单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783907
PMID:35003102
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和加权共表达网络分析，基于公共数据库识别出TNC作为瘢痕瘤的新型生物标志物 | 首次识别出Tenascin-C (TNC)作为瘢痕瘤的敏感生物标志物，并通过伪时间分析探讨了其在成纤维细胞分化中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅基于公共数据库和中心数据进行验证，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别瘢痕瘤的生物标志物，为设计新的靶向治疗提供依据 | 瘢痕瘤的生物标志物及成纤维细胞分化过程中的潜在作用 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序分析，加权共表达网络分析 | NA | RNA测序数据 | 16名瘢痕瘤患者及其邻近正常组织 |
| 882 | 2024-08-08 |
Molecular Subtypes Based on Cell Differentiation Trajectories in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: Differential Prognosis and Immunotherapeutic Responses
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.791621
PMID:35003112
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析识别的HNSCC细胞分化相关基因，全面分析了866例HNSCC病例的分子亚型及其免疫、代谢和干细胞特性，并开发了HNSCC细胞分化评分（HCDscore）以量化个体样本的独特异质性。 | 本研究首次将HNSCC分为三个基于HDRGs的分子亚型：活跃基质型（Cluster-A）、活跃代谢型（Cluster-B）和活跃免疫型（Cluster-C），并展示了HCDscore与免疫微环境、亚型、致癌生物过程、遗传变异和预后的相关性。 | NA | 旨在研究头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 多组学数据 | 866例HNSCC病例 |
| 883 | 2024-08-08 |
Statistical methods for analysis of single-cell RNA-sequencing data
2021, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2021.101580
PMID:35004214
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研究论文 | 本文提出了一种新的统计方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的独特分子标识符（UMI）计数数据 | 该方法考虑了导致严重丢失事件的生物过程，在模型中对观察到的UMI基因计数进行建模 | NA | 研究单细胞RNA测序数据分析中的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的UMI计数数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 884 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Identify Transcription Factor BACH1 as a Master Regulator Gene in Vascular Cells During Aging
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.786496
PMID:35004685
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了转录因子BACH1在血管细胞衰老中的主要调控作用 | 首次识别BACH1为血管细胞衰老的主调控基因，并阐明了其在氧化应激下加剧内皮细胞衰老的机制 | 研究主要基于已发表的数据，未涉及实验验证 | 探索衰老心脏血管的细胞和分子特性，并证明转录因子BACH1在内皮细胞衰老中的作用及其机制 | 猴子和老鼠的心脏血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括猴子的冠状动脉和大动脉以及老鼠的心脏 |
| 885 | 2024-08-08 |
MAP3K8 Is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Response in Glioma
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.779290
PMID:35004849
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研究论文 | 研究探讨了MAP3K8在胶质瘤中的表达、临床意义及其与免疫反应的关系 | 首次揭示了MAP3K8在胶质瘤中的异常高表达及其与不良临床病理特征的相关性，并探讨了其在胶质瘤免疫反应中的作用 | NA | 探索MAP3K8作为胶质瘤预后标志物的潜力及其在胶质瘤免疫反应中的作用 | MAP3K8在胶质瘤中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组化染色，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个数据集和组织样本 |
| 886 | 2024-08-08 |
eNOS controls angiogenic sprouting and retinal neovascularization through the regulation of endothelial cell polarity
2021-Dec-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04042-y
PMID:34971428
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研究论文 | 本研究探讨了eNOS在血管新生过程中的作用，特别是在内皮细胞极性调控中的角色 | 首次详细阐述了eNOS通过调节内皮细胞极性影响血管新生和视网膜新生血管化的机制 | NA | 研究eNOS在血管新生和视网膜新生血管化中的作用 | 内皮细胞的极性和血管新生 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | eNOS敲除小鼠的视网膜内皮细胞 |
| 887 | 2024-08-08 |
TREM2-independent oligodendrocyte, astrocyte, and T cell responses to tau and amyloid pathology in mouse models of Alzheimer disease
2021-12-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110158
PMID:34965428
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，广泛分析了三种不同阿尔茨海默病（AD）小鼠模型中的13种细胞类型，重点研究了微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 研究发现了少突胶质细胞在不同疾病模型中出现的两种不同的转录状态，并确定了它们的空间分布。此外，研究还探讨了Trem2缺失在合并病理背景下的影响。 | NA | 研究非神经元细胞在神经退行性疾病中的反应，以及这些反应如何影响疾病的发病机制和进展。 | 微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种不同阿尔茨海默病小鼠模型中的13种细胞类型 |
| 888 | 2024-08-08 |
Conjoint analysis of circulating tumor cells and solid tumors for exploring potential prognostic markers and constructing a robust novel predictive signature for breast cancer
2021-Dec-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02415-8
PMID:34953500
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研究论文 | 本研究通过分析循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据，探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个新的预测模型 | 首次在分子水平上研究循环肿瘤细胞的异质性，并利用这些信息构建了一个18基因的风险评分模型，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和批量测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个稳健的新预测模型 | 循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 涉及乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和实体瘤样本 |
| 889 | 2024-08-08 |
Spatially Resolved Expression of Transposable Elements in Disease and Somatic Tissue with SpatialTE
2021-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413623
PMID:34948421
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialTE的工具，用于分析空间转录组学数据中的转座子表达，并展示了其在体细胞和疾病组织中的应用 | SpatialTE工具能够分析空间转录组学数据中的转座子表达，这是由于转座子的高度重复性质在以往的研究中未被充分探讨 | NA | 研究转座子在空间上的表达模式及其在基因调控中的作用 | 转座子在体细胞和疾病组织中的表达 | NA | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 890 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell sequencing of 5-hydroxymethylcytosine and genomic DNA using scH&G-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101016
PMID:34950891
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA测序（scH&G-seq）的详细协议，用于同时量化单个细胞中的5hmC和基因组DNA，以在单细胞分裂分辨率下重建谱系树 | scH&G-seq技术能够同时量化单个细胞中的5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA，结合基因组变异数据，准确重建更大的谱系树 | NA | 开发一种新的单细胞测序技术，用于在单细胞分裂分辨率下重建细胞谱系 | 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）和基因组DNA | 基因组学 | NA | scH&G-seq | NA | DNA | 单个细胞 |
| 891 | 2024-08-08 |
Profiling Glioblastoma Cases with an Expression of DCX, OLIG2 and NES
2021-Dec-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413217
PMID:34948016
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了17例胶质母细胞瘤中DCX、NES和OLIG2的表达模式 | 首次详细分析了DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并结合单细胞RNA测序数据进行了深入探讨 | 研究结果未能明确证明DCX参与胶质母细胞瘤细胞的迁移 | 探讨DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用 | 胶质母细胞瘤中的DCX、NES和OLIG2表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 17例胶质母细胞瘤样本 |
| 892 | 2024-08-08 |
Immunotherapy for Hepatocellular Carcinoma: New Prospects for the Cancer Therapy
2021-Dec-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121355
PMID:34947886
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综述 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）的免疫治疗新进展，包括免疫检查点抑制剂、树突状细胞疫苗、溶瘤病毒等方法 | 介绍了单细胞RNA测序技术在识别免疫细胞群及其相互作用中的应用，以提高HCC患者对免疫治疗反应的可能性 | 目前免疫治疗策略在临床上尚未普遍引发强烈的抗肿瘤反应 | 探讨肿瘤浸润免疫细胞的种类及其在HCC发展中的作用，并讨论免疫治疗策略的最新进展 | 肝细胞癌及其免疫治疗 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 893 | 2024-08-08 |
Therapeutic Effect of IL-38 on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Cell Pathogenicity
2021-12-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.15.31
PMID:34967854
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素(IL)-38对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制 | 首次揭示了IL-38通过重编程免疫细胞景观和减少Th17细胞致病性来治疗EAU的效果 | NA | 阐明IL-38对EAU的影响及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 正常小鼠、EAU小鼠及IL-38治疗的小鼠的颈淋巴结 |
| 894 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Developmental Relationships and Specific Markers of Mouse Periodontium Cellular Subsets
2021-Aug, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2021.679937
PMID:34966906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠牙周组织细胞亚群的发育关系及特定标记物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了牙周组织细胞的异质性及其与牙囊细胞的关系，并鉴定了区分牙骨质细胞和牙槽骨成骨细胞的特定基因 | NA | 探讨牙周组织细胞的发育关系及其细胞间相互作用 | 小鼠牙周组织的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括PTHrP-mCherry牙囊细胞（P6）和2.3kb Col1a1启动子驱动的GFP牙周细胞（P25） |
| 895 | 2024-08-08 |
scGET: Predicting Cell Fate Transition During Early Embryonic Development by Single-cell Graph Entropy
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.008
PMID:34954425
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scGET的计算方法，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据探索基因间的关联，用于预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | scGET方法通过将基因表达数据转换为局部网络熵，利用单细胞图熵（SGE）值定量描述细胞群体间基因调控网络的稳定性和关键性，从而在单细胞水平上检测细胞命运或谱系承诺的关键信号 | NA | 研究目的是开发一种新的计算方法来预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | 研究对象是早期胚胎发育过程中的细胞命运转变 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 896 | 2024-08-08 |
GranatumX: A Community-engaging, Modularized, and Flexible Webtool for Single-cell Data Analysis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.005
PMID:34973417
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研究论文 | 介绍了一种名为GranatumX的下一代软件环境，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | GranatumX允许生物学家在基于Web的图形环境中访问最新的scRNA-seq生物信息学方法，并为软件开发者提供了一个快速推广其工具的平台 | NA | 开发一个社区参与、模块化和灵活的Web工具，用于单细胞数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据分析 | NA |
| 897 | 2024-08-08 |
Inhibition of Podocytes DPP4 Activity Is a Potential Mechanism of Lobeliae Chinensis Herba in Treating Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.779652
PMID:34950037
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研究论文 | 本文研究了传统中药半夏泻心汤（LCH）通过抑制足细胞中的DPP4活性来治疗糖尿病肾病（DKD）的潜在机制 | 首次通过单细胞测序数据和网络药理学方法，筛选出LCH中12种活性成分，并预测这些成分通过分子对接抑制DPP4活性，从而延缓足细胞增殖 | NA | 探讨半夏泻心汤治疗糖尿病肾病的机制 | 糖尿病肾病中的足细胞和DPP4活性 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 分子对接 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 898 | 2024-08-08 |
Dissecting the Landscape of Activated CMV-Stimulated CD4+ T Cells in Humans by Linking Single-Cell RNA-Seq With T-Cell Receptor Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.779961
PMID:34950144
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了人类外周血中CMVpp65再激活的CD4+ T细胞亚群的异质性和潜在功能 | 首次详细分析了CMV再激活的CD4+ T细胞亚群的表型和TCR谱系，为理解CD4+ T细胞在CMV感染中的功能和相互作用提供了线索 | NA | 解析CMV感染中激活的CD4+ T细胞的景观 | 人类外周血中CMVpp65再激活的CD4+ T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | RNA, TCR序列 | 来自人类外周血的CD4+ T细胞亚群 |
| 899 | 2024-08-08 |
Single-Cell Regulatory Network Inference and Clustering Identifies Cell-Type Specific Expression Pattern of Transcription Factors in Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.676515
PMID:34955748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并构建了细胞类型特异性的表达图谱 | 首次在单细胞水平上揭示了小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并创建了细胞类型特异性的表达图谱 | NA | 旨在识别复杂组织中的细胞类型，并进行大规模的细胞类型特异性基因表达分析 | 成年小鼠坐骨神经中的不同细胞类型及其转录因子表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 238个转录因子在9种不同细胞类型中表达 |
| 900 | 2024-08-08 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于双光子显微镜的活体成像技术，用于非侵入性地监测和表征视网膜类器官的长期发育 | 使用荧光寿命成像显微镜（FLIM）和超光谱成像技术监测视网膜类器官的代谢轨迹和分子结构变化 | 组织产物的异质性和主观组织选择降低了类器官实验的可重复性 | 提高类器官质量控制，监测视网膜类器官的长期发育 | 视网膜类器官的代谢和分子结构变化 | 数字病理学 | NA | 双光子显微镜，荧光寿命成像显微镜（FLIM），超光谱成像 | NA | 图像 | 多个细胞系和生产批次的视网膜类器官 |