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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-05 |
Deciphering neural heterogeneity through cell lineage tracing
2021-Mar, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03689-3
PMID:33151389
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综述 | 本文综述了神经细胞谱系追踪的策略及其对理解神经细胞功能克隆关系的作用 | 结合不同的报告蛋白和转基因小鼠，利用新型基因组编辑工具和单细胞测序技术，显著提高了谱系追踪能力 | 对于谱系追踪的复杂性和挑战性仍未提供明确的解决方案 | 探讨细胞谱系在成人大脑发育中的重要性 | 围绕大脑中的细胞谱系和它们的功能克隆关系进行研究 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑工具、单细胞测序 | 转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into the hematopoietic generation of T-lymphocyte precursors in mouse and human
2021-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.12.005
PMID:33454362
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评论 | 该文章综述了小鼠和人类早期T细胞祖细胞的单细胞转录组研究 | 文章揭示了小鼠和人类之间在T细胞发育中的核心程序和物种间的变异 | 研究主要集中于胎儿和严格纯化的后天样本，可能缺乏其他发育阶段的全面性 | 旨在探讨T细胞潜能的分子要求及其早期发展 | 研究对象为小鼠和人类的早期T细胞祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胎儿及后天严格纯化的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-05 |
Plasma IL-6 levels following corticosteroid therapy as an indicator of ICU length of stay in critically ill COVID-19 patients
2021-Mar-15, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00429-9
PMID:33723251
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研究论文 | 该研究探讨了在重症COVID-19患者中，皮质类固醇治疗后IL-6水平与ICU住院时长之间的关系 | 首次提出了皮质类固醇后IL-6水平可能与COVID-19严重程度相关的假设 | 样本量较小，仅涉及16名患者 | 探究皮质类固醇治疗后IL-6水平在重症COVID-19患者中的作用 | 重症COVID-19患者，特别是接受类固醇治疗的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本（平行组织扫描的细胞数据） | 16名重症患者接受治疗，41名未接受治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Modelling human blastocysts by reprogramming fibroblasts into iBlastoids
2021-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03372-y
PMID:33731926
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研究论文 | 本文描述了将成纤维细胞重编程为体外三维人类囊胚模型（称为iBlastoids）的方法 | iBlastoids能够模拟囊胚的整体结构，包括内细胞团样结构、外胚层和原始内胚层样细胞、囊胚腔样腔隙以及滋养层样外层细胞，并能产生多能性和滋养层干细胞，模拟植入早期的几个方面 | NA | 开发一个可扩展且易于操作的系统来模拟人类囊胚生物学，以促进早期人类发育的研究 | 人类囊胚的生物学特性 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维模型 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Multiplexed Analysis of Retinal Gene Expression and Chromatin Accessibility using scRNA-Seq and scATAC-Seq
2021-03-12, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62239
PMID:33779599
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研究论文 | 本文介绍了使用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC-Seq技术在视网膜发育中进行多重分析的方法 | 本文引入了MULTI-Seq技术，通过使用改良的寡核苷酸-脂质复合物标记单个样本，既扩大了单个实验的范围，又显著降低了成本 | NA | 研究视网膜基因调控网络在发育和疾病状态下的功能 | 视网膜的基因表达和染色质可及性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC-Seq | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Multimodal pooled Perturb-CITE-seq screens in patient models define mechanisms of cancer immune evasion
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00779-1
PMID:33649592
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研究论文 | 本文开发了Perturb-CITE-seq技术，通过在患者来源的黑色素瘤细胞和自体肿瘤浸润淋巴细胞共培养体系中进行大规模扰动筛选，揭示了癌症免疫逃逸的机制。 | 首次使用Perturb-CITE-seq技术进行多模态、单细胞水平的扰动筛选，发现了新的免疫逃逸机制，如CD58的丢失。 | NA | 阐明癌症免疫检查点抑制剂抵抗的潜在机制。 | 患者来源的黑色素瘤细胞和自体肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | Perturb-CITE-seq | CRISPR-Cas9 | 单细胞转录组和蛋白质 | 约218,000个细胞，750个与癌症细胞内在的ICI抵抗相关的扰动 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
Whole-organism eQTL mapping at cellular resolution with single-cell sequencing
2021-03-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.65857
PMID:33734084
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research paper | 本文开发了一种新方法，利用单细胞RNA测序在模式线虫中以细胞分辨率映射eQTL，揭示了细胞类型特异性的eQTL热点及其在神经系统中的单细胞特异性效应。 | 本文开发了一种新颖的方法，利用单细胞RNA测序技术在单次实验中以细胞分辨率映射eQTL，揭示了细胞类型特异性和单细胞特异性的eQTL效应。 | NA | 研究基因表达的遗传调控如何影响疾病风险和其他复杂性状的变异。 | 研究细胞类型特异性和单细胞特异性的表达数量性状位点（eQTL）效应。 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 极大量的遗传上不同的个体 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
2021-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00787-0
PMID:33558695
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研究论文 | 本研究利用10x Genomics Visium平台，在人类背外侧前额叶皮质的六个层次中定义了基因表达的空间地形图 | 研究首次在转录组规模上定义了人类背外侧前额叶皮质的空间基因表达地形图，并开发了一个数据驱动的框架来定义空间转录组数据中的无监督聚类 | NA | 旨在探索人类背外侧前额叶皮质的空间基因表达模式及其与神经精神疾病的关联 | 人类背外侧前额叶皮质的基因表达 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Dive into Single, Seek Out Multiple: Probing Cancer Metastases via Single-Cell Sequencing and Imaging Techniques
2021-Mar-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13051067
PMID:33802312
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和成像技术探究癌症转移机制 | 利用单细胞测序技术直接比较转移样本在不同阶段的基因组和转录组变化，以及通过单细胞成像技术实时观察肿瘤微环境中恶性与非恶性细胞的异质行为 | NA | 精确识别、理解和针对推动癌症转移的事件 | 癌症转移机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Time to Move to the Single-Cell Level: Applications of Single-Cell Multi-Omics to Hematological Malignancies and Waldenström's Macroglobulinemia-A Particularly Heterogeneous Lymphoma
2021-Mar-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13071541
PMID:33810569
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在血液系统恶性肿瘤和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的应用 | 单细胞多组学技术能够克服传统批量测序的局限，深入研究肿瘤的来源、发病机制、克隆结构和演化以及治疗抵抗机制 | NA | 探讨单细胞多组学技术在血液系统恶性肿瘤和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的应用潜力 | 血液系统恶性肿瘤和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症 | 数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Model-based deep embedding for constrained clustering analysis of single cell RNA-seq data
2021-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22008-3
PMID:33767149
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research paper | 本文提出了一种名为scDCC的聚类方法，该方法将领域知识整合到单细胞RNA-seq数据的聚类步骤中 | scDCC方法通过整合领域知识，显著提高了聚类性能，增强了聚类的生物学可解释性 | NA | 开发一种能够整合领域知识并提高单细胞RNA-seq数据聚类性能的方法 | 单细胞RNA-seq数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 数千至数万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Supports a Role of CHD8 in Autism
2021-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22063261
PMID:33806835
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术探讨了CHD8基因在自闭症谱系障碍中的作用及其分子和细胞机制 | 利用单细胞RNA测序技术直接量化信息承载的RNA分子，揭示了CHD8基因在自闭症中的作用机制 | 文章指出，尽管有新的发现，但仍需进一步研究以充分挖掘这些变革性技术的潜力 | 探讨CHD8基因在自闭症谱系障碍中的作用及其分子和细胞机制 | CHD8基因在自闭症谱系障碍中的作用 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA分子 | 涉及小鼠新皮质发育和人类大脑类器官的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Spatiotemporal single-cell RNA sequencing of developing chicken hearts identifies interplay between cellular differentiation and morphogenesis
2021-03-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21892-z
PMID:33741943
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，通过数据整合算法研究了鸡心脏从早期到晚期四腔阶段的发展过程 | 本研究首次通过空间映射技术揭示了心脏发育过程中细胞分化与形态发生之间的复杂相互作用 | 本研究未保留组织形态学和细胞间相互作用的空间信息 | 研究鸡心脏发育过程中细胞分化与形态发生的相互作用 | 鸡心脏的细胞系、空间组织及其在发育过程中的相互作用 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Integration and transfer learning of single-cell transcriptomes via cFIT
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2024383118
PMID:33658382
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cFIT的方法，用于整合和转移来自不同实验、技术和物种的单细胞转录组数据 | cFIT方法通过非负矩阵分解框架学习模型参数，能够捕捉不同数据集间的共享信息，并允许每个批次中基因表达的独特扭曲和偏移 | NA | 旨在更好地理解细胞身份和功能，通过整合和转移单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序数据，特别是来自人类和小鼠发育中大脑的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 非负矩阵分解 (NMF) | 转录组数据 | 多个scRNA-seq数据集，涉及不同技术和发育阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptomics reveals lineage trajectory of retinal ganglion cells in wild-type and Atoh7-null retinas
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21704-4
PMID:33674582
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学技术，揭示了野生型和Atoh7缺失型视网膜中视网膜神经节细胞（RGC）的谱系轨迹 | 发现了在Atoh7缺失的情况下，RGC谱系的意外出现，并揭示了视网膜前体细胞（RPCs）在过渡状态下的谱系特异性基因共表达 | NA | 进一步研究转录因子Atoh7、Pou4f2和Isl1在视网膜神经节细胞谱系建立中的作用 | 野生型和Atoh7缺失型视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 野生型和突变型视网膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
Single-cell differential splicing analysis reveals high heterogeneity of liver tumor-infiltrating T cells
2021-03-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-84693-w
PMID:33674641
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研究论文 | 本研究开发了一种新的计算工具DESJ-detection，用于在单细胞水平上准确检测细胞组间的差异表达剪接接头（DESJs），并分析了肝细胞癌中的T细胞 | 首次开发了DESJ-detection工具，用于在单细胞水平上检测差异表达的剪接接头，并发现了新的细胞状态pre-activation | NA | 研究肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的异质性与癌症发生和进展的关系 | 肝细胞癌中的T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 5063个T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Osteoclasts recycle via osteomorphs during RANKL-stimulated bone resorption
2021-03-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.02.002
PMID:33636130
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研究论文 | 本文通过活体成像技术揭示了RANKL刺激下的破骨细胞通过分裂成称为骨形态细胞的子细胞进行细胞再循环的过程 | 发现了破骨细胞在RANKL刺激下的一种新命运，即分裂成骨形态细胞，这一发现挑战了破骨细胞在吸收完成后会凋亡的传统观点 | NA | 探讨破骨细胞在RANKL刺激下的细胞命运及其对骨吸收的影响 | 破骨细胞及其分裂产物骨形态细胞 | NA | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
Exploring the stage-specific roles of Tcf-1 in T cell development and malignancy at single-cell resolution
2021-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00527-1
PMID:32868912
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研究论文 | 本研究通过条件性删除Tcf-1基因，探讨了Tcf-1在T细胞发育和恶性转化中的阶段特异性作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Tcf-1在不同发育阶段对T细胞命运分化的调控机制，并发现了Tcf-1缺乏导致白血病转化的潜在细胞群 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类样本中验证结果 | 揭示Tcf-1在T细胞发育和恶性转化中的具体机制 | Tcf-1在T细胞发育和恶性转化中的作用 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及不同发育阶段的T细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Spage2vec: Unsupervised representation of localized spatial gene expression signatures
2021-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15572
PMID:32976679
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研究论文 | 本文介绍了一种无监督且无需分割的方法spage2vec，用于解析复杂组织在亚细胞分辨率下的空间转录组异质性 | spage2vec通过将组织样本的空间转录组景观表示为图，并利用机器学习图表示技术创建局部空间基因表达的低维表示，无需细胞分割或先验生物学知识 | NA | 开发一种新的方法来解析组织中的空间转录组异质性 | 小鼠大脑数据和数百个单个细胞的空间基因表达数据 | 机器学习 | NA | 机器学习图表示技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠大脑数据来自三种不同的原位转录组测定法，以及包含数百个单个细胞的空间基因表达数据 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Corneal nonmyelinating Schwann cells illuminated by single-cell transcriptomics and visualized by protein biomarkers
2021-03, Journal of neuroscience research
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/jnr.24757
PMID:33197966
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序、显微镜和转基因技术，对中央角膜的非髓鞘化施万细胞（nm-cSCs）进行了特征描述 | 首次通过单细胞RNA测序和其他技术手段，成功识别并验证了nm-cSCs的蛋白质表达，为研究角膜感觉功能提供了新的工具和见解 | NA | 研究中央角膜的非髓鞘化施万细胞（nm-cSCs）的特征，并探索其在神经修复和角膜感觉功能研究中的应用 | 中央角膜的非髓鞘化施万细胞（nm-cSCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自雄性兔子的中央角膜细胞 | NA | NA | NA | NA |