单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-08 |
FEM: mining biological meaning from cell level in single-cell RNA sequencing data
2021, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.12570
PMID:34909283
|
研究论文 | 本文开发了功能表达矩阵（FEM）算法，用于从单细胞RNA测序数据中挖掘细胞层面的生物学意义 | FEM算法能够利用所有表达基因的信息，将基因表达矩阵（GEM）转换为FEM，从而提供单个细胞的生物学意义 | NA | 探索表达数据分析中基因的生物学意义或功能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-SEQ） | 功能表达矩阵（FEM）算法 | 基因表达数据 | 三个数据集（外周血单个核细胞、人肝脏和人胰腺） |
| 982 | 2024-08-08 |
Transcriptomic and Single-Cell Analysis Reveals Regulatory Networks and Cellular Heterogeneity in Mouse Primary Sjögren's Syndrome Salivary Glands
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.729040
PMID:34912329
|
研究论文 | 本文通过转录组和单细胞分析揭示了小鼠原发性Sjögren's综合征唾液腺中的调控网络和细胞异质性 | 本文通过RNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了与Sjögren's综合征病理生物学相关的重要通路和调控网络，以及疾病细胞群体的分子和细胞异质性 | NA | 阐明Sjögren's综合征的分子本质，为靶向治疗提供新见解 | 小鼠原发性Sjögren's综合征唾液腺 | 数字病理学 | 自身免疫病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了已建立的原发性Sjögren's综合征小鼠模型的下颌下腺 |
| 983 | 2024-08-08 |
Identification of the Nerve-Cancer Cross-Talk-Related Prognostic Gene Model in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.788671
PMID:34912722
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于神经-癌症交叉对话相关基因（NCCGs）的预后模型，用于预测头颈部鳞状细胞癌（HNSC）的生存率 | 首次构建了基于NCCGs的预后模型，并验证了其在HNSC中的有效性 | NA | 探索神经-癌症交叉对话相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的作用，并构建预后模型 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSC）及其相关基因 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA-HNSC队列中共有23个基因上调或下调 |
| 984 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Adipocytes: A Critical Player in the Bone Marrow Microenvironment
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770705
PMID:34912805
|
综述 | 本文综述了骨髓脂肪细胞（BMAs）的起源、分化及其在造血、成骨、破骨细胞生成和免疫调节中的作用 | BMAs被认为是骨髓相关疾病（如骨质疏松和白血病）的新治疗靶点 | NA | 探讨BMAs在骨髓微环境中的关键作用及其在疾病治疗中的潜在价值 | 骨髓脂肪细胞及其在骨髓微环境中的功能 | NA | 骨质疏松, 白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 985 | 2024-08-08 |
Molecular Characterization and Clinical Relevance of ANXA1 in Gliomas via 1,018 Chinese Cohort Patients
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777182
PMID:34912807
|
研究论文 | 本研究通过对中国1,018名胶质瘤患者的RNA测序和全外显子测序数据进行分析，探讨了ANXA1在胶质瘤中的分子特征及其临床相关性 | 首次揭示了ANXA1在胶质瘤中的表达与恶性进展、临床行为及患者生存结果的密切关系，并发现其在M2巨噬细胞和间质型肿瘤细胞中的高表达 | NA | 探讨ANXA1在胶质瘤中的生物学作用及其临床意义 | ANXA1在胶质瘤中的表达及其对患者生存结果的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序, 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,018名中国胶质瘤患者, 286例全外显子测序数据, 270例不同组织区域的胶质母细胞瘤样本, 7,630个单细胞 |
| 986 | 2024-08-08 |
Robotic high-throughput biomanufacturing and functional differentiation of human pluripotent stem cells
2021-12-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.11.004
PMID:34861164
|
研究论文 | 本文介绍了一种机器人平台，用于高效生产人类诱导多能干细胞（hiPSCs）并实现其功能性分化 | 开发了一种全自动的机器人平台，用于在化学定义条件下进行hiPSC的培养和分化，实现了高吞吐量和标准化生产 | NA | 建立一个集成平台，用于高效细胞制造，以支持疾病模型、药物筛选和细胞治疗 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）及其功能性分化 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、代谢分析、电生理学 | NA | 细胞 | 最多90种不同患者和疾病特异性细胞系 |
| 987 | 2024-08-08 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类胎儿脑中纹状体和皮质γ-氨基丁酸能神经元的起源结构——神经节隆起的细胞多样性 | 发现人类和啮齿类动物在中间神经元发育过程中共享保守的转录程序 | NA | 探究遗传变异如何通过影响特定细胞类型的发育而导致神经发育障碍 | 人类和啮齿类动物的中间神经元发育 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 988 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis identifies a key role for Hhip in murine coronal suture development
2021-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27402-5
PMID:34880220
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析胚胎期野生型小鼠冠状缝合线，定义其细胞群体结构，并探讨Hhip在冠状缝合线发育中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠冠状缝合线的细胞群体结构，并揭示了Hhip在调控缝合线发育中的重要作用 | NA | 研究Hhip在小鼠冠状缝合线发育中的作用 | 小鼠冠状缝合线的细胞群体结构及Hhip的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 胚胎期E16.5和E18.5的野生型小鼠冠状缝合线样本 |
| 989 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the dynamic process and novel markers in porcine spermatogenesis
2021-Dec-07, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-021-00638-3
PMID:34872612
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了150天龄猪睾丸中约16,966个细胞的转录组，揭示了猪精子发生过程中的动态变化和新标记物。 | 首次通过单细胞RNA测序分析了猪睾丸中雄性生殖细胞和体细胞的转录组，并发现了四个精子细胞亚群及两个新的细胞表面标记物。 | NA | 研究猪精子发生过程中的转录组动态变化和新标记物。 | 猪睾丸中的生殖细胞和体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约16,966个睾丸细胞 |
| 990 | 2024-08-08 |
Representation learning of RNA velocity reveals robust cell transitions
2021-12-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2105859118
PMID:34873054
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Velocity Autoencoder（VeloAE）的表示学习方法，用于学习RNA速度的低维表示，从而稳健地估计细胞过渡 | 提出了一种新的表示学习方法VeloAE，用于处理高维RNA速度数据中的不稳定和不准确问题 | NA | 旨在提高RNA速度技术在量化细胞过渡和揭示异质细胞群中瞬态细胞动力学的准确性和稳定性 | RNA速度数据和细胞过渡 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | Autoencoder | 转录组数据 | 多个实验数据集 |
| 991 | 2024-08-08 |
An efficient scRNA-seq dropout imputation method using graph attention network
2021-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04493-x
PMID:34876032
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的自动编码器结构网络GNNImpute，用于单细胞RNA测序数据中的dropout事件插补 | GNNImpute利用图注意力卷积聚合多层次相似细胞信息，并在非欧几里得空间的scRNA-seq数据上进行卷积操作，能准确有效地插补dropout并减少dropout噪声 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据dropout插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 图注意力网络 | 基因表达数据 | 分析了四个真实数据集 |
| 992 | 2024-08-08 |
Delineation of colorectal cancer ligand-receptor interactions and their roles in the tumor microenvironment and prognosis
2021-12-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03162-0
PMID:34876143
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌中单细胞RNA测序数据，揭示了配体-受体相互作用的模式及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 本研究通过深入分析现有的配体-受体对，为结直肠癌亚型分类提供了新思路，为结直肠癌患者提供了一种新的风险筛查工具，并发现了潜在的配体-受体对目标和治疗途径 | NA | 研究配体-受体相互作用在结直肠癌中的模式及其对肿瘤微环境和临床价值的影响 | 结直肠癌中的配体-受体相互作用及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 55,539个单细胞RNA测序样本来自29名结直肠癌患者和1411名结直肠癌患者的三个批量RNA-seq数据集 |
| 993 | 2024-08-08 |
Traditional chinese medicine syndromes classification associates with tumor cell and microenvironment heterogeneity in colorectal cancer: a single cell RNA sequencing analysis
2021-Dec-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-021-00547-7
PMID:34876190
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌中肿瘤细胞和微环境的异质性与中医证候分类的相关性 | 首次探讨了结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的关系，并揭示了不同证候分类下的肿瘤细胞特征基因和基因共表达网络 | 研究样本量较小，仅涉及11个原发性结直肠癌肿瘤，可能影响结果的普遍性 | 探讨结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的相关性和意义 | 结直肠癌中的肿瘤细胞和微环境异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11个原发性结直肠癌肿瘤，共662个细胞 |
| 994 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic identified HIF1A as a target for attenuating acute rejection after heart transplantation
2021-12-06, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-021-00904-5
PMID:34870762
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探索了心脏移植后急性排斥反应中免疫细胞的代谢变化，并发现HIF1A作为潜在的治疗靶点 | 首次揭示了心脏移植后急性排斥反应中免疫细胞代谢的变化，并确定了HIF1A作为调节免疫代谢的新治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证HIF1A抑制剂的效果 | 探索心脏移植后急性排斥反应的新治疗靶点 | 心脏移植后的急性排斥反应及免疫细胞代谢 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了46,040个细胞，包括20种免疫细胞亚型 |
| 995 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing analysis identifies genetics-modulated ORMDL3+ cholangiocytes having higher metabolic effects on primary biliary cholangitis
2021-Dec-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01154-2
PMID:34872583
|
研究论文 | 本研究通过构建计算框架整合GWAS和scRNA-seq数据，揭示了遗传因素调控的胆管细胞亚群在原发性胆管炎中的作用 | 首次将遗传信息与单细胞测序数据整合，解析遗传因素对原发性胆管炎风险的影响 | NA | 研究遗传因素对原发性胆管炎中肝脏细胞及其免疫微环境的影响 | 原发性胆管炎中的胆管细胞 | 数字病理学 | 原发性胆管炎 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 996 | 2024-08-08 |
Azvudine is a thymus-homing anti-SARS-CoV-2 drug effective in treating COVID-19 patients
2021-12-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00835-6
PMID:34873151
|
研究论文 | 本文研究了阿兹夫定（FNC）作为一种胸腺归巢抗SARS-CoV-2药物，对COVID-19患者的治疗效果 | 发现FNC不仅抑制HIV-1 RNA依赖的RNA聚合酶，还能有效抑制SARS-CoV-2和HCoV-OC43冠状病毒，并具有胸腺归巢特性 | 临床试验样本量较小，且为单臂试验，需要进一步的大规模双盲随机对照试验来验证其疗效和安全性 | 评估阿兹夫定作为COVID-19治疗药物的有效性和安全性 | COVID-19患者和SARS-CoV-2感染的猕猴 | NA | COVID-19 | NA | NA | NA | 临床试验涉及31名COVID-19患者 |
| 997 | 2024-08-08 |
Gene biomarker prediction in glioma by integrating scRNA-seq data and gene regulatory network
2021-12-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01115-6
PMID:34863158
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和基因调控网络，探索胶质瘤的分子机制并预测基因生物标志物 | 提出了一种算法框架，通过整合单细胞基因表达谱和基因调控关系来探索胶质瘤的分子机制 | NA | 探索胶质瘤的分子机制并预测基因生物标志物 | 胶质瘤的分子机制和基因生物标志物 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个胶质瘤样本中的恶性细胞 |
| 998 | 2024-08-08 |
Ground tissue circuitry regulates organ complexity in maize and Setaria
2021-Dec-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj2327
PMID:34855479
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了玉米根部的细胞分辨率图谱，揭示了组织形成转录因子SHORT-ROOT (SHR)的替代配置及其在皮质层扩展中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细解析了玉米根部皮质层的形成机制 | 研究主要集中在玉米和Setaria两种植物上，可能不适用于其他植物种类 | 探讨植物根部皮质层的形成及其在生理功能中的作用 | 玉米和Setaria植物的根部皮质层 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及玉米和Setaria植物的多个皮质层细胞 |
| 999 | 2024-08-08 |
An adaptive method of defining negative mutation status for multi-sample comparison using next-generation sequencing
2021-12-02, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00880-8
PMID:34856988
|
研究论文 | 本文提出了一种自适应方法，用于在多样本比较中通过下一代测序（NGS）定义负突变状态 | 本文提出的自适应突变特异性负（MSN）方法，能够更准确地区分负突变状态和未知状态，相较于传统的通用最小覆盖（UMC）方法，能产生更多的可用数据 | NA | 开发一种新的方法，用于在多样本比较的下一代测序数据中区分未知和负突变状态 | 癌症基因组学研究中的多样本比较 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | 测序数据 | 模拟数据集包含不同肿瘤细胞分数的样本，以及一个真实的双平台单细胞测序数据集 |
| 1000 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of salt-induced hypertensive mouse aortae reveals cellular heterogeneity and state changes
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00704-w
PMID:34862465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了高盐饮食诱导的高血压小鼠主动脉中的细胞异质性和状态变化 | 首次系统描述了高血压进展中血管细胞的组成和反应，并揭示了细胞组成和细胞间通讯在高血压进展中的显著变化 | NA | 研究高血压进展中血管细胞的组成和反应 | 高盐饮食诱导的高血压小鼠主动脉中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠的主动脉弓样本 |