单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2024-08-08 |
Endothelial Recovery in Bare Metal Stents and Drug-Eluting Stents on a Single-Cell Level
2021-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316472
PMID:34162228
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研究论文 | 本研究使用兔髂动脉模型分析了裸金属支架（BMS）和药物洗脱支架（DES）在单细胞水平上的内皮化差异 | 通过单细胞RNA测序揭示了BMS和DES内皮细胞的转录组特征差异，为理解支架植入后的内皮再生提供了新的视角 | 研究主要集中在30天后的内皮化情况，长期效果和临床应用的直接关联需要进一步研究 | 探讨裸金属支架和药物洗脱支架在血管内皮化过程中的分子机制差异 | 裸金属支架和药物洗脱支架的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了兔髂动脉模型进行分析 |
| 1782 | 2024-08-08 |
Prioritization of cell types responsive to biological perturbations in single-cell data with Augur
2021-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-021-00561-x
PMID:34172974
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研究论文 | 本文介绍了Augur工具，用于在单细胞数据中优先处理对生物扰动有响应的细胞类型 | 开发了Augur工具，能够在单细胞RNA-seq数据中对细胞类型进行优先排序，以识别对实验扰动最敏感的细胞类型 | NA | 开发和应用Augur工具，以优先处理在复杂组织中对实验扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含约20,000个基因和20种细胞类型的数据集 |
| 1783 | 2024-08-08 |
Dissecting the common and compartment-specific features of COVID-19 severity in the lung and periphery with single-cell resolution
2021-Jul-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102738
PMID:34179732
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研究论文 | 本研究利用96个公开的单细胞RNA测序数据集，分析了严重至危重COVID-19患者肺部和外周免疫细胞在转录表达、生物途径和配体-受体信号网络层面的共同特征和隔间特异性特征 | 本研究揭示了严重COVID-19中肺部和血液免疫细胞进入相似或不同病理状态的程度，并识别了隔间间的差异基因表达特征和共同调控的表面标记 | NA | 阐明严重至危重COVID-19患者肺部和外周免疫细胞的共同和隔间特异性特征 | 严重COVID-19患者肺部和外周的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 96个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 1784 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of the early developing mouse cerebral cortex disentangle the spatial and temporal components of neuronal fate acquisition
2021-07-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197962
PMID:34170322
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了早期发育的小鼠大脑皮层的神经元多样性，并探讨了神经元命运获取的空间和时间因素 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了神经元命运获取过程中空间信息和时间成熟的叠加作用 | NA | 探讨大脑皮层发育过程中神经元多样性的起源 | 小鼠早期发育的大脑皮层中的神经元和前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个早期发育的大脑皮层样本 |
| 1785 | 2024-08-08 |
scRNA sequencing uncovers a TCF4-dependent transcription factor network regulating commissure development in mouse
2021-07-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.196022
PMID:34184026
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和生物信息学策略，揭示了TCF4依赖的转录因子网络在调控小鼠胼胝体发育中的作用 | 本研究首次发现TCF4与非bHLH转录因子相互作用，并调控其转录活性，为神经发育过程中的转录因子网络提供了新的见解 | NA | 旨在识别TCF4在控制大脑半球间连接形成中的转录因子伙伴 | TCF4及其在神经发育中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1786 | 2024-08-08 |
The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq
2021-07, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01171-x
PMID:34155396
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析中的关键计算步骤，并探讨了不同方法的假设、成功案例、存在的模糊性和局限性 | 随着实验技术的能力和准确性提高，新兴算法的发展揭示了生物学中越来越复杂的方面 | 快速增长迫使不断重新评估基础统计模型、实验目的和大量数据处理 | 审查scRNA-seq分析中的计算方法，并强调其成功和局限性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 1787 | 2024-08-08 |
Molecular logic of cellular diversification in the mouse cerebral cortex
2021-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03670-5
PMID:34163074
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，生成小鼠大脑皮层发育的综合图谱，并结合空间转录组学时间序列数据，重建了大脑皮层细胞类别的发育轨迹，推断了它们的空间组织和伴随的基因调控程序。 | 首次全面揭示了小鼠大脑皮层细胞多样化的分子逻辑，为理解皮层发育异常提供了新的视角。 | NA | 揭示小鼠大脑皮层细胞多样化的分子机制及其在发育过程中的调控。 | 小鼠大脑皮层的细胞类型及其发育过程中的分子调控。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 1788 | 2024-08-08 |
The Three Rs of Single-Cell RNA Sequencing: Reuse, Refine, and Resource
2021-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2021.01.002
PMID:34167721
|
研究论文 | 本文通过结合和重新分析人类皮肤单细胞RNA测序数据集，揭示了成纤维细胞异质性的新见解 | 展示了基于Reuse、Refine和Resource原则，可以从已发表的数据中获得新的发现 | NA | 探索单细胞RNA测序在研究细胞异质性中的应用 | 人类皮肤中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个数据集 |
| 1789 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals a highly coordinated transcriptional program in mouse germ cells during primordial follicle formation
2021-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13424
PMID:34174788
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了在小鼠原始卵泡形成过程中，生殖细胞的高度协调转录程序 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和Monocle分析构建了卵母细胞发育的统一轨迹，并识别了可能的候选转录因子，这些因子可能在卵泡形成过程中维持转录程序 | NA | 阐明小鼠原始卵泡形成过程中卵母细胞的发育轨迹和调控机制 | 小鼠新生卵巢中的单个生殖细胞 | 数字病理学 | 卵巢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠（P0.5）卵巢中的单个生殖细胞 |
| 1790 | 2024-08-08 |
Early role for a Na+,K+-ATPase (ATP1A3) in brain development
2021-06-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023333118
PMID:34161264
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研究论文 | 本文探讨了Na,K-ATPase α3亚基在儿童多微脑回症中的作用及其在胎儿和婴儿大脑皮质发育中的表达模式 | 首次揭示了Na,K-ATPase泵复合体可能形成非冗余的细胞类型特异性α-β异构体组合，如兴奋性神经元中的α3-β1和抑制性神经元中的α3-β2 | NA | 研究Na,K-ATPase α3亚基在人脑皮质发育中的作用及其与疾病的关系 | Na,K-ATPase α3亚基在胎儿和婴儿大脑皮质发育中的表达模式 | 神经科学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序(Drop-seq) | NA | mRNA | 约125,000个单个细胞和52,000个核 |
| 1791 | 2024-08-08 |
Dissociation of microdissected mouse brain tissue for artifact free single-cell RNA sequencing
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100590
PMID:34159323
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research paper | 本文介绍了一种酶解法来分离小鼠脑细胞，以防止分离过程中的人工转录反应，并降低技术变异 | 提出了一种新的酶解法来分离小鼠脑细胞，以防止分离过程中的人工转录反应 | NA | 开发一种新的方法来分离小鼠脑细胞，以获得高质量的单细胞RNA测序结果 | 小鼠脑细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 3周至24个月大的小鼠脑组织 |
| 1792 | 2024-08-08 |
Obtaining purified human intestinal epithelia for single-cell analysis and organoid culture
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100597
PMID:34169291
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研究论文 | 本文描述了制备和分离高存活率的人类胎儿和儿童肠道组织以获得上皮单细胞悬液的协议 | 该协议能够生成用于单细胞RNA测序数据的上皮富集单细胞悬液，并从胎儿和儿童肠道创建人类肠道类器官 | NA | 制备和分离人类胎儿和儿童肠道组织以进行单细胞分析和类器官培养 | 人类胎儿和儿童的肠道组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬液 | NA |
| 1793 | 2024-08-08 |
Spike-in normalization for single-cell RNA-seq reveals dynamic global transcriptional activity mediating anticancer drug response
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab054
PMID:34159316
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，通过将内源基因表达与插入分子标准化，揭示了抗癌药物处理后癌细胞转录活性的动态变化 | 首次通过插入分子标准化方法，揭示了药物处理后单细胞转录活性的动态变化及其对药物反应的影响 | NA | 探究抗癌药物处理后癌细胞单细胞转录异质性的机制 | 癌细胞在不同药物处理后的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 转录组数据 | 多种癌细胞系及患者样本 |
| 1794 | 2024-08-08 |
The endogenous cellular protease inhibitor SPINT2 controls SARS-CoV-2 viral infection and is associated to disease severity
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009687
PMID:34181691
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研究论文 | 研究探讨了内源性细胞蛋白酶抑制剂SPINT2在SARS-CoV-2病毒感染中的作用及其与疾病严重程度的关系 | 发现了SPINT2与TMPRSS2之间的共调控关系，并验证了SPINT2在抑制SARS-CoV-2表达中的作用 | NA | 识别决定疾病易感性和严重程度的毒力因子 | SPINT2在SARS-CoV-2感染中的作用及其与疾病严重程度的关系 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 使用Calu-3细胞系进行验证，评估了来自合并症疾病的数据集 |
| 1795 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals transcriptional landscape and intratumor heterogenicity in gallbladder cancer liver metastasis microenvironment
2021-May, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2227
PMID:34164523
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胆囊癌肝转移微环境的转录组特征和肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了胆囊癌肝转移微环境中多种细胞类型的特征和相互作用 | 研究结果初步，需要进一步验证和深入研究 | 探索胆囊癌肝转移的分子机制 | 胆囊癌肝转移组织中的细胞类型及其特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7,788个细胞，包括T细胞、B细胞、恶性细胞、成纤维细胞、内皮细胞、巨噬细胞、树突状细胞和肥大细胞 |
| 1796 | 2024-08-08 |
Landscape of cell heterogeneity and evolutionary trajectory in ulcerative colitis-associated colon cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2021-Apr-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了溃疡性结肠炎相关结直肠癌中的细胞异质性和潜在的进化轨迹 | 首次在单细胞水平上揭示了从溃疡性结肠炎到结肠炎相关癌症的细胞组成和发展轨迹 | 研究样本仅来自一名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索结肠炎相关癌症中的肿瘤内异质性，并揭示从溃疡性结肠炎到结肠炎相关癌症的潜在进化轨迹 | 结肠炎相关癌症患者的肿瘤组织和邻近的溃疡性结肠炎组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 4,777个单细胞转录组，其中2,250个来自肿瘤组织，2,527个来自邻近的溃疡性结肠炎组织 |
| 1797 | 2024-08-08 |
Metformin, Macrophage Dysfunction and Atherosclerosis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.682853
PMID:34163481
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研究论文 | 本文探讨了二甲双胍对巨噬细胞功能及动脉粥样硬化的影响 | 文章总结了二甲双胍通过多种机制调节巨噬细胞功能，并讨论了未来的研究方向，如单细胞RNA测序、中性粒细胞外陷阱、表观遗传修饰及基于二甲双胍的联合药物 | NA | 探讨二甲双胍如何通过改善巨噬细胞功能来扩展其多效性药理作用 | 二甲双胍对巨噬细胞功能的影响及其在动脉粥样硬化等疾病中的作用 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 1798 | 2024-08-08 |
Single-Cell TCR and Transcriptome Analysis: An Indispensable Tool for Studying T-Cell Biology and Cancer Immunotherapy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.689091
PMID:34163487
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review | 本文综述了单细胞技术在T细胞研究中的应用，包括T细胞受体（TCR）和转录组分析，并讨论了其在T细胞介导的癌症免疫治疗中的重要性。 | 单细胞技术不仅验证了传统方法的观察结果，还为新发现铺平了道路，如先前未被识别的潜在影响自身免疫或癌症患者临床结果的T细胞亚群。 | NA | 探讨单细胞技术在T细胞生物学和癌症免疫治疗研究中的应用。 | T细胞及其在免疫反应、自身免疫、传染病和癌症免疫治疗中的作用。 | digital pathology | cancer | single-cell sequencing | NA | single-cell data | NA |
| 1799 | 2024-08-08 |
Cyclophosphamide Exposure Causes Long-Term Detrimental Effect of Oocytes Developmental Competence Through Affecting the Epigenetic Modification and Maternal Factors' Transcription During Oocyte Growth
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.682060
PMID:34164401
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研究论文 | 研究环磷酰胺暴露对卵母细胞发育能力长期负面影响及其通过影响表观遗传修饰和母源因子转录的作用机制 | 首次揭示了环磷酰胺治疗后卵母细胞质量下降的分子机制，并提出了通过LPA促进YAP1核定位来改善环磷酰胺修复胚胎发育能力的新策略 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨环磷酰胺暴露对卵母细胞发育能力的长期影响及其分子机制 | 环磷酰胺治疗后的小鼠卵母细胞及其胚胎发育能力 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠接受单次环磷酰胺治疗（100 mg/kg）后47天的卵母细胞样本 |
| 1800 | 2024-08-08 |
Identification of Liver Cancer Stem Cell Stemness Markers Using a Comparative Analysis of Public Data Sets
2021, Stem cells and cloning : advances and applications
DOI:10.2147/SCCAA.S307043
PMID:34168465
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研究论文 | 本研究通过对比分析公共数据集中的单细胞转录组数据，识别肝癌干细胞的干性标志物 | 本研究利用公开的肝癌和肝祖细胞类型的单细胞RNA测序数据，通过EdgeR差异表达分析，发现了一些干性标志物在癌症干细胞中的显著上调表达 | NA | 旨在通过对比重分析单细胞转录组数据，深入了解癌症干细胞的特性及其在肿瘤发生中的作用 | 肝癌干细胞及其干性标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开的肝癌和肝祖细胞类型的单细胞RNA测序数据 |