单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2024-08-08 |
Metabolic regulation of macrophage proliferation and function in atherosclerosis
2021-10-01, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000778
PMID:34334628
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综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性、脂质处理、代谢和增殖的最新见解 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了斑块中多种巨噬细胞群体的异质性，并探讨了代谢途径在决定巨噬细胞功能中的关键作用 | NA | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性和功能调控机制 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1622 | 2024-08-08 |
The effect of low-dose IL-2 and Treg adoptive cell therapy in patients with type 1 diabetes
2021-09-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147474
PMID:34324441
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研究论文 | 本研究探讨了低剂量IL-2与Treg细胞移植疗法在1型糖尿病患者中的效果 | 结合多克隆Tregs和低剂量IL-2，以增强Treg的生存和扩增，并评估其对Treg群体和其他免疫细胞随时间的影响 | 研究仅限于第一阶段，需要进一步的研究来验证长期效果和安全性 | 评估低剂量IL-2与Treg细胞移植疗法在1型糖尿病患者中的安全性和有效性 | 1型糖尿病患者 | NA | 1型糖尿病 | 流式细胞术，时间飞行细胞仪，10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 1623 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of SARS-CoV-2 cell entry factors in the preconceptional human endometrium
2021-09-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab183
PMID:34329437
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNAseq）分析了人类月经周期中子宫内膜的SARS-CoV-2细胞进入因子表达情况，发现感染风险较低。 | 首次在单细胞水平上分析了人类子宫内膜中SARS-CoV-2细胞进入因子的表达情况，揭示了低感染风险。 | 所有样本均用于scRNAseq分析，无法进行蛋白质表达或空间转录组学分析；子宫内膜细胞的感染情况只能在病毒存在的情况下评估。 | 探究SARS-CoV-2细胞进入因子在人类月经周期中子宫内膜的表达情况。 | 人类子宫内膜细胞中的SARS-CoV-2细胞进入因子。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 73,181个人类子宫内膜细胞，来自27名捐赠者 |
| 1624 | 2024-08-08 |
IFN-γ is essential for alveolar macrophage-driven pulmonary inflammation in macrophage activation syndrome
2021-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147593
PMID:34314387
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研究论文 | 本文研究了干扰素-γ在巨噬细胞激活综合征（MAS）中对肺部炎症的作用，特别是在系统性幼年特发性关节炎（SJIA）相关的MAS中。 | 首次在TLR9小鼠模型中机制性地定义了MAS中的肺部炎症，并证实了干扰素-γ驱动的转录变化和MAS特异性巨噬细胞群体的存在。 | NA | 旨在机制性地定义MAS中肺部炎症的潜在新观察。 | 巨噬细胞激活综合征（MAS）中的肺部炎症。 | NA | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1625 | 2024-08-08 |
CellCall: integrating paired ligand-receptor and transcription factor activities for cell-cell communication
2021-09-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab638
PMID:34331449
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研究论文 | 本文开发了CellCall工具，通过整合配对的配体-受体和转录因子（TF）活性来推断细胞间和细胞内通信途径 | CellCall不仅能预测细胞间通信途径，还能分析特定细胞类型间的细胞间对话和内部TF活性 | NA | 旨在开发一种工具，用于基于scRNA-seq数据解码细胞间通信及相关内部调控信号 | 细胞间通信途径和转录因子活性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | scRNA-seq数据 | 人类睾丸细胞和肿瘤免疫微环境的scRNA-seq数据集 |
| 1626 | 2024-08-08 |
Genomic and transcriptomic profiling of hepatoid adenocarcinoma of the stomach
2021-09, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01976-2
PMID:34326469
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research paper | 本文通过全外显子测序、转录组测序和单细胞RNA测序研究胃肝样腺癌的基因组和转录组特征 | 首次提供了胃肝样腺癌的综合基因组图谱，揭示了其起源于多能前体细胞，并具有高干细胞特性和高蛋氨酸循环活性 | NA | 研究胃肝样腺癌的分子特征，以促进其诊断、预后和治疗 | 胃肝样腺癌的基因组和转录组特征 | digital pathology | 胃癌 | 全外显子测序（WES）、转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 58个肿瘤样本及匹配的正常对照来自54名胃肝样腺癌患者，30个胃肝样腺癌肿瘤样本，1个胃肝样腺癌肿瘤的单细胞RNA测序 |
| 1627 | 2024-08-08 |
CRISPR Technique Incorporated with Single-Cell RNA Sequencing for Studying Hepatitis B Infection
2021-08-10, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02227
PMID:34328316
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9技术结合单细胞RNA测序，优化了对乙型肝炎病毒（HBV）感染肝细胞中稀有转录本的检测 | 通过CRISPR-Cas9技术优先富集稀有转录本，显著提高了HBV RNA在单细胞RNA测序中的检测率 | NA | 研究乙型肝炎病毒感染及干扰素治疗对肝细胞基因表达的影响 | 乙型肝炎病毒感染的肝细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | CRISPR-Cas9 | RNA | 7370个细胞 |
| 1628 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 activates lung epithelial cell proinflammatory signaling and leads to immune dysregulation in COVID-19 patients
2021-Aug, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103500
PMID:34311326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者肺泡灌洗液样本中的细胞类型和免疫反应 | 发现SARS-CoV-2感染导致肺上皮细胞中ACE2和TMPRSS2表达显著增加，并激活了促炎基因和干扰素/细胞因子信号 | NA | 旨在解析SARS-CoV-2感染的细胞类型、宿主免疫反应及其在COVID-19患者肺部的相互作用 | COVID-19患者的肺泡灌洗液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10名健康捐赠者、6名重症COVID-19患者和3名轻症康复患者 |
| 1629 | 2024-08-08 |
Molecular architecture of the developing mouse brain
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03775-x
PMID:34321664
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研究论文 | 本文报道了从原肠胚形成到出生期间小鼠胚胎大脑的综合单细胞转录组图谱 | 首次全面描述了小鼠胚胎大脑发育过程中的近八百种细胞状态，揭示了大脑及其包膜的功能元素发育程序 | NA | 系统地表征大脑发育过程中整个时空范围内的细胞状态 | 小鼠胚胎大脑的细胞状态和发育基因的空间表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎大脑 |
| 1630 | 2024-08-08 |
Multimodal single-cell omics analysis identifies epithelium-immune cell interactions and immune vulnerability associated with sex differences in COVID-19
2021-07-30, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00709-x
PMID:34330889
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞组学分析，揭示了COVID-19中与性别差异相关的上皮细胞-免疫细胞相互作用和免疫脆弱性 | 首次通过单细胞RNA测序和细胞间相互作用网络分析，揭示了COVID-19中性别差异的分子机制 | 研究主要集中在鼻腔、支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞，可能未涵盖所有相关组织和细胞类型 | 探讨COVID-19中性别差异的生物学机制 | COVID-19患者的鼻腔、支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个COVID-19患者的鼻腔、支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞样本 |
| 1631 | 2024-08-08 |
CRISPR/Cas9-based genetic screen of SCNT-reprogramming resistant genes identifies critical genes for male germ cell development in mice
2021-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-94851-9
PMID:34326397
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术对未被充分研究的SCNT重编程抗性基因进行遗传筛选，以识别对小鼠雄性生殖细胞发育至关重要的基因。 | 首次通过CRISPR-based遗传筛选方法，针对未被充分研究的SCNT重编程抗性基因，揭示了这些基因在小鼠雄性生殖细胞发育中的关键作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要验证这些发现是否适用于人类生殖医学。 | 识别对小鼠雄性生殖细胞发育至关重要的基因，并探索其在人类生殖医学中的潜在应用。 | 小鼠雄性生殖细胞发育相关的SCNT重编程抗性基因。 | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA-seq | 使用了C57BL/6N小鼠进行遗传筛选，并分析了成年小鼠组织的RT-qPCR数据以及成年小鼠睾丸的单细胞RNA-seq数据。 |
| 1632 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of mosquito hemocytes identifies signatures of immune cell subtypes and cell differentiation
2021-07-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66192
PMID:34318744
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了蚊子的免疫细胞，揭示了免疫细胞亚型的复杂性及其分化过程 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了蚊子免疫细胞的亚型及其分化，并定义了区分这些亚型的标记 | NA | 深入了解蚊子免疫细胞的生物学特性，并为比较无脊椎动物免疫学提供资源 | 蚊子的免疫细胞，特别是血细胞及其亚型和分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1633 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq revealed the kinetic of nasopharyngeal immune responses in asymptomatic COVID-19 carriers
2021-Jul-27, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00294-x
PMID:34315869
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1634 | 2024-08-08 |
Dimensionality reduction by UMAP reinforces sample heterogeneity analysis in bulk transcriptomic data
2021-07-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109442
PMID:34320340
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研究论文 | 本文比较了四种主要降维方法（PCA、MDS、t-SNE和UMAP）在分析71个大型bulk转录组数据集中的应用，发现UMAP在区分批次效应、识别预定义生物组和揭示二维空间中的深入聚类方面优于其他方法 | 首次将UMAP应用于bulk转录组数据分析，并展示了其在增强样本异质性分析方面的优势 | NA | 比较不同降维方法在bulk转录组数据分析中的效果 | bulk转录组数据集 | 生物信息学 | NA | 转录组分析 | UMAP | 转录组数据 | 71个大型bulk转录组数据集 |
| 1635 | 2024-08-08 |
[Gene expression profiles of myopic mouse scleral fibroblasts: a bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing]
2021-Jul-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了近视后小鼠巩膜成纤维细胞基因表达谱的变化及其功能机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析近视小鼠巩膜成纤维细胞的基因表达变化，并深入探讨了炎症、缺氧、蛋白质调控及内质网应激相关基因表达和通路调控的复杂机制 | NA | 研究近视后小鼠巩膜成纤维细胞基因表达谱的变化，并探索其功能障碍的机制 | 小鼠巩膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 6只C57BL/6J小鼠分为对照组和近视模型组，每组6只 |
| 1636 | 2024-08-08 |
Characterizing dedifferentiation of thyroid cancer by integrated analysis
2021-Jul, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf3657
PMID:34321197
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对甲状腺癌的异质性和分化过程进行了深入分析 | 首次在单细胞分辨率下描绘了甲状腺癌的分化过程及其抑制性免疫微环境，并揭示了CREB3L1在甲状腺癌分化相关通路中的潜在驱动作用 | NA | 深入理解甲状腺癌的去分化过程及其对患者预后的影响 | 甲状腺癌的异质性、分化过程及其分子机制 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 46,205个细胞 |
| 1637 | 2024-08-08 |
A single-cell type transcriptomics map of human tissues
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh2169
PMID:34321199
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学分析和空间抗体为基础的蛋白质组学，创建了人类组织的高分辨率单细胞类型图谱 | 本文创新性地推出了一个开放访问图谱，允许研究人员探索192个单细胞类型簇中人类蛋白质编码基因的表达 | NA | 旨在绘制人类体内细胞、组织和器官的基因表达图谱 | 人类组织的单细胞类型转录组 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 192个单细胞类型簇 |
| 1638 | 2024-08-08 |
Direct identification of neoantigen-specific TCRs from tumor specimens by high-throughput single-cell sequencing
2021-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002595
PMID:34321276
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞测序技术，直接从肿瘤样本中识别新抗原特异性T细胞受体（TCR） | 开发了一种新的流程，利用高通量单细胞测序技术从肿瘤样本中分离新抗原特异性TCR序列 | NA | 研究T细胞介导的免疫治疗反应，并开发基于T细胞的肿瘤特异性突变治疗方法 | 新抗原特异性T细胞受体（TCR） | 数字病理学 | 黑色素瘤，结直肠癌 | 高通量单细胞测序 | NA | TCR序列 | 从三个黑色素瘤和三个结直肠癌肿瘤样本中分离出28个新抗原特异性TCR |
| 1639 | 2024-08-08 |
Combining single-cell sequencing to identify key immune genes and construct the prognostic evaluation model for colon cancer patients
2021-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.465
PMID:34323426
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1640 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Atlas of Lymphocyte Adaptive Immune Repertoires and Transcriptomes Reveals Age-Related Differences in Convalescent COVID-19 Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.701085
PMID:34322127
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术分析了康复期COVID-19患者不同年龄组的淋巴细胞适应性免疫库和转录组 | 首次详细描述了不同年龄康复期COVID-19患者T细胞和B细胞的免疫受体库和转录组的组成差异 | NA | 研究康复期COVID-19患者适应性免疫反应的年龄相关差异 | 康复期COVID-19患者的T细胞和B细胞免疫库及转录组 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 多个康复期COVID-19患者样本，包括年轻组（平均年龄31岁）和老年组（平均年龄66.8岁） |