单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2886 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic atlas of primate pancreatic islet aging
2021-Feb, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa127
PMID:34691567
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了年轻和老年非糖尿病食蟹猴胰腺胰岛细胞的转录组变化 | 首次揭示了老年β细胞中未折叠蛋白反应（UPR）的增加及其与蛋白聚集物的积累，以及HSP90B1在老年β细胞中的上调 | 研究仅限于非糖尿病食蟹猴，可能不完全适用于其他物种或糖尿病患者 | 解码与胰腺胰岛功能衰退相关的转录组变化，并探讨通过靶向UPR成分来延缓β细胞衰老和预防与年龄相关的糖尿病的可能性 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年非糖尿病食蟹猴的胰腺胰岛细胞 |
| 1242 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals spatiotemporal heterogeneity and malignant progression in pancreatic neuroendocrine tumor
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61717
PMID:34671197
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索胰腺神经内分泌肿瘤的空间时间异质性和恶性进展机制 | 揭示了肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞的功能异质性子群，以及肿瘤进展不同阶段的致癌特征，并开发了定义肿瘤转移潜能的基因签名 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤的异质性和恶性进展机制 | 胰腺神经内分泌肿瘤的细胞异质性和转录状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24,544个细胞 |
| 1243 | 2024-08-08 |
Analysis of Cellular Heterogeneity in Immune Microenvironment of Primary Central Nervous System Lymphoma by Single-Cell Sequencing
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.683007
PMID:34671548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）的免疫微环境中的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PCNSL中六种主要细胞群体的异质性及其基因表达特征 | 研究仅限于PCNSL细胞与正常人胎儿脑细胞的比较，未涉及其他类型的脑部肿瘤 | 深入理解PCNSL的肿瘤异质性和分子表型，以改善该疾病的诊断和治疗 | PCNSL细胞及其与正常人胎儿脑细胞的比较 | 数字病理学 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 34,851个PCNSL细胞和21,250个正常人胎儿脑细胞 |
| 1244 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed CD14+ Monocytes Increased in Patients With Takayasu's Arteritis Requiring Surgical Management
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.761300
PMID:34671607
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了需要手术管理的Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组多样性和功能 | 首次揭示了Takayasu动脉炎患者中CD14+单核细胞的增加及其相关基因表达的变化 | 样本量较小，仅包括四名患者和四名健康对照 | 旨在解析Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组，并探索潜在的临床标志物 | Takayasu动脉炎患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共29918个合格细胞，包括四名Takayasu动脉炎患者和四名年龄性别匹配的健康捐赠者 |
| 1245 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Data Analyses Identify B7-H3 as a Novel Prognostic Biomarker and Predict Response to Immune Checkpoint Blockade in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.757047
PMID:34675936
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，确定B7-H3作为头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的新型预后生物标志物，并预测其对免疫检查点阻断的反应 | 首次揭示B7-H3表达与HNSCC肿瘤微环境、免疫治疗反应及预后的关系 | NA | 研究B7-H3在HNSCC中的预后价值及其在促进免疫抑制微环境中的作用 | B7-H3在HNSCC中的表达及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 1246 | 2024-08-08 |
Characterizing Intercellular Communication of Pan-Cancer Reveals SPP1+ Tumor-Associated Macrophage Expanded in Hypoxia and Promoting Cancer Malignancy Through Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.749210
PMID:34676217
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了六种癌症类型中的细胞间通讯，特别是缺氧环境下SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 首次在单细胞分辨率下识别并分析了缺氧肿瘤微环境中肿瘤相关非恶性细胞的亚型及其对癌症进展的影响 | 研究仅限于六种癌症类型，且样本量相对有限 | 揭示缺氧肿瘤微环境中不同细胞亚型间的复杂交互机制，并为高比例SPP1+ TAMs患者开发治疗靶点提供指导 | 肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞在缺氧肿瘤微环境中的亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 424,194个单细胞来自108名患者 |
| 1247 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of Glycolytic and Ketone Bodies Metabolic Genes: Implications for Response to Ketogenic Dietary Therapy
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.689068
PMID:34692477
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GEO和CCLE数据库中的RNA-seq和微阵列数据，探讨了33种癌症类型中糖酵解和酮体代谢途径基因的表达模式，并识别出可能预测酮饮食疗法反应的代谢亚型。 | 首次系统性地分析了糖酵解和酮体代谢途径基因在多种癌症类型中的表达模式，并识别出与临床结果相关的代谢亚型，这些亚型可能作为预测酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 研究主要基于数据库中的现有数据，需要在更多实验中验证这些代谢亚型的预测价值。 | 旨在识别和验证基于糖酵解和酮体代谢的代谢亚型，作为预测癌症对酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 33种癌症类型的糖酵解和酮体代谢途径基因表达模式及代谢亚型。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个肿瘤样本和近1,000个癌细胞系 |
| 1248 | 2024-08-08 |
Cardiac Resident Macrophages Prevent Fibrosis and Stimulate Angiogenesis
2021-12-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.319737
PMID:34645281
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研究论文 | 本研究探讨了心脏常驻巨噬细胞在心脏压力超负荷早期肥大反应中的作用 | 首次证实心脏常驻免疫细胞在心脏压力超负荷早期肥大发展中的影响 | NA | 评估心脏免疫细胞在心脏压力超负荷引起的早期肥大反应中的作用 | 心脏常驻巨噬细胞在心脏压力超负荷早期肥大反应中的作用 | NA | 心血管疾病 | Cite-Seq单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4个假手术心脏和6个TAC心脏 |
| 1249 | 2024-08-08 |
Tet2 deficiency in immune cells exacerbates tumor progression by increasing angiogenesis in a lung cancer model
2021-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15165
PMID:34657351
|
研究论文 | 本文通过小鼠肺癌模型研究了Tet2缺陷免疫细胞在肿瘤组织中的活性，发现Tet2缺陷的髓系细胞通过增加S100a8/S100a9表达促进肿瘤血管生成，从而加剧肿瘤进展。 | 首次揭示了TET2突变通过增加S100a8/S100a9表达促进肺癌进展的机制，并提出Emmprin抗体可能作为肺癌治疗的新靶点。 | NA | 评估Tet2缺陷免疫细胞在肺癌模型中的活性及其对肿瘤进展的影响。 | 小鼠肺癌模型中的Tet2缺陷免疫细胞及其对肿瘤生长的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 小鼠肺癌模型中的免疫细胞 |
| 1250 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell genomics pipelines to discover mechanisms of stem cell differentiation
2021-12, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2021.09.006
PMID:34657800
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在干细胞科学中的应用，重点讨论了通过多重单细胞分析扩大干细胞分化的策略，以及使用新的分析算法评估细胞分化的分子调控 | 本文介绍了集成和投影分析方法，用于分类和基准测试干细胞衍生物与体内细胞类型 | NA | 评估单细胞转录组学方法在干细胞科学中的应用，并讨论开发集成分析管道的策略 | 单细胞转录组学方法及其在干细胞分化研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1251 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct tumor microenvironmental patterns in lung adenocarcinoma
2021-12, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-02054-3
PMID:34663877
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了十例人肺腺癌和十例正常对照组织的肿瘤微环境，揭示了两种不同的微环境模式及其与预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了肺腺癌的肿瘤微环境，并识别出两种具有不同预后意义的微环境模式 | 研究样本量较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 深入了解肺腺癌的肿瘤微环境特征，为精准医疗提供依据 | 肺腺癌及其正常对照组织的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 十例肺腺癌和十例正常对照组织 |
| 1252 | 2024-08-08 |
Identification and characterization of distinct cell cycle stages in cardiomyocytes using the FUCCI transgenic system
2021-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2021.112880
PMID:34655601
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研究论文 | 本研究利用FUCCI转基因系统在小鼠模型中识别和表征心肌细胞在不同细胞周期阶段的特征 | 首次使用FUCCI系统在单细胞分辨率下研究心肌细胞的细胞周期活动，并生成特定于细胞分裂和内复制的心肌细胞转录组图谱 | NA | 理解心肌细胞增殖向内复制和细胞周期停滞转变的调控机制，并开发再生疗法 | 心肌细胞在不同细胞周期阶段的特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | FUCCI转基因小鼠模型 | 转录组数据 | 新生小鼠的心肌细胞在出生后第0天和第7天 |
| 1253 | 2024-08-08 |
KLF17 promotes human naïve pluripotency but is not required for its establishment
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199378
PMID:34661235
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研究论文 | 研究探讨了锌指蛋白KLF17在人类原始多能性中的作用，发现KLF17在人类胚胎发育中与NANOG和SOX2共同表达，并通过增益和失能分析揭示KLF17在体外条件下对原始多能性的建立是充分的但非必需的。 | 首次揭示KLF17在人类原始多能性中的作用，表明其在体外条件下对原始多能性的建立是充分的但非必需的。 | 研究主要集中在体外条件下，可能无法完全反映KLF17在体内环境中的作用。 | 探讨KLF17在人类原始多能性中的作用及其在胚胎发育中的表达模式。 | 人类胚胎干细胞（hESCs）和人类胚胎发育过程中的KLF17表达。 | NA | NA | 单细胞转录组学分析，CRISPR-Cas9介导的基因敲除 | NA | 转录组数据 | 涉及人类胚胎干细胞和人类胚胎发育样本 |
| 1254 | 2024-08-08 |
CD4+ T cells contribute to neurodegeneration in Lewy body dementia
2021-Nov-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf7266
PMID:34648304
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研究论文 | 本文研究了CD4+ T细胞在路易体痴呆（LBD）中的神经退行性作用及其机制 | 首次揭示了CD4+ T细胞在LBD中的神经退行性作用，并提出了CXCR4-CXCL12信号通路作为潜在的治疗靶点 | NA | 探讨适应性免疫系统在路易体痴呆中的作用及其机制 | CD4+ T细胞在路易体痴呆中的作用及其机制 | NA | 路易体痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 脑脊液 | NA |
| 1255 | 2024-08-08 |
Human resident memory T cells exit the skin and mediate systemic Th2-driven inflammation
2021-11-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210417
PMID:34643646
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研究论文 | 本文通过基因分型、数学建模、单细胞转录组学和功能分析，研究了接受异基因造血干细胞移植患者皮肤中的组织驻留记忆T细胞（TRMs）在血液中的迁移及其在移植物抗宿主病（GVHD）中的作用。 | 首次在人类模型中检测到具有TRM表型的循环皮肤来源T细胞（cTRMs），并揭示了其在GVHD中的潜在作用。 | NA | 研究皮肤TRMs在血液中的迁移及其在系统性炎症中的作用。 | 接受异基因造血干细胞移植患者的皮肤和血液T细胞。 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 基因分型、数学建模、单细胞转录组学 | NA | 血液和皮肤T细胞 | 接受异基因造血干细胞移植的患者 |
| 1256 | 2024-08-08 |
Obesity Impairs Embryonic Myogenesis by Enhancing BMP Signaling within the Dermomyotome
2021-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202102157
PMID:34647690
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了母体肥胖（MO）对胚胎发育中肌肉生成过程的影响 | 首次详细研究了母体肥胖对胚胎器官生成初期的影响，并揭示了通过增强BMP信号通路导致肌肉分化障碍的机制 | 研究主要集中在胚胎发育的特定阶段（E9.5），可能需要进一步研究不同发育阶段的影响 | 探讨母体肥胖对胚胎肌肉生成的影响及其分子机制 | 母体肥胖对胚胎肌肉生成的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞转录组分析（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 胚胎日9.5（E9.5）的小鼠胚胎 |
| 1257 | 2024-08-08 |
Spatially confined sub-tumor microenvironments in pancreatic cancer
2021-10-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.09.022
PMID:34644529
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研究论文 | 本文通过大规模整合组织学引导的区域多组学数据与临床数据和患者来源的临床前模型，解析了人类胰腺肿瘤微环境（TME）中的空间限制性亚肿瘤微环境（subTMEs）。 | 本文发现了基于成纤维细胞可塑性的组织学可定义的组织状态，这些状态与肿瘤免疫、亚型、分化和治疗反应有区域性关系。 | NA | 研究肿瘤微环境如何推动恶性进展中的肿瘤内异质性。 | 人类胰腺肿瘤微环境及其亚微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多组学 | NA | 组织学数据 | 大规模数据集 |
| 1258 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis identifies a cancer associated fibroblast-related signature for predicting prognosis and therapeutic responses in colorectal cancer
2021-Oct-20, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02252-9
PMID:34670584
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与癌症相关成纤维细胞（CAF）相关的预后标志物，用于预测结直肠癌（CRC）的预后和治疗反应。 | 本文首次构建了一个基于CAF的九基因预后标志物，并验证了其在不同数据集中的有效性，为抗CAF免疫治疗策略提供了新的基因组学证据。 | NA | 构建一个与癌症相关成纤维细胞（CAF）相关的预后标志物，用于预测结直肠癌（CRC）的预后和治疗反应。 | 结直肠癌（CRC）及其相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，批量基因表达数据分析 | Cox回归模型，LASSO分析 | 基因表达数据 | 训练集308例，验证集133例，总TCGA数据集441例，GSE39582数据集470例，GSE17536数据集177例，组织微阵列包含80例结肠癌样本 |
| 1259 | 2024-08-08 |
Inherent hepatocytic heterogeneity determines expression and retention of edited F9 alleles post-AAV/CRISPR infusion
2021-10-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2110887118
PMID:34649996
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研究论文 | 本文研究了使用CRISPR/AAV载体进行体内肝细胞基因编辑以治疗血友病B，并探讨了治疗相关炎症的影响。 | 首次报道了通过单次DNA切割介导的长距离替换恢复携带调节和编码缺陷的突变基因的FIX编码功能，并使用合成增强子/启动子模拟物P2确保FIX水平提升至临床有意义的水平。 | 文章未详细讨论现有治疗方法在复杂突变情况下的局限性。 | 研究使用CRISPR/AAV载体进行体内基因编辑治疗血友病B的可行性和效果。 | 研究对象为携带复杂突变的严重血友病B小鼠模型。 | 基因编辑 | 血友病 | CRISPR/AAV载体，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 1260 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics reveals a role for sensory nerves in preserving cranial suture patency through modulation of BMP/TGF-β signaling
2021-10-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2103087118
PMID:34663698
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研究论文 | 本文研究了感觉神经通过调节BMP/TGF-β信号传导在维持颅缝开放中的作用 | 首次揭示了感觉神经通过FSTL1等信号分子调节颅骨模式化的机制 | NA | 探讨感觉神经在颅骨模式化和颅缝开放中的作用 | 颅骨发育中的感觉神经和间充质前体细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了野生型小鼠的背根神经节(DRG)和间充质前体细胞进行体外共培养 |