单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-08 |
Single-cell spatial transcriptomics
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00778-8
PMID:34750575
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1142 | 2024-08-08 |
Temporal controls over inter-areal cortical projection neuron fate diversity
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04048-3
PMID:34754107
|
研究论文 | 本文通过结合MAPseq和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠新皮层中单个ICPN的连接组和转录组，揭示了不同类型ICPN在分子和功能分化上的时间差异 | 首次将连接组和转录组数据结合，揭示了ICPN在分子和功能分化上的时间差异，并发现SOX11转录因子在不同类型ICPN中的差异表达 | 仅限于小鼠新皮层中的ICPN研究，未涉及其他物种或其他脑区 | 探究新皮层中ICPN的分子和功能分化机制 | 小鼠新皮层中的ICPN | 神经科学 | NA | MAPseq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠新皮层中的单个ICPN |
| 1143 | 2024-08-08 |
A conserved expression signature predicts growth rate and reveals cell & lineage-specific differences
2021-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009582
PMID:34762642
|
研究论文 | 研究通过RNA测序分析快速和慢速增殖的同源细胞，发现了一种进化上保守的与增殖相关的转录组特征，并揭示了细胞类型和谱系特异性的差异 | 识别了一种在所有真核生物中保守的与增殖相关的转录组特征，并能准确预测酵母和癌细胞的生长速率 | 研究主要集中在小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞，可能需要进一步验证在其他细胞类型中的适用性 | 探究快速和慢速增殖细胞之间的差异，并识别与增殖相关的转录组特征 | 小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞的快速和慢速增殖亚群 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞的快速和慢速增殖亚群 |
| 1144 | 2024-08-08 |
Combined Mechanical and Enzymatic Dissociation of Mouse Brain Hippocampal Tissue
2021-10-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63007
PMID:34747412
|
research paper | 本文介绍了一种结合机械和酶解的神经解离协议，用于优化小鼠海马组织处理，以便进行详细的下游分析如流式细胞术或单细胞测序 | 该方法通过结合自动化机械解离和酶解消化，能够持续产生高存活率（>90%）的单细胞悬液，克服了传统方法中获取高存活率单细胞悬液的困难 | 部分步骤需要手动操作，这可能增加样本处理和潜在的细胞损失 | 优化小鼠海马组织的解离过程，以便进行下游的单细胞分析 | 小鼠海马组织 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞悬液 | 小量神经组织 |
| 1145 | 2024-08-08 |
Discovery and construction of prognostic model for clear cell renal cell carcinoma based on single-cell and bulk transcriptome analysis
2021-Sep, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-581
PMID:34733651
|
研究论文 | 本研究基于单细胞和批量转录组分析，发现并构建了透明细胞肾细胞癌的预后模型 | 本研究整合了单细胞和批量转录组数据，发现了两种具有不同生物学特性的透明细胞肾细胞癌亚型及两个潜在的生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | NA | 发现透明细胞肾细胞癌的新生物标志物并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 5,933个细胞 |
| 1146 | 2024-08-08 |
Identification of the distinctive role of DPT in dilated cardiomyopathy: a study based on bulk and single-cell transcriptomic analysis
2021-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2913
PMID:34733953
|
研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，识别了DPT在扩张型心肌病中的独特作用 | 首次揭示了DPT在扩张型心肌病中的关键作用，并提出了DPT+成纤维细胞作为心脏重塑过程的新调节因子 | NA | 旨在通过批量和单细胞转录组分析，寻找扩张型心肌病中的潜在关键基因和调节因子 | 扩张型心肌病中的关键基因和调节因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析 | LASSO回归, SVM-RFE, PPI网络 | 转录组数据 | 使用了三个微阵列数据集（GSE57338, GSE42955, GSE79962）和一个验证数据集（GSE116250），以及两个单细胞RNA测序数据集（GSE109816和GSE121893） |
| 1147 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of a Malignant Cell Subset Marker-Based Polygenic Risk Score in Stomach Adenocarcinoma Through Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720649
PMID:34733840
|
研究论文 | 本研究旨在基于恶性细胞标记物的表达，构建胃腺癌（STAD）患者不良生存的多元风险评分（PRS） | 通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了胃腺癌中有限的但显著的肿瘤内异质性，并提出了一种基于恶性细胞亚群标记物的PRS | NA | 构建并验证基于恶性细胞标记物的多元风险评分，以预测胃腺癌患者的预后 | 胃腺癌患者的恶性细胞标记物及其预后影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 涉及胃腺癌和正常胃组织的批量和单细胞RNA测序数据，以及两个独立的外部验证数据集 |
| 1148 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell Bioinformatics Analysis Reveals Intrinsic and Extrinsic Biological Characteristics of Hematopoietic Stem Cell Aging
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745786
PMID:34737765
|
研究论文 | 本研究通过整合三个独立的造血干细胞（HSC）单细胞转录组数据集，揭示了HSC衰老的内在和外在生物学特征 | 首次识别出Stat3和Ifngr1作为偏向凋亡和炎症的衰老HSC的标志物，并发现Skp2诱导的信号通路在衰老HSC中加速G1期过渡 | NA | 阐明造血干细胞衰老的生物学特征及其潜在的标志物和治疗靶点 | 造血干细胞（HSC）的衰老机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立的HSC单细胞转录组数据集 |
| 1149 | 2024-08-08 |
Discussion of "Exponential-family Embedding with Application to Cell Developmental Trajectories for Single-cell RNA-seq Data"
2021, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1880920
PMID:34744216
|
comments | 本文讨论了指数族奇异值分解（eSVD）在单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹应用的新方法及其面临的挑战 | eSVD提供了一个灵活的降维框架，能够处理单参数指数族分布并已证明其一致性 | 本文讨论了eSVD及其他类似方法在未来需要解决的多个开放问题和挑战 | 探讨eSVD及其类似方法的潜力和未来研究方向 | eSVD方法及其在数据分析中的应用 | NA | NA | 指数族奇异值分解（eSVD） | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 1150 | 2024-08-08 |
Meta-Analysis Reveals Transcription Factor Upregulation in Cells of Injured Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.688243
PMID:34744629
|
meta-analysis | 本研究通过分析四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，识别并验证了在小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中至少两倍上调的55个转录因子 | 首次系统地分析了小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中转录因子的上调情况，并通过单细胞RNA测序数据进行了验证 | NA | 旨在理解关键转录因子在外周神经再生中的功能，并为未来研究设计提供实验依据 | 小鼠坐骨神经损伤后的转录因子上调情况 | NA | NA | 微阵列数据分析，mRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 涉及四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，以及单细胞RNA测序数据集 |
| 1151 | 2024-08-08 |
A Dynamic Transcriptome Map of Different Tissue Microenvironment Cells Identified During Gastric Cancer Development Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.728169
PMID:34745098
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了胃癌发展过程中不同组织微环境细胞的动态转录图谱 | 本研究首次揭示了组织微环境细胞在胃癌发展过程中的关键转变标志物和动态致癌轨迹 | NA | 揭示胃癌发展过程中组织微环境细胞的关键病理机制 | 胃癌发展过程中的组织微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1152 | 2024-08-08 |
Ductal Macrophages Predominate in the Immune Landscape of the Lactating Mammary Gland
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.754661
PMID:34745127
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、流式细胞术和三维共聚焦显微镜技术，研究了哺乳期小鼠乳腺组织的免疫景观，发现巨噬细胞在免疫细胞中占主导地位，并可分为至少两种亚型：导管和基质巨噬细胞 | 首次精确描述了哺乳期乳腺组织的免疫组成，特别是导管巨噬细胞的高比例及其在乳腺免疫中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究哺乳期乳腺组织的免疫组成，以改进乳腺炎的预防和治疗策略 | 哺乳期小鼠乳腺组织的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1153 | 2024-08-08 |
The Single-Cell Sequencing: A Dazzling Light Shining on the Dark Corner of Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.759894
PMID:34745998
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞测序（SCS）在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤内异质性（ITH）的理解 | SCS能够测量单个细胞中的基因组序列分布和肿瘤细胞间的遗传变异性，从而提高对ITH的理解 | NA | 探讨SCS的进展及其在肿瘤中的应用 | 肿瘤细胞及其遗传变异性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组序列 | 单个细胞 |
| 1154 | 2024-08-08 |
Data-Driven Modeling of Breast Cancer Tumors Using Boolean Networks
2021, Frontiers in big data
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fdata.2021.656395
PMID:34746770
|
研究论文 | 本文提出了一种基于布尔网络的数据驱动模型，用于模拟乳腺癌肿瘤 | 结合单细胞RNA测序和相互作用组数据，研究上调基因的恶性子网络动态 | NA | 开发一种方法来检测与恶性吸引子稳定性相关的关键基因，这些基因的抑制可能应用于癌症治疗 | 乳腺癌肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | 布尔网络 | 基因表达数据 | 来自癌症基因组图谱的单细胞乳腺癌数据集 |
| 1155 | 2024-08-08 |
Capturing tumour heterogeneity in pre- and post-chemotherapy colorectal cancer ascites-derived cells using single-cell RNA-sequencing
2021-12-22, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212093
PMID:34708245
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了结直肠癌患者腹水来源细胞在化疗前后的肿瘤异质性 | 首次展示了单细胞分辨率下高度异质性的癌症亚群对特定化疗治疗的不同反应 | NA | 探索和表征结直肠癌患者腹水来源细胞的肿瘤异质性 | 结直肠癌患者腹水来源细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 19,653个细胞来自四个样本 |
| 1156 | 2024-08-08 |
Transcriptional landscape associated with TNBC resistance to neoadjuvant chemotherapy revealed by single-cell RNA-seq
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.09.002
PMID:34703883
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了超过5000个来自四名响应者和四名非响应者的单细胞转录组数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）耐药的转录组图谱 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了TNBC对NAC耐药的转录组图谱，并通过多变量生存分析确定了预测无复发生存的三个基因特征 | 本研究仅基于公开的转录组数据进行分析，未来需要进一步的实验验证和临床研究来确认这些发现 | 揭示三阴性乳腺癌对新辅助化疗耐药的机制，并寻找潜在的治疗靶点和预后标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过5000个单细胞，来自四名响应者和四名非响应者 |
| 1157 | 2024-08-08 |
Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.09.019
PMID:34729382
|
研究论文 | 本研究设计了一种单细胞RNA测序方法，用于监测通过慢病毒载体递送CD19-CAR基因的过程 | 本研究揭示了三模态表达模式，并提出了一种基于分布的识别CAR T细胞和CD8+淋巴细胞的方法 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术监测CAR T细胞的生成过程 | 研究对象为通过慢病毒载体暴露的人类供体外周血单个核细胞 | 基因工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 评估了400个与免疫反应相关的基因，包括特定于慢病毒载体的探针 |
| 1158 | 2024-08-08 |
Mitochondrial metabolism coordinates stage-specific repair processes in macrophages during wound healing
2021-12-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.004
PMID:34715039
|
研究论文 | 本文研究了在伤口愈合过程中，巨噬细胞在不同阶段的线粒体代谢变化及其对修复过程的影响 | 首次揭示了线粒体代谢在伤口愈合不同阶段对巨噬细胞功能的关键调控作用 | 研究仅在老鼠皮肤伤口模型中进行，可能需要进一步在其他物种或人体中验证 | 探讨线粒体代谢在伤口愈合过程中对巨噬细胞功能的调控机制 | 早期和晚期伤口愈合阶段的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 老鼠皮肤伤口模型中的巨噬细胞 |
| 1159 | 2024-08-08 |
A novel approach to identify the mechanism of miR-145-5p toxicity to podocytes based on the essential genes targeting analysis
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.09.005
PMID:34729245
|
研究论文 | 本文探讨了miR-145-5p对足细胞的毒性机制，通过分析其对足细胞关键基因的影响 | 本研究提供了一种新的方法来研究miRNA如何影响特定细胞类型，不仅识别miRNA药物副作用的分子机制，还能预测miRNA药物对各种细胞类型的毒性 | NA | 探索miR-145-5p对足细胞的毒性机制 | miR-145-5p对足细胞的影响及其关键基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 正常控制小鼠 |
| 1160 | 2024-08-08 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
|
研究论文 | 本研究通过随机单盲安慰剂对照的II期临床试验，验证了间充质干细胞（MSCs）治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了MSCs治疗COVID-19患者时，能够调动一种新型VNN2造血干细胞/祖细胞样（HSPC-like）细胞，并调节多种免疫细胞的功能 | NA | 验证间充质干细胞治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | COVID-19患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液 | 每个组29名患者 |