单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2024-08-08 |
Identifying Lung Cancer Cell Markers with Machine Learning Methods and Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Sep-09, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11090940
PMID:34575089
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研究论文 | 本文提出了一种基于转录组轮廓的计算方法，用于区分非小细胞肺癌不同病理区域的细胞亚型，并包括一组定性分类标准（生物标志物）和各种规则 | 利用单细胞RNA测序技术和机器学习方法，识别非小细胞肺癌的细胞标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌的发病机制并区分其细胞亚型 | 非小细胞肺癌的细胞亚型及其生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林分类器和决策树 | 转录组数据 | 720个特征用于随机森林分类器，1880个特征用于决策树 |
| 1342 | 2024-08-08 |
Single-Cell Omics in Dissecting Immune Microenvironment of Malignant Gliomas-Challenges and Perspectives
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092264
PMID:34571910
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研究论文 | 本文综述了单细胞技术在解析恶性胶质瘤免疫微环境中的应用，并探讨了其面临的挑战和未来展望 | 单细胞RNA测序和时间飞行细胞仪技术提供了前所未有的肿瘤微环境解析能力 | NA | 总结单细胞技术在恶性胶质瘤免疫微环境研究中的发现，并探讨其对设计有效免疫疗法的重要性 | 恶性胶质瘤的免疫微环境及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、时间飞行细胞仪（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1343 | 2024-08-08 |
Loss of Ubiquitin Carboxy-Terminal Hydrolase L1 Impairs Long-Term Differentiation Competence and Metabolic Regulation in Murine Spermatogonial Stem Cells
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092265
PMID:34571914
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研究论文 | 研究探讨了UCH-L1在鼠精原干细胞中的作用及其对长期分化能力和代谢调节的影响 | 首次揭示了UCH-L1缺失对精原干细胞稳态和代谢的影响，以及其对精原干细胞分化能力的潜在作用 | NA | 理解UCH-L1在鼠精原干细胞中的功能及其对精原干细胞分化和代谢的影响 | 鼠精原干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1344 | 2024-08-08 |
Pushing the Boundaries: Forensic DNA Phenotyping Challenged by Single-Cell Sequencing
2021-08-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12091362
PMID:34573344
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的应用 | 首次将单细胞测序技术应用于法医DNA表型分析，以改善混合物解卷积 | 单细胞测序在法医学中的应用尚不普遍 | 研究单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的潜力 | 从尸检血液中分离的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 20、10、5个细胞组以及20个单细胞 |
| 1345 | 2024-08-08 |
Modeling Notch-Induced Tumor Cell Survival in the Drosophila Ovary Identifies Cellular and Transcriptional Response to Nuclear NICD Accumulation
2021-08-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092222
PMID:34571871
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研究论文 | 本文通过建立果蝇卵巢肿瘤模型，研究了核内NICD积累对肿瘤细胞存活的影响及其细胞和转录反应。 | 开发了一种新的肿瘤模型，利用bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，揭示了NICD积累对肿瘤生长和细胞存活的分子机制。 | NA | 旨在理解NICD积累在肿瘤发生过程中的影响及其分子机制。 | 果蝇卵巢肿瘤细胞及其对NICD积累的响应。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 使用了bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，具体样本数量未明确。 |
| 1346 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Cisplatin-Treated Adult Stria Vascularis Identifies Cell Type-Specific Regulatory Networks and Novel Therapeutic Gene Targets
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.718241
PMID:34566577
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究顺铂处理后的成年鼠血管纹细胞，识别细胞类型特异性的调控网络和新的治疗基因靶点。 | 本文首次结合顺铂处理和单细胞RNA测序技术，揭示了血管纹细胞在顺铂暴露下的转录变化，并识别了独特的基因调控网络和可药物干预的基因靶点。 | NA | 旨在建立内耳电位功能障碍模型，进行转录分析和治疗测试。 | 成年鼠血管纹细胞在顺铂处理后的转录变化和治疗基因靶点。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鼠 |
| 1347 | 2024-08-08 |
Inhibition of BCL9 Modulates the Cellular Landscape of Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.713331
PMID:34566638
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研究论文 | 研究通过单细胞测序探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）细胞景观的影响 | 首次提出TAM-to-NK评分，评估肿瘤微环境中单核细胞/TAM细胞与NK样非功能细胞的动态平衡 | NA | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中TAMs细胞类型平衡和转录差异的影响 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1348 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of NEUROGENIN3+ Endocrine Progenitor Cells in the Human Pancreas
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.736286
PMID:34566896
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术深入探索人类胰腺中NEUROGENIN3+（NEUROG3+）内分泌前体细胞的分子程序 | 首次在人类中直接利用单细胞RNA测序技术研究NEUROG3+细胞，并揭示了其独特的基因特征和调控网络 | NA | 探索人类胰腺中NEUROG3+细胞的分子程序，以促进糖尿病治疗中β细胞再生的疗法开发 | 人类胰腺中的NEUROG3+内分泌前体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,174个胰腺细胞中的10个NEUROG3+上皮细胞 |
| 1349 | 2024-08-08 |
Unraveling the Heterogeneity and Ontogeny of Dendritic Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711329
PMID:34566965
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示树突状细胞（DCs）的异质性和发育过程的最新进展 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了DCs的重新分类和发育，以及在疾病中DCs的异质性和多功能性 | NA | 探讨树突状细胞的异质性和发育过程 | 树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 1350 | 2024-08-08 |
AdImpute: An Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Semi-Supervised Autoencoders
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.739677
PMID:34567089
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半监督自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法AdImpute | AdImpute方法使用另一种插补方法的结果作为自编码器的插补权重，并通过带有插补权重的成本函数学习数据的潜在信息，实现更准确的插补 | NA | 开发一种更准确的单细胞RNA测序数据插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 模拟数据集和真实数据集 |
| 1351 | 2024-08-08 |
The Stromal and Immune Landscape of Nasopharyngeal Carcinoma and Its Implications for Precision Medicine Targeting the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.744889
PMID:34568077
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综述 | 本文综述了鼻咽癌（NPC）的基质和免疫景观，并探讨了针对肿瘤微环境（TME）的精准医疗方法 | 利用单细胞测序技术解析了NPC浸润细胞的基质组成和功能动态，为精准治疗提供了新的视角 | 缺乏对TME的深入理解，限制了治疗的发展和优化 | 详细描绘NPC的基质景观，并提出基于微环境的精准治疗方法 | 鼻咽癌的肿瘤微环境及其对治疗的影响 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1352 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in YRDC cause a developmental disorder with progeroid features
2021-Dec, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-021-02347-3
PMID:34545459
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研究论文 | 本文报道了一个因YRDC基因双等位变异导致的新生儿严重早衰表型的病例，并通过全外显子测序和功能分析揭示了该变异对YRDC功能的影响及其对tRNA修饰和端粒维持的影响。 | 本文首次报道了YRDC基因的双等位变异与发育障碍和早衰特征的关联，并开发了一种新的高灵敏度3-D Q-FISH分析方法来研究YRDC对端粒维持的影响。 | 本文主要基于单一病例的研究，需要更多的病例来验证YRDC变异与早衰表型的普遍性和相关性。 | 研究YRDC基因变异与发育障碍和早衰表型的关联及其分子机制。 | 一个具有严重早衰表型的新生儿及其衍生的成纤维细胞。 | NA | 发育障碍 | 全外显子测序，3-D Q-FISH分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 单一病例 |
| 1353 | 2024-08-08 |
Plant Cell Identity in the Era of Single-Cell Transcriptomics
2021-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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综述 | 本文综述了高通量单细胞转录组学方法在植物学中的应用，及其对理解植物细胞多样性、分化和功能的影响 | 提供了对植物细胞身份的新见解，包括细胞转换的全新视角和罕见及新型细胞类型的定义 | 指出了当前应用和分析单细胞转录组学在植物中的挑战 | 探讨单细胞转录组学在植物学中的应用及其对植物细胞身份理解的影响 | 植物器官和组织的单细胞转录组分析 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个植物器官和组织 |
| 1354 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses Reveal Mechanisms of Cancer Stem Cell Maintenance and Epithelial-Mesenchymal Transition in Recurrent Bladder Cancer
2021-11-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4796
PMID:34526362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术，分析了13名不同复发风险膀胱癌患者的肿瘤细胞，揭示了膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 研究首次在单细胞水平上揭示了EZH2通过H3K27me3介导的NCAM1基因抑制，维持癌症干细胞特性，并阐明了TCF7在膀胱癌上皮-间质转化中的作用 | NA | 揭示膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 膀胱癌患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 13名患者，共54,971个单细胞 |
| 1355 | 2024-08-08 |
Functional coordination of non-myocytes plays a key role in adult zebrafish heart regeneration
2021-11-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202152901
PMID:34523214
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研究论文 | 本文通过LIGER算法分析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞（non-CMs）的单细胞RNA测序数据，揭示了non-CMs的多样性和功能状态的动态变化 | 首次构建了斑马鱼心脏再生过程中non-CMs的细胞状态图谱，并开发了Topologizer算法来分析功能状态之间的拓扑关系和动态转换 | NA | 探究斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的分子和细胞基础 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | LIGER算法, Topologizer算法 | 单细胞RNA测序数据 | 61,977个非心肌细胞样本 |
| 1356 | 2024-08-08 |
Visualization of individual cell division history in complex tissues using iCOUNT
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.012
PMID:34525348
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研究论文 | 本文开发了一种诱导性细胞分裂计数器（iCOUNT），用于在体外和体内报告人类和小鼠组织的细胞分裂事件，并通过分析神经干细胞/祖细胞（NSPCs）的分裂历史，揭示了干细胞行为的新的见解。 | 开发了iCOUNT工具，能够报告细胞分裂事件，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）识别与细胞分裂历史相关的功能性分子途径。 | NA | 研究干细胞的分裂潜力及其连续增殖的分子后果。 | 神经干细胞/祖细胞（NSPCs）及其后代。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1357 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of human pancreas: characteristics of two populations of acinar cells in chronic pancreatitis
2021-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00482.2020
PMID:34523348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了慢性胰腺炎患者胰腺组织中的细胞特征，特别是两种独特的腺泡细胞群 | 首次在单细胞水平上研究了慢性胰腺炎患者胰腺腺泡细胞的生理特性，并探讨了这些细胞对激动剂刺激的响应 | 研究样本量较小，仅包括五名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨慢性胰腺炎患者胰腺组织中细胞的特征及其对特定刺激的响应 | 慢性胰腺炎患者的胰腺组织及其中的腺泡细胞 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 |
| 1358 | 2024-08-08 |
Cell-specific gene association network construction from single-cell RNA sequence
2021-11, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2021.1978265
PMID:34530677
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研究论文 | 本文利用网络扰动理论和显著性分析，开发了一种细胞特异性网络，该网络基于单细胞分辨率下的分子表达来揭示基因-基因关联 | 本文首次利用单细胞RNA测序数据构建细胞特异性基因关联网络，并通过网络度理论识别枢纽基因 | NA | 开发一种新的方法来构建细胞特异性基因关联网络，并探索其在个性化药物设计和治疗中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络扰动理论 | 基因表达数据 | NA |
| 1359 | 2024-08-08 |
Adipose tissue and adipose secretome in systemic sclerosis
2021-11-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000000838
PMID:34534166
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综述 | 本文综述了脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症（SSc）病理中的作用，特别关注了脂肪细胞在脂肪向间充质转分化（AMT）中的局部效应，脂肪间质血管部分对SSc发病机制的影响，以及脂肪组织分泌组的系统效应。 | 新发现的从脂肪组织演化而来的成纤维细胞群体，如从脂肪源性间质细胞分化而来的COL11+癌症相关成纤维细胞，以及使用非常规标记物描述的人类肺部脂成纤维细胞，这些发现有助于进一步阐明脂肪细胞在SSc中的作用。 | NA | 探讨脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症发病机制中的重要作用。 | 脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症中的作用。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）和代谢组学 | NA | NA | NA |
| 1360 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了复发性自然流产中母体蜕膜基质微环境的缺陷特征 | 首次揭示了复发性自然流产中蜕膜基质细胞的异常分化和细胞间通讯障碍 | NA | 探讨复发性自然流产中母体蜕膜细胞异质性的作用 | 复发性自然流产患者和健康对照者的蜕膜样本 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 66,078个单细胞样本 |