单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2886 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2024-08-08 |
Epithelial-to-Mesenchymal Transition-Derived Heterogeneity in Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2021-Oct-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215355
PMID:34771518
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综述 | 本文综述了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中由上皮间质转化（EMT）引起的异质性及其对治疗反应的影响 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了与细胞周期、细胞应激、缺氧、上皮分化及部分上皮间质转化（pEMT）相关的RNA表达特征，这些特征与不良临床特征相关 | NA | 探讨HNSCC中分子异质性的机制及其对治疗反应的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的上皮间质转化（EMT）及其相关分子特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 1122 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulation dynamics from static snapshots of gene expression variability
2021-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.104.044406
PMID:34781497
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研究论文 | 本文展示了如何利用基因表达变异性的静态群体快照来严格推断基因表达动力学的特性 | 本文提出了一种利用荧光蛋白不同成熟时间的双报告实验方法，将实验缺陷转化为分析特征，并推导出检测基因调控网络中闭环反馈调控存在的相关条件 | NA | 从单细胞测序或流式细胞术实验获得的细胞异质性数据中推断基因调控动力学 | 基因调控网络中的功能关系和基因表达动力学 | 系统生物学 | NA | 单细胞测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1123 | 2024-08-08 |
Application of single-cell RNA sequencing technology in liver diseases: a narrative review
2021-Oct, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-4824
PMID:34790804
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肝脏疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术为健康和疾病肝脏提供了许多新的见解，有助于揭示肝脏发育、再生和疾病的分子机制 | NA | 总结单细胞转录组测序技术在肝脏疾病中的应用，并探讨其挑战和未来应用潜力 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 1124 | 2024-08-08 |
Fast and memory-efficient scRNA-seq k-means clustering with various distances
2021-Aug, ACM-BCB ... ... : the ... ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine. ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine
DOI:10.1145/3459930.3469523
PMID:34778889
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法和开源库minicore，用于高效地对单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据进行k-means聚类 | minicore库引入了向量化的加权水库抽样算法，能够快速找到初始的k-means++中心，并支持多种距离度量，如欧几里得距离、Jensen-Shannon散度、Kullback-Leibler散度和Bhattachaiyya距离 | NA | 开发一种快速且内存高效的scRNA-seq数据k-means聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | k-means聚类 | 基因表达矩阵 | 400万细胞 |
| 1125 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Novel Role of Ezh2 in NK Cell Maturation and Function
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.724276
PMID:34764950
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索Ezh2在NK细胞成熟和功能中的新作用 | 发现Ezh2通过激活AP-1家族基因表达在NK细胞发育中起关键作用，并揭示了Ezh2-AP-1-Klrg1轴在改变NK细胞成熟轨迹和细胞毒性中的新角色 | NA | 探索Ezh2在NK细胞成熟过程中的作用 | NK细胞的成熟和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六个不同阶段的NK细胞 |
| 1126 | 2024-08-08 |
GeneMarkeR: A Database and User Interface for scRNA-seq Marker Genes
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763431
PMID:34764987
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research paper | 本文介绍了一个名为GeneMarkeR的数据库和用户界面，用于scRNA-seq标记基因的检索 | GeneMarkeR采用了一种新算法，能够跨物种、方法和样本类型检索显示细胞类型特异性的标记基因，并支持在线提交和更新 | NA | 开发一个标准化的数据库和用户界面，以支持scRNA-seq分析中的细胞类型识别 | scRNA-seq标记基因 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 261,000行标准化标记基因结果，来自25项研究，涉及21,012个独特的基因组实体和99种独特的细胞类型 |
| 1127 | 2024-08-08 |
6-Phosphogluconolactonase Promotes Hepatocellular Carcinogenesis by Activating Pentose Phosphate Pathway
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.753196
PMID:34765603
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞单细胞测序数据，发现6-磷酸葡萄糖酸内酯酶（PGLS）与未分化型肝细胞癌亚型相关，并揭示了PGLS通过激活戊糖磷酸途径促进肝细胞癌发生发展的机制。 | 首次揭示PGLS在肝细胞癌中的作用及其通过调节戊糖磷酸途径影响癌细胞代谢的机制。 | NA | 探讨6-磷酸葡萄糖酸内酯酶在肝细胞癌中的作用及其机制。 | 肝细胞癌（HCC）细胞及其代谢途径。 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞 |
| 1128 | 2024-08-08 |
Plasma Gradient of Soluble Urokinase-Type Plasminogen Activator Receptor Is Linked to Pathogenic Plasma Proteome and Immune Transcriptome and Stratifies Outcomes in Severe COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738093
PMID:34777349
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研究论文 | 研究探讨了可溶性尿激酶型纤溶酶原激活物受体（suPAR）在严重COVID-19患者中的水平及其与疾病结果的关系 | 首次报道了suPAR在严重COVID-19患者中的高水平与特定的血浆蛋白质组和免疫转录组相关，并能有效预测患者死亡率 | 研究基于印度COVID-19患者群体，结果的普遍性可能受限 | 研究suPAR在严重COVID-19患者中的作用及其对疾病结果的影响 | 严重COVID-19患者，特别是伴有急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 流式细胞术、下一代测序、基于质谱的蛋白质组学 | NA | 血浆样本、单细胞RNA测序数据 | 印度COVID-19患者群体 |
| 1129 | 2024-08-08 |
Maximizing the Utility of Transcriptomics Data in Inflammatory Skin Diseases
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.761890
PMID:34777377
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综述 | 本文综述了转录组学数据在炎症性皮肤病中的应用，并讨论了如何最大化这些数据以推动诊断生物标志物和治疗靶点的发展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学在揭示炎症性皮肤病潜在转化靶点中的应用 | NA | 阐明典型炎症性皮肤病的分子因素，并推动诊断和治疗策略的改进 | 炎症性皮肤病，如银屑病和特应性皮炎 | 转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1130 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Cultured Bovine Satellite Cells
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.742077
PMID:34777469
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了牛卫星细胞的组成，揭示了其异质性 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入分析牛卫星细胞的基因表达谱，揭示了不同细胞群的转录状态和肌源性状态的差异 | 研究中仍有六个细胞群的身份无法确定 | 了解牛骨骼肌组成的遗传和生理机制，以提高牛骨骼肌生长效率或质量 | 牛卫星细胞及其在骨骼肌发育和生长中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从2周龄雄性小牛中分离的卫星细胞，共19,096个单细胞 |
| 1131 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of N6-Methyladenosine RNA Methylation Regulators Expression Identify Distinct Molecular Subtypes of Myocardial Infarction
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.756483
PMID:34778266
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研究论文 | 本研究通过分析N6-甲基腺苷（m6A）修饰调控因子的表达水平，确定了心肌梗死（MI）的不同分子亚型，并探讨了这些亚型在基因表达和信号通路中的差异。 | 首次通过全面分析m6A调控因子的表达，揭示了心肌梗死的三种分子亚型，并发现了与这些亚型相关的关键基因和信号通路。 | 研究主要基于数据库和生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认这些发现。 | 探讨m6A修饰在心肌梗死中的作用，并识别可能的生物标志物用于心肌梗死的治疗和诊断。 | 心肌梗死患者的心脏组织和m6A调控因子的表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究数据分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE5406数据库中的数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 1132 | 2024-08-08 |
Immune infiltration and prognostic and diagnostic use of LGALS4 in colon adenocarcinoma and bladder urothelial carcinoma
2021, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:34786063
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研究论文 | 本研究分析了免疫相关基因在结肠腺癌（COAD）中的预后和诊断特征，并发现LGALS4基因在COAD和膀胱尿路上皮癌（BLCA）中的下调现象 | 识别了LGALS4作为多种癌症类型的预后和诊断标志物，并揭示了一系列新的候选药物靶点和分子标志物 | NA | 评估免疫相关基因在结肠腺癌中的预后和诊断价值 | 结肠腺癌（COAD）和膀胱尿路上皮癌（BLCA）中的免疫相关基因 | 数字病理学 | 结肠癌 | TIMER（肿瘤免疫评估资源）解卷积方法 | NA | 基因表达谱 | 17个COAD和健康样本的基因表达谱 |
| 1133 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Ecosystems in Papillary Thyroid Carcinoma Progression
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.729565
PMID:34790166
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了乳头状甲状腺癌（PTC）进展中的生态系统 | 首次详细描述了PTC生态系统中的细胞组成和相互作用，特别是在原发肿瘤和淋巴结转移中的差异 | 研究仅基于单一患者样本，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解乳头状甲状腺癌的生物学特性，为个性化治疗提供依据 | 乳头状甲状腺癌的原发肿瘤、淋巴结转移和癌旁组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序（Sc-RNA seq） | NA | 转录组数据 | 11,805个细胞转录组 |
| 1134 | 2024-08-08 |
Computational workflow for functional characterization of COVID-19 through secondary data analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100873
PMID:34746856
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研究论文 | 本文介绍了一种计算异构数据集成和挖掘协议，用于通过结合多个模型系统的转录组签名、蛋白质-蛋白质相互作用、单细胞RNA-seq标记和表型-基因型关联来识别功能特征复合体，以更好地理解疾病病理生理学和结果。 | 该研究提出了一种新的计算方法，通过整合多种数据类型来识别功能特征复合体，这种方法在标准转录组分析的基础上提供了更深入的分子机制洞察。 | NA | 旨在通过次级数据分析来功能性地表征COVID-19，并揭示其背后的分子机制。 | COVID-19的功能特征及其相关分子机制。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 1135 | 2024-08-08 |
Isolation of human fetal intestinal cells for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100890
PMID:34746860
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类胎儿肠道样本中分离上皮和非上皮细胞的方法，用于单细胞RNA测序 | 该方法能够产生一个完整的人类发育过程中肠道细胞的图谱 | NA | 开发一种高效的方法来分离人类胎儿肠道细胞，以进行单细胞RNA测序 | 人类胎儿肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个胎儿肠道样本 |
| 1136 | 2024-08-08 |
Dissociation of human oral mucosal tissue for single-cell applications
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100908
PMID:34746866
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研究论文 | 本文描述了一种用于制备和分离人类颊部和牙龈口腔黏膜组织的高存活率单细胞悬浮液的协议 | 提出了一种新的方法来分离口腔黏膜组织中的多种细胞类型，同时保持高细胞存活率 | NA | 开发一种有效的口腔黏膜组织单细胞分离方法 | 人类颊部和牙龈的口腔黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1137 | 2024-08-08 |
Processing human lymph node samples for single-cell assays
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100914
PMID:34746869
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研究论文 | 本文描述了一种高效且温和的人体淋巴结样本处理方法，用于生成适合单细胞分析的单细胞悬浮液 | 该协议避免了酶促或机械应力，优化了生成适合单细胞RNA测序等精细分析的单细胞悬浮液 | NA | 为了更好地理解恶性与非恶性细胞之间的细胞异质性和复杂相互作用 | 人体淋巴结样本 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬浮液 | NA |
| 1138 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptional Changes in Neurodegenerative Diseases
2021-12-15, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和单核RNA测序技术在神经退行性疾病分子变化研究中的最新进展和发现 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，提供了脑细胞在单细胞水平上的细胞和分子细节，增进了对中枢神经系统的理解 | NA | 探讨神经退行性疾病的分子变化及其机制 | 神经退行性疾病中的单细胞转录变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1139 | 2024-08-08 |
A multi-omic single-cell landscape of human gynecologic malignancies
2021-12-02, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.10.013
PMID:34739872
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研究论文 | 本文通过单细胞分辨率下的转录组（scRNA-seq）和染色质可及性（scATAC-seq）分析，揭示了人类卵巢和子宫内膜肿瘤的复杂细胞异质性及其调控机制。 | 本文首次展示了恶性细胞通过获取先前未注释的调控元件来驱动癌症标志性通路，并强调了肿瘤内异质性的重要性。 | NA | 旨在解析驱动癌细胞转录程序的调控机制，以深入理解肿瘤生物学。 | 人类卵巢和子宫内膜肿瘤。 | 数字病理学 | 妇科恶性肿瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 立即手术切除的人类卵巢和子宫内膜肿瘤样本。 |
| 1140 | 2024-08-08 |
Interneuron origin and molecular diversity in the human fetal brain
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00940-3
PMID:34737447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位测序技术，揭示了人类胎儿脑中不同类型中间神经元前体细胞的分子特征 | 首次详细描述了人类胎儿脑中中间神经元前体细胞的分子多样性及其起源 | NA | 解析人类胎儿脑中中间神经元的起源和多样性 | 人类胎儿脑中的中间神经元前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位测序 | NA | RNA | NA |