单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-08 |
Lipid-related protein NECTIN2 is an important marker in the progression of carotid atherosclerosis: An intersection of clinical and basic studies
2021-Dec-01, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2021-0044
PMID:35136728
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研究论文 | 本研究探讨了脂质相关蛋白NECTIN2在颈动脉粥样硬化进展中的作用 | NECTIN2被识别为影响颈动脉粥样硬化的关键因素，并可能成为新的临床预防治疗靶点 | NA | 探索NECTIN2在颈动脉粥样硬化中的潜在作用 | 颈动脉粥样硬化患者和APOE-/-大鼠 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | 单细胞转录组和微阵列数据 | 108名患者和APOE-/-大鼠 |
| 842 | 2024-08-08 |
Discoveries in Pancreatic Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.732776
PMID:35141228
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰腺生理和疾病生物学中的应用及其对糖尿病和胰腺癌治疗策略优化的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术揭示了正常和疾病状态下胰腺中先前未知的细胞亚型，并研究了罕见胰岛细胞的功能角色以及糖尿病和癌症中各种细胞类型的作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在胰腺生理和病理学中的应用，以优化糖尿病和胰腺癌的治疗策略 | 胰腺生理功能、胰腺肿瘤基因表达、糖尿病和胰腺癌中的细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病、胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 843 | 2024-08-08 |
Immune Infiltration of CD8+ T Cells in Patients With Diabetic Pancreatic Cancer Reduces the Malignancy of Cancer Tissues: An In Silico Study
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.826667
PMID:35145483
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研究论文 | 本文通过计算研究探讨了糖尿病胰腺癌患者中CD8+ T细胞的免疫浸润如何降低癌细胞的恶性程度 | 首次揭示了糖尿病胰腺癌患者中炎症相关信号通路的激活增加CD8+ T细胞的免疫浸润，并减少恶性肿瘤组织的发展 | 研究基于数据库中的现有数据，未进行实验验证 | 探讨糖尿病胰腺癌患者中免疫浸润与肿瘤恶性程度的关系 | 糖尿病胰腺癌患者与非糖尿病胰腺癌患者的免疫浸润及肿瘤恶性程度 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞表达谱测序 | NA | mRNA表达数据 | 141例糖尿病胰腺癌患者和51例非糖尿病胰腺癌患者的mRNA表达数据 |
| 844 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomic and Chromatin Profiles Suggest Layer Vb Is the Only Layer With Shared Excitatory Cell Types in the Medial and Lateral Entorhinal Cortex
2021, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2021.806154
PMID:35153682
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术研究了内侧和外侧内嗅皮质的染色质可及性和转录组特征，发现Vb层是唯一具有共享兴奋性细胞类型的层 | 首次在两个相似但不同的皮质区域应用单细胞染色质可及性分析，并结合scRNA-seq数据集进行整合分析 | 研究仅限于内侧和外侧内嗅皮质，未涉及所有脑区域 | 阐明内嗅皮质电路中的细胞类型及其功能基础 | 内侧和外侧内嗅皮质的神经细胞类型 | 神经科学 | NA | 单细胞分析 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 4,136个细胞 |
| 845 | 2024-08-08 |
CA9-Related Acidic Microenvironment Mediates CD8+ T Cell Related Immunosuppression in Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.832315
PMID:35155218
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研究论文 | 本研究整合了胰腺癌TCGA、GEO和单细胞RNA测序数据集，通过生物信息学方法、体外和体内实验探索胰腺癌免疫微环境的潜在预后标志物和潜在机制。 | 研究揭示了胰腺癌细胞通过CA9抑制CD8+ T细胞浸润的机制，为胰腺癌的免疫逃逸途径和免疫靶向治疗提供了新的视角。 | NA | 探索胰腺癌免疫微环境的潜在预后标志物和潜在机制。 | 胰腺癌的免疫微环境及其对CD8+ T细胞的影响。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA、GEO和单细胞测序数据集，具体样本数量未详细说明。 |
| 846 | 2024-08-08 |
Interpreting Functional Impact of Genetic Variations by Network QTL for Genotype-Phenotype Association Study
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720321
PMID:35155440
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研究论文 | 本文提出了一种新的网络QTL框架，用于解析遗传变异对表型的功能影响，通过识别基因型与表型之间的网络关联，而非传统的表达QTL方法。 | 本文创新性地提出了网络QTL（nQTL）框架，通过识别基因型与表型之间的网络关联，能够更全面地解析遗传变异对表型的影响，特别是在复杂生物过程中。 | 本文未明确提及具体的研究局限性。 | 研究旨在通过网络QTL框架，解析遗传变异对表型的功能影响，特别是在疾病亚型、疾病预后、药物反应和病原因子关联中的应用。 | 研究对象包括遗传变异、基因网络、表型及其在生物医学数据中的应用。 | 基因组学 | NA | 网络QTL分析 | 网络QTL框架 | 基因表达数据 | 研究中使用了多种生物医学数据集，但具体样本数量未明确提及。 |
| 847 | 2024-08-08 |
Prudent application of single-cell RNA sequencing in understanding cellular features and functional phenotypes in cancer studies
2021-Dec-31, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中理解细胞特征和功能表型的应用 | scRNA-seq提供了一种无偏见的方法来揭示不同细胞子集的特征，并有助于揭示复杂系统中的异质性 | 研究者需要注意组织解离、细胞捕获和转录物测量中的潜在缺陷，这些可能影响细胞组成评估和细胞功能注释 | 提高对组织稳态和癌症生物学的理解 | 单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 848 | 2024-08-08 |
ZERO-INFLATED QUANTILE RANK-SCORE BASED TEST (ZIQRANK) WITH APPLICATION TO SCRNA-SEQ DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION ANALYSIS
2021-Dec, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/21-aoas1442
PMID:35116085
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研究论文 | 本文提出了一种基于零膨胀分位数秩得分检验（ZIQRank）的方法，用于单细胞RNA测序数据中的差异基因表达分析 | ZIQRank方法同时处理了单细胞RNA测序数据的多模态和零膨胀特性，通过两部分分位数回归模型进行零计数的逻辑建模和多个预设分位数的秩得分检验，提高了检测差异表达基因的准确性 | NA | 开发一种新的统计方法，用于提高单细胞RNA测序数据中差异基因表达分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的差异基因表达 | 生物信息学 | 脑瘤 | scRNA-seq | 两部分分位数回归模型 | 基因表达数据 | 涉及人类胶质母细胞瘤肿瘤和鼠肠道类器官细胞的数据 |
| 849 | 2024-08-08 |
Mitochondrial inhibitors circumvent adaptive resistance to venetoclax and cytarabine combination therapy in acute myeloid leukemia
2021-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00264-y
PMID:35122057
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研究论文 | 本文定义了一个'MitoScore'特征，识别AML患者体内高线粒体氧化磷酸化，并研究了线粒体抑制剂如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 发现了AML细胞对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性与线粒体氧化磷酸化、电子传递链复合体及TP53通路的变化有关，并提出了使用线粒体抑制剂来延迟复发的新策略 | NA | 研究如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 急性髓系白血病（AML）细胞及其对特定治疗的抗药性 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 850 | 2024-08-08 |
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
2021-02, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00154-9
PMID:35122077
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自26名患者的69,000多个胶质母细胞瘤干细胞（GSCs），揭示了GSCs在转录水平上的高度异质性，并发现这种异质性可能与正常神经发育和炎症伤口反应的转录状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9基因敲除筛选，揭示了胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性与其功能脆弱性之间的关系。 | 研究主要集中在细胞培养和基因敲除筛选上，可能未能完全反映肿瘤在体内的复杂环境。 | 探究胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性及其对肿瘤功能的影响。 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）及其转录状态。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 69,000多个GSCs来自26名患者 |
| 851 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Chronic Antibody-Mediated Rejection After Renal Transplantation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.767618
PMID:35111153
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了慢性抗体介导的排斥反应（cABMR）患者外周血单核细胞的转录组图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了cABMR中T细胞和B细胞的基因表达变化及其与炎症反应的关系 | 研究仅限于外周血单核细胞的分析，未涉及肾脏组织中的细胞 | 探讨慢性抗体介导的排斥反应后肾移植患者免疫细胞的转录组变化及其机制 | 慢性抗体介导的排斥反应患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | cABMR患者和对照组的外周血单核细胞样本 |
| 852 | 2024-08-08 |
High Throughput scRNA-Seq Provides Insights Into Leydig Cell Senescence Induced by Experimental Autoimmune Orchitis: A Prominent Role of Interstitial Fibrosis and Complement Activation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.771373
PMID:35111154
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞RNA测序研究了实验性自身免疫性睾丸炎（EAO）诱导的莱迪细胞衰老，并探讨了间质纤维化和补体激活在其中的作用 | 首次揭示了EAO环境下莱迪细胞衰老的机制，特别是补体激活和间质纤维化在其中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨慢性炎症环境下莱迪细胞的衰老机制 | 莱迪细胞在实验性自身免疫性睾丸炎中的衰老过程 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 853 | 2024-08-08 |
The ALDH Family Contributes to Immunocyte Infiltration, Proliferation and Epithelial-Mesenchymal Transformation in Glioma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.756606
PMID:35116021
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研究论文 | 本研究探讨了醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用，通过大量RNA测序和单细胞RNA测序分析，发现该家族与肿瘤细胞增殖、迁移及免疫环境调控有关。 | 首次深入研究了醛脱氢酶家族在胶质瘤中的具体作用，特别是在肿瘤细胞增殖、迁移和免疫环境调控方面。 | 研究主要基于数据分析，缺乏体内外实验验证。 | 探讨醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用及其对患者预后的影响。 | 醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用及其对肿瘤细胞增殖、迁移的影响。 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练集包含癌症基因组图谱数据，验证集包括中国胶质瘤基因组图谱和基因表达综合数据库的数据。 |
| 854 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Neutrophil Heterogeneity and Functional Multiplicity in the Early Stage of Severe Burn Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.792122
PMID:35116026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康捐赠者和早期烧伤患者循环中性粒细胞（PMNs）的转录组图谱，揭示了PMNs的异质性和功能多样性 | 首次详细分析了早期严重烧伤阶段PMNs的异质性和功能多样性，并发现了先前未描述的转录因子 | NA | 旨在阐明早期严重烧伤阶段PMNs异质性对病理生理学及相关机制的影响 | 健康捐赠者和早期烧伤患者的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 健康捐赠者和早期烧伤患者的循环中性粒细胞被分为五个亚群 |
| 855 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA Sequencing in Autoimmune Inflammatory Rheumatic Diseases: Current Applications, Challenges and a Step Toward Precision Medicine
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.822804
PMID:35118101
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在自身免疫性炎症性风湿病研究中的当前应用、挑战及其在精准医学发展中的潜在作用 | scRNA-seq技术能够分析单个细胞的整个转录组，揭示复杂的细胞网络，为开发更精准和个性化的治疗方法提供指标 | 自身免疫性炎症性风湿病的复杂性和患者的高度异质性使得完全理解其病理机制变得困难，且现有的治疗选择有限，长期效果不佳甚至有毒性 | 深入研究风湿病和药物抵抗的细胞和分子机制，识别新的治疗靶点，并推动基于分层和知情治疗决策的使用 | 自身免疫性炎症性风湿病 | 数字病理学 | 风湿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 856 | 2024-08-08 |
A Systematic Review on PD-1 Blockade and PD-1 Gene-Editing of CAR-T Cells for Glioma Therapy: From Deciphering to Personalized Medicine
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.788211
PMID:35126356
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综述 | 本文综述了PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞在胶质瘤治疗中的应用，旨在探讨这两种方法的优缺点，并提出改善胶质瘤患者预后的新策略。 | 提出了基于单细胞测序的第四代CAR-T细胞，能够覆盖患者来源的新抗原，并抑制相关的抑制性免疫检查点分子，从而改善抗肿瘤免疫反应。 | NA | 探讨PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞在胶质瘤治疗中的应用，提出改善胶质瘤患者预后的新策略。 | 胶质瘤治疗中的PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞。 | 免疫疗法 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | CAR-T细胞 | 基因编辑 | 动物模型 |
| 857 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Lung Cancer: Revealing Phenotype Shaping of Stromal Cells in the Microenvironment
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.802080
PMID:35126365
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肺癌肿瘤微环境中基质细胞研究中的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的基因表达谱分辨率，使得能够在单细胞水平上进行基因表达的定量分析 | NA | 深入理解肿瘤微环境中的基质成分，以促进肺癌的诊断和治疗 | 肺癌肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 858 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Immune-Related Prognosis of TK1 in Hepatocellular Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.786873
PMID:35127491
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研究论文 | 本研究利用TCGA数据库分析了TK1在肝细胞癌中的表达及其对患者生存的影响，并探讨了TK1与免疫细胞浸润的关系及其在肝细胞癌中的预后价值 | 首次揭示了TK1表达与肝细胞癌中免疫细胞浸润的关联，并建立了基于TK1相关免疫基因的预后风险评分模型 | 研究主要基于TCGA数据库，可能存在样本量和临床数据的局限性 | 探讨TK1在肝细胞癌中的免疫相关预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 肝细胞癌患者及HepG2细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序分析 | COX回归分析 | mRNA和蛋白质 | TCGA数据库中的肝细胞癌患者样本 |
| 859 | 2024-08-08 |
Properties and Roles of γδT Cells in Plasmodium yoelii nigeriensis NSM Infected C57BL/6 Mice
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.788546
PMID:35127555
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研究论文 | 本研究探讨了γδT细胞在感染Plasmodium yoelii nigeriensis NSM的C57BL/6小鼠中的性质和作用 | 通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了γδT细胞的多样性，并揭示了其在感染后的动态变化和激活状态 | NA | 研究γδT细胞在抗疟疾感染中的作用及其对免疫反应的影响 | 感染Plasmodium yoelii nigeriensis NSM的C57BL/6小鼠的γδT细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术，单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 感染和未感染的C57BL/6小鼠的脾脏γδT细胞 |
| 860 | 2024-08-08 |
Regeneration of Jaw Joint Cartilage in Adult Zebrafish
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777787
PMID:35127702
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研究论文 | 研究探讨成年斑马鱼下颌关节软骨的再生能力及其机制 | 首次展示了成年斑马鱼能够再生受损的下颌关节软骨，并揭示了参与再生的细胞类型和分子标记 | NA | 探索斑马鱼下颌关节软骨的再生能力及其潜在的细胞和分子机制 | 成年斑马鱼的下颌关节软骨 | NA | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1年龄的斑马鱼 |