单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2024-08-08 |
Recovery of strain-resolved genomes from human microbiome through an integration framework of single-cell genomics and metagenomics
2021-10-12, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-021-01152-4
PMID:34641955
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研究论文 | 本文介绍了一种结合单细胞基因组学和宏基因组学的框架，称为单细胞宏基因组学（sc-metagenomics），用于从微生物群落中重建具有菌株水平分辨率的基因组 | 提出的SMAGLinker框架通过使用微流控技术生成的单细胞扩增基因组（SAGs）作为分箱指南，并与宏基因组装基因组（MAGs）整合，从而恢复改进的草图基因组 | NA | 开发一种新的方法从微生物群落中获取高质量的参考基因组，以更好地理解未培养微生物的系统发育和功能 | 人类微生物群落中的微生物基因组 | 宏基因组学 | NA | 单细胞基因组学，宏基因组学 | NA | 基因组数据 | 103个肠道微生物基因组和45个皮肤微生物基因组 |
| 1242 | 2024-08-08 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
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研究论文 | 本文介绍了一种从鼠颈动脉腔内分离内皮细胞的方法，用于单细胞多组学实验 | 采用腔内消化法获取富含内皮细胞的单细胞制备物，有助于理解血流对内皮细胞的影响 | NA | 研究血流扰动对内皮细胞基因表达的影响 | 鼠颈动脉的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、单细胞转座酶可及染色质测序（scATACseq） | NA | 单细胞数据 | 使用鼠颈动脉进行实验，包括手术后的左颈动脉和右颈动脉作为对照 |
| 1243 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals antitumor characteristics of intratumoral immune cells in old mice
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002809
PMID:34642245
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和耦合T细胞受体（TCR）测序分析，揭示了老年小鼠肿瘤内浸润免疫细胞的抗肿瘤特性 | 发现老年小鼠肿瘤中效应免疫细胞比例显著较高，这些细胞有助于抵抗肿瘤进展 | NA | 深入理解老年个体如何防御肿瘤侵袭 | 年轻和老年小鼠的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，TCR测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的免疫细胞样本 |
| 1244 | 2024-08-08 |
MET overexpression contributes to STAT4-PD-L1 signaling activation associated with tumor-associated, macrophages-mediated immunosuppression in primary glioblastomas
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002451
PMID:34667077
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研究论文 | 本文研究了MET过表达在原发性胶质母细胞瘤中通过STAT4-PD-L1信号通路激活与肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制的关系 | 首次详细探讨了MET基因在原发性胶质母细胞瘤中逃避免疫监视检查点的能力，并揭示了MET-STAT4-PD-L1轴与肿瘤相关巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的作用 | NA | 探讨MET表达与胶质瘤微环境的关系，并通过生存分析理解MET在临床实践中的潜在意义 | 原发性胶质瘤样本中的MET表达及其与PD-L1和STAT通路的关系 | 数字病理学 | 脑瘤 | 多组学数据分析 | NA | RNA表达数据 | 1243个原发性胶质瘤样本 |
| 1245 | 2024-08-08 |
[An optimized protocol of meniscus cell extraction for single-cell RNA sequencing]
2021-Aug-31, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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研究论文 | 本文优化了半月板细胞提取协议，以提高细胞悬液制备效率并保持高细胞活力，用于单细胞RNA测序。 | 提出了一个优化的半月板细胞提取协议，相比常规方法能获得更多细胞且细胞活力更高。 | NA | 优化半月板细胞提取协议，以提高单细胞RNA测序的效率和细胞活力。 | 半月板细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 超过1×10^5个细胞 |
| 1246 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Approaches for Tracing T Cell Development
2021-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100408
PMID:34644259
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在追踪T细胞发育中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的分辨率，以分析细胞身份及其基因表达程序 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何提供对T细胞发育的深入见解 | T细胞发育过程中的细胞身份和基因表达程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1247 | 2024-08-08 |
[Research progress in the identification and lineage differentiation of skeletal stem cell]
2021-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文综述了骨骼干细胞（SSC）的鉴定、时空分布和功能特性的研究进展 | 讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在骨骼干细胞鉴定和功能研究中的应用 | NA | 阐明骨骼干细胞的特性，为干细胞治疗提供新的见解 | 骨骼干细胞的鉴定、时空分布和功能特性 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1248 | 2024-08-08 |
Full-Length Transcriptome: A Reliable Alternative for Single-Cell RNA-Seq Analysis in the Spleen of Teleost Without Reference Genome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.737332
PMID:34646272
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研究论文 | 本文提出了一种使用全长转录组作为参考的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法，并在没有已知基因组的硬骨鱼样本中进行了评估 | 本文提出的方法不依赖于参考基因组，适用于没有参考基因组的鱼类研究，为scRNA-seq数据分析提供了一种可靠的替代方案 | NA | 旨在开发和评估一种新的scRNA-seq数据分析方法，以在没有参考基因组的硬骨鱼中识别和表征免疫细胞亚群 | 硬骨鱼的脾脏中的免疫细胞亚群 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1249 | 2024-08-08 |
SCMAG: A Semisupervised Single-Cell Clustering Method Based on Matrix Aggregation Graph Convolutional Neural Network
2021, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2021/6842752
PMID:34646337
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研究论文 | 本文提出了一种基于矩阵聚合图卷积神经网络的半监督单细胞聚类方法SCMAG | SCMAG充分利用了单细胞数据的先验信息，提高了聚类算法的准确性 | NA | 旨在提高单细胞数据聚类分析的准确性 | 单细胞数据 | 机器学习 | NA | 图卷积神经网络 | 图卷积神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 不同单细胞数据集 |
| 1250 | 2024-08-08 |
Tryptophan metabolism is inversely regulated in the tumor and blood of patients with glioblastoma
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.60679
PMID:34646367
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤患者肿瘤和血液中色氨酸代谢的反向调控，并开发了新的技术来支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体激活的治疗 | 开发了结合LC-MS/MS与化学同位素标记的方法，用于同时定量比较色氨酸及其代谢物，并应用MALDI MSI和scRNA-seq技术分析色氨酸代谢和芳香烃受体活性 | NA | 更好地理解色氨酸代谢，支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体的治疗 | 胶质母细胞瘤患者的色氨酸代谢 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | LC-MS/MS, MALDI MSI, scRNA-seq | 人工神经网络 | 血液样本, 肿瘤组织 | 43名复发性胶质母细胞瘤患者和43名年龄性别匹配的健康对照 |
| 1251 | 2024-08-08 |
Tumor microenvironment-based screening repurposes drugs targeting cancer stem cells and cancer-associated fibroblasts
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.62676
PMID:34646392
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研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤微环境（TME）的筛选方法，以识别能够特异性靶向癌症干细胞（CSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs）的药物 | 开发了一种基于肿瘤微环境的高通量药物筛选平台，并利用单细胞RNA测序技术评估药物在CSCs和CAFs中的作用机制 | NA | 建立基于肿瘤微环境的药物筛选平台，以加速药物开发和治疗应用 | 肺癌患者来源的癌细胞和CAFs，以及CSCs和CAFs | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1,524种化合物 |
| 1252 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Sequencing Reveals a Murine Gallbladder Cell Transcriptome Atlas During the Process of Cholesterol Gallstone Formation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.714271
PMID:34650971
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的转录组图谱 | 首次展示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的细胞异质性和转录组动态变化 | NA | 揭示胆固醇结石形成过程中胆囊细胞的变化，增进对疾病发病机制和治疗的理解 | 小鼠胆囊细胞在胆固醇结石形成过程中的转录组变化 | 数字病理学 | 胆石症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 1253 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Peripheral Blood Reveals a Novel B-Cell Subset in Renal Allograft Recipients With Accommodation
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.706580
PMID:34658852
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析肾移植受者的外周血细胞，揭示了免疫抑制剂对免疫细胞亚群的新机制 | 发现了一个新的B细胞亚群（CD19IGLC3IGKCTCL1ACD127），该亚群在肾移植受者中显著减少，并显示出激活潜力 | 样本量较小，仅包括三名个体 | 描述肾移植受者免疫耐受的细节，并揭示免疫抑制剂对免疫细胞亚群的影响机制 | 肾移植受者的外周T细胞、B细胞、髓系细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 总共8,272个细胞，来自三名个体，包括2,758个健康对照细胞，2,550个ESRD患者细胞和2,964个肾移植患者细胞 |
| 1254 | 2024-08-08 |
Expansion of Human Papillomavirus-Specific T Cells in Periphery and Cervix in a Therapeutic Vaccine Recipient Whose Cervical High-Grade Squamous Intraepithelial Lesion Regressed
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645299
PMID:34659195
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研究论文 | 本文描述了一位接受HPV治疗性疫苗PepCan的女性，其宫颈高级别鳞状上皮内病变完全消退，并通过T细胞受体β深度测序分析了疫苗接种前后的T细胞反应。 | 结合传统和前沿的免疫监测技术，首次展示了HPV抗原特异性T细胞不仅在外周血中，而且在宫颈中的扩增。 | NA | 研究HPV治疗性疫苗对T细胞反应的影响，并验证疫苗特异性T细胞的存在。 | HPV治疗性疫苗PepCan接种者的T细胞反应及宫颈病变消退情况。 | 免疫学 | 宫颈疾病 | T细胞受体β深度测序 | NA | 单细胞RNA测序和TCR测序数据 | 70个可能的疫苗特异性克隆型 |
| 1255 | 2024-08-08 |
Phytohormone-Based Regulation of Trichome Development
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.734776
PMID:34659303
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综述 | 本文综述了植物激素对毛状体发育的调控作用 | 介绍了CRISPR-Cas9系统和单细胞转录组学等新技术在研究毛状体细胞系调控网络中的应用 | NA | 探讨植物激素对毛状体发育的调控机制 | 植物毛状体的发育 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统, 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 1256 | 2024-08-08 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
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综述 | 本文综述了结合功能基因组学知识与全基因组关联研究（GWAS）的数据整合生物信息学方法，以识别遗传调控基因 | 介绍了转录组广泛关联研究（TWAS）作为一种基因基础的关联方法，能够减少多重检验负担，并讨论了不同TWAS方法的设计和生物学假设 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨如何通过数据整合方法更好地理解GWAS发现与复杂疾病机制之间的关系 | 全基因组关联研究（GWAS）发现的非编码区域及其在复杂人类疾病和性状中的功能 | 基因组学 | NA | 全基因组关联研究（GWAS），转录组广泛关联研究（TWAS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 1257 | 2024-08-08 |
Identification of Specific Cell Subpopulations and Marker Genes in Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/1005793
PMID:34660776
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 揭示了卵巢癌中的特定细胞亚群和标记基因，为卵巢癌的异质性提供了新的见解 | NA | 分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66个高级别浆液性卵巢癌细胞样本和568个卵巢癌样本及8个正常卵巢样本 |
| 1258 | 2024-08-08 |
3D tumor angiogenesis models: recent advances and challenges
2021-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03814-0
PMID:34613483
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综述 | 本文综述了3D肿瘤血管生成模型的最新进展和面临的挑战 | 介绍了基于组织工程的肿瘤模型、血管类器官模型和器官芯片等新型3D肿瘤血管模型系统 | 现有模型多依赖于正常内皮细胞，与具有独特（表观）遗传和代谢特征的肿瘤内皮细胞有显著差异 | 旨在改进肿瘤血管模型系统，以促进个性化医疗的发展 | 肿瘤血管生成机制及其临床应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 1259 | 2024-08-08 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 本研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理学和体内钙成像技术，系统比较了投射到外侧缰核和腹侧被盖区的外侧下丘脑谷氨酸能神经元的功能差异 | 揭示了外侧下丘脑神经元在投射到不同脑区的功能异质性，表明奖励和厌恶在不同的传出通路中被不同处理 | NA | 解析外侧下丘脑特定神经元群的功能 | 外侧下丘脑谷氨酸能神经元投射到外侧缰核和腹侧被盖区的功能差异 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞测序、电生理学、体内钙成像 | NA | 神经元活动数据 | NA |
| 1260 | 2024-08-08 |
Significance of intratumoral infiltration of B cells in cancer immunotherapy: From a single cell perspective
2021-12, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2021.188632
PMID:34626740
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综述 | 本文综述了肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的作用，特别是从单细胞RNA测序的角度探讨其亚群、分化轨迹及与肿瘤微环境中的其他细胞的相互作用 | 利用单细胞RNA测序技术，高分辨率动态监测肿瘤微环境在免疫治疗中的变化，揭示B细胞在抗肿瘤免疫中的独特功能 | NA | 探讨肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的潜在临床应用价值，作为生物标志物和治疗靶点 | 肿瘤内浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |