单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2886 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 861 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Identifies Phagocytosis-Related Dual-Feature Cells in A Model of Acute Otitis Media in Rats
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760954
PMID:34759932
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，在急性中耳炎的大鼠模型中识别出与吞噬作用相关的双特征细胞 | 首次在急性中耳炎模型中发现具有吞噬作用相关双特征的稀有细胞群，并揭示了巨噬细胞在炎症反应中的关键作用 | NA | 探究急性中耳炎发展的分子机制及多细胞生态系统中的细胞间对话 | 大鼠急性中耳炎模型中的中耳黏膜细胞 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共测序了来自炎症中耳黏膜的7023个细胞和健康中耳黏膜的5258个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 862 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals B Cells Are Important Regulators in Fracture Healing
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.666140
PMID:34819916
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了B细胞在骨折愈合过程中的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨折愈合过程中B细胞的数量变化及其对骨形成和吸收活动的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类骨折愈合过程中B细胞的作用描述较少 | 探讨B细胞在骨折愈合中的作用及其机制 | 骨折组织中的免疫细胞，特别是B细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括中性粒细胞、单核细胞、T细胞、B细胞和浆细胞等多种免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 863 | 2024-08-07 |
Cellinker: a platform of ligand-receptor interactions for intercellular communication analysis
2021-Jan-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab036
PMID:33471060
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研究论文 | 本文开发了Cellinker平台，一个用于细胞间通信分析的配体-受体相互作用资源 | Cellinker提供了超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体蛋白-蛋白相互作用以及400多个内源性小分子相关的配体-受体相互作用，并特别收集了与冠状病毒感染相关的16个配体-受体相互作用信息 | NA | 提供一个全面的、高可信度的资源，用于检索配体-受体相互作用，以研究细胞间通信的功能效应 | 配体-受体相互作用及其在细胞间通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质-蛋白相互作用数据 | 超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体相互作用，以及400多个内源性小分子相关的相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 864 | 2024-08-07 |
Multiplexed single-cell RNA-sequencing of mouse thymic and splenic samples
2021-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101041
PMID:36475567
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研究论文 | 本文利用多重单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究小鼠胸腺和脾脏样本中的细胞表达 | 采用抗体标记的 hashtag 寡核苷酸（Ab-HTO）和10× Genomics技术进行样本多重标记，降低了scRNA-seq的成本并避免了批次效应 | NA | 研究小鼠胸腺和脾脏中T淋巴细胞的发育 | 小鼠胸腺和脾脏样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胸腺和脾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 865 | 2024-08-07 |
Evaluation of some aspects in supervised cell type identification for single-cell RNA-seq: classifier, feature selection, and reference construction
2021-09-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02480-2
PMID:34503564
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研究论文 | 本文系统评估了监督式细胞类型识别方法中的关键因素，包括特征选择、分类器选择和参考数据集构建 | 提出了使用多层感知器（MLP）作为分类器和F检验作为特征选择方法的建议，并建议合并所有可用数据集来构建参考数据集 | NA | 评估监督式细胞类型识别方法中的关键策略 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多层感知器（MLP） | RNA序列数据 | 涉及多个真实数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 866 | 2024-08-07 |
Normalization of single-cell RNA-seq counts by log(x + 1)† or log(1 + x)†
2021-Aug-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab085
PMID:33676365
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 867 | 2024-08-07 |
Joint cell segmentation and cell type annotation for spatial transcriptomics
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010108
PMID:34057817
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研究论文 | 本文开发了一种名为JSTA的计算框架，用于联合细胞分割和细胞类型注释，利用细胞类型特异性基因表达的先验知识，提高了空间转录组学中RNA分配的准确性 | JSTA框架通过利用现有的细胞类型分类，提高了RNA分配的准确性，并能够对细胞进行高度精细的分类 | NA | 提高空间转录组学中RNA分配的准确性，并揭示细胞类型的空间组织 | 小鼠海马区的细胞及其基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | RNA杂交 | JSTA框架 | 图像 | 分析了80个候选基因，识别了63个具有统计学意义的空间差异基因表达的基因，涉及61个细胞亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 868 | 2024-08-07 |
Quantifying the effect of experimental perturbations at single-cell resolution
2021-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00803-5
PMID:33558698
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研究论文 | 本文通过连续测量转录组空间中扰动效应，量化了单细胞水平上实验扰动的影响 | 开发了一种使用图信号处理估计每个细胞在各实验条件下相对似然性的方法，并提出了顶点频率聚类来提取受扰动影响的细胞群 | NA | 量化单细胞水平上实验扰动的影响 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图信号处理 | 转录组数据 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 869 | 2024-08-07 |
High-resolution single-cell transcriptomics reveals heterogeneity of self-renewing hair follicle stem cells
2021-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14262
PMID:33319418
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术，揭示了自我更新阶段的毛囊干细胞的分子异质性 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序技术，详细分析了毛囊干细胞在自我更新阶段的转录组特征，揭示了不同亚群的分子标记和潜在功能 | 研究仅限于小鼠皮肤样本，未来研究需要扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 揭示毛囊干细胞在自我更新阶段的分子异质性 | 毛囊干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从小鼠皮肤中分离的CD34 /K14-H2BGFP标记的毛囊干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 870 | 2024-08-07 |
Molecular classification of zebrafish retinal ganglion cells links genes to cell types to behavior
2021-02-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.12.003
PMID:33357413
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，对成年和幼年斑马鱼的视网膜神经节细胞（RGCs）进行了系统分类，并识别了超过30种成熟类型及其发育中间体的标记基因 | 本研究首次系统地分类了斑马鱼视网膜神经节细胞，并利用这些数据开发了转基因驱动线，实现了对特定RGC类型的实验操作 | NA | 研究旨在理解视网膜神经节细胞的多样性及其在视觉系统中的功能架构 | 斑马鱼的视网膜神经节细胞 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年和幼年斑马鱼 | NA | NA | NA | NA |
| 871 | 2024-08-07 |
Lipid-mediated innate lymphoid cell recruitment and activation in aspirin-exacerbated respiratory disease
2021-02, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2020.09.011
PMID:32950684
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研究论文 | 本文综述了脂质介导的2型先天淋巴细胞（ILC2s）招募和激活在阿司匹林加重性呼吸疾病（AERD）中的作用 | 利用新一代单细胞测序方法和最近开发的AERD小鼠模型，未来研究将更好地定义脂质介导的ILC2在AERD患者中的迁移 | 关于脂质介导的ILC2激活在AERD中发生的证据尚不充分 | 探讨脂质介导的ILC2招募和激活在AERD中的作用 | 2型先天淋巴细胞（ILC2s）在阿司匹林加重性呼吸疾病（AERD）中的作用 | NA | 呼吸疾病 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 872 | 2024-08-07 |
Harnessing Single-Cell RNA Sequencing to Better Understand How Diseased Cells Behave the Way They Do in Cardiovascular Disease
2021-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314776
PMID:33327741
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病中对病变细胞行为理解的应用 | 利用单细胞RNA测序技术构建细胞图谱，发现新的细胞类型及其在心血管疾病中的作用 | NA | 深入理解心血管疾病中病变细胞的行为机制 | 心血管组织中的特定细胞类型及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 873 | 2024-08-07 |
Injury-induced ASCL1 expression orchestrates a transitory cell state required for repair of the neonatal cerebellum
2021-Dec-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj1598
PMID:34878841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和命运图谱技术，研究了新生儿小脑损伤后的修复过程，特别是Bergmann胶质层中的神经发生性前体细胞（NEP）的适应性重编程 | 首次定义了NEP的分子亚型及其在稳态和修复过程中的谱系，并揭示了ASCL1表达在损伤诱导的适应性重编程中的关键作用 | NA | 理解新生儿小脑损伤后的修复机制 | 新生儿小脑中的神经发生性前体细胞（NEP）及其在损伤后的适应性重编程 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 874 | 2024-08-07 |
Intranasal priming induces local lung-resident B cell populations that secrete protective mucosal antiviral IgA
2021-Dec-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abj5129
PMID:34890255
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研究论文 | 研究通过鼻内免疫在小鼠流感病毒感染模型中诱导局部肺部IgA分泌，并探讨了IgA分泌细胞的类型及其在肺部保护性免疫中的作用 | 首次展示了鼻内免疫而非系统性免疫能诱导肺部局部IgA分泌，并发现肺部存在多种IgA表达细胞，包括组织驻留记忆B细胞、浆母细胞和浆细胞 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨肺部局部IgA分泌细胞的类型及其在保护性免疫中的作用，为设计针对呼吸道病毒感染的高效疫苗策略提供信息 | 肺部局部IgA分泌细胞及其在保护性免疫中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 875 | 2024-08-07 |
Targeting metabotropic glutamate receptor 4 for cancer immunotherapy
2021-Dec-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj4226
PMID:34890233
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研究论文 | 本研究报告了代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在抑制抗肿瘤免疫中的新作用，并通过遗传敲除或药物抑制在三种小鼠同源肿瘤模型中显著延迟了肿瘤生长 | 首次揭示了GRM4在抑制抗肿瘤免疫中的作用，并展示了通过靶向GRM4进行癌症免疫治疗的新方法 | NA | 探索代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用 | 代谢型谷氨酸受体4（GRM4）及其在肿瘤免疫中的作用 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析 | NA | RNA | 三种小鼠同源肿瘤模型（B16，MC38，3LL） | NA | NA | NA | NA |
| 876 | 2024-08-07 |
Location Matters: Profiling Diffuse Type Gastric Cancer At the Single-Cell Level
2021-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2935
PMID:34556549
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研究论文 | 本研究利用空间单细胞转录组学技术，分析了原发性弥漫型胃癌患者肿瘤不同位置的细胞差异 | 首次揭示了弥漫型胃癌中不同位置的癌细胞和基质细胞的差异，特别是深层肿瘤区域基质细胞表达的CCL2对免疫抑制微环境的潜在驱动作用 | NA | 研究弥漫型胃癌中单细胞水平的空间转录组学特征 | 弥漫型胃癌患者的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 877 | 2024-08-07 |
Temporal single-cell transcriptomes of zebrafish spinal cord pMN progenitors reveal distinct neuronal and glial progenitor populations
2021-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.07.010
PMID:34303700
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼脊髓pMN前体细胞，揭示了神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼脊髓pMN前体细胞中神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体，并鉴定了标记基因gsx2 | NA | 识别运动神经元和少突胶质前体细胞的发育起源和转录组特征 | 斑马鱼胚胎脊髓pMN细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 878 | 2024-08-07 |
Tissue factor expression, extracellular vesicles, and thrombosis after infection with the respiratory viruses influenza A virus and coronavirus
2021-11, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15509
PMID:34418279
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综述 | 本文综述了组织因子（TF）在流感A病毒（IAV）和冠状病毒感染后的表达、TF阳性外泌体（EVs）的释放、凝血激活及血栓形成的研究 | 强调了TF表达在IAV和致病性冠状病毒感染患者中与血栓形成的关系 | NA | 探讨病毒感染后组织因子表达与血栓形成的关系 | 流感A病毒和冠状病毒感染后的组织因子表达及血栓形成 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和COVID-19患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 879 | 2024-08-07 |
Molecular and Cellular Dynamics of Aortic Aneurysms Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.315852
PMID:34615376
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review | 本文综述了单细胞转录组测序在揭示主动脉瘤的分子和细胞动态方面的最新发现 | 单细胞RNA测序提供了血管细胞类型异质性、每个细胞类型的全面分子特征以及这些细胞群体之间表型相互关系的新见解 | 讨论了单细胞RNA测序在研究主动脉生物学和疾病中的挑战和未来方向 | 总结单细胞RNA测序分析在细胞异质性、细胞转换、细胞群体间通信和血管壁关键转录因子方面的发现，并探讨其对血管疾病发病机制的理解 | 主动脉瘤的分子和细胞动态 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 880 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome of early hematopoiesis guides arterial endothelial-enhanced functional T cell generation from human PSCs
2021-Sep-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi9787
PMID:34516916
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了人类多能干细胞（hPSCs）向血液细胞分化的过程中细胞命运选择和基因表达模式，并发现通过在体外定向分化过程中应用低氧条件，可以有效促进具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞（HPCs）的生成。 | 本研究首次展示了通过低氧条件在体外定向分化过程中促进动脉特异性程序的发展，从而生成具有功能性T细胞潜力的造血祖细胞。 | NA | 研究旨在深入理解人类造血起源，并指导体外生成功能性T细胞以应用于临床。 | 人类多能干细胞（hPSCs）的造血分化过程及其生成的血液细胞的功能性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |