单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1741 - 1760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1741 | 2024-08-08 |
Inflammation-related genes S100s, RNASE3, and CYBB and risk of leukemic transformation in patients with myelodysplastic syndrome with myelofibrosis
2021-Jul-02, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-021-00304-w
PMID:34229751
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研究论文 | 研究探讨了炎症相关基因S100s、RNASE3和CYBB在伴有骨髓纤维化的骨髓增生异常综合征患者白血病转化风险中的作用 | 首次通过单细胞测序分析了MDS-MF患者白血病转化前后基因表达水平的变化，发现炎症相关基因和通路的表达增加 | 研究样本量较小，仅包括53名MDS-MF患者和31名非MF的MDS患者 | 旨在识别MDS-MF患者白血病转化的潜在机制 | 伴有骨髓纤维化的骨髓增生异常综合征患者 | NA | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 53名MDS-MF患者和31名非MF的MDS患者 |
| 1742 | 2024-08-08 |
Co-delivery of novel bispecific and trispecific engagers by an amplicon vector augments the therapeutic effect of an HSV-based oncolytic virotherapy
2021-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002454
PMID:34230110
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研究论文 | 本文报道了通过扩增子载体同时递送新型双特异性和三特异性结合剂，增强基于HSV的溶瘤病毒疗法的治疗效果 | 开发了两种新型嵌合分子（双特异性嵌合结合剂蛋白BiCEP和三特异性嵌合结合剂蛋白TriCEP），能同时结合自然杀伤细胞（NK）和T细胞与肿瘤细胞，增强抗肿瘤活性 | NA | 旨在提高溶瘤病毒疗法的治疗效果，通过增强其与浸润免疫细胞的协同作用 | 新型嵌合分子BiCEP和TriCEP以及溶瘤单纯疱疹病毒 | 癌症免疫疗法 | 恶性肿瘤 | 溶瘤病毒疗法 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 1743 | 2024-08-08 |
Determination of the dynamic cellular transcriptional profiles during kidney development from birth to maturity in rats by single-cell RNA sequencing
2021-Jun-24, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00542-9
PMID:34226524
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从出生到成年大鼠肾脏发育过程中的细胞转录组动态变化 | 首次提供了从出生到成年大鼠肾脏发育中期和晚期的全面基因表达图谱 | NA | 深入理解肾脏发育中期和晚期的分子基础和调控事件 | 大鼠肾脏发育过程中的细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54,704个大鼠肾脏细胞 |
| 1744 | 2024-08-08 |
Decreased MEF2A Expression Regulated by Its Enhancer Methylation Inhibits Autophagy and May Play an Important Role in the Progression of Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2021.682247
PMID:34220439
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法分析多种微阵列和测序数据集，旨在识别与阿尔茨海默病（AD）发病机制相关的自噬相关基因，并探讨其在AD发病中的作用，以发现预防和治疗AD的新策略。 | 研究首次揭示了MEF2A增强子甲基化水平升高与AD发病机制中自噬抑制的关联，为AD的预防和治疗提供了新的分子靶点。 | 研究主要依赖于生物信息学分析和微阵列数据，可能需要进一步的实验验证以确认结果的可靠性。 | 识别与阿尔茨海默病发病机制相关的自噬相关基因，并探讨其在疾病进展中的作用。 | 阿尔茨海默病（AD）及其相关的自噬过程。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 微阵列分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 多种微阵列和测序数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 1745 | 2024-08-08 |
9-Gene Signature Correlated With CD8+ T Cell Infiltration Activated by IFN-γ: A Biomarker of Immune Checkpoint Therapy Response in Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.622563
PMID:34220795
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研究论文 | 本研究旨在识别与黑色素瘤中CD8+ T细胞浸润相关的因子及其共表达网络，并阐明黑色素瘤肿瘤微环境中CD8+ T细胞相关基因的相互作用 | 本研究首次识别了与CD8+ T细胞浸润相关的九基因标志物，并证实其在免疫检查点抑制剂治疗反应中的重要预测意义 | NA | 识别与CD8+ T细胞浸润相关的基因标志物，并探讨其在黑色素瘤免疫治疗反应中的作用 | 黑色素瘤及其癌旁组织的mRNA表达矩阵，以及CD8+ T细胞的比例和肿瘤微环境纯度 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | CIBERSORT算法，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞测序，免疫组化 | NA | mRNA表达数据 | 来自TCGA-SKCM和GSE65904的数据集 |
| 1746 | 2024-08-08 |
Visual Genomics Analysis Studio as a Tool to Analyze Multiomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.642012
PMID:34220932
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review | 本文介绍了Visual Genomics Analysis Studio（VGAS）这一先进的多组学单细胞数据分析和可视化工具，旨在帮助研究人员无需高级生物信息学知识即可分析复杂的免疫细胞数据 | VGAS提供了一个用户友好的界面，无需用户编写代码或访问高性能计算机，通过内置的优化代码提供快速直观的分析工具 | NA | 介绍和评估VGAS在多组学单细胞数据分析中的应用 | 多组学单细胞数据，特别是TCR-RNA-CITE-seq数据 | genomics | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell data | NA |
| 1747 | 2024-08-08 |
No evidence that plasmablasts transdifferentiate into developing neutrophils in severe COVID-19 disease
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1308
PMID:34221402
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研究论文 | 本文探讨了在严重COVID-19疾病中，浆母细胞是否能转化为'发育中的中性粒细胞'的问题 | 本文通过重新分析原始数据和代码，揭示了浆母细胞与发育中的中性粒细胞之间的谱系关系在未回归关键特征时会崩溃 | 在生物信息学分析和数据解释时应谨慎，并应通过正交技术交叉验证 | 验证浆母细胞在严重COVID-19疾病中是否能转化为发育中的中性粒细胞 | 浆母细胞和发育中的中性粒细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1748 | 2024-08-08 |
Ligand-Receptor Interactions Elucidate Sex-Specific Pathways in the Trajectory From Primordial Germ Cells to Gonia During Human Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.661243
PMID:34222234
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研究论文 | 本文通过分析人类胎儿性腺的单细胞转录组数据，揭示了在人类发育过程中从原始生殖细胞（PGCs）到精原细胞（gonia）的性别特异性分子交互作用 | 首次系统分析了发育中人类性腺的信号环境，并揭示了人类前减数生殖细胞发育中的性别特异性信号通路 | 目前无法在没有性腺组织的情况下模拟PGCs到gonia的转变 | 理解从PGCs到前减数卵原细胞或精原细胞的转变过程，并识别在逐步重建人类配子发生中感兴趣的性别特异性信号通路 | 人类胎儿性腺中的原始生殖细胞及其向精原细胞的性别特异性转变 | NA | NA | 单细胞转录组学 | CellPhoneDB算法 | 转录组数据 | 人类胎儿性腺样本 |
| 1749 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of the zebrafish embryonic trunk
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0254024
PMID:34234366
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术对斑马鱼胚胎躯干区域的20,000多个细胞进行了转录组分析 | 首次详细描述了斑马鱼胚胎发育过程中27种不同细胞类型和亚型的转录特征 | NA | 研究斑马鱼胚胎发育过程中的细胞分化和转录特征 | 斑马鱼胚胎躯干区域的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000多个细胞 |
| 1750 | 2024-08-08 |
Evolution of Developmental Programs for the Midline Structures in Chordates: Insights From Gene Regulation in the Floor Plate and Hypochord Homologues of Ciona Embryos
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.704367
PMID:34235159
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研究论文 | 本文研究了脊索动物中线结构的发育程序的进化，特别是通过基因调控在Ciona胚胎的底板和同源的腹索中的表达。 | 发现了驱动报告基因在底板中表达的调控区域，并揭示了底板和内胚层带共享部分基因调控程序，以及FoxA.a作为中线基因组的候选转录激活因子。 | NA | 探讨脊索动物中线结构的发育程序的进化起源。 | Ciona胚胎的底板和腹索的基因调控。 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Ciona尾芽胚胎 |
| 1751 | 2024-08-08 |
CStreet: a computed Cell State trajectory inference method for time-series single-cell RNA sequencing data
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab488
PMID:34196686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CStreet的计算方法，用于推断时间序列单细胞RNA测序数据中的细胞状态轨迹 | CStreet利用时间序列信息构建细胞间k近邻连接，并估计细胞状态的连接概率，通过力导向图可视化轨迹，支持多起点和路径 | NA | 旨在解决时间序列单细胞RNA测序数据中细胞状态轨迹的准确推断问题 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 1752 | 2024-08-08 |
Evaluation of immune status in testis and macrophage polarization associated with testicular damage in patients with nonobstructive azoospermia
2021-11, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13481
PMID:34192390
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化染色等技术，系统评估了非阻塞性无精子症患者睾丸免疫微环境的状态，特别是巨噬细胞的极化情况，并探讨了其与精子发生的关系 | 首次系统分析了非阻塞性无精子症患者睾丸中巨噬细胞的极化状态及其与精子发生的关系 | 研究基于公共微阵列数据集，可能存在样本选择偏倚；未涉及临床干预试验 | 揭示非阻塞性无精子症患者睾丸免疫微环境的机制 | 非阻塞性无精子症患者睾丸中的免疫细胞及其极化状态 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因集富集分析（ssGSEA）、基因集变异分析（GSVA）、免疫组化（IHC） | NA | 基因表达数据 | 使用了四个独立的公共微阵列数据集（GSE45885, GSE45887, GSE9210, 和 GSE145467） |
| 1753 | 2024-08-08 |
Intra-heterogeneity in transcription and chemoresistant property of leukemia-initiating cells in murine Setd2-/- acute myeloid leukemia
2021-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12189
PMID:34196511
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研究论文 | 本研究探讨了Setd2-/-小鼠急性髓系白血病（AML）中白血病起始细胞（LICs）的转录和化学抗性特性的内在异质性。 | 本研究首次揭示了Setd2-/- AML模型中LICs的转录和功能异质性，并发现了不同类型LICs共存导致的多样药物反应。 | NA | 旨在阐明AML中LICs的内在异质性，以帮助预测白血病行为并开发更有效的治疗方法。 | Setd2-/-小鼠的AML模型中的白血病起始细胞（LICs）。 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术、全基因组测序、RNA测序、限制性稀释分析、小分子抑制剂筛选 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Setd2-/- AML小鼠的脾细胞 |
| 1754 | 2024-08-08 |
AP-2α-Mediated Activation of E2F and EZH2 Drives Melanoma Metastasis
2021-09-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0772
PMID:34210752
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研究论文 | 本文研究了AP-2α转录因子在黑色素瘤转移中的作用，发现AP-2α通过激活E2F和EZH2途径促进黑色素瘤转移 | 首次揭示了AP-2α通过抑制NuRD抑制复合体来上调E2F途径基因，从而驱动黑色素瘤转移 | NA | 探讨AP-2α在黑色素瘤转移中的作用及其机制 | AP-2α转录因子及其在黑色素瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了转移性黑色素瘤小鼠模型 |
| 1755 | 2024-08-08 |
Dissecting human trophoblast cell transcriptional heterogeneity in preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2021-08, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1730
PMID:34212522
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的转录异质性 | 首次展示了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的发展轨迹，并揭示了其基因表达的改变 | NA | 探讨子痫前期胎盘在病理发生中的作用 | 子痫前期和健康妊娠胎盘中的滋养层细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自子痫前期和健康妊娠的胎盘样本 |
| 1756 | 2024-08-08 |
De novo generation of macrophage from placenta-derived hemogenic endothelium
2021-07-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.06.005
PMID:34197725
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠胎盘造血的转录组图谱，并验证了胎盘内皮细胞的一个亚群具有造血潜能，能够产生胎盘巨噬细胞。 | 首次发现并验证了胎盘内皮细胞的一个亚群具有造血潜能，能够产生胎盘巨噬细胞，为胎盘作为巨噬细胞来源提供了新的证据。 | NA | 探究巨噬细胞是否可以从其他胚胎部位产生，特别是胎盘来源的巨噬细胞。 | 小鼠胎盘内皮细胞及其造血潜能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1757 | 2024-08-08 |
Control of tissue development and cell diversity by cell cycle-dependent transcriptional filtering
2021-07-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64951
PMID:34212855
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研究论文 | 本文探讨了细胞周期依赖的转录过滤在组织发育和细胞多样性控制中的作用 | 通过数学模拟细胞增殖，揭示了细胞周期过滤器作为调节基因转录表达、细胞多样性和组织中不同细胞类型数量及比例的机制 | NA | 研究细胞周期动态在多细胞动物中控制基因转录表达和细胞命运的作用 | 细胞周期、基因转录表达、细胞多样性、组织中的细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模拟 | 基因组数据 | NA |
| 1758 | 2024-08-08 |
A Bayesian inference transcription factor activity model for the analysis of single-cell transcriptomes
2021-Jul, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265595.120
PMID:34193535
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研究论文 | 本文开发了一种基于贝叶斯推理的转录因子活性模型（BITFAM），用于分析单细胞转录组数据，并整合了ChIP-seq转录因子结合信息。 | BITFAM模型能够从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性，并结合现有的转录因子结合位点生物数据，为理解细胞功能和命运调控提供新视角。 | NA | 开发一种新的方法来推断单细胞转录组数据中的转录因子活性，并揭示其调控机制。 | 单细胞RNA测序数据中的转录因子活性及其调控机制。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），ChIP-seq | 贝叶斯推理模型 | 转录组数据 | NA |
| 1759 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq
2021-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01223-2
PMID:34194051
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1760 | 2024-08-08 |
A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-06-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02320-w
PMID:34193958
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研究论文 | 本文介绍了一种优化用于酵母的单细胞转录组学平台yeastDrop-Seq，并使用该平台研究了霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞全局mRNA水平的影响 | 开发了针对酵母细胞优化的yeastDrop-Seq平台，解决了Drop-Seq技术在不同细胞大小和形态特征生物体应用中的挑战 | NA | 研究霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞转录组的影响 | 酵母细胞的转录组 | 生物技术 | NA | Drop-Seq | NA | 转录组数据 | 多个同源酵母细胞 |