单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-19 |
Thymus-Derived CD4+CD8+ Cells Reside in Mediastinal Adipose Tissue and the Aortic Arch
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100208
PMID:34740961
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、流式细胞术和三维全装图像技术，发现并证实了在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中存在双阳性CD4CD8αβ细胞（DP细胞），并探讨了这些细胞的转录特征及其在血管稳态中的潜在作用 | 发现了在健康和动脉粥样硬化小鼠模型中，除了胸腺外，纵隔脂肪组织和主动脉外膜中也存在双阳性CD4CD8αβ细胞，这些细胞具有独特的转录特征 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨双阳性CD4CD8αβ细胞在不同组织中的分布及其在血管稳态中的作用 | 双阳性CD4CD8αβ细胞在胸腺、纵隔脂肪组织和主动脉外膜中的分布及转录特征 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维全装图像技术 | NA | 细胞 | 健康和动脉粥样硬化小鼠模型 |
| 102 | 2024-08-19 |
Stem/progenitor cells in normal physiology and disease of the pancreas
2021-12-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2021.111459
PMID:34543699
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综述 | 本文综述了胚胎期和成年期胰腺干细胞/祖细胞在稳态和疾病中的研究进展 | 结合最新的测序技术、谱系追踪和类器官技术，探讨了成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在及其在稳态和应激反应中的作用 | 由于实验结果的矛盾性，成年胰腺中干细胞/祖细胞的存在仍存在争议 | 探讨胰腺干细胞/祖细胞在正常生理和疾病中的作用 | 胚胎期和成年期的胰腺干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 103 | 2024-08-19 |
A transposon expression burst accompanies the activation of Y-chromosome fertility genes during Drosophila spermatogenesis
2021-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27136-4
PMID:34824217
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据，量化了果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达，并开发了一种方法来识别转座子和宿主基因表达模块 | 发现了在果蝇精子发生过程中，转座子表达爆发与Y染色体生育基因激活的关联，并揭示了特定细胞群中转座子表达的特异性 | NA | 研究果蝇睾丸中转座子活动和宿主沉默机制 | 果蝇睾丸中不同细胞类型的转座子表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 公开数据集中的多个样本 |
| 104 | 2024-08-19 |
Cell type identification from single-cell transcriptomes in melanoma
2021-11-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01118-3
PMID:34784909
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞基因和长非编码RNA表达水平的计算框架，用于从单细胞转录组中识别黑色素瘤中的细胞类型 | 该方法充分考虑了细胞脱落特性，通过定义细胞的脱落特征和脱落簇，构建差异共表达网络并识别差异模块，最终基于这些差异模块识别细胞类型 | NA | 探索黑色素瘤相关的关键细胞类型的分子机制，为黑色素瘤研究提供见解 | 单细胞转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 应用该方法于单细胞黑色素瘤数据，识别出八种细胞类型 |
| 105 | 2024-08-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential cell cycle activity in key cell populations during nephrogenesis
2021-11-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01790-6
PMID:34789782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了胚胎期14.5天小鼠肾脏发育过程中的基因表达，揭示了关键细胞群体中细胞周期活动的差异 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了肾脏发育过程中“准备”和“自我更新”的肾单位前体细胞亚群之间的细胞周期活动差异，并发现了不成熟远端小管中细胞周期相关基因的增强表达 | NA | 深入理解驱动肾脏发育的分子机制，为设计增强肾脏修复和再生的策略提供依据 | 小鼠胚胎期14.5天的肾脏发育过程 | 数字病理学 | 儿童慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期14.5天的小鼠肾脏样本 |
| 106 | 2024-08-19 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
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研究论文 | 本研究利用已知的肠道病毒（轮状病毒），该病毒损害绒毛顶端的上皮细胞但不直接损害肠道干细胞，探索了肠道上皮在单细胞水平上的再生转录反应 | 发现特定的细胞亚群表现出增加的细胞周期频率，与上皮隐窝的显著扩张相关，并伴随着未成熟肠细胞数量的增加。意外地发现轮状病毒感染了簇状细胞，并通过干扰素相关途径响应病毒感染 | NA | 理解上皮修复和再生在损伤后的机制，以开发促进快速愈合和恢复正常肠道功能的疗法 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞 | 数字病理学 | 消化疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 107 | 2024-08-19 |
Mechanisms of vascular smooth muscle cell investment and phenotypic diversification in vascular diseases
2021-11-01, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210138
PMID:34495326
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞在血管疾病中的投入机制及其表型多样化的研究进展 | 结合克隆系谱追踪和单细胞转录组学技术，揭示了血管病变中血管平滑肌细胞来源细胞的显著多样性 | NA | 探讨血管平滑肌细胞在病理血管重塑中的调控机制，并讨论开发治疗策略的可能性 | 血管平滑肌细胞及其在血管疾病中的作用 | NA | 心血管疾病 | 克隆系谱追踪、单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 108 | 2024-08-19 |
Conventional type I dendritic cells maintain a reservoir of proliferative tumor-antigen specific TCF-1+ CD8+ T cells in tumor-draining lymph nodes
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.026
PMID:34534439
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研究论文 | 研究探讨了在肺腺癌自发性模型中，常规I型树突状细胞如何在肿瘤引流淋巴结中维持肿瘤抗原特异性TCF-1+ CD8+ T细胞的增殖库 | 发现常规I型树突状细胞在肿瘤引流淋巴结中维持TCF-1 CD8 T细胞库，通过Flt3L+anti-CD40治疗恢复SlamF6 T细胞频率并减轻肿瘤负担 | 研究仅限于肺腺癌的自发性模型，可能需要进一步验证在其他类型肿瘤中的适用性 | 探究在肿瘤环境中，TCF-1 CD8 T细胞的维持机制及其对免疫检查点阻断反应的影响 | 肿瘤抗原特异性TCF-1 CD8 T细胞及其在肿瘤引流淋巴结中的动态变化 | 免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 涉及肿瘤抗原特异性TCF-1 CD8 T细胞的多个样本 |
| 109 | 2024-08-19 |
Implications of Intratumor Heterogeneity on Consensus Molecular Subtype (CMS) in Colorectal Cancer
2021-Sep-30, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13194923
PMID:34638407
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建算法，用于确定结直肠癌中单细胞共识分子亚型（CMS）的分类，并探讨其在肿瘤和非肿瘤细胞中的分布 | 开发了一种单细胞CMS分配算法，能够重现所有四种CMS的内在生物学特性 | 研究样本量较小，仅包括10个单细胞RNA测序数据集和3232个批量RNA测序数据集 | 探讨肿瘤内异质性对结直肠癌共识分子亚型（CMS）的影响 | 结直肠癌的共识分子亚型（CMS）及其在单细胞水平上的分布 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNASeq） | 算法 | RNA测序数据 | 3232个批量RNA测序数据集和10个单细胞RNA测序数据集 |
| 110 | 2024-08-19 |
Skeleton-vasculature chain reaction: a novel insight into the mystery of homeostasis
2021-Mar-22, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00138-0
PMID:33753717
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综述 | 本文综述了骨和血管之间的内分泌调节回路的新颖性和重要性，并总结了与骨血管相关的研究进展、血管相关骨骼疾病、病理条件及针对血管生成的治疗策略 | 探讨了骨和血管作为内分泌器官的新认识，以及单细胞测序等新技术在揭示这两种组织细胞多样性和可塑性方面的应用 | NA | 阐述骨和血管之间内分泌调节回路的新颖性和重要性，并探讨未来的研究方向 | 骨和血管的内分泌调节机制及其在疾病治疗中的应用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-19 |
The Single-Cell Transcriptomic Analysis of Prefrontal Pyramidal Cells and Interneurons Reveals the Neuronal Expression of Genes Encoding Antimicrobial Peptides and Immune Proteins
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.749433
PMID:34759929
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了前额叶锥体细胞和中间神经元中编码抗菌肽和免疫蛋白的基因表达 | 首次报道了皮质神经元中某些抗菌和免疫相关蛋白的转录表达 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠前额叶皮质细胞 | 探讨神经元与免疫细胞之间直接通讯的分子基础 | 前额叶锥体细胞和中间神经元的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 84个细胞 |
| 112 | 2024-08-19 |
BPI overexpression suppresses Treg differentiation and induces exosome-mediated inflammation in systemic lupus erythematosus
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63743
PMID:34815797
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质，并利用转基因小鼠模型探讨了细菌通透性增加蛋白（BPI）在SLE中的潜在致病作用。 | 首次揭示了BPI在SLE中的过度表达抑制Treg分化并诱导外泌体介导的炎症反应，为SLE的病理机制提供了新的见解。 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能与人类SLE的实际情况存在差异。 | 探讨BPI在系统性红斑狼疮中的致病作用及其对Treg分化的影响。 | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 蛋白质组学、免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 蛋白质、RNA | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体，转基因小鼠模型 |
| 113 | 2024-08-18 |
Six Shades of Vascular Smooth Muscle Cells Illuminated by KLF4 (Krüppel-Like Factor 4)
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316600
PMID:34470477
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review | 本文综述了血管平滑肌细胞（vSMCs）的六种表型及其在血管疾病中的作用 | 通过单细胞RNA测序研究，本文首次分类了六种vSMC表型，并探讨了表型转换对血管病理的影响 | 目前关于vSMC表型的共识尚未形成，研究结果可能受限于当前数据和分类方法 | 旨在详细描述vSMC的表型并识别表型转换的触发因素，以揭示不同表型在血管疾病中的相关性 | 血管平滑肌细胞（vSMCs）及其在血管疾病中的表型转换 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 114 | 2024-08-18 |
Comprehensive investigations revealed consistent pathophysiological alterations after vaccination with COVID-19 vaccines
2021-Oct-26, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00329-3
PMID:34697287
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研究论文 | 本研究报告了在接受灭活SARS-CoV-2疫苗接种的健康志愿者中，除了产生中和抗体外，还观察到血红蛋白A1c、血清钠和钾水平、凝血谱和肾功能的一致性改变 | 通过单细胞mRNA测序揭示了接种疫苗后免疫细胞类型的基因表达变化，以及NF-κB信号通路的增加和I型干扰素反应的减少 | 研究主要集中在健康志愿者中，对于有预先存在的临床条件的人群的具体影响需要进一步研究 | 探讨COVID-19疫苗接种后的生理变化，并评估其对特定人群的影响 | 健康志愿者接种COVID-19疫苗后的生理变化 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 115 | 2024-08-18 |
Large-scale analysis of imprinting in naive human pluripotent stem cells reveals recurrent aberrations and a potential link to FGF signaling
2021-10-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.09.002
PMID:34597600
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研究论文 | 本文研究了人类多能干细胞在转化为原始多能状态时基因组印记的异常表达情况，并探讨了其与FGF信号通路的可能关联 | 首次在大规模样本中分析了原始人类多能干细胞中的印记丢失（LOI）现象，并揭示了不同转化协议导致的LOI程度差异与FGF信号通路的紧密关联 | NA | 探讨人类多能干细胞在转化为原始多能状态时基因组印记的异常表达及其与FGF信号通路的关联 | 原始和激活的人类多能干细胞 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 大量批量和单细胞RNA测序样本 |
| 116 | 2024-08-18 |
The Advances of Single-Cell RNA-Seq in Kidney Immunology
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.752679
PMID:34721077
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研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序技术在肾脏免疫学中的应用，特别是针对几种特定的肾脏疾病 | 应用单细胞RNA测序技术成功定义了常驻和浸润免疫细胞的转录组特征，以及免疫细胞与邻近细胞之间的细胞内通信网络 | NA | 增加对肾脏免疫学的理解，并为肾脏疾病患者开发新的治疗方法 | 肾脏疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 血液、次级淋巴组织、肾活检和尿液样本中的免疫细胞 |
| 117 | 2024-08-18 |
Discovering Myeloid Cell Heterogeneity in Mandibular Bone - Cell by Cell Analysis
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.731549
PMID:34658914
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和高通量单细胞RNA测序技术，探讨了下颌骨与长骨（股骨）中髓系前体细胞群体的差异 | 本研究首次揭示了下颌骨骨髓细胞在髓系分化方面的持续缺陷，并发现了下颌骨髓系细胞在转录组层面的独特特征 | NA | 探索不同解剖位置骨髓中髓系前体细胞群体的差异 | 下颌骨与长骨（股骨）中的髓系前体细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 118 | 2024-08-17 |
Single-Cell RNA-Seq of T Cells in B-ALL Patients Reveals an Exhausted Subset with Remarkable Heterogeneity
2021-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101447
PMID:34365737
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者和健康个体的外周血T细胞，发现了患者中具有显著异质性的耗竭T细胞亚群 | 首次揭示了B-ALL患者中耗竭T细胞的异质性及其亚群特征，并探讨了其可能的起源 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示B-ALL患者中T细胞的功能集群，为免疫治疗和临床反应预测提供策略 | B-ALL患者和健康个体的外周血T细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康个体和B-ALL患者的T细胞样本 |
| 119 | 2024-08-17 |
CD177 modulates the function and homeostasis of tumor-infiltrating regulatory T cells
2021-10-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26091-4
PMID:34599187
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析肾透明细胞癌患者的免疫细胞，发现肿瘤浸润调节T细胞（TI Treg）存在两种不同的转录命运，其中Fate-1与较差的预后相关，并发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达，阻断CD177可减少Treg细胞的抑制活性，为TI Treg特异性免疫治疗提供新靶点 | 首次发现CD177在Fate-1 TI Treg细胞上特异性表达，并揭示其对Treg细胞功能和肿瘤生长的影响 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步在临床试验中验证 | 探索肿瘤浸润调节T细胞的功能和潜在治疗靶点 | 肾透明细胞癌患者的免疫细胞及肿瘤浸润调节T细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肾透明细胞癌患者 |
| 120 | 2024-08-17 |
Escape of hair follicle stem cells causes stem cell exhaustion during aging
2021-10, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-021-00103-w
PMID:37118327
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研究论文 | 本研究探讨了衰老过程中毛囊干细胞（HF-SCs）耗竭的机制 | 首次在活体动物中观察到衰老过程中毛囊干细胞的耗竭过程，并揭示了上皮细胞从毛囊干细胞微环境中逃逸的新机制 | NA | 阐明衰老过程中毛囊干细胞耗竭的机制及其对组织退化的影响 | 衰老小鼠的毛囊干细胞及其上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 细胞 | 衰老小鼠 |