单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1521 - 1540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1521 | 2024-08-08 |
NANOS2 suppresses the cell cycle by repressing mTORC1 activators in embryonic male germ cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102890
PMID:34401671
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研究论文 | 本文探讨了NANOS2蛋白在胚胎雄性生殖细胞中通过抑制mTORC1激活因子来抑制细胞周期的机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了NANOS2在野生型和KO小鼠睾丸中每个生殖细胞的细胞周期状态，并识别了NANOS2可能通过后转录方式抑制mTORC1活性的机制 | NANOS2调控细胞周期的详细机制仍不清楚 | 研究NANOS2在胚胎雄性生殖细胞中抑制细胞周期的机制 | NANOS2蛋白及其在胚胎雄性生殖细胞中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和KO小鼠的睾丸生殖细胞 |
| 1522 | 2024-08-08 |
CeTF: an R/Bioconductor package for transcription factor co-expression networks using regulatory impact factors (RIF) and partial correlation and information (PCIT) analysis
2021-Aug-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07918-2
PMID:34416858
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研究论文 | 开发了一个名为CeTF的R/Bioconductor包，用于通过RIF和PCIT分析转录因子共表达网络 | CeTF包整合了PCIT和RIF算法，用于从微阵列、RNA-seq或单细胞RNA-seq数据中识别转录因子 | NA | 识别基因表达数据挖掘中基因-基因相互作用和主要的转录因子 | 转录因子在共表达网络中的作用 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA的胃癌RNA-seq数据 |
| 1523 | 2024-08-08 |
BCL9 regulates CD226 and CD96 checkpoints in CD8+ T cells to improve PD-1 response in cancer
2021-08-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00730-0
PMID:34417435
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研究论文 | 研究通过基因敲除和药物抑制BCL9，发现BCL9抑制可减少肿瘤生长，促进CD8 T细胞浸润，并增强对PD-1抑制剂的反应 | 首次揭示BCL9在调节肿瘤免疫微环境中的作用，特别是对CD226和CD96检查点的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用及其对PD-1反应的影响 | BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用机制及其对CD226和CD96检查点的影响 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠结肠癌模型 |
| 1524 | 2024-08-08 |
Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2021-08-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-021-01392-w
PMID:34412644
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术检测实体瘤中的循环肿瘤细胞 | 通过单细胞测序技术，避免了肿瘤异质性的干扰，提供了理解肿瘤生物过程的新视角 | NA | 探索循环肿瘤细胞的基因组特征及其在肿瘤生物学中的应用 | 循环肿瘤细胞及其在肿瘤类型、转移分析、进展检测和辅助治疗中的应用 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1525 | 2024-08-08 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
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研究论文 | 本文介绍了墨尔本泌尿研究联盟（MURAL）收集的前列腺癌患者来源的异种移植模型（PDXs），旨在通过这些临床前模型加速发现和评估候选治疗方案 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX集合，涵盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱，并展示了肿瘤间的异质性 | NA | 建立一个重要的前列腺癌PDX资源，用于快速系统地评估候选治疗方案 | 前列腺癌的PDX模型及其在临床前研究中的应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 |
| 1526 | 2024-08-08 |
Single-cell evaluation reveals shifts in the tumor-immune niches that shape and maintain aggressive lesions in the breast
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25240-z
PMID:34408137
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和多参数成像技术，在乳腺癌小鼠模型中揭示了肿瘤-免疫微环境的特征，这些特征塑造并维持了乳腺中的侵袭性病变。 | 研究首次揭示了侵袭性肿瘤微环境中基底样细胞群的扩张、肿瘤亚群的特化以及可能作为腔内和基底表型过渡状态的混合谱系肿瘤细胞。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类乳腺癌中的适用性需要进一步验证。 | 旨在区分乳腺病变中的惰性和侵袭性，以指导个性化治疗。 | 研究对象包括乳腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 图像 | 研究涉及小鼠乳腺癌模型 |
| 1527 | 2024-08-08 |
Grafting of iPS cell-derived tenocytes promotes motor function recovery after Achilles tendon rupture
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25328-6
PMID:34408142
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞（iPSC）的技术，用于开发治疗肌腱损伤的新方法 | 首次使用iPSC衍生的肌腱细胞进行移植，促进肌腱损伤后的运动功能恢复 | NA | 开发一种新的治疗肌腱损伤的方法 | iPSC衍生的肌腱细胞及其在肌腱损伤修复中的应用 | 再生医学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 |
| 1528 | 2024-08-08 |
DL4-μbeads induce T cell lineage differentiation from stem cells in a stromal cell-free system
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25245-8
PMID:34408144
|
研究论文 | 本文报道了一种无基质细胞的微珠基方法，支持从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞高效体外分化为人类前T细胞和T系细胞 | DL4-μbeads与淋巴生成细胞因子一起，诱导从CD34细胞到CD34CD7CD5前T细胞再到CD3αβ T细胞的有序分化序列 | NA | 开发一种临床相关且易于扩展的系统，用于从造血干细胞/祖细胞（HSPCs）生成大量T系细胞 | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞分化为人类前T细胞和T系细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞 |
| 1529 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing of immune cells from anticitrullinated peptide antibody positive and negative rheumatoid arthritis
2021-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25246-7
PMID:34404786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞，以揭示不同亚型的免疫发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细比较了ACPA阳性和阴性RA患者的免疫细胞亚群，揭示了不同亚型RA的细胞和分子通路的差异 | NA | 探讨抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的免疫发病机制 | ACPA阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自ACPA阳性和阴性RA患者的外周血或滑膜组织中的CD45造血细胞 |
| 1530 | 2024-08-08 |
Spatially defined single-cell transcriptional profiling characterizes diverse chondrocyte subtypes and nucleus pulposus progenitors in human intervertebral discs
2021-Aug-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00163-z
PMID:34400611
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对来自年轻和成年健康人类椎间盘的三个主要部分（包括髓核、纤维环和软骨终板）的108个细胞进行了转录组图谱分析 | 首次在人类椎间盘中识别出多种软骨细胞亚型和髓核前体细胞，并揭示了细胞间信号网络在髓核微环境中的重要作用 | NA | 深入理解人类椎间盘的细胞异质性和分子机制，为椎间盘退行性变的临床治疗提供新策略 | 人类椎间盘的细胞类型和分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 108个椎间盘细胞 |
| 1531 | 2024-08-08 |
NGF-TrkA signaling dictates neural ingrowth and aberrant osteochondral differentiation after soft tissue trauma
2021-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25143-z
PMID:34400627
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研究论文 | 本文研究了软组织创伤后神经生长因子（NGF）-TrkA信号传导在神经纤维侵入和异常软骨骨化分化中的作用 | 首次揭示了NGF-TrkA信号传导在软组织创伤后异常软骨骨化分化中的作用，并提出了其在治疗中的双重用途 | NA | 探讨软组织创伤后NGF-TrkA信号传导对神经纤维侵入和异常软骨骨化分化的影响 | 小鼠的严重肢体损伤模型 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 病理样本和数据库分析 | NA |
| 1532 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals pre-meiotic X-chromosome dosage compensation in Drosophila testis
2021-08, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009728
PMID:34403408
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 发现X染色体在体细胞和前减数分裂细胞中与常染色体具有相同的转录活性，而在减数分裂和后减数分裂细胞中转录活性较低 | 研究主要集中在果蝇睾丸的单细胞RNA测序数据分析，未涉及其他物种或其他组织类型的研究 | 探讨果蝇睾丸中X染色体剂量补偿的时机和程度 | 果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个Drosophila melanogaster品系的睾丸单细胞RNA测序数据 |
| 1533 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals a critical role of novel pro-inflammatory EndMT in mediating adverse remodeling in coronary artery-on-a-chip
2021-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1694
PMID:34417174
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研究论文 | 研究使用三维微工程人冠状动脉芯片模型，通过单细胞RNA测序揭示了低振荡剪切应力（OSS）诱导的促炎性内皮间质转化（EndMT）在促进不良血管重塑中的关键作用 | 首次揭示了OSS通过Notch1/p38 MAPK-NF-κB信号轴促进促炎性EndMT，并发现IL-37能抑制OSS诱导的促炎性EndMT，从而减轻血管病理生物学反应 | NA | 探究低振荡剪切应力诱导的促动脉粥样硬化变化机制，并评估抗炎方法在缓解血管病理生物学反应中的效果 | 人冠状动脉芯片模型中的内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1534 | 2024-08-08 |
[Clinical importance of screening differential gene set of monocytes based on single-cell sequencing and digital polymerase chain reaction technology for early diagnosis of sepsis]
2021-Jul, Zhonghua wei zhong bing ji jiu yi xue
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研究论文 | 本研究旨在验证脓毒症中特定分化的单核细胞亚群，并通过单细胞测序和数字聚合酶链反应技术筛选和构建用于早期诊断脓毒症的单核细胞差异基因集 | 通过单细胞测序和数字PCR技术筛选出具有可靠诊断价值的单核细胞差异基因集，为早期诊断脓毒症提供新思路 | NA | 验证脓毒症中单核细胞的特定分化亚群，并筛选构建用于早期诊断的差异基因集 | 脓毒症患者的单核细胞及其差异基因集 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序技术，数字聚合酶链反应（PCR）技术 | NA | 基因表达数据 | 从2020年6月至2021年3月，广东省人民医院收治的脓毒症患者中提取外周血单个核细胞（PBMC） |
| 1535 | 2024-08-08 |
Sclerosing Sialadenitis Is Associated With Salivary Gland Hypofunction and a Unique Gene Expression Profile in Sjögren's Syndrome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.699722
PMID:34400910
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研究论文 | 本文开发了一种新方法来量化唾液腺中的纤维化程度，并探讨了纤维化与干燥综合征相关特定症状之间的关系 | 提出了相对间质纤维化面积（RIFA）量化方法，并发现与RIFA显著相关的基因表达模式 | NA | 研究纤维化与干燥综合征症状之间的关系 | 唾液腺纤维化及其对干燥综合征症状的影响 | NA | 干燥综合征 | 微阵列分析，DNase I超敏感位点测序分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20名女性干燥综合征患者 |
| 1536 | 2024-08-08 |
Isoform Age - Splice Isoform Profiling Using Long-Read Technologies
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.711733
PMID:34409069
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综述 | 本文综述了长读长测序技术在解析复杂剪接异构体中的应用及其对RNA调控和蛋白质功能的影响 | 结合长读长测序技术与其他技术如单细胞测序、靶向测序和空间转录组学，能够以前所未有的细节水平分析剪接异构体，并能确定遗传变异对异构体表达的影响 | NA | 探讨长读长测序技术如何解决现有短读长测序技术在解析复杂异构体方面的局限性 | RNA的替代剪接机制及其在疾病中的作用 | 基因组学 | NA | 长读长测序技术 | NA | RNA序列 | NA |
| 1537 | 2024-08-08 |
Interleukin 32 Promotes Foxp3+ Treg Cell Development and CD8+ T Cell Function in Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma Microenvironment
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.704853
PMID:34414188
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境（TME）中的肿瘤浸润免疫细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了白细胞介素32（IL-32）在不同免疫细胞类型中的表达及其作用。 | 首次详细探讨了IL-32在肿瘤微环境中不同免疫细胞亚型中的表达及其对Treg细胞和CD8+ T细胞功能的影响。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的实验验证。 | 探讨IL-32在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中对免疫细胞功能的影响及其潜在的临床应用。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1538 | 2024-08-08 |
Microglia-Specific Expression of HEXA and HEXB Leads to Poor Prognosis in Glioblastoma Patients
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.685893
PMID:34422641
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研究论文 | 本研究探讨了HEXA和HEXB基因在胶质母细胞瘤中的表达及其对患者预后的影响 | 首次揭示了HEXA和HEXB在胶质母细胞瘤患者中的微胶质细胞特异性表达及其对肿瘤进展的作用 | NA | 研究HEXA和HEXB基因在胶质母细胞瘤中的表达及其对患者预后的影响 | 胶质母细胞瘤患者的HEXA和HEXB基因表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 胶质母细胞瘤患者样本 |
| 1539 | 2024-08-08 |
HiPS-Endothelial Cells Acquire Cardiac Endothelial Phenotype in Co-culture With hiPS-Cardiomyocytes
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.715093
PMID:34422835
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research paper | 研究了人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的心肌细胞（hiPS-CMs）和内皮细胞（hiPS-ECs）在单培养和共培养条件下的相互作用 | 首次在人类内皮细胞中展示了EC-CM相互作用的重要性，并通过单细胞RNA测序揭示了共培养条件下基因表达的变化 | NA | 阐明心脏内皮细胞和心肌细胞的器官型发育及细胞间对话 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1540 | 2024-08-08 |
DeepHistoClass: A Novel Strategy for Confident Classification of Immunohistochemistry Images Using Deep Learning
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100140
PMID:34425263
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepHistoClass的新策略，用于使用深度学习对免疫组织化学图像进行可信分类 | 开发了一种多标签分类框架，结合了深度学习模型与新的不确定性度量DeepHistoClass（DHC）置信分数，显著提高了诊断性能 | NA | 提出一种可靠且全面的框架，用于免疫组织化学图像的自动化注释 | 7848张复杂的人类睾丸免疫组织化学图像，对应2794种独特蛋白质 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学 | 混合贝叶斯神经网络 | 图像 | 7848张图像，对应2794种独特蛋白质 |