单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-17 |
Spatial Transcriptomics of Nematodes Identifies Sperm Cells as a Source of Genomic Novelty and Rapid Evolution
2021-01-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa207
PMID:32785688
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研究论文 | 本文通过比较两种远缘线虫的空间转录组，揭示了精子细胞中新基因的富集及其在快速进化中的作用 | 首次在线虫中发现“睾丸外”假说，表明精子相关区域中新基因的富集 | NA | 探究基因表达的进化和新基因在空间分辨率下的作用 | 两种远缘线虫Caenorhabditis elegans和Pristionchus pacificus的空间转录组 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两种线虫的成年虫体 |
| 122 | 2024-08-16 |
Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2021.101126
PMID:34522794
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研究论文 | 本文通过整合生存分析和单细胞细胞间相互作用预测，研究了人胰腺导管腺癌中与预后相关的配体-受体对 | 首次系统地分析了细胞间相互作用通过配体-受体对与胰腺导管腺癌预后的关联，并识别了潜在的治疗靶点 | 需要进一步确定这些配体-受体对的临床意义 | 识别与胰腺导管腺癌患者预后相关的配体-受体对，为治疗提供潜在靶点 | 胰腺导管腺癌中的细胞间相互作用及其与预后的关联 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个癌症队列的基因表达数据 |
| 123 | 2024-08-16 |
High-throughput RNA sequencing of paraformaldehyde-fixed single cells
2021-09-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25871-2
PMID:34561439
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FD-seq的高通量方法，用于固定、通透和分选的单细胞的液滴RNA测序，适用于甲醛固定的细胞。 | FD-seq方法在固定和通透处理后能保持RNA完整性和相对基因表达水平，且能检测到比甲醇固定更多的基因和转录本。 | NA | 开发一种新的高通量单细胞RNA测序方法，以克服现有方法在处理甲醛固定细胞时的限制。 | 甲醛固定的单细胞，特别是支持人类肿瘤病毒KSHV裂解再激活的稀有细胞亚群和感染人类冠状病毒OC43的细胞。 | 基因组学 | 肿瘤病毒感染 | RNA测序 | NA | RNA | 文中未具体说明样本数量 |
| 124 | 2024-08-16 |
Fifty Generations of Amitosis: Tracing Asymmetric Allele Segregation in Polyploid Cells with Single-Cell DNA Sequencing
2021-Sep-17, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms9091979
PMID:34576874
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研究论文 | 研究利用单细胞全基因组测序技术，追踪多倍体细胞中不对称等位基因分离的现象，特别是在50次无丝分裂后的情况 | 首次使用单细胞全基因组测序技术研究无丝分裂对等位基因分离的影响，并通过数学模型验证实验结果 | 研究依赖于特定生物模型和特定的基因组特征，可能限制了结果的普遍性 | 探讨无丝分裂在生物医学和进化生物学中的意义 | 多倍体细胞中的不对称等位基因分离 | NA | NA | 单细胞全基因组测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 涉及多个细胞样本，具体数量未明确 |
| 125 | 2024-08-16 |
Hippocampal glucose uptake as a surrogate of metabolic change of microglia in Alzheimer's disease
2021-Aug-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-021-02244-6
PMID:34465358
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取之间的关系 | 发现海马体葡萄糖摄取可以作为评估微胶质细胞介导炎症的可行成像生物标志物 | NA | 研究阿尔茨海默病中微胶质细胞代谢变化与海马体葡萄糖摄取的关系 | 阿尔茨海默病中的微胶质细胞和海马体葡萄糖代谢 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | FDG PET, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 生物标志物 | 8个月和12个月大的5xFAD小鼠模型, 以及来自阿尔茨海默病神经影像倡议的人脑FDG PET数据 |
| 126 | 2024-08-16 |
A systematic dissection of human primary osteoblasts in vivo at single-cell resolution
2021-08-24, Aging
DOI:10.18632/aging.203452
PMID:34428745
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对从一名31岁男性髋关节置换术后新鲜分离的人类原代成骨细胞进行了系统的细胞分类学剖析 | 首次在单细胞水平上识别出三种不同的人类原代成骨细胞亚型，包括前成骨细胞、成熟成骨细胞和一个未确定的稀有成骨细胞亚群，并揭示了这些亚型在骨形成、血管生成和造血调节中的潜在生物学功能 | 研究样本仅来自一名31岁男性，可能限制了结果的普遍性 | 旨在揭示人类原代成骨细胞的细胞异质性和潜在生物学功能 | 人类原代成骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 一名31岁男性 |
| 127 | 2024-08-16 |
Current Methodological Challenges of Single-Cell and Single-Nucleus RNA-Sequencing in Glomerular Diseases
2021-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2021020157
PMID:34140401
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的方法学挑战 | 介绍了单细胞和单核RNA测序技术在肾小球疾病研究中的应用前景 | 肾小球细胞的分离困难，依赖于多种因素，如组织材料少、细胞分离协议不统一等 | 探讨单细胞转录组学实验在肾小球疾病研究中的技术挑战 | 肾小球疾病 | 数字病理学 | 肾小球疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 需要多个样本以识别肾小球细胞 |
| 128 | 2024-08-16 |
3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes)
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.719843
PMID:34497587
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研究论文 | 本研究使用多色荧光杂交技术，首次展示了模式鱼（Medaka）垂体前叶中七种内分泌细胞类型的三维分布图谱 | 首次在模式鱼Medaka中构建了垂体前叶内分泌细胞的三维分布图谱，并揭示了性二态性和双激素细胞的存在 | NA | 旨在通过比较和综合了解内分泌细胞类型的空间分布，以更好地理解其生理功能 | 模式鱼Medaka的垂体前叶内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 多色荧光杂交技术，免疫荧光技术，单细胞转录组学分析 | NA | 图像 | 成年Medaka鱼 |
| 129 | 2024-08-16 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies New Inflammation-Promoting Cell Subsets in Asian Patients With Chronic Periodontitis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711337
PMID:34566966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织，识别出与炎症促进相关的新细胞亚群 | 本研究首次识别出HLA-DR表达的血管内皮细胞和CXCL13成纤维细胞，这些细胞与免疫调节高度相关，并揭示了促炎性NLRP3巨噬细胞在牙周炎中的作用 | 研究样本量较小，仅包括10名牙周炎患者和10名健康志愿者，可能影响结果的普遍性 | 旨在探究慢性牙周炎中炎症反应的局部微环境，并识别新的炎症促进细胞亚群 | 慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10名牙周炎患者和10名健康志愿者 |
| 130 | 2024-08-16 |
A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.703465
PMID:34504786
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研究论文 | 本文研究了一种新型口服精氨酸酶1/2抑制剂OAT-1746，通过改变免疫抑制环境增强PD-1抑制在小鼠实验性胶质瘤中的抗肿瘤效果。 | 发现OAT-1746能有效穿过血脑屏障，增加脑内精氨酸水平，并与PD-1抑制剂联合使用，显著减少胶质瘤生长并增强抗肿瘤效果。 | NA | 探索精氨酸酶1/2抑制剂在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤潜力及其与PD-1抑制剂联合使用的疗效。 | 人及小鼠的胶质瘤细胞、肿瘤浸润性小胶质细胞和单核/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人及小鼠的胶质瘤样本 |
| 131 | 2024-08-16 |
Single Cell Transcriptome Helps Better Understanding Crosstalk in Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.657614
PMID:34485320
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在糖尿病肾病（DKD）中细胞间对话方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术深入理解DKD在细胞水平上的异质性和遗传易感性 | NA | 旨在回顾单细胞转录组分析在DKD中的最新进展，特别是肾内或肾外细胞间的对话 | 糖尿病肾病（DKD）中的细胞间对话、细胞靶点和潜在治疗策略 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 132 | 2024-08-15 |
Loss of Mir146b with aging contributes to inflammation and mitochondrial dysfunction in thioglycollate-elicited peritoneal macrophages
2021-08-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66703
PMID:34423778
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研究论文 | 研究探讨了Mir146b在衰老过程中对腹膜巨噬细胞炎症和线粒体功能障碍的影响 | 首次通过RNA测序方法发现Mir146b在衰老的腹膜巨噬细胞中表达下降，并揭示了其对巨噬细胞功能的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究巨噬细胞衰老过程中的分子机制及其对免疫功能的影响 | 衰老过程中的腹膜巨噬细胞 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠腹膜巨噬细胞 |
| 133 | 2024-08-15 |
CD11b+ lung dendritic cells at different stages of maturation induce Th17 or Th2 differentiation
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25307-x
PMID:34413303
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研究论文 | 研究报道了在不同成熟阶段的小鼠肺部CD11b+树突状细胞（DC）如何诱导Th17或Th2分化 | 首次揭示了肺部cDC2在不同成熟阶段对Th17和Th2分化的影响，并通过单细胞RNA测序分析了其发展过程 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨肺部树突状细胞在不同成熟阶段对T细胞分化的影响 | 小鼠肺部的CD11b+树突状细胞及其在Th17和Th2分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠肺部的多个树突状细胞亚群 |
| 134 | 2024-08-15 |
CoCoA-diff: counterfactual inference for single-cell gene expression analysis
2021-08-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02438-4
PMID:34404460
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研究论文 | 本文介绍了一种因果推断框架CoCoA-diff，用于在单细胞RNA-seq数据中优先考虑疾病基因，无需事先了解控制变量即可调整混杂因素 | CoCoA-diff方法在模拟和真实世界数据分析中显著提高了统计能力，并识别了215个在不同细胞类型中差异调节的因果基因 | NA | 寻找基因组医学中的因果基因 | 单细胞RNA-seq数据中的疾病基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 因果推断框架 | 基因表达数据 | 70,000个脑细胞 |
| 135 | 2024-08-15 |
Exploring the Biological Activity and Mechanism of Xenoestrogens and Phytoestrogens in Cancers: Emerging Methods and Concepts
2021-Aug-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168798
PMID:34445499
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综述 | 本文综述了外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制，以及新兴的研究方法和概念 | 介绍了患者来源的异种移植（PDX）模型和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的新应用，以及敏感期（WOS）这一新兴概念 | NA | 探讨外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的作用及其机制，以及如何利用这些知识开发预防和治疗癌症的新方法 | 外源性雌激素和植物雌激素在癌症中的生物活性和机制 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 患者来源的异种移植（PDX）模型 | RNA | 18项临床试验 |
| 136 | 2024-08-15 |
Defining the variety of cell types in developing and adult human kidneys by single-cell RNA sequencing
2021-Aug-11, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-021-00156-w
PMID:34381054
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了发育中和成人人类肾脏中的细胞类型多样性 | 本文通过比较单细胞RNA测序时代前后的文献，发现了新的细胞类型和中间细胞阶段，以及复杂的分子特征和谱系途径 | 单细胞RNA测序技术存在局限性，导致细胞类型多样性在文献中仍然存在差异 | 确定人类肾脏中细胞类型的数量 | 发育中和成人人类肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人肾脏中鉴定出41种肾源性细胞群和32种非肾源性细胞群 |
| 137 | 2024-08-15 |
RNA velocity-current challenges and future perspectives
2021-08, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110282
PMID:34435732
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综述 | 本文回顾了RNA速度建模方法的现状，讨论了其局限性和潜在缺陷，并提供了应对挑战的指导 | 提出了将RNA速度概念推广到更广泛的生物系统和模式的未来方向 | 讨论了RNA速度方法的局限性和潜在陷阱 | 探讨RNA速度方法的现状及未来发展方向 | RNA速度建模方法及其在生物系统中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 138 | 2024-08-15 |
N6-Methyladenosine Regulators and Related LncRNAs Are Potential to be Prognostic Markers for Uveal Melanoma and Indicators of Tumor Microenvironment Remodeling
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.704543
PMID:34395276
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（mA）调节因子和相关长链非编码RNA（lncRNA）在葡萄膜黑色素瘤（UM）中的预后标志物作用及其对肿瘤微环境（TME）重塑的影响 | 首次系统地识别了mA调节因子，并构建了基于mA调节因子的预后风险签名，通过单细胞测序数据验证了其在UM中的表达分布 | NA | 探索mA调节因子和相关lncRNA在UM中的预后标志物作用及对TME的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | LASSO Cox分析 | 转录组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的转录组和临床数据，以及GSE139829数据集的单细胞测序数据 |
| 139 | 2024-08-14 |
A Transcriptionally Distinct Subpopulation of Healthy Acinar Cells Exhibit Features of Pancreatic Progenitors and PDAC
2021-08-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0427
PMID:34049974
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研究论文 | 本研究重新分析了多个胰腺和胰腺导管腺癌（PDAC）的单细胞RNA测序数据集，发现了一组非恶性腺泡细胞亚群，称为腺泡边缘（AE）细胞，其转录组与典型腺泡细胞有显著差异 | 发现了在健康胰腺组织中随年龄增长的AE-like细胞亚群，这些细胞显示出胰腺祖细胞和癌前状态的特征，且这一现象在多个器官中普遍存在 | NA | 探讨胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤起源细胞的特征及其与健康细胞亚群的关系 | 胰腺和胰腺导管腺癌的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胰腺和PDAC样本 |
| 140 | 2024-08-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals ex vivo signatures of SARS-CoV-2-reactive T cells through 'reverse phenotyping'
2021-07-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24730-4
PMID:34312385
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过'反向表型'方法识别并分析了COVID-19患者中SARS-CoV-2反应性T细胞的特征 | 首次采用'反向表型'方法，利用T细胞受体序列作为条形码，识别SARS-CoV-2反应性T细胞，并揭示了抗原特异性刺激引入的表型效应 | NA | 揭示SARS-CoV-2抗原反应性T细胞在体内的表型特征 | COVID-19患者的SARS-CoV-2反应性T细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 独立队列中的严重疾病患者呼吸道的T细胞 |