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当前共找到 186 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-06-02
Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 综述脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的门控作用及其在疾病中的潜在治疗靶点 通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法,识别出构成功能性微环路的抑制性中间神经元的不同亚群 未提及具体局限性 理解抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式和功能,为治疗感觉和运动障碍提供潜在靶点 脊髓抑制性中间神经元 神经科学 感觉障碍、运动障碍 单细胞转录组学、转基因操作 NA 文献综述 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-05-29
Schistosoma mansoni venom allergen-like protein 6 (SmVAL6) maintains tegumental barrier function
2021-03, International journal for parasitology IF:3.7Q1
研究论文 本研究首次揭示了曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6 (SmVAL6) 在维持表皮屏障功能中的关键作用 首次提供第二组SmVAL在血吸虫生物学中具有必要功能的实验证据,并鉴定出与其直接相互作用的蛋白伴侣 未进行体内功能验证,且对其他第二组SmVAL家族成员的功能研究仍缺乏 探究第二组SmVAL家族成员SmVAL6在血吸虫生物学中的具体功能 曼氏血吸虫成虫及其卵细胞 NA 寄生虫病 RNA干扰、酵母双杂交、单细胞RNA测序、原位杂交 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 未具体说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3 2026-05-25
Chromosome 8 gain is associated with high-grade transformation in MPNST
2021-03-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过患者来源的异种移植物模型研究恶性外周神经鞘瘤中8号染色体获得与高级别转化的关联 首次在MPNST中鉴定出8号染色体获得是复发性基因组事件,并通过PDX、FISH和单细胞测序进行验证,发现其与软组织肉瘤的较差总生存率相关 未明确说明研究的局限性 理解MPNST的基因组异质性并建立包含该异质性的临床前模型 NF1相关恶性外周神经鞘瘤及其患者来源的异种移植物 基因组学 神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤 拷贝数分析、全外显子组测序、RNA测序、FISH、单细胞测序 NA 基因组数据、RNA测序数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞测序 NA NA
4 2026-05-25
Tristetraprolin expression by keratinocytes protects against skin carcinogenesis
2021-03-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了角质形成细胞中三脯氨酸锌指蛋白(TTP)的表达对皮肤癌发生的保护作用 首次通过调控过表达和条件性敲除模型,证明TTP在皮肤化学致癌过程中是关键调控因子,并识别出Areg为TTP在角质形成细胞中的直接靶点 未提及具体局限性 探究TTP在皮肤肿瘤发生中的调控作用及机制 小鼠皮肤角质形成细胞及人类恶性角质形成细胞 数字病理学 皮肤癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5 2026-05-24
A single-cell atlas of the healthy breast tissues reveals clinically relevant clusters of breast epithelial cells
2021-03-16, Cell reports. Medicine
研究论文 通过对健康女性乳腺活检组织进行单细胞RNA测序,创建了健康乳腺组织细胞图谱,并发现了23个乳腺上皮细胞簇,揭示了这些细胞簇与乳腺癌亚型的临床相关性 首次利用健康女性乳腺活检样本(而非传统上组织学异常的乳房缩小术样本)进行单细胞RNA测序,并鉴定了23个乳腺上皮细胞簇;揭示了成熟管腔细胞簇和管腔祖细胞簇基因特征在乳腺癌中的不同富集模式及其预后意义 未明确提及,但可推测可能包括样本量有限、单细胞测序技术本身的局限性、以及细胞簇标记基因的验证不足等 利用单细胞RNA测序技术构建健康乳腺组织的细胞图谱,探究乳腺上皮细胞簇与乳腺癌亚型及预后的关联 健康女性的乳腺活检组织样本以及约3000例乳腺癌转录组数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 健康乳腺活检样本(未明确数量)及约3000例乳腺癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-05-23
scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2021-03-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种新颖的图神经网络框架scGNN用于单细胞RNA测序数据分析,在基因归集和细胞聚类方面表现优异 首次将图神经网络与左截断混合高斯模型结合,通过迭代多模态自编码器实现无假设的scRNA-Seq分析,有效处理测序稀疏性和基因表达异质性 未在更大规模或更多样化的数据集上验证,计算效率可能随细胞数量增加而下降 开发一种通用的图神经网络框架以改进单细胞RNA测序数据分析中的基因归集和细胞聚类 四个基准单细胞RNA测序数据集,以及来自阿尔茨海默症死后脑组织的13,214个单细胞核 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) 图神经网络(GNN)、自编码器、左截断混合高斯模型 基因表达数据 四个基准数据集,以及13,214个单细胞核(阿尔茨海默症研究) NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-05-22
Circadian clock genes promote glioma progression by affecting tumour immune infiltration and tumour cell proliferation
2021-Mar, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 探讨昼夜节律时钟基因通过影响肿瘤免疫浸润和肿瘤细胞增殖促进胶质瘤进展的机制 首次系统揭示昼夜节律时钟基因失调与胶质瘤进展的关系,并建立基于时钟基因表达的风险预测模型 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要更多体内和临床样本验证 研究昼夜节律时钟基因失调对胶质瘤进展的影响及其潜在机制 胶质瘤患者样本及其肿瘤组织 机器学习 胶质瘤 单细胞RNA测序, RNA-seq LASSO回归 基因表达数据, 临床数据 训练集672个样本,4个验证集共1570个样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
8 2026-05-22
Single-cell transcriptome analysis revealed the heterogeneity and microenvironment of gastrointestinal stromal tumors
2021-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 对胃肠道间质瘤患者的肿瘤内外组织进行单细胞RNA测序,揭示了肿瘤细胞异质性及其与微环境中其他细胞相互作用的全景图 首次在单细胞水平上系统描绘了GIST肿瘤微环境的细胞组成和异质性,发现了两类具有不同增殖和转移风险的肿瘤细胞亚群,并揭示了脂肪内皮细胞与肿瘤细胞的高相互作用以及巨噬细胞在微环境中的核心地位 未明确说明局限性 探索胃肠道间质瘤中肿瘤细胞的异质性及其与微环境其他细胞的相互作用 胃肠道间质瘤患者的肿瘤内外组织样本 数字病理 胃肠道间质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 65个GIST样本用于RNA-seq验证,单细胞数据来自多个GIST患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-05-16
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文介绍了Constellation-Seq,一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术,能显著提高灵敏度并降低成本 实现两个数量级的灵敏度提升,通过最大化读取利用率减少数据稀疏性和测序成本 仅展示了在外周血单核细胞样本中的应用,未提及对多种复杂组织的验证 开发一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤方法,用于稀缺转录本识别和下游分析 外周血单核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,Constellation-Seq NA 单细胞转录组数据 外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10 2026-05-16
Input-output signal processing plasticity of vagal motor neurons in response to cardiac ischemic injury
2021-Mar-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示迷走神经背侧运动核神经元在心脏缺血损伤中的输入-输出信号处理可塑性 首次揭示稳态下DMV神经元可组织为可区分的输入-输出信号处理单元,并发现远程缺血预适应和慢性心脏缺血损伤诱导的神经元状态转变及其相关的调控microRNA变化 研究仅限于DMV神经元,且样本量可能有限,未能涵盖所有相关脑区或长期动态变化 探索DMV神经元的分子表型及其在心脏缺血损伤中的可塑性,为生物电子医学提供新靶点 数百个DMV神经元(稳态及生理扰动后) 自然语言处理 心血管疾病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 数百个DMV神经元(稳态及生理扰动后) NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-05-16
Isolation of human ESC-derived cardiac derivatives and embryonic heart cells for population and single-cell RNA-seq analysis
2021-03-19, STAR protocols IF:1.3Q4
protocol 描述了一种结合人口和单细胞RNA测序分析,从人胚胎干细胞分化和发育组织中分离心脏衍生物和胚胎心脏细胞的方法 结合群体和单细胞RNA测序分析,利用hESC分化和发育组织建立器官特异性细胞和分子图谱 NA 建立人胚胎发生中器官特异性细胞和分子图谱 人胚胎干细胞分化的心脏衍生物和人类胚胎心脏细胞 NA NA RNA-seq, Smart-seq2 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 群体RNA-seq NA NA
12 2026-05-11
Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8+ T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma
2021-Mar-26, Molecular therapy oncolytics IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性,并识别潜在治疗靶点 首次在黑色素瘤中系统描述了7个CD8+ T细胞亚群的异质性,并发现耗竭性CD8+ T细胞亚群2中的三个过表达基因(、、)可作为新型治疗靶点 研究基于已发表数据,未涉及实验验证;样本量可能有限;靶点的临床前验证尚未进行 探索黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 黑色素瘤样本中的CD8+ T细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-05-11
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 基于单细胞RNA测序数据构建基因调控网络,解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性 通过整合基因共表达和转录因子结合基序富集分析,为每个亚型构建基因调控网络,并基于中心性指标识别关键基因 未提及样本量大小及其他潜在局限性 利用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络,以解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性并识别关键基因 三阴性乳腺癌患者的恶性细胞亚型 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序 PAM50分型模型 单细胞转录组数据 未提供具体样本量 双歧杆菌 单细胞RNA测序 双歧杆菌 双歧杆菌
14 2026-04-06
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α(ERα)在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响,并证明ERα在此过程中的关键介导作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 小鼠 单细胞测序 乳腺癌 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-02-22
Pluripotent stem cell-derived models of neurological diseases reveal early transcriptional heterogeneity
2021-03-04, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究通过分析神经退行性疾病患者的单细胞RNA测序数据,揭示了疾病状态下神经元转录异质性的增加,并利用诱导多能干细胞模型验证了这一早期现象 首次在神经退行性疾病模型中系统性地展示了转录异质性在疾病早期阶段的增加,并关联到具体的基因功能类别如自噬和能量代谢 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经退行过程 探究神经退行性疾病早期阶段的转录调控变化及其诊断价值 阿尔茨海默病和亨廷顿病患者的神经元细胞,以及诱导多能干细胞分化的神经元祖细胞 单细胞组学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 诱导多能干细胞分化模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2025-10-06
Detecting cell-type-specific allelic expression imbalance by integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2021-03, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 开发了BSCET方法,通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据检测细胞类型特异性等位基因表达失衡 首次提出通过整合少量scRNA-seq数据来从大量bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性AEI的方法 依赖外部scRNA-seq数据集的质量和代表性,且需要准确的细胞类型组成推断 开发检测细胞类型特异性等位基因表达失衡的计算方法 等位基因表达失衡与人类疾病的关系 生物信息学 2型糖尿病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 统计模型 基因表达数据 两个胰岛bulk RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
17 2025-10-06
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology IF:1.7Q3
研究论文 开发了一种名为TWO-SIGMA的新型双组分单细胞模型关联方法,用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 首个能同时处理零膨胀计数、样本内相关性、非平衡设计、多层级协变量并支持广义差异表达检验的单细胞RNA-seq分析方法 未明确说明对计算资源的要求和在大规模数据集上的可扩展性 开发更灵活准确的单细胞RNA-seq差异表达分析方法 单细胞RNA-seq数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 混合效应逻辑回归模型, 混合效应负二项回归模型 基因表达计数数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
18 2025-10-06
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析母体SARS-CoV-2感染对晚期妊娠胎儿免疫系统的影响 首次在单细胞水平系统描述母体SARS-CoV-2感染引起的胎儿免疫表型变化,发现胎儿TCR受体库扩张等新现象 样本量有限,仅针对晚期妊娠感染病例,无法评估早期感染的影响 表征母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 第三孕期感染SARS-CoV-2母亲的新生儿脐带血单核细胞 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据 感染组与未感染对照组新生儿脐带血样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
19 2025-10-06
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统描述了垂体发育和功能中印记基因的动态表达模式 首次将印记基因作为一类基因系统研究其在垂体形成和功能中的作用,并揭示了妊娠期母体垂体中印记基因的动态调控 垂体在发育阶段体积小且成熟期细胞复杂性高,给获取有用转录组数据带来技术困难 阐明印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记障碍的关系 哺乳动物垂体腺(包括胚胎期、出生后和妊娠期母体) 发育生物学 印记障碍 高灵敏度RNA测序,单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA RNA-seq,单细胞RNA测序 NA NA
20 2025-10-06
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术分析疟原虫子孢子发育过程中的基因表达变化 首次在单细胞水平揭示疟原虫子孢子发育过程中的转录异质性和严格调控的基因表达变化 研究主要关注转录组水平,未直接验证候选基因的功能 阐明疟原虫子孢子在蚊子体内发育的分子机制 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)子孢子 单细胞组学 疟疾 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16,038个子孢子 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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