单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1761 - 1780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2024-08-08 |
The amniotic fluid cell-free transcriptome in spontaneous preterm labor
2021-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-92439-x
PMID:34188072
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研究论文 | 研究分析了自发早产情况下羊水中的游离RNA转录组，并探讨其在预测自发早产中的价值 | 首次量化了羊水中游离RNA中的已知胎盘单细胞RNA-Seq特征，并应用随机森林模型预测羊水穿刺后的分娩时间 | NA | 探讨羊水中游离RNA在预测自发早产中的应用 | 自发早产情况下羊水中的游离RNA | NA | 早产 | RNA-Seq | 随机森林模型 | RNA | 共分析了38份羊水样本，其中10份来自24小时内分娩的妇女，28份来自24小时后分娩的妇女 |
| 1762 | 2024-08-08 |
NF-Y Subunits Overexpression in HNSCC
2021-Jun-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13123019
PMID:34208636
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研究论文 | 研究报道了NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的过度表达情况 | 首次分析了TCGA和细胞系中的RNA-seq数据，并利用单细胞RNA-seq数据进行了肿瘤亚型的划分和生存曲线的推导 | NA | 探讨NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤生物学行为的影响 | NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了TCGA数据库和头颈部鳞状细胞癌的细胞系数据 |
| 1763 | 2024-08-08 |
A Literature-Derived Knowledge Graph Augments the Interpretation of Single Cell RNA-seq Datasets
2021-06-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060898
PMID:34200671
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研究论文 | 本文通过自然语言处理框架量化基因与细胞类型之间的关系，并开发了一种增强型注释算法来提高单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 首次展示了如何系统地应用文献衍生的知识图谱来加速和增强单细胞RNA测序数据的注释和解释 | NA | 开发一种新的方法来增强单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 人类蛋白质编码基因与细胞类型之间的关系，以及单细胞RNA测序数据集的细胞身份预测 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本 | 2600万篇生物医学文献，133个细胞集群 |
| 1764 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptomic Heterogeneity and Post-Traumatic Osteoarthritis-Associated Early Molecular Changes in Mouse Articular Chondrocytes
2021-06-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061462
PMID:34200880
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了健康和受伤小鼠膝关节软骨细胞的转录组异质性及其在创伤后骨关节炎早期分子变化 | 首次对关节软骨细胞进行单细胞分辨率的分子水平全面分析，并识别出九种具有不同分子特征的软骨细胞亚型 | 由于从密集的软骨细胞外基质中分离软骨细胞的技术难度，可能存在一定的技术限制 | 阐明不同软骨细胞亚型的分子和功能特征，以及这些亚型与其他关节细胞类型之间的相互作用，从而加深对关节生物学和骨关节炎病理学的理解 | 小鼠关节软骨细胞及其在创伤后的分子变化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和受伤的小鼠膝关节软骨细胞 |
| 1765 | 2024-08-08 |
Diversity of Rainbow Trout Blood B Cells Revealed by Single Cell RNA Sequencing
2021-Jun-09, Biology
DOI:10.3390/biology10060511
PMID:34207643
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研究论文 | 本研究利用10× Genomics单细胞RNA测序技术，首次在硬骨鱼中分析了外周血中单个B细胞的转录模式 | 首次在硬骨鱼中应用单细胞RNA测序技术分析B细胞的转录模式 | 研究主要集中在硬骨鱼中的彩虹鳟，尚未广泛应用于其他非模式生物 | 理解硬骨鱼B细胞的生物学特性并发现潜在的标记物 | 彩虹鳟的外周血B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十至数千个单个细胞 |
| 1766 | 2024-08-08 |
Exploring Viral Diversity in a Gypsum Karst Lake Ecosystem Using Targeted Single-Cell Genomics
2021-06-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060886
PMID:34201311
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研究论文 | 本研究利用靶向细胞分选结合单细胞测序技术，探索了石膏岩溶湖生态系统中感染绿色硫细菌的病毒的基因内容和基因组潜力 | 本研究发现大多数病毒基因和蛋白质序列与公共数据库中的噬菌体序列相似度很低或无相似性，揭示了先前未描述的绿色硫细菌病毒的巨大多样性 | NA | 研究石膏岩溶湖生态系统中绿色硫细菌病毒的多样性和分布 | 绿色硫细菌及其感染的病毒 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 62个单扩增基因组中鉴定出82个病毒连接体 |
| 1767 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptional Heterogeneity of Lymphatic Endothelial Cells in Normal and Inflamed Murine Lymph Nodes
2021-06-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061371
PMID:34199492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了正常和炎症状态下小鼠淋巴结中淋巴内皮细胞的转录变化 | 发现了淋巴内皮细胞在不同淋巴结窦中对皮肤炎症的个体响应，表明它们在病理条件下发挥不同功能 | NA | 深入分析淋巴结淋巴内皮细胞在正常状态和皮肤炎症中的转录景观 | 小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及正常和炎症状态下的小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 |
| 1768 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq landscape midbrain cell responses to red spotted grouper nervous necrosis virus infection
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009665
PMID:34185811
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了健康和感染红点石斑神经坏死病毒（RGNNV）的石斑鱼中脑细胞的转录组响应 | 首次揭示了RGNNV主要攻击石斑鱼的中脑，并识别了35种转录上不同的细胞亚型，包括28种神经元和7种非神经元细胞类型 | NA | 探讨神经坏死病毒（NNV）感染对鱼类中脑细胞的影响及其免疫响应 | 红点石斑鱼（Epinephelus coioides）的中脑细胞 | 数字病理学 | 鱼类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和感染RGNNV的石斑鱼中脑细胞 |
| 1769 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Breadth of Osteoblast Heterogeneity
2021-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10496
PMID:34189385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了成骨细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了成骨细胞的异质性，并识别出可能作为成骨细胞成熟阶段新标记的基因 | 研究仅限于新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他物种或不同发育阶段的成骨细胞 | 探索成骨细胞的异质性及其生物学意义 | 新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 272个Venus单细胞 |
| 1770 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis as a Promising Tool to Study Pluripotent Stem Cell Reprogramming
2021-Jun-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115988
PMID:34206025
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在多能干细胞重编程研究中的应用 | 介绍了近年来积极使用的单细胞分析技术，并预测了未来的研究方向 | NA | 理解疾病和细胞活动在单细胞层面的机制 | 多能干细胞及其重编程过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1771 | 2024-08-08 |
Dopamine Neuron Diversity: Recent Advances and Current Challenges in Human Stem Cell Models and Single Cell Sequencing
2021-06-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061366
PMID:34206038
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综述 | 本文综述了多巴胺神经元多样性的最新进展和当前挑战，特别是在人干细胞模型和单细胞测序技术中的应用 | 利用人多能干细胞和先进的计算单细胞转录组学技术，有望解码人多巴胺神经元的成熟和多样化机制 | 目前尚未有系统性的分子分类方法在全基因组水平上对多巴胺神经元进行分类 | 探讨如何利用干细胞模型和单细胞RNA测序技术深入理解人多巴胺神经元的生物学特性 | 人中脑多巴胺神经元的多样性和功能 | 干细胞研究 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 1772 | 2024-08-08 |
Marker Genes Change of Synovial Fibroblasts in Rheumatoid Arthritis Patients
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/5544264
PMID:34195267
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了类风湿性关节炎（RA）和骨关节炎（OA）患者的滑膜成纤维细胞的标志基因变化 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质相互作用网络分析，确定了RA和OA的特定细胞亚群及其关键基因，并验证了这些基因在临床样本中的表达差异 | 研究仅使用了两个公开数据集，可能需要更多样本和数据集来验证结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和验证RA患者的滑膜成纤维细胞中的关键基因，以作为诊断和治疗的新靶点 | 类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE109449和GSE56409两个数据集中的样本 |
| 1773 | 2024-08-08 |
Revealing immune responses in the Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis-infected THP-1 cells using single cell RNA-sequencing
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0254194
PMID:34214113
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人THP-1细胞在感染Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis（MAP）后的免疫反应 | 发现了由THP-1细胞分化出的新型细胞类型Mreg细胞，并揭示了不同细胞类型在相同条件下对MAP感染的反应差异 | NA | 探究MAP感染后人THP-1细胞的初始反应，以阐明Crohn's疾病的病理机制 | 人THP-1细胞在MAP感染后的免疫反应 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | THP-1细胞被分为七个不同的集群进行分析 |
| 1774 | 2024-08-08 |
Adult-repopulating lymphoid potential of yolk sac blood vessels is not confined to arterial endothelial cells
2021-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-1935-2
PMID:34181164
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研究论文 | 本研究通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，鉴定了中期妊娠期卵黄囊中六种分子上不同的内皮细胞群体，并探讨了这些内皮细胞的造血潜能及其在淋巴细胞生成中的作用。 | 首次揭示了卵黄囊内皮细胞在淋巴细胞生成中的潜能，并发现这种潜能不仅限于动脉内皮细胞，为理解哺乳动物发育过程中造血干细胞前体的来源提供了理论基础。 | NA | 探讨卵黄囊内皮细胞的造血潜能及其在淋巴细胞生成中的作用。 | 卵黄囊内皮细胞及其在造血干细胞前体生成中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 1775 | 2024-08-08 |
Breaking the barrier: In vitro models to study choroid plexus development
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.05.005
PMID:34182208
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研究论文 | 本文讨论了利用体外模型研究脉络丛发育及其在脑脊液分泌和屏障功能中的作用 | 介绍了利用新型技术如体内成像、单细胞转录组学和体外三维培养来研究脉络丛生物学的新突破 | 由于伦理和技术限制，人类脉络丛的具体机制仍了解较少 | 探讨体外模型在研究人类脑脊液分泌和屏障功能中的应用 | 脉络丛的发育及其在脑脊液分泌和屏障功能中的作用 | NA | NA | 体内成像、单细胞转录组学、体外三维培养 | NA | NA | NA |
| 1776 | 2024-08-08 |
Consensus clustering of single-cell RNA-seq data by enhancing network affinity
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab236
PMID:34160582
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研究论文 | 本文介绍了一种新的无监督方法SCENA，用于通过增强网络亲和力对单细胞RNA测序数据进行共识聚类 | SCENA方法采用了三种策略：选择多个基因集、增强细胞间的局部亲和力和共识矩阵的聚类，显著提高了细胞亚群检测的准确性和鲁棒性 | NA | 阐明单细胞RNA测序数据中细胞亚群的高分辨率识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类方法 | RNA测序数据 | 13个实际单细胞RNA测序数据集 |
| 1777 | 2024-08-08 |
EcTracker: Tracking and elucidating ectopic expression leveraging large-scale scRNA-seq studies
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab237
PMID:34184038
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研究论文 | 介绍EcTracker，一个基于R/Shiny的单细胞数据分析网络服务器，用于量化和定性评估真实细胞类型或组织特异性转录本以及单细胞RNA测序数据中的异位表达基因 | EcTracker提供了处理速度快、多个附加模块、交互式图形用户界面和全面性的关键特点，为分析单细胞数据集提供了新的维度 | NA | 开发一个集成且端到端的单细胞数据分析平台，用于解码细胞身份、识别异位表达基因及其调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的异位表达基因及其调控网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎干细胞分化为内胚层谱系的CRISPR干扰（CRISPRi）数据集 |
| 1778 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq describes the transcriptome landscape and identifies critical transcription factors in the leaf blade of the allotetraploid peanut (Arachis hypogaea L.)
2021-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.13656
PMID:34174007
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了花生叶片中的转录组景观，并识别了关键的转录因子 | 首次广泛应用scRNA-seq技术于植物细胞，特别是在花生叶片细胞中，揭示了细胞分化的新假说 | NA | 探索花生叶片细胞的转录组特征及其发育过程中的关键转录因子 | 花生叶片中的单细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6,815个单细胞 |
| 1779 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of mouse and human prostate reveals novel fibroblasts with specialized distribution and microenvironment interactions
2021-10, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5751
PMID:34173975
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了人和小鼠前列腺中的成纤维细胞亚型及其在微环境中的分布和相互作用 | 发现了两种新型的人类前列腺成纤维细胞亚型，并揭示了它们在前列腺中的特定分布模式和与微环境的相互作用 | NA | 揭示前列腺中基质-上皮相互作用的分子身份和解剖结构，为良性前列腺增生的新治疗靶点开发提供基础 | 人和小鼠的前列腺成纤维细胞亚型及其在微环境中的分布和相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1780 | 2024-08-08 |
Single-Cell Mapping of GLP-1 and GIP Receptor Expression in the Dorsal Vagal Complex
2021-09, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi21-0003
PMID:34176785
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综述 | 本文综述了单细胞方法在检测背侧迷走复合体（DVC）中GLP-1和GIP受体表达细胞分子特征方面的应用 | 讨论了单细胞转录组学、表观遗传学、空间转录组学和电路图谱技术在进一步研究后脑中肠降血糖素受体电路方面的潜力 | NA | 理解肠降血糖素如何通过中枢机制改变代谢和能量平衡 | 背侧迷走复合体（DVC）中的GLP-1和GIP受体表达细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学、表观遗传学、空间转录组学、电路图谱技术 | NA | 分子特征 | NA |