单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1821 - 1840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1821 | 2024-08-08 |
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-021-00612-1
PMID:34142341
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研究论文 | 本文通过分析TCGA和CGGA数据库中的转录组数据和单细胞测序数据，筛选出与胶质母细胞瘤（GBM）预后相关的差异表达基因（DEGs），并构建了一个综合的GBM预后模型 | 首次结合转录组和单细胞测序数据，构建了一个综合的GBM预后模型，并在老年GBM患者中验证了其良好的性能 | NA | 揭示潜在的GBM预后标记基因，阐明其功能，并构建一个有效的GBM患者预后模型 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用TCGA和CGGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1822 | 2024-08-08 |
Targeting the αv integrin/TGF-β axis improves natural killer cell function against glioblastoma stem cells
2021-07-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI142116
PMID:34138753
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研究论文 | 研究通过抑制αv整合素/TGF-β轴改善自然杀伤细胞对胶质母细胞瘤干细胞的功能 | 揭示了胶质母细胞瘤干细胞通过αv整合素介导的TGF-β激活逃避自然杀伤细胞的机制，并提出αv整合素/TGF-β轴作为治疗胶质母细胞瘤的新靶点 | NA | 探讨胶质母细胞瘤干细胞逃避自然杀伤细胞的机制及潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤干细胞、自然杀伤细胞及αv整合素/TGF-β轴 | NA | 脑癌 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及胶质母细胞瘤患者及健康捐赠者的外周血NK细胞及肿瘤样本 |
| 1823 | 2024-08-08 |
Sequential regulation of hemogenic fate and hematopoietic stem and progenitor cell formation from arterial endothelium by Ezh1/2
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.014
PMID:34143974
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研究论文 | 本文探讨了Ezh1/2在调节动脉内皮细胞向造血干细胞和祖细胞分化的过程中的机制 | 首次描述了Ezh1在脊椎动物造血干细胞生产中的机制作用，并通过单细胞RNA测序揭示了Ezh1基因型在动脉内皮细胞中的调控作用 | NA | 研究Ezh1/2在胚胎发育中调节动脉内皮细胞向造血干细胞和祖细胞分化的机制 | Ezh1/2在动脉内皮细胞向造血干细胞和祖细胞分化中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及Ezh1基因型的动脉内皮细胞 |
| 1824 | 2024-08-08 |
Airway basal stem cells reutilize the embryonic proliferation regulator, Tgfβ-Id2 axis, for tissue regeneration
2021-07-12, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.05.016
PMID:34129836
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研究论文 | 本文通过时间序列单细胞转录组学和遗传验证实验，研究了TGF-β信号在发育和再生过程中调控气道基底干细胞增殖转换的分子机制。 | 发现TGF-β-Id2轴在发育和再生过程中共同调控基底细胞的增殖转换，并揭示了其在正常再生和避免基底细胞过度增生中的精细调节作用。 | NA | 探讨TGF-β信号在气道基底干细胞发育和再生中的作用及其分子机制。 | 气道基底干细胞及其在发育和再生过程中的增殖转换。 | NA | NA | 时间序列单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1825 | 2024-08-08 |
Tissue-resident macrophages provide a pro-tumorigenic niche to early NSCLC cells
2021-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03651-8
PMID:34135508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了人非小细胞肺癌（NSCLC）病变中肿瘤相关白细胞的巨噬细胞亚群，发现组织驻留巨噬细胞在肿瘤早期形成时促进上皮-间质转化和肿瘤细胞侵袭，并诱导强烈的调节T细胞反应，保护肿瘤细胞免受适应性免疫的影响。 | 本研究首次揭示了组织驻留巨噬细胞在早期肺癌中的作用，并提出它们可作为早期肺癌病变预防和治疗的目标。 | 研究主要集中在巨噬细胞在早期肺癌中的作用，对于其在肿瘤进展后期及不同阶段的具体作用机制仍需进一步研究。 | 探索巨噬细胞在人非小细胞肺癌病变中的多样性及其对肿瘤微环境的影响。 | 人非小细胞肺癌病变中的肿瘤相关白细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人和小鼠的肺癌样本 |
| 1826 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing identify SDCBP in ACE2-positive bronchial epithelial cells negatively correlates with COVID-19 severity
2021-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16714
PMID:34137173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在COVID-19患者的ACE2阳性支气管上皮细胞中鉴定出SDCBP，并发现其与COVID-19严重程度呈负相关 | 首次在ACE2阳性支气管上皮细胞中发现SDCBP与COVID-19严重程度的相关性，并探讨了其在免疫浸润中的作用 | NA | 识别新的预后生物标志物和治疗靶点，以辅助COVID-19的诊断和治疗 | COVID-19患者的ACE2阳性支气管上皮细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 1827 | 2024-08-08 |
Individual B cells transcribe multiple rearranged immunoglobulin light chains in teleost fish
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102615
PMID:34142062
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研究论文 | 研究了硬骨鱼类B细胞中免疫球蛋白轻链的多个重排转录现象 | 首次展示了硬骨鱼类B细胞中单个细胞内多个重排VJC基因的转录，揭示了硬骨鱼类中同型排斥的宽松性 | NA | 探讨硬骨鱼类B细胞中免疫球蛋白轻链的重排和转录机制 | 硬骨鱼类B细胞及其免疫球蛋白轻链 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 单个虹鳟鱼B细胞 |
| 1828 | 2024-08-08 |
Cell landscape atlas for patients with chronic thromboembolic pulmonary hypertension after pulmonary endarterectomy constructed using single-cell RNA sequencing
2021-06-21, Aging
DOI:10.18632/aging.203168
PMID:34153003
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研究论文 | 本研究旨在构建慢性血栓栓塞性肺动脉高压（CTEPH）患者肺动脉内膜切除术后肺组织的细胞景观图谱，并全面表征其细胞组成 | 首次提供了CTEPH患者肺动脉内膜切除术后肺组织在单细胞分辨率下的细胞景观图谱 | 未提及具体限制 | 构建并表征CTEPH患者肺动脉内膜切除术后肺组织的细胞景观 | CTEPH患者肺动脉内膜切除术后的肺组织 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5个肺动脉内膜切除术后的肺组织样本 |
| 1829 | 2024-08-08 |
Collection and preprocessing of fine needle aspirate patient samples for single cell profiling and data analysis
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100581
PMID:34151301
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研究论文 | 本文描述了采集和预处理用于单细胞分析的皮肤细针穿刺（FNA）样本的方法 | 采用FNA采集方法，具有微创性，更易被患者接受，并能进行频繁的纵向采样，从而获得高质量的单细胞测序数据 | NA | 介绍一种采集和预处理皮肤FNA样本的方法，以进行单细胞RNA测序和数据分析 | 皮肤FNA样本的采集和预处理 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1830 | 2024-08-08 |
Model-based prediction of spatial gene expression via generative linear mapping
2021-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24014-x
PMID:34140477
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研究论文 | 本文介绍了一种基于模型的方法Perler，用于整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据与原位杂交（ISH）参考数据，以预测空间基因表达 | Perler方法通过生成线性映射和高斯混合模型，提高了空间转录组预测的准确性和生物学可解释性 | NA | 开发一种新的计算方法，用于准确且可解释地从scRNA-seq数据中解码多细胞系统的空间转录组 | 果蝇胚胎、斑马鱼胚胎、哺乳动物肝脏和鼠视觉皮层的空间基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、原位杂交（ISH） | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 涉及多种生物样本，包括果蝇胚胎、斑马鱼胚胎、哺乳动物肝脏和鼠视觉皮层 |
| 1831 | 2024-08-08 |
Implicating Gene and Cell Networks Responsible for Differential COVID-19 Host Responses via an Interactive Single Cell Web Portal
2021-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.06.07.447287
PMID:34127975
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据，开发了一个交互式单细胞网络门户，用于探索和比较细胞特征，以获得新的见解和假设 | 本文创新性地整合了多种数据集，并开发了一个交互式网络门户，使用户能够探索和比较细胞特征，从而提出新的生物学假设 | NA | 开发一个交互式单细胞网络门户，以便用户能够探索和比较细胞特征，从而获得新的见解和假设 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 数据集 | 多种样本类型，包括血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 |
| 1832 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals penaeid shrimp hemocyte subpopulations and cell differentiation process
2021-06-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66954
PMID:34132195
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了虾类血细胞的六种类型及其转录组特征，并预测了它们的分化途径和细胞生长因子。 | 首次通过单细胞RNA测序技术对虾类血细胞进行了详细的分类和分化途径预测，提供了对虾类免疫系统的统一分类。 | NA | 揭示虾类血细胞的亚群分类和细胞分化过程，以增进对虾类免疫系统的理解。 | 虾类血细胞的分类、成熟和分化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1833 | 2024-08-08 |
Utilizing single-cell RNA sequencing for analyzing the characteristics of PBMC in patients with Kawasaki disease
2021-06-14, BMC pediatrics
IF:2.0Q2
DOI:10.1186/s12887-021-02754-5
PMID:34126969
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析川崎病患者的PBMC细胞特征，并探讨其潜在的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术在单细胞水平上揭示川崎病患者的免疫细胞紊乱 | 样本量较小，仅包括一名健康儿童和一名川崎病患者 | 分析川崎病患者外周血单个核细胞的特征，并探索其潜在的分子机制 | 川崎病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两名样本，包括一名健康儿童和一名川崎病患者 |
| 1834 | 2024-08-08 |
Hypomorphic and hypermorphic mouse models of Fsip2 indicate its dosage-dependent roles in sperm tail and acrosome formation
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199216
PMID:34125190
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研究论文 | 本研究通过构建FSIP2基因的低表达和高表达小鼠模型，探讨了FSIP2在精子尾部和顶体形成中的剂量依赖性作用 | 首次揭示了FSIP2在精子尾部和顶体形成中的剂量依赖性作用，并通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析验证了其功能 | NA | 探讨FSIP2基因在精子形态和功能中的作用 | FSIP2基因及其在精子形成中的作用 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析 | NA | RNA，蛋白质 | 包括低表达和高表达FSIP2的小鼠模型 |
| 1835 | 2024-08-08 |
SDImpute: A statistical block imputation method based on cell-level and gene-level information for dropouts in single-cell RNA-seq data
2021-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009118
PMID:34138847
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研究论文 | 本文提出了一种名为SDImpute的统计方法，用于对单细胞RNA测序数据中的缺失值进行区块填补 | SDImpute方法能够基于基因表达水平和相似细胞及基因的表达变异自动识别缺失事件，并通过利用相似细胞中未受缺失影响的基因表达进行区块填补 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中大量缺失值对下游分析的阻碍问题 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计方法 | 基因表达数据 | 包括模拟数据集和真实数据集 |
| 1836 | 2024-08-08 |
IL-6 contributes to metastatic switch via the differentiation of monocytic-dendritic progenitors into prometastatic immune cells
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002856
PMID:34140316
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞通过IL-6介导的造血干细胞和祖细胞（HSPCs）向促转移性单核-树突状祖细胞（MDPs）的分化，从而促进肿瘤转移的机制。 | 首次揭示了肿瘤源性IL-6在劫持HSPC分化程序中的新作用，使其向促转移性MDPs分化，进而功能性地分化为免疫抑制性单核细胞，支持转移开关。 | NA | 研究肿瘤细胞如何通过IL-6影响HSPCs的分化，从而促进肿瘤转移。 | 使用具有低或高转移潜能的肿瘤细胞克隆模型，研究HSPCs的分化命运及其在肿瘤转移中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用来自低和高转移潜能肿瘤的小鼠骨髓HSPCs，以及来自乳腺癌和肺癌患者的外周单核细胞。 |
| 1837 | 2024-08-08 |
Next Generation Sequencing-Based Identification of T-Cell Receptors for Immunotherapy Against Hepatocellular Carcinoma
2021-Jun, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1697
PMID:34141993
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研究论文 | 本文介绍了一种基于下一代测序（NGS）的HBV特异性T细胞受体（TCR）识别方法，无需TCR单一化过程，通过两种配对策略有效识别多克隆T细胞中的TCR | 本文提出的NGS方法避免了传统T细胞克隆扩增和单细胞测序的繁琐步骤和成本，提高了TCR识别的效率和速度 | 该方法的有效性依赖于多克隆T细胞的纯化，且需要进一步的功能评估以验证其临床应用潜力 | 开发一种快速有效的HBV特异性TCR识别方法，用于HBV相关肝细胞癌的TCR-T细胞免疫治疗 | HBV特异性T细胞受体（TCR） | 数字病理学 | 肝细胞癌 | NGS | NA | 序列数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1838 | 2024-08-08 |
Novel non-terminal tumor sampling procedure using fine needle aspiration supports immuno-oncology biomarker discovery in preclinical mouse models
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002894
PMID:34145033
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研究论文 | 本文介绍了一种基于细针穿刺的新型非终末期肿瘤采样方法，用于在小鼠模型中进行肿瘤微环境（TME）的活检，并支持免疫肿瘤学生物标志物的发现。 | 开发了一种非终末期的肿瘤采样方法，通过细针穿刺技术，允许在小鼠模型中重复采样，并能够将肿瘤微环境生物标志物与治疗反应结果直接关联。 | NA | 旨在识别能够预测或丰富治疗反应的生物标志物，并改进肿瘤微环境的药效学分析。 | 小鼠模型中的肿瘤微环境（TME）和肿瘤浸润性免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 细针穿刺 | NA | 细胞 | NA |
| 1839 | 2024-08-08 |
A high-resolution cell atlas of the domestic pig lung and an online platform for exploring lung single-cell data
2021-05-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.03.012
PMID:34144929
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了3个月龄猪肺的细胞异质性，生成了包含16种主要细胞类型的单细胞图谱，并构建了一个在线平台ScdbLung用于探索猪肺单细胞数据 | 首次生成了猪肺的高分辨率单细胞图谱，并构建了一个综合的在线平台，用于指导猪肺研究和临床应用 | NA | 研究猪肺细胞异质性，比较猪肺与人类肺部在细胞交流和呼吸病毒受体表达模式上的相似性与差异性 | 3个月龄猪肺的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 13,580个细胞 |
| 1840 | 2024-08-08 |
FACS Enrichment of Total Interstitial Cells and Fibroblasts from Adult Mouse Ventricles
2021-May-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4028
PMID:34150935
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研究论文 | 本文描述了一种基于荧光激活细胞分选（FACS）的方法，用于从成年小鼠心室中分离出两种心脏细胞组分：总间质细胞群（TIP；非心肌细胞）和富集的（-GFP）心脏成纤维细胞。 | 本文提供了一种新的FACS方法，用于分离和富集成年小鼠心室中的总间质细胞和心脏成纤维细胞。 | NA | 研究心脏间质细胞的异质性和在健康及心肌梗死心脏中的动态变化。 | 成年小鼠心室中的总间质细胞和心脏成纤维细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 成年小鼠心室细胞 |