单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2024-08-08 |
Keratin Profiling by Single-Cell RNA-Sequencing Identifies Human Prostate Stem Cell Lineage Hierarchy and Cancer Stem-Like Cells
2021-Jul-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22158109
PMID:34360875
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了前列腺球中的上皮细胞谱系层次结构，并通过角蛋白分析识别了人类前列腺干细胞谱系层次和癌症干细胞样细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术对前列腺干细胞及其后代祖细胞进行角蛋白分析，揭示了干细胞和癌症相关通路的富集 | NA | 阐明人类前列腺干细胞谱系层次和癌症干细胞样细胞的角蛋白特征，以促进前列腺癌症干细胞样细胞的鉴定和治疗靶向 | 人类前列腺干细胞及其后代祖细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个前列腺干细胞和祖细胞集群 |
| 1622 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Simulation Reveals the Impact of Sequencing Parameters and Algorithms on Clustering
2021-Jul-19, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11070716
PMID:34357088
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序数据模拟，评估了测序参数和算法对细胞聚类的影响 | 开发了一种模拟程序SSCRNA，用于生成原始数据，并评估了不同算法和测序深度对聚类准确性的影响 | NA | 研究单细胞RNA测序中的参数和算法对细胞聚类的影响 | 单细胞转录组测序数据及其分析算法 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | K-means, Louvain | 转录组数据 | NA |
| 1623 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Mouse Brain Vasculature
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/7643209
PMID:34337051
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组数据构建了小鼠脑血管细胞的转录调控网络 | 利用改进的SCENIC方法构建基因调控网络，并通过单细胞RNA测序数据分析小鼠脑血管细胞的异质性 | NA | 研究小鼠脑部血管健康与功能的关系，并探索脑血管细胞的发育过程 | 小鼠脑部血管细胞的转录调控特征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC方法 | 转录组数据 | 小鼠脑部血管细胞的单细胞RNA测序数据集 |
| 1624 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ovarian Cancer: Promises and Challenges
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-73359-9_7
PMID:34339033
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review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在卵巢癌研究中的进展、方法、数据分析及其潜在应用 | 利用单细胞RNA测序技术来表征罕见亚群的基因表达，可能为卵巢癌识别新的治疗靶点和途径 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在卵巢癌中的应用潜力 | 卵巢癌中的癌细胞、免疫细胞和基质细胞亚群 | digital pathology | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1625 | 2024-08-08 |
Mapping Angiopoietin1 Expression in the Developing and Adult Brain
2021, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000518351
PMID:34348288
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研究论文 | 本文通过使用Angpt1-GFP敲入报告小鼠和多个单细胞RNA测序数据集的系统分析，描绘了Angiopoietin1（Angpt1）在发育中和成年大脑中的表达模式 | 首次详细描述了Angpt1在发育中和成年大脑中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 阐明Angpt1在发育中和成年大脑中的细胞类型特异性表达，并为未来研究其在脑发育、稳态和病理条件中的功能提供指导 | Angiopoietin1在发育中和成年大脑中的表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Angpt1-GFP敲入报告小鼠 |
| 1626 | 2024-08-08 |
New Insights From Single-Cell Sequencing Data: Synovial Fibroblasts and Synovial Macrophages in Rheumatoid Arthritis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.709178
PMID:34349767
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞和滑膜巨噬细胞的转录组表达水平 | 通过scRNA-seq技术揭示了滑膜细胞的异质性，并为类风湿性关节炎的治疗提供了新的治疗靶点 | NA | 研究类风湿性关节炎中滑膜细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 滑膜成纤维细胞和滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1627 | 2024-08-08 |
Camk2a-Cre and Tshz3 Expression in Mouse Striatal Cholinergic Interneurons: Implications for Autism Spectrum Disorder
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.683959
PMID:34349780
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研究论文 | 本文研究了Camk2a-Cre和Tshz3在老鼠纹状体胆碱能中间神经元中的表达，及其对自闭症谱系障碍的影响 | 首次展示了Camk2a-Cre表达细胞主要是纹状体胆碱能中间神经元，并且所有这些神经元都表达Tshz3 | NA | 探讨Camk2a-Cre和Tshz3在纹状体胆碱能中间神经元中的功能及其对自闭症谱系障碍的影响 | 老鼠纹状体胆碱能中间神经元中的Camk2a-Cre和Tshz3表达 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年老鼠纹状体中的多个基因 |
| 1628 | 2024-08-08 |
Striatal Control of Movement: A Role for New Neuronal (Sub-) Populations?
2021, Frontiers in human neuroscience
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fnhum.2021.697284
PMID:34354577
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序研究纹状体神经元转录组特征的最新进展，揭示了纹状体神经元的细胞复杂性和其在运动控制中的作用 | 发现纹状体投射神经元具有指示其解剖位置和分区的转录特征，并揭示了额外的独特神经元群体和先前未知的纹状体投射神经元亚群 | NA | 探讨纹状体在运动控制中的作用及其在运动障碍中的功能障碍 | 纹状体神经元及其在运动控制中的作用 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 1629 | 2024-08-08 |
Farnesoid X Receptor Is Required for the Redifferentiation of Bipotential Progenitor Cells During Biliary-Mediated Zebrafish Liver Regeneration
2021-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32076
PMID:34320243
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研究论文 | 本研究探讨了法尼醇X受体（FXR）在胆管介导的斑马鱼肝脏再生中对双潜能祖细胞（BPPCs）再分化的调控作用 | 首次揭示了FXR通过ERK1和Notch分别调控BPPC向肝细胞和胆管上皮细胞的再分化 | NA | 研究FXR在胆管上皮细胞介导的肝脏再生中的作用及其机制 | 斑马鱼模型中的双潜能祖细胞（BPPCs）及其再分化过程 | NA | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、定量实时PCR、荧光原位杂交、抗体染色 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1630 | 2024-08-08 |
Imaging of bone and joints in vivo: pathological osteoclastogenesis in arthritis
2021-11-25, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxab047
PMID:34324641
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综述 | 本文综述了骨免疫学中骨骼与免疫系统之间的相互作用，并介绍了单细胞RNA测序和活体成像等新技术在关节炎骨破坏发病机制研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序和活体成像技术，深入解析了关节炎中骨破坏的细胞相互作用和细胞因子环境 | NA | 探讨骨免疫疾病中骨破坏的发病机制 | 关节炎中的骨和关节 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | NA |
| 1631 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Cancer-Related Features in Lymphangioleiomyomatosis Cells and Tissue
2021-11, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-21-0220
PMID:34312290
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研究论文 | 本研究通过整合基因和蛋白质签名以及单细胞和批量组织转录组数据，探讨了淋巴管平滑肌瘤病（LAM）细胞和组织中的异质性及其与癌症相关特征的关系 | 首次展示了LAM疾病细胞在基因表达谱上的差异，并识别了与激素、代谢、增殖和干细胞特性相关的分子特征 | 研究主要集中在分子和细胞层面，对组织层面的异质性及其与临床表现的关系需要进一步探讨 | 揭示LAM细胞和组织中的分子异质性及其与癌症特征的关联 | LAM细胞和组织 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 转录组分析 | NA | 基因和蛋白质数据 | 涉及LAM患者的肺部病变组织和血液样本 |
| 1632 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and microcircuit computer modeling
2021-10, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2021.06.006
PMID:34325379
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综述 | 本文探讨了将单细胞转录组学与神经微电路计算机模型相结合的系统生物学策略 | 提出了一种新的方法，通过统计反卷积和基因本体论将分子细节与生物物理模型整合，以获得前所未有的机制洞察 | 需要进一步在特定的表型如癫痫或基础生物模型如秀丽隐杆线虫中测试这些整合策略 | 研究如何将单细胞转录组学与神经微电路的计算机模型相结合，以深入理解脑状态间的非线性相互作用 | 单细胞转录组学和神经微电路的计算机模型 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 计算机模型 | 转录组数据 | NA |
| 1633 | 2024-08-08 |
Metabolic regulation of macrophage proliferation and function in atherosclerosis
2021-10-01, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000778
PMID:34334628
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综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性、脂质处理、代谢和增殖的最新见解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了斑块中多种巨噬细胞群体的异质性，并探讨了代谢途径在决定巨噬细胞功能中的关键作用 | NA | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性和功能调控机制 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1634 | 2024-08-08 |
The effect of low-dose IL-2 and Treg adoptive cell therapy in patients with type 1 diabetes
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147474
PMID:34324441
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研究论文 | 本研究探讨了低剂量IL-2与Treg细胞移植疗法在1型糖尿病患者中的效果 | 结合多克隆Tregs和低剂量IL-2，以增强Treg的生存和扩增，并评估其对Treg群体和其他免疫细胞随时间的影响 | 研究仅限于第一阶段，需要进一步的研究来验证长期效果和安全性 | 评估低剂量IL-2与Treg细胞移植疗法在1型糖尿病患者中的安全性和有效性 | 1型糖尿病患者 | NA | 1型糖尿病 | 流式细胞术，时间飞行细胞仪，10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 1635 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of SARS-CoV-2 cell entry factors in the preconceptional human endometrium
2021-09-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab183
PMID:34329437
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNAseq）分析了人类月经周期中子宫内膜的SARS-CoV-2细胞进入因子表达情况，发现感染风险较低。 | 首次在单细胞水平上分析了人类子宫内膜中SARS-CoV-2细胞进入因子的表达情况，揭示了低感染风险。 | 所有样本均用于scRNAseq分析，无法进行蛋白质表达或空间转录组学分析；子宫内膜细胞的感染情况只能在病毒存在的情况下评估。 | 探究SARS-CoV-2细胞进入因子在人类月经周期中子宫内膜的表达情况。 | 人类子宫内膜细胞中的SARS-CoV-2细胞进入因子。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 73,181个人类子宫内膜细胞，来自27名捐赠者 |
| 1636 | 2024-08-08 |
IFN-γ is essential for alveolar macrophage-driven pulmonary inflammation in macrophage activation syndrome
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147593
PMID:34314387
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研究论文 | 本文研究了干扰素-γ在巨噬细胞激活综合征（MAS）中对肺部炎症的作用，特别是在系统性幼年特发性关节炎（SJIA）相关的MAS中。 | 首次在TLR9小鼠模型中机制性地定义了MAS中的肺部炎症，并证实了干扰素-γ驱动的转录变化和MAS特异性巨噬细胞群体的存在。 | NA | 旨在机制性地定义MAS中肺部炎症的潜在新观察。 | 巨噬细胞激活综合征（MAS）中的肺部炎症。 | NA | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1637 | 2024-08-08 |
CellCall: integrating paired ligand-receptor and transcription factor activities for cell-cell communication
2021-09-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab638
PMID:34331449
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研究论文 | 本文开发了CellCall工具，通过整合配对的配体-受体和转录因子（TF）活性来推断细胞间和细胞内通信途径 | CellCall不仅能预测细胞间通信途径，还能分析特定细胞类型间的细胞间对话和内部TF活性 | NA | 旨在开发一种工具，用于基于scRNA-seq数据解码细胞间通信及相关内部调控信号 | 细胞间通信途径和转录因子活性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | scRNA-seq数据 | 人类睾丸细胞和肿瘤免疫微环境的scRNA-seq数据集 |
| 1638 | 2024-08-08 |
Genomic and transcriptomic profiling of hepatoid adenocarcinoma of the stomach
2021-09, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01976-2
PMID:34326469
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research paper | 本文通过全外显子测序、转录组测序和单细胞RNA测序研究胃肝样腺癌的基因组和转录组特征 | 首次提供了胃肝样腺癌的综合基因组图谱，揭示了其起源于多能前体细胞，并具有高干细胞特性和高蛋氨酸循环活性 | NA | 研究胃肝样腺癌的分子特征，以促进其诊断、预后和治疗 | 胃肝样腺癌的基因组和转录组特征 | digital pathology | 胃癌 | 全外显子测序（WES）、转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 58个肿瘤样本及匹配的正常对照来自54名胃肝样腺癌患者，30个胃肝样腺癌肿瘤样本，1个胃肝样腺癌肿瘤的单细胞RNA测序 |
| 1639 | 2024-08-08 |
CRISPR Technique Incorporated with Single-Cell RNA Sequencing for Studying Hepatitis B Infection
2021-08-10, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02227
PMID:34328316
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9技术结合单细胞RNA测序，优化了对乙型肝炎病毒（HBV）感染肝细胞中稀有转录本的检测 | 通过CRISPR-Cas9技术优先富集稀有转录本，显著提高了HBV RNA在单细胞RNA测序中的检测率 | NA | 研究乙型肝炎病毒感染及干扰素治疗对肝细胞基因表达的影响 | 乙型肝炎病毒感染的肝细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | CRISPR-Cas9 | RNA | 7370个细胞 |
| 1640 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 activates lung epithelial cell proinflammatory signaling and leads to immune dysregulation in COVID-19 patients
2021-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103500
PMID:34311326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者肺泡灌洗液样本中的细胞类型和免疫反应 | 发现SARS-CoV-2感染导致肺上皮细胞中ACE2和TMPRSS2表达显著增加，并激活了促炎基因和干扰素/细胞因子信号 | NA | 旨在解析SARS-CoV-2感染的细胞类型、宿主免疫反应及其在COVID-19患者肺部的相互作用 | COVID-19患者的肺泡灌洗液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名健康捐赠者、6名重症COVID-19患者和3名轻症康复患者 |