单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2885 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-07 |
Opposing Wnt signals regulate cervical squamocolumnar homeostasis and emergence of metaplasia
2021-02, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00619-0
PMID:33462395
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分，揭示了两种上皮由不同的宫颈驻留干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生，并探讨了宫颈化生过程中基质重塑的机制 | 首次揭示了宫颈鳞状和柱状上皮由不同的干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生，并展示了化生过程中基质重塑的详细机制 | NA | 探讨宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮组织维持机制及化生过程中的基质重塑 | 宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 842 | 2024-08-07 |
Gut CD4+ T cell phenotypes are a continuum molded by microbes, not by TH archetypes
2021-02, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-00836-7
PMID:33462454
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质分析，探讨了在无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠结肠中CD4效应淋巴细胞（T细胞）的实际状态 | 研究发现T细胞的转录组和染色质结构无法解析出符合经典辅助T细胞（T）亚群的离散簇，而是呈现连续分布，且这种分布与感染的微生物有关，而非传统的细胞因子产生 | NA | 确定T细胞在活体前线组织中实际采用的状态 | CD4效应淋巴细胞（T细胞）在不同微生物环境下的状态 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析，染色质分析 | NA | 转录组数据 | 无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠的结肠T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 843 | 2024-08-07 |
Co-stimulation with opposing macrophage polarization cues leads to orthogonal secretion programs in individual cells
2021-01-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20540-2
PMID:33436596
|
research paper | 本研究使用单细胞RNA测序探索在同时刺激炎症因子LPS和IFN-γ以及解决性细胞因子IL-4的情况下，单个巨噬细胞的响应机制 | 研究发现，负交叉调控导致单个共刺激巨噬细胞中T细胞极化细胞因子基因Il6和Il12b与IL-4相关因子Arg1和Chil3的互斥表达 | NA | 探讨巨噬细胞在同时接受不同刺激信号时的转录响应和功能多样性 | 巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单个巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 844 | 2024-08-07 |
Cardiomyocytes stimulate angiogenesis after ischemic injury in a ZEB2-dependent manner
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20361-3
PMID:33398012
|
研究论文 | 本文研究了转录因子ZEB2在心肌细胞中的作用，特别是在缺血损伤后促进血管生成的能力 | 首次揭示了ZEB2在心肌细胞中的增加及其通过调节心肌细胞与内皮细胞间的对话来增强缺血后血管生成的机制 | NA | 探索增强心脏修复和恢复血管网络的因素 | 心肌细胞中的转录因子ZEB2及其在缺血损伤后的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 845 | 2024-08-07 |
Cholesterol-Induced Phenotypic Modulation of Smooth Muscle Cells to Macrophage/Fibroblast-like Cells Is Driven by an Unfolded Protein Response
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315164
PMID:33028096
|
research paper | 研究胆固醇诱导的血管平滑肌细胞向巨噬细胞/成纤维细胞样细胞表型转变的分子途径 | 揭示了未折叠蛋白反应（UPR）在胆固醇诱导的血管平滑肌细胞表型转变中的必要性和充分性 | NA | 探究胆固醇诱导血管平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 血管平滑肌细胞（SMCs）及其在胆固醇暴露下的表型变化 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | RNA sequencing | NA | NA | NA | NA | NA |
| 846 | 2024-08-07 |
Ndufs1 Deficiency Aggravates the Mitochondrial Membrane Potential Dysfunction in Pressure Overload-Induced Myocardial Hypertrophy
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5545261
PMID:33763166
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析scRNA-seq和微阵列数据，探讨了Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | 首次揭示了Ndufs1在压力超负荷诱导的心肌肥大中的关键作用，并通过动物实验和细胞模型验证了其对线粒体功能的影响。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中进行验证。 | 探讨Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | Ndufs1在心肌肥大中的作用及其对线粒体功能的影响。 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 使用TAC小鼠模型和Ang II诱导的心肌细胞模型进行研究。 | NA | NA | NA | NA |
| 847 | 2024-08-07 |
Loss of Claudin-3 Impairs Hepatic Metabolism, Biliary Barrier Function, and Cell Proliferation in the Murine Liver
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.003
PMID:33866021
|
研究论文 | 本文研究了紧密连接蛋白claudin-3在小鼠肝脏中的细胞类型特异性表达及其对肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖的影响 | 首次探讨了claudin-3在肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖中的具体作用 | NA | 探究紧密连接蛋白claudin-3在肝脏中的功能及其对代谢和屏障功能的影响 | 小鼠肝脏中的紧密连接蛋白claudin-3及其相关代谢和屏障功能 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | Cldn3-/-和Cldn3+/+小鼠的肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 848 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immunological Profiles of Renal Allograft Rejection in Mice
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.693608
PMID:34367152
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞特征 | 首次揭示了从小鼠急性排斥到慢性排斥过程中免疫细胞类型的变化及其对排斥过程的影响 | NA | 研究肾移植排斥过程中的免疫细胞特征及其变化 | 小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10,921个白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2024-08-07 |
Integrated Systems Analysis of the Murine and Human Pancreatic Cancer Glycomes Reveals a Tumor-Promoting Role for ST6GAL1
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100160
PMID:34634466
|
研究论文 | 本文通过系统方法整合了KC小鼠和人类胰腺癌患者的糖组分析，识别了在癌症形成中可能起作用的糖类 | 创建了一种新型小鼠模型，通过胰腺特异性遗传删除ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1酶，研究其对胰腺癌的影响 | 某些人类糖组变化在KC小鼠模型中未观察到 | 识别在胰腺癌形成中起作用的糖类，并开发针对这些糖类的治疗方法 | 小鼠和人类胰腺癌样本的糖组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 糖组分析 | NA | 序列数据 | 包括KC小鼠模型和人类胰腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 850 | 2024-08-07 |
Deep Parallel Characterization of AAV Tropism and AAV-Mediated Transcriptional Changes via Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.730825
PMID:34759919
|
研究论文 | 本文开发了一种实验和计算相结合的单细胞RNA测序（scRNA-seq）流程，用于高分辨率地表征编码rAAV池的趋向性和响应 | 首次采用scRNA-seq技术并行表征AAV的趋向性和转录变化，发现了未被识别的AAV衣壳靶向偏差和细胞类型特异性的短暂反应 | NA | 旨在开发安全且精确的基因递送载体，并展示在单细胞水平上理解基因疗法响应的重要性 | 重组腺相关病毒（rAAV）的趋向性和转录变化 | 基因疗法 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及多种细胞和组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 851 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Identifies Phagocytosis-Related Dual-Feature Cells in A Model of Acute Otitis Media in Rats
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760954
PMID:34759932
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，在急性中耳炎的大鼠模型中识别出与吞噬作用相关的双特征细胞 | 首次在急性中耳炎模型中发现具有吞噬作用相关双特征的稀有细胞群，并揭示了巨噬细胞在炎症反应中的关键作用 | NA | 探究急性中耳炎发展的分子机制及多细胞生态系统中的细胞间对话 | 大鼠急性中耳炎模型中的中耳黏膜细胞 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共测序了来自炎症中耳黏膜的7023个细胞和健康中耳黏膜的5258个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 852 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals B Cells Are Important Regulators in Fracture Healing
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.666140
PMID:34819916
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了B细胞在骨折愈合过程中的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨折愈合过程中B细胞的数量变化及其对骨形成和吸收活动的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类骨折愈合过程中B细胞的作用描述较少 | 探讨B细胞在骨折愈合中的作用及其机制 | 骨折组织中的免疫细胞，特别是B细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括中性粒细胞、单核细胞、T细胞、B细胞和浆细胞等多种免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 853 | 2024-08-07 |
Cellinker: a platform of ligand-receptor interactions for intercellular communication analysis
2021-Jan-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab036
PMID:33471060
|
研究论文 | 本文开发了Cellinker平台，一个用于细胞间通信分析的配体-受体相互作用资源 | Cellinker提供了超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体蛋白-蛋白相互作用以及400多个内源性小分子相关的配体-受体相互作用，并特别收集了与冠状病毒感染相关的16个配体-受体相互作用信息 | NA | 提供一个全面的、高可信度的资源，用于检索配体-受体相互作用，以研究细胞间通信的功能效应 | 配体-受体相互作用及其在细胞间通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质-蛋白相互作用数据 | 超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体相互作用，以及400多个内源性小分子相关的相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 854 | 2024-08-07 |
Multiplexed single-cell RNA-sequencing of mouse thymic and splenic samples
2021-Dec-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101041
PMID:36475567
|
研究论文 | 本文利用多重单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究小鼠胸腺和脾脏样本中的细胞表达 | 采用抗体标记的 hashtag 寡核苷酸（Ab-HTO）和10× Genomics技术进行样本多重标记，降低了scRNA-seq的成本并避免了批次效应 | NA | 研究小鼠胸腺和脾脏中T淋巴细胞的发育 | 小鼠胸腺和脾脏样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胸腺和脾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 855 | 2024-08-07 |
Evaluation of some aspects in supervised cell type identification for single-cell RNA-seq: classifier, feature selection, and reference construction
2021-09-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02480-2
PMID:34503564
|
研究论文 | 本文系统评估了监督式细胞类型识别方法中的关键因素，包括特征选择、分类器选择和参考数据集构建 | 提出了使用多层感知器（MLP）作为分类器和F检验作为特征选择方法的建议，并建议合并所有可用数据集来构建参考数据集 | NA | 评估监督式细胞类型识别方法中的关键策略 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多层感知器（MLP） | RNA序列数据 | 涉及多个真实数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 856 | 2024-08-07 |
Normalization of single-cell RNA-seq counts by log(x + 1)† or log(1 + x)†
2021-Aug-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab085
PMID:33676365
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 857 | 2024-08-07 |
Joint cell segmentation and cell type annotation for spatial transcriptomics
2021-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010108
PMID:34057817
|
研究论文 | 本文开发了一种名为JSTA的计算框架，用于联合细胞分割和细胞类型注释，利用细胞类型特异性基因表达的先验知识，提高了空间转录组学中RNA分配的准确性 | JSTA框架通过利用现有的细胞类型分类，提高了RNA分配的准确性，并能够对细胞进行高度精细的分类 | NA | 提高空间转录组学中RNA分配的准确性，并揭示细胞类型的空间组织 | 小鼠海马区的细胞及其基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | RNA杂交 | JSTA框架 | 图像 | 分析了80个候选基因，识别了63个具有统计学意义的空间差异基因表达的基因，涉及61个细胞亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 858 | 2024-08-07 |
Quantifying the effect of experimental perturbations at single-cell resolution
2021-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00803-5
PMID:33558698
|
研究论文 | 本文通过连续测量转录组空间中扰动效应，量化了单细胞水平上实验扰动的影响 | 开发了一种使用图信号处理估计每个细胞在各实验条件下相对似然性的方法，并提出了顶点频率聚类来提取受扰动影响的细胞群 | NA | 量化单细胞水平上实验扰动的影响 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图信号处理 | 转录组数据 | 未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 859 | 2024-08-07 |
High-resolution single-cell transcriptomics reveals heterogeneity of self-renewing hair follicle stem cells
2021-04, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14262
PMID:33319418
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术，揭示了自我更新阶段的毛囊干细胞的分子异质性 | 首次通过高分辨率单细胞RNA测序技术，详细分析了毛囊干细胞在自我更新阶段的转录组特征，揭示了不同亚群的分子标记和潜在功能 | 研究仅限于小鼠皮肤样本，未来研究需要扩展到其他物种以验证结果的普遍性 | 揭示毛囊干细胞在自我更新阶段的分子异质性 | 毛囊干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从小鼠皮肤中分离的CD34 /K14-H2BGFP标记的毛囊干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 860 | 2024-08-07 |
Molecular classification of zebrafish retinal ganglion cells links genes to cell types to behavior
2021-02-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.12.003
PMID:33357413
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学方法，对成年和幼年斑马鱼的视网膜神经节细胞（RGCs）进行了系统分类，并识别了超过30种成熟类型及其发育中间体的标记基因 | 本研究首次系统地分类了斑马鱼视网膜神经节细胞，并利用这些数据开发了转基因驱动线，实现了对特定RGC类型的实验操作 | NA | 研究旨在理解视网膜神经节细胞的多样性及其在视觉系统中的功能架构 | 斑马鱼的视网膜神经节细胞 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年和幼年斑马鱼 | NA | NA | NA | NA |