单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Vascular ApoE4 Impairs Behavior by Modulating Gliovascular Function
2021-02-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.11.019
PMID:33321072
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研究论文 | 本研究探讨了血管壁细胞特异性表达的apoE4对小鼠行为和脑血管功能的影响 | 首次揭示了血管表达的apoE4通过调节神经血管功能影响行为，且这种效应是形式依赖的 | NA | 研究apoE4在血管壁细胞中的表达如何影响阿尔茨海默病和多种血管疾病的风险 | 小鼠的血管壁细胞和神经血管功能 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.02.20.431155
PMID:33619488
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研究论文 | 研究分析了35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者的鼻咽样本，通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化及其对病毒病理的影响。 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化过程，并揭示了细胞类型多样性和异质性对病毒复制的影响。 | 研究样本量有限，且未涵盖所有可能的疾病状态和年龄组，可能影响结果的普遍性。 | 探讨SARS-CoV-2感染对上呼吸道上皮细胞的影响及其在COVID-19严重程度中的作用。 | COVID-19患者的鼻咽样本和非COVID-19患者的鼻咽样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者 |
| 43 | 2024-08-07 |
Diversified transcriptional responses of myeloid and glial cells in spinal cord injury shaped by HDAC3 activity
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd8811
PMID:33637528
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research paper | 本研究结合骨髓特异性转录组学和单细胞RNA测序，揭示了脊髓损伤后激活的微胶质细胞和巨噬细胞的共同核心及时间上独特的基因程序 | 发现了脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的多样化转录反应，并揭示了HDAC3在这些过程中的广泛影响 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的转录反应及HDAC3的作用 | 脊髓损伤后的微胶质细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.002
PMID:33508232
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meta-analysis | 本研究通过收集和分析超过1000名接受过检查点抑制剂治疗的患者的全外显子和转录组数据，评估了肿瘤细胞内在和微环境特征对检查点抑制剂敏感性的影响 | 首次系统性地分析了多种肿瘤类型中肿瘤突变负荷和CXCL9表达对检查点抑制剂反应的预测作用，并识别了与免疫原性表位相关的二核苷酸变异 | 研究未能达到泛癌种意义的亚克隆肿瘤突变负荷、体细胞拷贝数改变负荷和人类白细胞抗原进化分歧 | 揭示肿瘤细胞内在和微环境特征对检查点抑制剂敏感性的相对重要性 | 检查点抑制剂治疗患者的全外显子和转录组数据 | NA | NA | 全外显子测序、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 超过1000名患者，涵盖七种肿瘤类型 |
| 45 | 2024-08-07 |
Characterizing allele- and haplotype-specific copy numbers in single cells with CHISEL
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0661-6
PMID:32879467
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research paper | 本文介绍了一种名为CHISEL的方法，用于在单细胞和细胞亚群中推断等位基因和单体型特异性的拷贝数 | CHISEL方法通过聚合数百或数千个单个细胞的稀疏信号，能够推断出等位基因和单体型特异性的拷贝数，这在低序列覆盖率的情况下尤为重要 | NA | 研究目的是开发一种方法来推断单细胞中的等位基因和单体型特异性拷贝数，特别是在低序列覆盖率的情况下 | 研究对象是乳腺癌患者的单细胞序列数据 | digital pathology | breast cancer | single-cell sequencing | NA | genome | 约2,000个细胞，来自两名乳腺癌患者 |
| 46 | 2024-08-07 |
A multi-center cross-platform single-cell RNA sequencing reference dataset
2021-02-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-00809-x
PMID:33531477
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研究论文 | 本文介绍了一个多中心跨平台的单细胞RNA测序（scRNA-seq）基准数据集 | 该数据集包括20个scRNA-seq数据集，来自两个生物学上不同的细胞系，且包含多平台的全基因组测序数据，适用于评估各种scRNA-seq分析的生物信息学方法 | NA | 提供一个适用于不同scRNA-seq平台和生物信息学方法基准测试的参考数据集 | 两个生物学上不同的细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 20个scRNA-seq数据集 |
| 47 | 2024-08-07 |
Enabling single-cell trajectory network enrichment
2021-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-021-00025-y
PMID:38217228
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研究论文 | 本文开发了一种名为Scellnetor的网络约束时间序列聚类算法，用于单细胞测序数据分析，以揭示细胞分化过程中的基因表达网络模式 | Scellnetor算法能够提取解释两个发育轨迹调控差异的时间差异基因表达网络模式，将单细胞测序数据分析提升到系统生物学水平 | NA | 开发新的工具以增强单细胞测序数据在系统生物学层面的分析能力 | 单细胞测序数据中的细胞分化过程及其基因表达网络模式 | 系统生物学 | NA | scRNA-seq | 网络约束时间序列聚类算法 | 基因表达数据 | 使用已知特征的实验模型系统进行验证 |
| 48 | 2024-08-08 |
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
2021-02, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00154-9
PMID:35122077
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自26名患者的69,000多个胶质母细胞瘤干细胞（GSCs），揭示了GSCs在转录水平上的高度异质性，并发现这种异质性可能与正常神经发育和炎症伤口反应的转录状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9基因敲除筛选，揭示了胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性与其功能脆弱性之间的关系。 | 研究主要集中在细胞培养和基因敲除筛选上，可能未能完全反映肿瘤在体内的复杂环境。 | 探究胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性及其对肿瘤功能的影响。 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）及其转录状态。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 69,000多个GSCs来自26名患者 |
| 49 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic atlas of primate pancreatic islet aging
2021-Feb, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa127
PMID:34691567
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了年轻和老年非糖尿病食蟹猴胰腺胰岛细胞的转录组变化 | 首次揭示了老年β细胞中未折叠蛋白反应（UPR）的增加及其与蛋白聚集物的积累，以及HSP90B1在老年β细胞中的上调 | 研究仅限于非糖尿病食蟹猴，可能不完全适用于其他物种或糖尿病患者 | 解码与胰腺胰岛功能衰退相关的转录组变化，并探讨通过靶向UPR成分来延缓β细胞衰老和预防与年龄相关的糖尿病的可能性 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 |
| 50 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of mouse olfactory bulb chromatin accessibility
2021-02-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.02.007
PMID:33926839
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研究论文 | 本研究利用单细胞转座酶可及染色质测序技术，对小鼠嗅球中的9,549个单细胞的染色质可及性进行了全基因组分析 | 首次对小鼠嗅球的单细胞表观遗传景观进行了详细研究，揭示了不同细胞群特有的潜在调控元件及其功能 | NA | 旨在深入理解嗅球在单细胞水平上的调控机制及其治疗潜力 | 小鼠嗅球的单细胞染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 染色质可及性数据 | 9,549个单细胞 |
| 51 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Infection of Airway Epithelial Cells
2021-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2021.21.e3
PMID:33728096
|
综述 | 本文综述了SARS-CoV-2感染气道上皮细胞的细胞进入、宿主-病毒相互作用及免疫反应 | NA | NA | 探讨SARS-CoV-2在气道上皮细胞中的感染机制及相关治疗选项 | SARS-CoV-2感染的气道上皮细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Single Cell Transcriptomic Re-analysis of Immune Cells in Bronchoalveolar Lavage Fluids Reveals the Correlation of B Cell Characteristics and Disease Severity of Patients with SARS-CoV-2 Infection
2021-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2021.21.e10
PMID:33728103
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研究论文 | 本研究重新分析了来自COVID-19轻度和重度症状患者的支气管肺泡灌洗液中单细胞RNA测序数据，重点关注抗体产生细胞，揭示了B细胞特征与疾病严重程度的相关性 | 首次揭示了COVID-19患者中B细胞的激活状态与疾病严重程度的相关性，并发现重度患者中巨噬细胞表达更高水平的B细胞激活因子 | NA | 探究COVID-19患者中B细胞特征与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自COVID-19轻度和重度症状患者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 |
| 53 | 2024-08-09 |
The T Cell Repertoires from Nickel Sensitized Joint Implant Failure Patients
2021-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052428
PMID:33670995
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术分析了镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | 本研究首次详细描述了镍敏感导致的关节植入失败患者中镍特异性T细胞库的Vα和Vβ使用情况，并发现与接触性皮炎研究中的使用情况有所不同 | 研究样本仅来自两名患者，可能不足以代表所有镍敏感导致的关节植入失败患者的情况 | 旨在阐明镍过敏导致关节植入失败的机制 | 镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | NA | NA | 单细胞VDJ测序 | NA | T细胞受体序列 | 两名患者 |
| 54 | 2024-08-09 |
Time-Resolved scRNA-Seq Tracks the Adaptation of a Sensitive MCL Cell Line to Ibrutinib Treatment
2021-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052276
PMID:33668876
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研究论文 | 本研究使用时间分辨的单细胞RNA测序技术，追踪了敏感的套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系对伊布替尼治疗的适应过程 | 揭示了五个亚群及其对治疗的个体反应，并发现了B细胞受体信号通路的激活、与微环境的相互作用、代谢重编程等与伊布替尼耐药相关的机制 | NA | 旨在解析敏感的套细胞淋巴瘤细胞系对伊布替尼治疗的反应 | 套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的单细胞 |
| 55 | 2024-08-09 |
Ex uno, plures-From One Tissue to Many Cells: A Review of Single-Cell Transcriptomics in Cardiovascular Biology
2021-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22042071
PMID:33669808
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在心血管生物学中的应用，探讨了其在心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤中的作用 | 单细胞分析提供了比传统整体方法更精确的组织组成、细胞分化轨迹和细胞间通讯的定义 | NA | 旨在回顾单细胞多组学研究如何改变我们对心脏发育及健康与疾病状态下成年心肌细胞动力学的理解 | 心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
Guide Cells Support Muscle Regeneration and Affect Neuro-Muscular Junction Organization
2021-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22041939
PMID:33669272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别并分离了一类能够促进肌源性分化的血管相关细胞亚群，称为'引导'细胞，并研究了它们在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的影响。 | 首次识别并分离出能够促进肌源性分化的'引导'细胞，并探讨了其在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的作用。 | 需要进一步研究这些细胞的起源及其在再生肌纤维终末分化中的必要性。 | 研究肌肉再生过程中神经肌肉接头的形成机制。 | 肌肉再生过程中的'引导'细胞及其对神经肌肉接头形成的影响。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在小鼠急性肌肉损伤和再生模型中进行了实验。 |
| 57 | 2024-08-09 |
Tumor-specific cytolytic CD4 T cells mediate immunity against human cancer
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe3348
PMID:33637530
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研究论文 | 本研究通过挖掘单细胞RNA测序数据集，识别出在不同人类癌症中表现出细胞毒性表型的CD4 T细胞簇，并使用肽-MHCII-多聚体技术在体外验证了肿瘤特异性细胞毒性CD4 T细胞的存在 | 本研究首次在单细胞水平上综合表型和功能特征，利用高吞吐量纳米生物芯片和机器学习技术，展示了CD4 T细胞对肿瘤的直接、接触依赖性和粒酶依赖性细胞毒性活性 | NA | 研究CD4 T细胞在癌症免疫中的直接细胞毒性潜力 | CD4 T细胞在不同人类癌症中的细胞毒性表型 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | 不同人类癌症患者的数据 |
| 58 | 2024-08-09 |
Single-cell immune repertoire and transcriptome sequencing reveals that clonally expanded and transcriptionally distinct lymphocytes populate the aged central nervous system in mice
2021-02-24, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2020.2793
PMID:33622131
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，同时分析了年轻和老年小鼠大脑中B细胞和T细胞的免疫受体库及其伴随的基因表达谱 | 首次实现了在中枢神经系统中对淋巴细胞免疫受体库及其转录状态的综合分析 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨这些发现对人类神经系统疾病的具体影响 | 探讨随着年龄增长，中枢神经系统中淋巴细胞免疫受体库及其转录状态的变化 | 年轻和老年小鼠的中枢神经系统中的B细胞和T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的大脑样本 |
| 59 | 2024-08-09 |
Antigen Nonspecific Induction of Distinct Regulatory T Cell States in Oncogene-Driven Hyperproliferative Skin
2021-02-22, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100006
PMID:33619159
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在表达HPV16 E7的转基因小鼠皮肤移植物中招募的调节性T细胞（Tregs）的转录组和TCR谱 | 研究发现，由致癌基因诱导的过度增殖皮肤能够吸引并诱导非抗原特异性的Tregs，这些Tregs获得了由特定效应基因特征定义的独特调节表型 | NA | 探讨在慢性疾病（包括癌症）中，非淋巴组织如何塑造Treg表型多样性 | 表达HPV16 E7的转基因小鼠皮肤移植物中的Tregs | 免疫学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 转基因和非转基因小鼠皮肤移植物中的Tregs |
| 60 | 2024-08-09 |
Elevated LINC01550 induces the apoptosis and cell cycle arrest of melanoma
2021-Feb-20, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-021-01478-x
PMID:33609219
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析探讨了LINC01550在黑色素瘤组织中的表达及其对细胞增殖、侵袭和凋亡的影响 | 发现LINC01550在黑色素瘤中的低表达与患者生存率降低相关，并能抑制肿瘤细胞的增殖和侵袭能力 | NA | 研究LINC01550在黑色素瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 黑色素瘤组织和细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及黑色素瘤细胞系WM35和WM451 |