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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2024-08-08 |
[An optimized protocol of meniscus cell extraction for single-cell RNA sequencing]
2021-Aug-31, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本文优化了半月板细胞提取协议,以提高细胞悬液制备效率并保持高细胞活力,用于单细胞RNA测序。 | 提出了一个优化的半月板细胞提取协议,相比常规方法能获得更多细胞且细胞活力更高。 | NA | 优化半月板细胞提取协议,以提高单细胞RNA测序的效率和细胞活力。 | 半月板细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 超过1×10^5个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1362 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Approaches for Tracing T Cell Development
2021-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100408
PMID:34644259
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在追踪T细胞发育中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的分辨率,以分析细胞身份及其基因表达程序 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何提供对T细胞发育的深入见解 | T细胞发育过程中的细胞身份和基因表达程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1363 | 2024-08-08 |
[Research progress in the identification and lineage differentiation of skeletal stem cell]
2021-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文综述了骨骼干细胞(SSC)的鉴定、时空分布和功能特性的研究进展 | 讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在骨骼干细胞鉴定和功能研究中的应用 | NA | 阐明骨骼干细胞的特性,为干细胞治疗提供新的见解 | 骨骼干细胞的鉴定、时空分布和功能特性 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1364 | 2024-08-08 |
Full-Length Transcriptome: A Reliable Alternative for Single-Cell RNA-Seq Analysis in the Spleen of Teleost Without Reference Genome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.737332
PMID:34646272
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研究论文 | 本文提出了一种使用全长转录组作为参考的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析方法,并在没有已知基因组的硬骨鱼样本中进行了评估 | 本文提出的方法不依赖于参考基因组,适用于没有参考基因组的鱼类研究,为scRNA-seq数据分析提供了一种可靠的替代方案 | NA | 旨在开发和评估一种新的scRNA-seq数据分析方法,以在没有参考基因组的硬骨鱼中识别和表征免疫细胞亚群 | 硬骨鱼的脾脏中的免疫细胞亚群 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1365 | 2024-08-08 |
SCMAG: A Semisupervised Single-Cell Clustering Method Based on Matrix Aggregation Graph Convolutional Neural Network
2021, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2021/6842752
PMID:34646337
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研究论文 | 本文提出了一种基于矩阵聚合图卷积神经网络的半监督单细胞聚类方法SCMAG | SCMAG充分利用了单细胞数据的先验信息,提高了聚类算法的准确性 | NA | 旨在提高单细胞数据聚类分析的准确性 | 单细胞数据 | 机器学习 | NA | 图卷积神经网络 | 图卷积神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 不同单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1366 | 2024-08-08 |
Tryptophan metabolism is inversely regulated in the tumor and blood of patients with glioblastoma
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.60679
PMID:34646367
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤患者肿瘤和血液中色氨酸代谢的反向调控,并开发了新的技术来支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体激活的治疗 | 开发了结合LC-MS/MS与化学同位素标记的方法,用于同时定量比较色氨酸及其代谢物,并应用MALDI MSI和scRNA-seq技术分析色氨酸代谢和芳香烃受体活性 | NA | 更好地理解色氨酸代谢,支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体的治疗 | 胶质母细胞瘤患者的色氨酸代谢 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | LC-MS/MS, MALDI MSI, scRNA-seq | 人工神经网络 | 血液样本, 肿瘤组织 | 43名复发性胶质母细胞瘤患者和43名年龄性别匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 1367 | 2024-08-08 |
Tumor microenvironment-based screening repurposes drugs targeting cancer stem cells and cancer-associated fibroblasts
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.62676
PMID:34646392
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研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤微环境(TME)的筛选方法,以识别能够特异性靶向癌症干细胞(CSCs)和癌症相关成纤维细胞(CAFs)的药物 | 开发了一种基于肿瘤微环境的高通量药物筛选平台,并利用单细胞RNA测序技术评估药物在CSCs和CAFs中的作用机制 | NA | 建立基于肿瘤微环境的药物筛选平台,以加速药物开发和治疗应用 | 肺癌患者来源的癌细胞和CAFs,以及CSCs和CAFs | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1,524种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 1368 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Sequencing Reveals a Murine Gallbladder Cell Transcriptome Atlas During the Process of Cholesterol Gallstone Formation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.714271
PMID:34650971
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的转录组图谱 | 首次展示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的细胞异质性和转录组动态变化 | NA | 揭示胆固醇结石形成过程中胆囊细胞的变化,增进对疾病发病机制和治疗的理解 | 小鼠胆囊细胞在胆固醇结石形成过程中的转录组变化 | 数字病理学 | 胆石症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1369 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Peripheral Blood Reveals a Novel B-Cell Subset in Renal Allograft Recipients With Accommodation
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.706580
PMID:34658852
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析肾移植受者的外周血细胞,揭示了免疫抑制剂对免疫细胞亚群的新机制 | 发现了一个新的B细胞亚群(CD19IGLC3IGKCTCL1ACD127),该亚群在肾移植受者中显著减少,并显示出激活潜力 | 样本量较小,仅包括三名个体 | 描述肾移植受者免疫耐受的细节,并揭示免疫抑制剂对免疫细胞亚群的影响机制 | 肾移植受者的外周T细胞、B细胞、髓系细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 总共8,272个细胞,来自三名个体,包括2,758个健康对照细胞,2,550个ESRD患者细胞和2,964个肾移植患者细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1370 | 2024-08-08 |
Expansion of Human Papillomavirus-Specific T Cells in Periphery and Cervix in a Therapeutic Vaccine Recipient Whose Cervical High-Grade Squamous Intraepithelial Lesion Regressed
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645299
PMID:34659195
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研究论文 | 本文描述了一位接受HPV治疗性疫苗PepCan的女性,其宫颈高级别鳞状上皮内病变完全消退,并通过T细胞受体β深度测序分析了疫苗接种前后的T细胞反应。 | 结合传统和前沿的免疫监测技术,首次展示了HPV抗原特异性T细胞不仅在外周血中,而且在宫颈中的扩增。 | NA | 研究HPV治疗性疫苗对T细胞反应的影响,并验证疫苗特异性T细胞的存在。 | HPV治疗性疫苗PepCan接种者的T细胞反应及宫颈病变消退情况。 | 免疫学 | 宫颈疾病 | T细胞受体β深度测序 | NA | 单细胞RNA测序和TCR测序数据 | 70个可能的疫苗特异性克隆型 | NA | NA | NA | NA |
| 1371 | 2024-08-08 |
Phytohormone-Based Regulation of Trichome Development
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.734776
PMID:34659303
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综述 | 本文综述了植物激素对毛状体发育的调控作用 | 介绍了CRISPR-Cas9系统和单细胞转录组学等新技术在研究毛状体细胞系调控网络中的应用 | NA | 探讨植物激素对毛状体发育的调控机制 | 植物毛状体的发育 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统, 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1372 | 2024-08-08 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
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综述 | 本文综述了结合功能基因组学知识与全基因组关联研究(GWAS)的数据整合生物信息学方法,以识别遗传调控基因 | 介绍了转录组广泛关联研究(TWAS)作为一种基因基础的关联方法,能够减少多重检验负担,并讨论了不同TWAS方法的设计和生物学假设 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨如何通过数据整合方法更好地理解GWAS发现与复杂疾病机制之间的关系 | 全基因组关联研究(GWAS)发现的非编码区域及其在复杂人类疾病和性状中的功能 | 基因组学 | NA | 全基因组关联研究(GWAS),转录组广泛关联研究(TWAS) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1373 | 2024-08-08 |
Identification of Specific Cell Subpopulations and Marker Genes in Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/1005793
PMID:34660776
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 揭示了卵巢癌中的特定细胞亚群和标记基因,为卵巢癌的异质性提供了新的见解 | NA | 分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66个高级别浆液性卵巢癌细胞样本和568个卵巢癌样本及8个正常卵巢样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1374 | 2024-08-08 |
3D tumor angiogenesis models: recent advances and challenges
2021-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03814-0
PMID:34613483
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综述 | 本文综述了3D肿瘤血管生成模型的最新进展和面临的挑战 | 介绍了基于组织工程的肿瘤模型、血管类器官模型和器官芯片等新型3D肿瘤血管模型系统 | 现有模型多依赖于正常内皮细胞,与具有独特(表观)遗传和代谢特征的肿瘤内皮细胞有显著差异 | 旨在改进肿瘤血管模型系统,以促进个性化医疗的发展 | 肿瘤血管生成机制及其临床应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1375 | 2024-08-08 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 本研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理学和体内钙成像技术,系统比较了投射到外侧缰核和腹侧被盖区的外侧下丘脑谷氨酸能神经元的功能差异 | 揭示了外侧下丘脑神经元在投射到不同脑区的功能异质性,表明奖励和厌恶在不同的传出通路中被不同处理 | NA | 解析外侧下丘脑特定神经元群的功能 | 外侧下丘脑谷氨酸能神经元投射到外侧缰核和腹侧被盖区的功能差异 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞测序、电生理学、体内钙成像 | NA | 神经元活动数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1376 | 2024-08-08 |
Significance of intratumoral infiltration of B cells in cancer immunotherapy: From a single cell perspective
2021-12, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2021.188632
PMID:34626740
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综述 | 本文综述了肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的作用,特别是从单细胞RNA测序的角度探讨其亚群、分化轨迹及与肿瘤微环境中的其他细胞的相互作用 | 利用单细胞RNA测序技术,高分辨率动态监测肿瘤微环境在免疫治疗中的变化,揭示B细胞在抗肿瘤免疫中的独特功能 | NA | 探讨肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的潜在临床应用价值,作为生物标志物和治疗靶点 | 肿瘤内浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1377 | 2024-08-08 |
Curc-mPEG454, a PEGylated curcumin derivative, as a multi-target anti-fibrotic prodrug
2021-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2021.108166
PMID:34628270
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研究论文 | 本研究评估了PEG化姜黄素衍生物Curc-mPEG454在四氯化碳诱导的大鼠肝纤维化模型中的抗纤维化效果及其机制 | Curc-mPEG454不仅提高了姜黄素的血液浓度,还保留了其抗炎活性,并通过调节多种信号通路有效抑制了纤维化相关细胞的扩张 | NA | 评估Curc-mPEG454的抗纤维化效果并探索其作用机制 | Curc-mPEG454在四氯化碳诱导的大鼠肝纤维化模型中的作用 | NA | 肝纤维化 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用50 mg/kg和100 mg/kg Curc-mPEG454处理的大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1378 | 2024-08-08 |
Tumor-propagating side population cells are a dynamic subpopulation in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148768
PMID:34618689
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研究论文 | 本研究利用未分化多形性肉瘤(UPS)的小鼠模型,追踪了肉瘤侧群(SP)细胞与非SP细胞之间的谱系关系,并探讨了SP细胞的肿瘤传播潜力及其在肿瘤生长和自我更新中的作用。 | 首次证明了肉瘤中的肿瘤传播细胞(TPCs)的表型是动态的,非SP细胞可以转化为具有增强肿瘤传播潜力的SP细胞。 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在人类肉瘤中验证这些发现。 | 探讨肉瘤中肿瘤传播细胞的动态特性及其对肿瘤生长和自我更新的影响。 | 未分化多形性肉瘤(UPS)中的侧群(SP)细胞和非SP细胞。 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型中的SP细胞和非SP细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1379 | 2024-08-08 |
Human nasal wash RNA-Seq reveals distinct cell-specific innate immune responses in influenza versus SARS-CoV-2
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152288
PMID:34618691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的先天免疫反应差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的不同反应 | 研究样本仅限于成人,且未涵盖所有可能的细胞类型和亚型 | 探讨流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的先天免疫反应差异 | 人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人鼻洗液细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1380 | 2024-08-08 |
Cell cycle heterogeneity directs spontaneous 2C state entry and exit in mouse embryonic stem cells
2021-11-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.09.003
PMID:34624246
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研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎干细胞中自发进入和退出二细胞样状态的过程 | 揭示了细胞周期在调节核仁和核周异染色质组装中通过影响2C基因Dux表达,从而介导二细胞样状态与多能状态之间双向过渡的机制 | NA | 理解小鼠胚胎干细胞中二细胞样状态与多能状态之间的双向过渡机制 | 小鼠胚胎干细胞中的二细胞样细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 少量二细胞样细胞 | NA | NA | NA | NA |