瘤患者的蛋白质组和转录组数据。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 质谱蛋白质组学，RNA测序 | NA | 蛋白质组数据，转录组数据 | 87名胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of glial progenitor cells during the neurogenesis-to-gliogenesis switch in the developing human cerebral cortex
2021-03-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108788
PMID:33657375
|
研究论文 | 本文研究了发育中的人类大脑皮层中神经发生向胶质发生转变期间胶质前体细胞的异质性和分子特征 | 通过单细胞RNA测序技术，成功富集并表征了多种胶质和神经元谱系的前体细胞，并验证了其在固定切片中的表型 | NA | 探究发育中的人类大脑皮层中胶质前体细胞的异质性和分子特征 | 胶质前体细胞及其在神经发生向胶质发生转变过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | EGFR细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-09 |
Tracing cell-type evolution by cross-species comparison of cell atlases
2021-03-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108803
PMID:33657376
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，构建了跨物种的细胞类型进化层次结构，揭示了动物细胞类型的保守性和差异性。 | 首次全面研究了细胞类型的进化，并构建了跨物种的细胞类型进化层次结构。 | NA | 探索细胞类型的进化过程及其在不同物种间的保守性和差异性。 | 七种动物物种的细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据 | 七种动物物种的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-09 |
ArchR is a scalable software package for integrative single-cell chromatin accessibility analysis
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00790-6
PMID:33633365
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为ArchR的软件包，用于单细胞染色质可及性数据的快速和全面分析 | ArchR提供了一个直观的用户界面，支持复杂单细胞分析，如双细胞去除、单细胞聚类和细胞类型识别等，并能与单细胞RNA测序数据进行多组学整合 | NA | 加速单细胞水平上基因调控的理解 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞染色质可及性数据 | 超过120万个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-09 |
Blinatumomab-induced T cell activation at single cell transcriptome resolution
2021-Mar-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07435-2
PMID:33648458
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了Blinatumomab诱导的T细胞激活及其在单细胞层面的转录变化。 | 首次在单细胞层面详细分析了Blinatumomab诱导的T细胞激活及其转录变化，并发现了TNFSF4可能作为Blinatumomab治疗抵抗的机制及潜在的联合治疗靶点。 | 研究主要集中在细胞系模型和患者来源模型，未来需要更多的临床数据来验证这些发现。 | 揭示Blinatumomab诱导的T细胞激活机制及其在治疗B细胞淋巴母细胞白血病中的应用。 | Blinatumomab诱导的T细胞激活及其转录变化。 | 癌症免疫治疗 | B细胞淋巴母细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了来自细胞系模型的17,920个单细胞T细胞和来自患者样本的2,271个单细胞T细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in cancer research
2021-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01874-1
PMID:33648534
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在肿瘤研究中的应用 | scRNA-seq技术能够揭示肿瘤细胞的异质性，监测肿瘤发展进程，并分析免疫细胞的免疫逃逸和药物抵抗机制 | NA | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤异质性、发病机制及治疗中的应用 | 肿瘤细胞和肿瘤组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
Single-cell map of diverse immune phenotypes in the acute myeloid leukemia microenvironment
2021-Mar-01, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-021-00265-0
PMID:33648605
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了急性髓系白血病（AML）患者骨髓样本中的免疫细胞表型、功能和发展轨迹 | 首次详细描述了AML患者骨髓中多种免疫细胞类型的多样性，包括树突状细胞和巨噬细胞的差异，以及识别出几种独特的免疫细胞类型 | 研究仅限于AML患者的骨髓样本，未包括AML原始细胞 | 旨在理解AML微环境中免疫细胞表型、功能和发展轨迹，以揭示逃避免疫监视和免疫治疗反应的机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓免疫细胞 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16名AML患者和4名健康捐赠者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-09 |
Single-cell mapper (scMappR): using scRNA-seq to infer the cell-type specificities of differentially expressed genes
2021-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab011
PMID:33655208
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研究论文 | 本文介绍了一种名为single cell Mapper（scMappR）的方法，该方法利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和现有的反卷积方法，为从bulk RNA-seq获得的差异表达基因（DEGs）分配细胞类型特异性评分 | scMappR方法解决了bulk RNA-seq无法确定差异表达发生的细胞类型的问题，通过利用scRNA-seq数据和反卷积方法，为DEGs分配细胞类型特异性评分 | scMappR依赖于用户提供的scRNA-seq数据或预先整理的scRNA-seq表达矩阵，可能限制其在某些情况下的应用 | 开发一种方法，通过利用scRNA-seq数据和反卷积方法，为bulk RNA-seq获得的DEGs分配细胞类型特异性评分 | 评估scMappR方法在模拟RNA-seq数据和已排序血液细胞RNA-seq数据上的表现，并探究其在肾脏再生过程中细胞类型特异性变化的揭示能力 | 基因表达分析 | NA | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 约100种人类和鼠类组织 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-09 |
ELF3 activated by a superenhancer and an autoregulatory feedback loop is required for high-level HLA-C expression on extravillous trophoblasts
2021-03-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2025512118
PMID:33622787
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研究论文 | 本文研究了转录因子ELF3在滋养外胚层细胞中高表达HLA-C的调控机制 | 首次揭示了ELF3通过超级增强子和自调节反馈环路调控HLA-C表达的机制 | NA | 探讨HLA-C在滋养外胚层细胞中的表达调控及其与妊娠生物学和妊娠异常的关系 | 滋养外胚层细胞中的HLA-C表达 | NA | NA | ChIP-PCR, 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | RNA | 第一孕期的原代滋养外胚层细胞及JEG3细胞系 | NA | NA | NA | NA |