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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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921 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27599-5
PMID:34921160
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了食管鳞状细胞癌(ESCC)微环境的异质性 | 揭示了ESCC微环境中大多数细胞类型的异质性,特别是成纤维细胞和免疫细胞亚群,并发现了具有预后价值和生物学意义的肿瘤特异性CST1肌成纤维细胞亚群 | NA | 研究食管鳞状细胞癌微环境的异质性及其对癌症生物学和治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 62,161个细胞来自11名ESCC患者的血液、邻近非恶性组织和匹配的肿瘤样本 |
922 | 2024-08-08 |
Preparation of mouse pancreatic tumor for single-cell RNA sequencing and analysis of the data
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100989
PMID:34927097
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研究论文 | 本文描述了一种有效的鼠胰腺肿瘤分离协议,用于单细胞RNA测序分析细胞群体 | 提供了使用Common Workflow Language (CWL)管道在用户友好的科学数据分析平台中处理数据和聚类异质细胞群体的方法 | NA | 研究鼠胰腺肿瘤的细胞群体 | 鼠胰腺肿瘤的单细胞悬液 | 数字病理学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
923 | 2024-08-08 |
From nasal to basal: single-cell sequencing of the bursa of Fabricius highlights the IBDV infection mechanism in chickens
2021-Dec-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00728-9
PMID:34915931
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,详细阐述了传染性法氏囊病病毒(IBDV)在鸡体内的感染机制,特别是通过鼻腔进入并影响法氏囊细胞的过程 | 研究首次揭示了IBDV通过鼻腔后部感染鸡,并通过血液循环到达法氏囊,对不同类型的法氏囊细胞(如B细胞、上皮细胞、树突状细胞和成纤维细胞)的感染反应进行了详细分析 | NA | 旨在确定病毒通过鼻腔的入口点,并阐明为什么鸟类容易受到RNA病毒的感染 | 传染性法氏囊病病毒(IBDV)在鸡体内的感染机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
924 | 2024-08-08 |
Diet and Gut Microbiota Interaction-Derived Metabolites and Intrahepatic Immune Response in NAFLD Development and Treatment
2021-Dec-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9121893
PMID:34944709
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研究论文 | 本文综述了饮食与肠道微生物代谢物在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)发展及治疗中对肝内免疫反应的影响 | 首次总结了饮食-肠道微生物代谢物与肝内免疫激活在NAFLD发展和进展中的相互作用,并讨论了通过靶向肠道微生物和重要分子信号通路的潜在治疗选项 | NA | 探讨NAFLD的病理机制及潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)及其发展过程中的肠道微生物代谢物和肝内免疫反应 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | 全球约25%的人口受影响 |
925 | 2024-08-08 |
YAP1 Is a Potential Predictive Molecular Biomarker for Response to SMO Inhibitor in Medulloblastoma Cells
2021-Dec-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13246249
PMID:34944872
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1作为预测髓母细胞瘤对SMO抑制剂反应的分子生物标志物的潜力 | 发现YAP1在SHH alpha髓母细胞瘤中过度表达,并与SMO抑制剂的耐药性相关 | 研究基于回顾性队列微阵列数据和体外模型,需要进一步的临床前模型验证 | 评估YAP1作为髓母细胞瘤对SMO抑制剂反应的预测生物标志物的有效性 | 髓母细胞瘤细胞和患者样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 微阵列数据, 单细胞RNA测序数据 | 两个体外模型,五个患者样本 |
926 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing infers the role of malignant cells in drug-resistant multiple myeloma
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.653
PMID:34918874
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
927 | 2024-08-08 |
Neoadjuvant chemotherapy alters peripheral and tumour-infiltrating immune cells in breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.621
PMID:34919339
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
928 | 2024-08-08 |
Spatial discordances between mRNAs and proteins in the intestinal epithelium
2021-12, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-021-00504-6
PMID:34931081
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研究论文 | 本文研究了小肠上皮细胞中mRNA与蛋白质的空间不一致性 | 首次展示了小肠上皮细胞中mRNA与蛋白质在绒毛轴上的空间分布不一致性,并提出了空间无关的蛋白质合成延迟可以解释许多mRNA-蛋白质不一致现象 | 未提及 | 探讨小肠上皮细胞中mRNA与蛋白质的空间分布关系 | 小肠上皮细胞中的mRNA与蛋白质 | NA | NA | 空间排序与贝叶斯方法 | NA | 空间基因表达与蛋白质数据 | 未提及具体数量 |
929 | 2024-08-08 |
Construction and Validation of Prognostic Regulation Network Based on RNA-Binding Protein Genes in Lung Squamous Cell Carcinoma
2021-Dec, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2021.0145
PMID:34931870
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研究论文 | 本研究基于RNA结合蛋白基因构建并验证了肺鳞状细胞癌的预后调控网络 | 首次在肺鳞状细胞癌中识别出具有预测肿瘤发生和预后价值的RNA结合蛋白基因,并构建了预测模型 | NA | 探讨RNA结合蛋白在肺鳞状细胞癌肿瘤发生和预后中的作用 | 肺鳞状细胞癌患者的RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 从TCGA数据库中获取的肺鳞状细胞癌患者数据 |
930 | 2024-08-08 |
Costimulation of γδTCR and TLR7/8 promotes Vδ2 T-cell antitumor activity by modulating mTOR pathway and APC function
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003339
PMID:34937742
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研究论文 | 本文研究了通过共刺激γδTCR和TLR7/8来增强Vδ2 T细胞的抗肿瘤活性,并探讨了其机制。 | 开发了一种新的共刺激方法,通过激活γδTCR和TLR7/8来扩增Vδ2 T细胞,显著提高了其对肿瘤细胞的细胞毒性。 | 目前仅在体外和体内模型中进行了测试,临床应用效果有待进一步验证。 | 探索提高Vδ2 T细胞抗肿瘤活性的新方法,以增强基于γδ T细胞的癌症免疫疗法的疗效。 | Vδ2 T细胞及其在癌症免疫疗法中的应用。 | 癌症免疫疗法 | NA | 单细胞测序,反相蛋白阵列 | NA | 蛋白表达数据 | 涉及人源化NSG小鼠的PBMCs和脾细胞 |
931 | 2024-08-08 |
COVID-19 Specific Immune Markers Revealed by Single Cell Phenotypic Profiling
2021-Nov-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9121794
PMID:34944610
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者外周血单核细胞中的免疫细胞功能相关表面标记物,揭示了COVID-19特异性免疫标记物的变化 | 发现了COVID-19患者中特异性表达的新型免疫受体,这些受体影响免疫功能并与临床结果相关 | NA | 揭示COVID-19特异性免疫标记物及其对疾病进展的影响 | COVID-19患者的外周血单核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 50名COVID-19患者和27名健康供体 |
932 | 2024-08-08 |
Landscape of Cell Communication in Human Dental Pulp
2021-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100747
PMID:34928049
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙髓中的细胞群体及其相互通信情况 | 首次详细描绘了人类牙髓中细胞间的通信网络 | NA | 揭示人类牙髓中细胞群体的相互作用及其通信机制 | 人类牙髓中的干细胞、牙髓细胞、T细胞、巨噬细胞、内皮细胞和胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
933 | 2024-08-08 |
Mechanisms of Progression and Heterogeneity in Multiple Nodules of Lung Adenocarcinoma
2021-06, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100082
PMID:34927899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了五名多结节型肺腺癌患者的肿瘤和正常组织,深入探讨了肺腺癌亚型的异质性和演化机制 | 本研究首次在单细胞水平上对肺腺癌的异质性和演化进行了全面的基因表达分析,揭示了免疫微环境在肺腺癌发展过程中的变化 | NA | 探索肺腺癌亚型异质性和演化的相关因素 | 多结节型肺腺癌患者的肿瘤和正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名多结节型肺腺癌患者 |
934 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Methodologies: From Transcriptome to Multi-Dimensional Measurement
2021-06, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202100111
PMID:34927917
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术及其在多维度测量中的应用 | 介绍了单细胞转录组测序技术在多维度(基因组、表观基因组、转录组、空间和时间维度)的综合分析方法 | 目前仅在转录组水平或一维测量上存在局限性 | 深入理解细胞多样性、疾病过程和多细胞生物的组织结构 | 单细胞及其在生物系统中的分子特征和发展轨迹 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
935 | 2024-08-08 |
The Immune Barrier of Porcine Uterine Mucosa Differs Dramatically at Proliferative and Secretory Phases and Could Be Positively Modulated by Colonizing Microbiota
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.750808
PMID:34917075
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了猪子宫内膜在增殖期和分泌期的黏膜免疫差异,并探讨了定植微生物对其的正向调节作用 | 首次揭示了猪子宫内膜在不同生理阶段黏膜免疫的显著变化及其与定植微生物的相互作用 | NA | 探究猪子宫内膜在不同生理阶段的黏膜免疫变化及其分子调控机制 | 猪子宫内膜在增殖期和分泌期的黏膜免疫 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
936 | 2024-08-08 |
Imaging of Glioblastoma Tumor-Associated Myeloid Cells Using Nanobodies Targeting Signal Regulatory Protein Alpha
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.777524
PMID:34917090
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研究论文 | 本研究使用针对信号调节蛋白α(SIRPα)的纳米抗体来成像胶质母细胞瘤(GBM)中的肿瘤相关髓系细胞 | 首次使用针对SIRPα的纳米抗体在无血脑屏障渗透的情况下,非侵入性地成像GBM肿瘤中的髓系细胞 | 纳米抗体在GL261脑肿瘤中的渗透性较低 | 探索使用SIRPα靶向纳米抗体非侵入性地成像GBM肿瘤中髓系细胞的可行性 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq | NA | 图像 | 包括人GBM样本和GL261肿瘤小鼠模型 |
937 | 2024-08-08 |
A Novel Single-Cell RNA Sequencing Data Feature Extraction Method Based on Gene Function Analysis and Its Applications in Glioma Study
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.797057
PMID:34917514
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因功能分析的单细胞RNA测序数据特征提取方法FEGFS,并应用于胶质瘤研究 | FEGFS方法利用已知的基因功能,通过基因本体论(GO)术语推导功能基因集,并通过语义相似性分析和基因重复率降低来减少冗余,然后应用核主成分分析在每个非冗余功能基因集上选择特征,并将这些特征组合用于后续的聚类分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据特征提取方法,并评估其在胶质瘤研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据和胶质瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 核主成分分析 | 基因数据 | 六个真实的单细胞RNA测序数据集,包括Pollen、Goolam、Klein和Zeisel等 |
938 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Heterogeneity in Gene Regulatory Networks in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.765578
PMID:34917613
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据全面分析了结直肠癌患者的共识分子亚型(CMS),并探讨了基因调控网络的异质性及其关键调控因子 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了结直肠癌中不同CMS的基因调控网络异质性,并识别了关键的转录因子 | NA | 阐明结直肠癌中基因调控网络的异质性并识别关键调控因子 | 结直肠癌患者的共识分子亚型(CMS)及其基因调控网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
939 | 2024-08-08 |
Microglia Impede Oligodendrocyte Generation in Aged Brain
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S338242
PMID:34924766
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研究论文 | 本文研究了衰老大脑中少突胶质细胞的异质性及其在髓鞘丢失中的作用机制 | 首次揭示了衰老大脑中活化的微胶质细胞通过释放炎症因子抑制少突胶质前体细胞分化的机制,并提出了Stat1作为潜在的治疗靶点 | NA | 全面描绘年轻和老年小鼠中少突胶质细胞的异质性,并揭示衰老过程中髓鞘丢失的潜在机制 | 年轻和老年小鼠及人类的少突胶质细胞及其前体细胞 | 神经科学 | NA | 扩散张量成像、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 年轻和老年小鼠及人类样本 |
940 | 2024-08-08 |
The Clinical Significance and Potential Molecular Mechanism of Upregulated CDC28 Protein Kinase Regulatory Subunit 1B in Osteosarcoma
2021, Journal of oncology
DOI:10.1155/2021/7228584
PMID:34925510
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研究论文 | 本研究探讨了CDC28蛋白激酶调节亚基1B(CKS1B)在骨肉瘤(OS)中的临床意义和潜在分子机制 | 首次提供了CKS1B在骨肉瘤中上调的充分证据,并探讨了其在骨肉瘤进展中的作用 | 临床病理和预后分析未显示出显著意义 | 探讨CKS1B在骨肉瘤中的表达及其对患者临床病理特征和生存率的影响 | 骨肉瘤(OS)和非肿瘤组织样本 | NA | 骨肉瘤 | 免疫组织化学(IHC),组织微阵列,单细胞RNA测序 | NA | 组织样本,细胞系 | 197个骨肉瘤样本和83个非肿瘤样本 |