单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing and lipidomics reveal cell and lipid dynamics of fat infiltration in skeletal muscle
2021-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12643
PMID:33244879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和脂质组学分析，揭示了骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序和脂质组学技术，详细解析了骨骼肌脂肪浸润过程中的细胞起源和脂质及转录组变化 | 研究主要集中在短期内的细胞和脂质变化，长期影响及机制尚需进一步研究 | 探究骨骼肌中脂肪浸润的细胞起源和脂质及转录组变化 | 骨骼肌中的脂肪浸润现象 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | RNA, 脂质 | GLY注射后的骨骼肌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-05 |
Human airway mast cells proliferate and acquire distinct inflammation-driven phenotypes during type 2 inflammation
2021-02-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abb7221
PMID:33637594
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研究论文 | 本研究分析了人类气道肥大细胞在2型炎症过程中的增殖及其特异的以炎症驱动的表型 | 本研究链接了肥大细胞表面表型与其不同转录组之间的关系，揭示了肥大细胞在CRSwNP中的特异性增殖 | 对肥大细胞异质性的机制及其扩展的转录程序尚不完全理解 | 研究肥大细胞在2型过敏性炎症疾病中的作用及其增殖机制 | 人类气道中的肥大细胞，尤其是在慢性鼻窦炎伴有鼻息肉症中的肥大细胞 | 数字病理 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术及单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis of Blood-Brain Barrier Response to Pericyte Loss
2021-02-19, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317473
PMID:33375813
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研究论文 | 本研究揭示了缺失周细胞对脑内皮细胞转录变化的影响 | 首次从单细胞层面揭示了缺失周细胞对血脑屏障的复杂影响及其分子机制 | 研究中使用的是基因诱导的周细胞缺失小鼠模型，可能不完全反映人类病理状态 | 映射缺失周细胞接触对脑内皮细胞转录变化的影响，并与血脑屏障功能和血管表型的区域异质性进行关联 | 缺失周细胞接触的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 脑部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了成年Pdgfbret/ret小鼠进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-05 |
Investigation of Drosophila fruitless neurons that express Dpr/DIP cell adhesion molecules
2021-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63101
PMID:33616528
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研究论文 | 研究表达Dpr/DIP细胞粘附分子的果蝇fruitless神经元的功能和特征 | 通过对基因组研究的重新分析，发现对性别特异性行为的神经元形态和细胞数量存在性别二态性 | 未详细介绍实验样本和研究方法的局限性 | 探讨fruitless神经元在果蝇交配行为中的作用 | Drosophila的fruitless神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-05 |
CHARTS: a web application for characterizing and comparing tumor subpopulations in publicly available single-cell RNA-seq data sets
2021-Feb-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04021-x
PMID:33622236
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CHARTS的网络应用程序，可用于描述和比较公开可用的单细胞RNA-seq数据集中的肿瘤亚群 | CHARTS提供了一种新的方式，以便于对单细胞肿瘤亚群的基因表达、细胞类型和癌症状态进行深入分析 | 该研究未详细讨论应用程序的使用限制和数据集的质量控制问题 | 旨在提供一种工具，以更好地理解肿瘤异质性的机制 | 公开可用的单细胞RNA-seq肿瘤数据集 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional profiling of human thymic stroma uncovers novel cellular heterogeneity in the thymic medulla
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21346-6
PMID:33597545
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研究论文 | 该文章揭示了人类胸腺基质的细胞异质性及其在免疫耐受中的作用 | 使用单细胞RNA测序技术全面剖析胸腺基质的细胞异质性，并发现新型细胞群体和潜在的关键调节因子 | 研究局限于单细胞RNA测序数据，未涵盖更广泛的生理和病理状态 | 旨在理解人类胸腺细胞的多样性及其对免疫系统发展的影响 | 重点研究人类胸腺基质及其各个发展阶段的细胞群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals developmental heterogeneity among Plasmodium berghei sporozoites
2021-02-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-82914-w
PMID:33619283
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研究论文 | 本研究利用基于液滴的单细胞RNA测序技术，分析了从按蚊中肠和唾液腺中提取的超过8000个Plasmodium berghei孢子体的转录组 | 本研究首次使用高吞吐量的单细胞RNA测序工作流程，揭示了Plasmodium berghei孢子体在发育过程中的基因表达差异 | NA | 研究旨在通过分子水平了解疟疾寄生虫孢子体的发育异质性，为疟疾预防策略提供新见解 | 研究对象为Plasmodium berghei孢子体 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过8000个Plasmodium berghei孢子体 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Clustering Single-Cell RNA-Seq Data with Regularized Gaussian Graphical Model
2021-02-22, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12020311
PMID:33671799
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研究论文 | 本文提出了一种新的正则化高斯图形聚类（RGGC）方法，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的聚类 | RGGC方法基于高阶（偏）相关和子空间学习，对正则化参数λ具有广泛的鲁棒性，无需交叉验证即可简单设置λ=2或λ=log(p)，并且使用Louvain社区检测算法自动确定聚类数量 | NA | 开发一种简单、稳健且高效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 正则化高斯图形模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Benchmarking Computational Doublet-Detection Methods for Single-Cell RNA Sequencing Data
2021-02-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.11.008
PMID:33338399
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研究论文 | 本文对九种先进的计算双峰检测方法进行了系统的基准研究，以评估其在单细胞RNA测序数据中的性能 | 首次对多种计算双峰检测方法进行了全面的基准测试，为研究人员选择合适的方法提供了依据 | 研究仅限于特定的实验设置和数据集，可能无法完全代表所有可能的应用场景 | 评估和比较不同计算双峰检测方法在单细胞RNA测序数据中的准确性、对下游分析的影响及计算效率 | 九种计算双峰检测方法在16个真实数据集和112个合成数据集上的性能 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 16个真实数据集和112个合成数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
NECAB1 and NECAB2 are Prevalent Calcium-Binding Proteins of CB1/CCK-Positive GABAergic Interneurons
2021-02-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhaa326
PMID:33230531
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研究论文 | 本文探讨了CB1/CCK阳性GABA能中间神经元中NECAB1和NECAB2钙结合蛋白的表达及其在神经元中的分布和功能。 | 首次发现CB1/CCK阳性GABA能中间神经元中NECAB1和NECAB2作为主要的钙结合蛋白，并揭示了它们在亚细胞水平的纳米尺度差异。 | NA | 研究CB1/CCK阳性GABA能中间神经元中钙信号传导工具包的分子组成，特别是钙结合蛋白的表达。 | CB1/CCK阳性GABA能中间神经元中的NECAB1和NECAB2钙结合蛋白。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，免疫染色，膜片钳电生理学，共聚焦和STORM超分辨率显微镜。 | NA | RNA序列，图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
A tumor microenvironment-specific gene expression signature predicts chemotherapy resistance in colorectal cancer patients
2021-Feb-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00142-x
PMID:33580207
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研究论文 | 本研究利用肿瘤微环境（TME）特异性基因表达特征来预测结直肠癌（CRC）患者的化疗耐药性 | 构建了一个名为SFM的特征，能够区分TME和药物敏感性，并通过K-means聚类在三个独立队列中验证 | NA | 研究TME特异性基因表达特征在预测结直肠癌化疗耐药性中的作用 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境和化疗耐药性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | K-means聚类 | RNA测序数据 | 总共2269个'bulk' RNA测序数据集和四个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Mutated clones driving leukemic transformation are already detectable at the single-cell level in CD34-positive cells in the chronic phase of primary myelofibrosis
2021-Feb-04, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-021-00144-9
PMID:33542466
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研究论文 | 研究通过单细胞基因组学和转录组学分析，揭示了原发性骨髓纤维化（PMF）向急性髓系白血病（AML）转化过程中的克隆演化和基因突变模式 | 首次在单细胞水平上检测到驱动白血病转化的突变克隆，并揭示了Ruxolitinib对干扰素信号的抑制作用及其免疫抑制效应 | 研究仅基于单一患者样本，结果的普遍性和适用性有待进一步验证 | 探讨骨髓增生性肿瘤疾病进展的基因组复杂性，并评估单细胞分析在预测疾病演变和个性化治疗中的应用 | 原发性骨髓纤维化患者的CD34阳性细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞基因组学和转录组学 | NA | 基因组和转录组数据 | 单一患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Clonal evolution in liver cancer at single-cell and single-variant resolution
2021-02-02, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-021-01036-y
PMID:33531041
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研究论文 | 本文基于单细胞突变谱重构了人类肝癌的单变异分辨率克隆进化 | 首次重构了人类肝癌的单细胞和单变异克隆进化，并解析了遗传和表型异质性的关系 | NA | 研究肝癌的克隆进化及其与遗传和表型异质性的关系 | 人类肝癌的克隆进化及其遗传和表型异质性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞突变谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Tumour heterogeneity and intercellular networks of nasopharyngeal carcinoma at single cell resolution
2021-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21043-4
PMID:33531485
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和T细胞受体测序技术，分析了10对鼻咽癌肿瘤-血液样本中的176,447个细胞，揭示了鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间网络 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间相互作用，特别是发现了LAMP3树突状细胞、调节性T细胞和耗竭的CD8 T细胞之间的密集相互作用 | NA | 揭示鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间相互作用，为鼻咽癌的精准治疗提供新的见解 | 鼻咽癌肿瘤微环境的异质性和细胞间网络 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 176,447个细胞来自10对鼻咽癌肿瘤-血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals a concomitant delay in differentiation and cell cycle of aged hematopoietic stem cells
2021-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-00955-z
PMID:33526011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了年轻和老年小鼠造血干细胞的转录组，揭示了老化过程中造血干细胞分化和细胞周期的延迟现象 | 本研究首次在单细胞尺度上重新审视了小鼠造血干细胞在老化过程中的转录可塑性，并揭示了老化导致造血干细胞分化延迟的潜在机制 | NA | 探讨老化过程中造血干细胞的分化及细胞周期变化 | 小鼠的造血干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 15,000个年轻和老年小鼠的转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Melanoma Single-Cell Biology in Experimental and Clinical Settings
2021-Feb-01, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10030506
PMID:33535416
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术深入研究了恶性黑色素瘤的细胞异质性及其对治疗反应和耐药性的影响 | 揭示了免疫细胞和成纤维细胞在肿瘤微环境中的预后亚型，以及检查点抑制剂治疗耐药性的免疫细胞特征和新的可靶向的细胞内信号通路 | NA | 深入了解黑色素瘤的生物学特性，特别是肿瘤异质性和转录可塑性的作用 | 恶性黑色素瘤的单细胞生物学特性，包括免疫细胞和成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Patient-tailored design for selective co-inhibition of leukemic cell subpopulations
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe4038
PMID:33608276
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研究论文 | 本文提出了一种基于机器学习的方法，通过结合单细胞RNA测序和体外单药测试，为急性髓系白血病（AML）患者定制药物组合，以实现对特定白血病细胞亚群的选择性协同抑制。 | 本文的创新点在于利用机器学习方法，结合单细胞RNA测序和体外单药测试，为患者定制药物组合，实现对特定白血病细胞亚群的选择性协同抑制。 | NA | 本文的研究目的是设计个性化组合治疗方案，以利用患者特定的治疗脆弱性，选择性地靶向驱动疾病的细胞亚群。 | 本文的研究对象是急性髓系白血病（AML）患者及其白血病细胞亚群。 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 两个诊断期和两个难治性急性髓系白血病（AML）患者病例 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics uncovers potential marker genes of ochratoxin A-sensitive renal cells in an acute toxicity rat model
2021-02, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-020-09531-7
PMID:32468156
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-020-00561-1
PMID:32915415
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研究论文 | 本研究探讨了1p/19q共缺失状态对IDH突变型低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞（TAM）表型及其丰度的影响 | 首次全面研究了IDH突变型低级别胶质瘤中TAM的表型及其与1p/19q共缺失状态的关系 | 研究主要基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变型低级别胶质瘤中TAM的表型或其丰度 | IDH突变型低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 230个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Small Bowel Resection Increases Paracellular Gut Barrier Permeability via Alterations of Tight Junction Complexes Mediated by Intestinal TLR4
2021-02, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2020.08.049
PMID:33002664
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研究论文 | 本文研究了小肠切除术后通过肠道TLR4信号传导改变紧密连接复合物，从而增加肠道屏障通透性的机制 | 首次探讨了小肠切除术后通过肠道TLR4信号传导改变紧密连接复合物，从而影响肠道屏障通透性的机制 | 实验仅在特定的小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨小肠切除术后肠道屏障通透性增加的机制，并寻找可能的蛋白质靶点以恢复肠道屏障 | 小肠切除术后肠道屏障通透性的变化及其机制 | NA | 短肠综合征 | 单细胞RNA测序，荧光素异硫氰酸盐-葡聚糖摄取，电子显微镜 | NA | 蛋白质表达 | B6和肠道特异性TLR4敲除(iTLR4 KO)小鼠，50%小肠切除或假手术 | NA | NA | NA | NA |