单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2024-08-08 |
Dissecting the single-cell transcriptome network in patients with esophageal squamous cell carcinoma receiving operative paclitaxel plus platinum chemotherapy
2021-Oct-26, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-021-00359-2
PMID:34697289
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了接受手术及术前化疗的食管鳞状细胞癌患者的分子和细胞重编程模式 | 首次详细分析了接受术前化疗的食管鳞状细胞癌患者的单细胞转录组网络，揭示了肿瘤微环境中的细胞间相互作用和分子特征 | 研究仅基于10名患者的数据，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究食管鳞状细胞癌患者在接受术前化疗后的分子和细胞重编程模式 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 113,581个细胞，来自10名食管鳞状细胞癌患者 |
| 1202 | 2024-08-08 |
Exploring the oncostatin M (OSM) feed-forward signaling of glioblastoma via STAT3 in pan-cancer analysis
2021-Oct-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02260-9
PMID:34702277
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研究论文 | 本研究基于TCGA和GTEx数据库，对Oncostatin M（OSM）在泛癌分析中的肿瘤相关功能及其与肿瘤微环境中特定分子和细胞的关联进行了探讨，并特别关注了胶质母细胞瘤（GBM）中OSM诱导的信号通路和细胞间通讯。 | 首次系统评估了OSM在多种癌症中的作用，并揭示了其在肿瘤微环境中的广泛通讯能力，特别是在GBM中发现了OSM通过Jak-STAT和NF-κB通路促进肿瘤进展的关键作用。 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且样本量可能不足以全面代表所有癌症类型。 | 探讨OSM在肿瘤发展中的调控作用及其在肿瘤微环境中的机制。 | Oncostatin M（OSM）在泛癌分析中的作用及其与胶质母细胞瘤（GBM）的关系。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和GTEx数据库的多种癌症样本 |
| 1203 | 2024-08-08 |
Type I IFN-Driven Immune Cell Dysregulation in Rat Autoimmune Diabetes
2021-10-26, ImmunoHorizons
DOI:10.4049/immunohorizons.2100088
PMID:34702762
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研究论文 | 研究了在Kilham rat virus (KRV)感染下，IFNAR缺失对LEW.1WR1大鼠免疫细胞群体的影响，特别是在KRV诱导的自体免疫糖尿病模型中。 | 通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析，揭示了IFNAR缺失后免疫细胞的动态变化，特别是在KRV感染后，CD8 T细胞、NK细胞和调节性T细胞的变化。 | NA | 探讨IFNAR缺失对自体免疫糖尿病模型中免疫细胞群体的影响。 | LEW.1WR1大鼠的脾脏免疫细胞。 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | LEW.1WR1野生型和突变型大鼠的脾脏细胞 |
| 1204 | 2024-08-08 |
[Update on the value and application of single-cell RNA sequencing in human cardiovascular diseases]
2021-Oct-24, Zhonghua xin xue guan bing za zhi
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1205 | 2024-08-08 |
AdRoit is an accurate and robust method to infer complex transcriptome composition
2021-10-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02739-1
PMID:34686758
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AdRoit的方法，用于从混合细胞类型的转录组数据中推断细胞组成 | AdRoit采用自适应学习方法，减轻了单细胞和批量（或空间）转录组数据之间的测序技术差异，提高了跨平台读出的可比性 | NA | 开发一种准确且稳健的方法，从混合细胞类型的转录组数据中推断细胞组成 | 混合细胞类型的转录组数据 | 基因组学 | NA | RNA测序 | 自适应学习方法 | 基因表达数据 | 包括30种细胞类型的复杂混合物 |
| 1206 | 2024-08-08 |
Induction of inverted morphology in brain organoids by vertical-mixing bioreactors
2021-10-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02719-5
PMID:34686776
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研究论文 | 本研究通过使用垂直混合生物反应器，探讨了其对脑类器官结构的影响，并成功建立了倒置脑类器官 | 本研究首次通过垂直混合生物反应器诱导脑类器官形成倒置形态，并揭示了其背后的流体动力学机制和细胞机制 | NA | 探索通过生物力学工程控制流体动力学来指导脑类器官中干细胞分化的可能性 | 脑类器官的结构和细胞机制 | 生物工程 | NA | 垂直混合生物反应器 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1207 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal the heterogeneity and dynamic of cancer stem-like cells during breast tumor progression
2021-10-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04261-y
PMID:34675206
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研究论文 | 本研究利用乳腺癌小鼠模型MMTV-PyMT，构建了肿瘤进展四个阶段的单细胞图谱，揭示了乳腺癌干细胞样细胞的异质性和动态变化 | 首次在单细胞水平上揭示了乳腺癌干细胞样细胞在肿瘤进展中的基因表达连续性和免疫细胞浸润特征 | NA | 阐明乳腺癌干细胞样细胞的异质性和免疫细胞在乳腺癌进展中的重塑 | 乳腺癌干细胞样细胞及其在肿瘤进展中的动态变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 31,778个细胞 |
| 1208 | 2024-08-08 |
Meta-analysis of COVID-19 single-cell studies confirms eight key immune responses
2021-10-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-00121-z
PMID:34675242
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meta-analysis | 本文通过重新分析多个COVID-19单细胞RNA测序数据集，验证了20项已发表结果中的8项关键免疫反应 | 通过标准化方法重新分析多个数据集，验证了先前研究的部分结论 | 由于大多数研究样本量较小，导致结论的置信度受限 | 验证COVID-19感染免疫反应的单细胞RNA测序研究结果 | COVID-19患者的免疫反应 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小样本量 |
| 1209 | 2024-08-08 |
Effects of Sample Size on Plant Single-Cell RNA Profiling
2021-Oct-20, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb43030119
PMID:34698115
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研究论文 | 本研究评估了样本大小（即细胞数量）对植物单细胞转录组分析结果的影响 | 研究提供了优化植物单细胞RNA测序研究中样本大小的通用指南 | NA | 评估样本大小对单细胞转录组分析结果的影响 | 植物根细胞的单细胞RNA测序 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从约57,000个根细胞中采样不同数量的细胞 |
| 1210 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Revealed the Gene Expression Pattern during the In Vitro Maturation of Donkey Oocytes
2021-10-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12101640
PMID:34681034
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索驴的生发泡（GV）和体外成熟中期II（MII）卵母细胞的基因表达模式及其调控机制 | 首次揭示了驴卵母细胞在体外成熟过程中的基因表达模式，并识别了关键基因和调控机制 | NA | 研究驴卵母细胞在体外成熟过程中的基因表达模式及其调控机制，以促进驴种群的扩增和生物多样性及遗传资源的保护 | 驴的生发泡（GV）和体外成熟中期II（MII）卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共检测了24,164个卵母细胞基因，其中9073个在GV和MII卵母细胞中显著差异表达 |
| 1211 | 2024-08-08 |
Decoding Stem Cells: An Overview on Planarian Stem Cell Heterogeneity and Lineage Progression
2021-10-17, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom11101532
PMID:34680165
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review | 本文综述了扁虫干细胞的异质性和谱系进展 | 近年来，基于流式细胞术的分离技术、RNAi功能分析以及单细胞测序等高通量方法促进了我们对扁虫干细胞生物学的理解 | NA | 总结当前关于定义扁虫干细胞异质性的分子特征的知识 | 扁虫的干细胞（neoblasts）及其分化过程 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | RNA | NA |
| 1212 | 2024-08-08 |
High-Dimensional Single-Cell Transcriptomics in Melanoma and Cancer Immunotherapy
2021-10-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12101629
PMID:34681023
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学技术在黑色素瘤和癌症免疫治疗中的应用，并提供了实施这些分析平台的指导 | 介绍了近年来开发的几种新型单细胞技术，这些技术增强了我们对免疫治疗靶向的机制细胞和生物途径的理解 | 这些技术具有方法特定的优势、劣势和能力，需要在解答转化研究问题时加以考虑 | 探讨单细胞转录组学技术在癌症患者免疫治疗背景下解析肿瘤微环境中的应用，并讨论其在临床设置中的战略使用 | 黑色素瘤和癌症免疫治疗中的单细胞转录组学技术 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 1213 | 2024-08-08 |
Co-Expression with Membrane CMTM6/4 on Tumor Epithelium Enhances the Prediction Value of PD-L1 on Anti-PD-1/L1 Therapeutic Efficacy in Gastric Adenocarcinoma
2021-Oct-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13205175
PMID:34680324
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研究论文 | 本文探讨了在胃腺癌中，CMTM6/4与PD-L1共表达对PD-1/L1免疫治疗疗效预测的影响 | 开发了一种基于肿瘤上皮细胞膜上CMTM6/4和PD-L1共表达的预测模型，用于胃腺癌患者免疫治疗前的筛选 | NA | 旨在基于CMTM6/4和PD-L1的共表达建立新的患者分层策略，以提高免疫治疗效果 | 胃腺癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 多色多重免疫荧光染色 | 预测模型 | mRNA数据，蛋白质水平数据 | 48例接受免疫治疗前的患者 |
| 1214 | 2024-08-08 |
PPARγ Targets-Derived Diagnostic and Prognostic Index for Papillary Thyroid Cancer
2021-Oct-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13205110
PMID:34680260
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研究论文 | 本文开发了一种基于10个PPARγ靶基因表达的个性化预后指数PPARGi，用于甲状腺乳头状癌的诊断和预后评估 | 利用PPARγ靶基因作为潜在标记物，开发了一种新的个性化预后指数PPARGi，通过单细胞RNA测序数据分析和机器学习算法提高了诊断和预后评估的准确性 | NA | 旨在改进甲状腺乳头状癌的预后评估和患者管理 | 甲状腺乳头状癌及其相关基因表达 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | scRNA-seq | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自患者的甲状腺乳头状癌组织样本，TCGA-THCA和合并微阵列数据（MMD）中的甲状腺癌和正常组织样本 |
| 1215 | 2024-08-08 |
Isolation of Murine Retinal Endothelial Cells for Next-Generation Sequencing
2021-10-11, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63133
PMID:34694293
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从新生小鼠视网膜组织中分离和纯化视网膜内皮细胞的方法，并展示了该方法在下一代测序技术中的应用 | 该方法通过FACS纯化的CD31+/CD45-内皮细胞群高度富集内皮细胞基因表达，且在FACS后60分钟内细胞活力无变化 | NA | 优化从胚胎和新生组织中分离细胞的技术，以应用于血管发育模型的下一代测序 | 新生小鼠视网膜内皮细胞 | 分子和细胞生物学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | RNA序列 | NA |
| 1216 | 2024-08-08 |
The Dual Role of Innate Lymphoid and Natural Killer Cells in Cancer. from Phenotype to Single-Cell Transcriptomics, Functions and Clinical Uses
2021-Oct-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13205042
PMID:34680190
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综述 | 本文综述了先天淋巴细胞（ILCs）和自然杀伤细胞（NK细胞）在癌症中的作用，从表型到单细胞转录组学，功能和临床应用 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在研究ILCs和NK细胞转录组水平上的应用 | NA | 总结ILCs和NK细胞在癌症中的分类、功能及其在癌症治疗中的潜在应用 | 先天淋巴细胞（ILCs）和自然杀伤细胞（NK细胞） | 生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1217 | 2024-08-08 |
The molecular mechanisms of inflammation and scarring in the kidneys of immunoglobulin A nephropathy : Gene involvement in the mechanisms of inflammation and scarring in kidney biopsy of IgAN patients
2021-10, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-021-00891-8
PMID:34674036
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研究论文 | 本文旨在描述免疫球蛋白A肾病（IgAN）患者肾活检的转录组特征及潜在的尿液生物标志物 | 引入了单细胞RNA测序技术，克服了以往方法的局限，能够研究整个肾组织而无需解剖肾单位段，并允许更好地分析涉及细胞分化的细胞特异性基因表达 | NA | 探讨免疫球蛋白A肾病中肾损伤的分子机制及潜在的尿液生物标志物 | 免疫球蛋白A肾病患者的肾组织 | 数字病理学 | 肾病 | 实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR）、微阵列、RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用新鲜或冷冻的肾组织、甲醛固定石蜡包埋的肾组织标本 |
| 1218 | 2024-08-08 |
PD-L2 glycosylation promotes immune evasion and predicts anti-EGFR efficacy
2021-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002699
PMID:34697216
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研究论文 | 本文探讨了PD-L2糖基化在免疫逃逸和抗EGFR治疗中的作用及其调控机制 | 首次揭示了PD-L2糖基化与EGFR形成复合物，激活EGFR/STAT3信号通路，降低西妥昔单抗与EGFR的结合亲和力，并通过糖基化修饰稳定PD-L2，促进其与PD-1的结合和免疫逃逸 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步的临床试验验证 | 探究PD-L2糖基化在肿瘤免疫逃逸和抗EGFR治疗中的作用及其调控机制 | PD-L2糖基化在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对西妥昔单抗治疗的影响 | 免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序和免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 包含西妥昔单抗耐药和敏感的头颈部鳞状细胞癌组织样本 |
| 1219 | 2024-08-08 |
Improved SNV Discovery in Barcode-Stratified scRNA-seq Alignments
2021-09-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12101558
PMID:34680953
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研究论文 | 本文评估了从单细胞RNA测序数据中通过细胞条形码分割对齐来发现单核苷酸变异（SNV）的信息增益 | 通过在单细胞水平上对齐数据进行变异调用，识别的SNV数量至少是池化scRNA-seq的两倍，且这些SNV富含新的变异和终止密码子及错义替代 | NA | 评估从单细胞RNA测序数据中通过细胞条形码分割对齐来发现SNV的信息增益 | MCF7细胞系在抗癌治疗期间的数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 公开可用的MCF7细胞系数据 |
| 1220 | 2024-08-08 |
Tutorial: Guidelines for Single-Cell RT-qPCR
2021-09-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10102607
PMID:34685587
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教程 | 本文提供单细胞反转录定量PCR（scRT-qPCR）方法的全面总结，包括单细胞收集方法的局限性、反转录的重要性、预扩增和引物设计的建议，以及数据处理步骤的总结 | scRT-qPCR方法适用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）实验前的有效筛选或高吞吐量方法假设的验证 | 讨论了单细胞收集方法的局限性 | 提供scRT-qPCR方法的全面指南，使任何研究人员都能进行高标准的scRT-qPCR测量 | 单细胞基因表达分析 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 单细胞 |