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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 61 | 2024-08-07 |
Identification of leukemic and pre-leukemic stem cells by clonal tracking from single-cell transcriptomics
2021-03-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21650-1
PMID:33649320
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research paper | 本文通过结合单细胞转录组学和谱系追踪技术，识别和分子表征了急性髓系白血病中的白血病干细胞和前白血病干细胞 | 本文采用单细胞多组学方法，结合核和线粒体体细胞变异进行谱系追踪，能够识别特定的白血病干细胞基因表达程序和由白血病突变引起的分化阻滞 | NA | 深入表征癌症干细胞，以期从源头上根除癌症 | 急性髓系白血病中的白血病干细胞和前白血病干细胞 | digital pathology | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of mIHC images via antigen mapping
2021-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abc5464
PMID:33674303
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研究论文 | 本文开发了一种方法，通过抗原映射技术将单细胞RNA测序数据与多重免疫组织化学（mIHC）图像相结合，以增强组织切片的细胞注释 | 提出了一种名为STvEA的新方法，通过空间解析的转录组学与表位锚定，实现对高度多重细胞计数数据集的转录组引导注释 | NA | 克服在多重免疫组织化学中注释细胞群体的挑战，特别是对于抗体面板未包含特定标记的细胞 | 小鼠脾脏中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 多重免疫组织化学（mIHC），单细胞RNA测序 | NA | 图像，转录组数据 | 使用已发表的小鼠脾脏的细胞计数和mIHC数据 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
BARcode DEmixing through Non-negative Spatial Regression (BarDensr)
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008256
PMID:33684106
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研究论文 | 本文开发了一种新的分析方法BarDensr，用于解决空间转录组学中转录本混合的问题 | BarDensr通过非负空间回归的生成模型和稀疏凸优化方法，有效地估计了混合转录本的密度 | NA | 开发一种新的分析方法，以提高在高度混合转录本情况下的信号恢复能力 | 空间转录组学中的转录本混合问题 | 空间转录组学 | NA | 非负空间回归 | 生成模型 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics provides new insights into the role of fibroblasts during peritoneal fibrosis
2021-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.321
PMID:33784014
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探讨了腹膜纤维化过程中成纤维细胞的作用 | 通过单细胞RNA测序技术，提供了细胞水平的转录组分析，揭示了不同纤维化阶段细胞类型特异性的生物学过程 | NA | 探讨透析相关腹膜纤维化中不同细胞群体的贡献 | 正常腹膜组织、短期和长期腹膜透析患者的腹膜组织 | 数字病理学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 正常腹膜组织6例，短期腹膜透析患者6例，长期腹膜透析患者4例 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Inferring microenvironmental regulation of gene expression from single-cell RNA sequencing data using scMLnet with an application to COVID-19
2021-03-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa327
PMID:33341869
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研究论文 | 本研究提出了一种基于单细胞RNA测序数据的多层网络方法（scMLnet），用于推断细胞微环境对基因表达的调控 | scMLnet不仅模拟了细胞间的功能性通信，还模拟了细胞内的基因调控网络，为理解基因表达的微环境调控提供了一种新方法 | NA | 旨在揭示细胞微环境对基因表达的调控机制，特别是在COVID-19中的应用 | 研究对象包括COVID-19患者的单细胞RNA测序数据以及SARS-CoV-2受体ACE2的表达调控 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 多层网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals key immune cell phenotypes in the lungs of patients with asthma exacerbation
2021-03, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.09.032
PMID:33039479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了哮喘急性发作患者肺部关键免疫细胞表型 | 本研究首次在单细胞水平上识别了与哮喘急性发作强烈相关的候选基因，并揭示了多个细胞簇中共享的复杂分子框架 | NA | 旨在识别与哮喘急性发作在细胞水平上强烈相关的候选基因 | 哮喘急性发作患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 哮喘急性发作患者和健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Inhibitory CD161 receptor identified in glioma-infiltrating T cells by single-cell analysis
2021-03-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.022
PMID:33592174
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了31名IDH野生型胶质母细胞瘤和IDH突变型胶质瘤患者的肿瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 首次揭示了胶质瘤浸润T细胞中CD161作为候选抑制性受体的表达，并证明了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探索胶质瘤中T细胞的基因表达模式及其在癌症免疫治疗中的作用 | 胶质瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 31名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of nasopharyngeal carcinoma
2021-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21795-z
PMID:33750785
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态和肿瘤特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞群及其亚群，并揭示了其对患者预后和治疗结果的影响 | 研究仅基于14名患者的样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态，以促进癌症诊断、治疗和预后 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞及其亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66,627个细胞来自14名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
Development of double-positive thymocytes at single-cell resolution
2021-03-26, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00861-7
PMID:33771202
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术对小鼠胸腺细胞进行分析，通过无监督聚类定义胸腺细胞亚型，并验证双阳性细胞亚型 | 首次详细研究了双阳性T细胞的发育过程，并发现了不同发育阶段的双阳性胸腺细胞亚型及其特征 | NA | 深入理解胸腺细胞发育的基本免疫学过程 | 小鼠和人类的胸腺细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Transient ACE (Angiotensin-Converting Enzyme) Inhibition Suppresses Future Fibrogenic Capacity and Heterogeneity of Cardiac Fibroblast Subpopulations
2021-03-03, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨短暂使用血管紧张素转换酶抑制剂对心脏成纤维细胞亚群的影响 | 首次揭示了短暂使用ACE抑制剂能够持久改变心脏成纤维细胞亚群的分布和活性，从而减少纤维化表型 | 研究仅在自发性高血压大鼠模型中进行，结果的普遍性和临床应用需进一步验证 | 探讨短暂使用ACE抑制剂对心脏成纤维细胞亚群的影响及其保护机制 | 自发性高血压大鼠的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 每组7只自发性高血压大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the induction of novel myeloid and myeloid-associated cell populations in visceral fat with long-term obesity
2021-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202001970R
PMID:33566380
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、免疫荧光和流式细胞术，鉴定了小鼠附睾/内脏脂肪组织中的髓系细胞个体群 | 发现了与长期肥胖相关的新的髓系和髓系相关细胞群，并验证了一种具有髓系和间充质特性的新型髓系/巨噬细胞群 | NA | 探究长期肥胖下内脏脂肪中髓系细胞群的变化及其在肥胖相关炎症和纤维化中的作用 | 小鼠内脏脂肪组织中的髓系细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
High-dimensional analysis of the adenosine pathway in high-grade serous ovarian cancer
2021-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001965
PMID:33771891
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研究论文 | 本研究通过多参数平台分析了高级别浆液性卵巢癌中胞外ATP水解为腺苷（eADO）途径的影响 | 揭示了eADO信号在高级别浆液性卵巢癌中的临床和免疫学影响，以及CD39的化学保护作用，支持在卵巢癌患者中评估eADO靶向药物 | NA | 研究高级别浆液性卵巢癌中eADO途径的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者 | 癌症研究 | 卵巢癌 | 转录组元分析、组织微阵列、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 约1200名高级别浆液性卵巢癌患者和约1000例组织微阵列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
Single-Cell Toolkits Opening a New Era for Cell Engineering
2021-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0002
PMID:33795531
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）工具包的发展及其在细胞工程中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术的发展，使得研究人员能够以单细胞分辨率比较转录组，从而更深入地理解细胞功能 | 高吞吐量的单细胞'omics'工具的快速发展需要有效的假设验证策略 | 探讨细胞工程工具包的当前状态及其对单细胞和全基因组数据收集与分析的贡献 | 单细胞RNA测序工具包及其在细胞工程中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
Evaluating Capture Sequence Performance for Single-Cell CRISPR Activation Experiments
2021-Mar-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00499
PMID:33625849
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研究论文 | 本文评估了单细胞CRISPR激活实验中捕获序列性能的影响 | 引入了特征条形码技术，允许同时捕获mRNA和gRNA | 该技术尚处于起步阶段，缺乏优化实验参数的信息 | 识别CRISPR激活基因扰动研究的最佳gRNA支架 | 捕获序列、捕获序列位置和gRNA骨架 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR激活 | NA | mRNA、gRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Detection of gene cis-regulatory element perturbations in single-cell transcriptomes
2021-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008789
PMID:33711017
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研究论文 | 介绍了一种基于poly-adenine CRISPR gRNA的单细胞RNA测序方法（pAC-Seq），用于直接观察scRNA-seq中的gRNAs，并评估CRISPR/Cas9对基因顺式调控区域改变的表型后果 | pAC-Seq能够检测到顺式调控引起的靶基因表达改变，即使在只有约5%的细胞中发生双等位基因丢失 | 低比例的双等位基因丢失显著增加了检测调控基因组变化后果所需的细胞数量 | 评估CRISPR/Cas9对基因顺式调控区域改变的表型后果 | 基因顺式调控区域的改变及其对靶基因表达的影响 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约5%的细胞发生双等位基因丢失 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling lights different cell trajectories in plants
2021-Mar, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-021-00040-7
PMID:36304478
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综述 | 本文主要讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）方法在植物干细胞维持和分化、细胞对环境变化的响应以及scRNA-seq改进策略方面的最新见解 | 介绍了scRNA-seq在植物干细胞维持和分化中的应用，以及空间转录组学、表观基因组学和单细胞多组学等技术的新视角 | NA | 探讨scRNA-seq在植物干细胞维持和分化中的应用及其改进策略 | 植物干细胞的维持和分化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-08 |
Dupilumab Effects on Innate Lymphoid Cell and Helper T Cell Populations in Patients with Atopic Dermatitis
2021-Mar, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2021.100003
PMID:34909707
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研究论文 | 研究探讨了Dupilumab在特应性皮炎患者中对先天淋巴细胞和辅助T细胞群体的影响 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了Dupilumab治疗前后Th2细胞和ILC2s的基因表达变化 | 研究样本仅限于27名日本患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究Dupilumab治疗特应性皮炎的机制，特别是对Th2细胞和ILC2s的影响 | 特应性皮炎患者的Th2细胞和ILC2s | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 27名日本特应性皮炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscape of human blood cells
2021-Mar, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa180
PMID:34691592
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞RNA测序技术，构建了人类血液细胞的单细胞转录组图谱 | 首次构建了包含编码基因和长非编码RNA（lncRNA）的全面血液细胞转录组参考图谱，并识别了调控造血细胞分化的潜在lncRNA和转录因子 | NA | 提供一个单细胞分辨率的人类血液细胞转录组图谱，为生理和病理造血研究提供全面参考 | 人类血液细胞，包括造血干细胞、前体细胞和成熟血液细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7551个血液细胞，来自21名健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
An Integrative Single-cell Transcriptomic Atlas of the Post-natal Mouse Mammary Gland Allows Discovery of New Developmental Trajectories in the Luminal Compartment
2021-03, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-021-09488-1
PMID:33913090
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研究论文 | 本文通过整合三个基础报告中的单细胞RNA测序数据，研究了小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 本文通过整合大量单细胞RNA测序数据，提供了对先前检测到的Procr干细胞样亚群的更好分辨率，并识别了一组新的表达免疫样标记的乳腺上皮细胞 | NA | 研究小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 53,686个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Revealing lineage-related signals in single-cell gene expression using random matrix theory
2021-03-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913931118
PMID:33836557
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研究论文 | 本文利用随机矩阵理论在单细胞基因表达数据中识别与细胞分化或祖先相关的信号 | 本文首次将随机矩阵理论应用于单细胞RNA测序数据，以识别与分化和发育途径相关的基因 | NA | 揭示单细胞基因表达数据中与细胞分化或祖先相关的信号 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机矩阵理论 | 基因表达数据 | 包括哺乳动物表皮、肺、整个胚胎、成体、树突状细胞、肠上皮细胞以及正在进行诱导多能干细胞（iPSC）重编程的细胞等多种组织和生物样本 | NA | NA | NA | NA |