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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-07 |
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab004
PMID:33524142
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研究论文 | 本文介绍了BatchBench，一个用于比较单细胞RNA-seq数据批次校正方法的模块化灵活流程 | 提出了一个系统化评估和比较批次校正方法的开源工具，通过整合多个数据集进行性能分析 | 仅评估了八种方法，可能未涵盖所有现有技术，且依赖于特定数据集 | 比较和评估单细胞RNA-seq数据批次校正方法的性能 | 单细胞RNA-seq数据集和批次校正算法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 多个已研究的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-04-07 |
A flexible microfluidic system for single-cell transcriptome profiling elucidates phased transcriptional regulators of cell cycle
2021-04-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-86070-z
PMID:33846365
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Nadia Instrument的灵活、经济高效且用户友好的基于液滴的微流控系统，用于单细胞转录组分析，并展示了其在细胞周期研究中的应用 | 开发了一种新型微流控系统，具有高重现性液滴大小、低双联体率和高mRNA捕获效率，且可通过Nadia Innovate模块实现灵活配置，支持不同缓冲液和条形码珠设置 | 未明确提及系统在更大规模样本或更复杂组织类型中的验证，以及与其他现有平台的直接比较数据 | 开发并验证一种用于单细胞转录组分析的微流控系统，以促进细胞分辨率下的转录组学研究 | 异步人类和小鼠细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA序列数据 | 约50,000个单细胞或细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq | Nadia Instrument | 基于液滴的微流控系统，支持3' mRNA捕获，可与Nadia Innovate模块结合使用 |
| 103 | 2026-04-07 |
CD11c+CD88+CD317+ myeloid cells are critical mediators of persistent CNS autoimmunity
2021-04-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014492118
PMID:33785592
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序技术，揭示了CD11c+CD88+CD317+髓系细胞在持续性中枢神经系统自身免疫中的关键作用 | 首次鉴定出CD11c+CD88+CD317+髓系细胞亚群是中枢神经系统自身免疫的关键介质，并证明抗CD317治疗能显著改善实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；单细胞测序样本量相对较小 | 探究α4-整合素在CD11c+细胞中的特异性缺失对实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响，并鉴定关键致病细胞亚群 | CD11c.Cre C57BL/6基因工程小鼠、野生型对照小鼠、人类脑脊液样本 | 免疫学 | 多发性硬化症/实验性自身免疫性脑脊髓炎 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 基因工程小鼠模型（具体数量未明确）、人类脑脊液样本（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-04-07 |
Targeted Single-Cell RNA-seq Identifies Minority Cell Types of Kidney Distal Nephron
2021-Apr, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101407
PMID:33769948
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研究论文 | 本研究通过结合FACS富集与单细胞RNA-seq技术，分析了小鼠肾脏远端肾单位中9099个细胞的转录组，揭示了DCT和CTAL细胞亚型的多样性 | 首次在单细胞水平上系统识别了肾脏远端肾单位中的少数细胞类型，包括DCT1和DCT2的异质性以及三种不同的CTAL亚型，并发现了新的转录因子表达模式 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；单细胞RNA-seq可能无法完全捕获低丰度转录本；功能验证实验有限 | 探索肾脏远端肾单位中少数细胞类型的转录组多样性及其在水分和电解质平衡中的作用 | 小鼠肾脏厚壁升支（CTAL）和远端曲小管（DCT）区域的细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq，FACS（荧光激活细胞分选） | 无监督聚类分析 | 转录组数据 | 9099个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-04-06 |
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63333
PMID:33647234
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α（ERα）在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响，并证明ERα在此过程中的关键介导作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 | 小鼠 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-04-04 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
|
研究论文 | 本研究评估了在标准单细胞RNA测序样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单个核细胞是否会引起同种异体反应性转录响应 | 首次系统评估了在标准scRNA-seq样本制备条件下混合无关供体PBMCs是否会引起同种异体反应性基因表达变化，并识别了与PBMC制备方法和样本多重标记技术相关的技术假象 | 研究仅评估了30分钟4°C共孵育条件，未测试更长时间或不同温度条件；主要关注CD4+ T细胞中的同种异体反应性标记 | 评估样本多重技术在单细胞RNA测序中混合无关供体PBMCs时是否引入同种异体反应性假象，为横向免疫学研究建立基准 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 单个供体PBMCs与无关供体PBMCs混合实验，并分析了公开可用的scRNA-seq数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq, 样本多重技术 | 10x Genomics scRNA-seq平台, BD单细胞多重试剂盒（SCMK） | 10x Genomics单细胞RNA测序平台结合MULTI-seq和/或BD SCMK标记技术 |
| 107 | 2026-04-04 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
|
研究论文 | 本文介绍了CSEA-DB数据库，一个用于人类复杂性状与细胞类型关联的综合性资源库 | 整合了5120个GWAS汇总统计数据与超过90万个单细胞转录组数据，通过deTS算法进行了超过1000万次性状-细胞类型关联分析，首次构建了大规模的人类复杂性状与细胞类型特异性关联图谱 | 数据库依赖现有GWAS和单细胞数据的质量和覆盖范围，可能未涵盖所有组织或细胞类型 | 构建一个参考数据库，用于解析人类复杂性状与细胞类型特异性之间的遗传关联 | 人类复杂性状和疾病相关的遗传变异及细胞类型 | 生物信息学 | 复杂疾病 | GWAS, 单细胞转录组测序 | deTS算法 | GWAS汇总统计数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过900,000个细胞，涵盖71个成人和胎儿组织的752种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-04-03 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
|
研究论文 | 本研究通过开发一种新型肽激动剂C660，探讨了蛋白酶激活受体3（PAR3）在痛觉感知中的作用 | 开发了选择性激活PAR3的脂质锚定激动剂C660，并首次在体内证明了PAR3对机械超敏和痛觉可塑性的贡献 | 研究主要基于小鼠模型，PAR3在人类痛觉中的具体作用仍需进一步验证 | 探究PAR3在外周感觉神经系统中的功能及其在痛觉调节中的作用 | 小鼠背根神经节神经元和三叉神经神经元 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-03-15 |
Barcoded viral tracing of single-cell interactions in central nervous system inflammation
2021-04-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1230
PMID:33888612
|
研究论文 | 本研究开发了RABID-seq技术，结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序，以研究中枢神经系统炎症中的单细胞相互作用 | 开发了RABID-seq技术，首次将条形码病毒追踪与单细胞RNA测序结合，用于在体内研究星形胶质细胞相互作用，并识别了介导小胶质细胞-星形胶质细胞相互作用的候选分子 | NA | 研究中枢神经系统炎症中细胞间相互作用，特别是小胶质细胞与星形胶质细胞之间的互作机制 | 星形胶质细胞、小胶质细胞及其在中枢神经系统炎症模型中的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-03-10 |
Single-cell RNA sequencing in human lung cancer: Applications, challenges, and pathway towards personalized therapy
2021-06-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000000535
PMID:33883467
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类肺癌研究中的应用、挑战及其在推动个性化治疗发展中的潜力 | 填补了现有综述的空白，全面总结了scRNA-seq在肺癌研究中的广泛应用，并探讨了其在个性化癌症治疗中的未来应用与挑战 | NA | 总结scRNA-seq在人类肺癌研究中的各种应用，并探讨其在促进未来个性化癌症治疗发展中的潜力与挑战 | 人类肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-03-06 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为spQSP-IO的混合计算模型平台，用于模拟肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制剂免疫疗法的效果 | 开发了结合定量系统药理学模型和基于代理的空间模型的新平台，以整合空间数据并增强预测能力 | 未明确提及具体数据限制或模型验证的局限性 | 研究肿瘤微环境和癌症-免疫细胞相互作用在肿瘤发展中的作用，并评估抗PD-1治疗的效果 | 非小细胞肺癌的虚拟患者模型 | 机器学习 | 肺癌 | 定量系统药理学模型、基于代理的模型、空间转录组学 | 混合计算模型 | 空间数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2026-03-06 |
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1371
PMID:34301599
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型，揭示了胆汁盐代谢和Fxr信号通路在非哺乳类脊椎动物中的保守性及微生物修饰作用 | 首次在斑马鱼中系统解析了胆汁盐合成、转运及微生物修饰的全过程，并利用单细胞RNA测序构建了肠道上皮细胞图谱，明确了Fxr在回肠及其他细胞类型中的转录调控功能 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物的直接推演可能存在物种差异，且微生物修饰的具体机制仍需进一步探索 | 探究非哺乳类脊椎动物中胆汁盐代谢和Fxr信号通路的保守性与调控机制 | 斑马鱼的肝脏、肠道及肠道微生物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-03-06 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
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研究论文 | 本研究探讨了睾丸生殖细胞肿瘤的起源机制，发现NANOS2缺失导致生殖细胞无法进行性别特异性分化，从而驱动肿瘤发生 | 揭示了NANOS2作为关键内在因子，在连接遗传风险因素与肿瘤易感性中的核心作用，并首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪证明胚胎癌细胞仅来源于NANOS2缺失的生殖细胞 | 研究基于小鼠模型（129.MOLF-Chr19），可能不完全反映人类睾丸生殖细胞肿瘤的复杂性 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的起始机制，特别是性别特异性分化失败在肿瘤发生中的作用 | 小鼠睾丸生殖细胞，包括NANOS2缺失的生殖细胞和胚胎癌细胞 | 生殖生物学与肿瘤学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 单细胞RNA测序，谱系追踪实验 | NA | RNA测序数据 | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告等位基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-05 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
|
研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染胰腺与血栓纤维化及新发糖尿病之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫定位技术，在非人灵长类动物和人类中证实SARS-CoV-2可直接感染胰腺细胞，并揭示其与血栓纤维化及新发糖尿病的潜在机制 | 样本量较小（8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者），且为观察性研究，因果关系需进一步验证 | 探究SARS-CoV-2感染是否直接导致胰腺功能障碍及新发糖尿病 | 非人灵长类动物和人类胰腺组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，免疫定位 | NA | RNA测序数据，组织图像 | 8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-03-03 |
A Comprehensive Survey of Statistical Approaches for Differential Expression Analysis in Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-12-02, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12121947
PMID:34946896
|
综述 | 本文全面综述了单细胞RNA测序研究中差异表达分析的统计方法，并对19种广泛使用的方法在11个真实数据集上进行了性能评估 | 首次系统分类和评估了从批量RNA-seq借鉴的方法及专为scRNA-seq设计的方法，通过多标准分析推荐了最佳工具 | 评估基于特定数据集和性能指标，可能无法完全覆盖所有实验条件或新兴方法 | 为单细胞RNA测序数据中的差异表达分析提供方法选择指南和性能评估 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达分析方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 11个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-03-02 |
Metabolic modeling of single Th17 cells reveals regulators of autoimmunity
2021-08-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.045
PMID:34216539
|
研究论文 | 本研究开发了Compass算法，通过单细胞RNA测序和通量平衡分析，揭示了Th17细胞代谢状态与其自身免疫致病性之间的关联，并验证了多胺代谢在调控Th17细胞功能中的关键作用 | 开发了Compass算法，首次将单细胞RNA测序与通量平衡分析结合，实现了单细胞代谢状态的表征，并发现了多胺代谢在Th17细胞致病性中的新调控机制 | 算法基于RNA测序数据推断代谢状态，可能无法完全反映实际的代谢通量变化，且体内验证主要集中于中枢神经系统自身免疫模型 | 研究Th17细胞的代谢状态如何调控其自身免疫致病性 | Th17细胞（T辅助17细胞） | 计算生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，通量平衡分析，代谢测定 | Compass算法（基于通量平衡分析） | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-03-02 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ClonMapper的功能化谱系追踪系统，该系统整合了DNA条形码、单细胞RNA测序和克隆分离技术，用于全面表征异质群体中的数千个克隆 | 开发了ClonMapper系统，首次将DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离相结合，实现了对特定克隆的活细胞操作和基因组、表观组、转录组测量的整合 | NA | 研究肿瘤进化与治疗过程中的克隆动态 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及原代人类慢性淋巴细胞白血病样本 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | DNA条形码，单细胞RNA测序，克隆分离 | NA | 单细胞转录组数据 | 数千个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-03-02 |
Identification of EMT signaling cross-talk and gene regulatory networks by single-cell RNA sequencing
2021-05-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102050118
PMID:33941680
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了TGF-β1诱导的MCF10A细胞上皮-间质转化过程，揭示了EMT信号通路的交叉调控和基因调控网络 | 利用单细胞RNA测序和伪时间聚类重建，首次在单细胞水平上揭示了EMT过程中信号通路的顺序和并行激活模式，并识别了关键的NOTCH信号通路作为TGF-β诱导EMT的主要驱动因素 | 研究仅基于MCF10A细胞系模型，未在体内或更多细胞类型中验证，且单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应等局限性 | 探究上皮-间质转化过程中的信号通路交叉调控机制和基因调控网络 | MCF10A细胞系在TGF-β1刺激下经历EMT的过程 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 伪时间聚类分析、随机电路扰动方法 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于MCF10A细胞系进行单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-03-02 |
Single Molecule-Based fliFISH Validates Radial and Heterogeneous Gene Expression Patterns in Pancreatic Islet β-Cells
2021-05, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0802
PMID:33685924
|
研究论文 | 本研究利用fliFISH技术在单个细胞水平上量化小鼠胰岛切片中的转录本，验证了胰岛β细胞中基因表达的径向和异质性模式 | 采用fliFISH技术克服了scRNA-Seq在检测低丰度转录本和空间组织信息方面的局限性，首次在完整胰岛的空间背景下评估转录异质性 | 研究仅聚焦于小鼠胰岛，未涉及人类样本或其他物种；分析的基因数量有限，可能未全面覆盖胰岛β细胞的异质性 | 验证胰岛β细胞中基因表达的异质性模式，并探索其空间组织与细胞成熟状态的关系 | 小鼠胰岛β细胞 | 数字病理学 | NA | fliFISH（基于波动定位成像的荧光原位杂交） | NA | 图像 | 未明确指定样本数量，但涉及单个胰岛的多个细胞 | NA | 单细胞RNA测序（作为比较技术提及），但主要使用fliFISH | NA | NA |
| 120 | 2026-03-02 |
SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz166
PMID:31925417
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCDC的批量基因表达去卷积方法，该方法利用多个单细胞RNA测序参考数据集中的细胞类型特异性基因表达谱，通过集成方法整合不同实验室和时间产生的数据，以解决批次效应问题，并在模拟和实验混合细胞系中验证了其优于现有方法的准确性 | SCDC采用集成方法整合多个scRNA-seq参考数据集，隐式处理批次效应混淆问题，提高了细胞类型分解的准确性 | NA | 开发一种基于多个单细胞RNA测序参考数据集的批量RNA测序去卷积方法，以更准确地分解细胞类型比例 | 批量RNA测序数据，包括模拟生成的伪批量样本和实验混合细胞系，以及人类胰岛和小鼠乳腺组织数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |