单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1481 - 1500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2024-08-08 |
An in vitro platform supports generation of human innate lymphoid cells from CD34+ hematopoietic progenitors that recapitulate ex vivo identity
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.019
PMID:34453879
|
研究论文 | 本文开发了一种体外平台，能够从脐带血和骨髓中提取的CD34造血祖细胞生成人类先天淋巴细胞（ILCs），并验证了其在体外生成的ILC亚型的身份。 | 本文首次系统性地探索了人类ILC的生成，并展示了通过特定细胞因子和Notch信号的组合可以生成不同的ILC亚型。 | NA | 开发一种可靠的体外平台，用于生成和研究人类先天淋巴细胞（ILCs）。 | 人类先天淋巴细胞（ILCs）及其亚型。 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达、功能性检测、全局和单细胞转录组分析 | 从脐带血和骨髓中提取的CD34造血祖细胞 |
| 1482 | 2024-08-08 |
Restoring mammary gland structures and functions with autogenous cell therapy
2021-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文通过化学诱导方法将山羊耳成纤维细胞转化为具有泌乳功能的化学诱导乳腺上皮细胞，并研究了其在裸鼠中再生正常乳腺结构的能力 | 首次通过化学诱导方法实现了成纤维细胞直接转化为具有泌乳功能的乳腺上皮细胞，绕过了多能状态 | NA | 探索通过自体细胞疗法恢复乳腺结构和功能的新策略 | 山羊耳成纤维细胞和化学诱导乳腺上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1483 | 2024-08-08 |
Cellular origins and lineage relationships of the intestinal epithelium
2021-10-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00188.2021
PMID:34431400
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研究论文 | 本文描述了肠道上皮细胞的分化和发展轨迹，重点介绍了基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法及其在理解肠道上皮细胞系谱关系中的应用。 | 本文采用了最新的单细胞RNA测序技术，以更精细的方式解析了肠道上皮细胞的发展和系谱关系。 | 文章指出单细胞RNA测序技术虽然提供了详细的细胞类型和系谱信息，但其应用仍受限于技术和数据的解释。 | 研究肠道上皮细胞的起源和系谱关系，以更好地理解其在损伤和疾病中的扰动及治疗潜力。 | 肠道上皮细胞及其在稳态和损伤诱导再生模型中的动态变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1484 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Endothelial Cell Transcriptome Heterogeneity Under Homeostatic Laminar Flow
2021-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316797
PMID:34433297
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和荧光显微镜分析了在稳态层流条件下人内皮细胞的RNA和蛋白质基因表达水平的异质性 | 首次揭示了稳态层流条件下内皮细胞RNA表达水平的整体异质性增加，而选定蛋白质的表达异质性并未紧密跟随RNA异质性的变化 | 研究仅分析了特定基因的RNA和蛋白质表达异质性，未涵盖所有内皮细胞基因 | 探讨内皮细胞在稳态层流条件下的转录组异质性及其对成熟血管功能的影响 | 人内皮细胞在稳态层流条件下的RNA和蛋白质基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1485 | 2024-08-08 |
Suppressive Monocytes Impair MAIT Cells Response via IL-10 in Patients with Severe COVID-19
2021-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100228
PMID:34452933
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术全面分析了健康对照组和COVID-19患者的外周免疫细胞，发现重症COVID-19患者中HLA-DR单核细胞数量显著增加，而黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）数量大幅减少，且功能受损。 | 首次揭示了重症COVID-19患者中通过IFN/IL-10途径，抑制性HLA-DR单核细胞导致MAIT细胞功能障碍的免疫调节模式。 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证结果。 | 探讨重症COVID-19患者中免疫细胞反应的变化及其免疫调节机制。 | COVID-19患者（包括轻症、重症及无症状携带者）和健康对照组的外周免疫细胞。 | NA | COVID-19 | 质谱流式细胞术，单细胞转录组分析 | NA | 免疫细胞 | 23名轻症COVID-19患者，22名重症COVID-19患者，6名无症状COVID-19携带者，44名健康对照者 |
| 1486 | 2024-08-08 |
Foxm1 regulates neural progenitor fate during spinal cord regeneration
2021-09-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050932
PMID:34427977
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研究论文 | 研究通过批量和单细胞RNA测序分析了截肢前后分离的脊髓，揭示了Foxm1转录因子在脊髓再生中的新作用 | 发现了Foxm1在脊髓再生中调控神经前体细胞命运的新角色，而非控制细胞周期长度 | 组织特异性损伤反应的机制仍需进一步研究 | 探究脊髓再生过程中组织特异性反应的分子和细胞机制 | Xenopus蝌蚪的脊髓再生过程 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 截肢前后分离的脊髓样本 |
| 1487 | 2024-08-08 |
Quantitative lineage analysis identifies a hepato-pancreato-biliary progenitor niche
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03844-1
PMID:34433966
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研究论文 | 本文结合计算模型和遗传谱系追踪技术，精确重建了肝胰胆系统的谱系树，并揭示了一个多能祖细胞亚群在胰胆器官原基中的持续存在及其在发育中的作用 | 首次通过计算模型和遗传谱系追踪技术，精确重建了肝胰胆系统的谱系树，并定义了一个支持多能祖细胞亚群的特殊微环境 | 尚未完全阐明导致内胚层祖细胞分隔成肝、胆和胰腺结构的精确谱系层次和事件顺序 | 研究肝胰胆系统发育中的细胞可塑性及其对器官生长的影响 | 肝胰胆系统的祖细胞及其在器官发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 细胞 | NA |
| 1488 | 2024-08-08 |
A novel method for predicting cell abundance based on single-cell RNA-seq data
2021-Aug-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04187-4
PMID:34433409
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研究论文 | 本文提出了一种名为DCap的新方法，用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞丰度 | DCap方法通过非负最小二乘法考虑了批量RNA测序和单细胞RNA测序数据的测量噪声和计算误差，并通过加权迭代最小二乘法进行计算，从而减少了测量误差和不同样本中相同类型细胞表达基因数的差异导致的误差 | NA | 解决细胞类型丰度预测中的反卷积问题，并提供更好的疾病组织中细胞比例变化的研究 | 细胞类型丰度预测方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负最小二乘法 | RNA测序数据 | NA |
| 1489 | 2024-08-08 |
Current Epigenetic Insights in Kidney Development
2021-08-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12081281
PMID:34440455
|
综述 | 本文综述了与肾脏发育相关的表观遗传机制，包括主要基因和信号通路，以及单细胞RNA测序技术在肾脏发育研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和单细胞表观基因组学技术，有助于进一步理解胚胎和成人肾脏发育中早期细胞谱系特化的表观遗传修饰 | NA | 探讨表观遗传机制在肾脏发育中的作用 | 肾脏发育中的表观遗传机制 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1490 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Hepatic Stellate Cells in Fibrogenesis of the Liver: Insights from Single-Cell Transcriptomic Analysis in Liver Injury
2021-08-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10082129
PMID:34440898
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了肝星状细胞（HSC）在肝损伤中的纤维化机制 | 发现了多个HSC亚群，其中一个亚群表达高水平的细胞周期调控基因，并揭示了HSC向肌成纤维细胞转化的动态过程 | NA | 阐明肝星状细胞激活的机制及其在肝损伤中的纤维化过程 | 肝星状细胞及其在肝损伤中的功能异质性 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 使用了LRAT-Cre:Rosa26mT/mG小鼠模型，通过流式细胞仪分离出激活的GFP阳性HSC细胞群，共鉴定出8个HSC亚群 |
| 1491 | 2024-08-08 |
EmptyNN: A neural network based on positive and unlabeled learning to remove cell-free droplets and recover lost cells in scRNA-seq data
2021-Aug-13, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100311
PMID:34430929
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研究论文 | 介绍了一种名为EmptyNN的新型细胞识别算法，该算法基于正未标记学习训练神经网络，用于改进条形码过滤，以区分无细胞和含细胞的液滴 | EmptyNN算法能够准确移除无细胞液滴并恢复丢失的细胞群集，其性能优于当前最先进的细胞识别算法 | NA | 提高基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）的质量控制分析 | 基于液滴的单细胞RNA测序数据中的无细胞和含细胞液滴 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1492 | 2024-08-08 |
Clinical Perspectives of Single-Cell RNA Sequencing
2021-08-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom11081161
PMID:34439827
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在癌症精准医疗中的应用及其临床意义 | 单细胞基因组学能够解决肿瘤内异质性和微环境成分对治疗反应和抵抗的影响 | 单细胞基因组学在临床相关性的探索上仍处于早期阶段，需要进一步创新以广泛应用于临床 | 探索单细胞RNA测序技术在癌症精准医疗中的应用 | 癌症细胞的异质性和微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1493 | 2024-08-08 |
A Systematic Review on the Therapeutic Potentiality of PD-L1-Inhibiting MicroRNAs for Triple-Negative Breast Cancer: Toward Single-Cell Sequencing-Guided Biomimetic Delivery
2021-08-04, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12081206
PMID:34440380
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综述 | 本文是一篇系统综述，旨在探讨PD-L1抑制性微小RNA（miRs）在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗中的潜在应用，特别是基于单细胞测序引导的仿生递送策略。 | 本文提出了基于单细胞测序技术的仿生递送策略，以提高miR递送的特异性、效力和减少传统方法的毒性，为患者提供个性化癌症治疗。 | NA | 旨在全面且无偏见地综合当前关于PD-L1抑制性miRs恢复对TNBC发展和肿瘤微环境影响的证据。 | 研究对象为三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境。 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1494 | 2024-08-08 |
Regulatory Mechanisms of Retinal Photoreceptors Development at Single Cell Resolution
2021-Aug-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168357
PMID:34445064
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综述 | 本文综述了人眼视网膜光感受器细胞的类型，总结了单细胞分辨率下其发育调控机制的最新发现，并展望了该领域的未来发展 | 利用单细胞测序技术研究光感受器发育的新方法 | NA | 探讨视网膜光感受器细胞发育的调控机制 | 视网膜光感受器细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1495 | 2024-08-08 |
miQC: An adaptive probabilistic framework for quality control of single-cell RNA-sequencing data
2021-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009290
PMID:34428202
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研究论文 | 本文提出了一种名为miQC的自适应概率框架，用于单细胞RNA测序数据的质量控制 | miQC通过联合模型同时考虑线粒体DNA编码基因的读取比例和检测到的基因数量，以概率框架预测低质量细胞，相较于传统方法更具数据驱动性 | NA | 开发一种新的数据驱动质量控制方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的低质量细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1496 | 2024-08-08 |
Regulation of CTLA-4 and PD-L1 Expression in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis Patients after Treatment with Fingolimod, IFNβ-1α, Glatiramer Acetate, and Dimethyl Fumarate Drugs
2021-Jul-27, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11080721
PMID:34442365
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研究论文 | 研究评估了多发性硬化症患者在接受不同药物治疗后，外周血单个核细胞中CTLA-4和PD-L1基因表达的变化 | 使用单细胞RNA测序数据评估多发性硬化症患者不同细胞类型中CTLA-4和PD-L1的基因表达 | NA | 研究CTLA-4和PD-L1表达在多发性硬化症治疗中的变化及其对疾病发展的影响 | 多发性硬化症患者的外周血单个核细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1497 | 2024-08-08 |
Dynamic Network Biomarker of Pre-Exhausted CD8+ T Cells Contributed to T Cell Exhaustion in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.691142
PMID:34434188
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研究论文 | 本研究通过动态网络生物标志物（DNB）分析了结直肠癌（CRC）患者中单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的CD8+ T细胞发育轨迹和前耗竭T细胞特征 | 首次使用DNB方法识别出结直肠癌中前耗竭T细胞亚群的生物标志物，并揭示了这些标志物与患者总体生存率的关联 | NA | 探究结直肠癌中T细胞耗竭的机制，并为靶向免疫治疗提供线索 | 结直肠癌患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | 动态网络生物标志物（DNB） | RNA | 来自结直肠癌患者的样本 |
| 1498 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Glioblastoma Reveals a Unique Tumor Microenvironment and Potential Immunotherapeutic Target Against Tumor-Associated Macrophage
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.710695
PMID:34434898
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中独特的肿瘤微环境及针对肿瘤相关巨噬细胞的潜在免疫治疗靶点。 | 首次在单细胞水平上描述了人胶质母细胞瘤的免疫景观，并定义了胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的新分类方案。 | 研究主要集中在肿瘤相关巨噬细胞的激活状态和转录特征，未涉及其他免疫细胞类型。 | 阐明胶质母细胞瘤中免疫细胞的相对比例及其来源和状态，并识别潜在的免疫治疗靶点。 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞及其在不同亚型中的特征。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了16,201个细胞 |
| 1499 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals the Suppressive Role of Retinal Neurons in Microglia Activation Under Diabetes Mellitus
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.680947
PMID:34434927
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了糖尿病视网膜病变中视网膜神经元对小胶质细胞激活的抑制作用 | 首次通过单细胞转录组测序分析了糖尿病视网膜病变早期细胞特异性分子变化及细胞间相互作用网络 | NA | 解析糖尿病视网膜病变早期阶段的细胞和分子机制 | 非人灵长类糖尿病视网膜的六种主要细胞类型 | NA | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 转录组 | 非人灵长类糖尿病视网膜样本 |
| 1500 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645666
PMID:34447367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病（AD）患者和正常对照组的外周血单个核细胞，揭示了AD中免疫细胞亚群的特征性改变 | 首次在单细胞水平上揭示了AD患者外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | NA | 探索阿尔茨海默病中外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | 阿尔茨海默病患者和正常对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组和免疫组库测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 36,849个外周血单个核细胞 |