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当前共找到 2885 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-04-10
ICAM1 initiates CTC cluster formation and trans-endothelial migration in lung metastasis of breast cancer
2021-08-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质分析,揭示了ICAM1在乳腺癌肺转移中启动循环肿瘤细胞簇形成和跨内皮迁移的作用 首次发现ICAM1在乳腺癌肺转移中表达增加200倍,并通过同型和异型相互作用促进CTC簇形成和跨内皮迁移,为TNBC转移提供了新的治疗靶点 研究主要基于三例TNBC患者来源的异种移植模型,样本量较小,且未在更大临床队列中验证 探究ICAM1在乳腺癌肺转移中启动循环肿瘤细胞簇形成和跨内皮迁移的机制 三阴性乳腺癌的原发肿瘤细胞和肺转移灶 机器学习和单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 基于机器学习的算法 RNA测序数据和蛋白质分析数据 三例TNBC患者来源的异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
102 2026-04-10
A Novel Single Cell RNA-seq Analysis of Non-Myeloid Circulating Cells in Late Sepsis
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者非髓系循环细胞的转录组特征 首次在晚期脓毒症中应用CITE-seq技术对非髓系免疫细胞进行单细胞转录组分析,揭示了细菌性与真菌性脓毒症之间的转录组差异 样本量较小(仅4例患者和5例健康对照),且仅关注晚期时间点(脓毒症后14-21天) 通过单细胞转录组分析更好地理解晚期脓毒症的病理机制 晚期脓毒症患者和健康对照者的外周血非髓系免疫细胞 单细胞组学 脓毒症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CITE-seq NA 单细胞转录组数据 4例晚期脓毒症患者和5例健康对照者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
103 2026-04-09
A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-06-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文介绍了一种针对酵母优化的单细胞转录组学平台yeastDrop-Seq,用于量化单个酵母细胞中不同的mRNA分子数量,并研究了霉酚酸和鸟嘌呤对全局mRNA水平的影响 开发了yeastDrop-Seq平台,这是对Drop-Seq技术的优化,使其适用于酵母这种细胞大小和形态特征不同的生物体,从而实现了酵母单细胞转录组的量化分析 平台可能仅适用于酵母细胞,对于其他生物体的应用可能仍具挑战性,且未提及样本量或技术验证的详细限制 研究霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞全局mRNA水平的转录组影响,并优化单细胞转录组学技术以应用于酵母 单个酵母细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq yeastDrop-Seq 针对酵母优化的Drop-Seq平台,用于量化单个酵母细胞中不同的mRNA分子数量
104 2026-04-09
Cannabinoid Receptor Activation on Haematopoietic Cells and Enterocytes Protects against Colitis
2021-Jun-22, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 本研究探讨了大麻素受体激活在造血细胞和肠上皮细胞中对结肠炎的保护作用 揭示了THC通过作用于免疫细胞和肠上皮细胞来预防结肠炎,并明确了其独立于微生物组的抗炎机制 研究仅使用雌性C57BL/6小鼠,且CBD在测试剂量下效果有限,可能不适用于所有情况 确定大麻素在结肠炎中的抗炎作用机制,包括微生物组、代谢组以及造血和非造血细胞的贡献 雌性C57BL/6小鼠在化学诱导结肠炎模型中的反应 NA 结肠炎 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术, 结肠镜检查, 组织学分析 NA 基因表达数据, 细胞表型数据, 临床参数 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
105 2026-04-09
Urinary EGF and MCP-1 and risk of CKD after cardiac surgery
2021-06-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究评估了尿液中EGF和MCP-1作为心脏手术后慢性肾病风险的预测标志物 首次将反映细胞完整性的EGF和炎症标志物MCP-1联合用于预测心脏手术后的长期肾脏结局,并利用单细胞RNA测序在组织层面验证了相关基因表达变化 研究人群主要来自加拿大和美国的两家中心,可能存在选择偏倚,且为观察性研究,无法确定因果关系 评估新型尿液生物标志物对心脏手术后慢性肾病风险的预测价值 865名接受心脏手术的成年患者 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 尿液生物标志物数据、单细胞转录组数据 865名心脏手术患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
106 2026-04-09
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究利用恒河猴作为模型,探索人类晚期妊娠肾脏侧支肾单位发生的分子机制 首次将恒河猴确立为真实侧支肾单位发生的模型,支持了衰老肾单位祖细胞具有独特分子特征的假说 研究样本量有限,仅基于四个胎儿恒河猴肾脏,且依赖于人类存档组织进行验证 理解晚期妊娠人类胎儿肾脏发育的分子机制,特别是侧支肾单位发生 恒河猴胎儿肾脏及人类存档组织 数字病理学 肾脏疾病 免疫染色、3D渲染、单细胞RNA测序、单核RNA测序、RNAScope验证 NA 图像、RNA测序数据 四个妊娠129-131天的胎儿恒河猴肾脏皮质富集样本,以及人类存档组织 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
107 2026-04-09
Holistic characterization of single-hepatocyte transcriptome responses to high-fat diet
2021-02-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
研究论文 本研究利用基于液滴的单细胞RNA测序技术,全面分析了高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病中单个肝细胞的转录组响应特征 首次在单细胞水平系统表征了肝细胞对高脂饮食的异质性转录组变化,揭示了分区依赖和独立的响应模式,并发现了脂质代谢相关基因的空间共表达模式 研究主要关注转录组层面,未涉及蛋白质组或代谢组等多组学验证;样本来源为小鼠模型,人类临床样本的适用性有待进一步验证 探究高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病中肝细胞的单细胞转录组响应机制 高脂饮食喂养小鼠的肝细胞 单细胞组学 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,但基于单细胞测序技术分析多个肝细胞 未明确指定 单细胞RNA-seq Drop-seq 基于液滴的单细胞RNA测序平台
108 2026-04-09
Visual Genomics Analysis Studio as a Tool to Analyze Multiomic Data
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文介绍了Visual Genomics Analysis Studio (VGAS)这一集成应用,用于分析和可视化多组学单细胞数据,旨在帮助研究者无需高级生物信息学技能即可进行数据分析 VGAS是一个用户友好的Windows图形界面应用,无需用户编程或高性能计算机,整合了性能优化的隐藏代码,提供快速直观的数据分析工具和高分辨率图形输出 本文作为综述,主要介绍VGAS的功能和应用,未涉及具体实验验证或性能对比数据 开发并推广一个集成工具,以降低多组学单细胞数据分析的技术门槛,促进免疫介导药物不良反应的研究 多组学单细胞数据,特别是单细胞TCR-RNA-CITE-seq数据,用于分析免疫细胞群 生物信息学 药物不良反应 单细胞TCR测序, 单细胞RNA测序, CITE-seq NA 多组学单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序, 单细胞多组学 NA NA
109 2026-04-08
Uphyloplot2: visualizing phylogenetic trees from single-cell RNA-seq data
2021-Jun-05, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文介绍了Uphyloplot2,一个用于从单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息生成系统发育图的Python脚本工具 开发了一个自动化工具,直接从RNA-seq推断数据或Newick格式的树文件生成系统发育图,简化了肿瘤克隆性可视化的流程 工具依赖于外部CNV推断工具(如inferCNV、CaSpER、HoneyBADGER)的准确性,且未在多种肿瘤类型或大规模数据集上进行广泛验证 开发一个可视化工具,用于从单细胞RNA-seq数据中推断的染色体拷贝数变异(CNV)信息生成系统发育图,以展示肿瘤克隆性 单细胞RNA-seq数据推断的CNV信息或Newick格式的树文件 生物信息学 肿瘤 单细胞RNA-seq(scRNA-seq)、染色体拷贝数变异(CNV)推断 NA 基因表达数据、CNV推断数据、树文件 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
110 2026-04-08
Genetic pathways regulating hematopoietic lineage speciation: Factorial latent variable model analysis of single cell transcriptome
2021-Jun, Data in brief IF:1.0Q3
研究论文 本研究应用因子单细胞潜变量模型分析小鼠造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组数据,以解析造血谱系分化的遗传调控通路 首次采用因子单细胞潜变量模型分解单细胞转录组异质性为可解释的生物学因子,动态揭示细胞命运调控机制 研究仅基于12周龄雌性小鼠的造血干细胞和祖细胞数据,样本来源和年龄性别范围有限 解析稳态造血过程中调控细胞谱系分化的遗传通路 小鼠造血干细胞和祖细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 因子单细胞潜变量模型 单细胞转录组测序数据 1,920个造血干细胞和祖细胞,来自12周龄雌性小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
111 2026-04-08
Single cell RNA-seq analysis of the flexor digitorum brevis mouse myofibers
2021-05-17, Skeletal muscle IF:5.3Q2
研究论文 本研究开发并验证了一种通过流式分选分离完整骨骼肌肌纤维进行单细胞RNA测序的方法,以分析小鼠快肌纤维的基因表达模式 首次应用全细胞流式分选方法对单一肌肉类型(小鼠快肌屈趾短肌)进行单细胞RNA测序,而非基于单核RNA,扩展了纤维类型特异性基因的已知库 在763个肌纤维中,仅有171个细胞达到质量控制最优标准,样本利用率较低,可能影响统计效力 探索全细胞流式分选方法在单一肌肉类型单细胞RNA测序中的应用,以生成深度表达谱并识别纤维类型特异性基因 小鼠快肌屈趾短肌的完整和碎片化骨骼肌肌纤维 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式分选 NA RNA测序数据 763个完整和碎片化肌纤维,其中171个通过质量控制 NA 单细胞RNA-seq NA NA
112 2026-04-07
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,表征了重症哮喘患者外周血单个核细胞在Poly I:C刺激下的免疫反应模型 首次结合两种互补的单细胞技术(DropSeq scRNA-Seq和CyTOF)来表征重症哮喘患者PBMCs对TLR3激动剂Poly I:C的反应,揭示了基线状态下的促炎特征和刺激后强烈的干扰素通路诱导 样本量相对较小(5名SA患者和3名健康对照),且为体外模型,可能无法完全反映体内复杂的免疫微环境 表征重症哮喘患者外周血单个核细胞对TLR3激动剂Poly I:C刺激的免疫反应,以评估哮喘相关的干扰素反应缺陷 重症哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 8名个体(5名重症哮喘患者,3名健康对照)的PBMCs;scRNA-Seq分析9414个细胞,CyTOF分析160,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq DropSeq NA
113 2026-04-07
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了BatchBench,一个用于比较单细胞RNA-seq数据批次校正方法的模块化灵活流程 提出了一个系统化评估和比较批次校正方法的开源工具,通过整合多个数据集进行性能分析 仅评估了八种方法,可能未涵盖所有现有技术,且依赖于特定数据集 比较和评估单细胞RNA-seq数据批次校正方法的性能 单细胞RNA-seq数据集和批次校正算法 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 多个已研究的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
114 2026-04-07
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Nadia Instrument的灵活、经济高效且用户友好的基于液滴的微流控系统,用于单细胞转录组分析,并展示了其在细胞周期研究中的应用 开发了一种新型微流控系统,具有高重现性液滴大小、低双联体率和高mRNA捕获效率,且可通过Nadia Innovate模块实现灵活配置,支持不同缓冲液和条形码珠设置 未明确提及系统在更大规模样本或更复杂组织类型中的验证,以及与其他现有平台的直接比较数据 开发并验证一种用于单细胞转录组分析的微流控系统,以促进细胞分辨率下的转录组学研究 异步人类和小鼠细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA mRNA序列数据 约50,000个单细胞或细胞核 NA 单细胞RNA-seq Nadia Instrument 基于液滴的微流控系统,支持3' mRNA捕获,可与Nadia Innovate模块结合使用
115 2026-04-07
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序技术,揭示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性中枢神经系统自身免疫中的关键作用 首次鉴定出CD11c+CD88+CD317+髓系细胞亚群是中枢神经系统自身免疫的关键介质,并证明抗CD317治疗能显著改善实验性自身免疫性脑脊髓炎 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序样本量相对较小 探究α4-整合素在CD11c+细胞中的特异性缺失对实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响,并鉴定关键致病细胞亚群 CD11c.Cre C57BL/6基因工程小鼠、野生型对照小鼠、人类脑脊液样本 免疫学 多发性硬化症/实验性自身免疫性脑脊髓炎 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、基因工程小鼠模型 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 基因工程小鼠模型(具体数量未明确)、人类脑脊液样本(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2026-04-07
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过结合FACS富集与单细胞RNA-seq技术,分析了小鼠肾脏远端肾单位中9099个细胞的转录组,揭示了DCT和CTAL细胞亚型的多样性 首次在单细胞水平上系统识别了肾脏远端肾单位中的少数细胞类型,包括DCT1和DCT2的异质性以及三种不同的CTAL亚型,并发现了新的转录因子表达模式 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;单细胞RNA-seq可能无法完全捕获低丰度转录本;功能验证实验有限 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性及其在水分和电解质平衡中的作用 小鼠肾脏厚壁升支(CTAL)和远端曲小管(DCT)区域的细胞 单细胞转录组学 肾脏疾病 单细胞RNA-seq,FACS(荧光激活细胞分选) 无监督聚类分析 转录组数据 9099个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-04-06
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α(ERα)在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响,并证明ERα在此过程中的关键介导作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 小鼠 单细胞测序 乳腺癌 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
118 2026-04-04
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究评估了在标准单细胞RNA测序样本制备条件下,混合来自无关供体的外周血单个核细胞是否会引起同种异体反应性转录响应 首次系统评估了在标准scRNA-seq样本制备条件下混合无关供体PBMCs是否会引起同种异体反应性基因表达变化,并识别了与PBMC制备方法和样本多重标记技术相关的技术假象 研究仅评估了30分钟4°C共孵育条件,未测试更长时间或不同温度条件;主要关注CD4+ T细胞中的同种异体反应性标记 评估样本多重技术在单细胞RNA测序中混合无关供体PBMCs时是否引入同种异体反应性假象,为横向免疫学研究建立基准 外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 单个供体PBMCs与无关供体PBMCs混合实验,并分析了公开可用的scRNA-seq数据集 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA-seq, 样本多重技术 10x Genomics scRNA-seq平台, BD单细胞多重试剂盒(SCMK) 10x Genomics单细胞RNA测序平台结合MULTI-seq和/或BD SCMK标记技术
119 2026-04-04
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了CSEA-DB数据库,一个用于人类复杂性状与细胞类型关联的综合性资源库 整合了5120个GWAS汇总统计数据与超过90万个单细胞转录组数据,通过deTS算法进行了超过1000万次性状-细胞类型关联分析,首次构建了大规模的人类复杂性状与细胞类型特异性关联图谱 数据库依赖现有GWAS和单细胞数据的质量和覆盖范围,可能未涵盖所有组织或细胞类型 构建一个参考数据库,用于解析人类复杂性状与细胞类型特异性之间的遗传关联 人类复杂性状和疾病相关的遗传变异及细胞类型 生物信息学 复杂疾病 GWAS, 单细胞转录组测序 deTS算法 GWAS汇总统计数据, 单细胞RNA-seq数据 超过900,000个细胞,涵盖71个成人和胎儿组织的752种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
120 2026-04-03
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过开发一种新型肽激动剂C660,探讨了蛋白酶激活受体3(PAR3)在痛觉感知中的作用 开发了选择性激活PAR3的脂质锚定激动剂C660,并首次在体内证明了PAR3对机械超敏和痛觉可塑性的贡献 研究主要基于小鼠模型,PAR3在人类痛觉中的具体作用仍需进一步验证 探究PAR3在外周感觉神经系统中的功能及其在痛觉调节中的作用 小鼠背根神经节神经元和三叉神经神经元 神经科学 疼痛相关疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠背根神经节神经元 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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