单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1901 - 1920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1901 | 2024-08-08 |
Mammary cell gene expression atlas links epithelial cell remodeling events to breast carcinogenesis
2021-06-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02201-2
PMID:34079055
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了50K小鼠和24K人类乳腺上皮细胞图谱，涵盖了大部分生命阶段，以表征乳腺上皮细胞在发育、妊娠和绝经期间的复杂重塑过程 | 首次整合了小鼠和人类乳腺上皮细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了乳腺上皮细胞重塑与乳腺癌发展之间的关系 | NA | 研究乳腺上皮细胞在不同生命阶段的重塑过程及其与乳腺癌发展的关联 | 小鼠和人类的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 50K小鼠乳腺上皮细胞和24K人类乳腺上皮细胞 |
| 1902 | 2024-08-08 |
Targeting of the CD80/86 proinflammatory axis as a therapeutic strategy to prevent severe COVID-19
2021-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90797-0
PMID:34075090
|
研究论文 | 本文探讨了通过阻断CD80/86促炎轴作为治疗策略来预防严重COVID-19的可能性 | 提出了使用abatacept药物阻断CD80/86共刺激信号作为治疗严重COVID-19的新策略 | 研究样本量较小，且仅限于特定患者群体 | 验证阻断CD80/86促炎轴作为治疗严重COVID-19的有效性 | COVID-19患者的免疫反应和治疗效果 | 免疫学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 共涉及86名患者，包括38名风湿病患者和48名COVID-19患者 |
| 1903 | 2024-08-08 |
coupleCoC+: An information-theoretic co-clustering-based transfer learning framework for the integrative analysis of single-cell genomic data
2021-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009064
PMID:34077420
|
研究论文 | 本文提出了一种基于信息论的共聚类转移学习框架coupleCoC+，用于单细胞基因组数据的整合分析 | coupleCoC+利用源数据中的信息辅助目标数据的分析，通过链接特征实现有效知识转移，并匹配源数据和目标数据中的相似细胞类型 | NA | 提高多模态单细胞基因组数据的整体聚类性能 | 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和单细胞甲基化数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, sc-methylation | 共聚类框架 | 基因组数据 | 包括小鼠皮质scATAC-seq和scRNA-seq数据、小鼠和人类scRNA-seq数据、小鼠皮质sc-methylation和scRNA-seq数据，以及来自两个批次的人类血液树突细胞scRNA-seq数据 |
| 1904 | 2024-08-08 |
Direct and indirect immune effects of CMP-001, a virus-like particle containing a TLR9 agonist
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002484
PMID:34083419
|
研究论文 | 本文探讨了含有TLR9激动剂的病毒样颗粒CMP-001对树突状细胞和单核细胞的免疫刺激作用及其对肿瘤T细胞反应的影响 | 研究揭示了CMP-001通过抗Qβ抗体反应激活树突状细胞和单核细胞，进而增强肿瘤T细胞反应的复杂机制 | NA | 探索CMP-001对树突状细胞和单核细胞的初始效应如何激活其他细胞，从而促进肿瘤T细胞反应的发展 | CMP-001对不同外周血单个核细胞（PBMC）群体的摄取及其对肿瘤T细胞反应的影响 | 免疫学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多种外周血单个核细胞（PBMC）群体 |
| 1905 | 2024-08-08 |
Stromal Heterogeneity in the Human Proliferative Endometrium-A Single-Cell RNA Sequencing Study
2021-May-22, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11060448
PMID:34067358
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨人类增殖期子宫内膜中的基质细胞异质性 | 通过单细胞RNA测序技术发现了多种基质细胞群体，这些群体可能具有控制炎症和细胞外基质组成的能力 | NA | 旨在理解健康再生过程中的细胞相互作用，并为良性妇科疾病的治疗开发新疗法 | 人类增殖期子宫内膜的基质细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自健康生育期女性的增殖期子宫内膜活检样本 |
| 1906 | 2024-08-08 |
Dysregulation of Pulmonary Responses in Severe COVID-19
2021-05-21, Viruses
DOI:10.3390/v13060957
PMID:34064104
|
研究论文 | 本研究重新分析了已发表的单细胞RNA测序数据，探讨了严重COVID-19患者与轻症患者在支气管肺泡灌洗液中细胞类型的差异及其对肺部病理的影响。 | 发现了严重COVID-19患者中TH17型细胞减少、IFNA1表达细胞减少且TLR7和TLR8表达降低，以及IgA表达B细胞和超活化上皮细胞（或巨噬细胞）增加等现象，并提出IFN-I和PAI-1作为预测严重COVID-19的潜在生物标志物。 | NA | 探讨严重COVID-19患者的肺部反应失调机制，并寻找潜在的生物标志物。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的细胞类型及其表达特征。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1907 | 2024-08-08 |
Regulation and Role of Transcription Factors in Osteogenesis
2021-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115445
PMID:34064134
|
综述 | 本文综述了转录因子在成骨过程中的调控作用及其机制 | 介绍了通过谱系追踪、细胞分选和单细胞转录组研究在骨骼干细胞和基因调控方面的新发现 | NA | 探讨转录因子在成骨过程中的调控作用 | 成骨细胞的分化及其调控机制 | NA | NA | 谱系追踪、细胞分选、单细胞转录组 | NA | NA | NA |
| 1908 | 2024-08-08 |
Characterization of Alternative Splicing (AS) Events during Chicken (Gallus gallus) Male Germ-Line Stem Cell Differentiation with Single-Cell RNA-seq
2021-May-20, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani11051469
PMID:34065391
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了鸡雄性生殖干细胞分化过程中的可变剪接事件 | 首次在全基因组范围内提供了鸡雄性生殖干细胞可变剪接事件的综合图谱 | NA | 深入理解生殖细胞分化过程，为家禽繁殖、干细胞生物学及人类药物研发开辟新途径 | 鸡的胚胎干细胞、性腺原始生殖细胞和精原干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共检测了来自15,338个基因的38,494个可变剪接事件，以及来自14,783个基因的48,955个事件和来自15,089个基因的49,900个事件 |
| 1909 | 2024-08-08 |
Fabrication of Microfluidic Devices for Emulsion Formation by Microstereolithography
2021-May-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26092817
PMID:34068649
|
综述 | 本文综述了使用微立体光刻技术制造用于乳液形成的微流控设备的基本原理和最新创新 | 微立体光刻技术简化了设备制造过程，提供了真正的三维几何形状，成本效益高，并支持多材料加工 | NA | 支持研究人员建立自己的微立体光刻系统以制造定制的微流控设备 | 微立体光刻技术及其在微流控设备制造中的应用 | 微流控技术 | NA | 微立体光刻（PµSL） | NA | NA | NA |
| 1910 | 2024-08-08 |
The Cellular Composition of Bovine Coccygeal Intervertebral Discs: A Comprehensive Single-Cell RNAseq Analysis
2021-May-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094917
PMID:34066404
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNAseq）和批量RNA测序（RNAseq）分析了牛尾椎间盘的细胞组成，揭示了核软骨（NP）和纤维环（AF）中的细胞群及其发育变化。 | 本文首次整合scRNAseq和RNAseq数据，稳定了聚类结果，并鉴定了NP和AF结构/组织特异性基因，揭示了年轻牛椎间盘中NP和AF的细胞表型复杂性。 | NA | 支持退化椎间盘再生治疗的研究 | 牛尾椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），批量RNA测序（RNAseq） | NA | RNA序列 | NA |
| 1911 | 2024-08-08 |
The Transcriptome of SH-SY5Y at Single-Cell Resolution: A CITE-Seq Data Analysis Workflow
2021-May-06, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps4020028
PMID:34066513
|
研究论文 | 本文介绍了一种CITE-seq数据分析流程，用于分析SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞系的单细胞转录组 | CITE-seq技术结合了抗体标记和细胞分选的免疫表型能力与单细胞RNA测序的分辨率，通过添加12-bp核苷酸条形码到抗体上，可以在同一运行中对多个条形码样本进行测序，从而降低scRNA-seq的成本 | NA | 展示理想的CITE-seq数据分析流程，并探索细胞异质性 | SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞系的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | CITE-seq | NA | 转录组数据 | 2879个单细胞 |
| 1912 | 2024-08-08 |
Cell Type-Specific Differentiation Between Indica and Japonica Rice Root Tip Responses to Different Environments Based on Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.659500
PMID:34079581
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了籼稻和粳稻在不同环境下的细胞类型特异性差异表达基因 | 首次详细分析了籼稻和粳稻在不同环境下的细胞类型特异性差异表达基因，并探讨了这些基因与非生物胁迫响应的关系 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，未进行新的实验验证 | 旨在理解籼稻和粳稻在细胞水平上的分化和环境适应性的遗传基础 | 籼稻和粳稻的根尖细胞在不同环境下的响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及籼稻和粳稻的多个细胞类型 |
| 1913 | 2024-08-08 |
The Chromatin Accessibility Landscape of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients With Systemic Lupus Erythematosus at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.641886
PMID:34084162
|
研究论文 | 本研究旨在揭示系统性红斑狼疮（SLE）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的染色质可及性图谱，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子（TFs） | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了SLE患者PBMCs的染色质可及性图谱，并鉴定了20种TF激活模式，这些模式驱动SLE患者的异常免疫反应 | NA | 揭示SLE患者PBMCs的染色质可及性图谱，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1914 | 2024-08-09 |
Fibroblasts positive for meflin have anti-fibrotic properties in pulmonary fibrosis
2021-12, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.03397-2020
PMID:34049947
|
研究论文 | 本研究探讨了表达meflin的成纤维细胞在特发性肺纤维化（IPF）中的抗纤维化作用 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了meflin阳性成纤维细胞在IPF中的作用，并利用bleomycin诱导的肺纤维化模型验证了其抗纤维化特性 | 研究仅限于meflin阳性成纤维细胞的作用，未探讨其他类型成纤维细胞在IPF中的作用 | 确定meflin阳性成纤维细胞在特发性肺纤维化发展中的作用 | meflin阳性成纤维细胞在特发性肺纤维化中的功能 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 243,472个细胞来自32个IPF肺和29个正常肺样本 |
| 1915 | 2024-08-09 |
A New Hypothesis for Type 1 Diabetes Risk: The At-Risk Allele at rs3842753 Associates With Increased Beta-Cell INS Messenger RNA in a Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Sequencing Data
2021-Dec, Canadian journal of diabetes
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jcjd.2021.03.007
PMID:34052132
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据的荟萃分析，探讨了rs3842753位点的遗传变异与1型糖尿病风险之间的关系及其分子机制 | 首次在大规模单细胞水平上研究了rs3842753位点的遗传变异对INS mRNA表达的影响 | 研究样本主要来自成年无糖尿病和2型糖尿病患者，可能无法完全代表所有1型糖尿病患者的情况 | 探究rs3842753位点的遗传变异与1型糖尿病风险之间的关系及其分子机制 | rs3842753位点的遗传变异对INS mRNA表达的影响 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共整合了2,315个β细胞和1,223个β样细胞，来自13名A/A保护型供体、23名A/C杂合子供体和35名C/C风险供体 |
| 1916 | 2024-08-09 |
scDetect: a rank-based ensemble learning algorithm for cell type identification of single-cell RNA sequencing in cancer
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab410
PMID:34048541
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDetect的新型集成学习方法，该方法结合基因表达排名分析和基于多数投票的机器学习概率预测方法，能够基于不同测序平台的单细胞RNA测序数据进行高精度的细胞分类。 | scDetect方法通过结合基因表达排名分析和多数投票的机器学习概率预测方法，提高了细胞类型识别的准确性，并考虑了肿瘤异质性和细胞拷贝数变异。 | NA | 开发一种新的集成学习方法，用于提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | 应用scDetect方法于胰腺组织、单核细胞和肿瘤活检细胞的单细胞RNA测序数据。 |
| 1917 | 2024-08-08 |
HelPredictor models single-cell transcriptome to predict human embryo lineage allocation
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab196
PMID:34037706
|
研究论文 | 开发了一种名为HelPredictor的机器学习平台，用于预测人类胚胎的细胞谱系分配 | HelPredictor是首个整合三种特征选择方法和四种经典机器学习分类器的平台，能够高效分类不同的胚胎谱系及其发育轨迹 | NA | 深入理解人类胚胎植入前细胞命运决定机制，并开发有效的生物信息学策略来分析胚胎谱系分配和阶段特异性模式 | 人类胚胎的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习分类器 | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1918 | 2024-08-09 |
Corrigendum to: Evaluation of machine learning approaches for cell-type identification from single-cell transcriptomics data
2021-Nov-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab217
PMID:34050369
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1919 | 2024-08-08 |
Characterizing spatial gene expression heterogeneity in spatially resolved single-cell transcriptomic data with nonuniform cellular densities
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271288.120
PMID:34035045
|
研究论文 | 本文开发了MERINGUE计算框架，用于分析空间分辨的单细胞转录组数据中的空间基因表达异质性 | MERINGUE框架基于空间自相关和交叉相关分析，能够在考虑细胞类型3D空间组织和非均匀细胞密度的同时，识别具有空间异质性表达模式的基因，推断潜在的细胞间通信，并进行空间感知的细胞聚类 | NA | 解决现有技术在处理空间分辨单细胞转录组数据时缺乏可扩展计算分析方法的问题 | 空间分辨的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间分辨的转录组数据 | 数百到数千个基因 |
| 1920 | 2024-08-08 |
Analysis of alternative polyadenylation from single-cell RNA-seq using scDaPars reveals cell subpopulations invisible to gene expression
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271346.120
PMID:34035046
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDaPars的生物信息学算法，用于从单细胞RNA测序数据中准确量化APA事件 | scDaPars算法能够从单细胞RNA测序数据中恢复因单细胞中mRNA数量少而遗漏的APA事件，并揭示了传统基因表达分析无法识别的细胞亚群 | NA | 研究单细胞中APA异质性及其在细胞亚群识别中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的APA事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |