单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Detecting cell-type-specific allelic expression imbalance by integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2021-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009080
PMID:33661921
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研究论文 | 开发了BSCET方法，通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据检测细胞类型特异性等位基因表达失衡 | 首次提出通过整合少量scRNA-seq数据来从大量bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性AEI的方法 | 依赖外部scRNA-seq数据集的质量和代表性，且需要准确的细胞类型组成推断 | 开发检测细胞类型特异性等位基因表达失衡的计算方法 | 等位基因表达失衡与人类疾病的关系 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计模型 | 基因表达数据 | 两个胰岛bulk RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
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研究论文 | 开发了一种名为TWO-SIGMA的新型双组分单细胞模型关联方法，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | 首个能同时处理零膨胀计数、样本内相关性、非平衡设计、多层级协变量并支持广义差异表达检验的单细胞RNA-seq分析方法 | 未明确说明对计算资源的要求和在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更灵活准确的单细胞RNA-seq差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应逻辑回归模型, 混合效应负二项回归模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-311000/v1
PMID:33758834
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析母体SARS-CoV-2感染对晚期妊娠胎儿免疫系统的影响 | 首次在单细胞水平系统描述母体SARS-CoV-2感染引起的胎儿免疫表型变化，发现胎儿TCR受体库扩张等新现象 | 样本量有限，仅针对晚期妊娠感染病例，无法评估早期感染的影响 | 表征母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 | 第三孕期感染SARS-CoV-2母亲的新生儿脐带血单核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 感染组与未感染对照组新生儿脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040509
PMID:33808370
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研究论文 | 本研究通过高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序技术，系统描述了垂体发育和功能中印记基因的动态表达模式 | 首次将印记基因作为一类基因系统研究其在垂体形成和功能中的作用，并揭示了妊娠期母体垂体中印记基因的动态调控 | 垂体在发育阶段体积小且成熟期细胞复杂性高，给获取有用转录组数据带来技术困难 | 阐明印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记障碍的关系 | 哺乳动物垂体腺（包括胚胎期、出生后和妊娠期母体） | 发育生物学 | 印记障碍 | 高灵敏度RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Constellation-Seq的超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术 | 通过分子转录组过滤器实现两个数量级的灵敏度提升，同时减少数据稀疏性和测序成本 | NA | 解决单细胞转录组学中低丰度转录本识别受限的问题 | 外周血单个核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023438118
PMID:33653959
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析疟原虫子孢子发育过程中的基因表达变化 | 首次在单细胞水平揭示疟原虫子孢子发育过程中的转录异质性和严格调控的基因表达变化 | 研究主要关注转录组水平，未直接验证候选基因的功能 | 阐明疟原虫子孢子在蚊子体内发育的分子机制 | 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)子孢子 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16,038个子孢子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.015
PMID:33352111
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析人类发育期造血过程 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq技术分析人类发育期造血过程，识别了三个高增殖性寡能祖细胞群并揭示了表观遗传先于转录的启动现象 | 研究样本仅限于胎儿肝脏和骨髓，样本量相对有限 | 阐明人类发育期造血调控机制 | 人类胎儿肝脏和骨髓中的免疫表型血细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 超过8,000个人类免疫表型血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
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评论 | 本文是对Ranzoni等人关于人类发育造血过程中单细胞RNA测序和ATAC测序整合分析研究的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示科学研究中的同行评审过程 | 人类发育造血研究论文的评审过程 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Population-scale single-cell RNA-seq profiling across dopaminergic neuron differentiation
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00801-6
PMID:33664506
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研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序研究215个人类iPSC系分化为多巴胺能神经元过程中的遗传变异功能 | 开发高效多重策略在三个分化时间点对超过100万个细胞进行单细胞RNA测序，发现46%的eQTL未在GTEx数据库中出现 | 研究仅限于中脑神经命运分化过程，未涵盖其他细胞类型或发育阶段 | 研究常见遗传变异在原发性人类组织和发育过程中的功能 | 215个人类诱导多能干细胞系及其分化的多巴胺能神经元 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 215个iPSC系，超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Identification of resistance pathways and therapeutic targets in relapsed multiple myeloma patients through single-cell sequencing
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01232-w
PMID:33619369
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别复发性多发性骨髓瘤患者的耐药通路和治疗靶点 | 首次将纵向单细胞RNA测序与前瞻性临床试验相结合，揭示了包括低氧耐受、蛋白质折叠和线粒体呼吸在内的新型耐药分子通路，并发现PPIA作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（41例患者），为单臂临床试验设计缺乏对照组 | 研究多发性骨髓瘤耐药机制并识别新的治疗靶点 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者（41例）、健康受试者（11例）和新诊断MM患者（15例） | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例耐药/早期复发患者、11例健康对照、15例新诊断患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type- and artery type-specific vascular remodelling in male spontaneously hypertensive rats
2021-03-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa164
PMID:32589721
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示雄性自发性高血压大鼠血管重塑的细胞类型和动脉类型特异性特征 | 首次在高血压动物模型中系统描绘了抵抗性和传导性动脉的细胞图谱，并以无偏倚方式揭示了动脉类型和细胞类型特异性的基因表达失调 | 研究仅使用雄性自发性高血压大鼠，未涉及雌性模型或人类样本 | 系统表征高血压相关的血管重塑机制 | 自发性高血压大鼠的肠系膜动脉和主动脉 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-07 |
Targeting In Vivo Metabolic Vulnerabilities of Th2 and Th17 Cells Reduces Airway Inflammation
2021-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2001029
PMID:33558372
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研究论文 | 本研究通过靶向Th2和Th17细胞的代谢脆弱性来减轻气道炎症 | 首次揭示Th2和Th17细胞在气道炎症中的代谢依赖性，并证明靶向葡萄糖和谷氨酰胺代谢可增强糖皮质激素疗效 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索Th2和Th17细胞的代谢特性及其在气道炎症中的作用 | 哮喘患者外周血T细胞、小鼠肺部T细胞 | 免疫代谢 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 哮喘患者和健康对照的外周血T细胞，两种小鼠气道炎症模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2024-11-30 |
RNA timestamps identify the age of single molecules in RNA sequencing
2021-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0704-z
PMID:33077959
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA时间戳的方法，用于通过RNA编辑推断RNA测序数据中单个RNA的年龄 | 提出了RNA时间戳方法，通过RNA编辑推断RNA的年龄，并能够推断多个过去的转录事件的时间 | NA | 开发一种新的方法来推断RNA测序数据中单个RNA的年龄，并结合时间信息进行单细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据中的单个RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-11-07 |
Control of the Anterior Pituitary Cell Lineage Regulator POU1F1 by the Stem Cell Determinant Musashi
2021-03-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaa245
PMID:33373440
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研究论文 | 本文研究了脂肪因子瘦素通过调节前垂体细胞系调控因子POU1F1的表达，影响能量稳态的机制 | 首次报道了干细胞标志物Musashi1对POU1F1 mRNA翻译的抑制作用，并揭示了瘦素信号通过逆转Musashi介导的POU1F1 mRNA翻译调控，协调前垂体生长激素细胞功能与代谢状态的机制 | NA | 探讨瘦素信号对前垂体细胞系调控因子POU1F1表达的调控机制 | 前垂体生长激素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 来自对照雌性小鼠的垂体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-09-10 |
A modified vaccinia Ankara vector-based vaccine protects macaques from SARS-CoV-2 infection, immune pathology, and dysfunction in the lungs
2021-03-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.02.001
PMID:33631118
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研究论文 | 研究了基于改良安卡拉痘苗（MVA）载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护作用 | 首次展示了MVA/S疫苗在非人灵长类动物中诱导强效中和抗体和CD8 T细胞反应，并有效保护免受SARS-CoV-2感染和肺部病理损伤 | 研究仅限于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证 | 评估基于MVA载体的疫苗对SARS-CoV-2感染的保护效果 | SARS-CoV-2感染的非人灵长类动物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及小鼠和非人灵长类动物 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-09-10 |
Embryonic lethality and defective mammary gland development of activator-function impaired conditional knock-in Erbb3 V943R mice
2021-Mar, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.10036
PMID:36618440
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研究论文 | 研究了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型的胚胎致死性和乳腺发育缺陷 | 首次报道了ERBB3 V943R条件性敲入小鼠模型，并研究了其对胚胎发育和乳腺发育的影响 | 仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他物种的研究 | 研究ERBB3 V943R突变对小鼠胚胎发育和乳腺发育的影响 | ERBB3 V943R条件性敲入小鼠 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个小鼠样本，具体数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-19 |
Skeleton-vasculature chain reaction: a novel insight into the mystery of homeostasis
2021-Mar-22, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00138-0
PMID:33753717
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综述 | 本文综述了骨和血管之间的内分泌调节回路的新颖性和重要性，并总结了与骨血管相关的研究进展、血管相关骨骼疾病、病理条件及针对血管生成的治疗策略 | 探讨了骨和血管作为内分泌器官的新认识，以及单细胞测序等新技术在揭示这两种组织细胞多样性和可塑性方面的应用 | NA | 阐述骨和血管之间内分泌调节回路的新颖性和重要性，并探讨未来的研究方向 | 骨和血管的内分泌调节机制及其在疾病治疗中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-09 |
Leukocyte dynamics after intracerebral hemorrhage in a living patient reveal rapid adaptations to tissue milieu
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145857
PMID:33749664
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对一名参与微创手术联合溶栓治疗脑内出血试验的患者进行了血液和脑血肿流出物的纵向分析，揭示了脑内出血后白细胞的动态适应性变化 | 首次在单细胞分辨率下描述了活体患者脑内出血期间的局部细胞反应 | 仅基于单一病例的研究，可能缺乏普遍性 | 探索脑内出血后脑部免疫反应的动态变化 | 脑内出血患者的血液和脑血肿流出物 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Healthy and Diseased Brain: Insights from Single-Cell Omics
2021-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22063027
PMID:33809675
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术研究了健康和疾病状态下大脑中微胶质细胞的多样性 | 利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术，揭示了微胶质细胞在生理和病理条件下的未被发现的异质性 | NA | 总结单细胞组学研究在微胶质细胞功能多样性方面的发现，并探讨其在未来免疫调节治疗设计中的重要性 | 大脑中的微胶质细胞及其在健康和疾病状态下的多样性 | NA | 神经退行性疾病，中风，抑郁症，脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102151
PMID:33585804
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研究论文 | 研究报道了SARS-CoV-2感染的人类细胞系的基因表达谱，并识别出HSP90作为COVID-19治疗的目标 | 首次揭示了SARS-CoV-2在人类上皮细胞系Calu-3中引发的大约两倍于SARS-CoV的固有免疫反应刺激，并通过单细胞RNA测序分析了病毒感染细胞的基因表达模式 | NA | 深入了解SARS-CoV-2感染的分子生物学机制，包括病毒复制、宿主反应和疾病进展 | SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系，以及HSP90在感染中的作用 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三个SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系 | NA | NA | NA | NA |