单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 2885 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
161 2024-08-10
Transcriptional profiling of mouse peripheral nerves to the single-cell level to build a sciatic nerve ATlas (SNAT)
2021-04-23, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文通过单细胞水平的转录组分析,构建了小鼠坐骨神经的转录组图谱(SNAT) 首次结合了发育中的坐骨神经的批量RNA测序和Schwann细胞的批量及单细胞RNA测序,以及全坐骨神经的单细胞转录组分析 NA 促进对外周神经基本理解的研究 小鼠坐骨神经中的各种细胞类型 NA NA RNA测序 NA 转录组数据 包括发育中的坐骨神经和成年坐骨神经的多个样本
162 2024-08-10
A single-cell genomics pipeline for environmental microbial eukaryotes
2021-Apr-23, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文描述了一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 该流程整合了先进的单细胞基因组学工具和优化协议,旨在提高低成本下基因组质量 NA 开发和评估一种针对环境中低丰度未培养真核微生物的单细胞基因组学流程 环境中低丰度未培养的真核微生物 基因组学 NA 单细胞测序 NA 基因组数据 环境样本和早期分化线菌及Chromista/SAR培养物
163 2024-08-10
Applications of brain organoids in neurodevelopment and neurological diseases
2021-Apr-22, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
综述 本文综述了脑类器官在神经发育和神经系统疾病中的应用现状 介绍了脑类器官与免疫染色和单细胞测序技术的结合,以及其在模拟早期脑发育和建模人类脑部疾病中的应用 讨论了该技术的挑战和未来展望 介绍脑类器官分化策略的现状,总结其在医学领域的进展和应用 脑类器官及其在神经发育和神经系统疾病中的应用 NA 神经系统疾病 免疫染色技术,单细胞测序技术 NA 组织 NA
164 2024-08-10
The long noncoding RNA lnc-HLX-2-7 is oncogenic in Group 3 medulloblastomas
2021-04-12, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本文报道了一种新的长链非编码RNA lnc-HLX-2-7,作为第三组髓母细胞瘤的潜在分子标记和治疗靶点 首次发现lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中高度上调,并证实其作为治疗靶点的潜力 NA 研究lnc-HLX-2-7在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性 lnc-HLX-2-7在第三组髓母细胞瘤中的表达和功能 数字病理学 儿童肿瘤 RNA测序(RNA-seq) CRISPR/Cas9 RNA 175名髓母细胞瘤患者
165 2024-08-10
Colorectal Cancer Stem Cell States Uncovered by Simultaneous Single-Cell Analysis of Transcriptome and Telomeres
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文通过同时分析单细胞转录组和端粒长度,揭示了结直肠癌干细胞的状态 首次实现同时测量单细胞中的端粒长度和转录组,系统评估了结直肠癌干细胞 NA 揭示结直肠癌干细胞的特征及其与肿瘤进展和药物抵抗的关系 结直肠癌干细胞及其在肿瘤中的作用 数字病理学 结直肠癌 SMART-seq2, 10 × Genomics NA 转录组数据 NA
166 2024-08-10
A fish with no sex: gonadal and adrenal functions partition between zebrafish NR5A1 co-orthologs
2021-02-09, Genetics IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过敲除斑马鱼中的nr5a1a和nr5a1b基因,探讨NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色。 首次揭示了斑马鱼中nr5a1a和nr5a1b基因在性腺和肾上腺功能中的分工,以及这种分工对性发育差异的影响。 研究主要集中在斑马鱼模型上,可能需要进一步在其他物种中验证这些发现。 探索NR5A1同源基因在性腺和肾上腺功能中的祖先角色及其对性发育的影响。 斑马鱼的nr5a1a和nr5a1b基因及其在性腺和肾上腺中的功能。 遗传学 NA 单细胞RNA测序,RNA测序 NA 基因表达数据 包括1天和2天龄的斑马鱼胚胎以及成年斑马鱼。
167 2024-08-09
Research Techniques Made Simple: Use of Imaging Mass Cytometry for Dermatological Research and Clinical Applications
2021-04, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本文介绍了成像质谱流式细胞术(IMC)在皮肤病学研究和临床应用中的潜力 IMC技术能够同时分析多达40种蛋白质标记物,生成高维图像,保留组织结构和细胞间空间关系 NA 强调IMC在皮肤病学研究和临床应用中的潜在用途 皮肤病学领域的组织和细胞 数字病理学 NA 成像质谱流式细胞术(IMC) NA 图像 NA
168 2024-08-09
Leukocyte dynamics after intracerebral hemorrhage in a living patient reveal rapid adaptations to tissue milieu
2021-03-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,对一名参与微创手术联合溶栓治疗脑内出血试验的患者进行了血液和脑血肿流出物的纵向分析,揭示了脑内出血后白细胞的动态适应性变化 首次在单细胞分辨率下描述了活体患者脑内出血期间的局部细胞反应 仅基于单一病例的研究,可能缺乏普遍性 探索脑内出血后脑部免疫反应的动态变化 脑内出血患者的血液和脑血肿流出物 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 单一病例
169 2024-08-09
Single-cell immunophenotyping of the fetal immune response to maternal SARS-CoV-2 infection in late gestation
2021-Mar-16, Research square
研究论文 研究旨在描述母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫反应的影响 首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了母体SARS-CoV-2感染对胎儿免疫系统的调节作用 研究仅限于第三孕期的新生儿,且未观察到垂直传播 探究母体SARS-CoV-2感染对胎儿及儿童健康的潜在影响 母体SARS-CoV-2感染的第三孕期新生儿及其脐带血单个核细胞 NA COVID-19 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 NA RNA 母体感染SARS-CoV-2的新生儿脐带血单个核细胞
170 2024-08-09
Microglia Diversity in Healthy and Diseased Brain: Insights from Single-Cell Omics
2021-Mar-16, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文通过单细胞组学技术研究了健康和疾病状态下大脑中微胶质细胞的多样性 利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术,揭示了微胶质细胞在生理和病理条件下的未被发现的异质性 NA 总结单细胞组学研究在微胶质细胞功能多样性方面的发现,并探讨其在未来免疫调节治疗设计中的重要性 大脑中的微胶质细胞及其在健康和疾病状态下的多样性 NA 神经退行性疾病,中风,抑郁症,脑肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),质谱流式细胞术(CyTOF) NA 单细胞数据 数千个单个细胞
171 2024-08-09
Efficient IL-2R signaling differentially affects the stability, function, and composition of the regulatory T-cell pool
2021-02, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 研究通过分析一种自发突变小鼠品系,探讨了IL-2R信号在调节Treg细胞稳定性、功能及其组成中的作用 首次揭示了IL-2R信号的部分丧失如何影响Treg细胞池的维持、异质性和抑制功能 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探讨IL-2R信号在不同条件下对Treg细胞稳态、谱系稳定性和功能的影响 Treg细胞及其在非炎症和炎症环境下的功能 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及Cd25小鼠的Treg细胞
172 2024-08-09
Cell type prioritization in single-cell data
2021-01, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Augur的方法,用于在单细胞数据中优先考虑对生物扰动最敏感的细胞类型 Augur采用机器学习框架量化高维空间中扰动和未扰动细胞的可分离性,并在单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据集上验证了其方法,显示出优于基于差异基因表达的现有方法 NA 开发和验证一种新的方法来优先考虑单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型 单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 机器学习框架 单细胞数据 涉及小鼠脊髓神经刺激后的神经回路样本
173 2024-08-08
Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy
2021-Mar-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究报道了SARS-CoV-2感染的人类细胞系的基因表达谱,并识别出HSP90作为COVID-19治疗的目标 首次揭示了SARS-CoV-2在人类上皮细胞系Calu-3中引发的大约两倍于SARS-CoV的固有免疫反应刺激,并通过单细胞RNA测序分析了病毒感染细胞的基因表达模式 NA 深入了解SARS-CoV-2感染的分子生物学机制,包括病毒复制、宿主反应和疾病进展 SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系,以及HSP90在感染中的作用 数字病理学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 三个SARS-CoV和SARS-CoV-2感染的人类细胞系
174 2024-08-08
Single-cell transcriptional changes associated with drug tolerance and response to combination therapies in cancer
2021-03-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,研究了癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 首次展示了癌症细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中存在的多种癌症细胞亚群,并揭示了这些亚群的表观遗传变化和治疗敏感性的差异 NA 研究癌症细胞在药物耐受和联合治疗反应中的转录变化 癌症细胞的亚群及其对药物的耐受性和敏感性 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及细胞系、异种移植瘤和患者肿瘤中的多种癌症细胞亚群
175 2024-08-08
Urinary Single-Cell Profiling Captures the Cellular Diversity of the Kidney
2021-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组分析技术,对17份尿液样本中的23,082个细胞进行了分析,揭示了尿液中细胞的多样性及其与肾脏和膀胱细胞的相似性和差异性 首次通过单细胞转录组分析技术全面地描述了尿液中细胞的类型和特征 NA 生成人类尿液中细胞的参考数据集,并探索尿液中细胞与肾脏和膀胱细胞的关系 尿液中的单细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组分析 NA 细胞 17份尿液样本,来自5名受试者在不同时间的收集
176 2024-08-08
Single-cell lineage mapping of a diverse virus-specific naive CD4 T cell repertoire
2021-03-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本文利用单细胞测序技术追踪了病毒特异性CD4 T细胞在淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染下的克隆扩增、分化轨迹和谱系选择 首次实现了对自然TCR库中单个初始T细胞克隆扩增、分化和谱系选择的追踪 NA 研究病毒特异性CD4 T细胞在感染过程中的克隆扩增、分化和谱系选择 病毒特异性CD4 T细胞 免疫学 NA 单细胞测序技术 NA 序列数据 NA
177 2024-08-07
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 研究通过选择性删除CD11c细胞中的α4-整合素,探讨其在中枢神经系统(CNS)自身免疫中的作用 首次展示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性CNS自身免疫中的关键作用,并通过单细胞RNA测序进行了详细分析 研究主要在实验小鼠模型中进行,可能与人类疾病存在差异 探讨CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在多发性硬化症(MS)中的作用及机制 CD11c.Cre小鼠和野生型(WT)小鼠 免疫学 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 细胞 涉及CD11c.Cre小鼠和WT小鼠,以及人类脑脊液样本
178 2024-08-07
Identification and Characterization of Zebrafish Tlr4 Coreceptor Md-2
2021-03-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和功能实验,鉴定并表征了斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2,揭示了其在先天免疫系统中的作用 首次在斑马鱼中发现并验证了Md-2的存在,并证明其与Tlr4形成复合体响应LPS,挑战了之前认为斑马鱼缺乏Md-2的观点 文章中提到的功能丧失突变对LPS毒性的保护作用有限,表明可能存在其他未知的免疫机制 探究斑马鱼中Tlr4共受体Md-2的鉴定与功能,以及其在先天免疫系统中的作用 斑马鱼中的Tlr4共受体Md-2及其在先天免疫系统中的作用 生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及11种有颌脊椎动物的基因组分析
179 2024-08-07
Entropy subspace separation-based clustering for noise reduction (ENCORE) of scRNA-seq data
2021-02-22, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种基于熵子空间分离的聚类算法ENCORE,用于减少单细胞RNA测序数据中的噪声 ENCORE算法通过集成熵子空间分离策略和共识聚类方法,能够有效区分信息特征与噪声,提高细胞聚类的准确性和可视化分辨率 NA 研究旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和分辨率,以更好地研究细胞异质性和发现群体标记 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类、标记识别和可视化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 共识聚类方法 单细胞RNA测序数据 12个标准数据集
180 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing and lipidomics reveal cell and lipid dynamics of fat infiltration in skeletal muscle
2021-02, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和脂质组学分析,揭示了骨骼肌中脂肪浸润的细胞和脂质动态变化 首次通过单细胞RNA测序和脂质组学技术,详细解析了骨骼肌脂肪浸润过程中的细胞起源和脂质及转录组变化 研究主要集中在短期内的细胞和脂质变化,长期影响及机制尚需进一步研究 探究骨骼肌中脂肪浸润的细胞起源和脂质及转录组变化 骨骼肌中的脂肪浸润现象 数字病理学 肌肉疾病 单细胞RNA测序, 脂质组学 NA RNA, 脂质 GLY注射后的骨骼肌样本
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