单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-22 |
Loss of ESRP1 blocks mouse oocyte development and leads to female infertility
2021-01-18, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.196931
PMID:33318146
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研究论文 | 研究通过干扰ESRP1控制的pre-mRNA剪接事件，发现ESRP1的缺失导致小鼠卵母细胞发育受阻和雌性不育 | 首次阐明了ESRP1介导的母源mRNA转录本的AS程序，揭示了其在卵母细胞减数分裂和雌性生育中的作用 | NA | 探究ESRP1在卵母细胞发育和雌性生育中的作用 | 小鼠卵母细胞和雌性生育能力 | NA | 雌性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及六个月大的ESRP1敲除小鼠 |
| 122 | 2024-08-21 |
MAB21L1 modulates gene expression and DNA metabolic processes in the lens placode
2021-12-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.049251
PMID:34779479
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研究论文 | 本研究通过电子显微镜和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层早期单细胞水平表型 | 首次揭示了MAB21L1在晶状体基板形成过程中调节晶状体特异性基因表达和DNA/核苷酸代谢过程的作用 | NA | 探究MAB21L1在晶状体基板形成中的作用及其对基因表达和DNA代谢过程的调控 | Mab21l1基因敲除小鼠的晶状体外胚层 | NA | 先天性小脑、眼部、颅面和生殖系统（COFG）综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 131个基因下调，148个基因上调 |
| 123 | 2024-08-21 |
Leukotriene B4 Is a Major Determinant of Leukocyte Recruitment During Otitis Media
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.768815
PMID:35004347
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研究论文 | 本研究探讨了白三烯B4（LTB4）在急性中耳炎（OM）中的作用，通过基因表达分析和LTB4受体抑制剂的使用，观察了LTB4在炎症细胞招募中的关键作用。 | 首次详细研究了LTB4在急性中耳炎中的作用，并证明了LTB4受体拮抗剂在治疗OM中的潜在价值。 | 研究主要集中在LTB4的作用上，未全面探讨其他趋化因子在中耳炎中的作用。 | 研究LTB4在急性中耳炎中的作用及其对炎症反应的影响。 | 中耳感染非类型化流感嗜血杆菌（NTHi）的LTB4相关基因表达和中耳炎症反应。 | NA | 中耳炎 | 基因阵列分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 中耳感染NTHi的样本 |
| 124 | 2024-08-20 |
Cellular heterogeneity of circulating CD4+CD8+ double-positive T cells characterized by single-cell RNA sequencing
2021-12-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-03013-4
PMID:34880348
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴外周血中循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性 | 研究发现循环中的CD4+CD8+双阳性T细胞不仅包含大量幼稚细胞，还包含多种具有潜在功能的异质性细胞群 | 尽管研究揭示了循环CD4+CD8+双阳性T细胞的更多亚型，但这一群体本身非常小 | 研究循环CD4+CD8+双阳性T细胞的组成和特性 | 食蟹猴外周血中的循环CD4+CD8+双阳性T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 食蟹猴的外周血样本 |
| 125 | 2024-08-20 |
Roles of Macrophages in Atherogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.785220
PMID:34899348
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化不同阶段中的作用，并描述了基于巨噬细胞的治疗方法 | 利用单细胞测序技术探讨了病变中巨噬细胞的异质性 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及潜在治疗策略 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其治疗潜力 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-20 |
Aging of the Hematopoietic Stem Cell Niche: New Tools to Answer an Old Question
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738204
PMID:34858399
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综述 | 本文综述了骨髓微环境老化对造血干细胞（HSC）功能的影响，并介绍了用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 文章介绍了跨学科方法开发的新技术工具，如特定的小鼠模型、共培养系统、新的三维成像工具、骨化小体和模拟骨髓系统，以及单细胞测序技术、空间转录组学和人工智能深度学习方法在数据分析和整合中的应用 | NA | 探讨骨髓微环境老化对造血干细胞功能的影响，并介绍用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 造血干细胞（HSC）及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序技术、空间转录组学、人工智能和深度学习 | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-20 |
Single-Cell Sequencing Reveals Differential Cell Types in Skin Tissues of Liaoning Cashmere Goats and Key Genes Related Potentially to the Fineness of Cashmere Fiber
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.726670
PMID:34858469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和计算模型，在辽宁绒山羊的皮肤组织中鉴定了13种皮肤细胞类型，并分析了与绒毛形成相关的细胞簇中的枢纽基因 | 首次在单细胞水平上揭示了辽宁绒山羊皮肤组织中与绒毛细度相关的细胞类型和关键基因 | NA | 探究绒毛细度在细胞水平的调控机制 | 辽宁绒山羊的皮肤组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA |
| 128 | 2024-08-20 |
The Potential Prognostic Role of Oligosaccharide-Binding Fold-Containing Protein 2A (OBFC2A) in Triple-Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.751430
PMID:34868954
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研究论文 | 本研究旨在通过分析乳腺癌蛋白质组和转录组数据集，探讨三阴性乳腺癌（TNBC）的潜在预后标志物 | 发现OBFC2A蛋白在三阴性乳腺癌中具有独立的预后标志物作用，并与其免疫功能相关 | NA | 探讨三阴性乳腺癌的潜在预后标志物 | 三阴性乳腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 来自CPTAC的六种候选蛋白质，以及来自METABRIC的数据集 |
| 129 | 2024-08-19 |
Thymus-Derived CD4+CD8+ Cells Reside in Mediastinal Adipose Tissue and the Aortic Arch
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100208
PMID:34740961
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和三维全装图像技术，发现并证实了在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中存在双阳性CD4CD8αβ细胞（DP细胞），并探讨了这些细胞的转录特征及其在血管稳态中的潜在作用 | 发现了在健康和动脉粥样硬化小鼠模型中，除了胸腺外，纵隔脂肪组织和主动脉外膜中也存在双阳性CD4CD8αβ细胞，这些细胞具有独特的转录特征 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨双阳性CD4CD8αβ细胞在不同组织中的分布及其在血管稳态中的作用 | 双阳性CD4CD8αβ细胞在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中的分布及转录特征 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维全装图像技术 | NA | 细胞 | 健康和动脉粥样硬化小鼠模型 |
| 130 | 2024-08-19 |
Stem/progenitor cells in normal physiology and disease of the pancreas
2021-12-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2021.111459
PMID:34543699
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综述 | 本文综述了胚胎期和成年期胰腺干细胞/祖细胞在稳态和疾病中的研究进展 | 结合最新的测序技术、谱系追踪和类器官技术，探讨了成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在及其在稳态和应激反应中的作用 | 由于实验结果的矛盾性，成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在仍存在争议 | 探讨胰腺干细胞/祖细胞在正常生理和疾病中的作用 | 胚胎期和成年期的胰腺干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 131 | 2024-08-19 |
A transposon expression burst accompanies the activation of Y-chromosome fertility genes during Drosophila spermatogenesis
2021-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27136-4
PMID:34824217
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据，量化了果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达，并开发了一种方法来识别转座子和宿主基因表达模块 | 发现了在果蝇精子发生过程中，转座子表达爆发与Y染色体生育基因激活的关联，并揭示了特定细胞群中转座子表达的特异性 | NA | 研究果蝇睾丸中转座子活动和宿主沉默机制 | 果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 公开数据集中的多个样本 |
| 132 | 2024-08-19 |
Cell type identification from single-cell transcriptomes in melanoma
2021-11-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01118-3
PMID:34784909
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞基因和长非编码RNA表达水平的计算框架，用于从单细胞转录组中识别黑色素瘤中的细胞类型 | 该方法充分考虑了细胞脱落特性，通过定义细胞的脱落特征和脱落簇，构建差异共表达网络并识别差异模块，最终基于这些差异模块识别细胞类型 | NA | 探索黑色素瘤相关的关键细胞类型的分子机制，为黑色素瘤研究提供见解 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 应用该方法于单细胞黑色素瘤数据，识别出八种细胞类型 |
| 133 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential cell cycle activity in key cell populations during nephrogenesis
2021-11-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01790-6
PMID:34789782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了胚胎期14.5天小鼠肾脏发育过程中的基因表达，揭示了关键细胞群体中细胞周期活动的差异 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了肾脏发育过程中“准备”和“自我更新”的肾单位前体细胞亚群之间的细胞周期活动差异，并发现了不成熟远端小管中细胞周期相关基因的增强表达 | NA | 深入理解驱动肾脏发育的分子机制，为设计增强肾脏修复和再生的策略提供依据 | 小鼠胚胎期14.5天的肾脏发育过程 | 数字病理学 | 儿童慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期14.5天的小鼠肾脏样本 |
| 134 | 2024-08-19 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
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研究论文 | 本研究利用已知的肠道病毒（轮状病毒），该病毒损害绒毛顶端的上皮细胞但不直接损害肠道干细胞，探索了肠道上皮在单细胞水平上的再生转录反应 | 发现特定的细胞亚群表现出增加的细胞周期频率，与上皮隐窝的显著扩张相关，并伴随着未成熟肠细胞数量的增加。意外地发现轮状病毒感染了簇状细胞，并通过干扰素相关途径响应病毒感染 | NA | 理解上皮修复和再生在损伤后的机制，以开发促进快速愈合和恢复正常肠道功能的疗法 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 消化疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 135 | 2024-08-19 |
Mechanisms of vascular smooth muscle cell investment and phenotypic diversification in vascular diseases
2021-11-01, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210138
PMID:34495326
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞在血管疾病中的投入机制及其表型多样化的研究进展 | 结合克隆系谱追踪和单细胞转录组学技术，揭示了血管病变中血管平滑肌细胞来源细胞的显著多样性 | NA | 探讨血管平滑肌细胞在病理血管重塑中的调控机制，并讨论开发治疗策略的可能性 | 血管平滑肌细胞及其在血管疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 克隆系谱追踪、单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 136 | 2024-08-19 |
Conventional type I dendritic cells maintain a reservoir of proliferative tumor-antigen specific TCF-1+ CD8+ T cells in tumor-draining lymph nodes
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.026
PMID:34534439
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研究论文 | 研究探讨了在肺腺癌自发性模型中，常规I型树突状细胞如何在肿瘤引流淋巴结中维持肿瘤抗原特异性TCF-1+ CD8+ T细胞的增殖库 | 发现常规I型树突状细胞在肿瘤引流淋巴结中维持TCF-1 CD8 T细胞库，通过Flt3L+anti-CD40治疗恢复SlamF6 T细胞频率并减轻肿瘤负担 | 研究仅限于肺腺癌的自发性模型，可能需要进一步验证在其他类型肿瘤中的适用性 | 探究在肿瘤环境中，TCF-1 CD8 T细胞的维持机制及其对免疫检查点阻断反应的影响 | 肿瘤抗原特异性TCF-1 CD8 T细胞及其在肿瘤引流淋巴结中的动态变化 | 免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 涉及肿瘤抗原特异性TCF-1 CD8 T细胞的多个样本 |
| 137 | 2024-08-19 |
Implications of Intratumor Heterogeneity on Consensus Molecular Subtype (CMS) in Colorectal Cancer
2021-Sep-30, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13194923
PMID:34638407
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建算法，用于确定结直肠癌中单细胞共识分子亚型（CMS）的分类，并探讨其在肿瘤和非肿瘤细胞中的分布 | 开发了一种单细胞CMS分配算法，能够重现所有四种CMS的内在生物学特性 | 研究样本量较小，仅包括10个单细胞RNA测序数据集和3232个批量RNA测序数据集 | 探讨肿瘤内异质性对结直肠癌共识分子亚型（CMS）的影响 | 结直肠癌的共识分子亚型（CMS）及其在单细胞水平上的分布 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNASeq） | 算法 | RNA测序数据 | 3232个批量RNA测序数据集和10个单细胞RNA测序数据集 |
| 138 | 2024-08-19 |
Skeleton-vasculature chain reaction: a novel insight into the mystery of homeostasis
2021-Mar-22, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00138-0
PMID:33753717
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综述 | 本文综述了骨和血管之间的内分泌调节回路的新颖性和重要性，并总结了与骨血管相关的研究进展、血管相关骨骼疾病、病理条件及针对血管生成的治疗策略 | 探讨了骨和血管作为内分泌器官的新认识，以及单细胞测序等新技术在揭示这两种组织细胞多样性和可塑性方面的应用 | NA | 阐述骨和血管之间内分泌调节回路的新颖性和重要性，并探讨未来的研究方向 | 骨和血管的内分泌调节机制及其在疾病治疗中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-19 |
The Single-Cell Transcriptomic Analysis of Prefrontal Pyramidal Cells and Interneurons Reveals the Neuronal Expression of Genes Encoding Antimicrobial Peptides and Immune Proteins
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.749433
PMID:34759929
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了前额叶锥体细胞和中间神经元中编码抗菌肽和免疫蛋白的基因表达 | 首次报道了皮质神经元中某些抗菌和免疫相关蛋白的转录表达 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠前额叶皮质细胞 | 探讨神经元与免疫细胞之间直接通讯的分子基础 | 前额叶锥体细胞和中间神经元的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 84个细胞 |
| 140 | 2024-08-19 |
BPI overexpression suppresses Treg differentiation and induces exosome-mediated inflammation in systemic lupus erythematosus
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63743
PMID:34815797
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质，并利用转基因小鼠模型探讨了细菌通透性增加蛋白（BPI）在SLE中的潜在致病作用。 | 首次揭示了BPI在SLE中的过度表达抑制Treg分化并诱导外泌体介导的炎症反应，为SLE的病理机制提供了新的见解。 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能与人类SLE的实际情况存在差异。 | 探讨BPI在系统性红斑狼疮中的致病作用及其对Treg分化的影响。 | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 蛋白质组学、免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 蛋白质、RNA | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体，转基因小鼠模型 |