单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2024-08-08 |
CDC26 is a key factor in human oocyte aging
2021-11-18, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deab217
PMID:34590680
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研究论文 | 本研究探讨了CDC26在人类卵母细胞老化中的关键作用，发现CDC26的缺乏会扰乱卵母细胞成熟过程，导致卵母细胞老化，但这些缺陷可以通过CDC26蛋白的过度表达部分挽救 | 首次揭示了CDC26在人类卵母细胞老化中的关键作用，并证明了CDC26蛋白的过度表达可以部分挽救老化卵母细胞的缺陷 | 研究需要进一步探讨其他信号通路是否通过CDC26调节卵母细胞成熟，以及哪些基因是CDC26的直接分子靶点 | 探讨CDC26在人类卵母细胞老化中的作用 | 人类卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序技术，q-PCR，免疫细胞化学分析，转染技术 | NA | RNA | 年轻和老年女性的卵母细胞，KM雌性小鼠的卵母细胞，老年女性的卵母细胞 |
| 1302 | 2024-08-08 |
NK and CD8+ T cell phenotypes predict onset and control of CMV viremia after kidney transplant
2021-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153175
PMID:34609965
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研究论文 | 本研究分析了31名肾移植受者在CMV病毒血症前后的NK和CD8+ T细胞表型变化 | 首次详细描述了肾移植受者在CMV病毒血症前后NK和CD8+ T细胞的表型变化及其与病毒控制的关系 | 样本量相对较小，且仅限于肾移植受者 | 深入了解免疫功能受损导致CMV再激活的机制，指导抗病毒治疗并评估CMV对实体器官移植结果的影响 | 肾移植受者的NK和CD8+ T细胞表型及其与CMV病毒血症的关系 | 免疫学 | 器官移植 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, Luminex | NA | 细胞, 蛋白质 | 31名肾移植受者 |
| 1303 | 2024-08-08 |
Sciviewer enables interactive visual interrogation of single-cell RNA-Seq data from the Python programming environment
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab689
PMID:34601589
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Sciviewer的工具，该工具允许在Python编程环境中进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据的交互式可视化分析 | Sciviewer实现了一种新方法，用于识别嵌入中沿用户指定方向局部变化的基因，并支持在Python环境中快速灵活地迭代交互式和编程式scRNA-Seq探索模式 | 现有的交互式工具在实际应用中受限，因为它们不支持数据和结果在编程环境中的快速移动，打断了迭代过程 | 开发一种工具，以克服现有工具在scRNA-Seq数据分析中的局限性，提高分析效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 数据嵌入（如UMAP或tSNE） | NA |
| 1304 | 2024-08-08 |
Electromagnetized gold nanoparticles improve neurogenesis and cognition in the aged brain
2021-11, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 研究显示电磁化金纳米颗粒（AuNPs）能促进老年小鼠海马体中的神经发生，从而改善认知功能和记忆巩固 | 首次证明电磁化金纳米颗粒能显著增加神经干细胞和神经前体细胞的数量，并通过激活Kat2a促进组蛋白H3K9乙酰化，有效增加老年小鼠海马体的神经发生 | NA | 探索电磁化金纳米颗粒作为治疗与年龄相关脑疾病的新疗法 | 老年小鼠和Hutchinson-Gilford早衰症小鼠 | NA | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠和Hutchinson-Gilford早衰症小鼠 |
| 1305 | 2024-08-08 |
The landscape of tumor cell states and ecosystems in diffuse large B cell lymphoma
2021-10-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.08.011
PMID:34597589
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研究论文 | 本研究利用机器学习框架EcoTyper，通过整合转录组反卷积和单细胞RNA测序技术，对弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）中的肿瘤细胞状态和生态系统进行了系统性解析 | 首次大规模解析DLBCL中的肿瘤细胞状态及其临床相关性，并揭示了肿瘤微环境中的细胞状态交互作用 | NA | 解析弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境，并识别治疗靶点 | 弥漫大B细胞淋巴瘤中的肿瘤细胞状态和生态系统 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 转录组反卷积和单细胞RNA测序 | 机器学习框架EcoTyper | 转录组数据 | NA |
| 1306 | 2024-08-08 |
Resolving the intertwining of inflammation and fibrosis in human heart failure at single-cell level
2021-10-03, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-021-00897-1
PMID:34601654
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和单T细胞受体测序，研究了人类扩张型心肌病和缺血性心肌病心脏中的炎症和纤维化机制 | 首次在单细胞水平上解析了炎症和纤维化在心力衰竭中的交织机制，并鉴定了一个新的转录因子AEBP1作为ACTA2肌成纤维细胞中的关键心脏纤维化调节因子 | NA | 旨在详细解码白细胞和非心肌细胞的基因表达扰动和细胞间相互作用，以理解心力衰竭中特定细胞类型的病理 | 人类扩张型心肌病和缺血性心肌病心脏中的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 200,615个细胞 |
| 1307 | 2024-08-08 |
A single-cell interactome of human tooth germ from growing third molar elucidates signaling networks regulating dental development
2021-Oct-02, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00691-5
PMID:34600587
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正在生长的第三磨牙中的人类牙胚细胞互作网络，揭示了调控牙发育的关键信号通路 | 首次构建了人类牙胚细胞间的完整信号网络，为未来的牙再生工程和口腔病理学理解奠定了基础 | NA | 揭示调控牙发育的细胞间信号网络 | 人类牙胚细胞及其信号分子 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 正在生长的第三磨牙中的牙胚细胞 |
| 1308 | 2024-08-08 |
Cancer cell states and emergent properties of the dynamic tumor system
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.275308.121
PMID:34599005
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研究论文 | 本文定义了癌症细胞状态，并探讨了这些状态在肿瘤系统中的起源、动态变化及其对整个肿瘤系统的影响 | 通过单细胞转录组学技术识别了不同癌症类型中的特定癌症细胞状态，并探讨了这些状态的功能相关性和对肿瘤系统的优势 | 尚未完全揭示癌症细胞状态的起源和动态变化的机制 | 揭示癌症细胞状态在肿瘤发生中的作用及其对肿瘤适应性的贡献，并寻找可用于治疗的弱点 | 癌症细胞状态及其在肿瘤系统中的功能和优势 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1309 | 2024-08-08 |
Dual checkpoint blockade of CD47 and PD-L1 using an affinity-tuned bispecific antibody maximizes antitumor immunity
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003464
PMID:34599020
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研究论文 | 本文开发了一种新型亲和力调节的双特异性抗体，针对CD47和PD-L1，以拮抗先天性和适应性免疫检查点途径，从而最大化抗肿瘤免疫 | 设计了一种针对CD47和PD-L1的双特异性抗体，具有对PD-L1的高亲和力和对CD47的中等亲和力，以实现对肿瘤微环境中表达PD-L1的肿瘤和骨髓细胞的优先结合 | 大多数患者对T细胞检查点免疫疗法仍然不响应 | 提高抗体选择性和治疗窗口，改善患者对免疫疗法的响应 | CD47和PD-L1双特异性抗体的设计、机制及其在肿瘤模型中的效果 | 免疫疗法 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 双特异性抗体 | RNA | NA |
| 1310 | 2024-08-08 |
Antitumor immune effects of preoperative sitravatinib and nivolumab in oral cavity cancer: SNOW window-of-opportunity study
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003476
PMID:34599023
|
研究论文 | 本研究评估了术前使用sitravatinib和nivolumab在口腔癌中的免疫和分子效应 | sitravatinib与nivolumab联合使用在口腔癌中显示出深层的临床和病理反应，并揭示了患者具有不同的肿瘤生物学行为 | NA | 评估sitravatinib和nivolumab在口腔癌中的免疫和分子效应 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 图像 | 10名患者 |
| 1311 | 2024-08-08 |
Enhancer-associated H3K4 methylation safeguards in vitro germline competence
2021-10-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26065-6
PMID:34599190
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了体外胚胎干细胞向原始生殖细胞分化的过程中，增强子相关的H3K4甲基化在维持生殖能力中的作用 | 首次揭示了H3K4me1在增强子功能中的非必需性，但能促进增强子的（再）激活和基因表达程序的建立，特别是在特定的发育转变中 | NA | 探究增强子相关的H3K4甲基化在体外生殖能力维持中的作用 | 体外胚胎干细胞向原始生殖细胞分化的过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个阶段的体外PGCLC分化系统的细胞 |
| 1312 | 2024-08-08 |
High-throughput single-cell transcriptomics reveals the female germline differentiation trajectory in Arabidopsis thaliana
2021-10-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02676-z
PMID:34599277
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了拟南芥中雌性生殖细胞分化轨迹的分子基础 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细描绘了拟南芥雌性生殖细胞分化过程中的基因表达动态变化 | NA | 探究开花植物中雌性生殖细胞从体细胞分化为特化生殖器官的分子机制 | 拟南芥的雌性生殖细胞及其周围细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16,872个单细胞 |
| 1313 | 2024-08-08 |
SEAM is a spatial single nuclear metabolomics method for dissecting tissue microenvironment
2021-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01276-3
PMID:34608315
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEAM的空间单核代谢组学方法，该方法结合高空间分辨率成像质谱和一系列计算算法，能够显示多尺度和多色组织断层扫描，并通过单核的代谢指纹进行识别和聚类。 | SEAM方法能够探索单细胞水平的空间代谢特征和组织组织学，为理解组织代谢组织提供了更深入的视角。 | NA | 开发和验证一种新的空间单核代谢组学方法，以深入理解组织代谢组织。 | SEAM方法在野生型小鼠组织和人类纤维化肝脏中的应用。 | 代谢组学 | NA | 成像质谱 | NA | 图像 | 包括多种野生型小鼠组织和人类纤维化肝脏样本 |
| 1314 | 2024-08-08 |
A harmonized atlas of mouse spinal cord cell types and their spatial organization
2021-09-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25125-1
PMID:34588430
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研究论文 | 本文基于单细胞转录组数据生成小鼠脊髓细胞类型图谱，整合现有数据集到一个共同的参考框架中 | 首次整合了小鼠脊髓细胞类型的单细胞RNA测序数据，并开发了一个开源的细胞类型分类器SeqSeek | NA | 研究小鼠脊髓细胞类型的分子多样性和空间组织 | 小鼠脊髓细胞类型及其基因表达特征和分子组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1315 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals markers of disease progression in primary cutaneous T-cell lymphoma
2021-09-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-021-01419-2
PMID:34583709
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了原发性皮肤T细胞淋巴瘤中疾病进展的标志物 | 发现了与疾病进展相关的特定生物标志物面板，这些标志物的表达变化可能解释了晚期MF临床表型的转变 | NA | 揭示原发性皮肤T细胞淋巴瘤中疾病进展的生物标志物 | 早期和晚期MF患者的皮肤样本，以及非病变MF和健康对照皮肤 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1316 | 2024-08-08 |
Multi-species single-cell transcriptomic analysis of ocular compartment regulons
2021-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25968-8
PMID:34584087
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研究论文 | 本文构建了人类和小猪眼部的首个单细胞图谱，并研究了视网膜的种间差异，识别了虹膜组织中的假定成体干细胞，创建了眼部各部分疾病相关的基因图谱，并探讨了不同细胞群的调控网络。 | 首次构建了人类和小猪眼部的单细胞图谱，识别了虹膜中的假定成体干细胞，创建了眼部疾病基因图谱，并揭示了眼部细胞类型间的独特信号传导。 | NA | 研究跨物种视网膜的整合性研究，并探讨眼部不同细胞群的调控网络。 | 人类和小猪的眼部组织，特别是视网膜和虹膜。 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小猪的眼部组织样本 |
| 1317 | 2024-08-08 |
Confronting false discoveries in single-cell differential expression
2021-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25960-2
PMID:34584091
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学中差异表达分析方法的性能及其对生物学重复变异的考虑 | 揭示了不同方法在考虑生物学重复变异方面的差异，并指出了广泛使用的方法在缺乏生物学差异时可能产生大量假阳性的问题 | 文章未明确提及具体的方法局限性 | 旨在阐明单细胞差异表达分析中统计方法的性能和区分原则 | 研究对象为受伤的小鼠脊髓中的差异表达基因 | 单细胞转录组学 | NA | 差异表达分析 | NA | 转录组数据 | 研究未明确提及样本数量 |
| 1318 | 2024-08-08 |
Integration and gene co-expression network analysis of scRNA-seq transcriptomes reveal heterogeneity and key functional genes in human spermatogenesis
2021-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-98267-3
PMID:34580317
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研究论文 | 本研究通过整合多个正常生精过程的scRNA-seq数据集，分析了超过33,000个睾丸细胞的单细胞转录组，以揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，通过加权基因共表达网络分析揭示了精子发生过程中不同阶段的关键基因，为男性不育提供了新的见解 | NA | 揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 人类精子发生过程中的睾丸细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过33,000个睾丸细胞 |
| 1319 | 2024-08-08 |
Nuclei Isolation from Adult Mouse Kidney for Single-Nucleus RNA-Sequencing
2021-09-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62901
PMID:34605813
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠肾脏中分离细胞核并进行单核RNA测序的方法 | 该方法避免了传统酶解组织分离方法的局限，如需要新鲜组织、引入转录应激反应以及过度代表肾皮质细胞等问题 | NA | 旨在改进肾脏研究中单细胞转录组学的标准化方法 | 成年小鼠肾脏细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA | 从包含皮质、外髓和内髓的中央小鼠肾脏部分分离的细胞核 |
| 1320 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomes Reveal Characteristics of MicroRNAs in Gene Expression Noise Reduction
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.05.002
PMID:34606979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了微小RNA（miRNA）在减少小鼠细胞mRNA水平基因表达噪声中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，证明了miRNA在减少基因表达噪声中的作用，并构建了后转录调控的物理模型，通过合成基因电路观察，展示了miRNA目标加速降解与转录激活对抵抗外部波动的贡献 | NA | 探究miRNA在减少基因表达噪声中的作用及其机制 | 小鼠细胞中的miRNA及其目标基因 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | 物理模型 | RNA表达谱 | NA |