单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-15 |
CD11b+ lung dendritic cells at different stages of maturation induce Th17 or Th2 differentiation
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25307-x
PMID:34413303
|
研究论文 | 研究报道了在不同成熟阶段的小鼠肺部CD11b+树突状细胞（DC）如何诱导Th17或Th2分化 | 首次揭示了肺部cDC2在不同成熟阶段对Th17和Th2分化的影响，并通过单细胞RNA测序分析了其发展过程 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨肺部树突状细胞在不同成熟阶段对T细胞分化的影响 | 小鼠肺部的CD11b+树突状细胞及其在Th17和Th2分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠肺部的多个树突状细胞亚群 |
| 162 | 2024-08-15 |
CoCoA-diff: counterfactual inference for single-cell gene expression analysis
2021-08-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02438-4
PMID:34404460
|
研究论文 | 本文介绍了一种因果推断框架CoCoA-diff，用于在单细胞RNA-seq数据中优先考虑疾病基因，无需事先了解控制变量即可调整混杂因素 | CoCoA-diff方法在模拟和真实世界数据分析中显著提高了统计能力，并识别了215个在不同细胞类型中差异调节的因果基因 | NA | 寻找基因组医学中的因果基因 | 单细胞RNA-seq数据中的疾病基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 因果推断框架 | 基因表达数据 | 70,000个脑细胞 |
| 163 | 2024-08-15 |
Exploring the Biological Activity and Mechanism of Xenoestrogens and Phytoestrogens in Cancers: Emerging Methods and Concepts
2021-Aug-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168798
PMID:34445499
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综述 | 本文综述了外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制，以及新兴的研究方法和概念 | 介绍了患者来源的异种移植（PDX）模型和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的新应用，以及敏感期（WOS）这一新兴概念 | NA | 探讨外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的作用及其机制，以及如何利用这些知识开发预防和治疗癌症的新方法 | 外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 患者来源的异种移植（PDX）模型 | RNA | 18项临床试验 |
| 164 | 2024-08-15 |
Defining the variety of cell types in developing and adult human kidneys by single-cell RNA sequencing
2021-Aug-11, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-021-00156-w
PMID:34381054
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了发育中和成人人类肾脏中的细胞类型多样性 | 本文通过比较单细胞RNA测序时代前后的文献，发现了新的细胞类型和中间细胞阶段，以及复杂的分子特征和谱系途径 | 单细胞RNA测序技术存在局限性，导致细胞类型多样性在文献中仍然存在差异 | 确定人类肾脏中细胞类型的数量 | 发育中和成人人类肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人肾脏中鉴定出41种肾源性细胞群和32种非肾源性细胞群 |
| 165 | 2024-08-15 |
RNA velocity-current challenges and future perspectives
2021-08, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110282
PMID:34435732
|
综述 | 本文回顾了RNA速度建模方法的现状，讨论了其局限性和潜在缺陷，并提供了应对挑战的指导 | 提出了将RNA速度概念推广到更广泛的生物系统和模式的未来方向 | 讨论了RNA速度方法的局限性和潜在陷阱 | 探讨RNA速度方法的现状及未来发展方向 | RNA速度建模方法及其在生物系统中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 166 | 2024-08-15 |
N6-Methyladenosine Regulators and Related LncRNAs Are Potential to be Prognostic Markers for Uveal Melanoma and Indicators of Tumor Microenvironment Remodeling
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.704543
PMID:34395276
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（mA）调节因子和相关长链非编码RNA（lncRNA）在葡萄膜黑色素瘤（UM）中的预后标志物作用及其对肿瘤微环境（TME）重塑的影响 | 首次系统地识别了mA调节因子，并构建了基于mA调节因子的预后风险签名，通过单细胞测序数据验证了其在UM中的表达分布 | NA | 探索mA调节因子和相关lncRNA在UM中的预后标志物作用及对TME的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | LASSO Cox分析 | 转录组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的转录组和临床数据，以及GSE139829数据集的单细胞测序数据 |
| 167 | 2024-08-14 |
A Transcriptionally Distinct Subpopulation of Healthy Acinar Cells Exhibit Features of Pancreatic Progenitors and PDAC
2021-08-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0427
PMID:34049974
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研究论文 | 本研究重新分析了多个胰腺和胰腺导管腺癌（PDAC）的单细胞RNA测序数据集，发现了一组非恶性腺泡细胞亚群，称为腺泡边缘（AE）细胞，其转录组与典型腺泡细胞有显著差异 | 发现了在健康胰腺组织中随年龄增长的AE-like细胞亚群，这些细胞显示出胰腺祖细胞和癌前状态的特征，且这一现象在多个器官中普遍存在 | NA | 探讨胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤起源细胞的特征及其与健康细胞亚群的关系 | 胰腺和胰腺导管腺癌的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胰腺和PDAC样本 |
| 168 | 2024-08-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals ex vivo signatures of SARS-CoV-2-reactive T cells through 'reverse phenotyping'
2021-07-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24730-4
PMID:34312385
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过'反向表型'方法识别并分析了COVID-19患者中SARS-CoV-2反应性T细胞的特征 | 首次采用'反向表型'方法，利用T细胞受体序列作为条形码，识别SARS-CoV-2反应性T细胞，并揭示了抗原特异性刺激引入的表型效应 | NA | 揭示SARS-CoV-2抗原反应性T细胞在体内的表型特征 | COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性T细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 独立队列中的严重疾病患者呼吸道的T细胞 |
| 169 | 2024-08-14 |
Single-cell transcriptomics reveals immune response of intestinal cell types to viral infection
2021-07, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209833
PMID:34309190
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和高度多重RNA荧光原位杂交技术，研究了人肠道类器官在人星状病毒感染下的免疫反应 | 开发了一种新框架，结合单细胞RNA测序和高度多重RNA荧光原位杂交技术，揭示了不同肠道上皮细胞系在病毒感染下的独特免疫反应 | NA | 探索人肠道上皮细胞在病毒感染下的个体免疫反应 | 人肠道类器官在人星状病毒感染下的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，高度多重RNA荧光原位杂交 | NA | RNA | NA |
| 170 | 2024-08-13 |
GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profiles
2021-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24489-8
PMID:34234139
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为GapClust的轻量级算法，用于从超大规模的单细胞RNA测序数据集中检测稀有细胞类型 | GapClust算法在速度和内存效率上达到了最先进的水平，并且在多样本实验数据集上展示了优于其他近期方法的性能 | NA | 开发一种高效的算法来识别超大规模单细胞RNA测序数据集中的稀有细胞类型 | 稀有细胞类型 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 包括肠和68k PBMC数据集 |
| 171 | 2024-08-13 |
Compensatory hepatic adaptation accompanies permanent absence of intrahepatic biliary network due to YAP1 loss in liver progenitors
2021-07-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109310
PMID:34233187
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研究论文 | 研究探讨了Yes相关蛋白1（YAP1）在肝脏发育中的作用及其对肝细胞适应性的影响 | 首次揭示了YAP1在肝脏发育中的关键作用，并展示了肝细胞在没有胆管网络情况下的深刻适应能力 | NA | 探究YAP1在肝脏发育中的作用及肝细胞的适应性 | YAP1在肝脏发育中的作用及肝细胞的适应性 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA序列 | NA |
| 172 | 2024-08-13 |
[Progress in Single-cell RNA Sequencing of Lung Adenocarcinoma]
2021-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在肺腺癌研究中的应用和进展 | 单细胞测序作为一种新型测序方法，能够在单细胞水平上对细胞群体进行特定分析，揭示每种细胞类型的独特变化，并提供对异质性基质细胞和癌细胞的准确评估 | 尽管单细胞测序技术有诸多优势，但其在临床应用中仍面临技术挑战和数据解读的复杂性 | 深入理解肺腺癌的发病机制、肿瘤微环境的异质性及药物耐药形成的机制，以发现新的治疗靶点 | 肺腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 173 | 2024-08-13 |
Therapeutic Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.673485
PMID:34163359
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研究论文 | 本文系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征（CRS）相关的炎症细胞因子的转录调控因子，以识别可用于治疗靶点的转录因子（TFs）及其已批准的药物 | 本文通过整合TF-细胞因子基因相互作用资源与单细胞RNA-seq表达数据，发现了与COVID-19患者中上调的16种细胞因子相关的95个TFs，并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs | 需要进一步研究这些候选药物的重新定位，以确定治疗COVID-19患者CRS的有效疗法 | 探索COVID-19中CRS的治疗方法 | COVID-19患者的细胞因子释放综合征 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA | 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 |
| 174 | 2024-08-12 |
A survey of the mouse hindbrain in the fed and fasted states using single-nucleus RNA sequencing
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101240
PMID:33962048
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综述 | 本研究利用单核RNA测序技术，详细调查了在进食和禁食状态下小鼠延髓中的最后区（AP）和孤束核（NTS）的细胞 | 首次在延髓水平上进行深入的单细胞转录组学研究，揭示了关键抗肥胖药物受体表达细胞的转录组特征 | NA | 旨在详细描述AP和NTS细胞中关键抗肥胖药物受体的单细胞水平特征 | 小鼠延髓中的最后区（AP）和孤束核（NTS）细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 16,034个细胞，其中8,910个是神经元，7,124个是非神经元细胞 |
| 175 | 2024-08-12 |
Boosting scRNA-seq data clustering by cluster-aware feature weighting
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04033-7
PMID:34078287
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CaFew的新方法，通过集群感知特征加权来选择基因，以提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类的性能 | CaFew方法通过优化聚类目标函数，获得特征权重矩阵，用于特征选择，从而提高聚类效果 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8个真实scRNA-seq数据集 |
| 176 | 2024-08-12 |
Neural G0: a quiescent-like state found in neuroepithelial-derived cells and glioma
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209522
PMID:34101353
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类神经干细胞（hNSCs）的细胞周期状态，并构建了一个细胞周期分类器，识别出神经上皮来源细胞类型中的传统细胞周期阶段和一个类似静止状态（Neural G0），该状态在哺乳动物神经发生和胶质瘤中存在。 | 本研究首次识别出神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态（Neural G0），并发现该状态与较不具侵袭性的肿瘤和患者生存期延长相关。 | NA | 研究神经上皮来源细胞和胶质瘤中的细胞周期状态，特别是类似静止状态（Neural G0）。 | 人类神经干细胞（hNSCs）的细胞周期状态，以及神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态（Neural G0）。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 177 | 2024-08-12 |
EyeDiseases: an integrated resource for dedicating to genetic variants, gene expression and epigenetic factors of human eye diseases
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab050
PMID:34085038
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研究论文 | 开发了一个名为EyeDiseases的数据库，用于整合和解释人类眼病的多组学数据 | 首次开发了一个专门用于整合和解释人类眼病多组学数据的数据库 | NA | 加速发现和验证与各种眼病相关的候选位点和基因，以促进分子诊断和治疗 | 人类眼病的遗传变异、基因表达和表观遗传因子 | 数字病理学 | 眼病 | 多组学技术 | NA | 基因组数据 | 包含1344个与疾病相关的基因、1774个转录文件和105个表观基因组数据 |
| 178 | 2024-08-12 |
Ventricular, atrial, and outflow tract heart progenitors arise from spatially and molecularly distinct regions of the primitive streak
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001200
PMID:33999917
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序结合遗传谱系追踪和活体成像技术，揭示了在小鼠胚胎原条阶段，第一和第二心场（FHF和SHF）被细分为不同的前体细胞池，这些前体细胞在原条中具有不同的起源和分子特征 | 本研究首次在更早的胚胎发育阶段发现了FHF和SHF的细分前体细胞池，并揭示了这些细胞在原条中的不同起源和分子特征 | NA | 探讨心脏前体细胞在原条中的起源和分子特征 | 小鼠胚胎原条中的心脏前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 分子数据 | 小鼠胚胎原条中的多个前体细胞亚群 |
| 179 | 2024-08-12 |
An integrative microenvironment approach for laryngeal carcinoma: the role of immune/methylation/autophagy signatures on disease clinical prognosis and single-cell genotypes
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.58076
PMID:34093817
|
研究论文 | 本研究全面探讨了甲基化/自噬相关基因（MARGs）和免疫浸润在肿瘤微环境中对喉癌预后的影响 | 本研究结合单细胞和转录组学分析，探索了肿瘤微环境与预后特征之间的联系，并建立了基于神经网络的深度学习模型 | NA | 探讨甲基化/自噬相关基因和免疫浸润在肿瘤微环境中对喉癌预后的影响 | 喉癌的预后和单细胞基因型 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因数据 | 126个MARGs和10种免疫细胞，以及临床样本和GEO数据集 |
| 180 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptomics reveals the effect of PD-L1/TGF-β blockade on the tumor microenvironment
2021-05-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01034-z
PMID:34030676
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了PD-L1和/或TGF-β阻断对肿瘤微环境的影响 | 首次详细描述了PD-L1和/或TGF-β阻断在肿瘤微环境中的转录程序，并发现CCL5作为潜在的生物标志物 | 临床上PD-L1和TGF-β联合阻断的疗效尚未得到证实，且TGF-β抑制剂常引起毒性反应 | 探索增强T细胞浸润和PD-L1/PD-L1疗法疗效的策略 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约30,000个单细胞 |