单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1861 - 1880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2024-08-08 |
DevOmics: an integrated multi-omics database of human and mouse early embryo
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab208
PMID:34097004
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研究论文 | 介绍了一个名为DevOmics的综合多组学数据库，该数据库整合了人类和小鼠早期胚胎的基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰等多种数据 | DevOmics提供了统一的数据分析流程和用户友好的界面，便于生物学家和临床医生解析人类和小鼠早期胚胎的分子调控机制 | NA | 建立一个整合人类和小鼠早期胚胎调控信息的数据库，以促进辅助生殖技术和植入前遗传测试的研究 | 人类和小鼠早期胚胎的基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰等 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和3D染色质结构 | 涵盖六个发育阶段的人类和小鼠早期胚胎样本 |
| 1862 | 2024-08-08 |
MET Amplification Attenuates Lung Tumor Response to Immunotherapy by Inhibiting STING
2021-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1500
PMID:34099454
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研究论文 | 研究探讨了MET基因扩增如何通过抑制STING影响肺癌患者对免疫检查点阻断疗法的反应 | 首次揭示了MET信号通过磷酸化UPF1并调节STING的3'-UTR长度来下调STING表达，从而影响免疫疗法效果的机制 | 研究样本仅限于81名肺癌患者，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探究MET扩增对肺癌免疫疗法反应的影响及其机制 | 肺癌患者及其免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 81名肺癌患者，超过20,000个单个免疫细胞 |
| 1863 | 2024-08-08 |
Interleukin-10 and Transforming Growth Factor-β Cytokines Decrease Immune Activation During Normothermic Ex Vivo Machine Perfusion of the Rat Liver
2021-11, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society
IF:4.7Q1
DOI:10.1002/lt.26206
PMID:34118129
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研究论文 | 研究了在常温离体机器灌注条件下，白细胞介素10（IL10）和转化生长因子β（TGF-β）对大鼠肝脏免疫细胞活化的影响 | 首次证明肝脏常驻免疫细胞在常温离体肝脏灌注期间获得激活表型，并可通过IL10和TGF-β的治疗干预减少这种激活 | 研究未观察到IL10和TGF-β处理对炎症细胞因子产生的变化 | 探讨常温离体肝脏灌注对肝脏常驻免疫细胞活化的影响及抗炎细胞因子改善器官功能和减少免疫激活的能力 | 大鼠肝脏的免疫细胞活化及器官功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达、细胞表面标记、细胞因子 | 实验组7只大鼠肝脏，对照组4只 |
| 1864 | 2024-08-08 |
Potentials of single-cell genomics in deciphering cellular phenotypes
2021-10, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102059
PMID:34116424
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学，特别是通过RNA测序的单细胞转录组分析，在解析细胞表型方面的潜力 | 单细胞基因组学使我们能够观察每个细胞转录组的变化及其邻域，询问转录事件的序列，并评估它们对后续事件的影响，从而在生物学中实现范式转变 | 需要进一步研究和发展计算方法等领域的技术 | 探讨单细胞基因组学在解析细胞表型方面的应用 | 植物细胞的表型及其转录组过程 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1865 | 2024-08-08 |
Nkx2-2 expressing taste cells in endoderm-derived taste papillae are committed to the type III lineage
2021-09, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.05.020
PMID:34097879
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，发现转录因子Nkx2-2在哺乳动物味觉细胞中的表达情况，并探讨其在味觉细胞发育和再生中的作用 | 首次揭示Nkx2-2在味觉细胞中的特异性表达及其对类型III味觉细胞发育的关键作用 | NA | 探讨转录因子Nkx2-2在味觉细胞发育和再生中的作用及其对不同类型味觉细胞的影响 | 小鼠的味觉细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1866 | 2024-08-08 |
Progress in cardiac research: from rebooting cardiac regeneration to a complete cell atlas of the heart
2021-08-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab200
PMID:34114614
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综述 | 本文回顾了2020年在基础和转化心脏病学研究中的一些重要发现和进展 | 介绍了新的研究方法，如糖萼模拟物和3D生物打印技术，以及单细胞测序技术在心脏细胞异质性研究中的应用 | NA | 回顾和总结心脏病学领域的最新研究进展 | 心脏病学中的心肌梗死、细胞间通讯、干细胞分化、线粒体功能和癌症治疗诱导的心脏毒性等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1867 | 2024-08-08 |
Network biology to uncover functional and structural properties of the plant immune system
2021-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102057
PMID:34102601
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综述 | 本文综述了网络科学在植物免疫系统功能和结构特性发现中的应用 | 探讨了单细胞测序和多组学数据整合在揭示植物免疫系统复杂性中的新前沿 | NA | 旨在通过网络分析和多维数据整合全面理解植物-病原体相互作用 | 植物免疫系统的功能和结构特性 | 生物信息学 | NA | 网络科学 | 动态网络模型 | 多组学数据 | NA |
| 1868 | 2024-08-08 |
SC1: A Tool for Interactive Web-Based Single-Cell RNA-Seq Data Analysis
2021-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0051
PMID:34115950
|
research paper | 本文介绍了一种基于网络的高度交互式单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据分析工具SC1 | 该工具实现了一种基于词频逆文档频率得分的新方法来选择信息基因，并提供了一系列的聚类、差异表达分析、基因富集、交互式可视化和细胞周期分析方法 | NA | 开发一种交互式的网络工具，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 1869 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of the Pan-Cancer Immune Microenvironment and scTIME Portal
2021-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-1026
PMID:34117085
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术构建了泛癌症免疫微环境（TIME）的单细胞参考图谱，并开发了scTIME门户网站，用于分析和展示TIME的特征及其在免疫治疗中的潜在机制 | 首次进行了泛癌症的单细胞免疫微环境分析，识别了新的细胞类型特异性转录因子，并开发了scTIME门户网站，提供特定的分析模块和统一的细胞注释 | NA | 研究泛癌症免疫微环境的特征及其在免疫治疗中的分子和细胞机制 | 泛癌症免疫微环境中的细胞类型、细胞状态和细胞间通信 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 涉及多种肿瘤类型的患者样本 |
| 1870 | 2024-08-08 |
LncRNA PCBP1-AS1 correlated with the functional states of cancer cells and inhibited lung adenocarcinoma metastasis by suppressing the EMT progression
2021-07-16, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgab047
PMID:34107009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别与肺腺癌功能状态相关的长非编码RNA，并探讨其在肺腺癌转移中的作用 | 首次发现长非编码RNA PCBP1-AS1通过抑制上皮-间质转化过程抑制肺腺癌转移 | NA | 探讨长非编码RNA在肺腺癌功能状态及转移中的作用 | 长非编码RNA PCBP1-AS1及其在肺腺癌中的功能 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共识别出849个长非编码RNA，其中11个与肺腺癌预后显著相关 |
| 1871 | 2024-08-08 |
Comprehensive aptamer-based screen of 1317 proteins uncovers improved stool protein markers of colorectal cancer
2021-07, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-021-01795-y
PMID:34117903
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研究论文 | 本文通过基于适配体的1317种蛋白质筛选，发现并验证了新的结直肠癌粪便蛋白质标志物。 | 首次使用基于适配体的蛋白质筛选方法，发现并验证了结直肠癌的新型粪便蛋白质标志物。 | 需要纵向研究来评估这些新型标志物在早期诊断结直肠癌中的临床效用。 | 筛选和验证结直肠癌的新型粪便蛋白质标志物。 | 结直肠癌患者的粪便蛋白质标志物。 | NA | 结直肠癌 | 基于适配体的蛋白质筛选，ELISA验证，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据，单细胞RNA-seq数据 | 发现队列中包括结直肠癌患者和健康对照，验证队列包括76名结直肠癌患者，15名腺瘤患者和63名健康对照。 |
| 1872 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of renal cell cancers reveal insights into tumor microenvironment, cell of origin, and therapy response
2021-06-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2103240118
PMID:34099557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肾细胞癌，揭示了肿瘤微环境、细胞起源及治疗反应的相关信息 | 首次通过单细胞RNA测序构建了良性和恶性肾细胞图谱，并预测了多种肾细胞癌亚型的潜在细胞起源 | NA | 阐明不同肾细胞癌亚型的细胞起源及其在肿瘤微环境和治疗反应中的作用 | 肾细胞癌及其亚型 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | RNA | 超过10种肾细胞癌亚型 |
| 1873 | 2024-08-08 |
Applications of single-cell sequencing in cancer research: progress and perspectives
2021-06-09, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-021-01105-2
PMID:34108022
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在癌症研究中的应用进展和前景 | 单细胞测序技术能够解析单个细胞层面的细胞和分子景观，与提供平均数据的批量测序不同 | NA | 总结单细胞测序技术及其在癌症研究中的最新进展 | 恶性细胞、免疫细胞的景观、肿瘤异质性、循环肿瘤细胞及肿瘤生物行为的潜在机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学数据 | NA |
| 1874 | 2024-08-08 |
Clinical and molecular characteristics of COVID-19 patients with persistent SARS-CoV-2 infection
2021-06-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23621-y
PMID:34108465
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研究论文 | 本文比较了长期病毒脱落（LDs）和短期病毒脱落（SDs）的COVID-19患者的临床和分子特征，并发现LDs患者的某些细胞因子和趋化因子水平较低，单细胞RNA测序显示LDs中的自然杀伤细胞和CD14单核细胞减少，而调节性T细胞增加。 | 首次详细描述了COVID-19患者中持续SARS-CoV-2感染的临床和分子特征，并发现了与病毒持续感染相关的免疫抑制和低RP表达。 | NA | 研究COVID-19患者中持续SARS-CoV-2感染的临床和分子特征 | COVID-19患者中长期和短期病毒脱落的临床和分子特征 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 103名独立患者 |
| 1875 | 2024-08-08 |
CSF1R inhibition rescues tau pathology and neurodegeneration in an A/T/N model with combined AD pathologies, while preserving plaque associated microglia
2021-06-08, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-021-01204-8
PMID:34103079
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研究论文 | 本文报道了一种新的tau种子模型，其中淀粉样病变促进了双侧tau传播并导致脑萎缩，从而再现了强ATN病理 | 首次展示了CSF1R抑制剂在保留斑块相关小胶质细胞的同时，显著减轻tau病理和神经元萎缩的作用 | NA | 研究小胶质细胞在阿尔茨海默病中ATN病理组合存在下的作用及其对病理的影响 | 小胶质细胞在ATN病理组合中的激活状态及其对tau病理和神经元萎缩的影响 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1876 | 2024-08-08 |
Resolving the graft ischemia-reperfusion injury during liver transplantation at the single cell resolution
2021-06-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-03878-3
PMID:34103479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了肝移植过程中缺血再灌注损伤（IRI）的细胞机制 | 首次提供了肝移植过程中肝内细胞群的动态转录组图谱 | NA | 揭示肝移植过程中缺血再灌注损伤的细胞机制 | 肝移植过程中的肝组织细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 14,313个细胞 |
| 1877 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of human nail unit defines RSPO4 onychofibroblasts and SPINK6 nail epithelium
2021-06-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02223-w
PMID:34099859
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研究论文 | 本研究利用多指症标本进行人类指甲单元的单细胞RNA测序，揭示了指甲特异性间充质和上皮细胞群，分别由RSPO4和SPINK6特征化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类指甲单元中的特定细胞类型及其基因表达特征 | 研究样本来自多指症患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索人类指甲组织的转录组特征及其在疾病中的作用 | 人类指甲单元的间充质和上皮细胞 | 数字病理学 | 先天性无甲症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,541个细胞来自4个额外手指 |
| 1878 | 2024-08-08 |
Cellular Tropism of SARS-CoV-2 across Human Tissues and Age-related Expression of ACE2 and TMPRSS2 in Immune-inflammatory Stromal Cells
2021-Jun, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2021.0429
PMID:34094637
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研究论文 | 本研究分析了SARS-CoV-2在不同人体组织中的细胞嗜性，并探讨了ACE2和TMPRSS2在免疫炎症间质细胞中的年龄相关表达变化 | 开发了一种新的分析框架，用于绘制SARS-CoV-2的细胞嗜性，并强调了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在系统解决病毒发病机制中的作用 | NA | 探讨SARS-CoV-2的细胞嗜性及其在不同细胞类型中的年龄相关表达变化，为临床治疗和病理研究提供指导 | SARS-CoV-2的细胞嗜性、ACE2和TMPRSS2的表达 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 不同人体组织和不同细胞类型的样本 |
| 1879 | 2024-08-08 |
[Regulation of RNA Binding Protein Mbnl1 on Development of Mouse Embryonic Hematopoietic Stem Cells]
2021-Jun, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
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研究论文 | 分析小鼠胚胎造血干细胞发育过程中单细胞RNA结合蛋白（RBPs）的动态分子表达特征，并研究Mbnl1在调节小鼠胚胎造血干细胞发育中的功能 | 通过生物信息学分析和CRISPR/Cas9技术构建Mbnl1敲除小鼠模型，研究Mbnl1在造血干细胞发育中的作用 | NA | 阐明Mbnl1在调节小鼠胚胎造血干细胞发育中的功能 | 小鼠胚胎造血干细胞（HSCs）及其发育过程中的单细胞RNA结合蛋白Mbnl1 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9技术 | NA | 单细胞转录组数据 | E11.5时期的Mbnl1+/+和Mbnl1-/-两种基因型胚胎的主动脉-性腺-中肾（AGM）和卵黄囊（YS）组织 |
| 1880 | 2024-08-08 |
Secreted inhibitors drive the loss of regeneration competence in Xenopus limbs
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199158
PMID:34105722
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研究论文 | 研究探讨了非洲爪蟾蝌蚪在发育过程中失去肢体再生能力的原因，并识别了关键的抑制因子。 | 通过单细胞转录组学和体外再生肢体培养，揭示了特殊伤口表皮的形成机制及其在发育过程中失去再生能力的原因。 | 研究主要集中在非洲爪蟾蝌蚪，可能不完全适用于其他物种或更高等脊椎动物。 | 研究非洲爪蟾蝌蚪特殊伤口表皮的分子和细胞调节机制及其在发育过程中失去再生能力的原因。 | 非洲爪蟾蝌蚪的肢体再生能力和特殊伤口表皮的形成。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |