单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2024-08-08 |
Deciphering cell lineage specification of human lung adenocarcinoma with single-cell RNA sequencing
2021-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26770-2
PMID:34764257
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了25名肺腺癌患者的268,471个细胞，揭示了肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性及其转录特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了肺腺癌从癌前病变到侵袭性癌的细胞异质性和分子事件 | NA | 揭示肺腺癌不同组织学阶段的细胞谱系特异性和转录特征 | 肺腺癌患者的细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 268,471个细胞，来自25名患者 |
| 1082 | 2024-08-08 |
COVID-19 immune features revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2021-Nov-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.10.023
PMID:34767776
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1083 | 2024-08-08 |
IRF3 Knockout Results in Partial or Complete Rejection of Murine Mesothelioma
2021-Nov-07, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10215196
PMID:34768716
|
研究论文 | 研究IRF3敲除对小鼠间皮瘤的影响及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次探讨IRF3在间皮瘤中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | NA | 探索IRF3敲除对小鼠间皮瘤的治疗潜力及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 | NA | 间皮瘤 | 流式细胞术，scRNA-Seq | NA | mRNA表达数据 | 多种小鼠间皮瘤细胞系及IRF3敲除小鼠 |
| 1084 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity and Functional Diversity of Lymphatic Endothelial Cells
2021-Nov-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111976
PMID:34769408
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示淋巴内皮细胞异质性和功能多样性方面的最新发现 | 结合单细胞RNA测序数据与成像和深入的功能实验，推进对健康和疾病中淋巴内皮细胞的了解 | 对慢性炎症疾病中淋巴内皮细胞异质性和功能多样性的知识有限 | 总结单细胞RNA测序在淋巴血管生物学领域的新发现，并探讨淋巴内皮细胞作为慢性炎症疾病新治疗靶点的可能性 | 淋巴内皮细胞的异质性、功能多样性及其与其他细胞的相互作用 | 数字病理学 | 慢性炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1085 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis of Human Small Antral Follicles
2021-Nov-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111955
PMID:34769386
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征 | 首次描述了小腔卵泡中卵母细胞及其周围颗粒细胞的转录特征，并探讨了不同信号通路在卵母细胞和颗粒细胞间的双向配体-受体相互作用 | NA | 揭示小腔卵泡的多样性，并填补人类卵泡发育和卵子发生分子景观图谱的空白 | 人类小腔卵泡中的卵母细胞及其周围颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（SmartSeq2） | NA | 转录组数据 | 多个个体的小腔卵泡 |
| 1086 | 2024-08-08 |
Activated but impaired IFN-γ production of mucosal-associated invariant T cells in patients with hepatocellular carcinoma
2021-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003685
PMID:34789552
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）在肝细胞癌（HCC）患者中的功能和特征 | 首次详细描述了HCC患者中窦内MAIT细胞的功能和表型特征 | 研究仅限于外周血和肝脏样本，未涉及其他组织或器官 | 研究HCC患者中MAIT细胞的功能和表型变化 | HCC患者的外周血和肝脏中的MAIT细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | HCC患者和健康对照者的外周血和肝脏样本 |
| 1087 | 2024-08-08 |
Identification of astroglia-like cardiac nexus glia that are critical regulators of cardiac development and function
2021-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001444
PMID:34793438
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research paper | 本文通过荧光时间流逝成像、命运图谱和突变生成在斑马鱼模型中，鉴定了一种神经嵴来源的胶质细胞，称为nexus胶质细胞，该细胞利用Meteorin信号通过Jak/Stat3途径驱动分化并调节心率和节律。 | 首次在斑马鱼模型中鉴定出一种神经嵴来源的nexus胶质细胞，并揭示其在心脏发育和功能中的关键作用。 | NA | 研究nexus胶质细胞在心脏发育和功能中的作用及其分子机制。 | nexus胶质细胞及其在心脏中的功能。 | NA | NA | confocal time-lapse imaging, fate mapping, single-cell sequencing | NA | image, sequencing data | 涉及人类和鼠类心脏的单细胞测序数据 |
| 1088 | 2024-08-08 |
Rapid Isolation of Single Cells from Mouse and Human Teeth
2021-10-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63043
PMID:34779437
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研究论文 | 本文介绍了一种快速协议，用于从鼠和人类的牙齿中高效分离单细胞，适用于单细胞RNA测序 | 该协议通过加速组织分离步骤、酶消化和后续的单细胞悬液制备，实现了快速且温和的组织处理，适用于富含细胞外基质的组织 | NA | 开发一种快速且高效的单细胞分离方法，适用于单细胞转录组学研究 | 鼠和人类的牙齿组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 细胞 | 多个鼠和人类样本 |
| 1089 | 2024-08-08 |
Transcriptional Differences in Lipid-Metabolizing Enzymes in Murine Sebocytes Derived from Sebaceous Glands of the Skin and Preputial Glands
2021-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222111631
PMID:34769061
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序方法比较了来自皮肤皮脂腺和包皮腺的小鼠皮脂细胞，揭示了两者在脂质代谢酶表达水平上的显著差异 | 发现了皮肤皮脂腺和包皮腺皮脂细胞在特定脂质类生物合成途径中基因表达的显著差异，特别是涉及甲羟戊酸途径和鞘脂回收途径的酶编码基因 | 使用包皮腺作为皮肤皮脂腺的研究模型存在局限性，需要在实验设计前仔细考虑两者之间的差异 | 比较皮肤皮脂腺和包皮腺的皮脂细胞，揭示两者之间的相似性和差异 | 小鼠皮肤皮脂腺和包皮腺的皮脂细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1090 | 2024-08-08 |
The Epithelial and Stromal Immune Microenvironment in Gastric Cancer: A Comprehensive Analysis Reveals Prognostic Factors with Digital Cytometry
2021-Oct-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215382
PMID:34771544
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研究论文 | 本文通过数字细胞计量技术分析胃癌中的上皮和间质免疫微环境，构建了一个新的特征矩阵，利用单细胞RNA测序数据集和细胞混合反卷积方法，从批量转录组数据中估计不同上皮、间质和免疫细胞的比例，并识别出胃癌的强预后因子。 | 本文构建了一个新的特征矩阵来解析上皮和间质信号，并应用细胞混合反卷积方法从批量转录组数据中估计细胞比例，识别出胃癌的独立预后因子STEM评分。 | NA | 研究胃癌中的上皮和间质免疫微环境，识别预后因子。 | 胃癌患者的上皮、间质和免疫细胞比例及其预后影响。 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 四个独立的胃癌队列（GSE62254, GSE15459, GSE84437, TCGA-STAD） |
| 1091 | 2024-08-08 |
Epithelial-to-Mesenchymal Transition-Derived Heterogeneity in Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2021-Oct-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13215355
PMID:34771518
|
综述 | 本文综述了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中由上皮间质转化（EMT）引起的异质性及其对治疗反应的影响 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了与细胞周期、细胞应激、缺氧、上皮分化及部分上皮间质转化（pEMT）相关的RNA表达特征，这些特征与不良临床特征相关 | NA | 探讨HNSCC中分子异质性的机制及其对治疗反应的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的上皮间质转化（EMT）及其相关分子特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 1092 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulation dynamics from static snapshots of gene expression variability
2021-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.104.044406
PMID:34781497
|
研究论文 | 本文展示了如何利用基因表达变异性的静态群体快照来严格推断基因表达动力学的特性 | 本文提出了一种利用荧光蛋白不同成熟时间的双报告实验方法，将实验缺陷转化为分析特征，并推导出检测基因调控网络中闭环反馈调控存在的相关条件 | NA | 从单细胞测序或流式细胞术实验获得的细胞异质性数据中推断基因调控动力学 | 基因调控网络中的功能关系和基因表达动力学 | 系统生物学 | NA | 单细胞测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1093 | 2024-08-08 |
Application of single-cell RNA sequencing technology in liver diseases: a narrative review
2021-Oct, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-4824
PMID:34790804
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肝脏疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术为健康和疾病肝脏提供了许多新的见解，有助于揭示肝脏发育、再生和疾病的分子机制 | NA | 总结单细胞转录组测序技术在肝脏疾病中的应用，并探讨其挑战和未来应用潜力 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 1094 | 2024-08-08 |
Fast and memory-efficient scRNA-seq k-means clustering with various distances
2021-Aug, ACM-BCB ... ... : the ... ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine. ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine
DOI:10.1145/3459930.3469523
PMID:34778889
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法和开源库minicore，用于高效地对单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据进行k-means聚类 | minicore库引入了向量化的加权水库抽样算法，能够快速找到初始的k-means++中心，并支持多种距离度量，如欧几里得距离、Jensen-Shannon散度、Kullback-Leibler散度和Bhattachaiyya距离 | NA | 开发一种快速且内存高效的scRNA-seq数据k-means聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | k-means聚类 | 基因表达矩阵 | 400万细胞 |
| 1095 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Novel Role of Ezh2 in NK Cell Maturation and Function
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.724276
PMID:34764950
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索Ezh2在NK细胞成熟和功能中的新作用 | 发现Ezh2通过激活AP-1家族基因表达在NK细胞发育中起关键作用，并揭示了Ezh2-AP-1-Klrg1轴在改变NK细胞成熟轨迹和细胞毒性中的新角色 | NA | 探索Ezh2在NK细胞成熟过程中的作用 | NK细胞的成熟和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六个不同阶段的NK细胞 |
| 1096 | 2024-08-08 |
GeneMarkeR: A Database and User Interface for scRNA-seq Marker Genes
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763431
PMID:34764987
|
research paper | 本文介绍了一个名为GeneMarkeR的数据库和用户界面，用于scRNA-seq标记基因的检索 | GeneMarkeR采用了一种新算法，能够跨物种、方法和样本类型检索显示细胞类型特异性的标记基因，并支持在线提交和更新 | NA | 开发一个标准化的数据库和用户界面，以支持scRNA-seq分析中的细胞类型识别 | scRNA-seq标记基因 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 261,000行标准化标记基因结果，来自25项研究，涉及21,012个独特的基因组实体和99种独特的细胞类型 |
| 1097 | 2024-08-08 |
6-Phosphogluconolactonase Promotes Hepatocellular Carcinogenesis by Activating Pentose Phosphate Pathway
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.753196
PMID:34765603
|
研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞单细胞测序数据，发现6-磷酸葡萄糖酸内酯酶（PGLS）与未分化型肝细胞癌亚型相关，并揭示了PGLS通过激活戊糖磷酸途径促进肝细胞癌发生发展的机制。 | 首次揭示PGLS在肝细胞癌中的作用及其通过调节戊糖磷酸途径影响癌细胞代谢的机制。 | NA | 探讨6-磷酸葡萄糖酸内酯酶在肝细胞癌中的作用及其机制。 | 肝细胞癌（HCC）细胞及其代谢途径。 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞 |
| 1098 | 2024-08-08 |
Plasma Gradient of Soluble Urokinase-Type Plasminogen Activator Receptor Is Linked to Pathogenic Plasma Proteome and Immune Transcriptome and Stratifies Outcomes in Severe COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738093
PMID:34777349
|
研究论文 | 研究探讨了可溶性尿激酶型纤溶酶原激活物受体（suPAR）在严重COVID-19患者中的水平及其与疾病结果的关系 | 首次报道了suPAR在严重COVID-19患者中的高水平与特定的血浆蛋白质组和免疫转录组相关，并能有效预测患者死亡率 | 研究基于印度COVID-19患者群体，结果的普遍性可能受限 | 研究suPAR在严重COVID-19患者中的作用及其对疾病结果的影响 | 严重COVID-19患者，特别是伴有急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 流式细胞术、下一代测序、基于质谱的蛋白质组学 | NA | 血浆样本、单细胞RNA测序数据 | 印度COVID-19患者群体 |
| 1099 | 2024-08-08 |
Maximizing the Utility of Transcriptomics Data in Inflammatory Skin Diseases
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.761890
PMID:34777377
|
综述 | 本文综述了转录组学数据在炎症性皮肤病中的应用，并讨论了如何最大化这些数据以推动诊断生物标志物和治疗靶点的发展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学在揭示炎症性皮肤病潜在转化靶点中的应用 | NA | 阐明典型炎症性皮肤病的分子因素，并推动诊断和治疗策略的改进 | 炎症性皮肤病，如银屑病和特应性皮炎 | 转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1100 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Cultured Bovine Satellite Cells
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.742077
PMID:34777469
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了牛卫星细胞的组成，揭示了其异质性 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入分析牛卫星细胞的基因表达谱，揭示了不同细胞群的转录状态和肌源性状态的差异 | 研究中仍有六个细胞群的身份无法确定 | 了解牛骨骼肌组成的遗传和生理机制，以提高牛骨骼肌生长效率或质量 | 牛卫星细胞及其在骨骼肌发育和生长中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从2周龄雄性小牛中分离的卫星细胞，共19,096个单细胞 |