单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1181 - 1200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2024-08-08 |
[A review on integration methods for single-cell data]
2021-Oct-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
DOI:10.7507/1001-5515.202104073
PMID:34713670
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综述 | 本文综述了单细胞数据整合的基本原理、方法及其应用 | 探讨了现有方法的优缺点，并对未来的发展进行了展望 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序实验中无法全面捕捉所有细胞和基因信息的问题 | 单细胞RNA测序数据和多模态单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1182 | 2024-08-08 |
Integrating single cell sequencing with a spatial quantitative systems pharmacology model spQSP for personalized prediction of triple-negative breast cancer immunotherapy response
2021-Oct, Immunoinformatics (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.immuno.2021.100002
PMID:34708216
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研究论文 | 本文通过整合三阴性乳腺癌患者的全外显子测序和单细胞RNA测序数据，构建空间定量系统药理学模型（spQSP），用于个性化预测免疫治疗反应 | 首次将单细胞测序数据与空间定量系统药理学模型结合，用于预测个体化免疫治疗效果 | NA | 开发一种新的方法来预测三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 定量系统药理学模型 | 基因组数据 | NA |
| 1183 | 2024-08-08 |
Identification of Key eRNAs for Spinal Cord Injury by Integrated Multinomial Bioinformatics Analysis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.728242
PMID:34708039
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析，探讨了脊髓损伤（SCI）中关键增强子RNA（eRNAs）、转录因子（TFs）、信号通路和小分子抑制剂的作用。 | 构建了13个差异表达转录因子、6个差异表达增强子RNA、7个差异表达目标基因的调控网络，并发现了与SCI相关的潜在药物Trichostatin A。 | NA | 研究脊髓损伤中关键增强子RNA的作用及其调控机制。 | 脊髓损伤中的关键增强子RNA、转录因子、信号通路和小分子抑制剂。 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 微阵列数据分析、CIBERSORT算法、基因集变异分析（GSVA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 微阵列数据、scRNA-seq数据、ChIP-seq数据、ATAC-seq数据 | 27名健康志愿者和25名慢性期脊髓损伤患者的周围血单核细胞（PBMC）样本 |
| 1184 | 2024-08-08 |
Blood Immune Cell Composition Associated with Obesity and Drug Repositioning Revealed by Epigenetic and Transcriptomic Conjoint Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.714643
PMID:34712134
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研究论文 | 本研究通过表观遗传学和转录组联合分析，探讨了肥胖相关的血液免疫细胞组成，并识别了用于肥胖管理的新型潜在药物。 | 本研究首次通过表观遗传学和转录组联合分析，揭示了肥胖患者中CD8+ T细胞和NK细胞的显著降低，并发现了11种具有肥胖控制潜力的药物。 | 研究样本量较小，仅包括35个肥胖样本和37个对照样本，可能影响结果的普遍性。 | 分析肥胖中的免疫细胞组成，并识别新型有效药物用于肥胖管理。 | 肥胖患者和健康对照的血液免疫细胞组成及药物靶点表达。 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化分析，mRNA表达微阵列，单细胞RNA测序，qPCR | NA | DNA甲基化数据，mRNA表达数据 | 72个样本（35个肥胖样本和37个对照样本） |
| 1185 | 2024-08-08 |
TNFSF13 Is a Novel Onco-Inflammatory Marker and Correlates With Immune Infiltration in Gliomas
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.713757
PMID:34712225
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了TNFSF13（APRIL）在胶质瘤中的表达及其与患者预后和靶向治疗的关系 | 首次证实TNFSF13与胶质瘤中的免疫浸润和炎症反应相关，并可能作为新的诊断标志物和免疫治疗靶点 | NA | 探索TNFSF13作为胶质瘤的新诊断标志物和治疗靶点的潜力 | TNFSF13在胶质瘤中的表达及其与免疫浸润和炎症反应的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1186 | 2024-08-08 |
Immune Response in Severe and Non-Severe Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Infection: A Mechanistic Landscape
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738073
PMID:34721400
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序数据，探讨了COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | 揭示了低密度中性粒细胞和巨核细胞在淋巴细胞和髓系细胞间对话中的关键作用，并提供了淋巴细胞和髓系细胞相互作用的详细机制见解 | NA | 阐明COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自四个已发表研究的数据，包括轻度/中度和重度感染的患者 |
| 1187 | 2024-08-08 |
Phased differentiation of γδ T and T CD8 tumor-infiltrating lymphocytes revealed by single-cell transcriptomics of human cancers
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1939518
PMID:34721945
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，首次揭示了人类癌症中γδ T细胞与T CD8细胞的分化差异 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，展示了γδ T细胞在癌症中的分化情况，并发现其在肿瘤微环境中的分化与健康血液中的情况不同 | NA | 探讨γδ T细胞在人类癌症中的分化情况及其与免疫检查点疗法的关联 | γδ T细胞和T CD8细胞在人类癌症中的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约150个已发表的单细胞RNA测序数据集及人类肿瘤和小鼠模型的表型验证数据 |
| 1188 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Multiple Pathologic Types of Renal Cell Carcinoma Revealed Novel Potential Tumor-Specific Markers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.719564
PMID:34722263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在多种病理类型的肾细胞癌中发现了新的潜在肿瘤特异性标记物 | 本研究首次在不同病理类型的肾细胞癌中识别出多种新的肿瘤特异性标记物，并验证了其在肿瘤细胞中的高表达 | 研究样本量较小，仅包括三种病理类型的肾细胞癌 | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肾细胞癌的潜在肿瘤特异性标记物，以指导临床治疗 | 研究对象包括三种病理类型的肾细胞癌及正常肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共30,263个高质量单细胞转录组信息 |
| 1189 | 2024-08-08 |
A Comprehensive Characterization of Monoallelic Expression During Hematopoiesis and Leukemogenesis via Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702897
PMID:34722498
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，系统地研究了骨髓单个核细胞中的单等位基因表达（MAE），构建了MAE图谱，并探讨了其在造血和白血病发生中的作用 | 首次系统地研究了造血和白血病发生过程中的常染色体MAE、细胞类型特异性MAE和随机MAE，增加了对MAE特征和功能的认识 | NA | 探讨单等位基因表达在造血和白血病发生中的作用和机制 | 骨髓单个核细胞中的单等位基因表达 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1,020个常染色体MAE，74个细胞类型特异性MAE，114个随机MAE |
| 1190 | 2024-08-08 |
Classical Dichotomy of Macrophages and Alternative Activation Models Proposed with Technological Progress
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9910596
PMID:34722776
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在种植牙科中的炎症调节作用及其激活/极化状态的基础，并提出了基于先进技术的替代激活模型。 | 通过应用CyTOF、scRNA-seq和HSI等先进技术，提出了替代激活模型，有助于巨噬细胞的分型和功能基因的划分。 | NA | 探索巨噬细胞的激活模型及其在种植牙科中的应用。 | 巨噬细胞及其在种植牙科中的作用。 | 数字病理学 | NA | CyTOF, scRNA-seq, HSI | NA | 图像, 基因序列 | NA |
| 1191 | 2024-08-08 |
Expression of chimeric antigen receptor therapy targets detected by single-cell sequencing of normal cells may contribute to off-tumor toxicity
2021-12-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.09.016
PMID:34678153
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1192 | 2024-08-08 |
Diversity and convergence within peripheral glia development
2021-12, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2021.10.004
PMID:34689995
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了外周神经胶质细胞在发育过程中的多样性变化，并识别了成熟神经胶质细胞间的统一遗传特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了外周神经胶质细胞发育过程中的多样性和统一遗传特征 | NA | 探究外周神经胶质细胞的发育过程及其功能 | 外周神经胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 1193 | 2024-08-08 |
Untimely TGFβ responses in COVID-19 limit antiviral functions of NK cells
2021-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04142-6
PMID:34695836
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研究论文 | 研究探讨了COVID-19中NK细胞功能受TGFβ反应影响的机制 | 揭示了TGFβ在严重COVID-19中异常产生，抑制NK细胞功能的现象 | NA | 探究COVID-19中NK细胞功能受限的原因 | COVID-19患者的NK细胞及TGFβ反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的血清样本 |
| 1194 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of the In Vivo Dynamics of Host Circulating Immune Cells Highlights the Importance of Myeloid Cells in Avian Flaviviral Infection
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100116
PMID:34697228
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研究论文 | 本研究利用高通量单细胞转录组测序技术，构建了鸭循环免疫细胞的转录组图谱，并分析了鸭外周血白细胞（PBLks）在禽类登革病毒（TMUV）感染下的性别差异动态变化 | 首次揭示了鸭循环免疫细胞在TMUV感染下的性别差异反应，并发现了TMUV感染对鸭PBLks的性别特异性重编程 | NA | 研究鸭免疫系统与病毒的相互作用，特别是循环免疫细胞在病毒感染中的动态变化 | 鸭的循环免疫细胞及其在TMUV感染下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14种外周血白细胞（PBLks）群体 |
| 1195 | 2024-08-08 |
Regulation of intestinal immunity and tissue repair by enteric glia
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04006-z
PMID:34671159
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研究论文 | 本文揭示了肠神经胶质细胞（EGCs）在肠道稳态、免疫和组织修复中的重要作用 | 首次阐明了IFNγ信号在肠神经胶质细胞中的中心作用，并揭示了IFNγ-EGC-CXCL10轴在免疫反应和组织修复中的关键角色 | NA | 研究肠神经胶质细胞在肠道稳态、免疫和组织修复中的作用 | 肠神经胶质细胞（EGCs）及其在肠道中的功能 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和炎症性肠病患者 |
| 1196 | 2024-08-08 |
Dynamic transcriptional reprogramming leads to immunotherapeutic vulnerabilities in myeloma
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00766-y
PMID:34675390
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研究论文 | 本研究探讨了多发性骨髓瘤细胞如何通过动态转录重编程来适应治疗并逃避免疫疗法，揭示了治疗过程中产生的可利用的免疫治疗靶点。 | 本研究首次展示了多发性骨髓瘤细胞在治疗压力下如何通过转录重编程和增强子重连来适应并逃避免疫治疗，同时揭示了新的免疫治疗靶点CXCR4。 | NA | 揭示多发性骨髓瘤细胞如何通过转录重编程适应治疗并逃避免疫疗法，探索新的治疗策略。 | 多发性骨髓瘤细胞的转录重编程和增强子使用。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1197 | 2024-08-08 |
Human ALS/FTD brain organoid slice cultures display distinct early astrocyte and targetable neuronal pathology
2021-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00923-4
PMID:34675437
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研究论文 | 研究报道了从人诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的脑类器官切片模型，该模型再现了成熟皮层结构并显示C9ORF72 ALS/FTD的早期分子病理 | 开发了一种新的脑类器官切片模型，用于研究ALS/FTD的早期细胞病理，并探索了潜在的治疗方法 | NA | 阐明ALS/FTD的初始细胞病理，为治疗目标开发提供依据 | ALS/FTD的早期细胞病理和潜在治疗策略 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 单细胞RNA测序 | 脑类器官切片模型 | 细胞 | NA |
| 1198 | 2024-08-08 |
Simpler and Faster Development of Tumor Phylogeny Pipelines
2021-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0271
PMID:34698531
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研究论文 | 本文开发了一种名为plastic的肿瘤系统发育管道，该管道整合了简化输入数据、推断肿瘤系统发育和比较系统发育三个步骤 | 引入了新的内存数据结构，便于工具间信息的透明共享，并扩展了简化输入数据的工具，集成了两种机器学习程序，显著减少了运行时间 | NA | 开发更先进和快速的工具来分析单细胞测序产生的大量数据 | 单细胞测序数据和肿瘤系统发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | NA |
| 1199 | 2024-08-08 |
Possible selection bias limits the interpretation of single-cell transcriptomics data of steroid-resistant asthma exacerbation
2021-10-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102858118
PMID:34686592
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1200 | 2024-08-08 |
Reply to Dutta et al.: Understanding scRNA-seq data in the context of the tissue microenvironment requires clinical relevance
2021-10-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2109159118
PMID:34686602
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |