单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-08 |
Different Glucose Metabolic Features According to Cancer and Immune Cells in the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.769393
PMID:34966676
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研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞之间的葡萄糖代谢特征，并探讨了这些特征对肿瘤免疫状态的影响。 | 首次在单细胞水平上全面研究了肿瘤微环境中葡萄糖代谢特征，并发现GLUT可能是肿瘤免疫代谢状态的替代指标和免疫治疗辅助治疗的潜在靶点。 | NA | 探索肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞的葡萄糖代谢特征，以发现可行的代谢靶点。 | 肿瘤微环境中的癌细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括黑色素瘤、头颈癌和乳腺癌等多种人类癌症组织样本。 |
| 922 | 2024-08-08 |
Identification of Subtypes and a Prognostic Gene Signature in Colon Cancer Using Cell Differentiation Trajectories
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.705537
PMID:34966734
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研究论文 | 本研究通过细胞分化轨迹分析，探索结直肠癌（CC）细胞的异质性，并构建基于CC分化相关基因（CDRG）的预后风险评分（RS）特征 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出两个具有不同分化状态的子集，并基于CDRG构建分子亚型和预后RS特征，能有效预测患者的临床结局和治疗反应 | NA | 探索结直肠癌细胞的分化轨迹及其临床意义，并构建基于CDRG的预后风险评分特征 | 结直肠癌细胞的分化轨迹和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练集使用The Cancer Genome Atlas数据，验证集使用GSE39582数据，涉及40个由YY1和EGR2调控的枢纽CDRG |
| 923 | 2024-08-08 |
Identification of ZEB2 as an Immune-Associated Gene in Endometrial Carcinoma and Associated with Macrophage Infiltration by Bioinformatic Analysis
2021, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2021/4372373
PMID:34970423
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了子宫内膜癌中的免疫细胞组成，并发现ZEB2基因在免疫细胞中的特异性表达及其与肿瘤纯度和巨噬细胞浸润的关联 | 首次揭示了ZEB2在子宫内膜癌免疫环境中的独特作用，并探讨了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探讨ZEB2在子宫内膜癌免疫环境中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 子宫内膜癌中的免疫细胞及ZEB2基因的表达与功能 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-UCEC的bulk RNA-seq数据和来自HPA数据库的免疫组织化学样本 |
| 924 | 2024-08-08 |
Handling the Cellular Complex Systems in Alzheimer's Disease Through a Graph Mining Approach
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-78775-2_16
PMID:34973018
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研究论文 | 本文通过图挖掘方法处理阿尔茨海默病中的细胞复杂系统，开发了一种针对单细胞RNA-seq实验的子通路分析方法，以识别潜在的扰动生物过程。 | 本文提出了一种新的子通路分析方法，用于处理单细胞RNA-seq数据，以减少假发现并识别与神经退行性变相关的扰动生物过程。 | NA | 旨在通过图挖掘方法揭示复杂人类疾病的病理机制，并改进诊断和治疗方法。 | 阿尔茨海默病中的细胞系统及其生物过程。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 图挖掘 | RNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 925 | 2024-08-08 |
Low Expression of YTH Domain-Containing 1 Promotes Microglial M1 Polarization by Reducing the Stability of Sirtuin 1 mRNA
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.774305
PMID:34975410
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研究论文 | 本文研究了m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用，发现YTH域包含蛋白1（YTHDC1）的低表达通过降低Sirtuin 1 mRNA的稳定性促进小胶质细胞M1极化 | 首次揭示了YTHDC1在视网膜小胶质细胞炎症反应调节中的关键作用 | NA | 探讨m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用 | 视网膜小胶质细胞在葡萄膜炎中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜细胞 |
| 926 | 2024-08-08 |
Metabolic detection and systems analyses of pancreatic ductal adenocarcinoma through machine learning, lipidomics, and multi-omics
2021-Dec-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh2724
PMID:34936449
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研究论文 | 本文介绍了一种利用机器学习和脂质组学进行胰腺导管腺癌（PDAC）检测的微创方法 | 通过贪婪算法和质谱特征选择优化了17种特征代谢物作为检测特征，并开发了一种基于液相色谱-质谱的靶向检测方法 | NA | 旨在开发一种用于胰腺导管腺癌早期检测的有效液体检测方法 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 机器学习 | 胰腺癌 | 液相色谱-质谱 | 机器学习（ML） | 代谢物 | 1033名不同阶段的PDAC患者 |
| 927 | 2024-08-08 |
Adult mouse and human organoids derived from thyroid follicular cells and modeling of Graves' hyperthyroidism
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2117017118
PMID:34916298
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研究论文 | 本文报道了从成年小鼠和人类甲状腺滤泡细胞中建立的三维（3D）类器官，并展示了这些类器官模拟格雷夫斯病甲状腺功能亢进的能力。 | 首次成功从成年甲状腺组织中建立三维类器官，并展示了其模拟人类自身免疫疾病的能力。 | NA | 研究甲状腺滤泡细胞类器官的建立及其在模拟人类自身免疫疾病中的应用。 | 成年小鼠和人类的甲状腺滤泡细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺疾病 | 单细胞RNA测序，透射电子显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 928 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the critical molecular pattern of UV-induced cutaneous squamous cell carcinoma
2021-12-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04477-y
PMID:34934042
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术分析了紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌（cSCC）的关键分子模式 | 首次在单细胞水平上揭示了紫外线诱导的cSCC的关键分子模式，并发现S100A9和FABP5可能作为未来cSCC治疗的新靶点 | NA | 揭示紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌的分子机制 | 紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌及其邻近皮肤样本和健康皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 350个细胞，来自6个紫外线诱导的cSCC样本、匹配的邻近皮肤样本和3个健康皮肤组织 |
| 929 | 2024-08-08 |
Author Correction: Cellular basis of omentum activation and expansion revealed by single-cell RNA sequencing using a parabiosis model
2021-Dec-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04282-9
PMID:34934142
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 930 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of zebrafish cranial neural crest reveals spatiotemporal regulation of lineage decisions during development
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110140
PMID:34936864
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中的时空调控，揭示了神经嵴细胞谱系决策的时空动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术结合计算分析，揭示了斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中谱系决策的时空调控机制 | NA | 探究神经嵴细胞在斑马鱼胚胎发育过程中的谱系决策及其时空调控机制 | 斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中的单细胞转录组 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个迁移阶段的斑马鱼头部神经嵴细胞 |
| 931 | 2024-08-08 |
MultiMAP: dimensionality reduction and integration of multimodal data
2021-12-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02565-y
PMID:34930412
|
研究论文 | 介绍了一种名为MultiMAP的新算法，用于多模态数据降维和整合 | MultiMAP能够整合任意数量的数据集，利用非所有数据集共有的特征，不限于线性映射，允许用户指定每个数据集的影响，并且对大型数据集具有极高的可扩展性 | NA | 开发和评估一种新的多模态数据降维和整合算法 | 单细胞转录组学、染色质可及性、甲基化和空间数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 多模态数据 | NA |
| 932 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Links Loss of Human Pancreatic β-Cell Identity to ER Stress
2021-12-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10123585
PMID:34944092
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研究论文 | 本文通过结合β细胞系追踪和单细胞转录组学技术，研究了人胰岛细胞中β细胞身份改变的机制 | 本文首次展示了内质网稳态与β细胞表型之间的紧密关系，并强化了β细胞身份改变作为功能性β细胞质量损失机制的概念 | NA | 探讨人胰岛细胞中β细胞身份改变的机制 | 人胰岛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 初级人胰岛细胞 |
| 933 | 2024-08-08 |
Influence of Estrogen Treatment on ESR1+ and ESR1- Cells in ER+ Breast Cancer: Insights from Single-Cell Analysis of Patient-Derived Xenograft Models
2021-Dec-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13246375
PMID:34944995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了雌激素治疗对ER+乳腺癌中ESR1+和ESR1-细胞的影响 | 首次展示了雌激素对同一乳腺癌肿瘤中不同细胞类型的差异性影响 | NA | 探究雌激素治疗对ER+乳腺癌细胞的影响及其分子机制 | ER+乳腺癌中的ESR1+和ESR1-细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了雌激素刺激（SC31）和雌激素抑制（GS3）的患者来源异种移植（PDX）模型 |
| 934 | 2024-08-08 |
Heterologous prime-boost immunizations with chimpanzee adenoviral vectors elicit potent and protective immunity against SARS-CoV-2 infection
2021-Dec-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00360-4
PMID:34923570
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研究论文 | 本文描述了基于黑猩猩腺病毒血清型6和68（AdC6和AdC68）载体疫苗候选物的开发，并评估了其在小鼠中的免疫原性、保护效果和免疫细胞特征。 | 研究发现异源初免-加强免疫策略能诱导更高滴度的保护性抗体和更多的刺突特异性记忆CD8 T细胞。 | NA | 开发针对SARS-CoV-2的安全有效疫苗，以应对COVID-19全球大流行。 | 基于黑猩猩腺病毒载体的疫苗候选物在小鼠中的免疫反应和保护效果。 | 疫苗学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞特征 | 小鼠 |
| 935 | 2024-08-08 |
Investigating immune and non-immune cell interactions in head and neck tumors by single-cell RNA sequencing
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27619-4
PMID:34921143
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中非免疫细胞和免疫细胞的异质性、细胞群体特征及细胞间相互作用 | 首次全面展示了HNSCC微环境中细胞内在机制和细胞间通讯的单细胞视图 | NA | 旨在开发更有效的治疗方法，通过研究HNSCC中非免疫和免疫细胞群体的异质性、细胞群体特征及细胞间相互作用 | 6例人乳头瘤病毒（HPV）阳性和12例HPV阴性的HNSCC患者肿瘤及匹配的外周血样本 | 数字病理学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 134,606个细胞 |
| 936 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2021-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27599-5
PMID:34921160
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了食管鳞状细胞癌（ESCC）微环境的异质性 | 揭示了ESCC微环境中大多数细胞类型的异质性，特别是成纤维细胞和免疫细胞亚群，并发现了具有预后价值和生物学意义的肿瘤特异性CST1肌成纤维细胞亚群 | NA | 研究食管鳞状细胞癌微环境的异质性及其对癌症生物学和治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 62,161个细胞来自11名ESCC患者的血液、邻近非恶性组织和匹配的肿瘤样本 |
| 937 | 2024-08-08 |
Preparation of mouse pancreatic tumor for single-cell RNA sequencing and analysis of the data
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100989
PMID:34927097
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研究论文 | 本文描述了一种有效的鼠胰腺肿瘤分离协议，用于单细胞RNA测序分析细胞群体 | 提供了使用Common Workflow Language (CWL)管道在用户友好的科学数据分析平台中处理数据和聚类异质细胞群体的方法 | NA | 研究鼠胰腺肿瘤的细胞群体 | 鼠胰腺肿瘤的单细胞悬液 | 数字病理学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 938 | 2024-08-08 |
From nasal to basal: single-cell sequencing of the bursa of Fabricius highlights the IBDV infection mechanism in chickens
2021-Dec-16, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00728-9
PMID:34915931
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，详细阐述了传染性法氏囊病病毒（IBDV）在鸡体内的感染机制，特别是通过鼻腔进入并影响法氏囊细胞的过程 | 研究首次揭示了IBDV通过鼻腔后部感染鸡，并通过血液循环到达法氏囊，对不同类型的法氏囊细胞（如B细胞、上皮细胞、树突状细胞和成纤维细胞）的感染反应进行了详细分析 | NA | 旨在确定病毒通过鼻腔的入口点，并阐明为什么鸟类容易受到RNA病毒的感染 | 传染性法氏囊病病毒（IBDV）在鸡体内的感染机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 939 | 2024-08-08 |
Diet and Gut Microbiota Interaction-Derived Metabolites and Intrahepatic Immune Response in NAFLD Development and Treatment
2021-Dec-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9121893
PMID:34944709
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研究论文 | 本文综述了饮食与肠道微生物代谢物在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）发展及治疗中对肝内免疫反应的影响 | 首次总结了饮食-肠道微生物代谢物与肝内免疫激活在NAFLD发展和进展中的相互作用，并讨论了通过靶向肠道微生物和重要分子信号通路的潜在治疗选项 | NA | 探讨NAFLD的病理机制及潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病（NAFLD）及其发展过程中的肠道微生物代谢物和肝内免疫反应 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 全球约25%的人口受影响 |
| 940 | 2024-08-08 |
YAP1 Is a Potential Predictive Molecular Biomarker for Response to SMO Inhibitor in Medulloblastoma Cells
2021-Dec-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13246249
PMID:34944872
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研究论文 | 本研究探讨了YAP1作为预测髓母细胞瘤对SMO抑制剂反应的分子生物标志物的潜力 | 发现YAP1在SHH alpha髓母细胞瘤中过度表达，并与SMO抑制剂的耐药性相关 | 研究基于回顾性队列微阵列数据和体外模型，需要进一步的临床前模型验证 | 评估YAP1作为髓母细胞瘤对SMO抑制剂反应的预测生物标志物的有效性 | 髓母细胞瘤细胞和患者样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 微阵列数据, 单细胞RNA测序数据 | 两个体外模型，五个患者样本 |