单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-08 |
Role of Calcium Signaling Pathway-Related Gene Regulatory Networks in Ischemic Stroke Based on Multiple WGCNA and Single-Cell Analysis
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/8060477
PMID:34987704
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研究论文 | 本研究旨在通过多重加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞分析，探讨缺血性中风（IS）后相关通路的变化及基因表达的差异表达。 | 本研究首次结合多重WGCNA和单细胞分析，揭示了钙信号通路相关基因和转录因子在缺血性中风中的关键作用。 | NA | 探讨缺血性中风后相关通路的变化及基因表达的差异表达。 | 缺血性中风样本的转录组表达数据和脑血管组织的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | WGCNA | 基因表达数据 | 40个样本的微阵列表达谱 |
| 902 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Pancreatic Stellate Cells Are Powerful Contributors to the Malignant Progression of Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.783617
PMID:34988078
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研究论文 | 研究探讨了胰腺星状细胞（PSC）在胰腺癌恶性进展中的作用及其亚型对肿瘤发展和治疗抵抗的影响 | 利用单细胞测序技术分析了PSC的群体异质性，并揭示了两种功能互补且可逆的PSC亚型与肿瘤发展的关系 | NA | 深入理解PSC的分化及其在胰腺癌治疗中的作用 | 胰腺星状细胞及其在胰腺癌中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 903 | 2024-08-08 |
CTLA4-Mediated Immunosuppression in Glioblastoma is Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Microenvironment
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S341981
PMID:34992419
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研究论文 | 本研究探讨了CTLA4在胶质母细胞瘤（GBM）中的免疫抑制作用及其与肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的关系 | 开发了一个预测模型来计算每个GBM病例的风险评分，并发现CTLA4表达与巨噬细胞在GBM肿瘤微环境中的浸润水平和功能正相关 | CTLA4抑制剂在GBM中的临床效果有限 | 全面评估CTLA4在GBM中的作用 | CTLA4在GBM中的免疫抑制作用及其与肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 组织样本 | 471例GBM病例 |
| 904 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals CXCLs Enriched Fibroblasts Within Odontogenic Keratocysts
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S342951
PMID:34992422
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了牙源性角化囊肿中的细胞亚群，特别是与血管生成相关的细胞亚群，并探讨了血管生成的潜在调控机制 | 首次揭示了CXCLs富集的成纤维细胞在牙源性角化囊肿中的重要作用，并发现静水压力可以部分调控这些细胞的CXCL12分泌 | 研究样本仅来自3名捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 定义牙源性角化囊肿的细胞亚群，特别是与血管生成相关的细胞亚群，并探索血管生成的潜在调控机制 | 牙源性角化囊肿中的细胞亚群及其与血管生成的关系 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14,072个细胞来自3名捐赠者 |
| 905 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance of NLR About NETosis and Lymphocytes Perturbations in Localized Renal Cell Carcinoma With Tumor Thrombus
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.771545
PMID:34993135
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研究论文 | 本文探讨了中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）在伴有肿瘤血栓的局部肾细胞癌中的预后意义，特别是与NETosis和淋巴细胞扰动的关系。 | 首次证明了中性粒细胞相关的NETosis和系统性淋巴细胞扰动在伴有肿瘤血栓的局部肾细胞癌患者中的肿瘤进展作用，并指出NLR≥4是一个独立的预后风险因素。 | NA | 研究NLR在伴有肿瘤血栓的非转移性肾细胞癌中的预后意义，特别是与NETosis和淋巴细胞扰动的关系。 | 214名接受手术治疗的伴有肿瘤血栓的肾细胞癌患者。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, TCR测序, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 基因表达数据 | 214名患者 |
| 906 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Molecular Anatomy of Sheep Hair Follicle Heterogeneity and Wool Curvature
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.800157
PMID:34993204
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了羊毛囊的分子结构及其与羊毛弯曲度的关系 | 首次在羊中应用单细胞RNA测序技术，揭示了羊毛囊的细胞组成和分子机制，并阐明了羊毛弯曲度的潜在分子机制 | NA | 探究羊毛囊发育的分子机制及其与羊毛弯曲度的关系 | 羊的毛囊细胞及其转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15,830个单细胞转录组 |
| 907 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783907
PMID:35003102
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和加权共表达网络分析，基于公共数据库识别出TNC作为瘢痕瘤的新型生物标志物 | 首次识别出Tenascin-C (TNC)作为瘢痕瘤的敏感生物标志物，并通过伪时间分析探讨了其在成纤维细胞分化中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅基于公共数据库和中心数据进行验证，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别瘢痕瘤的生物标志物，为设计新的靶向治疗提供依据 | 瘢痕瘤的生物标志物及成纤维细胞分化过程中的潜在作用 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序分析，加权共表达网络分析 | NA | RNA测序数据 | 16名瘢痕瘤患者及其邻近正常组织 |
| 908 | 2024-08-08 |
Molecular Subtypes Based on Cell Differentiation Trajectories in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: Differential Prognosis and Immunotherapeutic Responses
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.791621
PMID:35003112
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析识别的HNSCC细胞分化相关基因，全面分析了866例HNSCC病例的分子亚型及其免疫、代谢和干细胞特性，并开发了HNSCC细胞分化评分（HCDscore）以量化个体样本的独特异质性。 | 本研究首次将HNSCC分为三个基于HDRGs的分子亚型：活跃基质型（Cluster-A）、活跃代谢型（Cluster-B）和活跃免疫型（Cluster-C），并展示了HCDscore与免疫微环境、亚型、致癌生物过程、遗传变异和预后的相关性。 | NA | 旨在研究头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 多组学数据 | 866例HNSCC病例 |
| 909 | 2024-08-08 |
Statistical methods for analysis of single-cell RNA-sequencing data
2021, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2021.101580
PMID:35004214
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研究论文 | 本文提出了一种新的统计方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的独特分子标识符（UMI）计数数据 | 该方法考虑了导致严重丢失事件的生物过程，在模型中对观察到的UMI基因计数进行建模 | NA | 研究单细胞RNA测序数据分析中的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的UMI计数数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 910 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Identify Transcription Factor BACH1 as a Master Regulator Gene in Vascular Cells During Aging
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.786496
PMID:35004685
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了转录因子BACH1在血管细胞衰老中的主要调控作用 | 首次识别BACH1为血管细胞衰老的主调控基因，并阐明了其在氧化应激下加剧内皮细胞衰老的机制 | 研究主要基于已发表的数据，未涉及实验验证 | 探索衰老心脏血管的细胞和分子特性，并证明转录因子BACH1在内皮细胞衰老中的作用及其机制 | 猴子和老鼠的心脏血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括猴子的冠状动脉和大动脉以及老鼠的心脏 |
| 911 | 2024-08-08 |
MAP3K8 Is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Response in Glioma
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.779290
PMID:35004849
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研究论文 | 研究探讨了MAP3K8在胶质瘤中的表达、临床意义及其与免疫反应的关系 | 首次揭示了MAP3K8在胶质瘤中的异常高表达及其与不良临床病理特征的相关性，并探讨了其在胶质瘤免疫反应中的作用 | NA | 探索MAP3K8作为胶质瘤预后标志物的潜力及其在胶质瘤免疫反应中的作用 | MAP3K8在胶质瘤中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组化染色，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和组织样本 |
| 912 | 2024-08-08 |
eNOS controls angiogenic sprouting and retinal neovascularization through the regulation of endothelial cell polarity
2021-Dec-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04042-y
PMID:34971428
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研究论文 | 本研究探讨了eNOS在血管新生过程中的作用，特别是在内皮细胞极性调控中的角色 | 首次详细阐述了eNOS通过调节内皮细胞极性影响血管新生和视网膜新生血管化的机制 | NA | 研究eNOS在血管新生和视网膜新生血管化中的作用 | 内皮细胞的极性和血管新生 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | eNOS敲除小鼠的视网膜内皮细胞 |
| 913 | 2024-08-08 |
TREM2-independent oligodendrocyte, astrocyte, and T cell responses to tau and amyloid pathology in mouse models of Alzheimer disease
2021-12-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110158
PMID:34965428
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，广泛分析了三种不同阿尔茨海默病（AD）小鼠模型中的13种细胞类型，重点研究了微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 研究发现了少突胶质细胞在不同疾病模型中出现的两种不同的转录状态，并确定了它们的空间分布。此外，研究还探讨了Trem2缺失在合并病理背景下的影响。 | NA | 研究非神经元细胞在神经退行性疾病中的反应，以及这些反应如何影响疾病的发病机制和进展。 | 微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种不同阿尔茨海默病小鼠模型中的13种细胞类型 |
| 914 | 2024-08-08 |
Conjoint analysis of circulating tumor cells and solid tumors for exploring potential prognostic markers and constructing a robust novel predictive signature for breast cancer
2021-Dec-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02415-8
PMID:34953500
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研究论文 | 本研究通过分析循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据，探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个新的预测模型 | 首次在分子水平上研究循环肿瘤细胞的异质性，并利用这些信息构建了一个18基因的风险评分模型，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和批量测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个稳健的新预测模型 | 循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 涉及乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和实体瘤样本 |
| 915 | 2024-08-08 |
Spatially Resolved Expression of Transposable Elements in Disease and Somatic Tissue with SpatialTE
2021-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413623
PMID:34948421
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialTE的工具，用于分析空间转录组学数据中的转座子表达，并展示了其在体细胞和疾病组织中的应用 | SpatialTE工具能够分析空间转录组学数据中的转座子表达，这是由于转座子的高度重复性质在以往的研究中未被充分探讨 | NA | 研究转座子在空间上的表达模式及其在基因调控中的作用 | 转座子在体细胞和疾病组织中的表达 | NA | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 916 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell sequencing of 5-hydroxymethylcytosine and genomic DNA using scH&G-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101016
PMID:34950891
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA测序（scH&G-seq）的详细协议，用于同时量化单个细胞中的5hmC和基因组DNA，以在单细胞分裂分辨率下重建谱系树 | scH&G-seq技术能够同时量化单个细胞中的5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA，结合基因组变异数据，准确重建更大的谱系树 | NA | 开发一种新的单细胞测序技术，用于在单细胞分裂分辨率下重建细胞谱系 | 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）和基因组DNA | 基因组学 | NA | scH&G-seq | NA | DNA | 单个细胞 |
| 917 | 2024-08-08 |
Profiling Glioblastoma Cases with an Expression of DCX, OLIG2 and NES
2021-Dec-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413217
PMID:34948016
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了17例胶质母细胞瘤中DCX、NES和OLIG2的表达模式 | 首次详细分析了DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并结合单细胞RNA测序数据进行了深入探讨 | 研究结果未能明确证明DCX参与胶质母细胞瘤细胞的迁移 | 探讨DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用 | 胶质母细胞瘤中的DCX、NES和OLIG2表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 17例胶质母细胞瘤样本 |
| 918 | 2024-08-08 |
Immunotherapy for Hepatocellular Carcinoma: New Prospects for the Cancer Therapy
2021-Dec-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121355
PMID:34947886
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综述 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）的免疫治疗新进展，包括免疫检查点抑制剂、树突状细胞疫苗、溶瘤病毒等方法 | 介绍了单细胞RNA测序技术在识别免疫细胞群及其相互作用中的应用，以提高HCC患者对免疫治疗反应的可能性 | 目前免疫治疗策略在临床上尚未普遍引发强烈的抗肿瘤反应 | 探讨肿瘤浸润免疫细胞的种类及其在HCC发展中的作用，并讨论免疫治疗策略的最新进展 | 肝细胞癌及其免疫治疗 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 919 | 2024-08-08 |
Therapeutic Effect of IL-38 on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Cell Pathogenicity
2021-12-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.15.31
PMID:34967854
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素(IL)-38对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制 | 首次揭示了IL-38通过重编程免疫细胞景观和减少Th17细胞致病性来治疗EAU的效果 | NA | 阐明IL-38对EAU的影响及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 正常小鼠、EAU小鼠及IL-38治疗的小鼠的颈淋巴结 |
| 920 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Developmental Relationships and Specific Markers of Mouse Periodontium Cellular Subsets
2021-Aug, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2021.679937
PMID:34966906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠牙周组织细胞亚群的发育关系及特定标记物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了牙周组织细胞的异质性及其与牙囊细胞的关系，并鉴定了区分牙骨质细胞和牙槽骨成骨细胞的特定基因 | NA | 探讨牙周组织细胞的发育关系及其细胞间相互作用 | 小鼠牙周组织的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括PTHrP-mCherry牙囊细胞（P6）和2.3kb Col1a1启动子驱动的GFP牙周细胞（P25） |