单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1881 - 1900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2024-08-08 |
A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.652974
PMID:34093652
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在植物研究中的应用及其通过基于细胞的计算模型在数据分析中的优势和挑战 | 探讨了单细胞转录组数据与植物形态发生模型结合的新机会，以及显微镜和细胞分辨率成像技术在解决单细胞转录组数据空间问题中的前景 | 集成转录组到形态发生水平的数据在一个统一系统中仍存在困难 | 探讨单细胞转录组技术在植物组织结构形成研究中的应用及其计算模型分析方法 | 植物组织的单细胞转录组数据及其在形态发生中的应用 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组技术 | 基于细胞的计算模型 | 转录组数据 | NA |
| 1882 | 2024-08-08 |
Integrating Spatial Transcriptomics and Single-Cell RNA-seq Reveals the Gene Expression Profling of the Human Embryonic Liver
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.652408
PMID:34095116
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对人类胚胎肝脏在不同发育阶段的基因表达进行无偏分析 | 首次系统地识别了人类胚胎肝脏中的九种细胞类型，并定义了主要细胞类型的发育途径 | NA | 了解胚胎发育过程中肝脏的复杂发展，以促进功能性肝脏替代组织的工程化及肝脏再生 | 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育过程中的基因表达 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育阶段样本 |
| 1883 | 2024-08-08 |
The Intestinal Epithelium - Fluid Fate and Rigid Structure From Crypt Bottom to Villus Tip
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.661931
PMID:34095127
|
综述 | 本文综述了肠道上皮从隐窝底部到绒毛顶端的流体命运和刚性结构，以及其与肠道功能的相互作用 | 介绍了单细胞测序、时空分析和类器官技术在揭示肠道上皮复杂微观结构和维持机制中的新发现 | 讨论了每种方法的优势和局限性，并考虑了这些结果对健康和疾病中肠道理解的影响 | 探讨近期关于肠道上皮和基质结构的新发现，并强调导致这些发现的技术 | 肠道上皮及其基质结构 | NA | NA | 单细胞测序、时空分析、类器官技术 | NA | 细胞 | NA |
| 1884 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Endothelial Plasticity During Diabetic Atherogenesis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.689469
PMID:34095155
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了糖尿病诱导的动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的表型和代谢异质性 | NA | 探究糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的生物学特性 | 小鼠心脏和主动脉中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自小鼠心脏和主动脉的富含内皮细胞的单细胞样本 |
| 1885 | 2024-08-08 |
Cell Heterogeneity Analysis in Single-Cell RNA-seq Data Using Mixture Exponential Graph and Markov Random Field Model
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9919080
PMID:34095314
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的方案，用于检测单细胞异质性的基因型特征，并将其应用于循环肿瘤细胞（CTCs）和三阴性乳腺癌（TNBC）的单细胞RNA测序数据中 | 本文引入了混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型，用于更灵活地重构细胞网络，并发现不同细胞亚群中的高共表达基因模块 | NA | 探索细胞异质性，特别是循环肿瘤细胞（CTCs）和三阴性乳腺癌（TNBC）的异质性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和基因网络关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 1886 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Seq Analysis Identifies Differentially Expressed Genes of Treg Cell in Early Treatment-Naive Rheumatoid Arthritis By Arsenic Trioxide
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.656124
PMID:34108876
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了三氧化二砷（AsO）对早期未治疗类风湿关节炎（RA）中调节性T细胞（Treg细胞）基因表达的影响 | 这是首个研究AsO对未治疗Treg细胞基因表达全基因组效应的研究，除了明显的抗炎和免疫调节作用外，AsO还影响Treg细胞中的氨基酸和葡萄糖代谢 | NA | 阐明早期类风湿关节炎中三氧化二砷对Treg细胞在发病机制中的调节作用 | 早期未治疗的类风湿关节炎中的Treg细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 从外周血单个核细胞（PBMCs）中分离并纯化的Treg细胞 |
| 1887 | 2024-08-08 |
The Presence of Circulating Nucleated Red Blood Cells Is Associated With Disease Severity in Patients of Hemorrhagic Fever With Renal Syndrome
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.665410
PMID:34113638
|
研究论文 | 本研究探讨了在汉坦病毒感染引起的肾综合征出血热患者中，外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次发现肾综合征出血热患者外周血中存在有核红细胞（NRBC），并与其疾病严重程度相关；首次表明汉坦病毒感染阻碍红细胞成熟 | NA | 探索肾综合征出血热患者外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 | 肾综合征出血热患者的外周血红细胞 | NA | 肾综合征出血热 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肾综合征出血热患者的PBMCs |
| 1888 | 2024-08-08 |
Expression of Urea Transporter B in Normal and Injured Brain
2021, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2021.591726
PMID:34122018
|
研究论文 | 研究探讨了尿素转运蛋白B（UT-B）在大脑正常和损伤状态下的表达特征 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法，详细描述了UT-B在大脑不同细胞类型中的分布和表达变化 | 研究主要集中在UT-B的表达变化，未深入探讨其具体功能和机制 | 确定UT-B在大脑中的表达特性及其在创伤性脑损伤（TBI）后的变化 | UT-B在大脑中的表达及其在TBI后的变化 | NA | 神经疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涉及多种大脑细胞类型，具体数量未详细说明 |
| 1889 | 2024-08-08 |
Revealing the Immune Infiltration Landscape and Identifying Diagnostic Biomarkers for Lumbar Disc Herniation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.666355
PMID:34122424
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，识别了腰椎间盘突出症（LDH）中核软骨（NP）组织免疫浸润的关键基因，并探讨了其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次通过CIBERSORT算法和WGCNA R包分析了LDH与对照组间NP组织的免疫浸润差异，并结合单细胞测序数据进行了深入分析 | NA | 揭示腰椎间盘突出症的免疫浸润景观并识别诊断生物标志物 | 腰椎间盘突出症中的核软骨组织 | 数字病理学 | 腰椎间盘突出症 | CIBERSORT算法, WGCNA R包, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1890 | 2024-08-08 |
Stress relief: emerging methods to mitigate dissociation-induced artefacts
2021-11, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2021.05.004
PMID:34074577
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在大规模应用中，传统细胞分离协议对细胞原生组织环境中转录特征捕获的影响，以及为避免这些失真而开发的方法和这些升级方法揭示的生物过程。 | 本文介绍了为减少分离诱导的伪影而开发的新兴方法。 | NA | 探讨单细胞RNA测序中细胞分离协议对转录特征的影响及改进方法。 | 单细胞RNA测序中的细胞分离协议及其对转录特征的影响。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1891 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals a Hepatic Stellate Cell-Activation Roadmap and Myofibroblast Origin During Liver Fibrosis in Mice
2021-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31987
PMID:34089528
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和谱系追踪技术，分析了HSCs和PFs在CCL4诱导和胆管结扎诱导的肝纤维化小鼠模型中的激活过程 | 揭示了HSCs和PFs在不同诱因下的肝纤维化中的不同转录特征及其对纤维化肌成纤维细胞的贡献 | NA | 探讨HSCs和PFs在肝纤维化中的动态基因表达机制及其对纤维化肌成纤维细胞的贡献 | HSCs和PFs在肝纤维化中的激活过程 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 1892 | 2024-08-08 |
Adaptive Total-Variation Regularized Low-Rank Representation for Analyzing Single-Cell RNA-seq Data
2021-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00444-5
PMID:34076860
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为自适应总变差正则化低秩表示（ATV-LRR）的新模型，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，以识别细胞亚型和功能 | ATV-LRR模型能够重建低秩子空间结构，学习细胞间的相似性，并能分割多个线性子空间，提取重要信息。此外，自适应总变差还能通过学习数据的梯度信息去除细胞噪声并保留细胞特征细节 | NA | 分析单细胞RNA测序数据，识别细胞亚型和功能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 自适应总变差正则化低秩表示（ATV-LRR） | 基因表达数据 | NA |
| 1893 | 2024-08-08 |
Cell-type diversity in the bed nucleus of the stria terminalis to regulate motivated behaviors
2021-08-06, Behavioural brain research
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.bbr.2021.113401
PMID:34090941
|
综述 | 本文综述了终纹床核（BNST）中不同神经元亚群的多样性及其在调节动机行为中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据揭示了BNST中多种遗传可识别的细胞类型簇 | 由于BNST神经元内高度分子异质性，该区域如何精确调节不同动机状态的机制仍不清楚 | 探讨BNST中不同神经元亚群的多样性及其在调节动机行为中的功能角色 | 终纹床核（BNST）中的神经元亚群及其在调节动机行为中的作用 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1894 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 infection induces beta cell transdifferentiation
2021-08-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.05.015
PMID:34081913
|
研究论文 | 本文描述了SARS-CoV-2病毒抗原在COVID-19患者胰腺beta细胞中的检测，并通过单细胞RNA测序和免疫染色证实了SARS-CoV-2感染引起的细胞应激反应和趋化因子诱导，以及beta细胞向alpha和腺泡细胞的转分化现象。 | 首次展示了SARS-CoV-2感染导致胰腺beta细胞转分化的现象，并发现这一过程可以通过trans-ISRIB抑制剂逆转。 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染与糖尿病之间的关联及其潜在的病理机制。 | COVID-19患者的胰腺beta细胞及SARS-CoV-2感染的影响。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的胰腺组织样本 |
| 1895 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing detects persistent cell type- and methylmercury exposure paradigm-specific effects in a human cortical neurodevelopmental model
2021-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2021.112288
PMID:34089799
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序（scRNAseq）评估了发育期甲基汞暴露在人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型中的持久效应 | 首次展示了甲基汞在人发育皮质神经元中引起的基因表达变化，这些变化在暴露停止后仍然存在，并且这些变化是细胞类型、发育阶段和暴露范式特异性的 | NA | 评估发育期甲基汞暴露对人类皮质神经发育的持久影响 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 暴露于0.1和1.0 μM甲基汞浓度的人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型 |
| 1896 | 2024-08-08 |
Endogenous neural stem cells modulate microglia and protect against demyelination
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.002
PMID:34087164
|
研究论文 | 本文研究了内源性神经干细胞在脱髓鞘过程中的免疫调节作用 | 首次提出内源性神经干细胞通过调节小胶质细胞和免疫反应，促进髓鞘再生 | NA | 探讨内源性神经干细胞在脱髓鞘过程中的免疫调节作用 | 内源性神经干细胞和小胶质细胞在脱髓鞘过程中的相互作用 | 神经科学 | 脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1897 | 2024-08-08 |
The molecular and epigenetic mechanisms of innate lymphoid cell (ILC) memory and its relevance for asthma
2021-07-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201354
PMID:34076685
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研究论文 | 研究探讨了先天淋巴细胞（ILC）记忆的分子和表观遗传机制及其与哮喘的关系 | 首次揭示了ILC2s在记忆驱动哮喘中的关键作用，并通过ATAC-seq和scRNA-seq技术识别了记忆ILC2s的独特表观遗传景观和基因调控网络 | 研究主要基于Rag1-/-小鼠模型，可能需要进一步在其他模型或人类样本中验证结果 | 阐明ILC记忆的分子和表观遗传机制及其在哮喘中的作用 | 先天淋巴细胞（ILC）记忆及其在哮喘中的作用 | 数字病理学 | 哮喘 | ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | Rag1-/-小鼠 |
| 1898 | 2024-08-08 |
The effect of methanol fixation on single-cell RNA sequencing data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07744-6
PMID:34090348
|
研究论文 | 本文研究了甲醇固定对单细胞RNA测序数据的影响 | 首次深入分析了甲醇固定对样本RNA完整性的影响，并阐明了在不同单细胞RNA测序实验设计中使用固定的潜在后果 | NA | 探讨甲醇固定对单细胞RNA测序数据的影响 | 甲醇固定的细胞与活细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1899 | 2024-08-08 |
PIKE-R2P: Protein-protein interaction network-based knowledge embedding with graph neural network for single-cell RNA to protein prediction
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04022-w
PMID:34078261
|
研究论文 | 本文提出了一种基于蛋白质-蛋白质相互作用网络和图神经网络的知识嵌入方法PIKE-R2P，用于单细胞RNA到蛋白质的预测 | PIKE-R2P方法结合了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）和先验知识嵌入到图神经网络中，显著提高了预测性能 | NA | 开发一种新的机器学习模型，用于从单细胞RNA测序数据预测蛋白质丰度 | 单细胞RNA到蛋白质的预测 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | RNA测序数据 | NA |
| 1900 | 2024-08-08 |
The immune modulatory effects of umbilical cord-derived mesenchymal stromal cells in severe COVID-19 pneumonia
2021-06-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02376-9
PMID:34078447
|
研究论文 | 研究脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19肺炎中的免疫调节作用 | 首次提供了脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19背景下可能相关的免疫学数据 | 研究仅基于单个患者的数据，可能缺乏广泛的代表性 | 探讨脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19肺炎中的免疫调节效果 | 严重COVID-19肺炎患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA和功能性检测 | NA | 血液和支气管肺泡灌洗液样本 | 单个患者 |