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当前共找到 2885 篇文献,本页显示第 1121 - 1140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1121 2024-08-08
Revisit the Cellular Transmission and Emerging Techniques in Understanding the Mechanisms of Proteinopathies
2021, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2
研究论文 本文重新探讨了Aβ和α-synuclein在细胞间传递机制及其在神经退行性疾病中的作用,并总结了近期从不同角度进行的单细胞转录组测序研究 利用单细胞RNA测序技术深入解析了神经系统中的基因表达模式和信号通路 NA 探讨Aβ和α-synuclein的细胞间传递机制及其在神经退行性疾病中的作用 Aβ和α-synuclein的病理聚集和传播机制 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
1122 2024-08-08
Identification of Genetic Predisposition in Noncirrhotic Portal Hypertension Patients With Multiple Renal Cysts by Integrated Analysis of Whole-Genome and Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过综合分析全基因组和单细胞RNA测序数据,探索非肝硬化性门脉高压伴多囊肾患者中的潜在候选变异/基因 本研究首次整合全基因组测序和公开的单细胞RNA测序数据,优先筛选与非肝硬化性门脉高压伴多囊肾相关的潜在候选基因 研究样本量较小,且依赖于公开的单细胞RNA测序数据 探索非肝硬化性门脉高压伴多囊肾患者的潜在遗传影响因素和/或决定因素 非肝硬化性门脉高压伴多囊肾患者 基因组学 非肝硬化性门脉高压 全基因组测序(WGS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据,单细胞RNA测序数据 8,295名肝硬化伴门脉高压患者和267名非肝硬化性门脉高压患者 NA NA NA NA
1123 2024-08-08
Vascular Regulation of Hematopoietic Stem Cell Homeostasis, Regeneration, and Aging
2021, Current stem cell reports IF:2.3Q4
综述 本文综述了骨髓微环境中血管内皮细胞在调节造血干细胞活性、健康和应激反应中的中心作用 近期动态成像研究结合单细胞RNA测序和功能性检测,增进了对支持造血干细胞的细胞类型及其在稳态、再生和衰老期间调控干细胞命运的协同机制的理解 NA 旨在理解造血干细胞与骨髓血管微环境之间的空间互作和分子机制,以开发改善血液疾病和促进健康造血的治疗方法 造血干细胞及其在骨髓微环境中的调节机制 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
1124 2024-08-08
Identification of Prognostic Biomarkers Originating From the Tumor Stroma of Betel Quid-Associated Oral Cancer Tissues
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过基因集富集分析和免疫组织化学等方法,揭示了槟榔相关口腔癌组织中肿瘤基质来源的预后生物标志物。 首次在槟榔相关口腔癌中识别出肿瘤基质来源的TGFBI和HYAL1作为独立的预后生物标志物。 研究样本仅限于台湾地区的槟榔使用者,可能限制了结果的普遍性。 识别槟榔相关口腔癌中的预后生物标志物,以改善口腔癌的控制。 槟榔相关口腔癌组织中的肿瘤基质细胞及其分子标志物。 数字病理学 口腔癌 基因集富集分析 Cox比例风险模型 转录组数据 40例台湾口腔癌组织样本 NA NA NA NA
1125 2024-08-08
Deconvolution of Bulk Gene Expression Profiles with Single-Cell Transcriptomics to Develop a Cell Type Composition-Based Prognostic Model for Acute Myeloid Leukemia
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学数据,利用CIBERSORT算法构建了一个基于细胞类型组成的急性髓系白血病(AML)预后模型,称为CTC评分。 首次基于AML患者外周血或骨髓抽吸物的细胞类型组成(CTCs)建立预后模型。 NA 开发一种基于细胞类型组成的AML预后模型,以辅助临床制定个性化治疗方案。 急性髓系白血病(AML)患者的预后评估。 数字病理学 白血病 CIBERSORT算法 Cox回归模型 基因表达数据 两个公共数据集(GSE6891和TCGA-LAML)中的患者数据,以及一个AML单细胞RNA测序数据集(GSE116256)。 NA NA NA NA
1126 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Defines the Regulation of Spermatogenesis by Sertoli-Cell Androgen Signaling
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序技术,分析了野生型和Sertoli细胞缺乏雄激素受体的小鼠睾丸中的细胞类型和转录变化,揭示了Sertoli细胞中雄激素信号调控精子发生的分子机制 本研究首次通过单细胞转录组测序技术,揭示了Sertoli细胞中雄激素受体信号调控精子发生的细胞特异性靶点和相关基因及信号通路 NA 探索Sertoli细胞中雄激素受体信号调控精子发生的分子和细胞过程 野生型和Sertoli细胞缺乏雄激素受体的小鼠睾丸中的细胞类型和转录变化 数字病理学 男性不育 单细胞转录组测序 NA 转录组 野生型和Sertoli细胞缺乏雄激素受体的小鼠睾丸样本 NA NA NA NA
1127 2024-08-08
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Peripheral Mononuclear Cells in Patients With Ankylosing Spondylitis
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过整合单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq),探讨了强直性脊柱炎(AS)发病相关的关键基因及其机制 发现了与AS进展相关的病原基因NFKB来源于CD8+ T细胞,并揭示了NFKB异常调控FOS、JUN和JUNB的可能机制 NA 构建遗传学研究与生物靶向治疗之间的桥梁 强直性脊柱炎患者的外周单核细胞 数字病理学 强直性脊柱炎 单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列,染色质可及性数据 强直性脊柱炎患者和正常对照的外周单核细胞中鉴定出18种细胞类型 NA NA NA NA
1128 2024-08-08
Identification of KLF6/PSGs and NPY-Related USF2/CEACAM Transcriptional Regulatory Networks via Spinal Cord Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis
2021, Disease markers
研究论文 本研究通过脊髓bulk和单细胞RNA-Seq分析,识别了KLF6/PSGs和NPY相关的USF2/CEACAM转录调控网络 本研究首次通过单细胞分析识别了USF2/CEACAM1&5和KLF6/PSG3&5转录调控网络 NA 进一步理解脊髓发育的转录特征 新生小鼠脊髓的V2a中间神经元 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) Seurat包 单细胞RNA测序数据 共筛选了949个细胞 NA NA NA NA
1129 2024-08-08
Roseburia intestinalis: A Beneficial Gut Organism From the Discoveries in Genus and Species
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
综述 本文综述了Roseburia intestinalis这一厌氧、革兰氏阳性、略弯曲的杆状鞭毛细菌在肠道中的作用及其在多种疾病治疗中的潜在价值 近期在初级培养技术、培养组学、单细胞测序和代谢组学技术上的进步提高了对Roseburia intestinalis的研究,揭示了其在人类健康和疾病治疗中的益处 NA 探讨Roseburia intestinalis在人类疾病治疗中的潜在作用 Roseburia intestinalis及其在肠道炎症、能量稳态和多种疾病中的作用 NA 炎症性肠病, 2型糖尿病, 抗磷脂综合征, 动脉粥样硬化 初级培养技术, 培养组学, 单细胞测序, 代谢组学 NA NA NA NA NA NA NA
1130 2024-08-08
Isolation of dental pulp and periodontal cells from human teeth for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文描述了一种从人类牙齿中分离牙髓和牙周细胞进行单细胞RNA测序分析的协议 提出了一个用于分离牙髓和牙周组织细胞的协议,以便进行单细胞RNA测序分析 NA 研究牙髓和牙周组织在多种病理影响下的细胞特性 人类牙髓和牙周组织细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
1131 2024-08-08
Optimized protocol for isolation of high-quality single cells from the female mouse reproductive tract tissues for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文描述了一种优化的协议,用于从雌性小鼠生殖道组织中分离高质量的单细胞,以进行单细胞RNA测序 提出了针对雌性生殖道不同区域的独特单细胞制备方法,以生成完整的分子细胞图谱 NA 研究正常生理和疾病状态下的分子细胞图谱 雌性小鼠生殖道的单细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 不同雌性小鼠生殖道区域的单细胞 NA NA NA NA
1132 2024-08-08
Protocol for scChaRM-seq: Simultaneous profiling of gene expression, DNA methylation, and chromatin accessibility in single cells
2021-12-17, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种名为scChaRM-seq的单细胞多组学测序技术,该技术能够同时分析单细胞中的基因表达、DNA甲基化和染色质可及性 scChaRM-seq技术结合了单细胞RNA测序、DNA甲基化和染色质可及性分析,提供了对单细胞功能和表观遗传调控的多模态理解 NA 开发和应用scChaRM-seq技术以研究单个人卵细胞中的DNA甲基化及其与转录和染色质可及性的关系 单个人卵细胞中的DNA甲基化、转录和染色质可及性 基因组学 NA scChaRM-seq NA 基因表达、DNA甲基化、染色质可及性数据 单个人卵细胞 NA NA NA NA
1133 2024-08-08
Prognostic value of metabolic signature on 18F-FDGuptake in breast cancer patients after radiotherapy
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics IF:5.3Q1
研究论文 本研究旨在通过利用公共数据集的mRNA表达谱,识别与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 首次构建并验证了与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 NA 研究放射治疗后乳腺癌患者的葡萄糖摄取特征的预后价值 放射治疗后的乳腺癌患者 NA 乳腺癌 单样本基因集富集分析(ssGSEA) NA mRNA表达谱 三个放射治疗后乳腺癌队列(GSE103744、NKI和FUSCC数据库)以及五个乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据库 NA NA NA NA
1134 2024-08-08
Systematic temporal analysis of peripheral blood transcriptomes using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation as a hallmark of severe COVID-19
2021-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个开源R包TrendCatcher,用于识别和可视化纵向转录组数据中的动态转录基因特征和生物过程 TrendCatcher应用平滑样条ANOVA模型和断点搜索策略,优化了时间序列转录组数据的分析方法 NA 研究COVID-19疾病进展中的基因表达变化,以识别早期生物标志物和潜在的治疗靶点 COVID-19患者的外周血转录组 生物信息学 COVID-19 RNA-seq 平滑样条ANOVA模型 转录组数据 包括bulk RNA-seq和scRNA-seq的时间序列数据 NA NA NA NA
1135 2024-08-08
Evolution of synapses and neurotransmitter systems: The divide-and-conquer model for early neural cell-type evolution
2021-12, Current opinion in neurobiology IF:4.8Q1
综述 本文综述了非两侧对称动物中神经分子进化的当前理解,并通过重新分析刺胞动物的单细胞测序数据,揭示了其与两侧对称动物神经元类型的同源性证据 提出了Unc13-RIM神经元可能存在于最早的真后生动物中,并在两侧对称动物的进化中占据主导地位的假设 NA 探讨神经系统和神经递质系统的进化,特别是早期神经细胞类型的进化 非两侧对称动物的神经分子进化及刺胞动物与两侧对称动物神经元的同源性 神经科学 NA 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA NA NA NA
1136 2024-08-08
Transcriptional profiling of sequentially generated septal neuron fates
2021-12-01, eLife IF:6.4Q1
research paper 本文通过单细胞RNA测序、组织学和遗传模型研究了海马神经元多样性在神经发生过程中的建立机制 发现海马前体细胞的转录组特征随神经发生而变化,并与不同神经元类型的生成相吻合 NA 探究海马神经元多样性的建立机制 海马神经元及其前体细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及至少三种形态学类别的神经元 NA NA NA NA
1137 2024-08-08
Loss of PRC2 subunits primes lineage choice during exit of pluripotency
2021-11-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了Polycomb抑制复合物2(PRC2)在胚胎干细胞(ESCs)中的两种不同形式PRC2.1和PRC2.2在谱系特化和承诺中的作用 揭示了MTF2和JARID2在PRC2复合物中的不同作用,以及它们在平衡谱系特异性基因激活中的重要性 NA 研究PRC2在胚胎干细胞谱系选择和承诺中的作用 MTF2和JARID2缺失的胚胎干细胞及其衍生的胚胎体 发育生物学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 来自MTF2和JARID2缺失的胚胎干细胞的胚胎体 NA NA NA NA
1138 2024-08-08
ScLRTC: imputation for single-cell RNA-seq data via low-rank tensor completion
2021-Nov-29, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文提出了一种基于低秩张量补全的方法scLRTC,用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 scLRTC方法利用单细胞间的相似性构建三阶低秩张量,并通过张量分解去噪,采用低秩张量补全算法重建细胞表达,恢复基因间和细胞间的相关性 NA 旨在解决单细胞RNA测序数据中的缺失数据和噪声问题,以提高下游分析的准确性 单细胞RNA测序数据中的缺失值 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 低秩张量补全 基因-细胞表达矩阵 不同数据规模的模拟数据集和真实单细胞RNA测序数据集 NA NA NA NA
1139 2024-08-08
Subclone-specific microenvironmental impact and drug response in refractory multiple myeloma revealed by single-cell transcriptomics
2021-11-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了20名复发/难治性多发性骨髓瘤(RRMM)患者治疗前后肿瘤细胞及其与骨髓微环境(BME)的复杂相互作用网络 揭示了具有1q染色体增益的亚克隆在治疗期间频繁扩增,并通过上调炎症细胞因子和与骨髓细胞紧密相互作用,塑造了一个免疫抑制的BME NA 解析RRMM中亚克隆的转录特征和微环境重编程机制,为临床决策提供依据 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 20名复发/难治性多发性骨髓瘤患者 NA NA NA NA
1140 2024-08-08
Stroke subtype-dependent synapse elimination by reactive gliosis in mice
2021-11-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用小鼠缺血性和出血性中风模型,探讨了反应性神经胶质增生区域中微胶质细胞/巨噬细胞和星形胶质细胞在吞噬突触中的不同作用 通过特异性删除MEGF10和MERTK吞噬受体,发现抑制微胶质细胞/巨噬细胞或星形胶质细胞的吞噬作用可以改善神经行为结果并减轻脑损伤 NA 探讨反应性神经胶质增生在中枢神经系统修复中的病理作用 微胶质细胞/巨噬细胞和星形胶质细胞在反应性神经胶质增生区域中吞噬突触的作用 NA 中风 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠缺血性和出血性中风模型 NA NA NA NA
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