单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-14 |
Single-cell transcriptomics reveals immune response of intestinal cell types to viral infection
2021-07, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209833
PMID:34309190
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和高度多重RNA荧光原位杂交技术，研究了人肠道类器官在人星状病毒感染下的免疫反应 | 开发了一种新框架，结合单细胞RNA测序和高度多重RNA荧光原位杂交技术，揭示了不同肠道上皮细胞系在病毒感染下的独特免疫反应 | NA | 探索人肠道上皮细胞在病毒感染下的个体免疫反应 | 人肠道类器官在人星状病毒感染下的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，高度多重RNA荧光原位杂交 | NA | RNA | NA |
| 142 | 2024-08-13 |
GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profiles
2021-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24489-8
PMID:34234139
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GapClust的轻量级算法，用于从超大规模的单细胞RNA测序数据集中检测稀有细胞类型 | GapClust算法在速度和内存效率上达到了最先进的水平，并且在多样本实验数据集上展示了优于其他近期方法的性能 | NA | 开发一种高效的算法来识别超大规模单细胞RNA测序数据集中的稀有细胞类型 | 稀有细胞类型 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 包括肠和68k PBMC数据集 |
| 143 | 2024-08-13 |
Compensatory hepatic adaptation accompanies permanent absence of intrahepatic biliary network due to YAP1 loss in liver progenitors
2021-07-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109310
PMID:34233187
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研究论文 | 研究探讨了Yes相关蛋白1（YAP1）在肝脏发育中的作用及其对肝细胞适应性的影响 | 首次揭示了YAP1在肝脏发育中的关键作用，并展示了肝细胞在没有胆管网络情况下的深刻适应能力 | NA | 探究YAP1在肝脏发育中的作用及肝细胞的适应性 | YAP1在肝脏发育中的作用及肝细胞的适应性 | NA | NA | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA序列 | NA |
| 144 | 2024-08-13 |
[Progress in Single-cell RNA Sequencing of Lung Adenocarcinoma]
2021-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在肺腺癌研究中的应用和进展 | 单细胞测序作为一种新型测序方法，能够在单细胞水平上对细胞群体进行特定分析，揭示每种细胞类型的独特变化，并提供对异质性基质细胞和癌细胞的准确评估 | 尽管单细胞测序技术有诸多优势，但其在临床应用中仍面临技术挑战和数据解读的复杂性 | 深入理解肺腺癌的发病机制、肿瘤微环境的异质性及药物耐药形成的机制，以发现新的治疗靶点 | 肺腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 145 | 2024-08-13 |
Therapeutic Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.673485
PMID:34163359
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研究论文 | 本文系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征（CRS）相关的炎症细胞因子的转录调控因子，以识别可用于治疗靶点的转录因子（TFs）及其已批准的药物 | 本文通过整合TF-细胞因子基因相互作用资源与单细胞RNA-seq表达数据，发现了与COVID-19患者中上调的16种细胞因子相关的95个TFs，并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs | 需要进一步研究这些候选药物的重新定位，以确定治疗COVID-19患者CRS的有效疗法 | 探索COVID-19中CRS的治疗方法 | COVID-19患者的细胞因子释放综合征 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA | 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 |
| 146 | 2024-08-12 |
A survey of the mouse hindbrain in the fed and fasted states using single-nucleus RNA sequencing
2021-11, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101240
PMID:33962048
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综述 | 本研究利用单核RNA测序技术，详细调查了在进食和禁食状态下小鼠延髓中的最后区（AP）和孤束核（NTS）的细胞 | 首次在延髓水平上进行深入的单细胞转录组学研究，揭示了关键抗肥胖药物受体表达细胞的转录组特征 | NA | 旨在详细描述AP和NTS细胞中关键抗肥胖药物受体的单细胞水平特征 | 小鼠延髓中的最后区（AP）和孤束核（NTS）细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 16,034个细胞，其中8,910个是神经元，7,124个是非神经元细胞 |
| 147 | 2024-08-12 |
Boosting scRNA-seq data clustering by cluster-aware feature weighting
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04033-7
PMID:34078287
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研究论文 | 本文提出了一种名为CaFew的新方法，通过集群感知特征加权来选择基因，以提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类的性能 | CaFew方法通过优化聚类目标函数，获得特征权重矩阵，用于特征选择，从而提高聚类效果 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 8个真实scRNA-seq数据集 |
| 148 | 2024-08-12 |
Neural G0: a quiescent-like state found in neuroepithelial-derived cells and glioma
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209522
PMID:34101353
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类神经干细胞（hNSCs）的细胞周期状态，并构建了一个细胞周期分类器，识别出神经上皮来源细胞类型中的传统细胞周期阶段和一个类似静止状态（Neural G0），该状态在哺乳动物神经发生和胶质瘤中存在。 | 本研究首次识别出神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态（Neural G0），并发现该状态与较不具侵袭性的肿瘤和患者生存期延长相关。 | NA | 研究神经上皮来源细胞和胶质瘤中的细胞周期状态，特别是类似静止状态（Neural G0）。 | 人类神经干细胞（hNSCs）的细胞周期状态，以及神经上皮来源细胞和胶质瘤中的类似静止状态（Neural G0）。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 149 | 2024-08-12 |
EyeDiseases: an integrated resource for dedicating to genetic variants, gene expression and epigenetic factors of human eye diseases
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab050
PMID:34085038
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研究论文 | 开发了一个名为EyeDiseases的数据库，用于整合和解释人类眼病的多组学数据 | 首次开发了一个专门用于整合和解释人类眼病多组学数据的数据库 | NA | 加速发现和验证与各种眼病相关的候选位点和基因，以促进分子诊断和治疗 | 人类眼病的遗传变异、基因表达和表观遗传因子 | 数字病理学 | 眼病 | 多组学技术 | NA | 基因组数据 | 包含1344个与疾病相关的基因、1774个转录文件和105个表观基因组数据 |
| 150 | 2024-08-12 |
Ventricular, atrial, and outflow tract heart progenitors arise from spatially and molecularly distinct regions of the primitive streak
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001200
PMID:33999917
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序结合遗传谱系追踪和活体成像技术，揭示了在小鼠胚胎原条阶段，第一和第二心场（FHF和SHF）被细分为不同的前体细胞池，这些前体细胞在原条中具有不同的起源和分子特征 | 本研究首次在更早的胚胎发育阶段发现了FHF和SHF的细分前体细胞池，并揭示了这些细胞在原条中的不同起源和分子特征 | NA | 探讨心脏前体细胞在原条中的起源和分子特征 | 小鼠胚胎原条中的心脏前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 分子数据 | 小鼠胚胎原条中的多个前体细胞亚群 |
| 151 | 2024-08-12 |
An integrative microenvironment approach for laryngeal carcinoma: the role of immune/methylation/autophagy signatures on disease clinical prognosis and single-cell genotypes
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.58076
PMID:34093817
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研究论文 | 本研究全面探讨了甲基化/自噬相关基因（MARGs）和免疫浸润在肿瘤微环境中对喉癌预后的影响 | 本研究结合单细胞和转录组学分析，探索了肿瘤微环境与预后特征之间的联系，并建立了基于神经网络的深度学习模型 | NA | 探讨甲基化/自噬相关基因和免疫浸润在肿瘤微环境中对喉癌预后的影响 | 喉癌的预后和单细胞基因型 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因数据 | 126个MARGs和10种免疫细胞，以及临床样本和GEO数据集 |
| 152 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptomics reveals the effect of PD-L1/TGF-β blockade on the tumor microenvironment
2021-05-25, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01034-z
PMID:34030676
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了PD-L1和/或TGF-β阻断对肿瘤微环境的影响 | 首次详细描述了PD-L1和/或TGF-β阻断在肿瘤微环境中的转录程序，并发现CCL5作为潜在的生物标志物 | 临床上PD-L1和TGF-β联合阻断的疗效尚未得到证实，且TGF-β抑制剂常引起毒性反应 | 探索增强T细胞浸润和PD-L1/PD-L1疗法疗效的策略 | 肿瘤微环境中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约30,000个单细胞 |
| 153 | 2024-08-11 |
Applications of Single-Cell Sequencing in Dermatology
2021-May-20, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.931862
PMID:34011922
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在皮肤病学领域的应用进展 | 单细胞测序技术能够在单细胞水平上评估基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学信息，揭示疾病的病理机制和药物抵抗性，并能识别新的细胞类型和分化轨迹 | NA | 总结单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | 单细胞测序技术在皮肤病学中的应用 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观遗传学等多组学数据 | NA |
| 154 | 2024-08-11 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了MCF10A细胞在TGF-β1刺激下经历上皮间质转化（EMT）的过程 | 揭示了EMT过程中信号通路的顺序和平行激活，以及过渡细胞状态的存在，并确定了驱动EMT的关键调控信号节点和微小RNA及转录因子的表达 | NA | 探究上皮间质转化（EMT）过程中的信号交叉对话和基因调控网络 | MCF10A细胞在TGF-β1刺激下的EMT过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MCF10A细胞 |
| 155 | 2024-08-11 |
Concurrent X chromosome inactivation and upregulation during non-human primate preimplantation development revealed by single-cell RNA-sequencing
2021-05-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-89175-7
PMID:33953270
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了非人类灵长类动物（绒猴）胚胎植入前发育阶段的X染色体失活和上调现象 | 首次在绒猴胚胎中观察到XIST的上调以及X染色体单等位基因表达的增加，表明X染色体失活的存在 | 研究仅限于绒猴胚胎，未涉及其他非人类灵长类动物或人类胚胎 | 阐明非人类灵长类动物X染色体剂量补偿机制 | 绒猴胚胎植入前发育阶段的X染色体 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个绒猴胚胎 |
| 156 | 2024-08-11 |
Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19
2021-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01329-2
PMID:33879890
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析，探讨了COVID-19患者免疫反应的特征 | 首次对COVID-19患者进行了大规模的单细胞转录组、表面蛋白组及T和B淋巴细胞抗原受体分析，揭示了免疫细胞在疾病中的具体变化 | 研究仅基于横断面队列，未涉及纵向数据分析 | 探究COVID-19患者免疫系统的响应机制及其对疾病发展的影响 | COVID-19患者的免疫细胞及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组、表面蛋白组分析 | NA | 细胞数据 | 130名不同严重程度的COVID-19患者，共780,000个外周血单个核细胞 |
| 157 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the heterogeneous effects of differential expression of tumor PD-L1 on responding TCR-T cells
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55075
PMID:33754038
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研究论文 | 研究分析了肿瘤PD-L1表达差异对TCR-T细胞功能的影响 | 首次深入评估了肿瘤PD-L1表达差异如何影响T细胞功能，并揭示了PD-L1表达增加对不同抑制检查点分子的不同影响 | 研究中肿瘤细胞和T细胞死亡信号富集与肿瘤PD-L1表达增加之间的相关性有限 | 探究肿瘤PD-L1表达差异对TCR-T细胞功能的影响 | TCR-T细胞在不同PD-L1表达水平的肿瘤环境中的反应 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用MART-1特异性TCR-T细胞与表达不同比例PD-L1的MEL-526肿瘤细胞进行实验 |
| 158 | 2024-08-11 |
A Cancer Cell Cluster Marked by LincRNA MEG3 Leads Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Metastasis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.656564
PMID:34055623
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）原发和转移组织的基因表达差异，发现了一个由长链非编码RNA MEG3标记的癌症细胞亚群，该亚群与PDAC的转移密切相关 | 首次揭示了由LincRNA MEG3标记的PDAC癌症细胞亚群在肿瘤转移中的关键作用 | NA | 探索驱动胰腺导管腺癌细胞转移的基因程序和核心调控因子 | 胰腺导管腺癌的原发和转移组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 159 | 2024-08-10 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种常用方法在11个真实数据集上的表现进行了评估 | 本文首次全面评估了从批量RNA测序实践中改编的方法以及专门为单细胞RNA测序设计的方法，并提供了选择适当工具的指导 | 难以通过单一性能标准确定全局最佳表现的方法 | 为单细胞RNA测序中的差异表达分析选择合适的工具提供指导 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 160 | 2024-08-10 |
Transfer learning between preclinical models and human tumors identifies a conserved NK cell activation signature in anti-CTLA-4 responsive tumors
2021-08-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00944-5
PMID:34376232
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研究论文 | 本文通过计算转移学习方法projectR，在鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤中识别出保守的NK细胞激活特征，并探讨了其在转移性黑色素瘤中的临床相关性 | 本文首次应用转移学习方法在临床前模型和人类肿瘤之间识别出保守的NK细胞激活特征，为癌症治疗提供了新的理解 | 目前的方法在临床前模型中识别的治疗机制未能完全转化为人类疾病，限制了转化研究的进展 | 通过转移学习方法识别肿瘤微环境中免疫细胞的保守转录变化，以提高免疫检查点抑制剂的疗效 | 研究对象包括鼠和人的抗CTLA-4反应性肿瘤，以及转移性黑色素瘤中的NK细胞激活特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 转移学习 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及鼠和人的肿瘤样本，具体数量未在摘要中提及 |