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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2024-08-08 |
Confronting false discoveries in single-cell differential expression
2021-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25960-2
PMID:34584091
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学中差异表达分析方法的性能及其对生物学重复变异的考虑 | 揭示了不同方法在考虑生物学重复变异方面的差异,并指出了广泛使用的方法在缺乏生物学差异时可能产生大量假阳性的问题 | 文章未明确提及具体的方法局限性 | 旨在阐明单细胞差异表达分析中统计方法的性能和区分原则 | 研究对象为受伤的小鼠脊髓中的差异表达基因 | 单细胞转录组学 | NA | 差异表达分析 | NA | 转录组数据 | 研究未明确提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1422 | 2024-08-08 |
Integration and gene co-expression network analysis of scRNA-seq transcriptomes reveal heterogeneity and key functional genes in human spermatogenesis
2021-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-98267-3
PMID:34580317
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研究论文 | 本研究通过整合多个正常生精过程的scRNA-seq数据集,分析了超过33,000个睾丸细胞的单细胞转录组,以揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集,通过加权基因共表达网络分析揭示了精子发生过程中不同阶段的关键基因,为男性不育提供了新的见解 | NA | 揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 人类精子发生过程中的睾丸细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过33,000个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1423 | 2024-08-08 |
Nuclei Isolation from Adult Mouse Kidney for Single-Nucleus RNA-Sequencing
2021-09-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62901
PMID:34605813
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠肾脏中分离细胞核并进行单核RNA测序的方法 | 该方法避免了传统酶解组织分离方法的局限,如需要新鲜组织、引入转录应激反应以及过度代表肾皮质细胞等问题 | NA | 旨在改进肾脏研究中单细胞转录组学的标准化方法 | 成年小鼠肾脏细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA | 从包含皮质、外髓和内髓的中央小鼠肾脏部分分离的细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 1424 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomes Reveal Characteristics of MicroRNAs in Gene Expression Noise Reduction
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.05.002
PMID:34606979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了微小RNA(miRNA)在减少小鼠细胞mRNA水平基因表达噪声中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析,证明了miRNA在减少基因表达噪声中的作用,并构建了后转录调控的物理模型,通过合成基因电路观察,展示了miRNA目标加速降解与转录激活对抵抗外部波动的贡献 | NA | 探究miRNA在减少基因表达噪声中的作用及其机制 | 小鼠细胞中的miRNA及其目标基因 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | 物理模型 | RNA表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1425 | 2024-08-08 |
Inferring Copy Number from Triple-Negative Breast Cancer Patient Derived Xenograft scRNAseq Data Using scCNA
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1740-3_16
PMID:34590283
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研究论文 | 本文描述了一种从三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中分离单细胞悬液,并使用scRNAseq技术进行单细胞RNA测序,以获取推断的拷贝数变异轮廓的方法 | 本文采用scCNA技术从单细胞RNA测序数据中推断拷贝数变异,有助于深入理解肿瘤内异质性 | NA | 研究旨在通过单细胞分辨率的数据分析,增强对肿瘤内异质性的理解,并识别遗传脆弱性,开发有效疗法 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNAseq | NA | 转录组数据 | 从TNBC患者来源的异种移植模型中分离的单细胞悬液 | NA | NA | NA | NA |
| 1426 | 2024-08-08 |
Immune Cell Landscape of Patients With Diabetic Macular Edema by Single-Cell RNA Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.754933
PMID:34594230
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱 | 首次构建了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱,并证实了外周血中先天免疫失调的存在 | NA | 确定糖尿病黄斑水肿患者外周免疫细胞的表型和功能 | 糖尿病黄斑水肿患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 57,650个外周血单个核细胞(24,919个健康对照,32,731个糖尿病黄斑水肿患者) | NA | NA | NA | NA |
| 1427 | 2024-08-08 |
Characterization of Organ-Specific Regulatory B Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711980
PMID:34594327
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq)技术,对小鼠不同器官(脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔)的B细胞进行分析,以更好地定义这些细胞的表型 | 本研究首次鉴定了19个在调节性B细胞(Breg)中显著表达的共同基因,并分析了这些细胞中的转录因子活性,揭示了七个器官特异性的Breg细胞亚群 | 研究主要集中在小鼠模型上,未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 旨在深入了解调节性B细胞(Breg)在不同器官中的异质性及其功能 | 小鼠不同器官(脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔)的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠器官的B细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1428 | 2024-08-08 |
A Systematic Review of the Tumor-Infiltrating CD8+ T-Cells/PD-L1 Axis in High-Grade Glial Tumors: Toward Personalized Immuno-Oncology
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.734956
PMID:34603316
|
综述 | 本文通过系统综述探讨了高级别胶质瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴的临床意义及其对患者抗癌治疗反应率的影响 | 通过单细胞测序技术分析肿瘤微环境中细胞的抑制性免疫检查点表达模式,为基于数据的免疫检查点抑制剂治疗提供新策略 | 综述主要基于已发表的研究,可能存在样本选择偏倚和研究质量不一的问题 | 旨在阐明肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴在高级别胶质瘤中的临床意义及其对患者治疗反应的影响 | 高级别胶质瘤患者及其肿瘤浸润性CD8+ T细胞和PD-L1表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1429 | 2024-08-08 |
Multiomics Analysis Reveals the Prognostic Non-tumor Cell Landscape in Glioblastoma Niches
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.741325
PMID:34603399
|
研究论文 | 本研究旨在全面描述原发性胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的特征及其预后影响 | 研究首次详细描述了胶质母细胞瘤微环境中非恶性细胞的预后效应,并发现了不同细胞类型在免疫反应中的作用 | NA | 揭示胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的预后效应 | 胶质母细胞瘤微环境中的非肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据 | 967例胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1430 | 2024-08-08 |
Tumor-Infiltrating PD-1hiCD8+-T-Cell Signature as an Effective Biomarker for Immune Checkpoint Inhibitor Therapy Response Across Multiple Cancers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.695006
PMID:34604032
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研究论文 | 本文构建了一种基于PD-1hiCD8+ T细胞转录组特征的生物标志物,用于预测多种癌症对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次利用RNA测序数据量化PD-1hiCD8+ T细胞,并验证其在多种癌症类型中的应用 | NA | 开发一种有效的生物标志物,用于预测患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | PD-1hiCD8+ T细胞在肿瘤浸润免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 581个临床样本和204个鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1431 | 2024-08-08 |
The Dynamic Changes of Transcription Factors During the Development Processes of Human Biparental and Uniparental Embryos
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.709498
PMID:34604214
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地研究了早期胚胎发育过程中转录因子的表达谱,揭示了人类双亲和单亲胚胎发育过程中转录因子的动态变化 | 首次系统地研究了单亲胚胎发育过程中转录因子的作用,并发现了多种特定类型的转录因子 | NA | 研究转录因子在人类双亲和单亲胚胎发育过程中的作用 | 转录因子在早期胚胎发育中的表达和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种类型的胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1432 | 2024-08-08 |
High throughput screening of novel AAV capsids identifies variants for transduction of adult NSCs within the subventricular zone
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.07.001
PMID:34553001
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研究论文 | 本研究通过高通量筛选177种脑室内注射的条形码AAV变体,利用RNA测序技术,鉴定出两种合成 capsid,能有效转导活跃和静止的成年神经干细胞 | 本研究首次鉴定出能高效转导成年神经干细胞的AAV变体,特别是AAV1_P5的进一步优化,实现了30%-60%的神经干细胞标记 | NA | 开发新的遗传修饰方法以重新激活成年神经干细胞的内在脑修复能力 | 成年哺乳动物大脑中的神经干细胞 | 基因治疗 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 177种AAV变体 | NA | NA | NA | NA |
| 1433 | 2024-08-08 |
T cell dysfunction in glioblastoma: a barrier and an opportunity for the development of successful immunotherapies
2021-12-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000988
PMID:34569985
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研究论文 | 本文探讨了胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的问题,并分析了其在中枢神经系统免疫治疗中的挑战与机遇。 | 通过单细胞RNA测序等全面无偏倚技术,揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤浸润T细胞的转录状态,发现其缺乏典型抗原驱动耗竭的特征,提示需要更好的肿瘤衍生抗原展示。 | 需要进一步研究胶质母细胞瘤肿瘤浸润T细胞功能障碍的自然史,确定这些细胞是否源自中枢神经系统驻留T细胞,以及如何进行治疗性操纵。 | 探索胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的机制,并为开发有效的免疫治疗策略提供新思路。 | 胶质母细胞瘤中的T细胞功能障碍及其在中枢神经系统免疫治疗中的作用。 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1434 | 2024-08-08 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性,揭示了Smad4调控的成年期星形胶质细胞生成 | 首次揭示了成年期间脑星形胶质细胞的生成及其调控机制,并发现了Smad4在体内外星形胶质细胞增殖和神经球形成中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性及其调控机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个基因表达簇的星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1435 | 2024-08-08 |
Developmental programming and lineage branching of early human telencephalon
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107277
PMID:34558085
|
研究论文 | 本文通过scRNA-seq和严格验证,揭示了人类端脑神经元在早期发育过程中的发展路线图 | 首次详细描述了人类端脑背侧和腹侧的放射状胶质细胞(RGs)如何通过中间前体细胞(IPCs_div)和早期有丝分裂后神经元(eNBs)分化成不同类型的神经元 | NA | 阐明人类端脑神经元在早期发育过程中的生成机制 | 人类端脑的背侧和腹侧神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1436 | 2024-08-08 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 首次在单细胞分辨率下解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性,揭示了不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 旨在解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 小鼠子宫的接受性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 预接受期和接受期的小鼠子宫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1437 | 2024-08-08 |
Systematic review on the current knowledge and use of single-cell RNA sequencing in head and neck cancer
2021-Nov, APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/apm.13173
PMID:34561896
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综述 | 本文系统回顾了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的应用和知识现状 | scRNA-seq技术能够在单细胞水平上对肿瘤组织进行遗传学特征分析 | 需要进一步的研究来继续发展和应用scRNA-seq技术 | 回顾scRNA-seq在HNSCC中的应用,并探讨其在临床研究中的潜力 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC) | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 共涉及20名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1438 | 2024-08-08 |
The histone acetyltransferase HBO1 promotes efficient tip cell sprouting during angiogenesis
2021-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199581
PMID:34550360
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白乙酰转移酶HBO1在血管生成中促进尖端细胞发芽的作用 | 发现HBO1和H3K14ac的缺失影响了发育中的发芽血管生成和病理性内皮细胞过度生长 | NA | 研究HBO1在血管生成中的作用及其对内皮细胞基因表达的影响 | 内皮细胞(ECs)和其在血管生长与重塑中的动态基因表达变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Hbo1缺陷的视网膜内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1439 | 2024-08-08 |
Mitochondrial respiratory chain function promotes extracellular matrix integrity in cartilage
2021-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2021.101224
PMID:34560099
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析揭示线粒体呼吸链功能对成熟软骨中细胞外基质(ECM)稳态的重要性 | 首次揭示线粒体呼吸链功能与ECM稳态之间的关联,并展示了这种功能障碍对ECM结构和机械稳定性的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探讨线粒体呼吸链功能与软骨中ECM稳态之间的关系 | 软骨组织中的线粒体呼吸链功能和ECM稳态 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),质谱/基质分析,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据 | 涉及1个月大的突变小鼠的股骨头软骨 | NA | NA | NA | NA |
| 1440 | 2024-08-08 |
The transcriptional characteristics of mast cells derived from skin tissue in type 2 diabetes patients at the single-cell level
2021-Oct, Acta histochemica
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.acthis.2021.151789
PMID:34560403
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研究论文 | 本研究旨在探讨2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征 | 首次在单细胞水平上描述了2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞的特征基因 | 样本量较小,仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者 | 探索2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征,为研究异常葡萄糖代谢下的肥大细胞行为提供实验数据 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的皮肤组织中的肥大细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞cDNA文库 | 共8888个细胞,来自两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者的皮肤组织 | NA | NA | NA | NA |