单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
141 2024-08-18
Six Shades of Vascular Smooth Muscle Cells Illuminated by KLF4 (Krüppel-Like Factor 4)
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
review 本文综述了血管平滑肌细胞(vSMCs)的六种表型及其在血管疾病中的作用 通过单细胞RNA测序研究,本文首次分类了六种vSMC表型,并探讨了表型转换对血管病理的影响 目前关于vSMC表型的共识尚未形成,研究结果可能受限于当前数据和分类方法 旨在详细描述vSMC的表型并识别表型转换的触发因素,以揭示不同表型在血管疾病中的相关性 血管平滑肌细胞(vSMCs)及其在血管疾病中的表型转换 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
142 2024-08-18
Comprehensive investigations revealed consistent pathophysiological alterations after vaccination with COVID-19 vaccines
2021-Oct-26, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究报告了在接受灭活SARS-CoV-2疫苗接种的健康志愿者中,除了产生中和抗体外,还观察到血红蛋白A1c、血清钠和钾水平、凝血谱和肾功能的一致性改变 通过单细胞mRNA测序揭示了接种疫苗后免疫细胞类型的基因表达变化,以及NF-κB信号通路的增加和I型干扰素反应的减少 研究主要集中在健康志愿者中,对于有预先存在的临床条件的人群的具体影响需要进一步研究 探讨COVID-19疫苗接种后的生理变化,并评估其对特定人群的影响 健康志愿者接种COVID-19疫苗后的生理变化 NA NA 单细胞mRNA测序 NA 基因表达数据 未具体说明样本数量
143 2024-08-18
Large-scale analysis of imprinting in naive human pluripotent stem cells reveals recurrent aberrations and a potential link to FGF signaling
2021-10-12, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本文研究了人类多能干细胞在转化为原始多能状态时基因组印记的异常表达情况,并探讨了其与FGF信号通路的可能关联 首次在大规模样本中分析了原始人类多能干细胞中的印记丢失(LOI)现象,并揭示了不同转化协议导致的LOI程度差异与FGF信号通路的紧密关联 NA 探讨人类多能干细胞在转化为原始多能状态时基因组印记的异常表达及其与FGF信号通路的关联 原始和激活的人类多能干细胞 基因组学 NA RNA测序 NA RNA 大量批量和单细胞RNA测序样本
144 2024-08-18
The Advances of Single-Cell RNA-Seq in Kidney Immunology
2021, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 本文讨论了利用单细胞RNA测序技术在肾脏免疫学中的应用,特别是针对几种特定的肾脏疾病 应用单细胞RNA测序技术成功定义了常驻和浸润免疫细胞的转录组特征,以及免疫细胞与邻近细胞之间的细胞内通信网络 NA 增加对肾脏免疫学的理解,并为肾脏疾病患者开发新的治疗方法 肾脏疾病的免疫细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列 血液、次级淋巴组织、肾活检和尿液样本中的免疫细胞
145 2024-08-18
Discovering Myeloid Cell Heterogeneity in Mandibular Bone - Cell by Cell Analysis
2021, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过流式细胞术和高通量单细胞RNA测序技术,探讨了下颌骨与长骨(股骨)中髓系前体细胞群体的差异 本研究首次揭示了下颌骨骨髓细胞在髓系分化方面的持续缺陷,并发现了下颌骨髓系细胞在转录组层面的独特特征 NA 探索不同解剖位置骨髓中髓系前体细胞群体的差异 下颌骨与长骨(股骨)中的髓系前体细胞 数字病理学 NA 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 细胞 具体样本数量未在摘要中提及
146 2024-08-17
Single-Cell RNA-Seq of T Cells in B-ALL Patients Reveals an Exhausted Subset with Remarkable Heterogeneity
2021-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者和健康个体的外周血T细胞,发现了患者中具有显著异质性的耗竭T细胞亚群 首次揭示了B-ALL患者中耗竭T细胞的异质性及其亚群特征,并探讨了其可能的起源 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示B-ALL患者中T细胞的功能集群,为免疫治疗和临床反应预测提供策略 B-ALL患者和健康个体的外周血T细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA RNA 健康个体和B-ALL患者的T细胞样本
147 2024-08-17
CD177 modulates the function and homeostasis of tumor-infiltrating regulatory T cells
2021-10-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析肾透明细胞癌患者的免疫细胞,发现肿瘤浸润调节T细胞(TI Treg)存在两种不同的转录命运,其中Fate-1与较差的预后相关,并发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达,阻断CD177可减少Treg细胞的抑制活性,为TI Treg特异性免疫治疗提供新靶点 首次发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达,并揭示其对Treg细胞功能和肿瘤生长的影响 研究主要在体外和小鼠模型中进行,需要进一步在临床试验中验证 探索肿瘤浸润调节T细胞的功能和潜在治疗靶点 肾透明细胞癌患者的免疫细胞及肿瘤浸润调节T细胞 免疫学 肾癌 单细胞RNA测序 NA RNA 肾透明细胞癌患者
148 2024-08-17
Escape of hair follicle stem cells causes stem cell exhaustion during aging
2021-10, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究探讨了衰老过程中毛囊干细胞(HF-SCs)耗竭的机制 首次在活体动物中观察到衰老过程中毛囊干细胞的耗竭过程,并揭示了上皮细胞从毛囊干细胞微环境中逃逸的新机制 NA 阐明衰老过程中毛囊干细胞耗竭的机制及其对组织退化的影响 衰老小鼠的毛囊干细胞及其上皮细胞 NA NA 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序(ATAC-seq) NA 细胞 衰老小鼠
149 2024-08-17
Spatial Transcriptomics of Nematodes Identifies Sperm Cells as a Source of Genomic Novelty and Rapid Evolution
2021-01-04, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1
研究论文 本文通过比较两种远缘线虫的空间转录组,揭示了精子细胞中新基因的富集及其在快速进化中的作用 首次在线虫中发现“睾丸外”假说,表明精子相关区域中新基因的富集 NA 探究基因表达的进化和新基因在空间分辨率下的作用 两种远缘线虫Caenorhabditis elegans和Pristionchus pacificus的空间转录组 基因组学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 两种线虫的成年虫体
150 2024-08-16
Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Dec, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本文通过整合生存分析和单细胞细胞间相互作用预测,研究了人胰腺导管腺癌中与预后相关的配体-受体对 首次系统地分析了细胞间相互作用通过配体-受体对与胰腺导管腺癌预后的关联,并识别了潜在的治疗靶点 需要进一步确定这些配体-受体对的临床意义 识别与胰腺导管腺癌患者预后相关的配体-受体对,为治疗提供潜在靶点 胰腺导管腺癌中的细胞间相互作用及其与预后的关联 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及多个癌症队列的基因表达数据
151 2024-08-16
High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells
2021-09-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法,用于固定、通透和分选的单细胞的液滴RNA测序,适用于甲醛固定的细胞。 FD-seq方法在固定和通透处理后能保持RNA完整性和相对基因表达水平,且能检测到比甲醇固定更多的基因和转录本。 NA 开发一种新的高通量单细胞RNA测序方法,以克服现有方法在处理甲醛固定细胞时的限制。 甲醛固定的单细胞,特别是支持人类肿瘤病毒KSHV裂解再激活的稀有细胞亚群和感染人类冠状病毒OC43的细胞。 基因组学 肿瘤病毒感染 RNA测序 NA RNA 文中未具体说明样本数量
152 2024-08-16
Fifty Generations of Amitosis: Tracing Asymmetric Allele Segregation in Polyploid Cells with Single-Cell DNA Sequencing
2021-Sep-17, Microorganisms IF:4.1Q2
研究论文 研究利用单细胞全基因组测序技术,追踪多倍体细胞中不对称等位基因分离的现象,特别是在50次无丝分裂后的情况 首次使用单细胞全基因组测序技术研究无丝分裂对等位基因分离的影响,并通过数学模型验证实验结果 研究依赖于特定生物模型和特定的基因组特征,可能限制了结果的普遍性 探讨无丝分裂在生物医学和进化生物学中的意义 多倍体细胞中的不对称等位基因分离 NA NA 单细胞全基因组测序 数学模型 基因组数据 涉及多个细胞样本,具体数量未明确
153 2024-08-16
Hippocampal glucose uptake as a surrogate of metabolic change of microglia in Alzheimer's disease
2021-Aug-31, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本文研究了阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取之间的关系 发现海马体葡萄糖摄取可以作为评估微胶质细胞介导炎症的可行成像生物标志物 NA 研究阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取的关系 阿尔茨海默病中的微胶质细胞和海马体葡萄糖代谢 数字病理学 阿尔茨海默病 FDG PET, 单细胞RNA测序 NA 图像, 生物标志物 8个月和12个月大的5xFAD小鼠模型, 以及来自阿尔茨海默病神经影像倡议的人脑FDG PET数据
154 2024-08-16
A systematic dissection of human primary osteoblasts in vivo at single-cell resolution
2021-08-24, Aging
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术对从一名31岁男性髋关节置换术后新鲜分离的人类原代成骨细胞进行了系统的细胞分类学剖析 首次在单细胞水平上识别出三种不同的人类原代成骨细胞亚型,包括前成骨细胞、成熟成骨细胞和一个未确定的稀有成骨细胞亚群,并揭示了这些亚型在骨形成、血管生成和造血调节中的潜在生物学功能 研究样本仅来自一名31岁男性,可能限制了结果的普遍性 旨在揭示人类原代成骨细胞的细胞异质性和潜在生物学功能 人类原代成骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 一名31岁男性
155 2024-08-16
Current Methodological Challenges of Single-Cell and Single-Nucleus RNA-Sequencing in Glomerular Diseases
2021-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
综述 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的方法学挑战 介绍了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的应用前景 肾小球细胞的分离困难,依赖于多种因素,如组织材料少、细胞分离协议不统一等 探讨单细胞转录组学实验在肾小球疾病研究中的技术挑战 肾小球疾病 数字病理学 肾小球疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) NA 转录组数据 需要多个样本以识别肾小球细胞
156 2024-08-16
3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes)
2021, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究使用多色荧光杂交技术,首次展示了模式鱼(Medaka)垂体前叶中七种内分泌细胞类型的三维分布图谱 首次在模式鱼Medaka中构建了垂体前叶内分泌细胞的三维分布图谱,并揭示了性二态性和双激素细胞的存在 NA 旨在通过比较和综合了解内分泌细胞类型的空间分布,以更好地理解其生理功能 模式鱼Medaka的垂体前叶内分泌细胞 数字病理学 NA 多色荧光杂交技术,免疫荧光技术,单细胞转录组学分析 NA 图像 成年Medaka鱼
157 2024-08-16
Single-Cell RNA Sequencing Identifies New Inflammation-Promoting Cell Subsets in Asian Patients With Chronic Periodontitis
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织,识别出与炎症促进相关的新细胞亚群 本研究首次识别出HLA-DR表达的血管内皮细胞和CXCL13成纤维细胞,这些细胞与免疫调节高度相关,并揭示了促炎性NLRP3巨噬细胞在牙周炎中的作用 研究样本量较小,仅包括10名牙周炎患者和10名健康志愿者,可能影响结果的普遍性 旨在探究慢性牙周炎中炎症反应的局部微环境,并识别新的炎症促进细胞亚群 慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织 数字病理学 牙周病 单细胞RNA测序 NA 转录组 10名牙周炎患者和10名健康志愿者
158 2024-08-16
A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文研究了一种新型口服精氨酸酶1/2抑制剂OAT-1746,通过改变免疫抑制环境增强PD-1抑制在小鼠实验性胶质瘤中的抗肿瘤效果。 发现OAT-1746能有效穿过血脑屏障,增加脑内精氨酸水平,并与PD-1抑制剂联合使用,显著减少胶质瘤生长并增强抗肿瘤效果。 NA 探索精氨酸酶1/2抑制剂在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤潜力及其与PD-1抑制剂联合使用的疗效。 人及小鼠的胶质瘤细胞、肿瘤浸润性小胶质细胞和单核/巨噬细胞。 数字病理学 脑肿瘤 RNA测序 NA RNA 涉及人及小鼠的胶质瘤样本
159 2024-08-16
Single Cell Transcriptome Helps Better Understanding Crosstalk in Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
综述 本文综述了单细胞转录组学在糖尿病肾病(DKD)中细胞间对话方面的最新进展 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术深入理解DKD在细胞水平上的异质性和遗传易感性 NA 旨在回顾单细胞转录组分析在DKD中的最新进展,特别是肾内或肾外细胞间的对话 糖尿病肾病(DKD)中的细胞间对话、细胞靶点和潜在治疗策略 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组 NA
160 2024-08-15
Loss of Mir146b with aging contributes to inflammation and mitochondrial dysfunction in thioglycollate-elicited peritoneal macrophages
2021-08-23, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究探讨了Mir146b在衰老过程中对腹膜巨噬细胞炎症和线粒体功能障碍的影响 首次通过RNA测序方法发现Mir146b在衰老的腹膜巨噬细胞中表达下降,并揭示了其对巨噬细胞功能的影响 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探究巨噬细胞衰老过程中的分子机制及其对免疫功能的影响 衰老过程中的腹膜巨噬细胞 NA NA RNA测序 NA RNA 小鼠腹膜巨噬细胞
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