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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1321 | 2024-08-08 |
High throughput screening of novel AAV capsids identifies variants for transduction of adult NSCs within the subventricular zone
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.07.001
PMID:34553001
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研究论文 | 本研究通过高通量筛选177种脑室内注射的条形码AAV变体,利用RNA测序技术,鉴定出两种合成 capsid,能有效转导活跃和静止的成年神经干细胞 | 本研究首次鉴定出能高效转导成年神经干细胞的AAV变体,特别是AAV1_P5的进一步优化,实现了30%-60%的神经干细胞标记 | NA | 开发新的遗传修饰方法以重新激活成年神经干细胞的内在脑修复能力 | 成年哺乳动物大脑中的神经干细胞 | 基因治疗 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 177种AAV变体 |
1322 | 2024-08-08 |
T cell dysfunction in glioblastoma: a barrier and an opportunity for the development of successful immunotherapies
2021-12-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000988
PMID:34569985
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研究论文 | 本文探讨了胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的问题,并分析了其在中枢神经系统免疫治疗中的挑战与机遇。 | 通过单细胞RNA测序等全面无偏倚技术,揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤浸润T细胞的转录状态,发现其缺乏典型抗原驱动耗竭的特征,提示需要更好的肿瘤衍生抗原展示。 | 需要进一步研究胶质母细胞瘤肿瘤浸润T细胞功能障碍的自然史,确定这些细胞是否源自中枢神经系统驻留T细胞,以及如何进行治疗性操纵。 | 探索胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的机制,并为开发有效的免疫治疗策略提供新思路。 | 胶质母细胞瘤中的T细胞功能障碍及其在中枢神经系统免疫治疗中的作用。 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
1323 | 2024-08-08 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性,揭示了Smad4调控的成年期星形胶质细胞生成 | 首次揭示了成年期间脑星形胶质细胞的生成及其调控机制,并发现了Smad4在体内外星形胶质细胞增殖和神经球形成中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性及其调控机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个基因表达簇的星形胶质细胞 |
1324 | 2024-08-08 |
Developmental programming and lineage branching of early human telencephalon
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107277
PMID:34558085
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和严格验证,揭示了人类端脑神经元在早期发育过程中的发展路线图 | 首次详细描述了人类端脑背侧和腹侧的放射状胶质细胞(RGs)如何通过中间前体细胞(IPCs_div)和早期有丝分裂后神经元(eNBs)分化成不同类型的神经元 | NA | 阐明人类端脑神经元在早期发育过程中的生成机制 | 人类端脑的背侧和腹侧神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
1325 | 2024-08-08 |
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13128
PMID:34558134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 首次在单细胞分辨率下解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性,揭示了不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 旨在解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性 | 小鼠子宫的接受性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 预接受期和接受期的小鼠子宫样本 |
1326 | 2024-08-08 |
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112213
PMID:34560556
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综述 | 本文通过综述探讨了PD-L1抑制性微小RNA在治疗结直肠癌中的潜在治疗价值,并探讨了基于单细胞测序的生物相容性递送系统 | 提出基于单细胞测序的生物相容性递送系统,以提高微小RNA递送的特异性,减少传统纳米颗粒的毒性,并改善肿瘤微环境 | NA | 探讨PD-L1抑制性微小RNA在结直肠癌治疗中的潜在价值 | PD-L1抑制性微小RNA及其在结直肠癌细胞中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
1327 | 2024-08-08 |
Systematic review on the current knowledge and use of single-cell RNA sequencing in head and neck cancer
2021-Nov, APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/apm.13173
PMID:34561896
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综述 | 本文系统回顾了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的应用和知识现状 | scRNA-seq技术能够在单细胞水平上对肿瘤组织进行遗传学特征分析 | 需要进一步的研究来继续发展和应用scRNA-seq技术 | 回顾scRNA-seq在HNSCC中的应用,并探讨其在临床研究中的潜力 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC) | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 共涉及20名患者 |
1328 | 2024-08-08 |
The histone acetyltransferase HBO1 promotes efficient tip cell sprouting during angiogenesis
2021-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199581
PMID:34550360
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白乙酰转移酶HBO1在血管生成中促进尖端细胞发芽的作用 | 发现HBO1和H3K14ac的缺失影响了发育中的发芽血管生成和病理性内皮细胞过度生长 | NA | 研究HBO1在血管生成中的作用及其对内皮细胞基因表达的影响 | 内皮细胞(ECs)和其在血管生长与重塑中的动态基因表达变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Hbo1缺陷的视网膜内皮细胞 |
1329 | 2024-08-08 |
Mitochondrial respiratory chain function promotes extracellular matrix integrity in cartilage
2021-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2021.101224
PMID:34560099
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析揭示线粒体呼吸链功能对成熟软骨中细胞外基质(ECM)稳态的重要性 | 首次揭示线粒体呼吸链功能与ECM稳态之间的关联,并展示了这种功能障碍对ECM结构和机械稳定性的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探讨线粒体呼吸链功能与软骨中ECM稳态之间的关系 | 软骨组织中的线粒体呼吸链功能和ECM稳态 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),质谱/基质分析,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据 | 涉及1个月大的突变小鼠的股骨头软骨 |
1330 | 2024-08-08 |
The transcriptional characteristics of mast cells derived from skin tissue in type 2 diabetes patients at the single-cell level
2021-Oct, Acta histochemica
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.acthis.2021.151789
PMID:34560403
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研究论文 | 本研究旨在探讨2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征 | 首次在单细胞水平上描述了2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞的特征基因 | 样本量较小,仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者 | 探索2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征,为研究异常葡萄糖代谢下的肥大细胞行为提供实验数据 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的皮肤组织中的肥大细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞cDNA文库 | 共8888个细胞,来自两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者的皮肤组织 |
1331 | 2024-08-08 |
Transitions in development - an interview with Tom Nowakowski
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200084
PMID:34568895
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访谈 | 本文是对加州大学旧金山分校助理教授Tom Nowakowski的访谈,他利用单细胞测序技术研究神经发育 | NA | NA | 了解Tom Nowakowski的职业发展及其作为研究组长的未来计划 | Tom Nowakowski的职业生涯和研究方向 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
1332 | 2024-08-08 |
Synthesized HMGB1 peptide attenuates liver inflammation and suppresses fibrosis in mice
2021-Sep-27, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00177-4
PMID:34565478
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研究论文 | 本文评估了合成HMGB1肽对CCl诱导的肝硬化小鼠模型的治疗效果,发现其能减轻肝脏炎症并抑制纤维化 | 提出了一种新的无细胞治疗方法,使用HMGB1肽诱导抗炎巨噬细胞,用于治疗肝硬化 | 体外分析未能证实HMGB1肽对单核细胞/巨噬细胞的直接影响 | 评估HMGB1肽对肝纤维化的治疗效果 | CCl诱导的肝硬化小鼠模型 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 小鼠 |
1333 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq data and bulk gene profiles reveal a novel signature of disease progression in multiple myeloma
2021-Sep-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02190-6
PMID:34563174
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和批量基因表达谱,揭示了多发性骨髓瘤(MM)发展过程中的新型分子特征 | 本文建立了一个20基因的特征,作为MM的独立生物标志物,并成功预测了接受硼替佐米治疗患者的临床结果 | NA | 揭示多发性骨髓瘤发展的分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞的转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 597个细胞 |
1334 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal DHX9 in mature B cell as a dynamic network biomarker before lymph node metastasis in CRC
2021-Sep-24, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.06.004
PMID:34553035
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了成熟B细胞中的DHX9在结直肠癌(CRC)淋巴结转移前的动态网络生物标志物作用 | 首次发现DHX9在成熟B细胞中作为CRC淋巴结转移前的关键动态网络生物标志物 | NA | 开发预测性生物标志物,以检测CRC淋巴结转移前成熟B细胞的关键转变点 | 结直肠癌患者的邻近组织中的成熟B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 动态网络生物标志物(DNB)方法 | 转录组数据 | 725个来自结直肠癌的B细胞 |
1335 | 2024-08-08 |
Reconstructing and counting genomic fragments through tagmentation-based haploid phasing
2021-09-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97852-w
PMID:34556684
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研究论文 | 本文通过基于标签化的单倍体分型技术,展示了通过新型生物信息学算法重建和计数基因组片段的概念 | 提出了一种新的生物信息学算法,用于检测基因组的离散性质,以准确确定基因拷贝数变化 | 该方法依赖于样本,调用敏感性因样本的倍性而异,并对测序数据中的噪声敏感 | 提高单细胞测序中基因拷贝数变化的准确性,以更好地追踪和理解肿瘤发生 | 癌症细胞的异质性和基因拷贝数变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
1336 | 2024-08-08 |
Epicardial differentiation drives fibro-fatty remodeling in arrhythmogenic cardiomyopathy
2021-Sep-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abf2750
PMID:34550725
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研究论文 | 本文利用人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的心脏培养物、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和移植的人ACM心脏研究了ACM中纤维脂肪重塑的心外膜贡献 | 首次揭示了TFAP2A通过促进上皮间质转化(EMT)介导心外膜分化,从而在ACM中驱动纤维脂肪重塑的关键作用 | NA | 探讨心律失常性心肌病(ACM)中心外膜对纤维脂肪重塑的贡献及其分子机制 | 人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞、单细胞RNA测序数据和ACM患者移植心脏 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 来自ACM患者和健康供体的人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞及ACM患者移植心脏样本 |
1337 | 2024-08-08 |
CCR2 deficiency alters activation of microglia subsets in traumatic brain injury
2021-09-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109727
PMID:34551293
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研究论文 | 研究探讨了CCR2缺乏对创伤性脑损伤中微胶质细胞亚群激活的影响 | 使用无偏倚的单细胞RNA测序方法揭示了创伤性脑损伤和正常脑中的25种微胶质细胞、单核/巨噬细胞和树突状细胞亚群,并发现CCR2缺乏的创伤性脑损伤小鼠与野生型创伤性脑损伤小鼠相比,微胶质细胞亚群的转录谱发生改变 | NA | 定义创伤性脑损伤中微胶质细胞和巨噬细胞表型的异质性,并探索CCR2缺乏对这些细胞的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在创伤性脑损伤中的作用 | NA | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和CCR2缺乏小鼠 |
1338 | 2024-08-08 |
Integrative Transcriptome Profiling Reveals SKA3 as a Novel Prognostic Marker in Non-Muscle Invasive Bladder Cancer
2021-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13184673
PMID:34572901
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析,揭示了SKA3作为非肌肉浸润性膀胱癌的新型预后标志物 | 发现SKA3与非肌肉浸润性膀胱癌的病理生理和不良生存相关,并可能通过抑制其表达来降低膀胱癌进展的风险 | NA | 提高非肌肉浸润性膀胱癌患者临床结果的诊断准确性 | 非肌肉浸润性膀胱癌及其向肌肉浸润性膀胱癌的进展 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个膀胱癌患者队列的公共数据集以及人类肿瘤组织的RNA测序数据 |
1339 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulatory networks from single-cell RNA-seq temporal snapshot data requires higher-order moments
2021-Sep-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100332
PMID:34553172
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研究论文 | 本文探讨了从单细胞RNA测序(scRNA-seq)时间快照数据推断基因调控网络(GRN)的方法,强调了高阶统计量的重要性 | 提出了一种基于高阶统计量的方法来推断基因调控网络,并强调了数据预处理对保留这些统计量的重要性 | 目前的数据预处理可能无法保留这些统计量,且需要计算密集型的最小化解算器 | 开发一种新的方法来从scRNA-seq数据中推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 时间快照数据 | NA |
1340 | 2024-08-08 |
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
2021-09-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62857
PMID:34570087
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研究论文 | 本文提供了一个全面的协议,用于准备人肠道类器官以感染肠道病原体,并考虑感染侧(顶端 vs. 基底侧)进行单细胞RNA测序,以表征细胞类型特异性的宿主/病原体相互作用。 | 本文创新地提出了在生物安全三级(BSL-3)条件下,通过考虑感染侧来准备人肠道类器官以进行单细胞RNA测序的方法。 | 本文未明确提及研究的具体限制。 | 研究肠道病原体感染的细胞类型特异性宿主/病原体相互作用。 | 人肠道类器官及其对肠道病原体感染的反应。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |