单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Cholangiocyte organoids can repair bile ducts after transplantation in the human liver
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz6964
PMID:33602855
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research paper | 本研究探讨了胆管细胞类器官在人体肝脏移植后修复胆管的潜力 | 首次展示了胆管细胞类器官在人体内的修复能力 | 尚未在临床实践中应用 | 验证胆管细胞类器官在修复胆管疾病中的应用 | 胆管细胞类器官和人体肝脏 | NA | 胆管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未具体说明 |
| 62 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals functional heterogeneity of glioma-associated brain macrophages
2021-02-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21407-w
PMID:33608526
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质瘤相关脑巨噬细胞的功能异质性 | 首次展示了正常和胶质瘤小鼠模型中CD11b髓系细胞的单细胞RNA测序结果，揭示了微胶质细胞、浸润性单核细胞/巨噬细胞和脑边界相关巨噬细胞的独特特征 | NA | 探讨胶质瘤中髓系细胞亚群的细胞异质性和功能表型 | 胶质瘤相关脑巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 正常和GL261胶质瘤小鼠模型中的CD11b髓系细胞 |
| 63 | 2024-08-09 |
Cell differentiation trajectory predicts patient potential immunotherapy response and prognosis in gastric cancer
2021-02-17, Aging
DOI:10.18632/aging.202515
PMID:33612483
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研究论文 | 本研究旨在探讨胃癌（GC）细胞的分化轨迹及其临床相关性，并基于GC分化相关基因（GDRGs）生成一个预测总生存期（OS）的预后风险评分（RS）特征。 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA-seq数据，分析了GC细胞的分化轨迹，并基于GDRGs生成了一个八基因的预后RS特征，结合临床病理特征构建了一个预测性能强的诺模图。 | NA | 研究胃癌细胞的分化轨迹及其对患者临床结果和潜在免疫治疗反应的预测意义。 | 胃癌细胞的分化轨迹及其与临床特征、免疫浸润状态和免疫检查点基因表达的关系。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 多个胃癌样本 |
| 64 | 2024-08-09 |
Infertility network and hub genes for nonobstructive azoospermia utilizing integrative analysis
2021-02-17, Aging
DOI:10.18632/aging.202559
PMID:33621950
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研究论文 | 本文通过综合分析揭示了非阻塞性无精症（NOA）中失调的差异表达基因及其相关信号通路或生物过程 | 构建了NOA基因共表达网络，并通过Seurat包对NOA患者的睾丸组织细胞进行分类，利用scRNA-seq数据集分析了不同细胞类型中关键基因的差异表达 | NA | 研究NOA的分子机制并识别潜在的生物标志物 | 非阻塞性无精症（NOA）的差异表达基因及其相关生物过程和信号通路 | 生物信息学 | 男性不育症 | 基因共表达网络分析，Seurat包，scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了两个Gene Expression Omnibus数据集（GSE45887和GSE106487）进行验证和分析 |
| 65 | 2024-08-09 |
SUGAR-seq enables simultaneous detection of glycans, epitopes, and the transcriptome in single cells
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe3610
PMID:33608275
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SUGAR-seq的新方法，能够在单细胞水平上同时检测N-连接糖基化、细胞外表位和转录组 | SUGAR-seq方法的创新之处在于它能够同时整合转录组和关键的翻译后修饰数据，这在多模态单细胞RNA测序中是不可实现的 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时检测糖基化、表位和转录组的方法 | 肿瘤浸润T细胞的表面糖基化特性 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 66 | 2024-08-09 |
A unique subset of glycolytic tumour-propagating cells drives squamous cell carcinoma
2021-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-021-00350-6
PMID:33619381
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研究论文 | 本文研究了头颈部鳞状细胞癌（SCC）中肿瘤传播细胞（TPCs）的糖酵解作用及其对癌症进展的影响 | 发现增强的糖酵解作用是SCC的主要驱动因素，并识别出具有更高糖酵解活性的TPCs子集作为Warburg效应的起源细胞 | NA | 探讨糖酵解在SCC中的功能重要性及其在肿瘤进展中的作用阶段 | 头颈部鳞状细胞癌中的肿瘤传播细胞及其糖酵解特性 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 67 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Drosophila Larval Ventral Cord
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.38
PMID:33620770
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研究论文 | 本文描述了一套针对果蝇幼虫腹神经索的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析的优化协议 | 本文介绍了针对果蝇幼虫腹神经索的scRNA-seq分析的优化协议，并详细说明了技术挑战和数据分析流程 | 由于果蝇大脑及其细胞的小尺寸，scRNA-seq方法需要一些适应性调整 | 研究果蝇神经系统的多样性和功能 | 果蝇幼虫腹神经索的单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 三个独立样本 |
| 68 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal dissection of the cell cycle with single-cell proteogenomics
2021-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03232-9
PMID:33627808
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研究论文 | 本文通过整合亚细胞分辨率的蛋白质组学、单细胞转录组学和细胞周期中个体细胞的精确时间测量，展示了人类蛋白质组异质性的时空图谱 | 首次系统地研究了细胞间蛋白质组变异性，并揭示了与有丝分裂和细胞周期相关的新蛋白质 | NA | 探索细胞周期中细胞间蛋白质组变异性的系统性研究 | 人类细胞周期中的蛋白质组异质性 | 蛋白质组学 | 癌症 | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及人类蛋白质组的约五分之一 |
| 69 | 2024-08-09 |
Potential therapeutic targets in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma: reversing the protumor effect of tumor-associated macrophages
2021-Feb-17, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01873-2
PMID:33596985
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综述 | 本文综述了肝细胞癌患者中肿瘤微环境的治疗靶点，特别是针对肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤促进效应的逆转 | 利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞间的相互作用网络，并识别出肿瘤相关巨噬细胞作为关键节点 | NA | 探讨如何通过重塑肿瘤微环境和重新编程肿瘤相关巨噬细胞表型来提高肝细胞癌患者的免疫治疗效果 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Dissection of intercellular communication using the transcriptome-based framework ICELLNET
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21244-x
PMID:33597528
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研究论文 | 本文开发了基于转录组的框架ICELLNET，用于解析细胞间通信 | ICELLNET集成了专家 curated的配体-受体相互作用数据库、通信分数量化、与31种参考人类细胞类型的连接以及三种可视化模式 | NA | 开发一个全面的、多功能的、生物学验证的、易于使用的框架，用于从单个或多个基于细胞的转录组数据中解析细胞通信 | 细胞间通信的解析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | 转录组数据 | 涉及31种参考人类细胞类型 |
| 71 | 2024-08-09 |
Molecular Signatures of Inflammatory Profile and B-Cell Function in Patients with Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome
2021-02-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02583-20
PMID:33593977
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研究论文 | 本研究利用靶向蛋白质组学和单细胞转录组学技术，分析了SFTS患者血液中的免疫景观变化，并揭示了B细胞功能改变与SFTSV感染致死性的关联 | 首次揭示了SFTSV感染导致B细胞亚群改变及干扰素途径下调，以及这些变化与疾病严重程度和致死性的关系 | NA | 探究SFTSV感染的临床表现机制及其与免疫反应的关系 | SFTS患者的血液样本，特别是外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | 靶向蛋白质组学，单细胞转录组学 | NA | 蛋白质，RNA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the differences in cell differentiation and immune microenvironment of papillary thyroid carcinoma between genders
2021-Feb-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00549-w
PMID:33588924
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）在不同性别间的细胞分化和免疫微环境的差异 | 首次揭示了性别对PTC中单细胞转录组景观的影响，包括细胞簇和免疫微环境的详细差异 | NA | 旨在阐明性别对甲状腺乳头状癌中细胞簇和免疫微环境的影响 | 甲状腺乳头状癌（PTC）在不同性别间的细胞分化和免疫微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共生成6720、14666和33373个单细胞转录组，分别来自4名男性PTC患者、7名女性PTC患者和3名结节性甲状腺肿患者 |
| 73 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals the potential oncogenic expression atlas of human iPSC-derived cardiomyocytes
2021-02-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.053348
PMID:33589441
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了人类诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的心肌细胞的致癌表达图谱 | 发现了与致癌相关的动态表达事件，以及Yamanaka因子基因的动态表达和共表达模式 | NA | 理解iPSC衍生的心肌细胞在单细胞分辨率下的特性 | 人类iPSC衍生的心肌细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 32,365个细胞 |
| 74 | 2024-08-09 |
Fast and precise single-cell data analysis using a hierarchical autoencoder
2021-02-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21312-2
PMID:33589635
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDHA的分析框架，用于从单细胞RNA测序数据中提取代表性信息 | scDHA框架包括一个非负核自动编码器和一个堆叠的贝叶斯自动编码器，能够有效去除不重要的基因或成分，并通过在压缩空间中反复扰动来学习更通用的数据表示 | NA | 解决单细胞RNA测序研究中数据量大和噪声水平高的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Cellular transcriptomics reveals evolutionary identities of songbird vocal circuits
2021-02-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abd9704
PMID:33574185
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了鸣禽鸣叫运动通路的神经元谱，揭示了鸣禽鸣叫电路与哺乳动物新皮质在神经发育上的差异和转录相似性 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了鸣禽鸣叫电路与哺乳动物新皮质在神经发育上的差异和转录相似性 | NA | 探究鸣禽鸣叫行为与哺乳动物复杂行为是否源自共享或不同的神经电路 | 鸣禽鸣叫运动通路的神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis of human B cell maturation predicts how antibody class switching shapes selection dynamics
2021-02-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe6291
PMID:33579751
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析人类B细胞成熟过程，预测抗体类别转换如何影响选择动力学 | 提供了人类B细胞成熟的全面路线图，结合单细胞转录组学和抗体谱系数据，定义了B细胞状态的基因表达、抗体谱系和克隆共享 | NA | 揭示B细胞介导的人类免疫反应的动态细胞状态，并强调抗体同种型在其抗体依赖性选择中的作用 | 人类B细胞的成熟过程及其在免疫反应中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Inflammatory Mechanisms Underlying Nonalcoholic Steatohepatitis and the Transition to Hepatocellular Carcinoma
2021-Feb-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13040730
PMID:33578800
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中炎症机制及其向肝细胞癌（HCC）转化的过程 | 介绍了单细胞测序、遗传命运图谱和活体显微镜等新技术在揭示免疫介导的肝脏损伤复杂机制中的应用 | NA | 深入理解非酒精性脂肪肝炎（NASH）进展及其向肝细胞癌转化的炎症机制 | NAFLD的炎症机制及其向HCC的转化 | NA | 肝病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Sexual Dimorphism through the Lens of Genome Manipulation, Forward Genetics, and Spatiotemporal Sequencing
2021-02-03, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaa243
PMID:33587127
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研究论文 | 本文探讨了通过基因组操作、正向遗传学和时空测序技术来研究性二态性的分子机制 | 引入了“4D基因组技术”，结合精确基因编辑、诱导性转基因系统和单细胞RNA测序等技术，以及经典实验设计，以高分辨率揭示性二态性的分子遗传基础 | NA | 揭示性二态性的分子遗传基础 | 性二态性的遗传机制 | 遗传学 | NA | 基因组操作、正向遗传学、时空测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Activin A promotes the development of acquired heterotopic ossification and is an effective target for disease attenuation in mice
2021-02-09, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.abd0536
PMID:33563697
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研究论文 | 本文研究了激活素A在异位骨化（HO）发展中的作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力。 | 发现激活素A是异位骨化的关键上游信号刺激因子，并证明了通过中和抗体阻断激活素A可以减少HO的发展和骨积累。 | NA | 探讨激活素A在异位骨化中的作用及其作为治疗靶点的有效性。 | 异位骨化的发展和激活素A的作用。 | NA | 异位骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行研究 |
| 80 | 2024-08-09 |
Atypical B cells are part of an alternative lineage of B cells that participates in responses to vaccination and infection in humans
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108684
PMID:33567273
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了健康个体和疟疾暴露个体中抗原特异性B细胞和总B细胞的多样性 | 揭示了两种B细胞谱系：经典的激活和静息记忆B细胞谱系以及包括先前描述的非典型B细胞在内的替代谱系 | NA | 研究人类B细胞的多样性及其在疫苗接种和感染反应中的作用 | 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞样本 |