单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal DHX9 in mature B cell as a dynamic network biomarker before lymph node metastasis in CRC
2021-Sep-24, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.06.004
PMID:34553035
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了成熟B细胞中的DHX9在结直肠癌（CRC）淋巴结转移前的动态网络生物标志物作用 | 首次发现DHX9在成熟B细胞中作为CRC淋巴结转移前的关键动态网络生物标志物 | NA | 开发预测性生物标志物，以检测CRC淋巴结转移前成熟B细胞的关键转变点 | 结直肠癌患者的邻近组织中的成熟B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 动态网络生物标志物（DNB）方法 | 转录组数据 | 725个来自结直肠癌的B细胞 |
| 1342 | 2024-08-08 |
Reconstructing and counting genomic fragments through tagmentation-based haploid phasing
2021-09-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97852-w
PMID:34556684
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研究论文 | 本文通过基于标签化的单倍体分型技术，展示了通过新型生物信息学算法重建和计数基因组片段的概念 | 提出了一种新的生物信息学算法，用于检测基因组的离散性质，以准确确定基因拷贝数变化 | 该方法依赖于样本，调用敏感性因样本的倍性而异，并对测序数据中的噪声敏感 | 提高单细胞测序中基因拷贝数变化的准确性，以更好地追踪和理解肿瘤发生 | 癌症细胞的异质性和基因拷贝数变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1343 | 2024-08-08 |
Epicardial differentiation drives fibro-fatty remodeling in arrhythmogenic cardiomyopathy
2021-Sep-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abf2750
PMID:34550725
|
研究论文 | 本文利用人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的心脏培养物、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和移植的人ACM心脏研究了ACM中纤维脂肪重塑的心外膜贡献 | 首次揭示了TFAP2A通过促进上皮间质转化（EMT）介导心外膜分化，从而在ACM中驱动纤维脂肪重塑的关键作用 | NA | 探讨心律失常性心肌病（ACM）中心外膜对纤维脂肪重塑的贡献及其分子机制 | 人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞、单细胞RNA测序数据和ACM患者移植心脏 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 来自ACM患者和健康供体的人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞及ACM患者移植心脏样本 |
| 1344 | 2024-08-08 |
CCR2 deficiency alters activation of microglia subsets in traumatic brain injury
2021-09-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109727
PMID:34551293
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研究论文 | 研究探讨了CCR2缺乏对创伤性脑损伤中微胶质细胞亚群激活的影响 | 使用无偏倚的单细胞RNA测序方法揭示了创伤性脑损伤和正常脑中的25种微胶质细胞、单核/巨噬细胞和树突状细胞亚群，并发现CCR2缺乏的创伤性脑损伤小鼠与野生型创伤性脑损伤小鼠相比，微胶质细胞亚群的转录谱发生改变 | NA | 定义创伤性脑损伤中微胶质细胞和巨噬细胞表型的异质性，并探索CCR2缺乏对这些细胞的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在创伤性脑损伤中的作用 | NA | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和CCR2缺乏小鼠 |
| 1345 | 2024-08-08 |
Integrative Transcriptome Profiling Reveals SKA3 as a Novel Prognostic Marker in Non-Muscle Invasive Bladder Cancer
2021-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13184673
PMID:34572901
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析，揭示了SKA3作为非肌肉浸润性膀胱癌的新型预后标志物 | 发现SKA3与非肌肉浸润性膀胱癌的病理生理和不良生存相关，并可能通过抑制其表达来降低膀胱癌进展的风险 | NA | 提高非肌肉浸润性膀胱癌患者临床结果的诊断准确性 | 非肌肉浸润性膀胱癌及其向肌肉浸润性膀胱癌的进展 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个膀胱癌患者队列的公共数据集以及人类肿瘤组织的RNA测序数据 |
| 1346 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulatory networks from single-cell RNA-seq temporal snapshot data requires higher-order moments
2021-Sep-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100332
PMID:34553172
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研究论文 | 本文探讨了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）时间快照数据推断基因调控网络（GRN）的方法，强调了高阶统计量的重要性 | 提出了一种基于高阶统计量的方法来推断基因调控网络，并强调了数据预处理对保留这些统计量的重要性 | 目前的数据预处理可能无法保留这些统计量，且需要计算密集型的最小化解算器 | 开发一种新的方法来从scRNA-seq数据中推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 时间快照数据 | NA |
| 1347 | 2024-08-08 |
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
2021-09-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62857
PMID:34570087
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研究论文 | 本文提供了一个全面的协议，用于准备人肠道类器官以感染肠道病原体，并考虑感染侧（顶端 vs. 基底侧）进行单细胞RNA测序，以表征细胞类型特异性的宿主/病原体相互作用。 | 本文创新地提出了在生物安全三级（BSL-3）条件下，通过考虑感染侧来准备人肠道类器官以进行单细胞RNA测序的方法。 | 本文未明确提及研究的具体限制。 | 研究肠道病原体感染的细胞类型特异性宿主/病原体相互作用。 | 人肠道类器官及其对肠道病原体感染的反应。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1348 | 2024-08-08 |
Identifying Lung Cancer Cell Markers with Machine Learning Methods and Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Sep-09, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11090940
PMID:34575089
|
研究论文 | 本文提出了一种基于转录组轮廓的计算方法，用于区分非小细胞肺癌不同病理区域的细胞亚型，并包括一组定性分类标准（生物标志物）和各种规则 | 利用单细胞RNA测序技术和机器学习方法，识别非小细胞肺癌的细胞标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌的发病机制并区分其细胞亚型 | 非小细胞肺癌的细胞亚型及其生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林分类器和决策树 | 转录组数据 | 720个特征用于随机森林分类器，1880个特征用于决策树 |
| 1349 | 2024-08-08 |
Single-Cell Omics in Dissecting Immune Microenvironment of Malignant Gliomas-Challenges and Perspectives
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092264
PMID:34571910
|
研究论文 | 本文综述了单细胞技术在解析恶性胶质瘤免疫微环境中的应用，并探讨了其面临的挑战和未来展望 | 单细胞RNA测序和时间飞行细胞仪技术提供了前所未有的肿瘤微环境解析能力 | NA | 总结单细胞技术在恶性胶质瘤免疫微环境研究中的发现，并探讨其对设计有效免疫疗法的重要性 | 恶性胶质瘤的免疫微环境及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、时间飞行细胞仪（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1350 | 2024-08-08 |
Loss of Ubiquitin Carboxy-Terminal Hydrolase L1 Impairs Long-Term Differentiation Competence and Metabolic Regulation in Murine Spermatogonial Stem Cells
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092265
PMID:34571914
|
研究论文 | 研究探讨了UCH-L1在鼠精原干细胞中的作用及其对长期分化能力和代谢调节的影响 | 首次揭示了UCH-L1缺失对精原干细胞稳态和代谢的影响，以及其对精原干细胞分化能力的潜在作用 | NA | 理解UCH-L1在鼠精原干细胞中的功能及其对精原干细胞分化和代谢的影响 | 鼠精原干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1351 | 2024-08-08 |
Pushing the Boundaries: Forensic DNA Phenotyping Challenged by Single-Cell Sequencing
2021-08-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12091362
PMID:34573344
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的应用 | 首次将单细胞测序技术应用于法医DNA表型分析，以改善混合物解卷积 | 单细胞测序在法医学中的应用尚不普遍 | 研究单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的潜力 | 从尸检血液中分离的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 20、10、5个细胞组以及20个单细胞 |
| 1352 | 2024-08-08 |
Modeling Notch-Induced Tumor Cell Survival in the Drosophila Ovary Identifies Cellular and Transcriptional Response to Nuclear NICD Accumulation
2021-08-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092222
PMID:34571871
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研究论文 | 本文通过建立果蝇卵巢肿瘤模型，研究了核内NICD积累对肿瘤细胞存活的影响及其细胞和转录反应。 | 开发了一种新的肿瘤模型，利用bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，揭示了NICD积累对肿瘤生长和细胞存活的分子机制。 | NA | 旨在理解NICD积累在肿瘤发生过程中的影响及其分子机制。 | 果蝇卵巢肿瘤细胞及其对NICD积累的响应。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 使用了bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，具体样本数量未明确。 |
| 1353 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Cisplatin-Treated Adult Stria Vascularis Identifies Cell Type-Specific Regulatory Networks and Novel Therapeutic Gene Targets
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.718241
PMID:34566577
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究顺铂处理后的成年鼠血管纹细胞，识别细胞类型特异性的调控网络和新的治疗基因靶点。 | 本文首次结合顺铂处理和单细胞RNA测序技术，揭示了血管纹细胞在顺铂暴露下的转录变化，并识别了独特的基因调控网络和可药物干预的基因靶点。 | NA | 旨在建立内耳电位功能障碍模型，进行转录分析和治疗测试。 | 成年鼠血管纹细胞在顺铂处理后的转录变化和治疗基因靶点。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鼠 |
| 1354 | 2024-08-08 |
Inhibition of BCL9 Modulates the Cellular Landscape of Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.713331
PMID:34566638
|
研究论文 | 研究通过单细胞测序探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）细胞景观的影响 | 首次提出TAM-to-NK评分，评估肿瘤微环境中单核细胞/TAM细胞与NK样非功能细胞的动态平衡 | NA | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中TAMs细胞类型平衡和转录差异的影响 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1355 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of NEUROGENIN3+ Endocrine Progenitor Cells in the Human Pancreas
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.736286
PMID:34566896
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术深入探索人类胰腺中NEUROGENIN3+（NEUROG3+）内分泌前体细胞的分子程序 | 首次在人类中直接利用单细胞RNA测序技术研究NEUROG3+细胞，并揭示了其独特的基因特征和调控网络 | NA | 探索人类胰腺中NEUROG3+细胞的分子程序，以促进糖尿病治疗中β细胞再生的疗法开发 | 人类胰腺中的NEUROG3+内分泌前体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,174个胰腺细胞中的10个NEUROG3+上皮细胞 |
| 1356 | 2024-08-08 |
Unraveling the Heterogeneity and Ontogeny of Dendritic Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711329
PMID:34566965
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示树突状细胞（DCs）的异质性和发育过程的最新进展 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了DCs的重新分类和发育，以及在疾病中DCs的异质性和多功能性 | NA | 探讨树突状细胞的异质性和发育过程 | 树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 1357 | 2024-08-08 |
AdImpute: An Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Semi-Supervised Autoencoders
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.739677
PMID:34567089
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半监督自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法AdImpute | AdImpute方法使用另一种插补方法的结果作为自编码器的插补权重，并通过带有插补权重的成本函数学习数据的潜在信息，实现更准确的插补 | NA | 开发一种更准确的单细胞RNA测序数据插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 模拟数据集和真实数据集 |
| 1358 | 2024-08-08 |
The Stromal and Immune Landscape of Nasopharyngeal Carcinoma and Its Implications for Precision Medicine Targeting the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.744889
PMID:34568077
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综述 | 本文综述了鼻咽癌（NPC）的基质和免疫景观，并探讨了针对肿瘤微环境（TME）的精准医疗方法 | 利用单细胞测序技术解析了NPC浸润细胞的基质组成和功能动态，为精准治疗提供了新的视角 | 缺乏对TME的深入理解，限制了治疗的发展和优化 | 详细描绘NPC的基质景观，并提出基于微环境的精准治疗方法 | 鼻咽癌的肿瘤微环境及其对治疗的影响 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1359 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in YRDC cause a developmental disorder with progeroid features
2021-Dec, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-021-02347-3
PMID:34545459
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研究论文 | 本文报道了一个因YRDC基因双等位变异导致的新生儿严重早衰表型的病例，并通过全外显子测序和功能分析揭示了该变异对YRDC功能的影响及其对tRNA修饰和端粒维持的影响。 | 本文首次报道了YRDC基因的双等位变异与发育障碍和早衰特征的关联，并开发了一种新的高灵敏度3-D Q-FISH分析方法来研究YRDC对端粒维持的影响。 | 本文主要基于单一病例的研究，需要更多的病例来验证YRDC变异与早衰表型的普遍性和相关性。 | 研究YRDC基因变异与发育障碍和早衰表型的关联及其分子机制。 | 一个具有严重早衰表型的新生儿及其衍生的成纤维细胞。 | NA | 发育障碍 | 全外显子测序，3-D Q-FISH分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 单一病例 |
| 1360 | 2024-08-08 |
Plant Cell Identity in the Era of Single-Cell Transcriptomics
2021-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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综述 | 本文综述了高通量单细胞转录组学方法在植物学中的应用，及其对理解植物细胞多样性、分化和功能的影响 | 提供了对植物细胞身份的新见解，包括细胞转换的全新视角和罕见及新型细胞类型的定义 | 指出了当前应用和分析单细胞转录组学在植物中的挑战 | 探讨单细胞转录组学在植物学中的应用及其对植物细胞身份理解的影响 | 植物器官和组织的单细胞转录组分析 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个植物器官和组织 |