单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 155 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
|
研究论文 | 本研究揭示了GLP-1受体激动剂通过β细胞GLP-1R依赖机制增强人α细胞中PCSK1表达和β细胞特征的分子通路 | 首次发现GLP-1介导的调节人α细胞功能的新通路，并应用新型单细胞RNA测序技术DART-Seq进行验证 | 研究机制尚未完全阐明，动物实验仅在小鼠中进行 | 探索α细胞中PC1/3表达激活机制，为糖尿病治疗寻找新靶点 | 人胰岛α细胞和小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 人胰岛样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | DART-Seq | 新型高灵敏度单细胞RNA测序技术 |
| 2 | 2025-10-06 |
Cholangiocyte organoids can repair bile ducts after transplantation in the human liver
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz6964
PMID:33602855
|
研究论文 | 本研究证明胆管细胞类器官可在移植后修复人类肝脏中的胆管 | 首次将胆管细胞类器官应用于人类肝脏修复，并证明其移植后能恢复体内转录特征 | 研究在离体常温灌注模型中进行，尚未进行体内临床试验 | 探索类器官技术在再生医学中修复人类胆管的可行性 | 人类胆管细胞和胆管类器官 | 再生医学 | 胆管病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Common clonal origin of conventional T cells and induced regulatory T cells in breast cancer patients
2021-02-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21297-y
PMID:33602930
|
研究论文 | 本研究通过T细胞受体和单细胞转录组测序分析乳腺癌患者中调节性T细胞的克隆起源 | 首次揭示人类乳腺癌中调节性T细胞可能主要来源于抗原经验性常规T细胞通过肿瘤内激活转化为诱导性调节性T细胞 | 研究仅限于乳腺癌患者，机制细节仍需进一步验证 | 探究人类癌症中调节性T细胞库形成的机制 | 乳腺癌患者的调节性CD4 T细胞和常规T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | T细胞受体测序, 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.002
PMID:33508232
|
荟萃分析 | 通过整合多种肿瘤类型的基因组和转录组数据，系统分析肿瘤细胞内在和微环境因素对检查点抑制剂敏感性的影响 | 首次在泛癌种水平验证了克隆肿瘤突变负荷是检查点抑制剂反应的最强预测因子，并发现CCR5和CXCL13作为T细胞内在的敏感性标志物 | 研究样本量相对有限，仅涵盖七种肿瘤类型，部分预测因子未达到泛癌种显著性 | 系统鉴定检查点抑制剂敏感性的肿瘤细胞内在和T细胞内在机制 | 1000多名接受检查点抑制剂治疗的患者，涵盖七种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 多变量预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 超过1000名患者 | NA | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肠道发育的时空动态 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学系统描绘人类肠道发育过程，识别了101种细胞状态和关键形态发生程序 | 研究主要关注胎儿期肠道发育，对出生后发育阶段涉及较少 | 解析人类肠道发育的细胞和分子机制 | 人类胎儿肠道组织 | 单细胞生物学, 发育生物学 | 肠道发育异常疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
|
研究论文 | 本研究揭示了MHC II类分子泛素化通过March-I调控树突状细胞功能的新机制 | 首次证明MHC II类分子泛素化缺陷会导致树突状细胞功能缺陷，即使表面pMHC-II水平正常 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类细胞中验证 | 探究MHC II类分子泛素化对树突状细胞功能的调控机制 | 树突状细胞、CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
|
研究论文 | 本研究通过清除衰老细胞改善老年小鼠大脑炎症和认知功能障碍 | 首次证明全身性清除衰老细胞可改善自然衰老过程中的认知功能，并发现小胶质细胞是衰老细胞清除的关键靶点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能改善年龄相关的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠，特别是海马体中的细胞 | 衰老生物学 | 年龄相关认知障碍 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠海马体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Assembly and Exploration of a Single Cell Atlas of the Drosophila Larval Ventral Cord. Identification of Rare Cell Types
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.37
PMID:33600085
|
研究论文 | 本研究开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的多阶段分析流程，并将其应用于果蝇幼虫腹侧索细胞图谱的构建和探索 | 整合了多个R软件包中的模块，创建了一个灵活、高质量的单细胞RNA-seq数据分析流程，能够识别和描述罕见细胞类型 | 分析流程需要针对特定目标进行定制和调整，存在一定的技术门槛 | 开发单细胞RNA测序数据分析方法并探索果蝇幼虫腹侧索的细胞多样性 | 果蝇幼虫腹侧索细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多阶段分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 多个果蝇幼虫腹侧索数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Drosophila Larval Ventral Cord
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.38
PMID:33620770
|
研究论文 | 本文描述了针对果蝇幼虫腹侧神经索进行单细胞RNA测序分析的优化实验方案 | 开发了一套专门针对果蝇幼虫腹侧神经索的scRNA-seq优化方案，解决了果蝇脑组织细胞尺寸小的技术挑战 | 方案主要针对果蝇幼虫腹侧神经索，可能需要进一步优化才能应用于其他组织 | 建立适用于果蝇神经系统的单细胞RNA测序分析方法 | 果蝇幼虫腹侧神经索 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3个独立样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Heterogeneous disease-propagating stem cells in juvenile myelomonocytic leukemia
2021-02-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20180853
PMID:33416891
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了幼年型粒单核细胞白血病中疾病传播干细胞的异质性特征 | 首次在JMML中鉴定出具有异质性的白血病干细胞群体，发现RAS通路突变是“首次打击”，并识别了新的治疗靶点/生物标志物 | 研究样本量有限，需要进一步验证候选靶点的临床价值 | 阐明幼年型粒单核细胞白血病的细胞层次结构和白血病干细胞特征 | 幼年型粒单核细胞白血病患者的造血干细胞/祖细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 克隆形成实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | JMML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00759-4
PMID:33349709
|
研究论文 | 通过活体成像技术在成年小鼠海马体中鉴定出具有长期自我更新能力的神经干细胞 | 首次通过活体成像技术直接观察并证实成年海马体中存在具有长期自我更新能力的Gli1靶向神经干细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型，人类海马体中是否存在类似干细胞群体尚不清楚 | 探究成年哺乳动物海马体中神经干细胞的长期自我更新能力 | 成年小鼠海马体中的神经干细胞 | 神经科学 | NA | 双光子显微镜, 活体成像, 单细胞RNA测序 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 成年小鼠海马体神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-07 |
The Nuclear Receptor ESRRA Protects from Kidney Disease by Coupling Metabolism and Differentiation
2021-02-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.011
PMID:33301705
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肾脏疾病中细胞多样性变化，发现近端小管细胞是易感细胞类型，并阐明代谢与细胞分化通过核受体ESRRA和PPARA耦合的机制 | 首次在单细胞水平系统揭示肾脏疾病中细胞特异性变化轨迹，发现代谢与细胞分化的耦合机制及核受体ESRRA的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肾脏疾病的细胞分子机制及保护性因子 | 小鼠肾脏疾病模型和患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠疾病模型和患者样本（具体数量未明确） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-07 |
Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108739
PMID:33567283
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究野生来源小鼠品系中小胶质细胞在阿尔茨海默病模型中的遗传变异影响 | 首次在野生来源小鼠品系中系统分析遗传多样性对小胶质细胞异质性和阿尔茨海默病反应的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索遗传变异如何影响阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和功能 | C57BL/6J和野生来源小鼠品系（WSB/EiJ、CAST/EiJ、PWK/PhJ）的小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | APP/PS1小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 四个小鼠品系（包括APP/PS1转基因和对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2024-12-08 |
Gut-licensed IFNγ+ NK cells drive LAMP1+TRAIL+ anti-inflammatory astrocytes
2021-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03116-4
PMID:33408417
|
研究论文 | 研究通过高通量流式细胞术筛选、单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9介导的细胞特异性体内遗传扰动，鉴定出表达LAMP1和TRAIL的星形胶质细胞亚群，并探讨其在中枢神经系统炎症中的作用 | 首次揭示了LAMP1TRAIL星形胶质细胞通过TRAIL-DR5信号诱导T细胞凋亡来限制中枢神经系统炎症，并发现这种星形胶质细胞亚群由肠道微生物群调节的IFNγ NK细胞维持 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的抗炎作用及其调控机制 | 星形胶质细胞、NK细胞、肠道微生物群 | 神经科学 | NA | 高通量流式细胞术、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-10-07 |
TATA and paused promoters active in differentiated tissues have distinct expression characteristics
2021-02, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209866
PMID:33543829
|
研究论文 | 研究了在分化组织中活跃的TATA和暂停启动子的不同表达特征 | 首次探讨了RNA聚合酶II暂停元素对组织特异性基因表达特征的影响，并提出了组织特异性基因在不同组织中表达的两种不同策略 | 研究仅限于果蝇晚期胚胎，可能无法完全推广到其他物种或发育阶段 | 探讨RNA聚合酶II暂停元素对组织特异性基因表达特征的影响 | TATA和暂停启动子在分化组织中的表达特征 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | 果蝇晚期胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-09-19 |
Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21246-9
PMID:33597522
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CellChat的工具，用于从单细胞RNA测序数据中推断和分析细胞间通信网络 | 开发了CellChat工具，能够准确表示细胞间信号连接并进行系统级分析，预测细胞的主要信号输入和输出，并通过网络分析和模式识别方法协调细胞和信号的功能 | NA | 理解和分析细胞间的全局通信 | 细胞间信号连接和通信网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类皮肤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-23 |
Opposing immune and genetic mechanisms shape oncogenic programs in synovial sarcoma
2021-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-01212-6
PMID:33495604
|
研究论文 | 本研究通过综合运用单细胞RNA测序、空间分析以及遗传和药理学扰动，探讨了滑膜肉瘤中的癌症-免疫相互作用 | 揭示了滑膜肉瘤中由SS18-SSX融合驱动的恶性细胞状态，并发现这种状态可被HDAC和CDK4/CDK6抑制剂联合治疗增强其免疫原性 | NA | 研究滑膜肉瘤中的癌症-免疫相互作用及其治疗策略 | 滑膜肉瘤中的恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 滑膜肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 16,872个细胞来自12个人类滑膜肉瘤肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-10 |
A fish with no sex: gonadal and adrenal functions partition between zebrafish NR5A1 co-orthologs
2021-02-09, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaa030
PMID:33724412
|
研究论文 | 本研究通过敲除斑马鱼中的nr5a1a和nr5a1b基因，探讨NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色。 | 首次揭示了斑马鱼中nr5a1a和nr5a1b基因在性腺和肾上腺功能中的分工，以及这种分工对性发育差异的影响。 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 | 探索NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色及其对性发育的影响。 | 斑马鱼的nr5a1a和nr5a1b基因及其在性腺和肾上腺中的功能。 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括1天和2天龄的斑马鱼胚胎以及成年斑马鱼。 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-09 |
Efficient IL-2R signaling differentially affects the stability, function, and composition of the regulatory T-cell pool
2021-02, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00599-z
PMID:33408345
|
研究论文 | 研究通过分析一种自发突变小鼠品系，探讨了IL-2R信号在调节Treg细胞稳定性、功能及其组成中的作用 | 首次揭示了IL-2R信号的部分丧失如何影响Treg细胞池的维持、异质性和抑制功能 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨IL-2R信号在不同条件下对Treg细胞稳态、谱系稳定性和功能的影响 | Treg细胞及其在非炎症和炎症环境下的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Cd25小鼠的Treg细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Entropy subspace separation-based clustering for noise reduction (ENCORE) of scRNA-seq data
2021-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1157
PMID:33305325
|
研究论文 | 本文提出了一种基于熵子空间分离的聚类算法ENCORE，用于减少单细胞RNA测序数据中的噪声 | ENCORE算法通过集成熵子空间分离策略和共识聚类方法，能够有效区分信息特征与噪声，提高细胞聚类的准确性和可视化分辨率 | NA | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和分辨率，以更好地研究细胞异质性和发现群体标记 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类、标记识别和可视化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 12个标准数据集 | NA | NA | NA | NA |