单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 186 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Resolving cellular systems by ultra-sensitive and economical single-cell transcriptome filtering
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102147
PMID:33665566
|
研究论文 | 本文介绍了Constellation-Seq，一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤技术，能显著提高灵敏度并降低成本 | 实现两个数量级的灵敏度提升，通过最大化读取利用率减少数据稀疏性和测序成本 | 仅展示了在外周血单核细胞样本中的应用，未提及对多种复杂组织的验证 | 开发一种超灵敏且经济的单细胞转录组过滤方法，用于稀缺转录本识别和下游分析 | 外周血单核细胞样本中的稀有树突状细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，Constellation-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-16 |
Input-output signal processing plasticity of vagal motor neurons in response to cardiac ischemic injury
2021-Mar-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102143
PMID:33665562
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示迷走神经背侧运动核神经元在心脏缺血损伤中的输入-输出信号处理可塑性 | 首次揭示稳态下DMV神经元可组织为可区分的输入-输出信号处理单元，并发现远程缺血预适应和慢性心脏缺血损伤诱导的神经元状态转变及其相关的调控microRNA变化 | 研究仅限于DMV神经元，且样本量可能有限，未能涵盖所有相关脑区或长期动态变化 | 探索DMV神经元的分子表型及其在心脏缺血损伤中的可塑性，为生物电子医学提供新靶点 | 数百个DMV神经元（稳态及生理扰动后） | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数百个DMV神经元（稳态及生理扰动后） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-16 |
Isolation of human ESC-derived cardiac derivatives and embryonic heart cells for population and single-cell RNA-seq analysis
2021-03-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100339
PMID:33644774
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protocol | 描述了一种结合人口和单细胞RNA测序分析，从人胚胎干细胞分化和发育组织中分离心脏衍生物和胚胎心脏细胞的方法 | 结合群体和单细胞RNA测序分析，利用hESC分化和发育组织建立器官特异性细胞和分子图谱 | NA | 建立人胚胎发生中器官特异性细胞和分子图谱 | 人胚胎干细胞分化的心脏衍生物和人类胚胎心脏细胞 | NA | NA | RNA-seq, Smart-seq2 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 群体RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8+ T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma
2021-Mar-26, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2020.12.003
PMID:33575475
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性，并识别潜在治疗靶点 | 首次在黑色素瘤中系统描述了7个CD8+ T细胞亚群的异质性，并发现耗竭性CD8+ T细胞亚群2中的三个过表达基因（、、）可作为新型治疗靶点 | 研究基于已发表数据，未涉及实验验证；样本量可能有限；靶点的临床前验证尚未进行 | 探索黑色素瘤中CD8+ T细胞亚群的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤样本中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.12.018
PMID:33575114
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性 | 通过整合基因共表达和转录因子结合基序富集分析，为每个亚型构建基因调控网络，并基于中心性指标识别关键基因 | 未提及样本量大小及其他潜在局限性 | 利用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，以解析三阴性乳腺癌的瘤内异质性并识别关键基因 | 三阴性乳腺癌患者的恶性细胞亚型 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | PAM50分型模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本量 | 双歧杆菌 | 单细胞RNA测序 | 双歧杆菌 | 双歧杆菌 |
| 6 | 2026-04-06 |
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63333
PMID:33647234
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α（ERα）在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响，并证明ERα在此过程中的关键介导作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 | 小鼠 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-02-22 |
Pluripotent stem cell-derived models of neurological diseases reveal early transcriptional heterogeneity
2021-03-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02301-6
PMID:33663567
|
研究论文 | 本研究通过分析神经退行性疾病患者的单细胞RNA测序数据，揭示了疾病状态下神经元转录异质性的增加，并利用诱导多能干细胞模型验证了这一早期现象 | 首次在神经退行性疾病模型中系统性地展示了转录异质性在疾病早期阶段的增加，并关联到具体的基因功能类别如自噬和能量代谢 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经退行过程 | 探究神经退行性疾病早期阶段的转录调控变化及其诊断价值 | 阿尔茨海默病和亨廷顿病患者的神经元细胞，以及诱导多能干细胞分化的神经元祖细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Detecting cell-type-specific allelic expression imbalance by integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2021-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009080
PMID:33661921
|
研究论文 | 开发了BSCET方法，通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据检测细胞类型特异性等位基因表达失衡 | 首次提出通过整合少量scRNA-seq数据来从大量bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性AEI的方法 | 依赖外部scRNA-seq数据集的质量和代表性，且需要准确的细胞类型组成推断 | 开发检测细胞类型特异性等位基因表达失衡的计算方法 | 等位基因表达失衡与人类疾病的关系 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计模型 | 基因表达数据 | 两个胰岛bulk RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
|
研究论文 | 开发了一种名为TWO-SIGMA的新型双组分单细胞模型关联方法，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | 首个能同时处理零膨胀计数、样本内相关性、非平衡设计、多层级协变量并支持广义差异表达检验的单细胞RNA-seq分析方法 | 未明确说明对计算资源的要求和在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更灵活准确的单细胞RNA-seq差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合效应逻辑回归模型, 混合效应负二项回归模型 | 基因表达计数数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-311000/v1
PMID:33758834
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析母体SARS-CoV-2感染对晚期妊娠胎儿免疫系统的影响 | 首次在单细胞水平系统描述母体SARS-CoV-2感染引起的胎儿免疫表型变化，发现胎儿TCR受体库扩张等新现象 | 样本量有限，仅针对晚期妊娠感染病例，无法评估早期感染的影响 | 表征母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 | 第三孕期感染SARS-CoV-2母亲的新生儿脐带血单核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 感染组与未感染对照组新生儿脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040509
PMID:33808370
|
研究论文 | 本研究通过高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序技术，系统描述了垂体发育和功能中印记基因的动态表达模式 | 首次将印记基因作为一类基因系统研究其在垂体形成和功能中的作用，并揭示了妊娠期母体垂体中印记基因的动态调控 | 垂体在发育阶段体积小且成熟期细胞复杂性高，给获取有用转录组数据带来技术困难 | 阐明印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记障碍的关系 | 哺乳动物垂体腺（包括胚胎期、出生后和妊娠期母体） | 发育生物学 | 印记障碍 | 高灵敏度RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Transcriptional heterogeneity and tightly regulated changes in gene expression during Plasmodium berghei sporozoite development
2021-03-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023438118
PMID:33653959
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析疟原虫子孢子发育过程中的基因表达变化 | 首次在单细胞水平揭示疟原虫子孢子发育过程中的转录异质性和严格调控的基因表达变化 | 研究主要关注转录组水平，未直接验证候选基因的功能 | 阐明疟原虫子孢子在蚊子体内发育的分子机制 | 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei)子孢子 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16,038个子孢子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.015
PMID:33352111
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序分析人类发育期造血过程 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq技术分析人类发育期造血过程，识别了三个高增殖性寡能祖细胞群并揭示了表观遗传先于转录的启动现象 | 研究样本仅限于胎儿肝脏和骨髓，样本量相对有限 | 阐明人类发育期造血调控机制 | 人类胎儿肝脏和骨髓中的免疫表型血细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 染色质可及性数据 | 超过8,000个人类免疫表型血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
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评论 | 本文是对Ranzoni等人关于人类发育造血过程中单细胞RNA测序和ATAC测序整合分析研究的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示科学研究中的同行评审过程 | 人类发育造血研究论文的评审过程 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Population-scale single-cell RNA-seq profiling across dopaminergic neuron differentiation
2021-03, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-021-00801-6
PMID:33664506
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研究论文 | 通过大规模单细胞RNA测序研究215个人类iPSC系分化为多巴胺能神经元过程中的遗传变异功能 | 开发高效多重策略在三个分化时间点对超过100万个细胞进行单细胞RNA测序，发现46%的eQTL未在GTEx数据库中出现 | 研究仅限于中脑神经命运分化过程，未涵盖其他细胞类型或发育阶段 | 研究常见遗传变异在原发性人类组织和发育过程中的功能 | 215个人类诱导多能干细胞系及其分化的多巴胺能神经元 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 215个iPSC系，超过100万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Identification of resistance pathways and therapeutic targets in relapsed multiple myeloma patients through single-cell sequencing
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01232-w
PMID:33619369
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别复发性多发性骨髓瘤患者的耐药通路和治疗靶点 | 首次将纵向单细胞RNA测序与前瞻性临床试验相结合，揭示了包括低氧耐受、蛋白质折叠和线粒体呼吸在内的新型耐药分子通路，并发现PPIA作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（41例患者），为单臂临床试验设计缺乏对照组 | 研究多发性骨髓瘤耐药机制并识别新的治疗靶点 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者（41例）、健康受试者（11例）和新诊断MM患者（15例） | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例耐药/早期复发患者、11例健康对照、15例新诊断患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type- and artery type-specific vascular remodelling in male spontaneously hypertensive rats
2021-03-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa164
PMID:32589721
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示雄性自发性高血压大鼠血管重塑的细胞类型和动脉类型特异性特征 | 首次在高血压动物模型中系统描绘了抵抗性和传导性动脉的细胞图谱，并以无偏倚方式揭示了动脉类型和细胞类型特异性的基因表达失调 | 研究仅使用雄性自发性高血压大鼠，未涉及雌性模型或人类样本 | 系统表征高血压相关的血管重塑机制 | 自发性高血压大鼠的肠系膜动脉和主动脉 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过20,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
Targeting In Vivo Metabolic Vulnerabilities of Th2 and Th17 Cells Reduces Airway Inflammation
2021-03-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2001029
PMID:33558372
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研究论文 | 本研究通过靶向Th2和Th17细胞的代谢脆弱性来减轻气道炎症 | 首次揭示Th2和Th17细胞在气道炎症中的代谢依赖性，并证明靶向葡萄糖和谷氨酰胺代谢可增强糖皮质激素疗效 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索Th2和Th17细胞的代谢特性及其在气道炎症中的作用 | 哮喘患者外周血T细胞、小鼠肺部T细胞 | 免疫代谢 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 哮喘患者和健康对照的外周血T细胞，两种小鼠气道炎症模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2024-11-30 |
RNA timestamps identify the age of single molecules in RNA sequencing
2021-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0704-z
PMID:33077959
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA时间戳的方法，用于通过RNA编辑推断RNA测序数据中单个RNA的年龄 | 提出了RNA时间戳方法，通过RNA编辑推断RNA的年龄，并能够推断多个过去的转录事件的时间 | NA | 开发一种新的方法来推断RNA测序数据中单个RNA的年龄，并结合时间信息进行单细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据中的单个RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-11-07 |
Control of the Anterior Pituitary Cell Lineage Regulator POU1F1 by the Stem Cell Determinant Musashi
2021-03-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaa245
PMID:33373440
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研究论文 | 本文研究了脂肪因子瘦素通过调节前垂体细胞系调控因子POU1F1的表达，影响能量稳态的机制 | 首次报道了干细胞标志物Musashi1对POU1F1 mRNA翻译的抑制作用，并揭示了瘦素信号通过逆转Musashi介导的POU1F1 mRNA翻译调控，协调前垂体生长激素细胞功能与代谢状态的机制 | NA | 探讨瘦素信号对前垂体细胞系调控因子POU1F1表达的调控机制 | 前垂体生长激素细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 来自对照雌性小鼠的垂体细胞 | NA | NA | NA | NA |