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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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881 | 2024-08-08 |
Interactions Between Anti-Angiogenic Therapy and Immunotherapy in Glioblastoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.812916
PMID:35096619
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综述 | 本文综述了胶质母细胞瘤中抗血管生成治疗与免疫治疗之间的相互作用及其潜在的协同效应 | 探讨了抗血管生成治疗与免疫治疗在胶质母细胞瘤中的协同作用,以及通过抑制VEGF等促血管生成因子来增加效应免疫细胞浸润的可能性 | NA | 探讨胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的肿瘤血管与免疫细胞的相互作用,并寻找针对这些相互作用的潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤的肿瘤微环境及其与免疫治疗的相互作用 | NA | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
882 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Aneurysmal Aortic Tissue in Patients with Marfan Syndrome Reveals Dysfunctional TGF-β Signaling
2021-12-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13010095
PMID:35052435
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了马方综合征患者升主动脉瘤组织中的细胞群变化和基因表达 | 首次揭示了马方综合征中升主动脉瘤组织中细胞群的变化,特别是平滑肌细胞的增殖和分化状态的改变,以及TGF-β信号通路的异常 | 样本量较小,仅包括3例马方综合征患者和4例年龄匹配的非动脉瘤对照组 | 探究马方综合征中升主动脉瘤发展的分子和细胞机制 | 马方综合征患者的升主动脉瘤组织和非动脉瘤对照组组织 | 数字病理学 | 马方综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例马方综合征患者和4例年龄匹配的非动脉瘤对照组 |
883 | 2024-08-08 |
mDrop-Seq: Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq of Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans
2021-Dec-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10010030
PMID:35062691
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研究论文 | 本文介绍了一种名为mDrop-seq的高通量单细胞RNA测序技术,用于分析两种酵母物种的转录组 | mDrop-seq技术能够克服微生物细胞壁坚硬和RNA含量低的挑战,实现高通量单细胞RNA测序 | NA | 旨在开发一种能够量化不同酵母物种基因表达变异的高通量单细胞RNA测序技术 | 研究对象包括酵母菌Saccharomyces cerevisiae和Candida albicans | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了74,814个细胞 |
884 | 2024-08-08 |
Dissecting the Complexity of Early Heart Progenitor Cells
2021-Dec-26, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9010005
PMID:35050215
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综述 | 本文综述了早期心脏发育中细胞异质性的三个关键方面 | 利用单细胞方法提供了前所未有的细胞异质性细节,为解析其功能作用提供了新机会 | 尽管有数十年的研究,我们对原始心脏管形成的谱系分隔的全面复杂性仍知之甚少 | 探讨早期心脏形态发生的关键方面,并讨论单细胞转录组学和表观基因组学等技术如何可能改变我们对心脏发育复杂性的理解 | 早期心脏发育中的心肌和内皮谱系分隔、信号引导的这些前体细胞分化以及原始心脏管中心肌细胞前体的转录异质性 | NA | 先天性心脏缺陷 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | NA | NA |
885 | 2024-08-08 |
Decode the Stable Cell Communications Based on Neuropeptide-Receptors Network in 36746 Tumor Cells
2021-Dec-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10010014
PMID:35052689
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研究论文 | 本文通过系统性的单细胞转录组数据整合分析,研究了不同恶性肿瘤中神经肽介导的细胞通讯的相似性和变异性 | 首次在单细胞水平上阐明了神经肽及其受体的分子机制,并构建了细胞间的通讯网络 | 研究主要基于已知的神经肽和受体的相互作用,可能存在未知的相互作用未被纳入分析 | 旨在阐明不同癌症类型中神经肽-受体网络介导的稳定细胞通讯模式 | 36746个肿瘤细胞中的神经肽-受体网络 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 72个癌症数据集,涵盖24种癌症类型 |
886 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Immune Characteristics of Myeloid Cells and Memory T Cells in Recovered COVID-19 Patients With Different Severities
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.781432
PMID:35046942
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同严重程度的康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞(PBMCs)的免疫特征 | 首次提供了大规模的康复期COVID-19患者外周免疫反应的单细胞图谱 | NA | 探究康复期COVID-19患者的免疫细胞特征 | 康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个样本,包含超过260,000个外周血单个核细胞 |
887 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Bone Marrow Cells in Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745483
PMID:35046994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞,揭示了B细胞在疾病中的作用及其对造血功能的影响 | 首次大规模单细胞转录组测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞,并鉴定了B细胞与造血细胞相互作用的特定配体-受体对 | NA | 探讨B细胞在再生障碍性贫血中的作用及其对造血功能的影响 | 再生障碍性贫血患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000个骨髓细胞,来自再生障碍性贫血患者和健康供体 |
888 | 2024-08-08 |
A Ductal-Cell-Related Risk Model Integrating Single-Cell and Bulk Sequencing Data Predicts the Prognosis of Patients With Pancreatic Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763636
PMID:35047000
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据,开发了一种与导管细胞相关的风险模型,用于预测胰腺腺癌患者的预后 | 首次通过整合单细胞和批量测序数据,开发了一种新的风险评分模型,用于区分胰腺腺癌患者的高风险和低风险组 | 研究未提及免疫细胞浸润分数在两组间的显著差异 | 旨在通过整合单细胞和批量测序数据,提取导致不同预后的导管细胞特征 | 胰腺导管腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
889 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Bulk Transcriptome Data Integration Reveals Dysfunctional Cell Types and Aberrantly Expressed Genes in Hypertrophic Scar
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.806740
PMID:35047019
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了肥厚性瘢痕中的功能障碍细胞类型和异常表达基因 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,详细分析了肥厚性瘢痕中的细胞组成、细胞间通讯和关键转录调控网络的变化 | NA | 研究肥厚性瘢痕的生物学特性,特别是细胞组成和转录调控网络的变化 | 肥厚性瘢痕中的细胞类型、细胞间通讯和转录调控网络 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
890 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Mesenchymal Stromal Cells: Identification, Classification, and Differentiation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.787118
PMID:35047499
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综述 | 本文综述了骨髓间充质干细胞(BMSCs)的鉴定、分类及其分化机制的最新进展 | 通过谱系追踪和单细胞测序技术,揭示了BMSCs的新亚群及其在生理和病理条件下的作用,以及调控BMSCs命运的关键因子和机制 | BMSCs的鉴定和分类仍存在争议,限制了其在临床上的应用 | 探讨BMSCs的鉴定、分类及其在临床应用中的重要意义 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
891 | 2024-08-08 |
Calcium-Prolactin Secretion Coupling in Rat Pituitary Lactotrophs Is Controlled by PI4-Kinase Alpha
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.790441
PMID:35058881
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研究论文 | 本文研究了磷脂酰肌醇激酶(PIKs)在钙驱动的垂体催乳素(PRL)释放中的作用,特别是在垂体乳头细胞中的作用 | 揭示了PI4KA在钙分泌偶联中的关键作用,这是通过电压门控和PI(4, 5)P2依赖的钙信号传导途径实现的 | NA | 分析磷脂酰肌醇激酶在钙驱动的催乳素释放中的作用 | 垂体乳头细胞中的催乳素释放 | NA | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR分析、放射免疫测定、ELISA、Fura 2成像 | NA | RNA、激素、钙信号 | 单细胞水平的研究 |
892 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Profiling Identifies Pathways Associated With CD8+ T-Cell Activation in Severe Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.790990
PMID:35058969
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析,结合转录组学分析,探讨了严重再生障碍性贫血(SAA)患者中CD8+ T细胞激活的关键通路 | 本研究首次揭示了SAA患者中CD8+ T细胞激活的新通路,并提供了潜在的治疗靶点 | NA | 揭示严重再生障碍性贫血患者中CD8+ T细胞激活的调控机制 | 严重再生障碍性贫血(SAA)患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA | SAA患者和健康捐赠者的血浆、骨髓上清液和CD8 T细胞 |
893 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Phosphorylation-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.734287
PMID:35059393
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序数据和TCGA RNA-seq数据,分析了肝细胞癌患者中的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因的表达情况 | 发现了九种在肝细胞癌干细胞中高表达的蛋白激酶和磷酸化相关基因,这些基因与肝细胞癌患者的预后不良相关,并揭示了它们在细胞周期相关通路中的作用 | NA | 探讨蛋白激酶信号传导的潜在机制,以提高肝细胞癌治疗的效果 | 肝细胞癌患者的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 肝细胞癌患者 |
894 | 2024-08-08 |
Role of Human Antigen R (HuR) in the Regulation of Pulmonary ACE2 Expression
2021-12-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11010022
PMID:35011584
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研究论文 | 研究HuR蛋白在调节肺部ACE2表达中的作用 | 首次探讨ACE2与HuR之间的关联 | 需要进一步研究ACE2表达调控的机制 | 探究COPD患者中ACE2表达的调控机制 | COPD患者和吸烟者的肺组织及人肺细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 成像流式细胞术 | NA | scRNA-seq数据, 免疫组织化学图像 | COPD患者和吸烟者的肺组织及人肺细胞 |
895 | 2024-08-08 |
CrossTalkeR: analysis and visualization of ligand-receptorne tworks
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab370
PMID:35032393
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研究论文 | CrossTalkeR框架用于分析和可视化配体-受体网络交互,特别关注于对比两种生物表型(如疾病与稳态)时细胞间通讯的变化 | CrossTalkeR能够识别导致细胞通讯变化的相关配体、受体和细胞类型,并提供特定细胞类型、配体或受体的聚焦分析 | 当前方法通常只提供推断的配体-受体交互列表,且多数方法无法量化两种生物表型间细胞间通讯的变化 | 开发一种新的框架来分析和可视化配体-受体网络交互,以更好地理解细胞间通讯在不同生物表型中的变化 | 配体、受体和细胞类型在两种生物表型(如疾病与稳态)中细胞通讯的变化 | 生物信息学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 涉及人类骨髓增殖性肿瘤的单细胞RNA-seq数据 |
896 | 2024-08-08 |
Single-cell reconstruction with spatial context of migrating neural crest cells and their microenvironments during vertebrate head and neck formation
2021-11-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199468
PMID:35020873
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研究论文 | 本文通过无标记、未分类的单细胞RNA测序技术,保留空间信息,研究了迁移中的神经嵴细胞及其微环境的转录状态,以及前四个鸡头至心脏的鳃弓(BA1-4)的细胞景观。 | 本文首次识别了迁移神经嵴细胞的新标记物和266个普遍存在于BA1-4流的入侵基因,并通过扰动分析和时间流逝成像揭示了这些基因的功能角色。 | NA | 阐明多能神经嵴细胞在脊椎动物胚胎中的分化和入侵动态。 | 迁移中的神经嵴细胞及其微环境,以及前四个鸡头至心脏的鳃弓(BA1-4)。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及前四个鸡头至心脏的鳃弓(BA1-4)的细胞。 |
897 | 2024-08-08 |
Differential analysis of binarized single-cell RNA sequencing data captures biological variation
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab118
PMID:34988441
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研究论文 | 本文提出使用二值化表达谱来识别单细胞RNA测序数据中的生物变异效应 | 采用二值化表达数据来更准确地表示生物变异,并揭示转录本的相对丰度 | NA | 识别单细胞RNA测序数据中的生物变异 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 16个公开可用和模拟的数据集 |
898 | 2024-08-08 |
Cross-Tissue Characterization of Heterogeneities of Mesenchymal Stem Cells and Their Differentiation Potentials
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.781021
PMID:34977025
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了来自四种组织的间充质干细胞(MSCs)的异质性及其分化潜能 | 首次在单细胞水平上比较了不同组织来源的MSCs,并识别了其亚群及其在不同诱导分化过程中的基因和转录因子 | NA | 优化MSCs在再生医学和自身免疫疾病治疗中的临床应用 | 间充质干细胞(MSCs)及其在不同组织中的异质性和分化潜能 | 再生医学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 来自脐带、骨髓、滑膜组织和脂肪组织的MSCs样本 |
899 | 2024-08-08 |
Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.794058
PMID:34977035
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析描述了主动脉瓣细胞的综合转录组景观和细胞间相互作用,并探讨了midkine通过细胞间对话防止主动脉瓣间质细胞钙化的机制 | 首次揭示了midkine通过MK途径与激活的主动脉瓣间质细胞和补体激活的主动脉瓣间质细胞相互作用,抑制钙化的机制 | NA | 阐明钙化主动脉瓣疾病进展的机制并开发治疗靶点 | 主动脉瓣间质细胞的钙化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
900 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Human Retinal Pigment Epithelium
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.802457
PMID:34977041
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对来自三个供体的9,302个人类视网膜色素上皮细胞进行了转录组图谱分析 | 首次报道了人类视网膜色素上皮细胞的多样性,并识别出两个具有显著基因表达模式和功能差异的亚群 | NA | 揭示人类视网膜色素上皮细胞的转录组特征,为理解视网膜生物学和疾病提供关键信息 | 人类视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9,302个细胞,来自三个供体 |