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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2024-08-09 |
Reshaping the Immune Microenvironment by Oncolytic Herpes Simplex Virus in Murine Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021-02-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.10.027
PMID:33130310
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研究论文 | 本研究通过建立免疫活性同基因的胰腺导管腺癌模型,探讨了溶瘤单纯疱疹病毒-1(oHSV)对肿瘤微环境(TME)免疫细胞组成的影响 | oHSV通过下调肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),尤其是抗炎性巨噬细胞,并增加肿瘤浸润淋巴细胞的比例,包括激活的细胞毒性CD8 T细胞和T辅助(Th)1细胞,从而重塑PDAC的TME,增强免疫活性 | NA | 研究oHSV在胰腺导管腺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境(TME) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多色荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 细胞 | 涉及携带肿瘤的小鼠 |
142 | 2024-08-09 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
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研究论文 | 介绍了一种基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序TransSynW,用于预测用户指定细胞群体的细胞转换转录因子(TFs) | TransSynW优先考虑预测转换TFs中的先驱因子,以促进细胞转换时常需的染色质开放,并预测标记基因以评估细胞转换实验的性能 | NA | 开发一种计算工具,帮助研究人员利用单细胞RNA测序数据生成所需的功能性细胞 | 细胞转换转录因子(TFs)和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
143 | 2024-08-09 |
Exploring cardiac macrophage heterogeneity in the healthy and diseased myocardium
2021-02, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2020.09.005
PMID:33128959
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研究论文 | 本文探讨了健康和病变心肌中心脏巨噬细胞的异质性,利用遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术,提供了一个概念框架来评估心脏巨噬细胞的复杂性。 | 本文采用了遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术,超越了传统的M1/M2分类,更细致地解析了巨噬细胞的异质性。 | 文章讨论了当前对心脏巨噬细胞多样性理解的局限性,特别是在缺血性损伤、高血压和心肌炎中的应用。 | 提供一个起点,帮助研究人员解析已知心脏巨噬细胞亚群的功能。 | 心脏巨噬细胞的异质性和其在健康及病变心肌中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
144 | 2024-08-09 |
Holistic characterization of single-hepatocyte transcriptome responses to high-fat diet
2021-02-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00391.2020
PMID:33103450
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研究论文 | 本研究使用基于液滴的单细胞RNA测序技术,分析了在高脂饮食下,单个肝细胞的转录组变化,特别是在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中的响应 | 首次详细描述了肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组变化,包括区域依赖性和非依赖性的效应 | 研究仅限于肝细胞,未涉及其他非实质细胞类型 | 探讨肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组响应 | 肝细胞在高脂饮食和NAFLD中的转录组变化 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 基于液滴的单细胞RNA测序(Drop-seq) | NA | 转录组数据 | 多个肝细胞样本 |
145 | 2024-08-09 |
CKS2 modulates cell-cycle progression of tongue squamous cell carcinoma cells partly via modulating the cellular distribution of DUTPase
2021-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13116
PMID:33107644
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研究论文 | 本文探讨了CKS2基因在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞周期进程的调控作用,特别是通过调节DUTPase的细胞分布。 | 首次研究了CKS2在舌鳞状细胞癌中的表达模式及其对疾病特异性生存和无进展生存的影响。 | 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析,缺乏临床干预实验。 | 探究CKS2在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞周期和患者生存的影响。 | 舌鳞状细胞癌组织和细胞。 | 数字病理学 | 口腔癌 | bulk-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 舌鳞状细胞癌组织样本128例,正常组织样本13例。 |
146 | 2024-08-09 |
Isolation of high-yield and -quality RNA from human precision-cut lung slices for RNA-sequencing and computational integration with larger patient cohorts
2021-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00401.2020
PMID:33112185
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研究论文 | 本研究介绍了一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的新方法,适用于RNA测序和计算分析。 | 提出了一种从少量组织中提取高质量RNA的新方法,适用于疾病组织如特发性肺纤维化,并展示了其适用于RNA-seq分析和计算管道。 | NA | 开发一种从人类精确切割肺切片中提取高质量RNA的方法,以支持下一代测序技术在非偏倚和高通量分析中的应用。 | 人类精确切割肺切片中的高质量RNA提取。 | 数字病理学 | 肺疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 少量组织,包括疾病组织如特发性肺纤维化 |
147 | 2024-08-09 |
Transcriptional heterogeneity of clonal plasma cells and immune evasion in immunoglobulin light chain amyloidosis
2021-Feb, International journal of hematology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s12185-020-03016-3
PMID:33040275
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了免疫球蛋白轻链淀粉样变性(AL淀粉样变性)患者的浆细胞(PCs)的转录异质性和免疫逃避机制 | 发现了AL淀粉样变性患者克隆浆细胞中MHC I类分子的过度表达和自然杀伤(NK)细胞频率的显著降低 | 研究样本量较小,仅包括四名AL淀粉样变性患者、一名治疗后的AL患者和六名健康对照 | 探讨AL淀粉样变性患者浆细胞的转录异质性和免疫逃避机制 | AL淀粉样变性患者的浆细胞和免疫系统 | 数字病理学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名AL淀粉样变性患者、一名治疗后的AL患者和六名健康对照 |
148 | 2024-08-09 |
Recent developments in the pathobiology of lung myofibroblasts
2021-02, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2021.1829972
PMID:32981357
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综述 | 本文综述了过去五年内关于肺肌成纤维细胞的定义、起源、活性调控及靶向治疗肺纤维化的最新进展 | 通过改进细胞谱系特征和单细胞RNA测序技术,对肺肌成纤维细胞的起源和间质异质性有了更清晰的认识 | NA | 深入理解肺纤维化的发病机制并探索针对肺肌成纤维细胞的治疗策略 | 肺肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 | NA | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | NA | NA |
149 | 2024-08-09 |
In Vivo Generation of Lung and Thyroid Tissues from Embryonic Stem Cells Using Blastocyst Complementation
2021-02-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201909-1836OC
PMID:32877203
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研究论文 | 本文通过胚胎互补技术,利用胚胎干细胞在体内生成肺和甲状腺组织 | 首次通过定向分化胚胎干细胞生成包含气道、肺泡、血管和基质的肺功能组织 | 技术挑战限制了生成高度分化的细胞以维持肺功能 | 探索胚胎干细胞在体内生成肺组织的能力 | 胚胎干细胞和缺乏肺组织的胚胎 | NA | NA | 胚胎互补技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 使用了正常的小鼠胚胎干细胞和缺乏肺组织的胚胎 |
150 | 2024-08-09 |
Effects of vitrification and cryostorage duration on single-cell RNA-Seq profiling of vitrified-thawed human metaphase II oocytes
2021-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-020-0792-7
PMID:32876878
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研究论文 | 研究玻璃化和冷冻储存时间对人类中期II期卵母细胞单细胞RNA-Seq分析的影响 | 首次探讨了玻璃化程序和相关冷冻储存时间对人类中期II期卵母细胞转录组的影响 | 样本量较小,仅涉及四名女性,可能影响结果的普遍性 | 探究玻璃化程序及其冷冻储存时间对人类卵母细胞转录组的影响 | 人类中期II期卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 共分析了3个新鲜卵母细胞和13个存活下来的玻璃化解冻卵母细胞 |
151 | 2024-08-09 |
Defining the Skin Cellular Community Using Single-Cell Genomics to Advance Precision Medicine
2021-02, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.05.104
PMID:32713511
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在皮肤细胞群研究中的应用,特别是通过单细胞RNA测序技术,以推动精准医学的发展 | 单细胞基因组学技术使得对人类组织中不同细胞类型的角色和功能进行高分辨率分析成为可能,为理解细胞通路和相互作用提供了新的视角 | 文章指出,尽管单细胞RNA测序技术具有显著优势,但在实际应用中仍面临实现有意义结果的挑战 | 研究旨在通过单细胞基因组学技术深入理解皮肤细胞群,推动精准医学的进步 | 研究对象为皮肤细胞,包括健康和疾病状态下的皮肤细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
152 | 2024-08-09 |
"Zooming in" on Glioblastoma: Understanding Tumor Heterogeneity and its Clinical Implications in the Era of Single-Cell Ribonucleic Acid Sequencing
2021-02-16, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/neuros/nyaa305
PMID:32674143
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术深入探讨了胶质母细胞瘤的异质性及其临床意义 | 引入了单细胞RNA测序技术,以更详细地理解胶质母细胞瘤的异质性 | NA | 探讨胶质母细胞瘤的异质性及其对个性化医疗的影响 | 胶质母细胞瘤的基因组和转录组异质性 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
153 | 2024-08-09 |
Immune cell infiltration features and related marker genes in lung cancer based on single-cell RNA-seq
2021-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-020-02435-2
PMID:32656582
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了肺癌中的免疫细胞浸润特征及相关标记基因 | 揭示了肺癌组织与正常组织中免疫细胞类型的显著差异 | NA | 分析肺癌免疫微环境中免疫细胞的浸润特征及相关标记基因 | 肺癌细胞及其免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,485个肺癌细胞 |
154 | 2024-08-09 |
Weighted gene co-expression network analysis can sort cancer-associated fibroblast-specific markers promoting bladder cancer progression
2021-02, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.29939
PMID:32657439
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研究论文 | 本文通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)研究了膀胱尿路上皮癌(BLCA)中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的特定基因表达模块,这些基因与癌症进展和生存状态相关 | 首次在膀胱尿路上皮癌中应用WGCNA分析CAFs的特定基因表达模块,并确定了15个关键基因作为BLCA特异性CAF标记 | NA | 探讨CAFs在膀胱尿路上皮癌进展中的作用及其特定基因标记 | 膀胱尿路上皮癌中的癌症相关成纤维细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | NA | 基因表达数据 | NA |
155 | 2024-08-09 |
Activation of the 15-lipoxygenase pathway in aspirin-exacerbated respiratory disease
2021-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.04.031
PMID:32371071
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研究论文 | 本文研究了阿司匹林加重呼吸疾病(AERD)中15-脂氧合酶途径的激活 | 首次采用单细胞RNA测序技术研究AERD中花生四烯酸代谢途径,并发现15-脂氧合酶(15-LO)基因在AERD患者鼻息肉细胞中显著上调 | NA | 利用无偏倚方法研究AERD中花生四烯酸代谢途径 | AERD患者和慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者的鼻息肉细胞 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | AERD和CRSwNP患者的鼻息肉细胞 |