单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2024-08-08 |
MapCell: Learning a Comparative Cell Type Distance Metric With Siamese Neural Nets With Applications Toward Cell-Type Identification Across Experimental Datasets
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.767897
PMID:34796179
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研究论文 | 本文介绍了一种使用孪生神经网络（SNN）学习比较细胞类型距离度量（MapCell）的方法，并展示了其在跨实验数据集的细胞类型识别中的应用 | 提出了一种基于深度度量学习的方法，使用孪生神经网络来捕捉细胞间的相似性，并促进不同实验间细胞类型注释的转移 | NA | 探索深度度量学习方法在跨实验数据集细胞类型识别中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 孪生神经网络（SNN） | 数据集 | 小规模训练集 |
| 1082 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing deconvolutes the in vivo heterogeneity of human bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61950
PMID:34803492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了人骨髓来源间充质干细胞的细胞异质性 | 首次系统地剖析了人骨髓来源间充质干细胞的细胞亚型，揭示了其细胞异质性及其在维持骨骼稳态中的作用 | NA | 探究人骨髓来源间充质干细胞的转录多样性 | 人骨髓来源间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自两名人类受试者的CD271骨髓单个核细胞 |
| 1083 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity of Tumor-Associated Macrophage in Non-Small Cell Lung Cancer and Differences Between Sexes
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.756722
PMID:34804043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在性别间的差异 | 首次在单细胞水平上详细分析了非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的亚型组成和功能异质性，并比较了性别对其的影响 | 研究仅限于早期吸烟的非小细胞肺癌患者，可能无法完全代表所有非小细胞肺癌患者的情况 | 阐明非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的亚型组成和功能异质性，并探讨性别对其的影响 | 非小细胞肺癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早期吸烟的非小细胞肺癌患者 |
| 1084 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals a Tumor-Reactive T Cell Signature Associated With Clinical Outcome and Immunotherapy Response In Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.758288
PMID:34804045
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研究论文 | 本研究通过整合分析三个黑色素瘤中T细胞的单细胞RNA测序数据集，揭示了肿瘤微环境中T细胞的广泛异质性功能状态，并识别出表达肿瘤反应性标记和T细胞激活标志的肿瘤反应性T细胞亚群 | 本研究首次开发并验证了一个与临床结果和免疫治疗反应显著相关的肿瘤反应性T细胞相关标志（TRS），该标志在预测免疫治疗反应方面优于CD8+ T细胞浸润水平和先前发表的预后相关标志 | NA | 旨在识别肿瘤反应性T细胞并开发一个与临床结果和免疫治疗反应相关的标志 | 黑色素瘤中的T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个黑色素瘤T细胞数据集及四个外部独立队列 |
| 1085 | 2024-08-08 |
Clinical Impact of Molecular Subtyping of Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743908
PMID:34805152
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研究论文 | 本文探讨了胰腺癌分子亚型对临床的影响及其潜在的临床意义 | 文章介绍了通过激光捕获显微切割和单细胞RNA测序技术揭示的胰腺癌细胞群体的基因组进化，以及不同亚型在化疗反应和生存率上的差异 | 文章未明确提及具体的局限性 | 研究胰腺癌分子亚型的临床相关性，以优化从实验室到临床的转化 | 胰腺癌的分子亚型及其对治疗反应和生存率的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1086 | 2024-08-08 |
Papillary Thyroid Carcinoma Landscape and Its Immunological Link With Hashimoto Thyroiditis at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.758339
PMID:34805166
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PTC的肿瘤微环境异质性及其与HT的免疫学联系 | 样本量较小，仅包括八名PTC患者，其中三名同时患有HT | 深入理解PTC的肿瘤微环境及其与HT的免疫学联系 | 甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的关系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八名PTC患者，其中三名同时患有HT |
| 1087 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Network of Peripartum Decidua that Orchestrates Delivery
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770621
PMID:34805176
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研究论文 | 本研究通过CellCall方法基于围产期蜕膜的scRNA-seq数据重建了蜕膜细胞间的通信网络，并分析了其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 首次系统地解码了围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其内部级联反应，并探讨了其在分娩中的作用 | NA | 旨在理解妊娠维持和分娩过渡中蜕膜细胞间通信的机制 | 围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq, 单细胞BCR/TCR测序 | CellCall方法 | 单细胞RNA测序数据 | 围产期蜕膜样本 |
| 1088 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Revealed a Critical Role of SPP1/CD44-Mediated Crosstalk Between Macrophages and Cancer Cells in Glioma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.779319
PMID:34805184
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了高级别胶质瘤中SPP1/CD44介导的巨噬细胞与癌细胞间的交叉对话在肿瘤进展中的关键作用 | 本研究首次揭示了SPP1/CD44信号轴在高级别胶质瘤进展中的重要作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | NA | 旨在识别驱动高级别胶质瘤肿瘤异质性的细胞和分子机制 | 高级别胶质瘤中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个高级别胶质瘤样本 |
| 1089 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity and tumorigenesis of BRCA1 deficient mammary tumors via single cell RNA sequencing
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63995
PMID:34815798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生机制 | 本研究首次将BRCA1缺陷型乳腺肿瘤分为四个亚型，并揭示了肿瘤内异质性的主要原因，包括细胞增殖、DNA损伤反应/修复和上皮-间质转化（EMT）的活性差异 | NA | 全面阐明BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生和进展的潜在机制 | BRCA1缺陷型乳腺肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自敲除小鼠的乳腺腺体细胞和乳腺肿瘤细胞 |
| 1090 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of cell composition and origin identified by single-cell transcriptomics in renal cysts of patients with autosomal dominant polycystic kidney disease
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.57220
PMID:34815804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿细胞组成和来源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了多囊肾囊肿可能来源于集合管或同时来源于近端小管和亨利环，并发现不同来源的囊肿上皮细胞具有不同的基因集激活 | 研究样本仅来自一名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索常染色体显性多囊肾病肾囊肿的细胞组成和来源 | 常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名患者的正常肾组织和七个囊肿 |
| 1091 | 2024-08-08 |
Characterization of Alzheimer's Disease-Associated Excitatory Neurons via Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2021.742176
PMID:34819847
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研究论文 | 本研究利用公开的单核RNA测序数据集，在5XFAD转基因模型和野生型小鼠中揭示了与阿尔茨海默病相关的兴奋性神经元群体（C3:Ex.Neuron）的特征 | 首次详细描述了阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征，并识别出一种先前未被发现的兴奋性神经元亚型（C3.1） | NA | 探索阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征 | 阿尔茨海默病中的兴奋性神经元群体 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 5XFAD转基因模型和野生型小鼠 |
| 1092 | 2024-08-08 |
Development of an Autophagy-Based and Stemness-Correlated Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Using Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743910
PMID:34820373
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研究论文 | 本研究开发了一种基于自噬和干细胞相关性的肝细胞癌预后模型，使用批量和单细胞RNA测序数据 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据，构建了基于自噬相关基因的肝细胞癌预后模型，并验证了其预测效能 | 研究仅在ICGC和TCGA数据库中验证了预后模型的效能，未来需在更多独立数据集中进行验证 | 开发和验证一种新的肝细胞癌预后模型，以提高患者生存预测的准确性 | 肝细胞癌（HCC）及其自噬相关基因和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 使用了ICGC和TCGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1093 | 2024-08-08 |
Prediction of Non-canonical Routes for SARS-CoV-2 Infection in Human Placenta Cells
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.614728
PMID:34820418
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2在人类胎盘细胞中的非经典感染途径 | 发现了胎盘细胞中可能作为SARS-CoV-2非经典感染途径的蛋白质 | NA | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制机制 | 人类胎盘细胞中的SARS-CoV-2感染途径 | NA | COVID-19 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1094 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies master regulators of neurodegeneration in SOD1 ALS iPSC-derived motor neurons
2021-12-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.10.010
PMID:34767750
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，分析了来自SOD1 E100G ALS患者诱导多能干细胞（iPSCs）分化出的运动神经元的功能障碍途径 | 本研究首次揭示了SMAD2作为TGF-β信号通路的下游介质，在SOD1 iPSC衍生运动神经元退化中的关键作用，并指出TGFβ信号激活可能是多种ALS亚型共有的机制 | NA | 揭示ALS中运动神经元退化的分子机制 | SOD1 E100G ALS患者的iPSC衍生运动神经元及其同源对照 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1095 | 2024-08-08 |
A non-classical monocyte-derived macrophage subset provides a splenic replication niche for intracellular Salmonella
2021-12-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.10.015
PMID:34788598
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研究论文 | 研究了单核吞噬细胞与胞内沙门氏菌在早期系统性感染中的相互作用，并描述了脾脏中细菌控制和复制的动态过程 | 首次描述了CD9阳性巨噬细胞在脾脏中为胞内沙门氏菌提供复制环境，并揭示了非经典单核细胞来源的巨噬细胞在感染中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨胞内沙门氏菌与单核吞噬细胞相互作用对感染结果的影响 | 胞内沙门氏菌、单核吞噬细胞、巨噬细胞亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1096 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of human non-small cell lung cancer lesions refines tumor classification and patient stratification
2021-12-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.10.009
PMID:34767762
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了35例早期非小细胞肺癌（NSCLC）病灶中的361,929个细胞，识别出一个由PDCD1CXCL13活化T细胞、IgG浆细胞和SPP1巨噬细胞组成的肺癌激活模块（LCAM），并探讨了其与肿瘤突变负荷（TMB）和免疫治疗反应的关系 | 首次识别并验证了肺癌激活模块（LCAM），并发现其与TMB、癌症睾丸抗原和TP53突变相关，可能作为免疫治疗反应的非冗余生物标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌中免疫细胞组成与肿瘤基因型之间的关系，以及其对免疫治疗反应的影响 | 早期非小细胞肺癌病灶中的免疫细胞和基因型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 35例早期非小细胞肺癌病灶中的361,929个细胞 |
| 1097 | 2024-08-08 |
Dynamic regulatory networks of T cell trajectory dissect transcriptional control of T cell state transition
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.10.011
PMID:34786214
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研究论文 | 本研究基于非小细胞肺癌中的T细胞单细胞转录组数据，提出了一种构建动态调控网络的方法，以解析T细胞状态转换的过程 | 本研究揭示了T细胞状态转换过程中频繁的调控交互重连，并进一步细化了介导每个状态转换的关键调控因子 | NA | 探究T细胞状态转换的分子调控机制 | T细胞在非小细胞肺癌中的功能状态转换 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组 | 动态调控网络 | 转录组数据 | NA |
| 1098 | 2024-08-08 |
Comprehensive analyses of bioinformatics applications in the fight against COVID-19 pandemic
2021-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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review | 本文全面总结了基于现有报告的生物信息学技术在COVID-19相关研究中的重要方法和应用 | 利用生物信息学方法，如下一代测序(NGS)和第三代测序(TGS)技术，分子动力学模拟，分子对接和人工智能(AI)技术，加速了病毒检测、药物开发和疫苗研究 | NA | 深入理解新冠病毒的基因组和蛋白质特征，临床诊断，致病机制，以及抗病毒药物和疫苗的开发 | 新冠病毒的基因组和蛋白质特征，临床诊断，致病机制，抗病毒药物和疫苗 | bioinformatics | COVID-19 | NGS, TGS, molecular dynamics simulation, molecular docking, AI | NA | genome sequence, protein structure | 超过228 million COVID-19感染病例 |
| 1099 | 2024-08-08 |
Desmosterol suppresses macrophage inflammasome activation and protects against vascular inflammation and atherosclerosis
2021-11-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2107682118
PMID:34782454
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研究论文 | 本文研究了胆固醇生物合成中间产物脱氢表雄酮在巨噬细胞中的作用，及其对血管炎症和动脉粥样硬化的保护作用 | 首次揭示了脱氢表雄酮在动脉粥样硬化病变中作为整合胆固醇稳态和免疫反应的关键分子，通过调节巨噬细胞功能来抑制炎症 | NA | 探讨脱氢表雄酮在动脉粥样硬化中的作用及其机制 | 巨噬细胞和动脉粥样硬化病变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 脂质组学和转录组学分析 | NA | 细胞 | 从动脉粥样硬化斑块中分离的CD45CD11b细胞 |
| 1100 | 2024-08-08 |
Characterization of normal and cancer stem-like cell populations in murine lingual epithelial organoids using single-cell RNA sequencing
2021-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01783-5
PMID:34785704
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠舌上皮类器官中正常和癌症干细胞样细胞群体的特征 | 揭示了舌癌中具有干细胞特性的异质细胞群体与正常干细胞群体的不同特征，为开发新型分子靶向治疗提供了依据 | NA | 开发基于特定基因表达谱的舌癌分子靶向治疗 | 小鼠舌上皮类器官中的正常和癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 舌癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |