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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在单细胞分辨率下描绘人类肠道发育的时空图谱 | 首次在单细胞水平系统性地构建人类肠道发育的时空图谱,揭示肠道形成的动态过程及多种细胞类型的分化层次 | 研究仅基于胎儿组织样本,可能无法完全代表出生后肠道发育的完整过程 | 解析人类肠道发育过程中的细胞组成、基因表达动态和空间组织规律 | 人类胎儿肠道组织的发育阶段(不同时间点的样本) | 数字病理学 | 罕见肠道发育障碍 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 未具体说明样本数量,涉及多个时间点的人类胎儿肠道组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium进行单细胞RNA测序,10x Visium进行空间转录组学分析 |
| 2 | 2026-05-16 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
|
研究论文 | 通过Wnt信号抑制诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞分化 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定出诱导多能干细胞来源的肺泡I型细胞,并证明XAV-939通过抑制经典Wnt信号通路促进其分化 | 未明确说明局限性(原文未提及) | 研究肺泡I型细胞的分化机制 | 人诱导多能干细胞来源的肺泡上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量(涉及成纤维细胞依赖的肺泡类器官) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 3 | 2026-05-11 |
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12968
PMID:33332660
|
研究论文 | 比较早发型和晚发型子痫前期的全身转录组,揭示其病理差异并发现新型生物标志物 | 首次整合胎盘和外周血转录组与母胎界面单细胞转录组,系统比较早发型和晚发型子痫前期的病理差异,并发现各自特异的新型生物标志物 | 需要更大样本量验证新标志物的临床适用性,且单细胞数据整合分析的深度有限 | 阐明早发型和晚发型子痫前期的病理差异并发现新型诊断生物标志物 | 子痫前期患者(早发型和晚发型)的胎盘和外周血样本 | 数字病理学 | 子痫前期 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 包含早发型和晚发型子痫前期患者及对照组的胎盘和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 整合了母胎界面的单细胞转录组数据 |
| 4 | 2026-05-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of decidual tissues during the peripartum period
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12967
PMID:33300223
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析围产期蜕膜组织的异质性和差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示围产期蜕膜中多种细胞亚型的动态变化及其功能,包括蜕膜基质细胞、绒毛外滋养细胞和T细胞的激活状态 | 未提及具体局限性 | 研究围产期蜕膜组织的细胞异质性和转录组变化,以理解其在分娩启动中的作用 | 分娩前后的蜕膜细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,231个蜕膜细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-05-11 |
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.20-0227
PMID:33125830
|
研究论文 | TransSynW是一个基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序,用于指导细胞转化实验 | 首次开发基于单细胞RNA测序数据的网络应用来预测细胞转化转录因子,并优先识别先驱因子以促进染色质开放 | 需进一步验证预测结果的实验可行性,且可能受限于单细胞数据的质量和细胞类型的代表性 | 开发计算工具预测细胞转化所需的转录因子,推动干细胞研究和再生医学中的细胞疗法 | 用户指定的细胞群体及其转化过程中涉及的转录因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-02 |
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-020-00561-1
PMID:32915415
|
研究论文 | 本研究探讨1p/19q共缺失状态对IDH突变低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞浸润的影响 | 首次揭示1p/19q共缺失状态与IDH突变低级别胶质瘤中TAM表型及浸润程度的关联,并发现M-CSF和TGFβ1信号通路可能介导这一过程 | 研究主要依赖TCGA转录组数据和有限样本的免疫染色,小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变低级别胶质瘤中TAM的表型或浸润程度 | IDH突变低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑胶质瘤 | RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫染色、小分子抑制剂 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、组织样本图像 | 230个TCGA样本及IDH突变LGG原代样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-09 |
Holistic characterization of single-hepatocyte transcriptome responses to high-fat diet
2021-02-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00391.2020
PMID:33103450
|
研究论文 | 本研究利用基于液滴的单细胞RNA测序技术,全面分析了高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病中单个肝细胞的转录组响应特征 | 首次在单细胞水平系统表征了肝细胞对高脂饮食的异质性转录组变化,揭示了分区依赖和独立的响应模式,并发现了脂质代谢相关基因的空间共表达模式 | 研究主要关注转录组层面,未涉及蛋白质组或代谢组等多组学验证;样本来源为小鼠模型,人类临床样本的适用性有待进一步验证 | 探究高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病中肝细胞的单细胞转录组响应机制 | 高脂饮食喂养小鼠的肝细胞 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但基于单细胞测序技术分析多个肝细胞 | 未明确指定 | 单细胞RNA-seq | Drop-seq | 基于液滴的单细胞RNA测序平台 |
| 8 | 2026-04-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
|
研究论文 | 本研究通过清除老年小鼠体内的衰老细胞,减轻了大脑炎症并改善了认知功能 | 首次证明在正常衰老过程中清除衰老细胞可以改善认知功能障碍,并发现衰老细胞在小胶质细胞和少突胶质前体细胞中显著增加 | 研究仅在INK-ATTAC转基因小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能缓解衰老过程中的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | RNA测序数据 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | NA | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
|
研究论文 | 本研究揭示了GLP-1受体激动剂通过β细胞GLP-1R依赖机制增强人α细胞中PCSK1表达和β细胞特征的分子通路 | 首次发现GLP-1介导的调节人α细胞功能的新通路,并应用新型单细胞RNA测序技术DART-Seq进行验证 | 研究机制尚未完全阐明,动物实验仅在小鼠中进行 | 探索α细胞中PC1/3表达激活机制,为糖尿病治疗寻找新靶点 | 人胰岛α细胞和小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 人胰岛样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | DART-Seq | 新型高灵敏度单细胞RNA测序技术 |
| 10 | 2025-10-06 |
Cholangiocyte organoids can repair bile ducts after transplantation in the human liver
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz6964
PMID:33602855
|
研究论文 | 本研究证明胆管细胞类器官可在移植后修复人类肝脏中的胆管 | 首次将胆管细胞类器官应用于人类肝脏修复,并证明其移植后能恢复体内转录特征 | 研究在离体常温灌注模型中进行,尚未进行体内临床试验 | 探索类器官技术在再生医学中修复人类胆管的可行性 | 人类胆管细胞和胆管类器官 | 再生医学 | 胆管病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Common clonal origin of conventional T cells and induced regulatory T cells in breast cancer patients
2021-02-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21297-y
PMID:33602930
|
研究论文 | 本研究通过T细胞受体和单细胞转录组测序分析乳腺癌患者中调节性T细胞的克隆起源 | 首次揭示人类乳腺癌中调节性T细胞可能主要来源于抗原经验性常规T细胞通过肿瘤内激活转化为诱导性调节性T细胞 | 研究仅限于乳腺癌患者,机制细节仍需进一步验证 | 探究人类癌症中调节性T细胞库形成的机制 | 乳腺癌患者的调节性CD4 T细胞和常规T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | T细胞受体测序, 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Meta-analysis of tumor- and T cell-intrinsic mechanisms of sensitization to checkpoint inhibition
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.01.002
PMID:33508232
|
荟萃分析 | 通过整合多种肿瘤类型的基因组和转录组数据,系统分析肿瘤细胞内在和微环境因素对检查点抑制剂敏感性的影响 | 首次在泛癌种水平验证了克隆肿瘤突变负荷是检查点抑制剂反应的最强预测因子,并发现CCR5和CXCL13作为T细胞内在的敏感性标志物 | 研究样本量相对有限,仅涵盖七种肿瘤类型,部分预测因子未达到泛癌种显著性 | 系统鉴定检查点抑制剂敏感性的肿瘤细胞内在和T细胞内在机制 | 1000多名接受检查点抑制剂治疗的患者,涵盖七种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 多变量预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 超过1000名患者 | NA | 全外显子组测序, 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Ubiquitination of MHC Class II by March-I Regulates Dendritic Cell Fitness
2021-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000975
PMID:33318291
|
研究论文 | 本研究揭示了MHC II类分子泛素化通过March-I调控树突状细胞功能的新机制 | 首次证明MHC II类分子泛素化缺陷会导致树突状细胞功能缺陷,即使表面pMHC-II水平正常 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证 | 探究MHC II类分子泛素化对树突状细胞功能的调控机制 | 树突状细胞、CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Assembly and Exploration of a Single Cell Atlas of the Drosophila Larval Ventral Cord. Identification of Rare Cell Types
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.37
PMID:33600085
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研究论文 | 本研究开发了一个用于单细胞RNA测序数据分析的多阶段分析流程,并将其应用于果蝇幼虫腹侧索细胞图谱的构建和探索 | 整合了多个R软件包中的模块,创建了一个灵活、高质量的单细胞RNA-seq数据分析流程,能够识别和描述罕见细胞类型 | 分析流程需要针对特定目标进行定制和调整,存在一定的技术门槛 | 开发单细胞RNA测序数据分析方法并探索果蝇幼虫腹侧索的细胞多样性 | 果蝇幼虫腹侧索细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多阶段分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 多个果蝇幼虫腹侧索数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Drosophila Larval Ventral Cord
2021-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.38
PMID:33620770
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研究论文 | 本文描述了针对果蝇幼虫腹侧神经索进行单细胞RNA测序分析的优化实验方案 | 开发了一套专门针对果蝇幼虫腹侧神经索的scRNA-seq优化方案,解决了果蝇脑组织细胞尺寸小的技术挑战 | 方案主要针对果蝇幼虫腹侧神经索,可能需要进一步优化才能应用于其他组织 | 建立适用于果蝇神经系统的单细胞RNA测序分析方法 | 果蝇幼虫腹侧神经索 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3个独立样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Heterogeneous disease-propagating stem cells in juvenile myelomonocytic leukemia
2021-02-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20180853
PMID:33416891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了幼年型粒单核细胞白血病中疾病传播干细胞的异质性特征 | 首次在JMML中鉴定出具有异质性的白血病干细胞群体,发现RAS通路突变是“首次打击”,并识别了新的治疗靶点/生物标志物 | 研究样本量有限,需要进一步验证候选靶点的临床价值 | 阐明幼年型粒单核细胞白血病的细胞层次结构和白血病干细胞特征 | 幼年型粒单核细胞白血病患者的造血干细胞/祖细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 克隆形成实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | JMML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00759-4
PMID:33349709
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研究论文 | 通过活体成像技术在成年小鼠海马体中鉴定出具有长期自我更新能力的神经干细胞 | 首次通过活体成像技术直接观察并证实成年海马体中存在具有长期自我更新能力的Gli1靶向神经干细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型,人类海马体中是否存在类似干细胞群体尚不清楚 | 探究成年哺乳动物海马体中神经干细胞的长期自我更新能力 | 成年小鼠海马体中的神经干细胞 | 神经科学 | NA | 双光子显微镜, 活体成像, 单细胞RNA测序 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 成年小鼠海马体神经干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
The Nuclear Receptor ESRRA Protects from Kidney Disease by Coupling Metabolism and Differentiation
2021-02-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.011
PMID:33301705
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示肾脏疾病中细胞多样性变化,发现近端小管细胞是易感细胞类型,并阐明代谢与细胞分化通过核受体ESRRA和PPARA耦合的机制 | 首次在单细胞水平系统揭示肾脏疾病中细胞特异性变化轨迹,发现代谢与细胞分化的耦合机制及核受体ESRRA的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究肾脏疾病的细胞分子机制及保护性因子 | 小鼠肾脏疾病模型和患者样本 | 单细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠疾病模型和患者样本(具体数量未明确) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
Natural genetic variation determines microglia heterogeneity in wild-derived mouse models of Alzheimer's disease
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108739
PMID:33567283
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究野生来源小鼠品系中小胶质细胞在阿尔茨海默病模型中的遗传变异影响 | 首次在野生来源小鼠品系中系统分析遗传多样性对小胶质细胞异质性和阿尔茨海默病反应的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探索遗传变异如何影响阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和功能 | C57BL/6J和野生来源小鼠品系(WSB/EiJ、CAST/EiJ、PWK/PhJ)的小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | APP/PS1小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 四个小鼠品系(包括APP/PS1转基因和对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2024-12-08 |
Gut-licensed IFNγ+ NK cells drive LAMP1+TRAIL+ anti-inflammatory astrocytes
2021-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03116-4
PMID:33408417
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研究论文 | 研究通过高通量流式细胞术筛选、单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9介导的细胞特异性体内遗传扰动,鉴定出表达LAMP1和TRAIL的星形胶质细胞亚群,并探讨其在中枢神经系统炎症中的作用 | 首次揭示了LAMP1TRAIL星形胶质细胞通过TRAIL-DR5信号诱导T细胞凋亡来限制中枢神经系统炎症,并发现这种星形胶质细胞亚群由肠道微生物群调节的IFNγ NK细胞维持 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的抗炎作用及其调控机制 | 星形胶质细胞、NK细胞、肠道微生物群 | 神经科学 | NA | 高通量流式细胞术、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |