单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2024-08-08 |
Imaging of Glioblastoma Tumor-Associated Myeloid Cells Using Nanobodies Targeting Signal Regulatory Protein Alpha
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.777524
PMID:34917090
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研究论文 | 本研究使用针对信号调节蛋白α（SIRPα）的纳米抗体来成像胶质母细胞瘤（GBM）中的肿瘤相关髓系细胞 | 首次使用针对SIRPα的纳米抗体在无血脑屏障渗透的情况下，非侵入性地成像GBM肿瘤中的髓系细胞 | 纳米抗体在GL261脑肿瘤中的渗透性较低 | 探索使用SIRPα靶向纳米抗体非侵入性地成像GBM肿瘤中髓系细胞的可行性 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq | NA | 图像 | 包括人GBM样本和GL261肿瘤小鼠模型 |
| 962 | 2024-08-08 |
A Novel Single-Cell RNA Sequencing Data Feature Extraction Method Based on Gene Function Analysis and Its Applications in Glioma Study
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.797057
PMID:34917514
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因功能分析的单细胞RNA测序数据特征提取方法FEGFS，并应用于胶质瘤研究 | FEGFS方法利用已知的基因功能，通过基因本体论（GO）术语推导功能基因集，并通过语义相似性分析和基因重复率降低来减少冗余，然后应用核主成分分析在每个非冗余功能基因集上选择特征，并将这些特征组合用于后续的聚类分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据特征提取方法，并评估其在胶质瘤研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据和胶质瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 核主成分分析 | 基因数据 | 六个真实的单细胞RNA测序数据集，包括Pollen、Goolam、Klein和Zeisel等 |
| 963 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Heterogeneity in Gene Regulatory Networks in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.765578
PMID:34917613
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据全面分析了结直肠癌患者的共识分子亚型（CMS），并探讨了基因调控网络的异质性及其关键调控因子 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌中不同CMS的基因调控网络异质性，并识别了关键的转录因子 | NA | 阐明结直肠癌中基因调控网络的异质性并识别关键调控因子 | 结直肠癌患者的共识分子亚型（CMS）及其基因调控网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 964 | 2024-08-08 |
Microglia Impede Oligodendrocyte Generation in Aged Brain
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S338242
PMID:34924766
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研究论文 | 本文研究了衰老大脑中少突胶质细胞的异质性及其在髓鞘丢失中的作用机制 | 首次揭示了衰老大脑中活化的微胶质细胞通过释放炎症因子抑制少突胶质前体细胞分化的机制，并提出了Stat1作为潜在的治疗靶点 | NA | 全面描绘年轻和老年小鼠中少突胶质细胞的异质性，并揭示衰老过程中髓鞘丢失的潜在机制 | 年轻和老年小鼠及人类的少突胶质细胞及其前体细胞 | 神经科学 | NA | 扩散张量成像、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 年轻和老年小鼠及人类样本 |
| 965 | 2024-08-08 |
The Clinical Significance and Potential Molecular Mechanism of Upregulated CDC28 Protein Kinase Regulatory Subunit 1B in Osteosarcoma
2021, Journal of oncology
DOI:10.1155/2021/7228584
PMID:34925510
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研究论文 | 本研究探讨了CDC28蛋白激酶调节亚基1B（CKS1B）在骨肉瘤（OS）中的临床意义和潜在分子机制 | 首次提供了CKS1B在骨肉瘤中上调的充分证据，并探讨了其在骨肉瘤进展中的作用 | 临床病理和预后分析未显示出显著意义 | 探讨CKS1B在骨肉瘤中的表达及其对患者临床病理特征和生存率的影响 | 骨肉瘤（OS）和非肿瘤组织样本 | NA | 骨肉瘤 | 免疫组织化学（IHC），组织微阵列，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本，细胞系 | 197个骨肉瘤样本和83个非肿瘤样本 |
| 966 | 2024-08-08 |
A Deep-Learning Pipeline for TSS Coverage Imputation From Shallow Cell-Free DNA Sequencing
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.684238
PMID:34926480
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research paper | 本文介绍了一种用于从浅层游离DNA测序中进行转录起始位点（TSS）覆盖率推算的深度学习流程 | 提出的Autoencoder of cfDNA TSS（AECT）覆盖率推算方法在TSS覆盖率准确性和捕捉潜在生物特征方面优于现有的单细胞测序推算算法 | NA | 开发一种高准确性且成本适中的非侵入性筛查方法 | 游离DNA（cfDNA）的转录起始位点（TSS）覆盖率 | machine learning | breast cancer, rectal cancer | NA | Autoencoder | DNA sequencing data | NA |
| 967 | 2024-08-08 |
MCC Regulator of WNT Signaling Pathway (MCC) Is a Podocyte Essential Gene
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.777563
PMID:34926519
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术检测了小鼠足细胞中WNT信号通路调节因子MCC的表达，并证实了MCC对足细胞的重要性 | 首次证实MCC是足细胞的关键基因，并通过RNA测序和生物信息学分析揭示了MCC在足细胞中的作用机制 | 未发现MCC下调对细胞周期和β-catenin信号活性的显著影响，可能存在其他未检测到的机制 | 探讨MCC在足细胞中的作用及其对足细胞疾病的影响 | 小鼠和人类足细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类足细胞样本 |
| 968 | 2024-08-08 |
FaDA: A web application for regular laboratory data analyses
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0261083
PMID:34928943
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研究论文 | 本文介绍了一个名为FaDA的基于网络的应用程序，用于非计算科学家进行常规实验室数据分析 | FaDA提供了一个免费的、直观的界面，使没有生物信息学技能的生物学家能够轻松快速地进行常见的实验室数据分析 | NA | 开发一个通用的网络工具，用于非计算科学家进行常规实验室数据分析 | 常规实验室数据分析工具 | 生物信息学 | NA | R Shiny包 | NA | 实验室数据 | NA |
| 969 | 2024-08-08 |
Intra-Tumoral Expression of SLC7A11 Is Associated with Immune Microenvironment, Drug Resistance, and Prognosis in Cancers: A Pan-Cancer Analysis
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.770857
PMID:34938318
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研究论文 | 本文通过泛癌分析研究了肿瘤内SLC7A11表达与免疫微环境、药物抗性和癌症预后的关系。 | 首次系统阐述了SLC7A11在多种癌症中的表达及其对患者生存和免疫治疗反应的影响。 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证。 | 探讨SLC7A11在癌症中的表达与患者生存和免疫治疗反应的关系。 | SLC7A11在多种癌症中的表达及其生物学功能。 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序, CRISPR, RNAi | NA | 基因表达数据 | 25/27种癌症类型，多种胰腺癌细胞系 |
| 970 | 2024-08-08 |
CREM Is Correlated With Immune-Suppressive Microenvironment and Predicts Poor Prognosis in Gastric Adenocarcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.697748
PMID:34938728
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研究论文 | 本研究利用生物信息学方法探讨了转录抑制因子cAMP反应元件调节因子（CREM）在胃腺癌（GAC）中的作用 | 发现CREM的高表达与GAC中的T细胞耗竭和M2极化相关，表明CREM可能作为GAC的预后生物标志物 | NA | 探索CREM在胃腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胃腺癌（GAC）中的CREM表达及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 971 | 2024-08-08 |
Inflammatory Cells Accelerated Carotid Artery Calcification via MMP9: Evidences From Single-Cell Analysis
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.766613
PMID:34938784
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了炎症细胞通过MMP9加速颈动脉钙化的机制 | 首次揭示了炎症巨噬细胞样VSMCs亚群的存在，并确定了MMP9在VSMCs表型转化中的重要作用 | NA | 研究血管平滑肌细胞在钙化早期的转化过程及其机制 | 颈动脉钙化核心及间质组织的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 972 | 2024-08-08 |
Constructing local cell-specific networks from single-cell data
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2113178118
PMID:34903665
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研究论文 | 本文开发了一种名为locCSN的方法，用于从单细胞RNA测序数据中构建细胞特异性基因共表达网络，该方法能够保留细胞异质性信息并检测非线性相关性 | locCSN方法能够检测非线性相关性，并且在处理分布挑战时更为稳健，此外，该方法还能识别在基因表达上无差异但在共表达网络上存在差异的基因 | 单个细胞特异性网络的估计存在较大噪声，尽管平均网络提供了稳定的估计 | 开发一种新的方法来构建准确的细胞特异性基因共表达网络，并利用这些网络进行下游分析以深入理解疾病 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达网络 | 生物信息学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 973 | 2024-08-08 |
splatPop: simulating population scale single-cell RNA sequencing data
2021-12-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02546-1
PMID:34911537
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研究论文 | 本文介绍了splatPop模型，用于模拟具有已知表达数量性状位点的群体规模单细胞RNA测序数据 | splatPop模型能够灵活、可重复且有文档记录地模拟群体规模的scRNA-seq数据，并考虑了遗传效应 | NA | 开发和测试适用于群体规模单细胞RNA测序数据的方法 | 群体规模单细胞RNA测序数据的模拟 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 974 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics captures features of human midbrain development and dopamine neuron diversity in brain organoids
2021-12-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27464-5
PMID:34911939
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研究论文 | 本研究建立了一种中脑类器官培养系统，通过单细胞RNA测序技术，研究了从多能干细胞到成熟多巴胺神经元的发育轨迹，并识别出三种分子特征不同的多巴胺神经元亚型。 | 设计了由重组蜘蛛丝微纤维支持的生物工程化腹侧中脑类器官，这些类器官在多巴胺神经发生的关键分子方面具有高相似性，并减少了类器官间的细胞类型组成和多巴胺神经元形成的变化。 | 尽管取得了显著进展，但脑类器官的使用仍受限于重复性和不完全成熟的问题。 | 研究人类中脑发育和多巴胺神经元多样性。 | 人类中脑发育和多巴胺神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及多种细胞类型和多巴胺神经元亚型 |
| 975 | 2024-08-08 |
The hidden genomic diversity of ciliated protists revealed by single-cell genome sequencing
2021-12-14, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01202-1
PMID:34903227
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组测序技术揭示了纤毛原生生物的隐藏基因组多样性 | 优化了单细胞测序方法和数据分析，有效去除了共生细菌的污染，生成了多个Euplotia物种的高质量基因组 | NA | 揭示纤毛原生生物的基因组多样性及其系统发育关系和代谢潜力 | 纤毛原生生物的基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 八个高质量的Euplotia基因组 |
| 976 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis identifies a unique tumor cell type producing multiple hormones in ectopic ACTH and CRH secreting pheochromocytoma
2021-12-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68436
PMID:34905486
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别出一种独特的肿瘤细胞类型，该细胞类型在异位ACTH和CRH分泌的嗜铬细胞瘤中产生多种激素 | 发现了新的多功能嗜铬样细胞类型，该细胞高表达POMC和CRH，并提出了这种细胞类型导致库欣综合征的分子机制 | 研究基于一个罕见病例，可能需要更多样本验证结果的普遍性 | 探究异位ACTH和CRH分泌的嗜铬细胞瘤中是否存在独特的细胞类型负责多种激素分泌 | 异位ACTH和CRH分泌的嗜铬细胞瘤及其周边组织 | 数字病理学 | 嗜铬细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 三个不同解剖位置的肿瘤组织和一个肿瘤周边组织，以及三个常见的嗜铬细胞瘤和肾上腺皮质腺瘤样本 |
| 977 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals distinct immune cell subsets and signaling pathways in IgA nephropathy
2021-Dec-11, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00706-1
PMID:34895340
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了IgA肾病中免疫细胞亚群及其信号通路的早期转录变化 | 首次在单细胞水平上解析了IgA肾病中免疫细胞的动态变化，并发现了与疾病进展相关的特定细胞亚群和信号通路 | NA | 揭示IgA肾病中免疫细胞的早期转录变化及其与疾病进展的关系 | IgA肾病患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 978 | 2024-08-08 |
Dissecting the single-cell transcriptomeunderlying chronic liver injury
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.11.008
PMID:34900395
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研究论文 | 本研究通过建立慢性肝损伤小鼠模型并进行单细胞RNA测序，揭示了慢性肝损伤过程中的单细胞转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下系统地描述了慢性肝损伤过程，并识别了潜在的肝损伤标志物和细胞间通信变化 | NA | 探究慢性肝损伤过程中的分子机制，并为有效干预慢性肝病提供临床策略 | 慢性肝损伤小鼠模型中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 总共捕获了16,389个高质量细胞 |
| 979 | 2024-08-08 |
Can single cell RNA sequencing reshape the clinical biochemistry of hematology: New clusters of circulating blood cells
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.671
PMID:34898038
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在血液学临床生物化学中的应用及其对循环血细胞分类的影响 | scRNA-seq有助于深入理解疾病，识别疾病特异性目标组，并提出新的治疗策略 | scRNA-seq的应用需要标准化和规范化，并在大量健康和疾病患者中进行验证 | 研究scRNA-seq在临床决策和分子医学指导中的作用 | 循环血细胞的分类和分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 大量健康和疾病患者 |
| 980 | 2024-08-08 |
Combinatorial immunotherapy induces tumor-infiltrating CD8+ T cells with distinct functional, migratory, and stem-like properties
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003614
PMID:34903555
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研究论文 | 研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序分析了组合免疫疗法对肿瘤浸润性CD8+ T细胞功能和迁移特性的影响 | 发现OX40/4-1BB激动剂扩展了一种干细胞样PD-1loKLRG-1+Ki-67+CD8+ T细胞亚群，与PD-(L)1阻断协同作用，显著增强了干细胞样TIL的存在 | 对单一疗法作用机制的理解尚不完全，且不清楚组合疗法是否会导致协同作用、引发新的免疫机制或产生叠加效应 | 探讨组合免疫疗法中各成分之间的相互作用机制 | 肿瘤浸润性淋巴细胞（TILs）及其在不同治疗方案下的功能和迁移特性 | 免疫学 | NA | 高维流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自携带B16或MC38同基因肿瘤宿主的肿瘤浸润性淋巴细胞 |