单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptional changes associated with drug tolerance and response to combination therapies in cancer
2021-03-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21884-z
PMID:33712615
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 | 首次展示了癌症细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中存在的多种癌症细胞亚群，并揭示了这些亚群的表观遗传变化和治疗敏感性的差异 | NA | 研究癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 | 癌症细胞的亚群及其对药物的耐受性和敏感性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中的多种癌症细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-08 |
Urinary Single-Cell Profiling Captures the Cellular Diversity of the Kidney
2021-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020050757
PMID:33531352
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析技术，对17份尿液样本中的23,082个细胞进行了分析，揭示了尿液中细胞的多样性及其与肾脏和膀胱细胞的相似性和差异性 | 首次通过单细胞转录组分析技术全面地描述了尿液中细胞的类型和特征 | NA | 生成人类尿液中细胞的参考数据集，并探索尿液中细胞与肾脏和膀胱细胞的关系 | 尿液中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 17份尿液样本，来自5名受试者在不同时间的收集 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-08 |
Single-cell lineage mapping of a diverse virus-specific naive CD4 T cell repertoire
2021-03-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200650
PMID:33201171
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术追踪了病毒特异性CD4 T细胞在淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染下的克隆扩增、分化轨迹和谱系选择 | 首次实现了对自然TCR库中单个初始T细胞克隆扩增、分化和谱系选择的追踪 | NA | 研究病毒特异性CD4 T细胞在感染过程中的克隆扩增、分化和谱系选择 | 病毒特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Identification and Characterization of Zebrafish Tlr4 Coreceptor Md-2
2021-03-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901288
PMID:33472906
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能实验，鉴定并表征了斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2，揭示了其在先天免疫系统中的作用 | 首次在斑马鱼中发现并验证了Md-2的存在，并证明其与Tlr4形成复合体响应LPS，挑战了之前认为斑马鱼缺乏Md-2的观点 | 文章中提到的功能丧失突变对LPS毒性的保护作用有限，表明可能存在其他未知的免疫机制 | 探究斑马鱼中Tlr4共受体Md-2的鉴定与功能，以及其在先天免疫系统中的作用 | 斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2及其在先天免疫系统中的作用 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及11种有颌脊椎动物的基因组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-05 |
Taming human brain organoids one cell at a time
2021-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2020.05.022
PMID:32718852
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review | 本综述总结了单细胞转录组技术在解析人脑类器官复杂性方面的最新方法、进展和挑战 | 文章创新在于整合了单细胞转录组学和新兴技术，以深入研究人脑发展和疾病特征 | 文章没有讨论具体的应用案例和局限性 | 研究人脑类器官的复杂性及其在发育过程中的基因调控 | 人脑类器官，特别是它们的细胞组成和发育起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-05 |
Resident and circulating memory T cells persist for years in melanoma patients with durable responses to immunotherapy
2021-03, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00180-1
PMID:34179824
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研究论文 | 研究了黑色素瘤患者在免疫治疗后持久存在的记忆T细胞。 | 发现了长期存活的记忆T细胞在肿瘤和皮肤中的共享亚群，并且不同部位的克隆型存在相互关系。 | 本研究主要集中在黑色素瘤患者，可能不适用于其他类型癌症的记忆T细胞研究。 | 探讨免疫治疗后黑色素瘤患者的记忆T细胞的持久性 | 多发性黑色素瘤存活者的CD8 T细胞反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序和成对T细胞受体测序 | NA | RNA数据 | 研究涉及的样本数量和类型未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-05 |
Deciphering neural heterogeneity through cell lineage tracing
2021-Mar, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03689-3
PMID:33151389
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综述 | 本文综述了神经细胞谱系追踪的策略及其对理解神经细胞功能克隆关系的作用 | 结合不同的报告蛋白和转基因小鼠，利用新型基因组编辑工具和单细胞测序技术，显著提高了谱系追踪能力 | 对于谱系追踪的复杂性和挑战性仍未提供明确的解决方案 | 探讨细胞谱系在成人大脑发育中的重要性 | 围绕大脑中的细胞谱系和它们的功能克隆关系进行研究 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑工具、单细胞测序 | 转基因小鼠 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into the hematopoietic generation of T-lymphocyte precursors in mouse and human
2021-03, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.12.005
PMID:33454362
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评论 | 该文章综述了小鼠和人类早期T细胞祖细胞的单细胞转录组研究 | 文章揭示了小鼠和人类之间在T细胞发育中的核心程序和物种间的变异 | 研究主要集中于胎儿和严格纯化的后天样本，可能缺乏其他发育阶段的全面性 | 旨在探讨T细胞潜能的分子要求及其早期发展 | 研究对象为小鼠和人类的早期T细胞祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类的胎儿及后天严格纯化的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-05 |
Plasma IL-6 levels following corticosteroid therapy as an indicator of ICU length of stay in critically ill COVID-19 patients
2021-Mar-15, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00429-9
PMID:33723251
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研究论文 | 该研究探讨了在重症COVID-19患者中，皮质类固醇治疗后IL-6水平与ICU住院时长之间的关系 | 首次提出了皮质类固醇后IL-6水平可能与COVID-19严重程度相关的假设 | 样本量较小，仅涉及16名患者 | 探究皮质类固醇治疗后IL-6水平在重症COVID-19患者中的作用 | 重症COVID-19患者，特别是接受类固醇治疗的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本（平行组织扫描的细胞数据） | 16名重症患者接受治疗，41名未接受治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Modelling human blastocysts by reprogramming fibroblasts into iBlastoids
2021-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03372-y
PMID:33731926
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研究论文 | 本文描述了将成纤维细胞重编程为体外三维人类囊胚模型（称为iBlastoids）的方法 | iBlastoids能够模拟囊胚的整体结构，包括内细胞团样结构、外胚层和原始内胚层样细胞、囊胚腔样腔隙以及滋养层样外层细胞，并能产生多能性和滋养层干细胞，模拟植入早期的几个方面 | NA | 开发一个可扩展且易于操作的系统来模拟人类囊胚生物学，以促进早期人类发育的研究 | 人类囊胚的生物学特性 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维模型 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Multiplexed Analysis of Retinal Gene Expression and Chromatin Accessibility using scRNA-Seq and scATAC-Seq
2021-03-12, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62239
PMID:33779599
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研究论文 | 本文介绍了使用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC-Seq技术在视网膜发育中进行多重分析的方法 | 本文引入了MULTI-Seq技术，通过使用改良的寡核苷酸-脂质复合物标记单个样本，既扩大了单个实验的范围，又显著降低了成本 | NA | 研究视网膜基因调控网络在发育和疾病状态下的功能 | 视网膜的基因表达和染色质可及性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单细胞ATAC-Seq | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Multimodal pooled Perturb-CITE-seq screens in patient models define mechanisms of cancer immune evasion
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00779-1
PMID:33649592
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研究论文 | 本文开发了Perturb-CITE-seq技术，通过在患者来源的黑色素瘤细胞和自体肿瘤浸润淋巴细胞共培养体系中进行大规模扰动筛选，揭示了癌症免疫逃逸的机制。 | 首次使用Perturb-CITE-seq技术进行多模态、单细胞水平的扰动筛选，发现了新的免疫逃逸机制，如CD58的丢失。 | NA | 阐明癌症免疫检查点抑制剂抵抗的潜在机制。 | 患者来源的黑色素瘤细胞和自体肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | Perturb-CITE-seq | CRISPR-Cas9 | 单细胞转录组和蛋白质 | 约218,000个细胞，750个与癌症细胞内在的ICI抵抗相关的扰动 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Whole-organism eQTL mapping at cellular resolution with single-cell sequencing
2021-03-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.65857
PMID:33734084
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research paper | 本文开发了一种新方法，利用单细胞RNA测序在模式线虫中以细胞分辨率映射eQTL，揭示了细胞类型特异性的eQTL热点及其在神经系统中的单细胞特异性效应。 | 本文开发了一种新颖的方法，利用单细胞RNA测序技术在单次实验中以细胞分辨率映射eQTL，揭示了细胞类型特异性和单细胞特异性的eQTL效应。 | NA | 研究基因表达的遗传调控如何影响疾病风险和其他复杂性状的变异。 | 研究细胞类型特异性和单细胞特异性的表达数量性状位点（eQTL）效应。 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 极大量的遗传上不同的个体 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Transcriptome-scale spatial gene expression in the human dorsolateral prefrontal cortex
2021-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00787-0
PMID:33558695
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研究论文 | 本研究利用10x Genomics Visium平台，在人类背外侧前额叶皮质的六个层次中定义了基因表达的空间地形图 | 研究首次在转录组规模上定义了人类背外侧前额叶皮质的空间基因表达地形图，并开发了一个数据驱动的框架来定义空间转录组数据中的无监督聚类 | NA | 旨在探索人类背外侧前额叶皮质的空间基因表达模式及其与神经精神疾病的关联 | 人类背外侧前额叶皮质的基因表达 | 数字病理学 | 精神疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Dive into Single, Seek Out Multiple: Probing Cancer Metastases via Single-Cell Sequencing and Imaging Techniques
2021-Mar-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13051067
PMID:33802312
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和成像技术探究癌症转移机制 | 利用单细胞测序技术直接比较转移样本在不同阶段的基因组和转录组变化，以及通过单细胞成像技术实时观察肿瘤微环境中恶性与非恶性细胞的异质行为 | NA | 精确识别、理解和针对推动癌症转移的事件 | 癌症转移机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Time to Move to the Single-Cell Level: Applications of Single-Cell Multi-Omics to Hematological Malignancies and Waldenström's Macroglobulinemia-A Particularly Heterogeneous Lymphoma
2021-Mar-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13071541
PMID:33810569
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在血液系统恶性肿瘤和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的应用 | 单细胞多组学技术能够克服传统批量测序的局限，深入研究肿瘤的来源、发病机制、克隆结构和演化以及治疗抵抗机制 | NA | 探讨单细胞多组学技术在血液系统恶性肿瘤和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的应用潜力 | 血液系统恶性肿瘤和瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症 | 数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Model-based deep embedding for constrained clustering analysis of single cell RNA-seq data
2021-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22008-3
PMID:33767149
|
research paper | 本文提出了一种名为scDCC的聚类方法，该方法将领域知识整合到单细胞RNA-seq数据的聚类步骤中 | scDCC方法通过整合领域知识，显著提高了聚类性能，增强了聚类的生物学可解释性 | NA | 开发一种能够整合领域知识并提高单细胞RNA-seq数据聚类性能的方法 | 单细胞RNA-seq数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 数千至数万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomics Supports a Role of CHD8 in Autism
2021-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22063261
PMID:33806835
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术探讨了CHD8基因在自闭症谱系障碍中的作用及其分子和细胞机制 | 利用单细胞RNA测序技术直接量化信息承载的RNA分子，揭示了CHD8基因在自闭症中的作用机制 | 文章指出，尽管有新的发现，但仍需进一步研究以充分挖掘这些变革性技术的潜力 | 探讨CHD8基因在自闭症谱系障碍中的作用及其分子和细胞机制 | CHD8基因在自闭症谱系障碍中的作用 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA分子 | 涉及小鼠新皮质发育和人类大脑类器官的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Spatiotemporal single-cell RNA sequencing of developing chicken hearts identifies interplay between cellular differentiation and morphogenesis
2021-03-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21892-z
PMID:33741943
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，通过数据整合算法研究了鸡心脏从早期到晚期四腔阶段的发展过程 | 本研究首次通过空间映射技术揭示了心脏发育过程中细胞分化与形态发生之间的复杂相互作用 | 本研究未保留组织形态学和细胞间相互作用的空间信息 | 研究鸡心脏发育过程中细胞分化与形态发生的相互作用 | 鸡心脏的细胞系、空间组织及其在发育过程中的相互作用 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Integration and transfer learning of single-cell transcriptomes via cFIT
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2024383118
PMID:33658382
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cFIT的方法，用于整合和转移来自不同实验、技术和物种的单细胞转录组数据 | cFIT方法通过非负矩阵分解框架学习模型参数，能够捕捉不同数据集间的共享信息，并允许每个批次中基因表达的独特扭曲和偏移 | NA | 旨在更好地理解细胞身份和功能，通过整合和转移单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序数据，特别是来自人类和小鼠发育中大脑的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 非负矩阵分解 (NMF) | 转录组数据 | 多个scRNA-seq数据集，涉及不同技术和发育阶段 | NA | NA | NA | NA |