单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-08 |
A Dynamic Transcriptome Map of Different Tissue Microenvironment Cells Identified During Gastric Cancer Development Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.728169
PMID:34745098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了胃癌发展过程中不同组织微环境细胞的动态转录图谱 | 本研究首次揭示了组织微环境细胞在胃癌发展过程中的关键转变标志物和动态致癌轨迹 | NA | 揭示胃癌发展过程中组织微环境细胞的关键病理机制 | 胃癌发展过程中的组织微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1142 | 2024-08-08 |
Ductal Macrophages Predominate in the Immune Landscape of the Lactating Mammary Gland
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.754661
PMID:34745127
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、流式细胞术和三维共聚焦显微镜技术，研究了哺乳期小鼠乳腺组织的免疫景观，发现巨噬细胞在免疫细胞中占主导地位，并可分为至少两种亚型：导管和基质巨噬细胞 | 首次精确描述了哺乳期乳腺组织的免疫组成，特别是导管巨噬细胞的高比例及其在乳腺免疫中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究哺乳期乳腺组织的免疫组成，以改进乳腺炎的预防和治疗策略 | 哺乳期小鼠乳腺组织的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1143 | 2024-08-08 |
The Single-Cell Sequencing: A Dazzling Light Shining on the Dark Corner of Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.759894
PMID:34745998
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序（SCS）在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤内异质性（ITH）的理解 | SCS能够测量单个细胞中的基因组序列分布和肿瘤细胞间的遗传变异性，从而提高对ITH的理解 | NA | 探讨SCS的进展及其在肿瘤中的应用 | 肿瘤细胞及其遗传变异性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组序列 | 单个细胞 |
| 1144 | 2024-08-08 |
Data-Driven Modeling of Breast Cancer Tumors Using Boolean Networks
2021, Frontiers in big data
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fdata.2021.656395
PMID:34746770
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研究论文 | 本文提出了一种基于布尔网络的数据驱动模型，用于模拟乳腺癌肿瘤 | 结合单细胞RNA测序和相互作用组数据，研究上调基因的恶性子网络动态 | NA | 开发一种方法来检测与恶性吸引子稳定性相关的关键基因，这些基因的抑制可能应用于癌症治疗 | 乳腺癌肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | 布尔网络 | 基因表达数据 | 来自癌症基因组图谱的单细胞乳腺癌数据集 |
| 1145 | 2024-08-08 |
Capturing tumour heterogeneity in pre- and post-chemotherapy colorectal cancer ascites-derived cells using single-cell RNA-sequencing
2021-12-22, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212093
PMID:34708245
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了结直肠癌患者腹水来源细胞在化疗前后的肿瘤异质性 | 首次展示了单细胞分辨率下高度异质性的癌症亚群对特定化疗治疗的不同反应 | NA | 探索和表征结直肠癌患者腹水来源细胞的肿瘤异质性 | 结直肠癌患者腹水来源细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 19,653个细胞来自四个样本 |
| 1146 | 2024-08-08 |
Transcriptional landscape associated with TNBC resistance to neoadjuvant chemotherapy revealed by single-cell RNA-seq
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.09.002
PMID:34703883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了超过5000个来自四名响应者和四名非响应者的单细胞转录组数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）耐药的转录组图谱 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了TNBC对NAC耐药的转录组图谱，并通过多变量生存分析确定了预测无复发生存的三个基因特征 | 本研究仅基于公开的转录组数据进行分析，未来需要进一步的实验验证和临床研究来确认这些发现 | 揭示三阴性乳腺癌对新辅助化疗耐药的机制，并寻找潜在的治疗靶点和预后标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过5000个单细胞，来自四名响应者和四名非响应者 |
| 1147 | 2024-08-08 |
Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.09.019
PMID:34729382
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研究论文 | 本研究设计了一种单细胞RNA测序方法，用于监测通过慢病毒载体递送CD19-CAR基因的过程 | 本研究揭示了三模态表达模式，并提出了一种基于分布的识别CAR T细胞和CD8+淋巴细胞的方法 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术监测CAR T细胞的生成过程 | 研究对象为通过慢病毒载体暴露的人类供体外周血单个核细胞 | 基因工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 评估了400个与免疫反应相关的基因，包括特定于慢病毒载体的探针 |
| 1148 | 2024-08-08 |
Mitochondrial metabolism coordinates stage-specific repair processes in macrophages during wound healing
2021-12-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.004
PMID:34715039
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研究论文 | 本文研究了在伤口愈合过程中，巨噬细胞在不同阶段的线粒体代谢变化及其对修复过程的影响 | 首次揭示了线粒体代谢在伤口愈合不同阶段对巨噬细胞功能的关键调控作用 | 研究仅在老鼠皮肤伤口模型中进行，可能需要进一步在其他物种或人体中验证 | 探讨线粒体代谢在伤口愈合过程中对巨噬细胞功能的调控机制 | 早期和晚期伤口愈合阶段的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 老鼠皮肤伤口模型中的巨噬细胞 |
| 1149 | 2024-08-08 |
A novel approach to identify the mechanism of miR-145-5p toxicity to podocytes based on the essential genes targeting analysis
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.09.005
PMID:34729245
|
研究论文 | 本文探讨了miR-145-5p对足细胞的毒性机制，通过分析其对足细胞关键基因的影响 | 本研究提供了一种新的方法来研究miRNA如何影响特定细胞类型，不仅识别miRNA药物副作用的分子机制，还能预测miRNA药物对各种细胞类型的毒性 | NA | 探索miR-145-5p对足细胞的毒性机制 | miR-145-5p对足细胞的影响及其关键基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 正常控制小鼠 |
| 1150 | 2024-08-08 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
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研究论文 | 本研究通过随机单盲安慰剂对照的II期临床试验，验证了间充质干细胞（MSCs）治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了MSCs治疗COVID-19患者时，能够调动一种新型VNN2造血干细胞/祖细胞样（HSPC-like）细胞，并调节多种免疫细胞的功能 | NA | 验证间充质干细胞治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | COVID-19患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液 | 每个组29名患者 |
| 1151 | 2024-08-08 |
[Protective macrophages : New insights into the role of synovial macrophages in inflammatory joint diseases]
2021-Dec, Zeitschrift fur Rheumatologie
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s00393-021-01112-1
PMID:34705071
|
研究论文 | 本文探讨了滑膜巨噬细胞在炎症性关节疾病中的保护作用和抗炎功能 | 利用单细胞测序和高级显微技术，揭示了巨噬细胞在组织稳态和组织再生中的多功能性，并发现了在滑膜组织中具有保护和抗炎作用的特殊上皮样巨噬细胞群体 | NA | 研究巨噬细胞在慢性炎症疾病中的作用，特别是其在类风湿性关节炎中的保护功能 | 巨噬细胞及其在炎症性关节疾病中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 1152 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of the ciliary epithelium and contiguous tissues in the mouse eye
2021-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108811
PMID:34717927
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠眼中睫状上皮及其邻近组织的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 约一半的测序细胞来自邻近的视网膜，而非专门分离的睫状体 | 研究睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 小鼠眼中的睫状上皮及其邻近组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10,024个细胞 |
| 1153 | 2024-08-08 |
Miscell: An efficient self-supervised learning approach for dissecting single-cell transcriptome
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103200
PMID:34712916
|
研究论文 | 本文开发了Miscell，一种使用深度神经网络作为潜在特征编码器的自监督学习方法，用于从单细胞转录组中挖掘信息 | Miscell在多种聚类指标上实现了至少可比或更好的性能，并能通过深度学习方法量化基因对细胞簇的影响，识别细胞类型特异性标记 | NA | 开发一种高效的自监督学习方法，用于解析单细胞转录组 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三个异质性数据集 |
| 1154 | 2024-08-08 |
Erratum to: Assessing heterogeneity in spatial data using the HTA index with applications to spatial transcriptomics and imaging
2021-Nov-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab692
PMID:34718412
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1155 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome reveals the intra-tumoral heterogeneity and regulators underlying tumor progression in metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Nov-03, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00663-1
PMID:34732701
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和调控肿瘤进展的关键因素 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性及其分子机制 | NA | 旨在全面描绘转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和揭示其分子机制 | 转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和分子机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 6236个来自5个肝转移性胰腺导管腺癌病变的单个细胞 |
| 1156 | 2024-08-08 |
NRG1/ErbB signalling controls the dialogue between macrophages and neural crest-derived cells during zebrafish fin regeneration
2021-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26422-5
PMID:34732706
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研究论文 | 本文通过结合三重转基因斑马鱼胚胎的活体成像和单细胞RNA测序，详细绘制了斑马鱼幼体再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了NRG1/ErbB信号通路在调控巨噬细胞与神经嵴来源细胞间对话中的关键作用 | 本文首次详细绘制了斑马鱼再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了foxd3阳性神经嵴来源细胞在再生过程中的作用及NRG1/ErbB信号通路的关键调控作用 | NA | 研究斑马鱼尾鳍再生过程中细胞多样性及特定细胞群的作用 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的细胞类型及其相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 三重转基因斑马鱼胚胎 |
| 1157 | 2024-08-08 |
Dissecting mammalian spermatogenesis using spatial transcriptomics
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109915
PMID:34731600
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研究论文 | 使用空间转录组学技术Slide-seq，生成小鼠和人睾丸的空间基因表达图谱，揭示了精子发生过程中的细胞类型定位和基因表达模式 | 首次利用Slide-seq技术在近单细胞分辨率下捕捉小鼠和人睾丸的空间基因表达模式，并开发了一种计算框架来精确地定位睾丸细胞类型 | NA | 揭示哺乳动物精子发生过程中的空间基因表达模式及其在糖尿病诱导的男性不育中的潜在机制 | 小鼠和人的睾丸组织 | 空间转录组学 | 糖尿病 | Slide-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人的睾丸组织样本 |
| 1158 | 2024-08-08 |
Patch-seq of mouse DRG neurons reveals candidate genes for specific mechanosensory functions
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109914
PMID:34731626
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研究论文 | 本文通过结合机械敏感电流记录和单细胞RNA测序，研究了小鼠DRG神经元的机械感觉功能相关候选基因 | 本文首次将机械敏感电流记录与单细胞转录组测序相结合，实现了机械电特性与转录组定义的神经元群体之间的一一对应 | 本文的敲降实验排除了Tmem120a和Tmem150c作为感觉神经元中机械敏感电流的介导因子，但未进一步验证其他候选基因 | 揭示特定机械感觉功能的分子机制 | 小鼠DRG神经元的机械感觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种机械感觉神经元亚型 |
| 1159 | 2024-08-08 |
Pancreatic beta cell neogenesis: Debates and updates
2021-11-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.007
PMID:34731654
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研究论文 | 本文探讨了成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性再生来源 | Gribben等人（2021）通过谱系追踪和单细胞RNA测序方法，报告了Ngn3表达的导管细胞可以作为成年胰腺中新β细胞的前体 | NA | 寻找成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性可再生来源 | 成年胰腺中的β细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1160 | 2024-08-08 |
Integrative analysis methods for spatial transcriptomics
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01272-7
PMID:34711969
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |