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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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181 | 2024-08-09 |
The mononuclear phagocyte system contributes to fibrosis in post-transplant obliterans bronchiolitis
2021-03, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00344-2020
PMID:33033147
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research paper | 本研究使用谱系追踪工具追踪或清除异位气管移植模型中潜在的肌成纤维细胞来源,以识别移植后气道纤维闭塞的间充质细胞前体 | 发现受体来源的髓系祖细胞是同种异体移植后气道浸润的间充质细胞的临床相关来源,并提出针对单核吞噬细胞系统的治疗可能改善肺移植后的长期结果 | NA | 识别移植后气道纤维闭塞的间充质细胞前体 | 肌成纤维细胞的来源及其在移植后纤维化过程中的作用 | NA | 肺移植后闭塞性细支气管炎综合征 | 谱系追踪、组织学分析、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞转录组分析 | NA | 组织样本 | NA |
182 | 2024-08-09 |
Senescence of Alveolar Type 2 Cells Drives Progressive Pulmonary Fibrosis
2021-03-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202004-1274OC
PMID:32991815
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研究论文 | 研究探讨了肺泡类型2细胞衰老在特发性肺纤维化(IPF)的启动和进展中的作用,并评估了针对衰老相关通路和衰老细胞的治疗潜力。 | 开发了一种新型的小鼠模型,用于研究条件性肺泡类型2细胞衰老在肺纤维化中的作用,并展示了通过遗传或药物干预靶向p53激活或衰老可以阻止纤维化生成。 | NA | 研究肺泡类型2细胞衰老在特发性肺纤维化中的作用及其治疗潜力。 | 肺泡类型2细胞,特发性肺纤维化患者和对照组的肺组织。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA | 9份对照组近端和远端肺组织,11份IPF纤维化肺组织 |
183 | 2024-08-09 |
Sympathetic Input to Multiple Cell Types in Mouse and Human Colon Produces Region-Specific Responses
2021-03, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.09.030
PMID:32980343
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研究论文 | 研究探讨了交感神经对小鼠和人结肠中多种细胞类型的区域特异性调节作用及其对结肠运动模式的影响 | 首次确定了交感神经对肠肌神经网络大规模活动的影响,并发现交感神经递质可以调节非神经细胞(如肠神经胶质和先天免疫细胞)的活动 | NA | 研究交感神经后节神经元如何调节结肠功能 | 小鼠和人的结肠 | NA | NA | 免疫组织化学、光遗传学(GCaMP钙成像、通道视紫红质)、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | 小鼠和人的结肠样本 |
184 | 2024-08-09 |
Dissecting transcriptional heterogeneity in primary gastric adenocarcinoma by single cell RNA sequencing
2021-03, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2019-320368
PMID:32532891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,系统地描绘了胃腺癌的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了胃腺癌的细胞亚群及其转录特征,并验证了其在公共数据集中的存在 | 仅基于转录组数据进行分析,未涉及其他类型的分子数据 | 揭示胃腺癌的分子和细胞异质性,为精准诊断和预后提供帮助 | 胃腺癌细胞及其转录组 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27677个细胞,来自9个肿瘤和3个非肿瘤样本 |
185 | 2024-08-09 |
A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear cells in end-stage renal disease
2021-03-29, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfz227
PMID:31883338
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,生成了来自健康志愿者和终末期肾病患者的单核细胞转录组图谱,并进行了无监督聚类和注释分析。 | 本研究首次生成了终末期肾病患者外周血单核细胞的高分辨率转录组图谱,并揭示了细胞类型特异性的终末期肾病相关通路和转录因子。 | 由于使用的是混合样本分析,结果的普遍性受到限制。 | 旨在深入了解终末期肾病中免疫异常的机制。 | 终末期肾病患者和健康志愿者的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 终末期肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名健康志愿者和10名终末期肾病患者的外周血单核细胞,共生成12,981和9,578个单细胞转录组。 |
186 | 2024-08-09 |
A Gene Rank Based Approach for Single Cell Similarity Assessment and Clustering
2021 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2019.2931582
PMID:31369384
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因排序的单细胞相似性评估和聚类方法BioRank | BioRank是一种新的细胞相似性评估方法,基于注释基因集和基因排序,能够更好地进行单细胞聚类 | scRNA-seq数据分析面临高噪声、高维度和稀疏性的挑战,且多个潜在因素对基因表达异质性和细胞类型识别能力的影响尚不明确 | 旨在克服scRNA-seq数据分析中的挑战,准确识别不同的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 12个公共scRNA-seq数据集 |