单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1721 - 1740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2024-08-08 |
Identification of a special cell type as a determinant of the kidney tropism of SARS-CoV-2
2021-09, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16114
PMID:34228902
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和尿液蛋白质组学分析，识别出一种名为PT-3的特殊细胞类型，该细胞类型在肾脏中对SARS-CoV-2感染具有易感性 | 首次识别出PT-3细胞作为SARS-CoV-2在肾脏中的易感细胞类型，并发现其在不同肾脏疾病中的分布差异 | NA | 探究SARS-CoV-2在肾脏中的易感细胞类型及其机制 | PT-3细胞及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），尿液蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，尿液蛋白质组数据 | 正常人肾脏和已有疾病肾脏的单细胞RNA测序数据，COVID-19患者和健康个体的尿液样本 |
| 1722 | 2024-08-08 |
Multiplexing Methods for Simultaneous Large-Scale Transcriptomic Profiling of Samples at Single-Cell Resolution
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101229
PMID:34240574
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综述 | 本文综述了基于DNA的样本多重标记方法在单细胞RNA测序（scRNA-seq）中的应用 | 详细比较了四种主要条码策略，并提供了根据个性化需求选择最合适条码技术的指南 | NA | 探讨样本多重标记技术在scRNA-seq中的应用及未来发展 | 单细胞RNA测序中的样本多重标记方法 | 测序技术 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 1723 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies unique chondrocyte subsets and reveals involvement of ferroptosis in human intervertebral disc degeneration
2021-09, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2021.06.010
PMID:34242803
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类椎间盘退变中的软骨细胞亚群，并揭示了铁死亡在椎间盘退变中的作用 | 首次报道了椎间盘髓核中的七个软骨细胞亚群，其中四个亚群（C1-C4）为新发现的亚群，并发现铁死亡途径在椎间盘退变中的富集 | NA | 探索椎间盘退变过程中髓核中细胞亚群及其生物学过程 | 人类椎间盘退变中的髓核组织 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat包 | 基因表达数据 | 正常对照组和椎间盘退变模型组的髓核组织各6个样本 |
| 1724 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2感染胰腺后促进血栓纤维化并与新发糖尿病相关的情况 | 首次报道了SARS-CoV-2在胰腺中的感染情况，并观察到胰腺纤维化和血栓形成的现象 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探究SARS-CoV-2感染胰腺与新发糖尿病之间的关系 | 胰腺中的ACE2和TMPRSS2表达，以及SARS-CoV-2在胰腺细胞中的免疫定位 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 8只非人类灵长类动物和5名COVID-19患者 |
| 1725 | 2024-08-08 |
Inferring single cell expression profiles from overlapped pooling sequencing data with compressed sensing strategy
2021-08-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab581
PMID:34244789
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研究论文 | 本文提出了一种利用重叠池化和压缩感知策略从重叠池化测序数据中推断单细胞表达谱的方法 | 通过重叠池化和压缩感知策略，能够在保持基因检测灵敏度和个体特异性的同时，节省约一半的文库成本 | NA | 开发一种降低大规模单细胞表达数据获取成本的方法 | 单细胞表达谱 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 压缩感知 | 测序数据 | 54个单细胞 |
| 1726 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq revealed diverse cell types in the mouse placenta at mid-gestation
2021-08-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2021.112715
PMID:34217714
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）揭示了E10.5小鼠胎盘中多样化的细胞类型及其在细胞组成和通讯上的差异 | 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了小鼠胎盘中的细胞异质性，并追踪了滋养层细胞和Hofbauer样细胞的发育轨迹 | NA | 研究旨在深入了解正常胎盘的细胞组成和通讯机制 | 小鼠胎盘中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | E10.5小鼠胎盘样本 |
| 1727 | 2024-08-08 |
Key molecular alterations in endothelial cells in human glioblastoma uncovered through single-cell RNA sequencing
2021-08-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.150861
PMID:34228647
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究人胶质母细胞瘤中内皮细胞的关键分子改变 | 构建了人脑内皮细胞的分子图谱，提供了对人类血脑屏障异质性及其在胶质母细胞瘤中分子改变的前所未有的分子洞察 | NA | 揭示人胶质母细胞瘤中内皮细胞的分子异质性及其在肿瘤中的改变 | 人胶质母细胞瘤中的内皮细胞及其配对的肿瘤周围组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新鲜分离的人胶质母细胞瘤内皮细胞及配对的肿瘤周围组织 |
| 1728 | 2024-08-08 |
Cascaded filter deterministic lateral displacement microchips for isolation and molecular analysis of circulating tumor cells and fusion cells
2021-08-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00360g
PMID:34219135
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研究论文 | 本文介绍了一种级联过滤确定性横向位移微芯片，用于循环肿瘤细胞和融合细胞的分离及分子分析 | 提出了一种新的过滤确定性横向位移概念，通过级联微流体设计实现了高吞吐量和无堵塞的分离 | NA | 实现循环肿瘤细胞的高效分离和高纯度，以支持癌症研究和个性化治疗 | 循环肿瘤细胞和肿瘤细胞-白细胞融合细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 确定性横向位移 | NA | 细胞 | 来自肺癌患者的样本 |
| 1729 | 2024-08-08 |
Unveiling the neuroimaging-genetic intersections in the human brain
2021-08-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000952
PMID:34227572
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研究论文 | 本研究旨在介绍结合神经影像学和遗传数据的不同方法学途径 | 利用新的公开脑部和单细胞转录组数据集，将神经影像学发现与遗传数据关联起来 | NA | 探索神经影像学与遗传数据之间的交叉点 | 人类大脑 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | NA | 影像数据 | NA |
| 1730 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals neuroinflammation in severe COVID-19
2021-08, Nature reviews. Neurology
DOI:10.1038/s41582-021-00536-2
PMID:34234324
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1731 | 2024-08-08 |
High-grade serous tubo-ovarian cancer refined with single-cell RNA sequencing: specific cell subtypes influence survival and determine molecular subtype classification
2021-07-09, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00922-x
PMID:34238352
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对高级别浆液性输卵管卵巢癌进行细化分析，探讨特定细胞亚型对生存率和分子亚型分类的影响。 | 通过单细胞RNA测序技术提高了分子亚型的转录组分辨率，揭示了细胞亚型与生存率的相关性。 | 目前缺乏与这些亚型强相关的预后或预测相关性，阻碍了其在临床上的应用。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示高级别浆液性输卵管卵巢癌中细胞亚型与生存率和分子亚型分类的关系。 | 高级别浆液性输卵管卵巢癌的细胞亚型及其对生存率和分子亚型分类的影响。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 18,403个细胞来自7个未经治疗的高级别浆液性输卵管卵巢癌肿瘤样本 |
| 1732 | 2024-08-08 |
NF-κB-dependent IRF1 activation programs cDC1 dendritic cells to drive antitumor immunity
2021-07-09, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abg3570
PMID:34244313
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研究论文 | 本研究探讨了核因子κB（NF-κB）和干扰素（IFN）信号通路在调节肿瘤内常规类型1树突状细胞（cDC1s）成熟过程中的作用，以及这些通路如何影响抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示了NF-κB依赖的IRF1激活在cDC1s中的作用，以及这一机制如何影响抗肿瘤免疫反应 | 研究主要集中在单个细胞转录组学分析和特定基因网络的激活，可能需要进一步的体内实验验证 | 探究NF-κB和IFN信号通路在cDC1s抗肿瘤免疫功能中的作用 | 肿瘤内常规类型1树突状细胞（cDC1s）及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1733 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling of mESC-derived tendon and fibrocartilage cell fate switch
2021-07-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24535-5
PMID:34244516
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研究论文 | 本研究通过激活TGFβ和hedgehog通路，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和发育线索的迭代方法，成功从鼠胚胎干细胞（mESCs）中诱导生成肌腱和纤维软骨细胞，并展示了其在三维工程组织中的应用。 | 首次通过激活特定信号通路，高效生成肌腱和纤维软骨细胞，并成功应用于三维工程组织的构建。 | NA | 探究肌腱及相关纤维软骨组织（如半月板和纤维环）的转录调控因子，并开发高效生成这些细胞和组织的方法。 | 鼠胚胎干细胞（mESCs）衍生的肌腱和纤维软骨细胞。 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 90%诱导效率的mESC衍生的肌腱和纤维软骨细胞 |
| 1734 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals cell communication triggered by macrophages associated with the reduction and exhaustion of CD8+ T cells in COVID-19
2021-07-08, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-021-00754-7
PMID:34238338
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了与COVID-19中CD8+ T细胞减少和耗竭相关的巨噬细胞触发的细胞间通信 | 本研究首次描述了COVID-19严重程度中涉及巨噬细胞和T细胞亚群的配体-受体相互作用 | 本研究为回顾性观察研究，未进行临床试验注册 | 旨在理解由多种细胞类型组成的呼吸免疫微环境及其基于配体-受体相互作用的细胞通信，以开发疫苗、探究COVID-19发病机制并改进大流行控制措施 | COVID-19患者的临床信息、常规实验室检测和流式细胞术分析数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 102名确诊COVID-19的住院患者 |
| 1735 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of endometriosis provides insights into fibroblast fates and immune cell heterogeneity
2021-Jul-07, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00637-x
PMID:34233737
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了子宫内膜异位症中成纤维细胞的命运和免疫细胞的异质性 | 首次构建了子宫内膜异位症的单细胞转录组图谱，并揭示了与疾病发展相关的成纤维细胞亚群和免疫细胞变化 | NA | 深入理解子宫内膜异位症的病因和病理机制 | 子宫内膜异位症患者的异位子宫内膜、子宫内膜异位症患者的正常子宫内膜以及健康女性的正常子宫内膜 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约55,000个单细胞样本，来自三组不同来源 |
| 1736 | 2024-08-08 |
Dynamics of primitive streak regression controls the fate of neuromesodermal progenitors in the chicken embryo
2021-07-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64819
PMID:34227938
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研究论文 | 本文通过追溯克隆分析和单细胞RNA测序技术，研究了鸡胚胎中原始条纹回缩过程中神经中胚层前体细胞（NMPs）的命运 | 首次在单细胞水平上直接证明了NMPs在鸡胚胎中的双潜能性，并揭示了NMPs在轴向延长过程中保持其转录组特征的同时失去上皮特性的现象 | NA | 探讨原始条纹和尾芽通过NMPs对羊膜胚胎身体形成的贡献 | 鸡胚胎中的神经中胚层前体细胞（NMPs）及其在身体形成中的作用 | 发育生物学 | NA | 追溯克隆分析，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 鸡胚胎样本 |
| 1737 | 2024-08-08 |
Coordination of endothelial cell positioning and fate specification by the epicardium
2021-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24414-z
PMID:34230480
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了心外膜细胞（EPDCs）在心脏发育过程中对内皮细胞（ECs）定位和命运指定的调控作用 | 首次识别出Slit2+ EPDCs作为血管导向细胞，并揭示了心外膜细胞通过旁分泌信号调控内皮细胞定位和命运指定的机制 | NA | 探讨心外膜细胞如何通过空间信息控制内皮细胞的身份和行为，以及其在心脏发育中的作用 | 内皮细胞（ECs）和心外膜细胞（EPDCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1738 | 2024-08-08 |
The predicting roles of carcinoembryonic antigen and its underlying mechanism in the progression of coronavirus disease 2019
2021-07-03, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-021-03661-y
PMID:34217339
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研究论文 | 本研究旨在识别COVID-19的候选预测因子并探讨其潜在机制 | 首次揭示了癌胚抗原（CEA）在COVID-19进展中的预测作用及其通过调节细胞间通讯的潜在机制 | NA | 识别COVID-19的预测生物标志物及其潜在机制 | COVID-19患者的癌胚抗原（CEA）及其在疾病进展中的作用 | NA | COVID-19 | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | 304名住院的成年COVID-19患者 |
| 1739 | 2024-08-08 |
Sox9-expressing cells promote regeneration after radiation-induced lung injury via the PI3K/AKT pathway
2021-07-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02465-9
PMID:34215344
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研究论文 | 研究探讨了Sox9表达细胞在辐射诱导肺损伤后的再生作用及其机制 | 首次揭示了Sox9表达细胞在辐射修复和再生中的作用，并发现PI3K/AKT通路在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和在线单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的人体研究验证 | 探索Sox9表达细胞在辐射诱导肺损伤后的再生作用及其分子机制 | Sox9表达细胞及其在肺组织再生中的作用 | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了Sox9CreER, RosatdTomato 和 RosaDTA小鼠模型 |
| 1740 | 2024-08-08 |
Dissecting spatial heterogeneity and the immune-evasion mechanism of CTCs by single-cell RNA-seq in hepatocellular carcinoma
2021-07-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24386-0
PMID:34215748
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研究论文 | 本研究通过单细胞全长RNA测序技术，分析了肝细胞癌患者中来自四个不同血管部位的113个循环肿瘤细胞的转录组，揭示了CTCs在血液传播过程中的转录动态及其免疫逃逸机制 | 首次揭示了CTCs在血液传播过程中的转录动态，并识别了CCL5作为CTCs免疫逃逸的重要介质 | 样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究循环肿瘤细胞在血液传播过程中的转录组可塑性和适应机制 | 肝细胞癌患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞全长RNA测序 | NA | 转录组数据 | 113个单细胞循环肿瘤细胞 |