单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2024-08-08 |
Transcription factor FOXF1 identifies compartmentally distinct mesenchymal cells with a role in lung allograft fibrogenesis
2021-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147343
PMID:34546975
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研究论文 | 本研究展示了转录因子FOXF1在成人肺部特定解剖位置的间质基质细胞群中的保留，并识别出这些表达胶原蛋白的特定亚群细胞在肺同种异体移植重塑和纤维化中的关键作用 | 首次揭示了FOXF1+细胞在肺同种异体移植纤维化中的作用，并阐明了其与Sonic hedgehog信号通路的相互作用 | NA | 研究转录因子FOXF1在肺同种异体移植纤维化中的作用及其分子机制 | 肺部间质基质细胞及其在肺同种异体移植中的作用 | NA | 肺纤维化 | Bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Foxf1-tdTomato BAC和Foxf1-tdTomato Col1a1-GFP小鼠模型进行研究 |
| 1362 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing and Proteomics Reveal Neonatal Ileum Dynamic Developmental Potentials
2021-Oct-26, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00725-21
PMID:34546071
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和蛋白质组学分析，揭示了新生期回肠动态发育的潜力 | 发现了先前未知的发育变化，包括未分化细胞的特定增加、独特的肠细胞分化以及分泌细胞的时间依赖性减少 | NA | 探讨新生期小肠发育和成熟过程中的细胞分化和分子相互作用 | 新生期猪回肠的40,186个回肠上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 40,186个回肠上皮细胞 |
| 1363 | 2024-08-08 |
Microfluidic single-cell transcriptomics: moving towards multimodal and spatiotemporal omics
2021-10-12, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00607j
PMID:34541590
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review | 本文综述了微流控单细胞转录组学的最新进展，重点介绍了其方法学和技术趋势 | 文章讨论了微流控技术在单细胞转录组学中的应用，特别是向多模态和时空组学的转变，以及单细胞空间转录组学和时间转录组学的新进展 | 文章提到了当前微流控单细胞转录组学面临的挑战，包括需要解决的技术问题和未来的发展方向 | 综述微流控单细胞转录组学的方法和技术，探讨其未来发展 | 微流控单细胞转录组学技术及其在生物学中的应用 | digital pathology | NA | 微流控技术 | NA | 转录组数据 | 单细胞 |
| 1364 | 2024-08-08 |
Tunable and Contamination-Free Injection with Microfluidics by Stepinjection
2021-10-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02721
PMID:34546041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为stepinjection的微流控技术，通过改进T型接头设计，有效避免了传统皮克注射器中的交叉污染问题。 | stepinjection技术通过在T型接头中采用阶梯通道设计，增大了扩散缓冲区，从而增加了液滴与注射通道入口之间的压力差，有效防止了交叉污染。 | NA | 展示stepinjection技术在污染敏感的酶学检测中的应用能力。 | 使用stepinjection技术将酪蛋白荧光素异硫氰酸酯（FITC-casein）注入含有savinase和无savinase（标记为红色荧光染料）的液滴混合物中，观察是否有交叉污染。 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
| 1365 | 2024-08-08 |
Genes related to SNPs identified by Genome-wide association studies of age-related hearing loss show restriction to specific cell types in the adult mouse cochlea
2021-10, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2021.108347
PMID:34536825
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研究论文 | 研究通过全基因组关联研究识别与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在成年小鼠耳蜗中的表达 | 发现与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在耳蜗细胞亚型中的广泛且不同的表达模式，以及与阿尔茨海默病和细胞极性及囊泡循环相关的基因集的重叠 | NA | 确定与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在耳蜗中的表达 | 年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因及其在耳蜗细胞亚型中的表达 | 基因组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠耳蜗细胞亚型 |
| 1366 | 2024-08-08 |
Type I Interferon signaling controls the accumulation and transcriptomes of monocytes in the aged lung
2021-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13470
PMID:34547174
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研究论文 | 本文揭示了衰老导致肺部干扰素信号增强和趋化因子浓度升高，进而引起单核细胞向肺实质的浸润 | 发现了一种依赖于I型干扰素信号的新型单核细胞亚群（MO-ifn），该亚群在衰老过程中上调IFNAR1表达并表现出更大的转录组变化 | NA | 探讨生理性衰老过程中肺部免疫细胞的机制 | 衰老肺部的单核细胞及其转录组变化 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1367 | 2024-08-08 |
A single-cell tumor immune atlas for precision oncology
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.273300.120
PMID:34548323
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research paper | 本研究构建了一个单细胞肿瘤免疫图谱，用于精确肿瘤学 | 提出了一个综合的单细胞肿瘤免疫细胞图谱，并开发了一个自动细胞注释系统和空间转录组学工具 | NA | 旨在提高肿瘤预后和免疫治疗的分层方法 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞及其空间定位 | digital pathology | NA | single-cell and spatial transcriptomics | NA | single-cell data | 超过500,000个细胞，来自217名患者和13种癌症类型 |
| 1368 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals distinct immune response in asymptomatic COVID-19 patients
2021-09-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00753-7
PMID:34531370
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T/B细胞受体测序，分析了无症状COVID-19患者与中度患者的免疫反应差异 | 首次揭示了无症状COVID-19患者与中度患者在免疫反应上的显著差异，包括NK细胞和干扰素-γ的上调以及TCR克隆扩增的增强 | 研究样本量较小，且仅包括外周血单个核细胞样本，可能无法全面反映所有免疫细胞的反应 | 旨在识别无症状与中度COVID-19患者之间的免疫反应差异 | 无症状、中度和重度COVID-19患者以及健康对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序，TCR/BCR测序 | NA | 细胞 | 37份纵向收集的外周血单个核细胞样本 |
| 1369 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity and immune subtypes associated with disease activity in human myasthenia gravis
2021-Sep-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00314-w
PMID:34521820
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了39,243个细胞的转录组，揭示了与疾病活动相关的人类重症肌无力中的转录异质性和免疫亚型 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了重症肌无力患者的细胞转录组，发现了与疾病活动相关的特定细胞亚群 | 研究仅限于新发重症肌无力患者和健康对照，未涉及长期或慢性重症肌无力患者 | 深入理解重症肌无力发病机制中的细胞异质性 | 重症肌无力患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39,243个细胞 |
| 1370 | 2024-08-08 |
Limited access to antigen drives generation of early B cell memory while restraining the plasmablast response
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.017
PMID:34525339
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了小鼠对T依赖性抗原的早期B细胞反应，探讨了早期B细胞激活过程中的细胞命运决定及其对抗原和疫苗反应结果的影响。 | 研究揭示了抗原可及性对早期B细胞记忆生成和浆细胞样细胞反应的调控机制，并发现了非生发中心来源的早期记忆B细胞在免疫反应中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步在其他物种或人类中验证这些发现。 | 探讨早期B细胞激活过程中的细胞命运决定及其对抗原和疫苗反应结果的影响。 | 小鼠的早期B细胞反应。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠的B细胞样本 |
| 1371 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory and proliferative microglia drive progression of glioblastoma
2021-09-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109718
PMID:34525361
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，全面绘制了胶质母细胞瘤中的细胞群体，并揭示了SETD2突变型胶质母细胞瘤细胞与肿瘤微环境之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了一种特定的高级别胶质瘤相关小胶质细胞（HGG-AM），并阐明了其通过TGF-β1激活后表现出促炎和增殖特征，进而促进肿瘤进展的机制。 | NA | 旨在深入理解胶质母细胞瘤微环境及其分子基础，以开发更有效的治疗策略。 | 胶质母细胞瘤中的细胞群体及其相互作用。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1372 | 2024-08-08 |
ASGARD: A Single-cell Guided pipeline to Aid Repurposing of Drugs
2021-Sep-14, ArXiv
PMID:34545335
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研究论文 | 本文提出了一种名为ASGARD的新型药物推荐系统，该系统利用单细胞RNA测序技术来解决细胞间异质性问题，以促进精准医学 | ASGARD通过考虑所有细胞集群来定义一种新的药物评分，以预测药物，从而解决每个患者内部的细胞间异质性问题 | NA | 开发一种新的药物再利用推荐工具，以促进个性化医学 | ASGARD系统在多种疾病中的应用，包括乳腺癌、急性淋巴细胞白血病和COVID-19 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 涉及多种疾病的患者样本，包括三阴性乳腺癌患者样本 |
| 1373 | 2024-08-08 |
Understanding the pathogenesis of infectious diseases by single-cell RNA sequencing
2021-Sep-06, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2021.09.759
PMID:34527720
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了感染性疾病的发病机制，并讨论了该技术在研究宿主与病原体相互作用中的应用及未来治疗潜力 | 介绍了单细胞RNA测序技术在分析细胞多样性、免疫反应异质性及感染性疾病分子机制中的最新进展 | NA | 揭示感染性疾病的发病机制，并探索新的干预和治疗方法 | 细菌、病毒、真菌和寄生虫引起的感染性疾病 | 数字病理学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1374 | 2024-08-08 |
Applying Machine Learning to Stem Cell Culture and Differentiation
2021-Sep, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.261
PMID:34529356
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研究论文 | 本文详细介绍了机器学习技术在干细胞培养和分化中的应用 | 本文首次系统地介绍了机器学习在干细胞研究中的应用，并提供了具体的实例和方法 | NA | 旨在帮助干细胞生物学家理解和设计机器学习工作流程 | 干细胞的培养和分化 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序和基于图像的方法 | 回归、分类和无监督聚类 | 数据 | NA |
| 1375 | 2024-08-08 |
Transcriptomic entropy benchmarks stem cell-derived cardiomyocyte maturation against endogenous tissue at single cell level
2021-09, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009305
PMID:34534204
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研究论文 | 本文通过转录组熵量化多能干细胞（PSC）衍生的心肌细胞（CM）成熟度，并与内源性组织进行单细胞水平的比较 | 开发了一种新的方法来量化PSC衍生的心肌细胞成熟度，通过转录组熵，该方法在不同数据集间具有鲁棒性，不受分离协议、文库准备和其他潜在批次效应的影响 | NA | 建立一个跨研究、跨物种的心肌细胞成熟度参考，并直接比较PSC衍生的心肌细胞与体内发育轨迹 | 多能干细胞衍生的心肌细胞成熟度 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 分析了超过45个scRNA-seq数据集和超过52,000个心肌细胞 |
| 1376 | 2024-08-08 |
The establishment of variant surface glycoprotein monoallelic expression revealed by single-cell RNA-seq of Trypanosoma brucei in the tsetse fly salivary glands
2021-09, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009904
PMID:34543350
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了舌蝇唾液腺中布氏锥虫的发育过程，特别是变异表面糖蛋白（VSG）单等位基因表达的建立。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了布氏锥虫在舌蝇唾液腺中VSG单等位基因表达的动态过程，并提出了转录竞赛模型来解释这一现象。 | NA | 深入理解布氏锥虫在舌蝇唾液腺中变异表面糖蛋白单等位基因表达的建立过程。 | 布氏锥虫在舌蝇唾液腺中的发育过程及其变异表面糖蛋白的表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 多个布氏锥虫细胞 |
| 1377 | 2024-08-08 |
Preparation of Drosophila Larval Blood Cells for Single-cell RNA Sequencing
2021-Aug-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4127
PMID:34541045
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研究论文 | 本文提供了一种详细的方法，用于从果蝇第三龄幼虫中获取用于单细胞RNA测序的高质量单个血细胞 | 该方法简便且可重复，无需酶解，细胞存活率问题极小 | NA | 提供一种用于单细胞RNA测序的高质量单个血细胞的制备方法 | 果蝇第三龄幼虫的血细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 从果蝇第三龄幼虫中获取的血细胞 |
| 1378 | 2024-08-08 |
A Single-cell Transcriptome Atlas of Cashmere Goat Hair Follicle Morphogenesis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.003
PMID:34534715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了绒山羊胎儿背部皮肤在不同发育阶段的细胞异质性和细胞命运决定 | 首次通过无监督聚类分析识别了16个细胞集群，并揭示了真皮和表皮细胞系发育路径的详细分子景观 | NA | 探究绒山羊毛发 follicle 发育过程中的转录组特征 | 绒山羊的次级毛发 follicle (SHFs) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,705个单细胞 |
| 1379 | 2024-08-08 |
Identify differential genes and cell subclusters from time-series scRNA-seq data using scTITANS
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.07.016
PMID:34527187
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTITANS的方法，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中识别差异基因和细胞亚群 | scTITANS通过使用轨迹推断分析的伪时间来校正细胞异步性，并引入基于时间序列分析方法的时间依赖协变量，从而更准确、定量地处理细胞间的异质性并充分利用生物过程中的时间信息 | NA | 开发一种有效工具，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中识别差异基因和细胞亚群 | 时间序列单细胞RNA测序数据中的差异基因和细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列数据 | 多个时间点的单细胞样本 |
| 1380 | 2024-08-08 |
Stromal infiltrating mast cells identify immunoevasive subtype high-grade serous ovarian cancer with poor prognosis and inferior immunotherapeutic response
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1969075
PMID:34527431
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤浸润肥大细胞（TIMs）在高度浆液性卵巢癌（HGSOC）中的预后、免疫环境和免疫治疗反应的相关性 | 首次揭示了基质TIMs（sTIMs）在HGSOC中的预后价值和与免疫逃逸亚型的关联，并构建了一个基于sTIMs和PD-L1的诺模图来预测患者的5年总生存率 | 研究样本量有限，且仅限于高级别浆液性卵巢癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在确定TIMs在HGSOC中的预后、免疫环境和免疫治疗反应的相关性 | 高级别浆液性卵巢癌患者及其肿瘤浸润肥大细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 免疫组织化学（IHC），单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 组织样本 | 197名高级别浆液性卵巢癌患者 |