单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 1321 | 2024-08-08 |
The Dual Role of Innate Lymphoid and Natural Killer Cells in Cancer. from Phenotype to Single-Cell Transcriptomics, Functions and Clinical Uses
2021-Oct-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13205042
PMID:34680190
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综述 | 本文综述了先天淋巴细胞（ILCs）和自然杀伤细胞（NK细胞）在癌症中的作用，从表型到单细胞转录组学，功能和临床应用 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在研究ILCs和NK细胞转录组水平上的应用 | NA | 总结ILCs和NK细胞在癌症中的分类、功能及其在癌症治疗中的潜在应用 | 先天淋巴细胞（ILCs）和自然杀伤细胞（NK细胞） | 生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1322 | 2024-08-08 |
The molecular mechanisms of inflammation and scarring in the kidneys of immunoglobulin A nephropathy : Gene involvement in the mechanisms of inflammation and scarring in kidney biopsy of IgAN patients
2021-10, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-021-00891-8
PMID:34674036
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研究论文 | 本文旨在描述免疫球蛋白A肾病（IgAN）患者肾活检的转录组特征及潜在的尿液生物标志物 | 引入了单细胞RNA测序技术，克服了以往方法的局限，能够研究整个肾组织而无需解剖肾单位段，并允许更好地分析涉及细胞分化的细胞特异性基因表达 | NA | 探讨免疫球蛋白A肾病中肾损伤的分子机制及潜在的尿液生物标志物 | 免疫球蛋白A肾病患者的肾组织 | 数字病理学 | 肾病 | 实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR）、微阵列、RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用新鲜或冷冻的肾组织、甲醛固定石蜡包埋的肾组织标本 | NA | NA | NA | NA |
| 1323 | 2024-08-08 |
PD-L2 glycosylation promotes immune evasion and predicts anti-EGFR efficacy
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002699
PMID:34697216
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研究论文 | 本文探讨了PD-L2糖基化在免疫逃逸和抗EGFR治疗中的作用及其调控机制 | 首次揭示了PD-L2糖基化与EGFR形成复合物，激活EGFR/STAT3信号通路，降低西妥昔单抗与EGFR的结合亲和力，并通过糖基化修饰稳定PD-L2，促进其与PD-1的结合和免疫逃逸 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步的临床试验验证 | 探究PD-L2糖基化在肿瘤免疫逃逸和抗EGFR治疗中的作用及其调控机制 | PD-L2糖基化在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对西妥昔单抗治疗的影响 | 免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序和免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 包含西妥昔单抗耐药和敏感的头颈部鳞状细胞癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1324 | 2024-08-08 |
Improved SNV Discovery in Barcode-Stratified scRNA-seq Alignments
2021-09-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12101558
PMID:34680953
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研究论文 | 本文评估了从单细胞RNA测序数据中通过细胞条形码分割对齐来发现单核苷酸变异（SNV）的信息增益 | 通过在单细胞水平上对齐数据进行变异调用，识别的SNV数量至少是池化scRNA-seq的两倍，且这些SNV富含新的变异和终止密码子及错义替代 | NA | 评估从单细胞RNA测序数据中通过细胞条形码分割对齐来发现SNV的信息增益 | MCF7细胞系在抗癌治疗期间的数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 公开可用的MCF7细胞系数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1325 | 2024-08-08 |
Tutorial: Guidelines for Single-Cell RT-qPCR
2021-09-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10102607
PMID:34685587
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教程 | 本文提供单细胞反转录定量PCR（scRT-qPCR）方法的全面总结，包括单细胞收集方法的局限性、反转录的重要性、预扩增和引物设计的建议，以及数据处理步骤的总结 | scRT-qPCR方法适用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）实验前的有效筛选或高吞吐量方法假设的验证 | 讨论了单细胞收集方法的局限性 | 提供scRT-qPCR方法的全面指南，使任何研究人员都能进行高标准的scRT-qPCR测量 | 单细胞基因表达分析 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1326 | 2024-08-08 |
Combining Multiple RNA-Seq Data Analysis Algorithms Using Machine Learning Improves Differential Isoform Expression Analysis
2021-Sep-27, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps4040068
PMID:34698224
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研究论文 | 本文开发了一种结合多种RNA测序数据分析算法的新方法，利用机器学习技术提高差异性剪接表达分析的准确性 | 提出了一种新的综合方法，通过机器学习技术整合多种算法，以提高差异性剪接表达分析的性能 | NA | 旨在提高RNA测序数据中差异性剪接表达分析的准确性 | RNA测序数据中的差异性剪接表达 | 机器学习 | NA | RNA-Seq | 机器学习 | RNA测序数据 | 基于多种生物的模拟数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1327 | 2024-08-08 |
Cell-Cell Communication Networks in Tissue: Toward Quantitatively Linking Structure with Function
2021-Sep, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2021.05.002
PMID:34693081
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综述 | 本文综述了利用前沿技术如多重组织成像、活体显微镜和单细胞RNA测序等，量化细胞类型丰度、共定位及受体和配体全局水平的方法，并探讨了构建计算模型以更全面理解细胞间通信网络动态运作的重要性 | 强调了将高级统计方法与低级物理化学机制结合的潜在价值 | 目前仍难以将这些量化数据转化为对细胞间通信网络动态运作的更全面理解 | 旨在通过构建计算模型，更全面地理解细胞间通信网络的功能 | 细胞间通信网络在组织中的动态运作 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1328 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of the aging human and macaque retina
2021-Apr, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa179
PMID:34691611
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研究论文 | 本文提供了一个基于119,520个单细胞的人和猕猴视网膜的综合转录组图谱，涵盖不同年龄段，揭示了视网膜细胞的分子特征和老化过程 | 首次提供了人和猕猴视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了视网膜细胞在不同区域和物种间的特异性，以及人类视网膜老化的区域和细胞类型特异性 | NA | 探究老化灵长类视网膜的分子和细胞过程 | 人类和猕猴的视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 119,520个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1329 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic landscape of human blood cells
2021-Mar, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa180
PMID:34691592
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞RNA测序技术，构建了人类血液细胞的单细胞转录组图谱 | 首次构建了包含编码基因和长非编码RNA（lncRNA）的全面血液细胞转录组参考图谱，并识别了调控造血细胞分化的潜在lncRNA和转录因子 | NA | 提供一个单细胞分辨率的人类血液细胞转录组图谱，为生理和病理造血研究提供全面参考 | 人类血液细胞，包括造血干细胞、前体细胞和成熟血液细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7551个血液细胞，来自21名健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 1330 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic atlas of primate pancreatic islet aging
2021-Feb, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa127
PMID:34691567
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了年轻和老年非糖尿病食蟹猴胰腺胰岛细胞的转录组变化 | 首次揭示了老年β细胞中未折叠蛋白反应（UPR）的增加及其与蛋白聚集物的积累，以及HSP90B1在老年β细胞中的上调 | 研究仅限于非糖尿病食蟹猴，可能不完全适用于其他物种或糖尿病患者 | 解码与胰腺胰岛功能衰退相关的转录组变化，并探讨通过靶向UPR成分来延缓β细胞衰老和预防与年龄相关的糖尿病的可能性 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1331 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals spatiotemporal heterogeneity and malignant progression in pancreatic neuroendocrine tumor
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61717
PMID:34671197
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索胰腺神经内分泌肿瘤的空间时间异质性和恶性进展机制 | 揭示了肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞的功能异质性子群，以及肿瘤进展不同阶段的致癌特征，并开发了定义肿瘤转移潜能的基因签名 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤的异质性和恶性进展机制 | 胰腺神经内分泌肿瘤的细胞异质性和转录状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24,544个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1332 | 2024-08-08 |
Analysis of Cellular Heterogeneity in Immune Microenvironment of Primary Central Nervous System Lymphoma by Single-Cell Sequencing
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.683007
PMID:34671548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）的免疫微环境中的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PCNSL中六种主要细胞群体的异质性及其基因表达特征 | 研究仅限于PCNSL细胞与正常人胎儿脑细胞的比较，未涉及其他类型的脑部肿瘤 | 深入理解PCNSL的肿瘤异质性和分子表型，以改善该疾病的诊断和治疗 | PCNSL细胞及其与正常人胎儿脑细胞的比较 | 数字病理学 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 34,851个PCNSL细胞和21,250个正常人胎儿脑细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1333 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed CD14+ Monocytes Increased in Patients With Takayasu's Arteritis Requiring Surgical Management
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.761300
PMID:34671607
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了需要手术管理的Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组多样性和功能 | 首次揭示了Takayasu动脉炎患者中CD14+单核细胞的增加及其相关基因表达的变化 | 样本量较小，仅包括四名患者和四名健康对照 | 旨在解析Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组，并探索潜在的临床标志物 | Takayasu动脉炎患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共29918个合格细胞，包括四名Takayasu动脉炎患者和四名年龄性别匹配的健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 1334 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Data Analyses Identify B7-H3 as a Novel Prognostic Biomarker and Predict Response to Immune Checkpoint Blockade in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.757047
PMID:34675936
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，确定B7-H3作为头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的新型预后生物标志物，并预测其对免疫检查点阻断的反应 | 首次揭示B7-H3表达与HNSCC肿瘤微环境、免疫治疗反应及预后的关系 | NA | 研究B7-H3在HNSCC中的预后价值及其在促进免疫抑制微环境中的作用 | B7-H3在HNSCC中的表达及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1335 | 2024-08-08 |
Characterizing Intercellular Communication of Pan-Cancer Reveals SPP1+ Tumor-Associated Macrophage Expanded in Hypoxia and Promoting Cancer Malignancy Through Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.749210
PMID:34676217
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了六种癌症类型中的细胞间通讯，特别是缺氧环境下SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 首次在单细胞分辨率下识别并分析了缺氧肿瘤微环境中肿瘤相关非恶性细胞的亚型及其对癌症进展的影响 | 研究仅限于六种癌症类型，且样本量相对有限 | 揭示缺氧肿瘤微环境中不同细胞亚型间的复杂交互机制，并为高比例SPP1+ TAMs患者开发治疗靶点提供指导 | 肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞在缺氧肿瘤微环境中的亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 424,194个单细胞来自108名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1336 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of Glycolytic and Ketone Bodies Metabolic Genes: Implications for Response to Ketogenic Dietary Therapy
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.689068
PMID:34692477
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GEO和CCLE数据库中的RNA-seq和微阵列数据，探讨了33种癌症类型中糖酵解和酮体代谢途径基因的表达模式，并识别出可能预测酮饮食疗法反应的代谢亚型。 | 首次系统性地分析了糖酵解和酮体代谢途径基因在多种癌症类型中的表达模式，并识别出与临床结果相关的代谢亚型，这些亚型可能作为预测酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 研究主要基于数据库中的现有数据，需要在更多实验中验证这些代谢亚型的预测价值。 | 旨在识别和验证基于糖酵解和酮体代谢的代谢亚型，作为预测癌症对酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 33种癌症类型的糖酵解和酮体代谢途径基因表达模式及代谢亚型。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个肿瘤样本和近1,000个癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 1337 | 2024-08-08 |
Cardiac Resident Macrophages Prevent Fibrosis and Stimulate Angiogenesis
2021-12-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.319737
PMID:34645281
|
研究论文 | 本研究探讨了心脏常驻巨噬细胞在心脏压力超负荷早期肥大反应中的作用 | 首次证实心脏常驻免疫细胞在心脏压力超负荷早期肥大发展中的影响 | NA | 评估心脏免疫细胞在心脏压力超负荷引起的早期肥大反应中的作用 | 心脏常驻巨噬细胞在心脏压力超负荷早期肥大反应中的作用 | NA | 心血管疾病 | Cite-Seq单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个假手术心脏和6个TAC心脏 | NA | NA | NA | NA |
| 1338 | 2024-08-08 |
Tet2 deficiency in immune cells exacerbates tumor progression by increasing angiogenesis in a lung cancer model
2021-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15165
PMID:34657351
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研究论文 | 本文通过小鼠肺癌模型研究了Tet2缺陷免疫细胞在肿瘤组织中的活性，发现Tet2缺陷的髓系细胞通过增加S100a8/S100a9表达促进肿瘤血管生成，从而加剧肿瘤进展。 | 首次揭示了TET2突变通过增加S100a8/S100a9表达促进肺癌进展的机制，并提出Emmprin抗体可能作为肺癌治疗的新靶点。 | NA | 评估Tet2缺陷免疫细胞在肺癌模型中的活性及其对肿瘤进展的影响。 | 小鼠肺癌模型中的Tet2缺陷免疫细胞及其对肿瘤生长的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 小鼠肺癌模型中的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1339 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell genomics pipelines to discover mechanisms of stem cell differentiation
2021-12, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2021.09.006
PMID:34657800
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在干细胞科学中的应用，重点讨论了通过多重单细胞分析扩大干细胞分化的策略，以及使用新的分析算法评估细胞分化的分子调控 | 本文介绍了集成和投影分析方法，用于分类和基准测试干细胞衍生物与体内细胞类型 | NA | 评估单细胞转录组学方法在干细胞科学中的应用，并讨论开发集成分析管道的策略 | 单细胞转录组学方法及其在干细胞分化研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1340 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in lung adenocarcinoma
2021-12, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-02054-3
PMID:34663877
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了十例人肺腺癌和十例正常对照组织的肿瘤微环境，揭示了两种不同的微环境模式及其与预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了肺腺癌的肿瘤微环境，并识别出两种具有不同预后意义的微环境模式 | 研究样本量较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 深入了解肺腺癌的肿瘤微环境特征，为精准医疗提供依据 | 肺腺癌及其正常对照组织的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十例肺腺癌和十例正常对照组织 | NA | NA | NA | NA |