单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 155 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
101 2024-08-09
Mapping the Intratumoral Heterogeneity in Glioblastomas with Hyperspectral Stimulated Raman Scattering Microscopy
2021-02-02, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文介绍了使用高光谱受激拉曼散射(SRS)显微镜快速、无标记地评估胶质母细胞瘤(GBM)的肿瘤内异质性 开发了一种独特的无标记拉曼成像诊断平台,包括大范围GBM组织标本的光谱聚焦高光谱SRS成像、SRS图像和使用多元曲线分辨率算法的谱图检索,以及基于二次支持向量机模型的亚型分类,用于快速分子亚型分类 NA 研究胶质母细胞瘤的肿瘤内异质性,并开发一种新的诊断平台 胶质母细胞瘤(GBM)的肿瘤内异质性 数字病理学 脑肿瘤 高光谱受激拉曼散射(SRS)显微镜 二次支持向量机 图像 大范围GBM组织标本
102 2024-08-09
Effects of Nanoplastics and Butyl Methoxydibenzoylmethane on Early Zebrafish Embryos Identified by Single-Cell RNA Sequencing
2021-02-02, Environmental science & technology IF:10.8Q1
研究论文 研究探讨了纳米塑料和丁基甲氧基二苯甲酰甲烷对斑马鱼胚胎早期发育的毒性和相互作用 利用单细胞RNA测序技术识别了两种污染物共同影响的神经中细胞,并确定了它们对斑马鱼胚胎发育的具体影响 NA 研究纳米塑料和防晒剂成分对斑马鱼胚胎发育的毒性及其相互作用 斑马鱼胚胎 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 从2到12小时受精后(hpf)的斑马鱼胚胎
103 2024-08-09
Finding needles in a haystack: dissecting tumor heterogeneity with single-cell transcriptomic and chromatin accessibility profiling
2021-02, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2
综述 本文综述了单细胞转录组和染色质可及性分析技术在解析肿瘤异质性中的应用 介绍了单细胞基因组学技术如scRNA-seq和scATAC-seq在解析肿瘤细胞亚群中的创新应用 NA 深入理解肿瘤异质性 肿瘤细胞的异质性及其对治疗抵抗和转移进展的影响 数字病理学 NA scRNA-seq, scATAC-seq NA 转录组, 染色质可及性 NA
104 2024-08-09
Circuits between infected macrophages and T cells in SARS-CoV-2 pneumonia
2021-02, Nature IF:50.5Q1
研究论文 研究SARS-CoV-2感染患者的肺泡免疫反应,特别是感染的巨噬细胞与T细胞之间的相互作用 首次详细描述了SARS-CoV-2感染肺泡中巨噬细胞与T细胞之间的正反馈循环,推动持续的肺泡炎症 研究样本仅限于88名SARS-CoV-2感染患者和211名其他病原体引起的肺炎患者,可能影响结果的普遍性 探究SARS-CoV-2感染肺泡的病理生物学机制 SARS-CoV-2感染患者的肺泡免疫反应 NA SARS-CoV-2肺炎 流式细胞术,批量转录组分析,单细胞RNA测序 NA 肺泡灌洗液样本 88名SARS-CoV-2感染患者和211名其他病原体引起的肺炎患者
105 2024-08-09
T Cell Development: Old Tales Retold By Single-Cell RNA Sequencing
2021-02, Trends in immunology IF:13.1Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术研究哺乳动物T细胞发育过程中的关键问题 单细胞RNA测序技术使得研究早期胸腺祖细胞和描绘常规及非常规T细胞的精细发育轨迹成为可能 由于细胞稀缺和缺乏适当技术,一些长期存在的问题如关键祖细胞/前体的特征和其命运决定的分子机制尚未完全解决 探讨哺乳动物T细胞发育过程中的关键问题 哺乳动物T细胞发育过程中的祖细胞和前体细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 多个细胞样本
106 2024-08-09
Single-cell RNA sequencing of developing maize ears facilitates functional analysis and trait candidate gene discovery
2021-02-22, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序技术分析了发育中的玉米穗的转录组,构建了一个发育图谱,并验证了结果,展示了这些数据如何促进遗传研究,整合转录网络,并识别与作物产量性状相关的候选基因。 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了玉米穗发育过程中的细胞类型多样性和发育域,克服了传统遗传学方法因遗传冗余和多效性带来的限制。 NA 深入理解玉米穗发育过程中的细胞类型多样性和发育域,以及相关的基因网络。 发育中的玉米穗的单细胞转录组。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 12,525个单细胞
107 2024-08-09
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,对人类肠道发育进行了时空分析 首次详细描述了肠道发育过程中的细胞状态和形态发生里程碑,并提供了公开的在线资源以促进进一步研究 NA 深入理解人类肠道发育的机制 人类肠道发育过程中的细胞状态和形态发生 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 101种细胞状态
108 2024-08-09
Memory-like HCV-specific CD8+ T cells retain a molecular scar after cure of chronic HCV infection
2021-02, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 研究慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染治愈后,HCV特异性CD8+ T细胞的分子特征和命运 揭示了直接作用抗病毒(DAA)治疗后,记忆样和终末期耗竭HCV特异性CD8 T细胞之间的前体-后代关系,并发现记忆样细胞在DAA治疗后得以维持,而终末期耗竭细胞消失 研究主要集中在单细胞转录组层面,未涉及其他层面的分析 探讨慢性HCV感染治愈后,HCV特异性CD8 T细胞的分子特征和命运 慢性HCV感染治愈后的HCV特异性CD8 T细胞 NA 肝炎 单细胞转录组学 NA 转录组 具体样本数量未在摘要中提及
109 2024-08-09
Heterogeneous disease-propagating stem cells in juvenile myelomonocytic leukemia
2021-02-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本文通过流式细胞术和单细胞RNA测序研究了青少年髓单核细胞白血病(JMML)中的异质性造血干细胞/祖细胞(HSPCs),并揭示了白血病干细胞(LSCs)的特性及其在疾病传播中的作用 首次揭示了JMML中HSPCs的异质性,并发现了与疾病复发相关的突变模式 NA 研究JMML中的细胞层次结构,特别是白血病干细胞(LSCs)的特性 青少年髓单核细胞白血病(JMML)中的造血干细胞/祖细胞(HSPCs)和白血病干细胞(LSCs) 数字病理学 白血病 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA RNA序列 多个JMML患者的造血干细胞/祖细胞(HSPCs)样本
110 2024-08-09
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Heterogeneous Cellular Response to BK Virus Infection
2021-02-24, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应 首次通过单细胞转录组学揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应,并发现了先前未被识别的被BK病毒下调的通路 研究主要集中在体外培养的肾近端小管上皮细胞,可能与体内实际情况存在差异 探究BK病毒感染后细胞的异质性反应及其对细胞基因表达模式的影响 BK病毒感染的肾近端小管上皮细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组 数千个细胞
111 2024-08-09
Cross-Comparison of Human iPSC Motor Neuron Models of Familial and Sporadic ALS Reveals Early and Convergent Transcriptomic Disease Signatures
2021-02-17, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析,研究了来自健康、家族性和散发性肌萎缩侧索硬化症(ALS)患者的诱导多能干细胞(iPSC)衍生的运动神经元(MNs),以识别统一的、可重复的ALS特征 本文采用单细胞RNA测序技术,通过多次分化和跨平台分析,考虑了遗传和实验变异性,以识别早期、汇聚和运动神经元解析的ALS特征 文章指出,遗传和实验变异性限制了iPSC衍生神经培养物的实用性,影响可重复性和追踪发病机制的细胞起源 研究目的是通过iPSC衍生的神经培养物模型,识别肌萎缩侧索硬化症(ALS)的早期和汇聚的转录组疾病特征 研究对象包括健康、家族性和散发性ALS患者的iPSC衍生的运动神经元 数字病理学 肌萎缩侧索硬化症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及多个患者的iPSC衍生的运动神经元
112 2024-08-09
Cetuximab enhances the anti-tumor function of macrophages in an IL-6 dependent manner
2021-Feb-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究探讨了西妥昔单抗通过抑制EGFR/IL-6通路抑制肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的促肿瘤功能 发现西妥昔单抗通过抑制IL-6表达,将TAMs从M2样表型转变为M1样表型,从而减轻肿瘤负担 NA 研究西妥昔单抗对肿瘤微环境的影响及其分子机制 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)和结直肠癌(CRC)患者 NA 结直肠癌 流式细胞术,Western blotting,RT-qPCR,ELISA NA scRNA-seq数据,转录组数据 使用AOM/DSS和肿瘤异种移植小鼠模型进行实验,分析公共CRC患者数据集
113 2024-08-09
Distinct developmental pathways from blood monocytes generate human lung macrophage diversity
2021-02-09, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究利用表达人细胞因子的转基因小鼠模型,在体内解析了人造血干细胞和祖细胞(HSPCs)向肺泡巨噬细胞的分化途径 本研究首次揭示了从循环单核细胞到肺泡巨噬细胞的不同发育途径,并阐明了细胞起源如何影响人巨噬细胞的身份、多样性和体内定位 NA 研究人巨噬细胞及其发育途径 人肺泡巨噬细胞的分化途径 NA NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 三种巨噬细胞群体
114 2024-08-09
Maternal immune activation in mice disrupts proteostasis in the fetal brain
2021-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术研究了母体免疫激活对小鼠胎儿大脑蛋白质稳态的影响 首次揭示了母体免疫激活通过激活整合应激反应在雄性后代中引发神经发育障碍的分子机制 研究仅限于小鼠模型,且未探讨雌性后代中未观察到相同效应的原因 探讨母体感染和炎症导致后代神经发育障碍的分子机制 小鼠胎儿大脑在母体免疫激活后的转录变化 NA 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA RNA NA
115 2024-08-09
STING agonist promotes CAR T cell trafficking and persistence in breast cancer
2021-02-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本研究通过使用STING激动剂DMXAA或cGAMP增强CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性 开发了新的方法来增强CAR T细胞在实体瘤中的治疗效果,特别是在乳腺癌中 持续的肿瘤消退仅在使用STING激动剂的同时添加anti-PD-1和anti-GR-1 mAb时实现 增强CAR T细胞在实体瘤中的渗透和持久性 CAR T细胞在乳腺癌中的活性和持久性 免疫疗法 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
116 2024-08-09
Allele-specific expression: applications in cancer and technical considerations
2021-02, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2
综述 本文综述了等位基因特异性表达在癌症易感性和进展中的普遍存在现象,并强调了实验设计和计算分析在准确量化等位基因表达和避免假阳性中的重要性 NA NA 探讨等位基因特异性表达在癌症研究中的应用及技术考虑 等位基因特异性基因表达及其在癌症中的作用 NA 癌症 NA NA NA NA
117 2024-08-09
Microbial single-cell RNA sequencing by split-pool barcoding
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本文介绍了一种名为microSPLiT的高通量单细胞RNA测序方法,用于分析革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 microSPLiT方法能够解析细菌中异质的转录状态,并为无法进行单细胞分析的自然微生物群落提供高通量基因表达分析 NA 开发一种适用于细菌的高通量单细胞RNA测序方法 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 超过25,000个细胞
118 2024-08-09
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究通过比较早期和晚期发作的先兆子痫的系统转录组,揭示了其不同的病理机制并发现了新的生物标志物 本研究首次系统比较了早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组,并结合单细胞转录组学,发现了新的特定生物标志物 NA 旨在揭示早期和晚期发作的先兆子痫之间的差异,并识别新的生物标志物 早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 使用患者血液样本进行实验验证
119 2024-08-09
Hepatobiliary acid-base homeostasis: Insights from analogous secretory epithelia
2021-02, Journal of hepatology IF:26.8Q1
综述 本文综述了从类似分泌上皮中获得的关于肝胆酸碱稳态的见解 利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了人类胆管细胞的表达,提供了关于pH稳态及其在胆道系统中失调的分子基础的见解 NA 探讨在类似分泌上皮中发现的保守原则,并结合当前对胆管细胞生理学的认识 肝胆酸碱稳态及其在类似分泌上皮中的机制 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
120 2024-08-09
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究通过活体成像技术,识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的神经干细胞(NSCs)。 首次通过活体成像技术识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的Gli1靶向NSCs,并比较了Gli1和Ascl1靶向细胞的转录组特征。 研究仅限于小鼠模型,且依赖于特定的基因标记技术。 旨在揭示成年小鼠海马体中神经干细胞的长期自我更新能力及其潜在机制。 研究对象为成年小鼠海马体中的神经干细胞及其子代细胞。 NA NA 双光子显微镜、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 研究涉及多个基因标记的神经干细胞及其子代细胞。
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