单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of mouse neural stem cell differentiation reveals adverse effects of cadmium on neurogenesis
2021-Feb, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2020.111936
PMID:33387572
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了暴露于镉的幼鼠神经干细胞分化过程中的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了镉暴露对神经干细胞分化的具体影响，并探讨了其分子机制 | 研究仅限于24小时镉暴露和7天分化的时间点，可能需要更长时间的研究来全面理解镉的长期影响 | 探讨镉暴露对神经干细胞分化过程的影响及其分子机制 | 幼鼠神经干细胞在镉暴露后的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 幼鼠神经干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Opposing Wnt signals regulate cervical squamocolumnar homeostasis and emergence of metaplasia
2021-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00619-0
PMID:33462395
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分，揭示了两种上皮由不同的宫颈驻留干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生，并探讨了宫颈化生过程中基质重塑的机制 | 首次揭示了宫颈鳞状和柱状上皮由不同的干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生，并展示了化生过程中基质重塑的详细机制 | NA | 探讨宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮组织维持机制及化生过程中的基质重塑 | 宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Gut CD4+ T cell phenotypes are a continuum molded by microbes, not by TH archetypes
2021-02, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00836-7
PMID:33462454
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质分析，探讨了在无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠结肠中CD4效应淋巴细胞（T细胞）的实际状态 | 研究发现T细胞的转录组和染色质结构无法解析出符合经典辅助T细胞（T）亚群的离散簇，而是呈现连续分布，且这种分布与感染的微生物有关，而非传统的细胞因子产生 | NA | 确定T细胞在活体前线组织中实际采用的状态 | CD4效应淋巴细胞（T细胞）在不同微生物环境下的状态 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析，染色质分析 | NA | 转录组数据 | 无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠的结肠T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Molecular classification of zebrafish retinal ganglion cells links genes to cell types to behavior
2021-02-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.12.003
PMID:33357413
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，对成年和幼年斑马鱼的视网膜神经节细胞（RGCs）进行了系统分类，并识别了超过30种成熟类型及其发育中间体的标记基因 | 本研究首次系统地分类了斑马鱼视网膜神经节细胞，并利用这些数据开发了转基因驱动线，实现了对特定RGC类型的实验操作 | NA | 研究旨在理解视网膜神经节细胞的多样性及其在视觉系统中的功能架构 | 斑马鱼的视网膜神经节细胞 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年和幼年斑马鱼 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
Lipid-mediated innate lymphoid cell recruitment and activation in aspirin-exacerbated respiratory disease
2021-02, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2020.09.011
PMID:32950684
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研究论文 | 本文综述了脂质介导的2型先天淋巴细胞（ILC2s）招募和激活在阿司匹林加重性呼吸疾病（AERD）中的作用 | 利用新一代单细胞测序方法和最近开发的AERD小鼠模型，未来研究将更好地定义脂质介导的ILC2在AERD患者中的迁移 | 关于脂质介导的ILC2激活在AERD中发生的证据尚不充分 | 探讨脂质介导的ILC2招募和激活在AERD中的作用 | 2型先天淋巴细胞（ILC2s）在阿司匹林加重性呼吸疾病（AERD）中的作用 | NA | 呼吸疾病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Harnessing Single-Cell RNA Sequencing to Better Understand How Diseased Cells Behave the Way They Do in Cardiovascular Disease
2021-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314776
PMID:33327741
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病中对病变细胞行为理解的应用 | 利用单细胞RNA测序技术构建细胞图谱，发现新的细胞类型及其在心血管疾病中的作用 | NA | 深入理解心血管疾病中病变细胞的行为机制 | 心血管组织中的特定细胞类型及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
The lung microenvironment shapes a dysfunctional response of alveolar macrophages in aging
2021-02-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI140299
PMID:33586677
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research paper | 研究揭示了肺部微环境如何影响老年肺泡巨噬细胞的功能障碍 | 首次通过综合分析单细胞RNA测序数据，揭示了人类和小鼠肺泡巨噬细胞转录组中与年龄相关的同质性变化，并发现肺部微环境驱动了肺泡巨噬细胞对增殖的年龄相关抵抗性 | NA | 探讨年龄相关的肺泡巨噬细胞功能障碍及其背后的机制 | 肺泡巨噬细胞及其在老年肺炎中的作用 | NA | geriatric disease | single-cell RNA-Seq | NA | RNA | 涉及人类和小鼠的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Vascular ApoE4 Impairs Behavior by Modulating Gliovascular Function
2021-02-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.11.019
PMID:33321072
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研究论文 | 本研究探讨了血管壁细胞特异性表达的apoE4对小鼠行为和脑血管功能的影响 | 首次揭示了血管表达的apoE4通过调节神经血管功能影响行为，且这种效应是形式依赖的 | NA | 研究apoE4在血管壁细胞中的表达如何影响阿尔茨海默病和多种血管疾病的风险 | 小鼠的血管壁细胞和神经血管功能 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.02.20.431155
PMID:33619488
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研究论文 | 研究分析了35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者的鼻咽样本，通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化及其对病毒病理的影响。 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化过程，并揭示了细胞类型多样性和异质性对病毒复制的影响。 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的疾病状态和年龄组，可能影响结果的普遍性。 | 探讨SARS-CoV-2感染对上呼吸道上皮细胞的影响及其在COVID-19严重程度中的作用。 | COVID-19患者的鼻咽样本和非COVID-19患者的鼻咽样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Diversified transcriptional responses of myeloid and glial cells in spinal cord injury shaped by HDAC3 activity
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd8811
PMID:33637528
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research paper | 本研究结合骨髓特异性转录组学和单细胞RNA测序，揭示了脊髓损伤后激活的微胶质细胞和巨噬细胞的共同核心及时间上独特的基因程序 | 发现了脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的多样化转录反应，并揭示了HDAC3在这些过程中的广泛影响 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的转录反应及HDAC3的作用 | 脊髓损伤后的微胶质细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Characterizing allele- and haplotype-specific copy numbers in single cells with CHISEL
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0661-6
PMID:32879467
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research paper | 本文介绍了一种名为CHISEL的方法，用于在单细胞和细胞亚群中推断等位基因和单体型特异性的拷贝数 | CHISEL方法通过聚合数百或数千个单个细胞的稀疏信号，能够推断出等位基因和单体型特异性的拷贝数，这在低序列覆盖率的情况下尤为重要 | NA | 研究目的是开发一种方法来推断单细胞中的等位基因和单体型特异性拷贝数，特别是在低序列覆盖率的情况下 | 研究对象是乳腺癌患者的单细胞序列数据 | digital pathology | breast cancer | single-cell sequencing | NA | genome | 约2,000个细胞，来自两名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
A multi-center cross-platform single-cell RNA sequencing reference dataset
2021-02-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-00809-x
PMID:33531477
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研究论文 | 本文介绍了一个多中心跨平台的单细胞RNA测序（scRNA-seq）基准数据集 | 该数据集包括20个scRNA-seq数据集，来自两个生物学上不同的细胞系，且包含多平台的全基因组测序数据，适用于评估各种scRNA-seq分析的生物信息学方法 | NA | 提供一个适用于不同scRNA-seq平台和生物信息学方法基准测试的参考数据集 | 两个生物学上不同的细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 20个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Enabling single-cell trajectory network enrichment
2021-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-021-00025-y
PMID:38217228
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研究论文 | 本文开发了一种名为Scellnetor的网络约束时间序列聚类算法，用于单细胞测序数据分析，以揭示细胞分化过程中的基因表达网络模式 | Scellnetor算法能够提取解释两个发育轨迹调控差异的时间差异基因表达网络模式，将单细胞测序数据分析提升到系统生物学水平 | NA | 开发新的工具以增强单细胞测序数据在系统生物学层面的分析能力 | 单细胞测序数据中的细胞分化过程及其基因表达网络模式 | 系统生物学 | NA | scRNA-seq | 网络约束时间序列聚类算法 | 基因表达数据 | 使用已知特征的实验模型系统进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-08 |
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
2021-02, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00154-9
PMID:35122077
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自26名患者的69,000多个胶质母细胞瘤干细胞（GSCs），揭示了GSCs在转录水平上的高度异质性，并发现这种异质性可能与正常神经发育和炎症伤口反应的转录状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9基因敲除筛选，揭示了胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性与其功能脆弱性之间的关系。 | 研究主要集中在细胞培养和基因敲除筛选上，可能未能完全反映肿瘤在体内的复杂环境。 | 探究胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性及其对肿瘤功能的影响。 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）及其转录状态。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 69,000多个GSCs来自26名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic atlas of primate pancreatic islet aging
2021-Feb, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa127
PMID:34691567
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了年轻和老年非糖尿病食蟹猴胰腺胰岛细胞的转录组变化 | 首次揭示了老年β细胞中未折叠蛋白反应（UPR）的增加及其与蛋白聚集物的积累，以及HSP90B1在老年β细胞中的上调 | 研究仅限于非糖尿病食蟹猴，可能不完全适用于其他物种或糖尿病患者 | 解码与胰腺胰岛功能衰退相关的转录组变化，并探讨通过靶向UPR成分来延缓β细胞衰老和预防与年龄相关的糖尿病的可能性 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of mouse olfactory bulb chromatin accessibility
2021-02-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.02.007
PMID:33926839
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研究论文 | 本研究利用单细胞转座酶可及染色质测序技术，对小鼠嗅球中的9,549个单细胞的染色质可及性进行了全基因组分析 | 首次对小鼠嗅球的单细胞表观遗传景观进行了详细研究，揭示了不同细胞群特有的潜在调控元件及其功能 | NA | 旨在深入理解嗅球在单细胞水平上的调控机制及其治疗潜力 | 小鼠嗅球的单细胞染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 染色质可及性数据 | 9,549个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Infection of Airway Epithelial Cells
2021-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2021.21.e3
PMID:33728096
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综述 | 本文综述了SARS-CoV-2感染气道上皮细胞的细胞进入、宿主-病毒相互作用及免疫反应 | NA | NA | 探讨SARS-CoV-2在气道上皮细胞中的感染机制及相关治疗选项 | SARS-CoV-2感染的气道上皮细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-09 |
Single Cell Transcriptomic Re-analysis of Immune Cells in Bronchoalveolar Lavage Fluids Reveals the Correlation of B Cell Characteristics and Disease Severity of Patients with SARS-CoV-2 Infection
2021-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2021.21.e10
PMID:33728103
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研究论文 | 本研究重新分析了来自COVID-19轻度和重度症状患者的支气管肺泡灌洗液中单细胞RNA测序数据，重点关注抗体产生细胞，揭示了B细胞特征与疾病严重程度的相关性 | 首次揭示了COVID-19患者中B细胞的激活状态与疾病严重程度的相关性，并发现重度患者中巨噬细胞表达更高水平的B细胞激活因子 | NA | 探究COVID-19患者中B细胞特征与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自COVID-19轻度和重度症状患者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
The T Cell Repertoires from Nickel Sensitized Joint Implant Failure Patients
2021-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052428
PMID:33670995
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术分析了镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | 本研究首次详细描述了镍敏感导致的关节植入失败患者中镍特异性T细胞库的Vα和Vβ使用情况，并发现与接触性皮炎研究中的使用情况有所不同 | 研究样本仅来自两名患者，可能不足以代表所有镍敏感导致的关节植入失败患者的情况 | 旨在阐明镍过敏导致关节植入失败的机制 | 镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | NA | NA | 单细胞VDJ测序 | NA | T细胞受体序列 | 两名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Time-Resolved scRNA-Seq Tracks the Adaptation of a Sensitive MCL Cell Line to Ibrutinib Treatment
2021-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052276
PMID:33668876
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研究论文 | 本研究使用时间分辨的单细胞RNA测序技术，追踪了敏感的套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系对伊布替尼治疗的适应过程 | 揭示了五个亚群及其对治疗的个体反应，并发现了B细胞受体信号通路的激活、与微环境的相互作用、代谢重编程等与伊布替尼耐药相关的机制 | NA | 旨在解析敏感的套细胞淋巴瘤细胞系对伊布替尼治疗的反应 | 套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的单细胞 | NA | NA | NA | NA |