单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2024-08-08	Dupilumab Effects on Innate Lymphoid Cell and Helper T Cell Populations in Patients with Atopic Dermatitis 2021-Mar, JID innovations : skin science from molecules to population health DOI:10.1016/j.xjidi.2021.100003 PMID:34909707	研究论文	研究探讨了Dupilumab在特应性皮炎患者中对先天淋巴细胞和辅助T细胞群体的影响	通过单细胞RNA测序分析，揭示了Dupilumab治疗前后Th2细胞和ILC2s的基因表达变化	研究样本仅限于27名日本患者，可能限制了结果的普遍性	探究Dupilumab治疗特应性皮炎的机制，特别是对Th2细胞和ILC2s的影响	特应性皮炎患者的Th2细胞和ILC2s	NA	特应性皮炎	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	27名日本特应性皮炎患者
62	2024-08-08	Single-cell transcriptomic landscape of human blood cells 2021-Mar, National science review IF:16.3Q1 DOI:10.1093/nsr/nwaa180 PMID:34691592	研究论文	本文通过高通量单细胞RNA测序技术，构建了人类血液细胞的单细胞转录组图谱	首次构建了包含编码基因和长非编码RNA（lncRNA）的全面血液细胞转录组参考图谱，并识别了调控造血细胞分化的潜在lncRNA和转录因子	NA	提供一个单细胞分辨率的人类血液细胞转录组图谱，为生理和病理造血研究提供全面参考	人类血液细胞，包括造血干细胞、前体细胞和成熟血液细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	7551个血液细胞，来自21名健康捐赠者
63	2024-08-09	An Integrative Single-cell Transcriptomic Atlas of the Post-natal Mouse Mammary Gland Allows Discovery of New Developmental Trajectories in the Luminal Compartment 2021-03, Journal of mammary gland biology and neoplasia IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s10911-021-09488-1 PMID:33913090	研究论文	本文通过整合三个基础报告中的单细胞RNA测序数据，研究了小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性	本文通过整合大量单细胞RNA测序数据，提供了对先前检测到的Procr干细胞样亚群的更好分辨率，并识别了一组新的表达免疫样标记的乳腺上皮细胞	NA	研究小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性	小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	53,686个单细胞
64	2024-08-09	Revealing lineage-related signals in single-cell gene expression using random matrix theory 2021-03-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.1913931118 PMID:33836557	研究论文	本文利用随机矩阵理论在单细胞基因表达数据中识别与细胞分化或祖先相关的信号	本文首次将随机矩阵理论应用于单细胞RNA测序数据，以识别与分化和发育途径相关的基因	NA	揭示单细胞基因表达数据中与细胞分化或祖先相关的信号	单细胞RNA测序数据中的基因表达模式	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	随机矩阵理论	基因表达数据	包括哺乳动物表皮、肺、整个胚胎、成体、树突状细胞、肠上皮细胞以及正在进行诱导多能干细胞（iPSC）重编程的细胞等多种组织和生物样本
65	2024-08-09	Hexokinase 2 discerns a novel circulating tumor cell population associated with poor prognosis in lung cancer patients 2021-03-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2012228118 PMID:33836566	研究论文	本文展示了己糖激酶-2（HK2）作为代谢功能相关标记物，用于检测非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的循环肿瘤细胞（CTCs），特别是那些细胞角蛋白阴性（HK2/CK）的CTCs。	首次使用HK2作为标记物，检测到NSCLC患者中细胞角蛋白阴性的CTCs，并发现这些细胞与不良预后相关。	研究样本量较小，且仅限于NSCLC患者，可能限制了结果的普遍性。	探索新的CTCs标记物，以更全面地了解NSCLC患者的预后。	非小细胞肺癌患者的循环肿瘤细胞。	数字病理学	肺癌	单细胞分析	NA	血液样本	59名非小细胞肺癌患者
66	2024-08-09	A specific RIP3+ subpopulation of microglia promotes retinopathy through a hypoxia-triggered necroptotic mechanism 2021-03-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2023290118 PMID:33836603	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，发现了一种特定的RIP3+亚群微胶质细胞（sMG2），该细胞通过缺氧触发的坏死性凋亡机制促进视网膜病变	首次揭示了微胶质细胞激活驱动的血管新生分子机制，并证明了针对微胶质细胞坏死性凋亡轴的治疗策略对视网膜新生血管疾病的抗血管生成效果	NA	探索微胶质细胞在视网膜新生血管形成中的作用及其分子机制	微胶质细胞及其在视网膜病变中的作用	数字病理学	视网膜病变	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
67	2024-08-09	Macrophages in SHH subgroup medulloblastoma display dynamic heterogeneity that varies with treatment modality 2021-03-30, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.108917 PMID:33789113	研究论文	研究探讨了SHH亚组髓母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的动态异质性及其在不同治疗方式下的变化	通过单细胞RNA测序分析，揭示了TAM在不同治疗方式下的显著异质性，并识别了不同TAM亚群的标志物	NA	研究SHH亚组髓母细胞瘤中TAM的异质性及其对治疗方式的响应	SHH亚组髓母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞	数字病理学	儿童脑癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	自发性小鼠SHH亚组髓母细胞瘤样本
68	2024-08-09	Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland 2021-03-30, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes12040509 PMID:33808370	研究论文	研究了印记基因在发育和产后垂体中的动态表达	首次尝试将印记基因的表达与垂体的形成和功能联系起来，并利用高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序数据描述了垂体的印记转录组	由于垂体在发育期间的小尺寸和成熟细胞的复杂性，获取有用的转录组数据存在技术困难	探讨印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记疾病的关联	印记基因在垂体中的表达及其对垂体发育和功能的影响	NA	印记疾病	RNA测序	NA	转录组数据	NA
69	2024-08-09	Single-Cell Sequencing Confirms Transcripts and VHDJH Rearrangements of Immunoglobulin Genes in Human Podocytes 2021-03-25, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes12040472 PMID:33806147	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和嵌套PCR结合Sanger测序，证实了人类足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和VHDJH重排	首次在单细胞水平上证实了足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和重排，并揭示了在病理情况下足细胞表达的免疫球蛋白多样性增加	NA	确认足细胞中免疫球蛋白基因的转录本并表征其重排谱	人类足细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序，嵌套PCR，Sanger测序	NA	RNA序列	360个足细胞用于单细胞RNA测序，48个单足细胞用于嵌套PCR和Sanger测序
70	2024-08-09	Novel Gene Regulation in Normal and Abnormal Spermatogenesis 2021-03-17, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells10030666 PMID:33802813	综述	本文综述了新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制	利用单细胞RNA测序等新技术，识别了更多与精子发生相关的调控基因	NA	探讨新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制	啮齿动物和人类精原干细胞的增殖、分化和凋亡，以及精母细胞和其他生殖细胞的减数分裂	NA	男性不育	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
71	2024-08-09	Single-Cell Expression Landscape of SARS-CoV-2 Receptor ACE2 and Host Proteases in Normal and Malignant Lung Tissues from Pulmonary Adenocarcinoma Patients 2021-Mar-12, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers13061250 PMID:33809063	研究论文	本研究探讨了肺腺癌患者正常和恶性肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱	首次揭示了肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱	NA	阐明肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱	肺腺癌患者的正常和恶性肺组织	数字病理学	肺腺癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	5个肺腺癌组织和14个匹配的正常组织，共186,916个细胞
72	2024-08-09	Advancing Drug Discovery for Neurological Disorders Using iPSC-Derived Neural Organoids 2021-Mar-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms22052659 PMID:33800815	研究论文	本文探讨了利用诱导多能干细胞衍生的神经类器官在神经退行性疾病药物发现中的应用	文章介绍了使用CRISPR创建同基因模型、单细胞RNA测序和机器学习分析复杂数据集等技术解决方案，以扩大类器官在药物发现中的应用	类器官技术在工业界大规模药物筛选中的应用受到可重复性、可扩展性和向人类疾病转化的挑战	推动类器官技术在神经退行性疾病大规模药物筛选中的应用	诱导多能干细胞衍生的神经类器官及其在神经退行性疾病模型中的应用	生物技术	神经退行性疾病	CRISPR, 单细胞RNA测序	机器学习	图像, 文本	NA
73	2024-08-09	Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways 2021-Mar-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms22052667 PMID:33800863	综述	本文综述了脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的作用及其在脊髓微环路中的组织和功能	通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法，识别出表达一系列遗传和/或神经化学标记的抑制性中间神经元群体，构成功能性微环路	NA	探讨抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式及其在感觉运动通路中的调控作用，为治疗与抑制功能缺陷相关的病理状况提供潜在的治疗靶点	脊髓抑制性中间神经元及其在感觉运动通路中的作用	神经科学	感觉和运动障碍	转基因操作、神经化学分析、单细胞转录组学	NA	基因和神经化学标记	NA
74	2024-08-09	The transcriptional landscape of Venezuelan equine encephalitis virus (TC-83) infection 2021-03, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1 DOI:10.1371/journal.pntd.0009306 PMID:33788849	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了委内瑞拉马脑炎病毒（TC-83株）感染人星形胶质细胞后的宿主转录组和病毒RNA	首次在单细胞水平上同时分析宿主转录组和病毒RNA，揭示了病毒感染过程中的细胞间异质性，并识别了抗病毒治疗的潜在靶点	NA	研究委内瑞拉马脑炎病毒与宿主细胞的相互作用，寻找抗病毒治疗的潜在靶点	委内瑞拉马脑炎病毒（TC-83株）感染的人星形胶质细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	数千个单细胞
75	2024-08-09	The Role of Diagnostic Biomarkers, Omics Strategies, and Single-Cell Sequencing for Nonalcoholic Fatty Liver Disease in Severely Obese Patients 2021-Mar-01, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1 DOI:10.3390/jcm10050930 PMID:33804302	研究论文	本文探讨了诊断生物标志物、组学策略和单细胞测序在严重肥胖患者非酒精性脂肪肝病中的作用	文章介绍了组学技术和单细胞测序在发现生物标志物和增加对非酒精性肝病及脂肪性肝炎病理生理学理解方面的最新进展	当前诊断工具如弹性成像在设备和测量质量方面存在局限，尤其是在腹部周长大和皮下脂肪多的患者中	旨在发现新的生物标志物，并加深对健康和受损肝脏中个体细胞类型生物学功能的理解	严重肥胖患者的非酒精性脂肪肝病	NA	非酒精性脂肪肝病	单细胞测序	NA	基因组学、转录组学和蛋白质组学数据	NA
76	2024-08-09	A RIPK1-regulated inflammatory microglial state in amyotrophic lateral sclerosis 2021-03-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2025102118 PMID:33766915	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，在肌萎缩侧索硬化症（ALS）的小鼠模型中鉴定了一种新型的小胶质细胞亚类，称为RIPK1调控的炎症性小胶质细胞（RRIMs），并探讨了其在ALS中的作用机制	首次鉴定并描述了RIPK1调控的炎症性小胶质细胞（RRIMs），并揭示了其在ALS中的具体作用和调控机制	NA	阐明RIPK1激酶抑制在ALS小鼠模型中提供治疗益处的机制，并可能为正在进行的使用RIPK1抑制剂的ALS临床试验提供额外的生物标志物	RIPK1调控的炎症性小胶质细胞（RRIMs）及其在ALS中的作用	神经退行性疾病	肌萎缩侧索硬化症	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠模型中的小胶质细胞样本
77	2024-08-09	A zero-inflated non-negative matrix factorization for the deconvolution of mixed signals of biological data 2021-03-30, The international journal of biostatistics DOI:10.1515/ijb-2020-0039 PMID:33783171	研究论文	本文提出了一种零膨胀非负矩阵分解方法，用于解卷积生物数据中的混合信号	本文引入了一种零膨胀非负矩阵分解方法，并推导出有效的乘法参数更新规则，以改善在存在过多零值情况下的估计准确性	NA	提高生物数据中混合信号解卷积的准确性	脑基因表达数据和粪便微生物组数据	生物信息学	NA	非负矩阵分解	零膨胀非负矩阵分解	序列数据	NA
78	2024-08-09	A cross-talk between CAR T cell subsets and the tumor microenvironment is essential for sustained cytotoxic activity 2021-03-26, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abd4344 PMID:33771887	研究论文	本文报道了在免疫活性小鼠B细胞淋巴瘤模型中，CAR T细胞亚群与肿瘤微环境之间的相互作用对肿瘤控制至关重要	揭示了CAR T细胞通过产生IFN-γ与肿瘤微环境相互作用，增强内源性T细胞和自然杀伤细胞活性，并维持CAR T细胞的细胞毒性	文章未明确提及局限性	研究CAR T细胞与肿瘤微环境之间的相互作用及其对肿瘤治疗的影响	CAR T细胞亚群与肿瘤微环境	免疫学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	免疫活性小鼠B细胞淋巴瘤模型
79	2024-08-09	Pten is a key intrinsic factor regulating raphe 5-HT neuronal plasticity and depressive behaviors in mice 2021-03-26, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-021-01303-z PMID:33771970	研究论文	本文探讨了PTEN作为调节脑内5-HT神经元活性和抑郁行为的关键内在因子，并展示了其在小鼠中的作用机制	提出了PTEN作为调节5-HT神经元活性和抑郁行为的新治疗策略	NA	研究PTEN在调节5-HT神经元活性和抑郁行为中的作用	小鼠的5-HT神经元和抑郁行为	神经科学	抑郁	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠
80	2024-08-09	The Burkholderia pseudomallei intracellular 'TRANSITome' 2021-03-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-021-22169-1 PMID:33772012	研究论文	本文开发了一种'TRANSITomic'方法，用于在特定阶段分析单个Burkholderia pseudomallei细胞在宿主细胞感染过程中的转录组，从而获得病理生理学见解	首次提出'TRANSITome'概念，用于研究单个细菌细胞在宿主细胞内的时空特异性过程	NA	深入理解宿主-病原体相互作用	Burkholderia pseudomallei细菌在宿主细胞感染过程中的转录组	NA	NA	转录组分析	NA	转录组数据	单个Burkholderia pseudomallei细胞