单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1961	2024-08-09	Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis 2021-11, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220256 PMID:34001518	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1962	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing profiling in a patient with discordant primary cutaneous B-cell and T-cell lymphoma reveals micromilieu-driven immune skewing 2021-11, The British journal of dermatology DOI:10.1111/bjd.20512 PMID:34018188	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术对一位同时患有皮肤B细胞和T细胞淋巴瘤的患者进行了分子特征分析	首次揭示了肿瘤微环境对免疫偏向的影响，并区分了不同类型淋巴瘤皮肤病变中的特定克隆群体	NA	提高复杂类型原发性皮肤淋巴瘤的诊断和分子特征分析	原发性皮肤B细胞和T细胞淋巴瘤	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	一位患者
1963	2024-08-09	Integrative analysis of the human brain mural cell transcriptome 2021-11, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1 DOI:10.1177/0271678X211013700 PMID:34027687	研究论文	本文利用多个独立的人脑单细胞RNA测序数据集，构建了人脑壁细胞的转录组数据库，并分析了人鼠壁细胞转录组的物种差异、人脑周细胞的培养诱导去分化及人壁细胞的器官特异性	首次综合利用多个独立的人脑单细胞RNA测序数据集，详细分析了人脑壁细胞的分子特征，填补了该领域的知识空白	NA	深入了解人脑壁细胞的分子组成，为研究壁细胞功能提供资源，并促进动物模型与人类模型的比较评估	人脑壁细胞，包括周细胞和血管平滑肌细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	多个独立的人脑样本
1964	2024-08-09	Characterization of the heterogeneity of endothelial cells in bleomycin-induced lung fibrosis using single-cell RNA sequencing 2021-11, Angiogenesis IF:9.2Q1 DOI:10.1007/s10456-021-09795-5 PMID:34028626	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了博莱霉素诱导的肺纤维化中内皮细胞的异质性	首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞亚群的特征及其在病理过程中的作用	研究仅限于大鼠模型，可能与人类疾病存在差异	探讨内皮细胞亚群在肺纤维化发展中的作用	博莱霉素诱导的肺纤维化中的内皮细胞	数字病理学	肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	大鼠模型中的内皮细胞亚群
1965	2024-08-09	Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis 2021-11, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220209 PMID:34031030	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，识别了系统性硬化症（SSc）患者皮肤中特定的T细胞反应	首次使用液滴法单细胞转录组分析SSc皮肤活检，揭示了患者特异性的T细胞异质性，并发现了与SSc皮肤疾病严重程度相关的功能通路中的新基因表达	研究样本量有限，仅包括27名活动性SSc患者和10名健康捐赠者的皮肤活检样本	旨在深入研究系统性硬化症患者受影响皮肤中的T细胞介导的免疫反应	系统性硬化症患者和健康个体的皮肤活检样本中的CD3+淋巴细胞	数字病理学	系统性硬化症	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	3729个CD3+淋巴细胞，包括867个来自正常皮肤和2862个来自SSc皮肤样本
1966	2024-08-09	Integrated pseudotime analysis of human pre-implantation embryo single-cell transcriptomes reveals the dynamics of lineage specification 2021-09-02, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2021.04.027 PMID:34004179	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据的伪时间分析，重建了早期小鼠和人类胚胎发育过程，并揭示了人类胚胎发育中谱系特化的动态变化	本研究首次通过伪时间分析揭示了人类胚胎发育中谱系特化的精确时间点，并识别了转录组特征和细胞命运标记	NA	理解人类胚胎植入前发育中的谱系特化过程，以改进辅助生殖技术和干细胞研究	人类胚胎植入前发育过程中的谱系特化	干细胞研究	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
1967	2024-08-09	Category encoding method to select feature genes for the classification of bulk and single-cell RNA-seq data 2021-08-15, Statistics in medicine IF:1.8Q1 DOI:10.1002/sim.9015 PMID:34028849	研究论文	本文提出了一种类别编码（CAEN）方法，用于选择特征基因以分类批量和单细胞RNA-seq数据	CAEN方法通过使用每个类别中基因序列样本的排名进行类别编码，并考虑样本排名和新的类别排名的相关系数，选择最高基因相关系数作为特征基因	NA	改进批量和单细胞RNA-seq数据的分类性能并节省计算时间	批量和单细胞RNA-seq数据中的特征基因选择	生物信息学	NA	RNA-seq	NA	文本	NA
1968	2024-08-09	Characterization of Global Research Trends and Prospects on Single-Cell Sequencing Technology: Bibliometric Analysis 2021-08-10, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/25789 PMID:34014832	研究论文	本文通过文献计量分析方法，研究了单细胞测序技术领域的全球合作网络和发展趋势	分析了单细胞测序技术在免疫学应用中的潜在研究热点	NA	展示单细胞测序方法领域的合作情况，并探索关键主题和未来方向	单细胞测序技术	NA	NA	单细胞测序	NA	文献	2489篇文献，涉及14,202位作者，1970个机构，61个国家
1969	2024-08-09	Human photoreceptor cells from different macular subregions have distinct transcriptional profiles 2021-07-28, Human molecular genetics IF:3.1Q2 DOI:10.1093/hmg/ddab140 PMID:34014299	研究论文	本研究通过批量和单细胞RNA测序比较了人眼中央视网膜同心区域的基因表达，揭示了不同视网膜区域的独特分子特征	首次详细描述了视网膜转录组的空间特征，并发现了特定区域特有的基因表达模式和差异剪接基因	NA	探究人眼中央视网膜不同区域的基因表达差异	人眼中央视网膜的锥状光感受器细胞	数字病理学	NA	RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
1970	2024-08-09	Integrated Single-Cell Atlas of Endothelial Cells of the Human Lung 2021-07-27, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.120.052318 PMID:34030460	研究论文	本文提供了一个全面的人类肺部内皮细胞参考图谱，通过重新分析6个数据集的单细胞RNA测序数据，揭示了肺部内皮细胞的多样性和组成。	发现了先前未被识别的肺部内皮细胞亚群，并通过跨物种分析确认了这些细胞类型在人类和老鼠中的存在。	NA	提供一个详细的肺部内皮细胞图谱，以促进对肺部内皮细胞多样性和组成的更好理解。	人类和小鼠的肺部内皮细胞。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	超过15,000个血管内皮细胞来自73个个体
1971	2024-08-09	Single-cell co-expression analysis reveals that transcriptional modules are shared across cell types in the brain 2021-07-21, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2021.04.010 PMID:34015329	研究论文	本文通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了大脑中跨细胞类型的转录模块共享现象	利用大脑细胞普查网络的单细胞RNA测序数据，首次展示了跨细胞类型的共享转录调控信号	NA	探究基因-基因关系如何塑造细胞身份	大脑中的细胞类型及其转录调控模块	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	500,000个细胞/核，涵盖7个BICCN数据集
1972	2024-08-09	Treg cell-derived osteopontin promotes microglia-mediated white matter repair after ischemic stroke 2021-07-13, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2021.04.022 PMID:34015256	研究论文	本研究探讨了调节性T细胞（Treg细胞）在缺血性中风后对长期组织修复的有益作用及其机制	发现Treg细胞通过分泌骨桥蛋白促进小胶质细胞介导的白质修复	NA	揭示Treg细胞作为中风恢复的神经修复目标	Treg细胞在中风后的作用及其对白质修复的影响	NA	中风	单细胞RNA测序和流式细胞术	NA	RNA	小鼠实验中风模型
1973	2024-08-09	Functionally distinct POMC-expressing neuron subpopulations in hypothalamus revealed by intersectional targeting 2021-07, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-021-00854-0 PMID:34002087	研究论文	本文通过交叉定位技术揭示了下丘脑中表达POMC的神经元亚群具有不同的功能特性	开发了新的鼠模型，通过交叉Cre/Dre依赖的重组技术成功标记、翻译组学分析和功能表征了表达瘦素受体和胰高血糖素样肽1受体的不同POMC神经元	尚未解决POMC神经元异质性的确切分子基础和功能后果	揭示下丘脑中POMC表达神经元的功能异质性和分子基础	下丘脑弓状核中表达POMC的神经元	NA	NA	交叉Cre/Dre依赖的重组技术	NA	单细胞测序数据	NA
1974	2024-08-09	Nasal ciliated cells are primary targets for SARS-CoV-2 replication in the early stage of COVID-19 2021-07-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI148517 PMID:34003804	研究论文	本文研究了SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段在上呼吸道中的细胞嗜性，特别是鼻纤毛细胞	本文首次展示了SARS-CoV-2在多纤毛上皮细胞中的蛋白质水平相对较高，并且其定位局限于细胞的顶侧	NA	探讨SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段的细胞嗜性，并提出预防病毒传播的策略	SARS-CoV-2在COVID-19早期阶段的细胞嗜性及病毒复制情况	数字病理学	COVID-19	RNA-Seq	NA	蛋白质水平数据	患者样本
1975	2024-08-09	Genome stabilization by RAD51-stimulatory compound 1 enhances efficiency of somatic cell nuclear transfer-mediated reprogramming and full-term development of cloned mouse embryos 2021-Jul, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13059 PMID:34021643	研究论文	本文研究了RAD51刺激化合物1通过增强体细胞核转移介导的重编程效率和克隆小鼠胚胎的完整发育，从而稳定基因组的作用。	通过补充RS-1激活剂，增加RAD51表达和DSB焦点，从而提高SCNT重编程效率，并观察到大量基因的重新激活，可能与克服发育障碍有关。	NA	研究基因组不稳定性和DNA损伤在体细胞重编程过程中的作用，以及如何通过修复这些损伤来提高重编程效率。	体细胞核转移（SCNT）介导的重编程过程中的基因组稳定性和DNA损伤修复。	NA	NA	体细胞核转移（SCNT），单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
1976	2024-08-09	Transcriptome landscape of double negative T cells by single-cell RNA sequencing 2021-07, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.jaut.2021.102653 PMID:34022742	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自C57BL/6小鼠脾脏的28,835个单个免疫细胞，揭示了五种转录上不同的幼稚DNT细胞簇，这些细胞簇表达独特的基因集并主要执行辅助T细胞、细胞毒性和先天免疫功能	本研究首次详细描述了幼稚和激活状态下的DNT细胞的异质性，解决了关于DNT细胞的争议，并提供了潜在的转录特征	研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现	揭示DNT细胞的分子和功能特征，以及它们在免疫系统中的作用	DNT细胞的转录组特征及其在免疫系统中的功能	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	28,835个单个免疫细胞
1977	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing in cancer: Applications, advances, and emerging challenges 2021-Jun-25, Molecular therapy oncolytics IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.omto.2021.04.001 PMID:34027052	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肿瘤研究领域的应用、进展及新兴挑战	scRNA-seq作为一种有效的方法，能够在单细胞分辨率下解析人类肿瘤组织，为解释肿瘤生物学提供了新的视角	NA	进一步阐明癌症机制，开发更好的检测和治疗策略	肿瘤循环细胞、肿瘤干细胞、肿瘤耐药性、肿瘤微环境等	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
1978	2024-08-09	Deficiency of histone lysine methyltransferase SETDB2 in hematopoietic cells promotes vascular inflammation and accelerates atherosclerosis 2021-06-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.147984 PMID:34003795	研究论文	本文研究了组蛋白赖氨酸甲基转移酶SETDB2在造血细胞中的缺乏如何促进血管炎症并加速动脉粥样硬化的进程	首次报道了SETDB2在人及小鼠的动脉粥样硬化病变中表达上调，并在造血细胞中遗传删除SETDB2会促进血管炎症和加速动脉粥样硬化的进展	NA	探究SETDB2在动脉粥样硬化中的作用及其对免疫反应的调节机制	SETDB2在造血细胞中的作用及其对血管炎症和动脉粥样硬化的影响	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	从动脉粥样硬化斑块中分离的CD45+细胞
1979	2024-08-09	Integration of spatial and single-cell transcriptomics localizes epithelial cell-immune cross-talk in kidney injury 2021-06-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.147703 PMID:34003797	研究论文	本文通过整合空间转录组学和单核测序数据，研究了肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞的相互作用及其空间分布	首次优化了空间转录组学和单核测序数据的协调，揭示了急性肾脏损伤中细胞类型的空间分布及其转录组特征	NA	研究急性肾脏损伤中上皮细胞与免疫细胞的相互作用及其空间分布	人类肾脏切除样本和两种小鼠急性肾脏损伤模型	数字病理学	肾脏疾病	空间转录组学，单核测序	NA	转录组数据	30种主要细胞类型
1980	2024-08-09	CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones 2021-06-21, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2021.04.026 PMID:34010629	研究论文	本文开发了CloneSeq平台，结合3D水凝胶球内的克隆扩增和基于液滴的RNA测序，用于揭示细胞异质性。	CloneSeq提高了检测细胞变异的敏感性，并能揭示特定亚群，如癌症干细胞样细胞和胚胎干细胞的早期分化决策。	NA	克服单细胞测序的敏感性限制，揭示生物系统中的细胞异质性。	肺癌细胞和胚胎干细胞。	数字病理学	肺癌	RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及。