单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 155 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108739
PMID:33567283
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了C57BL/6J和野生型小鼠的微胶质细胞，探讨了遗传多样性对阿尔茨海默病模型中微胶质细胞特征和动态变化的影响 | 首次展示了遗传多样性对微胶质细胞在基础神经免疫功能和淀粉样病变反应中的显著影响，并揭示了与人类阿尔茨海默病相关基因的表达差异 | NA | 探讨遗传多样性如何影响微胶质细胞在阿尔茨海默病模型中的异质性 | C57BL/6J和野生型小鼠的微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括C57BL/6J和三种野生型小鼠（WSB/EiJ, CAST/EiJ, PWK/PhJ）的微胶质细胞 |
| 82 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling identifies pre-existing CD19-negative subclones in a B-ALL patient with CD19-negative relapse after CAR-T therapy
2021-02-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21168-6
PMID:33558546
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了在接受CAR-T治疗后复发的B-ALL患者中，存在预先存在的CD19阴性亚克隆 | 首次通过单细胞RNA测序技术证明CAR-T治疗前已存在CD19阴性白血病细胞，这些细胞在治疗后被选择性扩增导致复发 | 研究样本仅为单一病例，可能限制了结果的普遍性 | 探究CAR-T治疗后B-ALL患者复发的原因，并评估单细胞RNA测序技术在预测靶向治疗失败风险中的应用 | B-ALL患者的白血病细胞及其在CAR-T治疗前后的变化 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一B-ALL患者 |
| 83 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of neutrophil heterogeneity in sepsis
2021-02-06, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-021-03481-0
PMID:33549126
|
研究论文 | 本研究通过小鼠CLP模型和单细胞基因测序技术，探讨了脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 | 首次揭示了脓毒症晚期中性粒细胞的多种功能障碍，并通过单细胞RNA测序技术发现了中性粒细胞的多个亚群 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类脓毒症的实际情况存在差异 | 探讨脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 | 中性粒细胞在脓毒症中的异质性和功能 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞基因测序技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的中性粒细胞 |
| 84 | 2024-08-09 |
Follicular Lymphoma Microenvironment: An Intricate Network Ready for Therapeutic Intervention
2021-Feb-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13040641
PMID:33562694
|
综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤（FL）微环境的复杂网络及其在疾病发生、进展和异质性中的作用，并探讨了针对该微环境的新型治疗策略。 | 利用最新的技术如全外显子测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，精确解析了FL微环境中特定细胞表型及其在疾病中的作用。 | NA | 探讨滤泡性淋巴瘤微环境的主要参与者及其当前和未来的治疗策略。 | 滤泡性淋巴瘤的微环境及其在疾病中的作用。 | NA | 淋巴瘤 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
Tumor Evolution and Therapeutic Choice Seen through a Prism of Circulating Tumor Cell Genomic Instability
2021-02-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10020337
PMID:33562741
|
综述 | 本文综述了通过循环肿瘤细胞（CTCs）的单细胞分析来探讨基因组不稳定性（GI）的分子机制及其对肿瘤演化和耐药克隆出现的影响 | 介绍了通过分子和功能特性监测CTCs以理解基因组不稳定性的分子机制，并强调了染色体不稳定性（CIN）在CTCs驱动转移进展和获得性耐药中的作用 | 讨论了单CTC分析中遇到的技术障碍和挑战 | 探讨CTCs中的基因组异常与预后之间的关系，并支持在临床风险评估和治疗选择中监测CTCs中的基因组不稳定性的潜在用途 | 不同类型肿瘤中的循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交（FISH），单细胞测序 | NA | 细胞 | 极低数量的循环肿瘤细胞（CTCs） |
| 86 | 2024-08-09 |
Nitric oxide prevents aortic valve calcification by S-nitrosylation of USP9X to activate NOTCH signaling
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe3706
PMID:33547080
|
研究论文 | 本文研究了硝酸氧化物（NO）通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化的机制 | 发现了一种新的机制，即通过S-亚硝基化依赖的泛素相关通路调节来预防钙化性主动脉瓣疾病（CAVD） | NA | 探讨NO如何通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化 | 猪主动脉瓣间质细胞和单细胞RNA测序 | NA | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 87 | 2024-08-09 |
Implications of liver injury in risk-stratification and management of patients with COVID-19
2021-Feb, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-020-10123-0
PMID:33548030
|
研究论文 | 本研究评估了COVID-19患者中肝脏损伤对临床结果的影响 | 提供了预测COVID-19患者住院期间肝脏损伤风险和严重程度的模型 | NA | 评估肝脏损伤对COVID-19患者临床结果的影响 | COVID-19患者的肝脏损伤及其对临床结果的影响 | NA | COVID-19 | scRNA-seq, 基因表达谱分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 1520名严重或危重的COVID-19患者 |
| 88 | 2024-08-09 |
SiglecF(HI) Marks Late-Stage Neutrophils of the Infarcted Heart: A Single-Cell Transcriptomic Analysis of Neutrophil Diversification
2021-02-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.019019
PMID:33525909
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了心肌梗死（MI）后中性粒细胞的分化和动态变化 | 首次揭示了心肌梗死后中性粒细胞的多样化，特别是SiglecF标记的晚期中性粒细胞的发现和特性 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究心肌梗死后中性粒细胞的分化和动态变化 | 心肌梗死后的中性粒细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过28,000个中性粒细胞转录组 |
| 89 | 2024-08-09 |
SATB2 induction of a neural crest mesenchyme-like program drives melanoma invasion and drug resistance
2021-02-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64370
PMID:33527896
|
研究论文 | 本文通过过表达筛选80种表观遗传/转录调节因子，发现神经嵴间质发育调节因子SATB2能加速黑色素瘤的侵袭性发展，并诱导zebrafish肿瘤和人类黑色素瘤细胞系的侵袭和药物抗性 | 首次发现SATB2通过诱导神经嵴间质样程序，驱动黑色素瘤的侵袭和药物抗性 | NA | 测试转录适应是否能驱动黑色素瘤的进展 | SATB2在黑色素瘤侵袭和药物抗性中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 80种表观遗传/转录调节因子 |
| 90 | 2024-08-09 |
CNS fibroblasts form a fibrotic scar in response to immune cell infiltration
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00770-9
PMID:33526922
|
研究论文 | 本文研究了中枢神经系统（CNS）纤维母细胞在免疫细胞浸润后形成纤维化瘢痕的过程 | 首次确定CNS纤维化瘢痕主要来源于增殖的CNS纤维母细胞，而非周细胞或浸润的骨髓来源细胞，并通过特定细胞表达的疱疹胸苷激酶敲除增殖的纤维化细胞，观察到运动障碍的减少 | NA | 探讨CNS在免疫细胞浸润后的纤维化反应机制 | CNS纤维母细胞、纤维化瘢痕、免疫细胞浸润 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 实验使用了实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型 |
| 91 | 2024-08-09 |
UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00810-6
PMID:33526946
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Reply to: UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00811-5
PMID:33526947
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
Sex-Stratified Gene Regulatory Networks Reveal Female Key Driver Genes of Atherosclerosis Involved in Smooth Muscle Cell Phenotype Switching
2021-02-16, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过生成性别特异性的基因调控网络（GRNs），揭示了女性在动脉粥样硬化中平滑肌细胞表型转换的关键驱动基因。 | 首次在女性中识别出动脉粥样硬化的关键驱动基因，并展示了这些基因在平滑肌细胞表型转换中的作用。 | 研究样本仅包括160名女性和年龄匹配的男性，可能限制了结果的普遍性。 | 探索性别差异在动脉粥样硬化中的分子机制，并寻找性别特异性的治疗靶点。 | 动脉粥样硬化患者的动脉壁组织和平滑肌细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因调控网络数据 | 160名女性和年龄匹配的男性 |
| 94 | 2024-08-09 |
Changes in genome architecture and transcriptional dynamics progress independently of sensory experience during post-natal brain development
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.032
PMID:33484631
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率的多重退火和循环扩增环技术（MALBAC-DT）和二倍体染色质构象捕获（Dip-C）方法，生成了发育中的小鼠大脑皮层和海马体的转录组和三维基因组图谱。 | 首次揭示了单个脑细胞的三维基因组结构，并展示了转录组和三维基因组在出生后的动态变化，这些变化与感觉经验无关。 | 研究主要集中在小鼠大脑皮层和海马体，可能不适用于其他物种或大脑区域。 | 探索哺乳动物大脑发育过程中基因组结构和转录动态的独立变化。 | 小鼠大脑皮层和海马体的转录组和三维基因组。 | 基因组学 | NA | 多重退火和循环扩增环技术（MALBAC-DT），二倍体染色质构象捕获（Dip-C） | NA | 转录组数据，三维基因组数据 | 3,517个细胞的转录组，3,646个细胞的三维基因组 |
| 95 | 2024-08-09 |
Targeting the tumor microenvironment in cholangiocarcinoma: implications for therapy
2021-02, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2021.1882998
PMID:33502260
|
综述 | 本文综述了胆管癌（CCA）中肿瘤微环境（TME）的作用，并探讨了针对TME的潜在治疗策略 | 利用单细胞RNA测序技术对CCA中的TME进行功能性表征，为免疫疗法和癌症相关成纤维细胞及细胞外基质导向治疗铺平道路 | 文章指出手术和细胞毒性化疗的低效性，强调需要新的治疗策略和伴随生物标志物 | 探讨胆管癌中肿瘤微环境的作用，并开发新的治疗策略 | 胆管癌及其肿瘤微环境 | NA | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Traumatic Brain Injury Causes Chronic Cortical Inflammation and Neuronal Dysfunction Mediated by Microglia
2021-02-17, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2469-20.2020
PMID:33452227
|
研究论文 | 研究探讨了创伤性脑损伤（TBI）后微胶质细胞在慢性皮质炎症和神经元功能障碍中的作用 | 通过使用CSF1R拮抗剂PLX5622耗竭微胶质细胞，研究了其在TBI后不同时间点的神经病理学和炎症反应中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类 | 确定微胶质细胞在创伤性脑损伤后神经病理学中的贡献 | 研究对象包括小鼠的微胶质细胞、神经元和其他胶质细胞 | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 研究使用了雄性小鼠 |
| 97 | 2024-08-09 |
High-Dimensional Immune Monitoring for Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapies
2021-02, Current hematologic malignancy reports
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11899-020-00602-4
PMID:33449291
|
研究论文 | 本文综述了基于R语言的高维流式细胞术数据分析管道，主要应用于嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法 | 近年来，已有的用于分析复杂高维数据的工具，如单细胞RNA测序（scRNAseq），已成功移植到细胞术研究中，提供了动态且用户友好的探索空间 | 现有的环境如Cytobank、FlowJo和FCS Express提供的工具要么价格昂贵，要么对无经验用户来说相当复杂 | 综述高维流式细胞术实验方法，并介绍用于CAR T细胞疗法的差异分析的R语言管道 | 高维流式细胞术数据和CAR T细胞疗法 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术 | NA | 高维数据 | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Does tissue imprinting restrict macrophage plasticity?
2021-02, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00849-2
PMID:33462453
|
research paper | 本文讨论了近期研究，这些研究通过结合命运图谱、单细胞转录组学和表观遗传学，详细分析了单个巨噬细胞亚群对肺部损伤的反应，并呼吁调整巨噬细胞可塑性概念 | 提出长时间组织定居会关闭巨噬细胞的大部分可塑性，并推测这种受限的可塑性是进化过程中为了保护组织稳态而选择的 | NA | 探讨巨噬细胞的可塑性及其在组织稳态中的作用 | 巨噬细胞及其在肺部损伤中的反应 | NA | NA | 命运图谱、单细胞转录组学、表观遗传学 | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2021-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03110-w
PMID:33469225
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
Transcriptional Diversity and Niche-Specific Distribution of Leukocyte Populations during Staphylococcus aureus Craniotomy-Associated Biofilm Infection
2021-02-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2001042
PMID:33419769
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在颅骨切开术感染的小鼠模型中，揭示了脑内常驻小胶质细胞和浸润单核细胞以及皮下帽状腱膜和骨瓣中粒细胞亚群的复杂转录异质性 | 首次揭示了颅骨切开术感染中白细胞群体的转录多样性和特定分布，以及粒细胞和骨髓源性抑制细胞在感染控制中的关键作用 | NA | 探讨颅骨切开术感染中白细胞群体的转录多样性和特定分布，以及这些细胞在感染控制中的作用 | 小胶质细胞、单核细胞、粒细胞亚群及其在颅骨切开术感染中的转录特征和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |